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Chimie – Chimie Organique

Chapitre 2 :
Composés et fonctions organiques

Marine PEUCHMAUR
Année universitaire 2010/2011
Université Joseph Fourier de Grenoble - Tous droits réservés.
1. Les hydrocarbures

2. Les fonctions organiques


1. Les hydrocarbures

1.1. Les alcanes


1.2. Les alcènes
1.3. Les alcynes
1.4. Les composés aromatiques

Les hydrocarbures ne sont composés que d’atomes de carbone et d’hydrogène


1.1. Les alcanes
A. Les alcanes acycliques

sp3
C Les alcanes sont des composés saturés.
Leur formule brute est du type CnH(2n+2).

: atome de C ou H

Exemples :

Chaînes
principales
pentane
méthylbutane diméthylpropane Ramifications

Alcane linéaire Alcanes ramifiés

Carbone quaternaire (relié à 4 C)


Carbone tertiaire (relié à 3 C)
Carbone secondaire (relié à 2 C)
Carbone primaire (relié à 1 C)
1.1. Les alcanes (suite)
B. Les cycloalcanes Les cycloalcanes sont des composés insaturés.
Leur formule brute est du type CnH(2n+2).

alcanes hexane C6H14 5 doublets liants C-C


Composés
saturés
2-méthylpentane C6H14 5 doublets liants C-C

cyclohexane C6H12 6 doublets liants C-C


cycloalcanes
1 doublet liant C-C
supplémentaire méthylcyclopentane C6H12 6 doublets liants C-C
2 atomes
d’hydrogène
en moins
1,2-diméthylcyclobutane C6H12 6 doublets liants C-C
 1 insaturation

Le nombre d’insaturation correspond au nombre de doublets σ ou π – hormis les liaisons


C-H – que comporte l’hydrocarbure étudié, en plus par rapport à son homologue alcane. A
chaque insaturation correspond un manque de 2 atomes d’hydrogène.
1.2. Les alcènes
(ou oléfines)

sp2
Les alcènes sont des composés insaturés (double liaison).
Leur formule brute est du type CnH2n.

Remarque : les cycloalcanes possèdent la même formule brute

Géométrie trigonale autour des C Pas de rotation autour de


hybridés sp2 de la double liaison la double liaison C=C

LC=C < LC–C et EC=C > EC–C Liaison C=C plus difficile à casser
totalement que liaison C–C

Les électrons π sont plus mobiles et


EπC=C < EσC–C plus polarisables que les électrons σ :
ce sont eux qui vont conférer ses
propriétés chimiques à la molécule
1.2. Les alcènes (suite)

H3C CH3 éthane C2H6 saturé

H2C CH2 éthène (ou éthylène) C2H4 1 insaturation


(2 atomes H en moins)

Exemples :

propène
cyclohexène cyclopenta-1,3-diène limonène
(citron, menthe, pin)

NO2
OH

Phéromone de défense des termites

Vitamine A (rétinol)

β-carotène
1.3. Les alcynes

sp
Les alcynes sont des composés insaturés (triple liaison).
Leur formule brute est du type CnH2n-2.

H3C CH3 éthane C2H6 saturé

H2C CH2 éthène (ou éthylène) C2H4 1 insaturation

HC CH éthyne (ou acétylène) C2H2 2 insaturations


(4 atomes H en moins)

Exemples :
ènediyne

COOH
Hex-1-yne Hex-2-yne OH O HN
O

OCH3

Alcyne terminal = alcyne vrai Alcyne interne


(H lié à la triple liaison acide)
OH O OH
Dynémycine A
(fermentation Micromonospora chersina)
1.3. Les composés aromatiques

Les aromatiques sont des composés insaturés


(cycle + doubles liaisons).
sp2

A. Le benzène et ses dérivés

Nombre d’insaturations
C6H6 Hydrocarbure saturé (alcane) : CnH(2n+2) C6H14
 8 atomes H en moins
 4 insaturations (1 cycle + 3 doublets π)
Structures de Kekulé du benzène Représentation du
benzène sous forme
 Les 6 liaisons carbone-carbone d’une structure unique
sont identiques (l = 1,39 Å)
 Les 6 liaisons carbone-hydrogène
sont identiques ( l = 1,09 Å)

OH CHO NO2
Exemples :

Toluène Phénol Benzaldéhyde Nitrobenzène


(méthylbenzène) (benzénol) (benzène-carbaldéhyde)
1.3. Les composés aromatiques
B. Position des substituants sur le benzène
Exemples :
X
ortho Br NO2
ortho par rapport à X 1
1 1
2 Cl
2
2
3 3
4 Br
méta méta
OH
par rapport à X
p-hydroxytoluène m-dibromobenzène o-chloronitrobenzène
para 4-hydroxytoluene 1,3-dibromobenzène 2-chloronitrobenzène
par rapport à X

C. Autres composés aromatiques


Un composé sera aromatique si :
Règles de Hückel  cycle plan avec recouvrement latéral des OA voisines
 4n + 2 (n entier ≥ 0) électrons délocalisés

Exemples :

Cation
Cyclobutadiène Anion
cyclopropényle Cation cyclopentadiényle
Cyclooctatétraène
14-Annulène cycloheptatriényle
Non aromatiques Aromatiques
2. Les fonctions organiques

2.1. Quelques fonctions organiques en biochimie


2.2. Les fonctions organiques halogénées
2.3. Les fonctions organiques oxygénées
2.4. Les fonctions organiques azotées
2.5. Autres hétéroatomes
2.1. Quelques fonctions organiques en biochimie
Les fonctions organiques ou groupements fonctionnels sont liés à la
présence d’hétéroatomes (oxygène, soufre, azote, phosphore…).
Acides Nucléiques NH2
NH2

Acides aminés - Peptides


N N OH
N
O
HO
N N O S
O P O N O
O
OH
O H2N OH
H2N
OH OH OH O
Nucléotide Désoxyribonucléoside O L-tyrosine
L-méthionine
(Adénosine monophosphate - AMP) (désoxycytidine)

O
Lipides
O

Glucides OH

OH Prostaglandine A1
OH
Lactose
(Disaccharide) HO
O
HO O HO OH O O
OH OH
P N
O O O O
O
β-D-galactose OH
O O

α/β-D-glucose

palmitoyloleylphosphatidylcholine
2.2. Les fonctions organiques halogénées

Les halogénoalcanes (ou halogénures d’alkyle) sont des


C X alcanes dont un ou plusieurs atomes H ont été remplacés
par un halogène noté X (X = F, Cl, Br ou I).

A. Propriétés de la liaison C–X

Longueur de liaison : C–F < C–Cl < C–Br < C–I


Eléctronégativité : C << I < Br < Cl < F

δ+ δ–
C X
Liaison C–X polarisée :

Polarisabilité : F < Cl < Br < I


Force de liaison : C–F > C–Cl > C–Br > C–I
Réactivité relative : C–F < C–Cl < C–Br < C–I

Remarque : Conséquences sur les propriétés physiques


Halogénoalcanes = composés polaires → plus de forces intermoléculaires (dipôle-dipôle) que dans
leurs homologues alcanes non polaires → températures de changement d’état élevées.
A température ambiante, CH3CH3 : gaz, CH3CH2Cl : gaz, par contre CH3CH2Br et CH3CH2I : liquides.
2.2. Les fonctions organiques halogénées
B. Exemples d’halogénoalcanes

H3C I CHCl3

iodométhane trichlorométhane
(chloroforme)

F
F
F *
Cl *
Cl Cl n

Cl n
Cl
Chlorure
Trichlorotrifluoroéthane de vinyle PVC
CFC-113

Br
F F
Cl Cl
* *

F F
n
Br Cl
Polytétrafluoroéthène (PTFE)
Téflon Halomon
2.3. Les fonctions organiques oxygénées
A. La liaison simple C–O

Trois grandes classes de composés possèdent des liaisons simples C–O : les
alcools, les phénols et les étheroxydes. Ces composés peuvent être considérés
comme des dérivés de l’eau dans laquelle un ou deux atomes H ont été substitués.

méthanol H3C H
H3C CH3 méthoxyméthane
O
alcool O étheroxyde

H H
O

Oxygène hybridé sp3


(géométrie tétraèdrique)
phénol
H phénol
O

A.1. Les alcools

Alcools = hydrocarbures dont un atome H a été


C OH
remplacé par un groupement hydroxyle (–OH).

Atome de C devant être hybridé sp3


2.3. Les fonctions organiques oxygénées
A.1. Les alcools (suite)

Propriétés des alcools


 Les liaisons C–O et O–H sont polarisées (électronégativité : C,H < O).
H δ'
+

δ+ δ– Bien que fortes, les liaisons C–O et O–H seront


C O très réactives (polarité + doublets non liants de
δ'– l’oxygène).

 Les alcools jouent le rôle d’acides dans les couples ROH / RO- (RO- : alcoolate, R : groupement
alkyle). Ce sont des acides indifférents dans l’eau (pKa > 14).
 Les alcools peuvent également agir en tant que bases dans les couples ROH2+ / ROH. Ce sont
des bases indifférentes dans l’eau (pKa < 0).

OH
méthanol
H3C

H2
éthanol
C Alcool primaire
H3C OH
CH3
Classement des alcools
propan-2-ol CH Alcool secondaire
isopropanol H3C OH

H3C CH3
méthylpropan-2-ol Alcool tertiaire
C
tertiobutanol
H3C OH
2.3. Les fonctions organiques oxygénées
A.1. Les alcools (suite)

Exemples :

HO
HO Cholestérol
Vitamine D3

O O
levure
OH C6H12O6 2 H3C C C O
glucose anion 2-oxopropanoate
(pyruvate)
prop-2-èn-1-ol
décarboxylation -CO2
OH
OH
sp2 O
réduction
menthol 2 CH3CH2OH 2 H3C C H

Attention propèn-2-ol éthanol éthanal


il ne s’agit
pas d’un Production d’éthanol par fermentation
alcool (énol)
2.3. Les fonctions organiques oxygénées
A.2. Les phénols

H
Phénols = composés aromatiques (Ar) portant un groupement
Ar O hydroxyle –OH (si plusieurs –OH : polyphénols).

 Les phénols sont plus acides que les alcools (stabilisation de l’ion phénolate
par mésomérie).
OH O

Couple acidobasique :

Formes mésomères de l’ion phénolate

O O O O O

Hybride de
résonance

Base conjuguée du phénol stabilisée acidité plus importante du phénol


2.3. Les fonctions organiques oxygénées
A.2. Les phénols (suite)

Exemples : HO

OH H
N
O

O
(E)-Capsaïcine
(E)-8-méthyl-N-vanilly-trans-6-nonenamide

HO
OH
Estradiol
HO

OH

O2N NO2
COOH COOH trans-resvératrol
(raisin)
OH OH
O

OH
O
NO2
HO
acide salicylique Acide picrique
Aspirine
acide ortho-hydroxybenzoïque 2,4,6-trinitrophénol
HN
HO
Adrénaline ou épinéphrine
(R)-4-(1-hydroxy-2-(méthylamino)éthylbenzène-1,2-diol)
2.3. Les fonctions organiques oxygénées
A.3. Les étheroxydes

C Ethéroxydes (ou éthers) : propriétés proches des


C O alcools (présence doublets libres de l’atome O).

Atomes de C devant être hybridés sp3

Exemples :

O
O
éthoxyéthane Charles J. Pederson, Jean-Marie Lehn,
O O
éther diéthylique Donald J. Cram : Prix Nobel de chimie en
K
1987 pour leurs travaux sur les molécules
dont la structure permet des intéractions
O O spécifiques avec une haute sélectivité
O (reconnaissance moléculaire).
O

oxacyclopentane éthers couronnes


tétrahydrofurane (THF) 18C6
2.3. Les fonctions organiques oxygénées
A.4. Autres fonctions comprenant une liaison simple C–O

Rappel
Hydrate Hémiacétal Acétal
C OH
R'

C OH C OH C O
H
HO O O
Ar O

R R
R, R’ = chaînes carbonées
C

C O
Ne surtout pas confondre ces fonctions avec des alcools ou étheroxydes!!

OH
Exemples : O
H2O
Cl3C Cl3C CH hydrate O

H OH
Aculéatine
Chloral Chloral hydrate
trichloroacétaldéhyde 2,2,2-trichloroéthane-1,1-diol acétal
O
O
12

OH
hémiacétal
O
HO α-D-glucopyranose
HO OH
HO
OH
2.3. Les fonctions organiques oxygénées
B. La liaison double C=O

X
Formule générale des carbonyles (C=O).
O Dans cette famille, différentes fonctions existent
Y
suivant la nature des groupements X et Y.

Atomes O et C hybridés sp2 Exemples :

R O OH OH
H
O O
O H OH
H
H H OH OH
aldéhyde méthanal
formaldéhyde benzaldéhyde hexose
R = H ou chaîne carbonée 11-cis-rétinal
H O

R O O O

R'

cétone
camphre damascénone cis-jasmone
R, R’ = chaînes carbonées
2.3. Les fonctions organiques oxygénées
B. La liaison double C=O (suite) Liaison
peptidique
R R R R R R

O O O O O O

HO R'O Cl O R'S R' N

Acide Ester Chlorure d’acyle O Thioester R''


carboxylique (chlorure d’acide) R' ‘Thio’ : Amide
présence
R, R’ = chaînes carbonées Anhydride de soufre R’, R’’ = H ou chaînes carbonées
d’acide
Exemples :
acide

CH3
ester O
COOH
O
CH2 C
O
OH COOCH3 n ester
acide N
acétate d’isopentyle
Acide nicotinique (arome de banane)
Ibuprofène Poly(méthacrylate de méthyle)
PMMA (plexiglas)
NH3

amide N
amide O N
Pénicilline G OH OH
H O O O
N N
S N P P N
amide H O
O OH O O
N O NH
O O OH
CO2H S
Lactame (amide intracyclique) O P OH
Lactone (ester intracyclique) acide
thioester O Acétyl co-enzyme A O-
2.3. Les fonctions organiques azotées
A. La liaison simple C–N : la fonction amine

R
Amines = dérivés de l’ammoniac dont un ou plusieurs
C N
H sont remplacés par des chaînes carbonées.
R'
R, R’ = H ou chaînes carbonées

Atome N devant être hybridé sp3

Propriétés des amines


 Les liaisons C–N et N–H sont polarisées (électronégativité : C,H < N) + doublet libre sur N.
H H
δ– δ+ δ– δ+
O H NR2 R3N H O

 Les amines sont basiques (doublet libre sur N).

R3N H OH R3N H OH
amine cation
ammonium
R

R' N
Basicité croissante des amines
R''
NH3 CH3NH2 (CH3)2NH
Effets inductifs donneurs
des chaînes carbonées
2.3. Les fonctions organiques azotées
A. La liaison simple C–N : la fonction amine (suite)
Classement des amines
Exemples :
pyrrolidine
Amine I
pyridine
NH2
N Amine primaire
H N
R Amine III
H
amphétamine
N
nicotine

Amine secondaire
N
H O Amine III
R
R'
N N
OH

Amine tertiaire choline


N OH
R''
R
R' N
quinine
quinoléine OH

R''' O
N
Sel d’ammonium O Amide O
N N
R'' quaternaire
R Amine III
R'

HN Quinapril
(Accupril®)
Remarque : ce n’est pas la même O
définition que pour les alcools (on prenait
en compte le C portant l’hydroxyle, ici c’est Amine II
méthadone O
directement le N).
2.3. Les fonctions organiques azotées
B. La liaison double C=N : la fonction imine

R' R
Imines
C N
Si R = alkyl ou aryl, on peut parler de bases de Schiff (imines stables).
R''
R, R’ , R’’ = H ou chaînes carbonées

Atomes de C et N devant être hybridés sp2

Exemples :
N-(3-chlorophényl)-2-hydroxy-1-naphthaldimine

énol- céto-
N O O

H H
-imino N N -amino
polyzonimine Tautomérie

Tautomérie : réaction chimique réversible Cl Cl


faisant intervenir le déplacement concomitant
d’un atome d’hydrogène et d’une liaison π énolimino cétoamino
(proportion des tautomères dépend du pH, du
Propriétés photochromiques et thermochromiques à l’état solide
solvant, de la température).
2.4. Autres hétéroatomes
A. Le soufre

H H R'
S R'
S S S R S
R Ar R

Thiol Thiophénol Thioéther Disulfure


(mercaptan)
Soufre hybridé sp3
(géométrie tétraèdrique)
Exemples : OH

O S H2N COOH
O

HS OH NH2 méthionine S
SH S
NH2 3-méthylbut-2-ène-1-thiol
Cystine
Cystéine (jet de moufette)
H2N COOH
acide (R)-2-amino- HS 2-(4-méthylcyclohex-
3-sulfanylpropanoïque 3-ènyl)propane-2-thiol
(pamplemousse)
SH
O
O O O
S
H S
N
OH
HO N OH Allylméthyl thioéther S
H
3-(méthylsulfanyl)prop-1-ène Acide lipoïque
NH2 O
glutathion
2.4. Autres hétéroatomes
B. Le phosphore

Ion phosphate : PO43

 propriétés acido-basiques

Acide phosphorique Ion dihydrogénophosphate Ion hydrogénophosphate Ion phosphate

H3PO4 H2PO4 + H HPO42 + H PO43 + H


O
pKa1 = 2,1 O
pKa2 = 7,2 O
pKa3 = 12 O

P OH P OH P OH P O
HO OH O OH O O O O

 formules mésomères

O O O O

P O P O P O P O
O O O O O O O O
2.4. Autres hétéroatomes
B. Le phosphore (suite)

Phosphoester Phosphodiester
O
 monophosphate
P R
O R O O
O R'
P O
O O

Phosphotriester
 diphosphate
O
O O R
R'' P R
P P O O O
O R'
O O O
O

 triphosphate Acylphosphate
O O O R
O O
P P P O
O O O O P
O O R O O
O
CQFR

1. Les hydrocarbures

 Savoir reconnaître un alcane, alcène, alcyne ou aromatique.


 Connaître les caractéristiques liées à ces familles de composé (insaturations,
position particulière des substituants sur un cycle dérivé du benzène).

2. Les fonctions organiques


 Savoir identifier et nommer les fonctions organiques citées dans le cours.
Exercices d’application
1) Parmi ces composés, lesquels sont aromatiques (pensez éventuellement à prendre en compte les
doublets non liants)?
H
N
O

2) Déterminez le nombre d’insaturations portées par les composés suivants :

3) Soit un cycle benzénique avec deux substituants –CH3 en position 1 et 3. S’agit-il du para-
diméthylbenzène, de l’ortho-diméthybenzène ou du méta-diméthylbenzène?

4) Donnez la formule brute des 7 molécules représentées ci-dessus.


Exercices d’application
5) Identifiez et nommez les fonctions présentes sur les molécules ci-dessous :

O
O

HO
N

Cinnamaldéhyde
O OH O
(composant principal de l’essence de cannelle)
Epothilone A
(produit bactérien naturel possédant une activité
anticancéreuse plus puissante que celle du taxol)
HO O

O
O
NH2
HO

O
H
N
H
Sérotonine
(neuromodulateur du système nerveux central)

Mévastatine
(métabolite fongique inhibant l’enzyme qui contrôle
la biosynthèse du cholestérol)
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