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SOMMAIRE
Produire des connaissances - p5
Les arbres plus efficaces que les buissons pour lutter contre lrosion olienne des sols - p6
Les saumons recolonisent les zones nouvellement reconnectes dans les rivires du bassin de lAdour - p8
Pourquoi le cerveau a-t-il besoin des omga 3 ? - p10
De lintrt dune approche mtabolomique pour comprendre la rgulation de la biosynthse de trichothcnes B chez Fusarium
graminearum - p12
Le phosphore : une ressource limite et un enjeu plantaire pour lagriculture du 21me sicle - p14
Dcryptage des trois tapes de linvasion de la cochenille du pin maritime Matsucoccus feytaudi, responsable du dprissement de son
arbre hte dans le sud-est et en Corse - p17
La programmation nutritionnelle, une approche prometteuse pour amliorer lutilisation des nouveaux aliments chez la truite - p19
Colloque anniversaire des 20 ans du GIS Coop - p21
Le changement climatique affecte la slection sexuelle chez les truites - p23
Un partenariat CIRAD - Inra durable sur la gntique de leucalyptus - p26
Premires preuves exprimentales dun service de rgulation des insectes ravageurs forestiers par les chauves-souris - p28
La prsence de deux nouveaux virus de vigne identifis en France - p 30
Face au rchauffement, cultiver le Champignon de Paris, mme 25C - p32
Jeu minimal de gnes pour raliser la synthse de protines - p34
Nutrition et sant du cerveau : Cration dun laboratoire International Associ OptiNutriBrain - p48
LInra et le Conseil rgional dAquitaine signent une convention pluriannuelle de partenariat pour renforcer les capacits de recherche, de
formation et dinnovation - p49
Inauguration de deux infrastructures de recherche et dinnovation au service des filires Fort-bois en Aquitaine - p51
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR ISPA
CONTACT
Sylvain Dupont
sylvain.dupont@bordeaux.inra.fr
La revgtalisation des sols est une mthode courante pour limiter lrosion olienne dans
les rgions arides. En renouvelant la manire de modliser lrosion olienne en prsence de
vgtation, des chercheurs de lInra et du CNRS ont montr que les arbres sont plus efficaces que
les buissons pour rduire lrosion olienne des sols. Le modle dvelopp reprsente un outil
prometteur pour quantifier lrosion olienne des rgions semi-arides, lorigine de nombreuses
problmatiques environnementales. Ces travaux ont t publis dans le Journal of Geophysical
Research Earth Surface en fvrier 2014.
Lrosion olienne des sols correspond lentrainement de grains de sable par le vent
(saltation) et lmission de poussires dans latmosphre par impact de ces grains avec le sol.
La saltation peut endommager les cultures par abrasion, ensevelissement ou dracinement, et
former des dunes de sable en zones dsertiques. Lmission de poussires diminue localement
la fertilit des sols agricoles, et impacte globalement la formation des nuages et le bilan radiatif
terrestre. Ces poussires atmosphriques ont aussi des consquences sanitaires lies leur
inhalation par les tres humains, la propagation dagents potentiellement pathognes et la
dispersion de polluants. La revgtalisation des sols est une mthode courante pour rduire
lrosion olienne de rgions sujettes la dsertification, mais son efficacit suivant le type de
vgtation et leur arrangement nest pas encore bien connu. De plus, les modles actuels de
quantification de lrosion olienne sont peu adapts aux surfaces vgtales parses en raison
de leur reprsentation grossire du vent.
Produire des
connaissances
Les rgions semi-arides reprsentent une source importante de poussires pour latmosphre.
Contrairement aux rgions dsertiques, ces rgions sont caractrises par une vgtation
clairseme saisonnire. Ces recherches permettront de mieux quantifier les missions de
poussires issues de ces rgions. Ceci est dautant plus important que la perte en fertilit
des sols agricoles de ces rgions devrait saccentuer dans les annes venir sous leffet
combin du changement climatique et de la modification de lusage des sols lie aux activits
humaines. Ces rgions sont en effet des zones de transition climatique notamment en termes
damplitude et de frquence des prcipitations qui affectent le couvert vgtal des surfaces,
et donc lrosion olienne du sol. Elles sont aussi soumises une croissance importante de
la population conduisant des changements radicaux dans les usages des terres comme
lextension et lintensification des zones cultives.
RFRENCE SCIENTIFIQUE
Produire des
connaissances
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR ECOBIOP
cologie comportementale et
biologie des populations de
poissons
CONTACT
Philippe Gaudin
Philippe Gaudin@st-pee.inra.fr
Des chercheurs de lInra, de lUniversit Laval Qubec, du CIRAD et de lUniversit de Pau et des
Pays de lAdour ont tudi limpact de lamnagement de dispositifs permettant aux saumons de
franchir les barrages hydrolectriques et de recoloniser les zones nouvellement reconnectes dans
le bassin de lAdour. Ils ont montr grce des outils de gntique des populations que les sources
de recolonisation sont trs probablement les secteurs aval des obstacles amnags et que la perte
de diversit gntique est faible lors de la recolonisation des zones nouveau disponibles. Ces
rsultats laissent entrevoir un fort potentiel volutif des populations nouvellement formes.
Produire des
connaissances
Les auteurs de ce travail ont galement constat que le niveau de diversit gntique des
saumons chantillonns en amont des obstacles ne prsente pas de diminution significative
par rapport aux saumons prlevs en aval. Ces rsultats suggrent que les dispositifs de
franchissement sont non slectifs et suffisamment efficaces pour quil ny ait pas une
rduction artificielle de la diversit gntique des saumons dans les zones situes en amont.
Du point de vue de la prennit de la recolonisation, le maintien dun haut niveau de diversit
gntique est une condition essentielle pour le maintien dun potentiel volutif adquat au
sein de ces nouvelles populations. Des oprations de suivi dmographique sont galement
mises en uvre afin de dterminer la productivit des nouvelles populations et le caractre
prenne ou non de la recolonisation. Les meilleures zones de production de saumon se
trouvant dans les eaux froides et courantes localises en amont des rivires, il y a fort
parier que la recolonisation de ces zones la suite de lamnagement ou de leffacement des
barrages permettra un regain long terme de la productivit des populations de saumon.
Cette tude est donc trs encourageante, car elle atteste de lefficacit de lamnagement
et du dmantlement de certains obstacles hydrauliques pour faciliter ou restaurer la libre
circulation des poissons migrateurs, essentielle leur cycle de vie.
RFRENCE SCIENTIFIQUE
Produire des
connaissances
Perrier, C., Le Gentil, J., Ravign, V., Gaudin, P. & Salvado, J.-C. (2014), Origins and
genetic diversity among Atlantic salmon recolonizing upstream areas of a large South
European river following restoration of connectivity and stocking, Conservation Genetics,
115. doi:10.1007/s10592-014-0602-3
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR NUTRINEURO
Nutrition et neurobiologie
intgre
CONTACT
Sophie Lay
sophie.laye@bordeaux.inra.fr
Omga 3, omga 6 : comment agissent les acides gras polyinsaturs (AGPI) sur le cerveau ?
Sophie Lay, directrice Inra de lunit Nutrition et Neurobiologie Intgre (Inra, Universit de
Bordeaux) et Richard Bazinet, professeur lUniversit de Toronto font un point sur ltat des
connaissances scientifiques et mdicales du fonctionnement de ces AGPI dans le cerveau normal
et pathologique. Publie dans Nature Reviews Neuroscience le 12 novembre 2014, cette synthse
aborde galement les nouvelles pistes pour comprendre comment ces lipides protgent des troubles
neuropsychiatriques et des maladies neurodgnratives.
Inra
Thon, sardine, maquereau et tous les poissons gras en gnral mais aussi les huiles de noix,
de soja, etc. sont les principales sources domga 3, des acides gras polyinsaturs (AGPI).
Dans le cerveau, les principales formes dAGPI sont lacide docosahxanoque (DHA) pour
la famille omga 3 et lacide arachidonique (AA) pour la famille omga 6. Ces lipides sont
issus de prcurseurs fournis exclusivement par lalimentation qui parviennent au cerveau
par le sang. Si DHA et AA sont peu utiliss comme source dnergie dans le cerveau, ces
lipides et leurs drivs sont impliqus dans un certain nombre de processus comme la
neurotransmission, la survie des cellules, la neuro-inflammation et par consquent agissent
sur lhumeur et la cognition.
Produire des
connaissances
dans les membranes des cellules du cerveau. Cependant, leur entre dans le cerveau devant
rester constante pour viter les carences, les apports nutritionnels doivent rester appropris
la fois au cours du dveloppement et lge adulte.
En 2012, les chercheurs de lInra et de lUniversit de Bordeaux ont montr chez des souris
ges quun rgime enrichi en DHA dans le cerveau rduit la neuro-inflammation et la
survenue de troubles cognitifs (comme la perte de mmoire). Plus rcemment, les chercheurs
de lunit NutriNeuro ont confort ces observations laide dun modle de souris
transgniques prsentant des taux endognes dAGPI omga 3 plus levs dans le cerveau. En
provoquant une neuro-inflammation, ils ont montr que les souris transgniques prsentaient
des performances cognitives normales ainsi quune plasticit neuronale prserve, linverse
des souris tmoins.
Se protger de la dpression
Quels sont le rle et limplication des AGPI dans les pathologies neuropsychiatriques et
neurodgnratives ? De nombreuses donnes chez lhomme associent une diminution des
taux sanguins et crbraux des AGPI omga 3 la dpression, la schizophrnie ou la maladie
dAlzheimer. Des travaux rcents mens par les chercheurs de lunit NutriNeuro dcryptent
chez la souris comment des apports alimentaires dsquilibrs perturbent leur comportement
motionnel. Les scientifiques y dmontrent quune carence en AGPI omga 3 conduit un tat
de stress chronique et au dveloppement de comportement de type anxieux via la modulation
de la morphologie du cortex prfrontal. Leurs rsultats montrent galement le rle dun
rgime riche en omga 3 pour prvenir lapparition de la dpression (5). Ces observations
sont concordantes avec des essais cliniques mens avec des supplmentations alimentaires en
omga 3 qui rvlent une amlioration de lefficacit de certains traitements mdicamenteux,
ouvrant ainsi de nouvelles perspectives thrapeutiques. Lensemble de ces recherches vise
dterminer lapport nutritionnel en AGPI omga 3 adapt au fonctionnement optimum du
cerveau et sa protection, notamment face des vnements neuropathologiques.
11
Produire des
connaissances
RFRENCE SCIENTIFIQUE
Polyunsaturated fatty acids and their metabolites in brain function and disease
Richard P. Bazinet and Sophie Lay. Nature Reviews Neuroscience, en ligne le 12
novembre 2014. DOI: 10.1038/nrn3820
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UR MYCSA
Mycologie et scurit
des aliments
CONTACT
Florence Forget
florence.forget@bordeaux.inra.fr
La lutte contre la contamination des crales par des mycotoxines produites par les champignons
du genre Fusarium est un dfi majeur pour diminuer les pertes et contribuer la scurit
alimentaire mondiale. Des tudes globales de mtabolomique rvlent les rseaux de rgulation
mtabolique conduisant la synthse des toxines et ouvrent des perspectives didentification de
cibles fongiques pour la matrise du risque mycotoxique dans les grains.
Inra
Contexte et enjeux
12
Produire des
connaissances
Lespce fongique Fusarium graminearum est lun des agents principaux de la fusariose de
lpi, maladie des crales lorigine de pertes significatives de rendement. Mais surtout
F.graminearum produit plusieurs familles de mycotoxines, dont celle des trichothcnes de
type B. Ce sont des contaminants frquents des rcoltes cralires. Le doxynivalenol (DON)
accompagn de ses drivs actyls est le contaminant le plus frquemment observ dans les
rcoltes cralires en Europe. Si la voie de biosynthse des trichothcnes est lucide et les
paramtres environnementaux la contrlant en voie dtre bien dfinis, les mcanismes qui
sous-tendent sa rgulation sont encore trs mal compris. Les dernires avances scientifiques
mettent en vidence le rle de rgulateurs cellulaires centraux (homostasie redox, pH,
dveloppement, etc.) capables dinduire ou rprimer la voie de toxinognse et soulignent
la ncessit de dvelopper des tudes globales, intgrant aussi bien le mtabolisme fongique
primaire que le mtabolisme secondaire.
Rsultats
Grce une collaboration avec la plateforme mtabolome du CGFB, le mtabolome de
F.graminearum a t analys dans des conditions de culture induisant la toxinognse ou la
limitant (supplmentation par un antioxydant, lacide cafique). Le couplage des techniques
LC-MS et H-RMN a permis de suivre prs de 60 mtabolites au cours de cintiques de
croissance. Ces mtabolites comprenaient des mtabolites primaires (acides amins, sucres),
des mtabolites secondaires dont le DON et ses prcurseurs, diffrents alcalodes indoliques
et drivs polyactates. La comparaison du mtabolome de F. graminearum diffrents temps
de culture en prsence ou absence dacide cafique a permis didentifier des corrlations
entre voies mtaboliques et de proposer, pour la premire fois, une carte mtabolomique de
F. graminearum. Cette carte illustre limbrication trs troite du mtabolisme secondaire de
production de mycotoxines au sein du mtabolisme primaire et met en vidence des noeuds
de communication prpondrants dans ces rseaux.
Perspectives
Cette premire carte mtabolomique et les avances permises par cette approche originale
ouvrent des perspectives trs intressantes pour progresser dans la connaissance des
mcanismes de rgulation de la production de mycotoxines et en consquence, dans
lidentification de stratgies efficaces de matrise du risque de contamination des crales.
Cette tude sera largie un panel plus large de conditions inductrices ou inhibitrices de la
toxinognse mais aussi un set de diffrentes souches de F. graminearum prsentant des
niveaux contrasts de production de toxines
Valorisation
MycSA / Inra
RFRENCE SCIENTIFIQUE
13
Produire des
connaissances
Ces travaux ont t prsents aux journes Mycotoxines en 2014 et sont en cours
de publication.
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR ISPA
UMR ECO&SOL
(Montpellier)
cologie fonctionnelle et
biogochimie des sols
CONTACTS
Bruno Ringeval
bruno.ringeval@bordeaux.inra.fr
Philippe Hinsinger
philippe.hinsinger@supagro.inra.fr
Thomas Nesme
thomas.nesme@agro-bordeaux.fr
Sylvain Pellerin
sylvain.pellerin@bordeaux.inra.fr
Contexte et enjeux
14
Produire des
connaissances
Concernant les cosystmes peu anthropiss, leur rponse aux changements globaux lis
laugmentation de la teneur en CO2 de latmosphre et des retombes de N via les dpts
atmosphriques, est contrainte par les dsquilibres stchiomtriques induits vis--vis
dautres nutriments, et particulirement P. Ainsi les capacits de squestration de C et de
mitigation du changement climatique seraient infrieures ce que prdisent les modles
plantaires ne prenant pas en compte la contrainte de la faible disponibilit de P des sols de
nombreux cosystmes. La quantification de cet effet est un enjeu majeur pour la prdiction
du climat futur et llaboration de scnarios dattnuation.
Une approche par modlisation a t mise en uvre pour apporter des rponses ces deux
questions, aux chelles globales et nationales.
Rsultats
Les travaux de modlisation conduits lchelle plantaire ont montr quel point, quels
que soient les modles de changements climatiques pris en compte, la disponibilit de P
dterminait la production primaire et ainsi le stockage de C dans les cosystmes en rponse
ces changements. Ils ont rvl, contre toute attente, que cette contrainte par le P tait
moins forte dans les cosystmes tropicaux que dans le reste du monde.
15
Produire des
connaissances
Cet ensemble dvnements a constitu la Phosphorus Week 2014, organise par lInra et le
CIRAD, et qui a stimul les rencontres entre scientifiques de disciplines varies, des sciences
agronomiques, de lenvironnement, des procds et des sciences sociales et politiques,
couvrant lensemble du cycle et des usages du phosphore, au-del du seul secteur agricole.
Ils ont galement fait intervenir des porteurs denjeux, des secteurs politique et conomique,
dans les domaines de lagrofourniture, des biotechnologies, de lpuration des eaux, etc.
Perspectives
Le modle sur les flux de P lis lhistorique de fertilisation est actuellement utilis dans
le cadre dun projet de recherche dont lobjectif est didentifier les dterminants de la
teneur en phosphore des sols agricoles lchelle mondiale. Il sera appliqu quelques
pays contrasts afin dvaluer la dpendance de la fertilit P des sols et de la production
agricole actuelle au P dorigine anthropique en fonction de lhistorique agricole (anciennet
du recours la fertilisation de synthse notamment). Lobjectif est davoir une vision de la
dpendance de la fertilit P des sols aux apports dengrais de synthse lchelle globale.
Par ailleurs, ltude du rle de la disponibilit de P dans la modulation de la rponse des
cosystmes aux changements globaux est poursuivie dans un projet de recherche visant
affiner les prdictions dans diffrentes rgions du monde et pour diffrents types de biomes.
Lestimation de la disponibilit de P dans les sols ces chelles globales constitue ds lors un
vritable challenge pour ces modles plantaires.
Les spcialistes de P saccordent dire quil convient de faire merger une gouvernance
mondiale des ressources en phosphore, ncessitant au pralable un effort majeur de
communication et dducation de nos concitoyens, en vue dveiller la conscience collective
et la responsabilit des individus face cette problmatique globale. Ceci commence prendre
forme en Europe, au travers des activits de lEuropean Sustainable Phosphorus Platform.
Le prochain sommet mondial SPS5 aura lieu en Chine en 2016, avec le souci dy associer la
GPNM, Global Partnership for Nutrient Management, tandis que le prochain symposium
international PSP6 sera organis en 2018 en Belgique, avec le mme souci qu Montpellier
dimpliquer les chercheurs et porteurs denjeux des pays du Sud.
Inra
RFRENCES SCIENTIFIQUES
Penuelas, J., Poulter, B., Sardans, J., Ciais, P., van der Velde, M., Bopp, L., Boucher, O.,
Godderis, Y., Hinsinger, P., Llusia, J., Nardin, E., Vicca, S., Obersteiner, M., Janssens, I.
A. (2013), Human-induced nitrogen-phosphorus imbalances alter natural and managed
ecosystems across the globe. Nature Communications, 4. DOI: 10.1038/ncomms3934
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Produire des
connaissances
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR CBGP
(Montpellier)
Centre de biologie pour la gestion
des populations
URFM
(Avignon)
cologie des forts
mditerranennes
Des approches de gntique des populations couples des comparaisons de scnarios par des
approches Baysiennes ont permis de dcrypter les 3 tapes cls de la colonisation de M. feytaudi:
introduction accidentelle aprs guerre via le transport de bois en provenance de la fort des
Landes; diffusion naturelle de linsecte vers lEst dans les forts fragmentes de pin maritime;
transport accidentel longue distance par le vent dun petit nombre dindividus colonisateurs du Sud
Est vers la Corse.
UMR BIOGECO
Biodiversit, gnes et
communauts
CONTACTS
Carole Kerdelhu
Carole.Kerdelhue@supagro.inra.fr
Thomas Boivin
thomas.boivin@avignon.inra.fr
Christian Burban
Christian.Burban@pierroton.inra.fr
Contexte et enjeux
17
Produire des
connaissances
Rsultats
Lchantillonnage consquent, lutilisation de marqueurs microsatellites polymorphes
(Kerdelhu & Decroocq, 2006), et lanalyse comparative des scnarios possibles ont
clairement dmontr que la colonisation de la rgion sud-est et de la Corse par la cochenille
du pin maritime a eu lieu en trois tapes, impliquant des modes de dispersion et des
dynamiques diffrentes. La cochenille est arrive dans le Sud Est de la France depuis la
fort des Landes, probablement juste aprs la Deuxime Guerre mondiale. Nous navons pas
mis en vidence deffet fondateur marqu, ce qui suggre quun grand nombre de larves ou
dadultes ont t imports de manire rcurrente avec des grumes en provenance des Landes,
probablement lors de la reconstruction daprs-guerre. Cette hypothse est cohrente avec
le fait que les pins des Landes sont naturellement rsistants la cochenille, qui na donc pas
pu tre dtecte prventivement. La progression de linsecte vers lItalie sest faite par une
expansion diffusive, par dispersion naturelle de linsecte (vol actif des mles et transport
des larves par le vent) entre patchs de pins maritimes, dont la distribution est fragmente
dans cette partie de son aire. Enfin, nos analyses montrent que la colonisation de la Corse
na impliqu quun faible nombre dinsectes colonisateurs, en provenance du sud-est de la
France et de Ligurie. Ce rsultat, coupl au fait que le premier foyer ait t dcouvert loin des
infrastructures portuaires et routires, suggre une arrive accidentelle en Corse de quelques
larves emportes par le Mistral, vent dominant qui souffle du nord vers le sud dans cette
rgion au printemps. Ces rsultats ont t publis en 2014 (Kerdelhu et al., 2014).
Perspectives
Arte / Inra
Ces rsultats montrent toute la complexit des scnarios invasifs. Lactivit humaine peut tre
lorigine de colonisations dvastatrices, en particulier lorsque les plantes htes de la zone
dorigine sont rsistantes au ravageur et donc asymptomatiques. Dans le cas de M. feytaudi,
la premire rgion historiquement envahie a servi de tte de pont (Lombaert et al., 2010),
et de point de dpart la colonisation de la Corse. Les pins maritimes de Tunisie et dAlgrie,
galement sensibles, pourraient dsormais tre menacs.
RFRENCE SCIENTIFIQUE
18
Produire des
connaissances
Kerdelhu C, Boivin T, Burban C (2014). Contrasted invasion processes imprint the genetic
structure of an invasive scale insect across southern Europe. Heredity 113(5): 390-400.
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UR NUMEA
Nutrition, mtabolisme,
aquaculture
CONTACTS
Stphane Panserat
stephane.panserat@st-pee.inra.fr
Inge Geurden
Inge.Geurden@st-pee.inra.fr
Les nouveaux aliments base de plantes (riches en glucides et de faible apptence) rduisent la
croissance des poissons dlevage. Lexposition prcoce ds le premier repas un stimulus court
avec glucides alimentaires a entran des changements persistants dans lutilisation mtabolique
du glucose au stade juvnile. De la mme faon, lalimentation prcoce avec un aliment base de
plantes pendant 3 semaines a permis la truite adulte de mieux accepter les nouveaux aliments
(meilleures prise alimentaire et efficacit alimentaire). Dautres fentres dexposition des
stimuli prcoces, par exemple la priode de dveloppement embryonnaire, semblent galement
prometteuses, comme lindiquent nos premires expriences dinjections de glucose dans les ufs
de poisson-zbre. Le concept de programmation nutritionnelle chez les poissons est donc valid et
ouvre de nouvelles perspectives en nutrition des poissons.
Contexte et enjeux
Laquaculture connat un essor remarquable depuis une vingtaine dannes, fournissant en
2010 prs de 50% des produits aquacoles pour la consommation humaine. Afin dinscrire
la production de poissons dans une optique de durabilit, il devient ncessaire de proposer
de nouvelles stratgies alimentaires pour saffranchir des ingrdients dorigine marine
dans laliment aquacole. Chez les mammifres, il est dsormais largement admis que des
vnements nutritionnels prcoces peuvent modifier de faon permanente la physiologie
et le mtabolisme de lorganisme (Lucas, 1998). Bases sur ce concept, deux approches de
programmation nutritionnelle cibles sur un nutriment spcifique (glucose) ou sur un
aliment (aliment vgtal) ont t mises en place dans lunit de recherche Inra NUMEA
(Saint-Pee-sur-Nivelle).
19
Produire des
connaissances
Rsultats
Perspectives
La programmation nutritionnelle est maintenant un concept applicable chez la truite mais
aussi chez dautres espces de poissons comme lindiquent des donnes rcentes obtenues
chez le bar europen et la daurade royale. Afin de dvelopper et piloter cette approche de
programmation nutritionnelle comme nouvelle stratgie alimentaire chez les poissons
dlevage, il est toutefois fondamental de comprendre les mcanismes lorigine de cette
programmation parmi lesquels lpigntique est probablement lun des acteurs majeurs.
RFRENCES SCIENTIFIQUES
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Produire des
connaissances
Geurden I, Mennigen J, Plagnes-Juan E, Veron V, Cerezo T., Mazurais D, ZamboninoInfante J, Gatesoupe J, Skiba-Cassy S, Panserat S (2014) High or low dietary carbohydrate:
protein ratios during first-feeding affect glucose metabolism and intestinal microbiota in
juvenile rainbow trout. J exp Biol 217 : 3396-3406
Lucas A (1998) Programming by early nutrition: an experimental approach. J Nutr. 128(2
Suppl): 401S-406S.
olakof S, Panserat S, Soengas J, Moon TW (2012) Glucose metabolism in fish : a review. J
P
Comp Physiol B 182:10151045.
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR LERFOB
(Nancy)
Laboratoire dtude des
ressources fort-bois
Lobjectif du colloque tait, dune part, de faire connatre le GIS Coop un large public (dcideurs
politiques, directeurs dorganismes forestiers et chercheurs) et, dautre part, didentifier les enjeux
et perspectives pour le GIS Coop dans le contexte actuel des changements environnementaux et
des nouvelles demandes socitales. Le colloque sest droul sur 2 journes : les 2 et 3 octobre 2014.
UMR BIOGECO
Biodiversit, gnes et
communauts
UE Fort Pierroton
CONTACTS
Ingrid Seynave
seynave@nancy.Inra.fr
Cline Meredieu
Celine.Meredieu@pierroton.inra.fr
Patrick Pastuszka
Patrick.Pastuszka@pierroton.inra.fr
BIOGECO / Inra
Contexte et enjeux
Le Groupement dIntrt Scientifique (GIS) Cooprative de donnes sur la croissance des
peuplements forestiers a ft ses 20 ans. Sous lgide du Ministre charg de lagriculture et
de la fort, sept organismes mutualisent leurs moyens et leurs comptences pour installer
et grer des dispositifs exprimentaux, recueillir et mettre en commun des donnes sur la
croissance des peuplements forestiers. Ils contribuent ainsi llaboration de modles de
dynamique forestire intgrs dans la plateforme de simulation CAPSIS. Par ailleurs, ses
rseaux servent de rfrences techniques pour les prescripteurs en sylviculture. Aprs 20 ans
de fonctionnement et face un contexte climatique changeant, le GIS Coop a prsent ses
principales valorisations scientifiques et techniques ainsi que les potentialits de ses rseaux
dexprimentations sylvicoles.
Rsultats
21
Produire des
connaissances
Ces deux journes ont permis de toucher un public trs vari : plus de 80 personnes, issues
des Ministres en charge de la fort et de lenvironnement, dorganismes de recherche,
denseignement, de dveloppement et de gestion forestire pour les forts prives et publiques,
ont particip ce colloque.
Perspectives
Suite ce colloque et pour continuer mieux faire connatre les rseaux du GIS Coop,
plusieurs actions sont prvues :
ralisation dun site internet propre
diffusion, par courrier et via les sites internet du GIS et de ses membres, de la
plaquette de prsentation du GIS Coop
rdaction dun article de prsentation des rseaux dans une revue scientifique
faisant suite la publication de vulgarisation technique (Bdeneau et al. 2001) et
sappuyant sur les travaux scientifiques publis de valorisation (Meredieu et al. 2003
ou Trouv et al. 2014)
RFRENCES SCIENTIFIQUES
Trouve R., Bontemps J.D., Collet C., Seynave I., Lebourgeois F. 2014. Growth partitioning
in forest stands is affected by stand density and summer drought in sessile oak and Douglasfir. Forest Ecology and Management, 334, 358-368.
BIOGECO / Inra
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Produire des
connaissances
Bdeneau M., Sindou C., Ruchaud F., Bailly A., Crmire L. 2001. Un partenariat scientifique
original : la cooprative de donnes sur la croissance des arbres et peuplements forestiers.
Revue Forestire Franaise, 53, 177-171.
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR ECOBIOP
cologie comportementale et
biologie des populations de
poissons
CONTACTS
Dans le cadre du changement climatique, des chercheurs de lInra ont tudi leffet de
laugmentation de la variabilit des dbits en rivire sur la reproduction et la slection sexuelle
chez la truite commune. Il apparat que ce changement environnemental affecte linvestissement
dans la reproduction, les phnotypes qui auront le plus de succs, ainsi que la probabilit que des
individus dorigines diffrentes se reproduisent ensemble.
Jacques Labonne
jacques.labonne@st-pee.inra.fr
ECOBIOP / Inra
Contexte et enjeux
Le changement climatique implique une augmentation des vnements extrmes en zone
tempre. Dans le cas des rivires, cela se traduit par une hydrologie plus alatoire, avec
davantage dvnements extrmes comme les crues ou les tiages. La biodiversit abrite par
les rivires est dj une des plus menaces, de par la concentration des perturbations lies aux
activits anthropiques : prlvement, eutrophisation, pollution, et fragmentation.
Les salmonids comme la truite sont extrmement dpendants de lhydrologie pour leur
reproduction, et dveloppent en rponse des stratgies adaptes permettant de maximiser
leur succs reproducteur. Lingalit de succs reproducteur entre des individus prsentant
des phnotypes et donc des gnotypes diffrents va modifier la composition gntique des
populations pour la gnration suivante, et donc leur potentiel adaptatif : cest la slection
sexuelle. Le succs reproducteur est dtermin par linvestissement reproducteur, le succs
dappariement, et la survie des descendants, mais aussi par la disponibilit et les diffrents
phnotypes des partenaires sexuels.
23
Produire des
connaissances
Enfin, la truite utilise le substrat de la rivire pour y creuser un nid afin de dposer ses ufs
labri des prdateurs jusqu un stade plus autonome. Lenvironnement hydrologique peut
donc potentiellement affecter les dpenses dnergie des adultes pendant la reproduction,
mais aussi la survie des descendants en raison de risques dtiage et darasement.
Afin dinvestiguer ces questions, nous avons mis en place une exprience en milieu semicontrl, le chenal exprimental du Laptixuri, situ au Pays Basque. Deux environnements
ont t crs : un environnement prdictible avec un dbit constant, et un environnement
variable avec un dbit trs fluctuant, passant de conditions de crues des conditions dtiage
rapidement et alatoirement. Nous avons introduit dans chacun de ces environnements des
adultes issus de deux populations gntiquement distinctes, lune provenant dun milieu
hydrologiquement plus stable et prdictible que lautre. Nous avons suivi leur comportement
de reproduction (activit, comptition, appariement) laide de camras sub-aquatiques. Leur
investissement reproducteur a t mesur par les variations de poids au cours de la priode
de reproduction, ainsi que les variations de concentrations de mtabolites nergtiques dans
le plasma sanguin. Enfin, le succs reproducteur a t estim en attendant que les alevins
issus de la reproduction mergent du substrat environ deux mois aprs la reproduction.
Ils ont t assigns leurs parents respectifs laide de mthodes de biologie molculaire.
Enfin, des modles ont t spcifiquement dvelopps pour cette exprience, permettant de
prendre en compte linvestissement reproducteur, le succs dappariement et le nombre de
descendants, ainsi que leffet des phnotypes des partenaires sexuels sur ces composantes de
la slection sexuelle.
Rsultats
Nos rsultats indiquent tout dabord que les traits phnotypiques des truites comme la
taille corporelle - influencent effectivement leur succs reproducteur, impliquant une
slection sexuelle assez forte : certains phnotypes produisent davantage de descendants
la gnration suivante que dautres. En revanche, des diffrences importantes peuvent tre
observes en fonction de lenvironnement (constant ou alatoire) et de lorigine des individus:
24
Produire des
connaissances
Perspectives
Ces rsultats originaux devraient permettre de mieux clairer le rle de la slection sexuelle
dans lvolution de la biodiversit sous leffet du changement climatique. Dans le cadre de la
gestion de la biodiversit, nous souhaitons continuer explorer la sensibilit diffrentielle des
populations face ce changement, afin de comprendre en quoi des adaptations divergentes
peuvent mener des rponses variables, lintrieur dune mme espce. Enfin, ces
conclusions devraient influencer les politiques de gestion et dadaptation au changement
climatique, qui se situent lheure actuelle lchelle de chaque espce, avec des mesures
appliques uniformment toutes les populations.
RFRENCE SCIENTIFIQUE
25
Produire des
connaissances
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR BIOGECO
Biodiversit, gnes
et communauts
CONTACTS
Jean-Marc Gion
gion@pierroton.inra.fr
Le CIRAD et lInra collaborent depuis 6 ans, via les UMR AGAP et BIOGECO, sur la gntique
de leucalyptus. Les travaux les plus rcents ont permis de construire des cartes gntiques
contenant des milliers de gnes agencs de manire extrmement prcise les uns par rapport aux
autres, ce qui a permis damliorer lassemblage du gnome dEucalyptus grandit qui vient juste
dtre publi. Cette seconde version du gnome a t utilise pour identifier des gnes candidats
impliqus dans lefficience dutilisation de leau.
Inra
Contexte et enjeux
Les dveloppements des technologies de squenage et de gnotypage haut dbit sont en
train de rvolutionner les approches de gntique et dcologie chez les espces darbres
forestiers. Laccs des gnomes de rfrence apporte notamment des perspectives nouvelles
dtude de larchitecture gntique de caractres complexes, pour ces espces prennes long
cycle de rvolution. En effet, cette information gntique associe des outils de phnotypage
en plein essor eux aussi, permet dtudier plus prcisment les dterminants gntiques et
environnementaux de caractres comme la qualit du bois, la dynamique de croissance,
ou encore lefficience dutilisation de leau... Avec un gnome de rfrence dune qualit
exceptionnelle, une communaut scientifique importante et fdre au niveau international,
leucalyptus a acquis aujourdhui le rang despce modle.
Rsultats
26
Produire des
connaissances
Bartholom et al. (2014a) rapportent pour la premire fois, chez un arbre forestier, des cartes
gntiques dites haute rsolution, i.e. o la distance gntique entre deux marqueurs a pu
tre estime trs prcisment grce au gnotypage de 1000 plein-frres. Disposant dune
squence de rfrence du gnome dEucalyptus grandis depuis 2012, nous avons identifi
des millions de polymorphismes de type SNP en resquenant les deux gniteurs de cette
famille, puis slectionn un lot de 6000 marqueurs rpartis sur lensemble du gnome. Une
biopuce ADN a alors t fabrique pour gnotyper leurs descendants. Si cette tude rvle
une trs bonne correspondance entre lassemblage du gnome (en 11 pseudo-molcules
correspondant aux 11 chromosomes de lespce) et les deux cartes gntiques, elle a permis
aussi damliorer significativement la premire version du gnome de rfrence. Cette
seconde version, maintenant disponible auprs de la communaut scientifique, a t utilise
pour identifier des QTL communs entre espces (Gion et al. 2014) et des gnes candidats
positionnels pour lefficience dutilisation de leau (Bartholom et al. 2014b). Ces tudes
ont bnfici de collaborations avec le CRDPI en Rpublique du Congo, la plate-forme de
bioinformatique de lInra de Toulouse (Genotoul), le Joint Genome Institute du DOE aux
tats-Unis et lUMR EEF de lInra de Nancy.
Perspectives
Ces travaux ouvrent de nombreuses pistes de recherche pour les annes venir. Il sagira
dans un premier temps danalyser la recombinaison gntique le long des chromosomes
de leucalyptus afin de localiser les points chauds de recombinaison, ce qui prsente un
intrt majeur en amlioration gntique. Ces nouvelles investigations sur la structure du
gnome sont au cur dune collaboration dj engage avec des chercheurs de lUniversit
de Tasmanie en Australie. Par ailleurs, lalignement du gnome aux cartes gntiques sur
lesquels de nombreux QTL majeurs ont t positionns, ouvre la voie des approches dites
de clonage positionnel, qui permettront didentifier les gnes sous-jacents. Ces donnes
viendront galement appuyer les approches de slection gnomique susceptibles damliorer
lefficacit des programmes damlioration. Enfin, nous poursuivons nos recherches sur
larchitecture gntique de la dynamique de croissance radiale (mesure un pas de temps
sub-horaire) et de sa rponse aux contraintes environnementales, qui ouvre un nouveau
champ de recherche sur la gntique comportementale des arbres forestiers.
Inra
RFRENCES SCIENTIFIQUES
Bartholom J, Mandrou E, Mabiala A, Jenkins J, Nabihoudine I, Klopp C, Schmutz J,
Plomion C, Gion JM (2014a). High-resolution genetic maps of Eucalyptus improve
Eucalyptus grandis genome assembly. New Phytologist. (doi: 10.1111/nph.13150)
Bartholom J, Mabiala A, Savelli B, Bert D, Brendel O, Plomion C, Gion JM (2014b). Genetic
architecture of carbon isotope composition and growth in Eucalyptus. New Phytol (in press)
27
Produire des
connaissances
Gion JM, Chaumeil Ph, Plomion C (2014). EucaMaps : Linking genetic maps and associated
QTLs to the Eucalyptus grandis genome. Tree Genetics and Genomes (in press).
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR BIOGECO
Biodiversit, gnes
et communauts
CONTACTS
Yohan Charbonnier
yohan.charbonnier@pierroton.inra.fr
Luc Barbaro
luc.barbaro@pierroton.inra.fr
Herv Jactel
Herve.Jactel@pierroton.inra.fr
Contexte et enjeux
28
Produire des
connaissances
mis par les chauves-souris afin didentifier les espces de chiroptres et de quantifier leur
activit de chasse. Nous avons galement utilis des piges phromone pour estimer les
densits de processionnaires et mesurer les niveaux dinfestation sur les arbres des lisires
chantillonnes.
Rsultats
Il existe une troite concidence temporelle entre lactivit des chiroptres et celle de la
processionnaire du pin, lactivit de chasse des chauves-souris tant maximale au dbut de
lt et en dbut de nuit, priode o mergent les papillons et o les chauves-souris doivent
nourrir leurs petits.
Les chauves-souris montrent une rponse numrique la densit de proies puisque leur
abondance augmente avec celles de papillons de processionnaire. Certaines espces de
chiroptres, notamment la Srotine commune et la Pipistrelle de Kuhl, manifestent galement
une rponse fonctionnelle en intensifiant leur prdation au niveau des agrgats de papillons
induits par les leurres artificiels.
Ce renforcement de lactivit de prdation par les chauves-souris se traduit par une rduction
du potentiel de reproduction des populations de processionnaire du pin qui conduit
une diminution significative des infestations lanne suivante. On dmontre ainsi pour la
premire fois en fort tempre que les chiroptres assurent un service cosystmique de
rgulation des insectes ravageurs.
Perspectives
Inra
La processionnaire du pin prsente une dynamique des populations cyclique, avec des
pullulations tous les 6 8 ans. Il sera donc intressant de suivre en parallle la dynamique
temporelle des chiroptres et dvaluer leur effet long terme sur la dmographie de la proie.
Des tudes rcentes ont rvl la complexit des comportements de rponse aux signaux
acoustiques mis par les chauves-souris avec des phnomnes de cris sociaux et
mme lmission dultrasons par les papillons pris en chasse. Nous envisageons donc
denregistrer plus finement les changes dinformation acoustique entre les chiroptres et
la processionnaire du pin pour analyser leurs rponses comportementales et ainsi mieux
dcrypter les interactions proies prdateurs et prdateurs - prdateurs.
Valorisation
Cette tude sintgre dans le cadre de lagro-cologie et montre que la lutte par conservation
de la biodiversit, ici des essences forestires, offre des perspectives intressantes pour la
rgulation des insectes ravageurs forestiers par leurs prdateurs naturels.
Elle confirme galement le rle majeur des habitats forestiers pour la conservation de la
biodiversit des chiroptres, alors que ce groupe vient dtre valu par lUICN comme le
plus menac parmi les mammifres en Europe (10 espces sur la Liste Rouge)
29
Produire des
connaissances
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR SVQV
(Colmar)
Sant de la vigne et qualit
du vin
UMR BFP
On connat prs de soixante-dix virus et virodes capables dinfecter la vigne et de nouveaux virus
sont rgulirement dcouverts. Parmi ces nouveaux agents, le Grapevine Pinot gris virus (GPGV),
qui semble associ une pathologie particulire et le Grapevine Red globe virus (GRGV), dont
le pouvoir pathogne nest pas avr sur vigne, ont t identifis pour la premire fois dans les
vignobles franais par une collaboration entre deux quipes du dpartement SPE de lInra.
CONTACTS
Olivier Lemaire
olivier.lemaire@colmar.inra.fr
Thierry Candresse
thierry.candresse@bordeaux.inra.fr
Contexte et enjeux
30
Produire des
connaissances
Parmi les 70 virus et virodes infectant la vigne, de trs nombreux dentre eux sont capables
de causer des symptmes, parfois graves. Ils sont le plus souvent prsents en association,
ce qui rend dlicate lanalyse de ltiologie de ces viroses. De nouveaux virus de vigne sont
rgulirement dcouverts, en particulier ces dernires annes avec la monte en puissance
des approches de diagnostic non cibles par squenage haut dbit. Dans le mme temps, de
nombreuses pathologies dorigine encore inconnue mais vraisemblablement virale, dont des
syndromes de dprissement qui affectent la longvit des vignobles, existent chez la vigne.
Parmi les agents rcemment dcrits, le Grapevine Pinot gris virus (GPGV) et le Grapevine
Red globe virus (GRGV) pourraient tre associs des pathologies particulires (de type
court-nou pour le GPGV) et leur dcouverte en France par les quipes SPE va ncessiter
une valuation plus prcise du potentiel pathognique de ces virus et de leur(s) mode(s) de
dissmination, soit par diffusion de matriel infect, soit par transmission par des vecteurs
ariens. Le GPGV est un Trichovirus apparent au Grapevine berry inner necrosis virus,
transmis par lacarien ryophide Colomerus vitis. Il sera ainsi trs important de rechercher si
lun ou lautre des 2 acariens trs communs sur vigne, Colomerus vitis et Calepitrimerus vitis
sont en mesure de transmettre le GPGV. Ces rsultats pourraient avoir des consquences
cruciales sur lpidmiologie de cette virose et sur les mesures mettre en place pour limiter
la diffusion de ce virus potentiellement inquitant pour la viticulture franaise.
Rsultats
Lutilisation dapproches de diagnostic bases sur lutilisation du squenage haut dbit puis
sur lanalyse bioinformatique des squences obtenues a permis de mettre en vidence le
GPGV sur des plants de Merlot greffs sur le porte-greffe Gravesac provenant de la rgion
de Bordeaux ainsi que sur des plants de Carignan, montrant des symptmes foliaires svres
de dformation, fasciation et chlorose faisant penser des symptmes de court-nou.
Lensemble des tests srologiques et molculaires raliss navaient pas permis de mettre en
vidence un ventuel Nepovirus, agent du court-nou. Le GRGV a lui t identifi sur des
plants de Cabernet Franc greffs sur Gravesac et provenant galement de la rgion bordelaise.
Sur la base des squences obtenues, des tests de dtection par RT-PCR laide damorces
spcifiques de ces deux virus, ont t mis au point. Ces outils de dtection vont permettre de
mener des tudes de prvalence de ces deux virus, afin de connatre dune part leur aire de
rpartition en France et les cpages affects, et dautre part la diversit molculaire en France
de ces agents.
Perspectives
La prsence de ces virus en France et, en particulier, du GPGV, pose de faon plus aige
la question de la pathognicit de ces agents et de leur pidmiologie. Un projet europen
(ArimNet2) impliquant un consortium international et agrgeant, outre les deux quipes
Inra, des chercheurs Italiens, Espagnols, Slovnes et Slovaques, est en cours de montage pour
conduire des efforts internationaux afin de parvenir une meilleure comprhension de la
contribution du GPGV des pathologies de la vigne et de disposer de moyens de dtection
et de lutte efficace en Europe.
RFRENCES SCIENTIFIQUES
Glasa, M., Predajna, L., Komnek, P., Nagyova, A., Candresse, T., Olmos, A. (2014), Molecular
characterization of divergent grapevine Pinot gris virus isolates and their detection in
Slovak and Czech grapevines. Arch Virol DOI 10.1007/s00705-014-2031-5
31
Produire des
connaissances
Beuve, M., Candresse, T., Tannires, M. & Lemaire, O. (2014) First Report of Grapevine
Pinot gris virus (GPGV) in grapevine in France. Plant Disease, sous presse.
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UR MYCSA
Mycologie et scurit
des aliments
CONTACTS
Jean-Michel Savoie
jean-michel.savoie@bordeaux.inra.fr
La thermo-tolrance du Champignon de Paris est un caractre qui mrite dtre slectionn pour
favoriser sa culture dans les rgions chaudes du globe ou pour diminuer les cots de production en
priode estivale sous nos latitudes. Lexploitation de la grande variabilit gntique contenue dans
la Collection du Germoplasme des Agarics Bordeaux (CGAB) a permis aux chercheurs de lUnit
de Recherche MycSA de reprer des individus (appels souches) isols de la nature, capables de
fructifier 25C.
Contexte et enjeux
La thermo-tolrance du Champignon de Paris est un caractre qui mrite dtre slectionn
pour favoriser sa culture dans les rgions chaudes du globe ou pour diminuer les cots de
production en priode estivale sous nos latitudes.
En effet, Agaricus bisporus, (nom scientifique du Champignon de Paris), est une espce
des rgions tempres dont les varits utilises actuellement ncessitent des tempratures
comprises entre 16 et 19C pour un rendement optimal. Autrefois, ces conditions taient
obtenues dans des carrires souterraines. Depuis quelques annes, la production se fait dans
de grandes salles climatises qui permettent laugmentation ainsi que la stabilisation de la
quantit et de la qualit des rcoltes. Si les champignonnistes pouvaient disposer de varits
produisant 25C, ils diminueraient leurs dpenses nergtiques en priodes chaudes. Ces
varits pourraient aussi favoriser le dveloppement de la culture dans de nouvelles zones
climatiques.
32
Produire des
connaissances
Rsultats
Lexploitation de la grande variabilit gntique contenue dans la Collection du Germoplasme
des Agarics Bordeaux (CGAB) a permis aux chercheurs de lUnit de Recherche MycSA
de reprer des individus (appels souches) isols de la nature, capables de fructifier 25C
(Largeteau et al. 2011). Parmi ces souches, un petit nombre possde un potentiel de
rendement intressant cette temprature, quivalant celui quelles expriment 17C
(Navarro & Savoie 2014). Pour approfondir leur connaissance de la biologie dAgaricus
bisporus et dvelopper des outils danalyse facilitant le travail de slection varitale, les
chercheurs de lInra se sont intresss aux fondements gntiques de cette thermo-tolrance.
Ltude dune descendance issue dun parent thermo-tolrant et dun parent incapable de
produire des champignons 25C a rvl la complexit de lhritabilit gntique de ce
caractre. Deux zones du gnome (appeles QTLs) sont impliques dans lhritabilit de la
thermo-tolrance (Foulongne et al 2014). Elles contiennent des gnes pouvant intervenir
dans laptitude produire des champignons plus haute temprature. Paralllement, un
nouveau gne dAgaricus bisporus a t caractris. Aap1 code pour une protine qui joue un
rle de facteur de transcription impliqu dans une rsistance gnrale aux stress subis par le
Champignon de Paris (Navarroet al. 2014).
Perspectives
Lutilisation dans des programmes de slection varitale de ces ressources gntiques
naturelles et des connaissances sur les fondements gntiques devrait permettre de proposer
prochainement des varits de Champignon de Paris thermo-tolrantes prsentant par
ailleurs toutes les qualits requises attendues par les producteurs et les consommateurs.
RFRENCES SCIENTIFIQUES
Largeteau M.L., Callac P., Navarro-Rodriguez A.M., Savoie J.M. (2011). Diversity in the
ability of Agaricus bisporus wild isolates to fruit at high temperature (25C). Fungal Biology.
115: 1186-1195.
Foulongne-Oriol M., Navarro P., Spataro C., Ferrer N. Savoie J.M. (2014) Deciphering the
ability of Agaricus bisporus var. burnettii to produce mushrooms at high temperature
(25C). Fungal Genetics and Biology. 73: 1-11
Navarro P., Savoie J.M. (2014). Selected wild strains of Agaricus bisporus produce high yields
of mushrooms at 25C. Revista Iberoamericana de Micologa. 32: 54-58
33
Produire des
connaissances
Navarro P., Billette C., Ferrer N., Savoie J.M. (2014). Characterization of the aap1 gene of
Agaricus bisporus, a homolog of the yeast YAP1. Comptes Rendus Biologie 337: 29-43.
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR BFP
CONTACTS
Alain Blanchard
alain.blanchard@bordeaux.inra.fr
Dans toutes les cellules vivantes, le message gntique ports par les ARN messagers est traduit
en protines par une machinerie complexe impliquant notamment le ribosome. Ce processus
appel traduction est extrmement conserv des bactries aux mammifres et aux plantes.
Par gnomique compare, nous avons identifi un jeu minimal de gnes requis pour la traduction
chez les cellules les plus simples. Ce travail a des implications notamment en biologie de synthse
dans la perspective de construction dune cellule minimale.
Contexte et enjeux
Le contexte est celui dun des objectifs de la biologie de synthse qui est de construire de
nouveaux chssis cellulaires, si possible en simplifiant au maximum le fonctionnement de
cellules vivantes. La construction dune cellule minimale ncessite un ensemble doutils
dingnierie gnomique mais galement des prdictions fiables sur les gnes ncessaires au
fonctionnement dune telle cellule. Cest dans ce cadre que ce travail sinsre.
Rsultats
Nous avons identifi un ensemble de protines impliques dans la traduction qui sont
communes aux 39 bactries de la classe Mollicutes slectionnes. Ces protines sont
ncessaires la traduction mais ne sont pas suffisantes. En effet, malgr leur parent
phylogntique, ces organismes ont dvelopp au cours de leur volution des solutions
distinctes de minimisation de leur gnome pour assurer cette fonction essentielle de la
34
Produire des
connaissances
traduction. Nous avons mis en vidence des phnomnes de compensation en fonction des
pertes subies et avons propos un scnario de pertes et/ou de gains des gnes impliqus dans
la synthse de protines au cours lvolution de ces bactries. Ce travail sappuyant sur les
comptences complmentaires des auteurs de la publication a conduit lidentification dun
jeu minimal de gnes ncessaires la synthse de protines dans des cellules minimales.
Perspectives
Ce travail doit alimenter les rflexions autour de la construction dune cellule minimale.
Lanalyse ralise ouvre galement des tudes fonctionnelles plus cibles comme cest le cas
pour des enzymes de modification des ARN qui interviennent pour assurer la fiabilit de la
traduction. De rcents travaux dirigs par Carole Lartigue dans notre quipe concernent la
caractrisation dune telle enzyme par des approches de biologie de synthse (Nucleic Acids
Res. 2014;42:8073-82).
RFRENCE SCIENTIFIQUE
35
Produire des
connaissances
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR BIOGECO
Biodiversit, gnes et
communauts
CONTACTS
Rmy Petit
remy.petit@pierroton.inra.fr
Erwan Guichoux
erwan.guichoux@ pierroton.inra.fr
37
Produire
des
Concevoir
des innovations
connaissances
Les travaux du projet OAKTRACK soutenu par lAgence Nationale de la Recherche (ANR)
dans le cadre de son programme Emergence ont permis de valider des outils molculaires
de contrle de lorigine des bois de chne utiliss en tonnellerie et de les rendre accessibles
la filire. Deux aspects ont t abords, lespce botanique et la provenance gographique.
Ainsi, les acteurs de la filire fort-bois ont dsormais leur disposition des moyens de
contrle de leur production ou de leurs approvisionnements. En amont, les gestionnaires
pourront garantir la conformit de lespce et/ou de lorigine gographique des grumes
commercialises, en utilisant un test ADN infalsifiable. Et, en aval, les nologues pourront
optimiser la maturation des vins et des alcools, avec un meilleur contrle du potentiel
aromatique des bois utiliss, par lidentification de lespce de bois de chne utilise.
Afin de caractriser les marqueurs gntiques les plus performants pour identifier lespce
et estimer lorigine gographique des chnes, de nombreuses squences dADN ont t
analyses, obtenues sur plusieurs chantillons reprsentatifs de la diversit gntique de ces
espces. Une fois les meilleurs marqueurs reprs, les efforts ont port sur la mise au point
dune technologie de gnotypage (identification gntique) base sur la spectromtrie de
masse, technique qui combine diffrents avantages : flexibilit, rapidit, prcision et cot
matris. Deux kits de marqueurs gntiques ont t dvelopps et optimiss pour tre
utiliss indpendamment ou en combinaison. Ils permettent didentifier lespce de manire
certaine comme de contrler lorigine gographique dun bois de chne (test de conformit
par rapport une origine annonce).
Ces outils devraient rpondre aux attentes de la filire, qui souhaite mieux valoriser les lots
de bois mais galement optimiser le contrle des approvisionnements.
RFRENCE
Guichoux E, Petit RJ (2014) Dclaration dinvention (n DI-RV-13-00566) auprs de lINPI:
Mthode de traabilit gographique des bois de chne.
38
+ DINFOS
>> Commnuniqu de presse
>> Vido
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR ISPA
CONTACT
Sylvain Dupont
sylvain.dupont@bordeaux.inra.fr
La revgtalisation des sols est une mthode courante pour limiter lrosion olienne.
En renouvelant la manire de modliser lrosion olienne en prsence de vgtation, nous avons
montr que les arbres sont plus efficaces que les buissons pour rduire lrosion des sols. Le modle
dvelopp reprsente un outil prometteur pour quantifier lrosion olienne des rgions semiarides, lorigine de nombreuses problmatiques environnementales.
Contexte et enjeux
39
Produire
des
Concevoir
des innovations
connaissances
Lrosion olienne des sols correspond lentrainement de grains de sable par le vent, aussi
appel saltation, et lmission de poussires dans latmosphre par impact de ces grains
avec le sol. La saltation peut endommager les cultures par abrasion, ensevelissement ou
dracinement, et former des dunes de sable en zones dsertiques. Lmission de poussires
diminue localement la fertilit des sols agricoles, et impacte globalement la pollution de lair,
la formation des nuages et le bilan radiatif terrestre. Ces poussires atmosphriques ont aussi
des consquences sanitaires lies leur inhalation par les tres humains, et la propagation
de polluants ou dagents potentiellement pathognes, fixs sur les grains de poussire.
La revgtalisation des sols est une mthode courante pour rduire lrosion olienne de
rgions sujettes la dsertification, mais son efficacit suivant lorganisation spatiale des
couverts vgtaux et le type de vgtation nest pas encore bien connue. De plus, les modles
actuels de quantification de lrosion olienne sont peu adapts aux surfaces avec des couverts
vgtaux pars en raison de leur reprsentation grossire du vent.
Rsultats
Nous avons dvelopp une modlisation originale de la saltation dun sol en reproduisant
linteraction complte entre le mouvement de plusieurs millions de grains de sable et le vent
instantan, et leurs interactions avec le sol et la vgtation dans un champ tridimensionnel.
Une premire version de ce modle sans vgtation nous a permis de reproduire les banderoles
de grains de sable oscillant la surface dune plage par vent fort. Ces premiers travaux ont
permis de confirmer de prcdentes hypothses sur lorigine de ces banderoles en lien avec
les caractristiques de la turbulence du vent prs de la surface. En incluant la vgtation
dans une deuxime version du modle, nous avons montr qu superficie gale, les arbres
sont plus efficaces que les buissons pour rduire lrosion olienne. Bien que les buissons
pigent les particules en saltation, les arbres induisent une rduction de vent plus grande
chelle que le simple effet protecteur local des buissons. La rduction de lrosion olienne
apparait par ailleurs fortement dpendante de larrangement de la vgtation par rapport
la direction du vent.
Perspectives
Les rgions semi-arides reprsentent une source importante de poussires pour latmosphre.
Contrairement aux rgions dsertiques, ces rgions sont caractrises par une vgtation
clairseme saisonnire. Lextension de ce modle de saltation aux poussires nous permettra
de mieux quantifier les missions de poussires issues de ces rgions. Ceci est dautant plus
important que la perte en fertilit des sols agricoles de ces rgions devrait saccentuer dans
les annes venir sous leffet combin du changement climatique et de la modification de
lusage des sols lie aux activits humaines. Ces rgions sont en effet des zones de transition
climatique notamment en termes damplitude et de frquence des prcipitations qui affectent
la couverture vgtale des surfaces, et donc lrosion olienne du sol. Ce sont aussi des rgions
o la croissance dmographique est importante, conduisant des changements radicaux
dans les usages des terres comme lextension et lintensification des zones cultives.
SLAGMULDER Christian / Inra
RFRENCES SCIENTIFIQUES
40
Dupont S., G. Bergametti, S. Simons (2014), Modeling soil erosion in presence of vegetation
J. Geophys. Res. Earth Surf., 119, 168-187, DOI: 10.1002/2013JF002875.
Dupont S. (2014), Modelling wind erosion intermittency, ICAR VIII Eighth International
Conference on Aeolian Research, Lanzhou, CHINA, July 21-25, 2014.
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR BFP
UMR EGFV
Ecophysiologie et Gnomique
Fonctionnelle de la Vigne
Les UMR BFP et EGFV se sont associes dans un projet de construction dune nouvelle serre de
confinement qui vient dtre mise en service en septembre 2014. Ce projet sest inscrit dans
une action pilote Dveloppement durable de lInra : la nouvelle serre prsente de hautes
performances nergtiques faisant appel des solutions techniques dutilisation dnergie
renouvelable et alternative aux nergies fossiles, ainsi quun clairage par lampes LED.
CONTACTS
Thierry Candresse
thierry.candresse@bordeaux.inra.fr
Serge Delrot
serge.delrot@bordeaux.inra.fr
Daniel Just
daniel.just@bordeaux.inra.fr
Frdric Laigret
frederic.laigret@bordeaux.inra.fr
Contexte et enjeux
Les recherches conduites par les UMR1332 BFP et -1287 EGFV (dpendant du
dpartement BAP) ncessitent un dispositif exprimental important de serres de
confinement. Un tel outil lourd est rendu ncessaire par la rglementation actuelle, tant en
ce qui concerne les OGM (considrs ici en tant quoutils dtude) quen ce qui concerne
les agents phytopathognes quils soient de quarantaine ou non. La monte en puissance
des thmatiques ncessitant de lexprimentation en conditions confines nous a conduits
dposer en 2008, un projet de construction dune serre de confinement S2 de 740 m
(constitue de 6 compartiments) et dun local technique de 290 m. Le financement de ce
projet (pour un montant total de 2 212k) a t acquis auprs de plusieurs partenaires : le
Conseil Rgional dAquitaine, les fonds europens FEDER, lInra, lUniversit de Bordeaux,
le Centre Interprofessionnel des Vins de Bordeaux (CIVB) et le Crdit Agricole.
41
Produire
des
Concevoir
des innovations
connaissances
La construction de cette nouvelle serre sest inscrite dans une dmarche novatrice sur le centre
Bordeaux-Aquitaine et lInra. En effet son implantation au contact de serres existantes
a permis de rduire les cots dinstallation, mais ce projet a eu surtout pour ambition de
dlivrer une serre la plus respectueuse de lenvironnement possible en faisant appel des
quipements associs lutilisation dune nergie alternative aux nergies fossiles (pompe
chaleur) et dune source dnergie renouvelable (panneaux solaires photovoltaques), la
rcupration deau, et au traitement des effluents. Il sagit dun projet pilote pour lInra qui
a obtenu des financements complmentaires de la part de lInra dans le cadre de lappel
projets Dveloppement Durable/Actions Pilotes, hauteur de 398 k. Malgr cet effort de
lInra au travers de la dlgation au Dveloppement Durable, et pour rpondre au surcout
engendr par la construction par rapport lestimation originelle du projet, un financement
complmentaire a t obtenu provenant de la SFR Biologie Intgrative et Ecologie pour
quiper cette serre HPE avec un clairage dappoint faisant appel des lampes LED. Ainsi
lclairage de la serre est rest dans la mme cohrence dveloppement durable du projet, en
vitant linstallation un clairage lampes sodium moins couteuses en investissement mais
extrmement nergivores en fonctionnement.
Rsultats
Loriginalit de ce projet de construction dune serre HPE est quil sinscrit dans une
dmarche de dveloppement durable avec un axe cologique trs fort visant une rduction
trs importante de la consommation dnergie grce : (i) une isolation renforce par
utilisation de doubles vitrages (verres faible missivit avec lame dargon), et diverses
solutions techniques qui en font une serre dont lisolation est 2 fois plus performante que
les serres les plus rcentes; (ii) un chauffage 100 % nergie renouvelable avec linstallation
dune pompe chaleur air/eau qui ne ncessite pas dappoint par une chaudire gaz, et
de panneaux photovoltaques dont la production sera consomme sur le centre Inra et
compensera entirement sur 1 an llectricit consomme par la pompe chaleur ; (iii) la
prsence dquipements remarquables : un logiciel dintgration des tempratures, un
systme de rcupration deau de pluie et de recyclage des solutions nutritives, linstallation
dun clairage lampes LED.
Perspectives
Les travaux de construction se sont achevs courant 2014, et la serre HPE a t mise en
fonctionnement dbut septembre 2014. Les attendus de cette installation exprimentale
concernent non seulement une augmentation de nos surfaces de culture de plantes en
conditions confines, mais galement la viabilit du fonctionnement de cette serre grce aux
conomies ralises sur la consommation en fluides : le chauffage tant entirement apport
par des nergies renouvelables, il sera gratuit ; linstallation de lampes LED contribuera
fortement des conomies dnergie et un fonctionnement conome. Cette serre aura un
faible impact sur lenvironnement par une consommation dnergie trs faible (bilan carbone
extrmement favorable), et sera conomique en fonctionnement.
42
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR EGFV
cophysiologie et gnomique
fonctionnelle de la vigne
CONTACT
Zhanwu Dai
zhanwu.dai@bordeaux.inra.fr
Les tudes fluxomique et mtabolique dans les baies recueillies sur la vigne ou mme de plants
issus dun environnement semi-contrl (par exemple serres) sont techniquement difficiles et
les rsultats obtenus peuvent souvent tre influencs par de multiples facteurs : fluctuations de
lenvironnement, des stress biotiques, variations naturelles des plant, etc. Pour pallier ces difficults
dans ltude des rponses mtaboliques des stimuli spcifiques, calibres dans un environnement
totalement contrl, un modle in vitro de culture de baies a t dvelopp dans le cadre dun
projet Inra financ par le programme projets innovants du Dpartement Environnement et
agronomie (EA).
Contexte et enjeux
La composition et la maturation des raisins la rcolte dpendent fortement des nutriments
et des hormones imports par la baie tout au long de son dveloppement. Or, la conduite du
vignoble comprend souvent un effeuillage partiel et la manipulation du ratio puits / source.
Cependant, il est difficile de contrler prcisment les transferts entre la plante et la baie sur
les plantes intactes. La conception dun systme o la concentration des sucres, des acides
amins, des hormones ... qui alimentent la baie est bien contrle et permet la maturation est
un progrs exprimental important.
Rsultats
43
Produire
des
Concevoir
des innovations
connaissances
Le systme conu permet de contrler les conditions de croissance des baies partir de baies
strilises en pr-vraison, de les garder jusqu 60 jours et dinduire la vraison normale
Perspectives
Ce systme sera trs utile pour analyser les effets de divers composs nutritifs et hormonaux
du milieu sur la composition des raisins, comme les transferts travers le xylme et le
phlome, constituants des tissus vgtaux.
EGFV / Inra
RFRENCE SCIENTIFIQUE
44
Dai ZW, Meddar M, Renaud C, Merlin I, Hilbert G, Delrot S, Goms E (2014), Long-term
in vitro culture of grape berries and its application to assess the effects of sugar supply on
anthocyanin accumulation. Journal of Experimental Botany 65, 4665-4677. DOI: 10.1093/
jxb/ert489
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR ECOBIOP
cologie comportementale et
biologie des populations de
poissons
CONTACTS
Olivier Lepais
Olivier.Lepais@st-pee.inra.fr
Matthias Vignon
Matthias.Vignon@st-pee.inra.fr
Contexte et enjeux
Lacquisition de nouvelles donnes dans le domaine de la Biologie connat un essor important
en lien avec les progrs technologiques. Bien souvent, la typologie des donnes, ou bien sa
quantit ou encore son cot dacquisition ncessitent des mthodes danalyse sophistiques
non disponibles parmi les outils classiques de la statistique scientifique. En 2014, lUMR
Ecobiop a mis disposition de la communaut scientifique deux packages R cibls sur
laide la dcision : le premier est li aux nouvelles techniques de squenage, tandis que
le second est li au traitement de donnes microchimiques obtenues par spectromtrie de
masse couple un plasma inductif (ICP-MS).
45
Produire
des
Concevoir
des innovations
connaissances
Rsultats
Nicolas Bertrand / Inra
Nous avons dvelopp SimRAD (Simulation of Restriction site Associated DNA markers), un
package R permettant de simuler in silico les diffrents protocoles danalyses de gnotypage
par squenage partir des informations de base sur les caractristiques du gnome de son
espce dtude ou bien de la squence elle-mme si elle est disponible. SimRAD permet ainsi
de comparer le nombre de marqueurs gntiques cibls par chaque protocole permettant
ainsi de choisir lapproche de gnotypage par squenage la plus adapte. 2/ Le package
TAMPO (Tools for the Analysis of Microchemical Profiles from Otoliths) a t dvelopp
pour permettre lanalyse simultane de grandes sries temporelles multivaries afin de
dterminer lhabitat utilis par un poisson au cours de sa vie. En plus de la retranscription
en langage R des bauches de mthodes prexistantes, le package propose une nouvelle
mthode entirement paramtrable permettant lextraction dun signal rpondant aux
critres dintelligibilit de lutilisateur. Ces critres dpendent dune part des proprits
biochimiques du systme tudi, mais galement du matriel utilis pour lanalyse ICP-MS.
Perspectives
SimRAD devrait participer faciliter ladoption des nouvelles technologies de squenages
dans des domaines varis de la biologie.
46
RFRENCE SCIENTIFIQUE
Lepais O, Weir JT. 2014. SimRAD: an R package for simulation-based prediction of the
number of loci expected in RADseq and similar genotyping by sequencing approaches.
Molecular Ecology Resources, Early View, DOI: 10.1111/1755-0998.12273.
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR NUTRINEURO
Nutrition et neurobiologie
intgre
CONTACT
Sophie Lay
sophie.laye@bordeaux.inra.fr
NutriNeuro et lINAF (institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels) de lUniversit Laval ont
cr un laboratoire international associ (LIA) Optinutribrain. Il sera co-dirig par Sophie Lay
de lInra et Frdric Calon de lINAF. Laccord a t sign par lInra, lUniversit Laval et lUniversit
de Bordeaux le 3 Novembre 2014 Laval en prsence de Franois Houllier, PDG de lInra, et Denis
Brire, Recteur de lUniversit Laval.
48
Construire des
partenariats
scientifiques
Partenariats scientifiques et
institutionnels
et institutionnels
Centre
Bordeaux-Aquitaine
CONTACT
Hubert de Rochambeau
hubert.de-rochambeau@bordeaux.inra.fr
Les secteurs agricoles, sylvicoles ainsi que les activits marines et aquacoles jouent un rle
majeur dans lconomie de lAquitaine en matire de cration de valeur ajoute, dexportation,
demplois ainsi que de prservation et de mise en valeur du territoire rgional.
La Rgion sest dote dun Schma rgional de lEnseignement suprieur, de la Recherche et de
lInnovation (SRESRI) qui se veut surtout une feuille de route pour la dcennie. Quatre dfis
sont relever : structurer la recherche, consolider le dveloppement industriel en favorisant
le rapprochement entre les entreprises et les laboratoires de recherche o sinventent les relais
de croissance futurs, russir un dveloppement quilibr des territoires et favoriser la russite
et lpanouissement de chacun.
49
Construire des
partenariats
scientifiques
Partenariats scientifiques et
institutionnels
et institutionnels
LInra dveloppe des recherches innovantes et finalises dans les domaines de lalimentation,
de lagriculture et environnement. Au travers de ses implantations en Aquitaine, il dcline ses
missions de production de connaissances scientifiques, dclairage de la dcision publique et
daccompagnement de linnovation, pour rpondre aux enjeux de lconomie de demain.
Afin de coordonner leurs actions sur le territoire aquitain, la Rgion Aquitaine et lInra
mettent en place une convention de partenariat, dont lobjectif est de soutenir et renforcer
les capacits de recherche, de formation et dinnovation en rponse aux grands enjeux des
filires rgionales, dont celui de renforcer une agriculture organise autour de filires de
qualit, respectueuses de lenvironnement.
Par cette convention, la Rgion Aquitaine et lInra vont consolider leur collaboration
afin de :
soutenir les travaux de recherche et dinnovation,
conforter les implantations et les infrastructures de recherche ainsi que les
dispositifs dexprimentation,
contribuer au dialogue sciences-socit,
accrotre la visibilit et lattractivit de la recherche agronomique,
dployer ou exprimenter sur le territoire aquitain des outils et savoir-faire matriss
par lInra.
50
Construire des
partenariats scientifiques
et institutionnels
+ DINFOS
Centre
Bordeaux-Aquitaine
CONTACT
Hubert de Rochambeau
hubert.de-rochambeau@bordeaux.inra.fr
51
Construire des
partenariats
scientifiques
Partenariats scientifiques et
institutionnels
et institutionnels
+ DINFOS
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Construire des
partenariats scientifiques
et institutionnels
Prix et distinctions
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR BIOGECO
Biodiversit, gnes et
communauts
CONTACT
Michel Mench
Michel.Mench@bordeaux.inra.fr
Les travaux mens sur le phytomanagement des sites et sols contamins, des dterminants
molculaires de la rsistance de vgtaux exposs en excs dlments traces la restauration
des services cosystmiques, ont t prims par la remise au Dr. Michel Mench du Milton Gordon
Award, plus haute distinction internationale dans le domaine des Phytotechnologies,
la Confrence annuelle de lInternational Phytotechnology Society (IPS, Hraklion, octobre 2014).
Contexte et enjeux
Le phytomanagement de sites contamins, qui inclut la restauration des services
dapprovisionnement et cologiques en sus de lassainissement des voies dexposition
aux contaminants, est une demande socitale forte, tant en local qu linternational. Les
mcanismes lchelle de la plante et des communauts vgtales sont explorer pour
innover des modes de gestion durables, favorisant la production et lutilisation des biomasses,
la biodiversit et les services cosystmiques.
Rsultats
54
Prix et distinctions
Perspectives
Les travaux, conduits dans le projet europen FP7 Greenland, se poursuivent dans lANR
CD2i Phytochem. Des partenariats en France et en Europe sont mens pour transformer des
biomasses issues du phytomanagement.
RFRENCES SCIENTIFIQUES
Hego E, Bes C, Bedon F, Palagi PM, Chaumeil P, Barr A, Claverol S, Dupuy JW, Bonneu M,
Lalanne C, Plomion C, Mench M 2014 Differential accumulation of soluble proteins in roots
of metallicolous and non-metallicolous populations of Agrostis capillaris L. exposed to Cu.
Proteomics, 14, 17461758. Doi: 10.1002/pmic.201300168.
Kolbas A., Mench M., Marchand L., Herzig R., Nehnevajova E. 2014. Phenotypic seedling
responses of a metal-tolerant mutant line of sunflower growing on a Cu-contaminated soil
series. Plant and Soil 376, 377-397. DOI: 10.1007/s11104-013-1974-8.
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Prix et distinctions
Marchand L., Nsangawimana F, Lamy J.B., Quintela-Sabaris C., Gonnelli C., Colzi I., Fletcher
T., Oustrire N., Kolbas A., Kidd P., Bordas F., Newell P., Alvarenga P., Deletic A., Mench
M. 2014. Root biomass production in populations of six rooted macrophytes in response
to Cu exposure: Intra-specific variability versus constitutive-like tolerance. Environmental
Pollution 193, 205-215. Doi 10.1016/j.envpol.2014.07.001.
Centre
Bordeaux-Aquitaine
Lisa Wingate
Laurate du Laurier jeune chercheur Inra 2014
Rsum
UMR ISPA
CONTACT
Lisa Wingate, charge de recherche lunit mixte de recherche Interactions sol-planteatmosphre (ISPA) de lInra de Bordeaux, est laurate du Laurier jeune chercheur 2014.
Elle a aliment ses quinze premires annes de recherches dune curiosit et dune crativit
insatiable.
Lisa Wingate
lisa.wingate@bordeaux.inra.fr
56
Prix et distinctions
Le projet qui a permis Lisa Wingate dobtenir la bourse ERC prolonge ses prcdents
travaux sur lactivit enzymatique des sols et ses micro-organismes : Lenzyme cible,
lanhydrase carbonique, est lune des plus anciennes, essentielle la vie et prsente dans tous
les micro-organismes du sol. Son rle, essentiel dans tous les processus de photosynthse
et de respiration, est de catalyser trs efficacement linter-conversion du CO2 dissous en
bicarbonate. Mon projet est dexplorer et de comprendre les mcanismes de rgulation de
cette enzyme dans diffrents cosystmes et conditions exprimentales, et damliorer ainsi
notre comprhension du cycle du carbone lchelle plantaire . Lisa Wingate se dit ravie
davoir obtenu ce financement, une opportunit formidable pour un jeune chercheur
davoir sa propre quipe tout en ayant conscience quelle devra travailler trs dur pendant
les cinq prochaines annes .
+ DINFOS
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Prix et distinctions
Participer au dialogue
science-socit
Centre
Bordeaux-Aquitaine
Le poisson la loupe
Journe portes ouvertes de lAquaple de Saint-Pesur-Nivelle
Rsum
UMR ECOBIOP
cologie comportementale et
biologie des populations de
poissons
UR NUMEA
Nutrition, mtabolisme,
aquaculture
UAR Aquaple
CONTACT
communication@bordeaux.inra.fr
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Participer au dialogue
science-socit
Enfants et adultes ont ainsi pu comprendre comment et par quels moyens les scientifiques
et personnels techniques sy prennent pour capturer, marquer les poissons, comment ceuxci prlvent lADN des espces, pourquoi ils utilisent un fluvarium (unique en Europe),
quelles fins ils ont cr un chenal de fraie, etc. pour mieux connatre le comportement et
ladaptation des espces de poissons migrateurs tels que la truite, le saumon ou encore la
civelle (anguille).
Par ailleurs, autour dateliers pdagogiques, le public a pu dcouvrir les recherches menes sur
la nutrition des poissons dlevage, ou comment lInra dveloppe des formules alimentaires
sans ressource halieutique base daliments vgtaux.
La journe sest organise autour de 11 ateliers thmatiques et ludiques
Laboratoire de recherche cologie comportementale et Biologie des Populations de Poissons
(ECOBIOP, Unit mixte de recherche INRA-UPPA)
+ DINFOS
60
Participer au dialogue
science-socit
Centre
Bordeaux-Aquitaine
UMR BIOGECO
Biodiversit, gnes et
communauts
UMR ISPA
UE FORT PIERROTON
CONTACT
communication@bordeaux.inra.fr
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Participer au dialogue
science-socit
+ DINFOS
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Participer au dialogue
science-socit