Où chercher des informations scientifiques 

?
Pour le domaine de connaissance de Santé, il existe des sources spécifiques recommandées pour la
recherche d'informations qui sont exposées ci-après :

PubMed
Le PubMed est un moteur de recherche d'accès libre à la base de données MEDLINE pour la
recherche d'articles scientifiques dans le domaine biomédical. Il s'agit d'un service offert par la
Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis (National Library of Medicine, NLM) en tant que
partie du plan Entrez (Global Query Cross-Database Search System) du Centre national d'information
biotechnologique (National Center for Biotechnology Information, NCBI) du NLM et des instituts
nationaux de santé (National Institutes of Health, NIH). On estime que la banque de données de
MEDLINE couvre environ 4 800 revues publiées aux États-Unis et dans plus de 70 pays du monde
entier. L'adresse Internet est : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

Avant de commencer ce paragraphe, il convient de noter qu'il n'existe pas une manière correcte pour
rechercher dans le PubMed. Cela dépendra de l'expertise, la créativité et le goût de chaque chercheur
qui s'acquiert par le biais de la pratique et du niveau de connaissance concernant le sujet de la
recherche. Toutefois, vous trouverez ci-après quelques lignes générales qui peuvent servir d'aide aux
personnes qui ne connaissent pas le fonctionnement de ce système.

a) En tentant sa chance.

Une recherche à travers PubMed repose essentiellement sur l'utilisation de mots-clés ou d’éléments
descriptifs qui s’écrivent sur la ligne de commande et qui peuvent être nuancés et combinés selon les
intérêts personnels. Dans l'exemple qui est présenté ci-après, on propose l’un des moyens les plus
élémentaires de recherche à travers ce système.

Exemple :
Supposons que la personne veuille apprendre au sujet de la transplantation de cellules souches dans
le traitement du diabète. La première chose qu’elle doit faire est de localiser ses mots-clés :
transplantation, stem cells, et diabète. Il faudra les introduire sur la page principale de PubMed
comme on le voit sur la figure.
Après avoir cliqué surSearch le système donnera par défaut une liste des 20 plus récentes
publications dans le domaine. De plus, dans le coin supérieur gauche, on indique le nombre total
d’enregistrements trouvés. Pour cette recherche, c’était 907. Dans la zone supérieure droite, le résultat
de filtrage apparaît en trois groupes : le nombre total (907), le nombre de révisions (347) et le nombre
total de publications dont le texte complet est accessible (272). Le PubMed aide également à la
recherche des documents dans lesquels les termes recherchés apparaissent dans le titre (et par
conséquent le PubMed interprète qu’ils peuvent être pertinents pour la recherche). N’oubliez pas que
dans cette modalité le PubMed localise les termes introduits dans toute partie du document
enregistré (title, authors, key-words, abstract, journal, etc.), comme le montre la figure.
b) En optimisant la recherche.

Il convient de connaître la logique de PubMed pour la recherche. PubMed offre divers filtres à travers
un système de recherche avancée (PubMed Advanced search) dans lequel on peut introduire divers
filtres pour affiner la recherche en utilisant diverses étiquettes. D'autre part, il est possible de faire
usage des termes spécialisés à travers le Medical subject headings (MeSH) ou à travers le moteur de
recherche de revues et d'auteurs. Il faut tenir compte que dans une recherche sans étiquettes,
PubMed recherchera le terme dans tous les champs. Par conséquent, on étend la possibilité de
registres mais il est également plus probable de trouver des registres qui n’ont pas d'intérêt pour la
recherche en cours. Toutes les informations sur ces aides, outre d’être disponibles dans les tutoriels
pour les utilisateurs sont des éléments qui s’acquièrent avec la pratique.

c) Choix des termes appropriés.

Pour mener à bien une recherche à travers la plupart des champs de PubMed (y compris le titre, le
résumé ou les termes MeSH d'un article) il faut écrire les termes en anglais. Il est également
important de prendre soin à l'utilisation des accents et des lettres qui ne sont pas d'usage dans le
vocabulaire anglo-saxon. Cela est particulièrement important dans la recherche d'auteurs avec des
noms qui peuvent contenir ce type de lettres. Dans la mesure du possible, il est recommandé d'éviter
l'utilisation de tildes et de remplacer le n par ñ lorsque nécessaire. Lorsque l'on veut trouver une
phrase exacte, il faut la mettre entre guillemets, dans le cas contraire le système comprendra qu'il faut
chercher chaque terme séparément. Autrement dit, si l'on recherche cancer du poumon, il est
recommandé d'introduire “lung cancer” et non pas lung cancer.

d) Les termes MeSH.

Le système de recherche de PubMed identifie de façon automatique les termes MeSH ou synonymes
associés qui coïncident avec les termes d’une recherche. Cependant, il est très utile de savoir utiliser
ces termes en premier lieu. Le thésaurus MeSH contient environ 22 000 termes de ce type. Ces
derniers sont organisés de façon hiérarchique, des plus généraux aux plus spécifiques. Par le biais du
PubMed, il est possible d'accéder au MeSH Database où sont organisés tous les termes MeSH et où
l’on peut faire une recherche systématique à partir de ceux-ci comme le montre la figure.

Il convient de mentionner que la recherche en utilisant les paramètres du MeSH est un outil de plus.
Son utilisation n'est pas une garantie nécessaire d'une recherche plus exhaustive ou précise. Par
conséquent, la recommandation reste celle de l'utilisation de plus d'une stratégie de recherche et de
l'expérience. Par ailleurs, le système de MeSH n'est pas totalement infaillible et peut avoir des
contraintes et des lacunes importantes. Par exemple, comme il a déjà été évoqué dans le PubMed,
pas toutes les citations sont assignées à des termes MeSH, ce qui peut entraîner des lacunes ou des
erreurs au moment de lancer une recherche.

e) Limite par périodes de publication.

On peut restreindre la recherche de travaux publiés à une période de temps déterminée. Cela peut se
faire par le biais de l'option de recherche avancée ou bien directement sur le moteur de recherche en
utilisant l'étiquette [dp] à la suite de l'année de publication que l’on souhaite obtenir (par exemple,
1977[dp]) ou de la période d’années sur laquelle on souhaite réaliser cette recherche (par exemple,
1977:1987[dp]). Exemple : Dans le cas présenté ci-après, on a fait une recherche pour des travaux
effectués sur les embryons en 1938. Dans la case de recherche, on voit que l’on a introduit le terme de
recherche embryo suivi de l'année 1938 et de l'étiquette [dp]. PubMed a affiché 9 registres pour cette
recherche comme le montre la figure.
f) Articles connexes.

Dans le résultat d'une recherche, on trouve après chaque référence le lien related citations. À travers
celui-ci, on peut accéder à des articles sélectionnés par PubMed qui, de par leur structure ou système
de citation peuvent être étroitement associés à l'article que vous cherchez ou aux dossiers que le
système offre à partir de certains paramètres de recherche. La sélection peut être fondée sur
l'existence de mots communs dans les titres, les résumés et termes MeSH des travaux en question.
Les articles liés peuvent être organisés sur une nouvelle page en ordre décroissant d’association avec
le premier trouvé.

g) Limites de recherche.

Un des outils les plus puissants que possède le PubMed est l'option de recherche limitée. Cette option
est accessible par le biais de l'option limits de la zone de recherche. Les limites permettent d'établir
une série de critères qui permettent l'ajustement personnalisé de la recherche. Ces critères sont les
suivants :

– Date de publication ou paramètre temporaire pour la recherche.

– Type de document (lettres, méta-analyse, articles, révisions ou autres).
Langue Cela indique la langue dans laquelle le document a été publié.

(Il ne faut pas oublier que même si le document a été publié dans une autre langue, sa recherche dans
PubMed sera toujours en anglais).

– Espèces. Cela permet de distinguer les études qui ont été réalisées chez l'homme de celles
effectuées sur des animaux.
 Genre. Cela permet de distinguer si l'étude a été fait avec des femelles ou des mâles.
– Sous-groupes. Cela permet d'organiser la recherche en fonction d'un groupe de revues (revues
du domaine de soins infirmiers, de psychiatrie, clinique ou autres).
Âge. Cela permet d'organiser les documents en fonction du groupe d'étude (adultes, enfants,
adolescents ou autres).
Options du document. Cela permet d'accéder uniquement à des articles de libre accès ou d’accès
restreint.
Type d'enregistrement. Si l’on recherche des articles, des brevets, des formules, des séquences
génétiques ou autres.

ISI Web of Knowledge (ISI-WOK)

L'ISI Web of Knowledge (ISI-WOK) est une autre base de données universitaires en ligne développée
par le Thomson Scientific's Institute for Scientific Information. À la différence de PubMed, l'accès au
WOK est soumis à un abonnement. Toutefois, une des principales vertus de l'ISI-WOK et qui le
différentie de PubMed est de gérer plusieurs bases de données indépendantes : le Web of Science, qui
inclut le Science Citation Index (SCI), le Social Sciences Citation Index (SSCI) et le Arts and
Humanities Citation Index (A&HCI), le Current Contents Connect, le Derwent Innovations Index, le
MEDLINE et le Journal Citation Reports. De cette manière l'ISI-WOK couvre plus de 10 000 revues de
science, technologie, sciences sociales, arts et sciences humaines. La page web est :
http://wokinfo.com/

Excerpta Medica / EMBASE

Excerpta Medica est une base de données éditée dans les Pays-bas depuis 1948, elle constitue avec
l'Index Medicus l’une des bases de données les plus importantes dans le domaine des sciences de la
santé. Toutefois, contrairement à la ressource précédente, elle possède un caractère hautement
sélectif et analytique de sorte qu'elle inclue seulement les publications de plus haut niveau. Elle couvre
environ 4 500 revues et ouvrages. EMBASE est une plate-forme de recherche spécialisée de la base
de données Excerpta Medica, développée par Elsevier qui contient plus de 11 millions de documents
depuis 1948 jusqu'à aujourd’hui. Elle couvre des publications de 70 pays. La base de données est
accessible par Internet mais elle nécessite un abonnement préalable. Le site web est :
http://www.embase.com/

Dialnet
Dialnet est un portail de diffusion de la production scientifique principalement en espagnol. Il a
commencé à fonctionner en 2001 en se spécialisant en sciences humaines et sociales. Sa base de
données, d'accès libre a été créée par l'Université de La Rioja (Espagne) et constitue une
hémérothèque virtuelle qui contient les index de revues scientifiques et humanistes d'Espagne et
d'Amérique latine, y compris des livres (monographies), des thèse de doctorat, des hommages et
d’autres types de documents. De nombreux documents sont disponibles en ligne. Même s’il ne s'agit
pas d'une base de données spécialisée dans le domaine biomédical, elle rassemble une grande partie
du matériel bibliographique dans le domaine de la bioéthique, l'éthique de la santé et la déontologie
scientifique et médicale. Le site web est : http://dialnet.unirioja.es/
 LILACS / SciELO
La LILACS (Literatura Latino-Americana e do Caraïbes em Ciências da Saúde) est une base de
données bibliographiques en ligne pour le domaine de médecine et de sciences de la santé,
développée par le BIREME (Centre latino-américain et des Caraïbes de l'information en sciences de la
Santé), ayant son siège à Sao Paulo, Brésil. Elle rassemble des publications qui ont été introduites
dans le MEDLINE et qui font partie des publications scientifiques de la région latino-américaine. Par la
suite, la plate-forme SciELO (Scientific Electronic Library Online ou bibliothèque scientifique
électronique en ligne) a été créée. Il s'agit d'un projet de bibliothèque électronique développée
initialement par la FAPESP (Fundação d'Amparo à Pesquisado Estado de São Paulo) et du BIREME
auxquelles au fil des années d'autres institutions internationales se sont ajoutées. SciELO permet la
publication électronique d'éditions complètes de revues scientifiques, elle facilite également l'accès
par le biais de divers mécanismes, y compris par listes de diplômes et par matière, par index d’auteurs
et de matières et par moteur de recherche. Les principaux pays participants au projet sont : Argentine,
Brésil, Chili, Colombie, Cuba, Espagne et Venezuela et dans une moindre mesure, Costa Rica, Mexique,
Pérou, Portugal et Uruguay. Le site web est : http://www.scielo.cl/

Autres sources bibliographiques en santé

• MEDLINE (littérature internationale en sciences de la santé).
• ADOLEC (santé à l'adolescence).
• COCHRANE (sources d'information de référence en soins de santé).
• ERIC (moteur de recherche d'informations dans le domaine de l'éducation).
• HISA (histoire de la santé publique d'Amérique latine et des Caraïbes.
• MEDCARIB (littérature des Caraïbes en sciences de la santé).
• BIOÉTHIQUE (Base de données du programme régional de bioéthique de l'OPS/OMS.
• PAHO (catalogue de la bibliothèque du siège de l'OPS).
• PROQUEST (collection clinique et biomédicale).
• WHOLIS (système d'information de la bibliothèque de l'OMS).

Références bibliographiques

Livres
[1] Vivanco, L. (2009). Metodología de la investigación científica aplicada a las ciencias biomédicas.
España: Funiber.

Internet:
[1] Biblioteca Virtual en Salud. Liens web : http://bvsalud.org/