Cycle

 pluridisciplinaire  d’études  supérieures,  L2  

Écologie  
Enseignant  :  David  Claessen  
 Centre  de  forma4on  s  sur  l'environnement  et  la  société  (CERES)    
et  Ins4tut  de  Biologie  de  l’ENS  (IBENS)  
École  normale  supérieure,  24  rue  Lhomond,  75005  Paris  
 
25  janvier  2016  
Qu'est-­‐ce  que  l'écologie  ?    
Qu'est-­‐ce  que  l'écologie  ?    

Donner  une  ou  plusieurs  défini4ons  

 Objec4f  du  cours  
•  Concepts  et  idées  fondamentaux    
–  de  l'écologie  générale,  
–  allant  de  l'écologie  évolu4ve  à  l'écologie  
fonc4onnelle    
•  Les  processus  écologiques  
–  examinés  aux  différentes  échelles,    
–  de  l'individu  dans  son  environnement  aux  
écosystèmes  en4ers    
Time  and  space  scales  of  
the  boreal  forest  and  their  
rela4onship  to  some  of  the  
processes  that  structure  
the  forest.  These  processes  
include  insect  outbreaks,  
fire,  atmospheric  
processes,  and  the  rapid  
carbon  dioxide  increase  in  
modern  4mes.  Contagious  
mesoscale  disturbance  
processes  provide  a  linkage  
between  macroscale  
atmospheric  processes  and  
microscale  landscape  
processes.  Scales  at  which  
deer  mouse,  beaver,  and  
moose  choose  food  items,  
occupy  a  home  range,  and  
disperse  to  locate  suitable  
home  ranges  vary  with  
their  body  size.  
 Forme  d’enseignement    
•  Cours  magistraux,    
•  Analyse  d’ar4cles  scien4fiques,    
•  Exercices  en  modélisa4on    

•  Textbooks:  
–  Robert  Barbault,  (2008)    
Écologie  générale  :  Structure  et  fonc2onnement  de  la  biosphère.    
Sciences  Sup,  Dunod.  -­‐  6ème  edi4on  
–  Begon,  M.,  Townsend,  C.  R.  and  Harper,  J.  L.  (2005)    
Ecology  –  From  Individuals  to  Ecosystems    
(4th  edi4on).  Blackwell  Scien4fic  Publica4ons,  Oxford.  
 Planning  
Introduc4ons  des  concepts  :    
Ecologie,  environnement,  écosystème,  popula4on,  individu,  évolu4on,  biodiversité,  fitness  ;  la  
méthode  scien4fique  en  écologie  
Organismes  dans  leur  environnement  :    
Niche  ;  condi4ons  ;  ressources  ;  life  histories  ;  compé44on  intra-­‐spécifique  ;  dynamique  de  
popula4ons  I  (régula4on)  
Interac4ons  entre  espèces  :    
Interac4ons  :  compé44on  inter-­‐spécifique,  préda4on,  mutualisme,  parasi4sme  ;  dynamique  de  
popula4ons  II  (fluctua4ons,  bistabilité)  réseaux  trophiques  :  producteurs,  consommateurs,  
detri4vores,  decomposeurs  ;  cascades  trophiques  
Communautés,  écosystèmes  :    
L'environnement  physique  et  chimique  ;  structure  spa4ale  et  temporelle  ;  diversité,  stabilité,  
produc4vité,  résilience  ;  flux  d'énergie  et  cycle  des  nutriments  
Présenta4on  de  méthodes  pour  l'écologie  :    
Expérimenta4on  en  écologie  ;  modélisa4on  ;  sta4s4ques  ;  capture-­‐marquage-­‐recapture  ;  
méthodes  moléculaires  
Ecologie  et  évolu4on  :    
Le  concept  de  fitness  (II)  ;  adapta4on  ;  Darwinisme  ;  modélisa4on  de  l'évolu4on    
 Ecologie  comme  une  science  de  la  
nature  
•  Ecologie  =  
–  L’étude  des  rela4ons  des  organismes  avec  leur  
environnement  
–  L’étude  des  interac4ons  qui  déterminent  la  
distribu4on  et  l’abondance  des  organismes  
–  L’étude  des  écosystèmes  
•  De  la  physiologie  à  la  biogéographie  
•  Histoire  naturelle,  théorie  des  systèmes,  
théorie  de  l’évolu4on  
Interac4ons  :  réseau  trophique  
Un  peu  d’épistémologie  
 L’écologie  touche  à  l’homme  et  au  social  
Structure  épistémologique  

Deux  grands   Les  grands  

axes   types  de  
mécanismes  
ou  
phénomènes  
 Ecologie  de  popula4ons  
•  Animales,  plantes,  microbienne…  
•  Dynamique  
•  Vital  rates  
–  Reproduc4on,  survie,  croissance,  …  
–  «  processus  biodémographiques  »  
 Ecologie  d’écosystèmes  
•  Objets:  écosystèmes,  paysages  
•  Pas  100%  biologiques  
•  Cycle  de  la  ma4ère,  flux  d’énergie  
•  Processus  de  décomposi4on,  produc4on,  
transferts,  recyclage  
•  Cycles  biogeochimiques  
 Science  appliqué  
•  Problèmes  liés  à  la  sauvegarde,  
l’aménagement  ou  l’exploita4on  des  
écosystèmes  
•  Ressources  renouvelables  de  la  biosphère  
Ecologie  :  Quel  type  de  ques4ons?  
Quoi?  
Comment?  
Pourquoi?  

Quoi?  

«  Comment?  »  
•  Physiologie,  biologie  
cellulaire,  moleculaire:  
•  Causes  immédiates  
•  Analyse  de  processus  
 «  Pourquoi?  »  
 
•  Facteurs  historiques  
et  évolu4fs  
•  Causes  ul4mes  

•  Causes  immédiates:  écologie  d’écosystèmes  («  comment?  »)  

•  Causes  ul4mes:  écologie  évolu4ve  («  pourquoi?  »)  
 La  no4on  de  système  
•  Objet  immédiatement  
donné:  individu  
•  Sens  donné  par  le  
système  de  rela@ons  qui  
les  lient  
•  L’unité  fondamentale  des  
systèmes  écologiques:  la  
popula@on  :  «  l’ensemble  
des  individus  de  meme  
espèce  coexistent  dans  le  
milieu  considéré  »  
•  Exemples…  
 Systèmes  écologiques  évoluent…  
•  Les  systèmes  peuvent  changer,  transformer,  
disparaître  :  sujet  de  ce  cours  
•  Evolu4on  darwinien  
•  Les  popula4ons  évoluent    
–  Dynamique  de  l’effec4f,  démographie    
–  Dynamique  géné4que,  adapta4on,  sélec4on  
naturelle  à  «  Evolu@on  »  
 Equilibre  de  la  biosphère  
•  L’espèce  humaine,  impacte  planétaire  
–  Agriculture,  sylviculture,  pêche,  chasse,  élevage,  urbanisa4on  
•  «  gérer  la  Terre  »,  climat,  biodiversité,  pollu4ons,  etc  
•  Deux  grandes  types  de  processus:  

•  Dynamique  des  écosystèmes  (biosphère)  étroitement  liée  à  la  

dynamique  des  espèces  à  biologie  de  la  conserva4on  
 Equilibre  de  la  biosphère  (2)  
•  Dynamique  des  écosystèmes  (biosphère)  étroitement  liée  à  la  
dynamique  des  espèces  à  biologie  de  la  conserva4on  
•  Processus  élémentaires  assez  bien  connus  
•  Problème  est  de  comprendre  leur  effet  dans  le  monde  réel  :  
–  à  l’échelle  de  l’écosystème,  biosphère  
–  Des  systèmes  hétérogène,  variable  de  l’espace  et  le  temps  
–  Microsite  –  Parcelle  –  écosystème  –  biosphère    
–  Processus  opérant  sur  des  échelles  de  temps  et  espace  très  variables  
•  Défi  :  développer  des  approches  intégrées  qui  permerent  de  
modéliser  la  dynamique  d’ensemble  avec  un  bon  degré  de  
prévisibilité  
 
 Probléma4que  interdisciplinaire  
•  Problèmes  d’environnement  
–  Changement  clima4ques,  pollu4on,  
érosion  de  la  biodiversité  
–  Problèmes  de  société  
•  L’écologie  est  une  des  sciences  de  
l’environnement  
•  L’écologie  moderne  a  «  oublié  »  
l’espèce  humain  
•  L’écologie  des  écosystèmes  et  
paysages  n’est  pas  une  spécialité  de  
la  biologie:  couvre  tous  les  sciences  
de  la  nature  et  touche  aux  sciences  
de  la  société  
 GENES  

SPECIES  

FUNCTIONS  
La biodiversité et ses multiples fonctions
Qualité  de  l’eau  
Qualité  de  l’air  
Cycle  de  l’eau   Régula@on  clima@que  
Recyclage  des    
Stabilité  des  sols  
nutriments  
Séquestra4on  du     Energies  
GENES   carbone   fossiles  

Milieu  géochimique   Ma@ères  

ESPECES   premières  
Produc4on  
primaire   Fer@lité  
des  sols  
FONCTIONS   Pollinisa4on  
Produc@vité  
Interac4ons   agricole  
trophiques  
Transmission     Résistance  aux  invasions  
des  pathogènes  
Risque  épidémique  
Pharmacologie  
Ecosystem  services  and  their  global  status  
Ecosystem  services  and  their  global  status  
 Combien  d’espèces  dans  le  système  Terre  ?  
Comment  sont-­‐elles  distribuées  ?  

Dans  quelles  fonc@ons  

sont-­‐elles  impliquées  ?  

Sont-­‐elles  interchangeables  ?  

Comment  leurs  communautés  répondent-­‐elles  aux  changements  de  

l’environnement  ?  Comment  ces  réponses  rétrocontrôlent-­‐elles  
l’environnement  ?