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DMONSTRATEUR PR-INDUSTRIEL

EN MTAGNOMIQUE QUANTITATIVE ET FONCTIONNELLE

METAGENOPOLIS
Une rvolution
Le microbiote au cur du bien-tre et de la sant humaine.

avnement de la mtagnomique a boulevers la communaut scientique en rendant possible lexploration des milliards de bactries qui peuplent notre ore intestinale aussi appele microbiote. Rcemment, lanalyse de ces bactries a permis de rvler le rle du microbiote intestinal sur la sant et le bien-tre de lhomme.

millions 19 dEuros

Face ces nouvelles perspectives, le projet MetaGenoPoliS (MGP), nanc hauteur de 19 millions deuros par les investissements davenir, met disposition de la communaut scientique et industrielle son expertise et ses outils dans ce domaine.

Un objectif

Se donner les moyens de reprogrammer le microbiote intestinal des ns nutritionnelles prventives ou thrapeutiques.

Une dmarche

De la recherche fondamentale la recherche translationnelle : Des projets collaboratifs dans le domaine mdical et nutritionnel Pour des partenaires industriels et acadmiques

Des applications
Prvention, diagnostic, thrapeutique, nutrition alimentaire
Cration de prols mtagnomiques et stratication de cohortes de sujets sains ou malades Identication de biomarqueurs de risque de la maladie Stratication des bons et mauvais rpondants un traitement pour une mdecine personnalise Suivi de lvolution du microbiote des patients Analyse des mcanismes dinteractions microbiote hte dans la maladie et la sant Analyse dcosystmes complexes de produits alimentaires Amlioration des qualits nutritionnelles et de la scurit microbiologique Analyse du microbiote des animaux Amlioration des performances dlevage, dans ses aspects production, sant et effets sur lenvironnement Modles pour lhomme Identication de fonctionnalits microbiennes dintrt (anti-inammatoires, anti-prolifratives, satitognes,) Probiotiques Stratgies de slection de supplments nutritionnels ou daliments fonctionnels apportant des bnces cibls Recommandations nutritionnelles

Unique en Europe
Haut dbit et la pointe
Un nancement public global de 25M quipements la pointe en squenage, criblage, imagerie, informatique Dveloppements techniques (automatisation, logiciels) Mthodes benchmarkes au niveau international

Une quipe dexcellence


pluridisciplinaire : mdecins, immunologistes, microbiologistes, statisticiens, informaticiens, reconnue : des responsables scientiques parmi les principaux auteurs mondiaux en cologie microbienne, obsit, diabte et microbiote H index de 69, 52, 37 et 24 performante : 700 publications

Haut dbit

Excellence

Performant

Unique

Un dispositif de collaboration performant et efficace


15 projets de recherche collaboratifs depuis 2008 Capacits - de 20 000 chantillons traits en 2012 100 000 en 2014 - de 2 500 squenages raliss en 2012 10 000 en 2017 - de 50 000 cellules cribles en 2012 500 000 ds 2014 LIMS "Laboratory Information Management System" Certication ISO 9001 en cours

Un assemblage unique de comptences


Biobanque Prparation des acides nucliques (ADN, ARN) Squenage Analyses fonctionnelles Analyses bioinformatiques et biostatistiques Ethique Nouveaux biomarqueurs, nouvelles fonctions, nouveaux produits, molcules potentiel thrapeutique, 5 demandes de brevet en 1 an

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4 plateformes innovantes
SAMBO
Biobanque
Comptences expertes sur la conception et la spcication dtudes cliniques, les standards de collecte et de stockage des chantillons fcaux humains et dADN drivs.
Prpare la cration dune biobanque nationale permettant de stocker et de manipuler plus dun million dchantillons Mthodes standardises et benchmarkes au niveau international Capacits : de 20 000 chantillons/an en 2012 100 000 en 2014

Mtagnomique fonctionnelle
tude des mcanismes et des interactions entre les bactries de lintestin et les cellules humaines, identication de bioactifs (criblage de bactries, gnes, molcules), biomarqueurs ou voies thrapeutiques. Expertise en microbiologie et biologie cellulaire
Rend possible lidentication des fonctions importantes du microbiote Capacits : de 50 000 cellules cribles en 2012 500 000 en 2014

METAFUN

METAQUANT

Mtagnomique quantitative
Cration de prols mtagnomiques haute rsolution dchantillons intestinaux humains et analyse bioinformatique et biostatistique permettant didentier des biomarqueurs et de dvelopper des modles diagnostiques/pronostiques. Utilisation de la technologie New Generation Sequencing (NGS)
Garantit la qualit des donnes.

Ethique

SOCA
Analyse de limpact socital et thique de la recherche en mtagnomique humaine.

Dveloppement dun ensemble doutils informatiques


Optimise la abilit et la vitesse danalyse de larges volumes de donnes.

Encadre les recherches et veille au respect de la dignit et des valeurs humaines

Expertise bioinformatique et statistique


Analyse performante et prouve de donnes volumineuses et htrognes. Capacits : de 2500 chantillons squencs en 2012 10 000 en 2017

Une offre de partenariats personnalise et volutive


En collaboration avec ses partenaires, MGP construit et dveloppe des projets adapts leurs besoins et leurs objectifs Fonds sur des technologies de pointe, les protocoles de recherche mis en uvre par MGP sont construits sur un savoir-faire prouv et suivent les avances technologiques

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Contact MGP : contact@mgps.eu

Les partenaires
LInstitut national de la recherche agronomique (INRA) hberge et coordonne le projet MGP qui fait suite aux dcouvertes issues des projets MetaHIT et MicroObes et conrme le rle pilote de lINRA dans la mtagnomique humaine. Deux partenaires d'excellence, aux comptences complmentaires, sont associs MetaGenoPolis : lInstitut de cardiomtabolisme et nutrition (ICAN) an de favoriser la recherche translationnelle et le dveloppement dune mdecine personnalise dans les pathologies cardiomtaboliques et les maladies lies la nutrition en gnral, lUniversit catholique de Lyon, et son groupe de recherche en pistmologie et thique des sciences et technologies qui intervient auprs des scientiques et mdecins impliqus dans les projets de recherche, veille au respect de lthique et tudie limpact socital des recherches en mtagnomique (plateforme SOCA).

INRA DOMAINE DE VILVERT Unit MGP - Btiment 325 78352 Jouy-en-Josas Cedex FRANCE Email : contact@mgps.eu Site internet : www.mgps.eu

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