Proposition de stage de Master 2 en biostatistiques

Utilisation de la cohorte entière dans l’analyse d'échantillons contre-appariés ;

application à l’étude de la relation entre cancer de vessie et exposition professionnelle
aux brouillards d’huiles.

Établissement d’accueil : département épidémiologie en entreprise, à l’Institut national de

recherche et de sécurité, Vandoeuvre lès Nancy, France

Date de début : à partir de janvier 2021

Durée de stage : entre 4 et 6 mois pendant l’année académique 2020-2021

Gratification de stage : 1155 € bruts mensuels

Contexte et objectif du stage

Le département épidémiologie en entreprise a réalisé une étude cas-témoins nichée dans

une cohorte sidérurgique afin de rechercher s’il existe un risque de cancer de la vessie
associé à des expositions professionnelles à des brouillards d’huiles (1). Les témoins ont été
sélectionnés selon la méthode de contre-appariement (2). Les données individuelles des
sujets de la cohorte ont été complétées uniquement pour les sujets de l’étude cas-témoins
par des données plus fines sur l’exposition professionnelle, utilisées dans l’analyse

L’un des défis des études épidémiologiques est d’utiliser toute l’information disponible afin
d’améliorer la précision des résultats. Alors que les méthodes d’analyses des études cas-
témoins n’utilisent que les cas et les témoins sélectionnés, d’autres méthodes ont été
développées afin d’utiliser l’ensemble des sujets de la cohorte (3, 4). Ces méthodes
comprennent plusieurs étapes : modélisation des données d’exposition obtenues dans
l’études cas-témoins en fonction des informations connues sur l’ensemble de la cohorte,
imputation des valeurs aux sujets de la cohorte non inclus dans l’étude cas-témoin,
calibration des probabilités d’inclusion, estimation finale des paramètres du modèle d’intérêt.
Aucune solution tout-en-un n’est disponible dans les logiciels d’analyses statistiques pour
appliquer ces méthodes.

L’objectif du stage est de mettre en œuvre cette méthodologie pour réanalyser les données
recueillies dans l’étude cas-témoins.

Vos missions :

 étudier, comprendre et prendre en main la méthode,

 appliquer la méthode à la cohorte, en programmant les différentes étapes,
 interpréter les résultats obtenus et les comparer à ceux issus de l’analyse cas-
témoins,
 tester la robustesse des résultats, notamment en rapport au choix du modèle imputé
Profil attendu du stagiaire :

 Vous êtes actuellement en Ecole d’ingénieur ou Master 2 en statistique/biostatistique,

mathématiques, modélisation ou équivalent
 Connaissances en statistiques, modèles multivariés, analyse de survie, calibration et
imputation multiple
 Connaissance des logiciels STATA ou R
 Anglais scientifique (capacité à lire et à comprendre des articles scientifiques)

Références

1. Colin R, Grzebyk M, Wild P, Hedelin G, Bourgkard E. Bladder cancer and

occupational exposure to metalworking fluid mist: a counter-matched case-control study in
French steel-producing factories. Occup Environ Med. 2018;75(5):328-36.

2. Langholz B, Borgan O. COUNTER-MATCHING - A STRATIFIED NESTED CASE-

CONTROL SAMPLING METHOD. Biometrika. 1995;82(1):69-79.

3. Breslow NE, Lumley T, Ballantyne CM, Chambless LE, Kulich M. Improved Horvitz-
Thompson Estimation of Model Parameters from Two-phase Stratified Samples: Applications
in Epidemiology. Stat Biosci. 2009;1(1):32.

4. Rivera C, Lumley T. Using the whole cohort in the analysis of countermatched

samples. Biometrics. 2016;72(2):382-91.

Contacts et modalités de candidature : Pour plus d’information ou pour candidater, merci

d’envoyer votre CV et lettre de motivation à Michel Grzebyk (michel.grzebyk@inrs.fr)