Alphafold
Par Yoakim Galipeau-Théberge, 2211996
introduction
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Plan de la présentation
• Les protéines, et la complexité de la prédiction du pliage des protéines
• Les algorithms
Impacts
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Les protéines
• Définitions
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• À l'intérieur de chaque cellule de votre corps, des milliards de
minuscules machines moléculaires travaillent dur. Ce sont ce qui
permet à vos yeux de détecter la lumière, à vos neurones de tirer et de
lire les « instructions » de votre ADN, ce qui fait de vous la personne
unique que vous êtes.
Ces machines exquises et complexes sont des protéines. Ils sous-
tendent non seulement les processus biologiques de votre corps, mais
aussi chaque processus biologique de chaque être vivant. Ce sont les
éléments constitutifs de la vie.
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• L'attraction et la répulsion entre les 20 différents types d'acides aminés
font plier la corde dans un exploit d'« origami spontané », formant les
boucles, les boucles et les plis complexes de la structure 3D d'une
protéine.
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Les acides aminés https://www.nature.com/scitable/topicpage/protein-structure-
14122136/
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https://sitn.hms.harvard.edu/flash/2010/issue65/
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L’origine de l’intelligence artificielle
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Les 3 types d’algorithmes
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À base de règle fixes
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Appprentissage profond (deep learning)
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L’impact
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• Actuellement, il y a environ 230 millions de protéines dans UniProt,
avec des millions d'autres cataloguées chaque année. Chacun a une
forme 3D unique qui détermine comment il fonctionne et ce qu'il fait.
AlphaFold DB offre maintenant une prédiction de ce à quoi pourrait
ressembler chacune des plus de 200 millions de protéines connues
dans UniProt.
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