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Alger: 16.05.2023
2
Introduction
3
A
Validité:
situation expérimentale (Se, Sp)
situation réelle (VPP, VPN)
4
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Résultat quantitatif
5
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
6
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Maladie
Présente Absente
Test +
-
7
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Maladie
Présente Absente
VP
Test +
-
8
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Maladie
Présente Absente
VP
Test +
- FN
9
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Maladie
Présente Absente
VP FP
Test +
- FN
10
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Maladie
Présente Absente
VP FP
Test +
- FN VN
11
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Maladie
Présente Absente
VP FP
Test +
- FN VN
12
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Maladie
Présente Absente
VP
Test +
- FN
13
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Maladie
Présente Absente
VP
Test +
- FN
Se =
14
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
.
Exemple Résultat binaire
On veut tester la sensibilité
d’un test de dépistage de
l’hépatite virale C. On Maladie
dispose d’un groupe de 58
prélèvements , Présente Absente
correspondant à des
individus atteints de façon
VP
certaine. Parmi eux, le test
a été positif dans 54 cas. Test +
- FN
Se =
15
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple Résultat binaire
On veut tester la sensibilité
d’un test de dépistage de
l’hépatite virale C. On Maladie
dispose d’un groupe de 58
prélèvements , Présente Absente
correspondant à des
individus atteints de façon
54
certaine. Parmi eux, le test
a été positif dans 54 cas. Test +
- 4
Se =
16
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple Résultat binaire
On veut tester la sensibilité
d’un test de dépistage de
l’hépatite virale C. On Maladie
dispose d’un groupe de 58
prélèvements , Présente Absente
correspondant à des
individus atteints de façon
54
certaine. Parmi eux, le test
a été positif dans 54 cas. Test +
- 4
Se = 93,1%
17
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Maladie
Présente Absente
FP
Test +
- VN
18
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Maladie
Présente Absente
FP
Test +
- VN
Sp =
19
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple Résultat binaire
On veut tester la spécificité
d’un test de dépistage de
l’hépatite virale C. On Maladie
dispose d’un groupe de 125
prélèvements , Présente Absente
correspondant à des
individus indemnes de
FP
façon certaine. Parmi eux,
le test a été négatif dans Test +
114 cas.
- VN
Sp =
20
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple Résultat binaire
On veut tester la spécificité
d’un test de dépistage de
l’hépatite virale C. On Maladie
dispose d’un groupe de 125
prélèvements , Présente Absente
correspondant à des
individus indemnes de
11
façon certaine. Parmi eux,
le test a été négatif dans Test +
114 cas.
- 114
Sp =
21
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple Résultat binaire
On veut tester la spécificité
d’un test de dépistage de
l’hépatite virale C. On Maladie
dispose d’un groupe de 125
prélèvements , Présente Absente
correspondant à des
individus indemnes de
11
façon certaine. Parmi eux,
le test a été négatif dans Test +
114 cas.
- 114
Sp = 91,2%
22
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat binaire
Maladie
Présente Absente
VP FP
Test +
- FN VN
Se = Sp =
23
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
24
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
25
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
26
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
1,26 g/l
27
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
1,26 g/l
28
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
29
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
30
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
VN
31
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
VN VP
32
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
VN VP
FN
33
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
VN VP
FN FP
34
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
Cas Témoins
VN VP
VP FP
FP
+
FN
- FN VN
Se = Sp =
35
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
Cas Témoins
VN VP
VP FP
FP
+
-
FN
FN VN
Se = Sp =
36
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
Cas Témoins
VN VP
VP FP
FP
+
-
FN
FN VN
Se = Sp =
37
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
Cas Témoins
VN VP
VP FP
FP
+
-
FN
FN VN
Se = ↑ Sp = ↓
38
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
Cas Témoins
VN VP
VP FP
FN
+
FP
- FN VN
Se = Sp =
39
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
Cas Témoins
VN VP
VP FP
FN
+
FP
- FN VN
Se = ↓ Sp = ↑
40
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
Sensibilité
ou 100%
Spécificité
41
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
Sensibilité
Sensibilité
ou 100%
Spécificité
Spécificité
42
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
VP
VN
FP
Sensibilité = 100%
43
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
VN
FN VP
Spécificité = 100%
44
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
45
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
46
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
47
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
48
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
49
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
50
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
51
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
52
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
53
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
54
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Spécificité
55
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Résultat quantitatif
courbe ROC
56
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
C
e st
T
Sensibilité
stB
Te
A
e st
T
1-Spécificité 1 58
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
1
stD
Te
C
e st
T
Sensibilité
stB
Te
A
e st
T
1-Spécificité 1 59
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple : courbe ROC.
Performance du test d’IFI dans le dépistage
sérologique du paludisme
1/10 100 40
1/20 100 50
1/40 90 80
1/80 80 90
1/160 60 95
1/320 40 99
1/640 10 100
60
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple : courbe ROC.
Performance du test d’IFI dans le dépistage Se (%)
sérologique du paludisme 100
90 1/20 1/10
Dilutions Cas de paludisme Sujets sains 1/40
80
1/80
70
IFI Se (%) Sp (%) 60 1/160
50
1/10 100 40 1/320
40
1/20 100 50 30
20
1/40 90 80
10 1/640
1/80 80 90 0
0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
1/160 60 95
1-Sp (%)
1/320 40 99
1/640 10 100
61
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple : courbe ROC.
Performance du test d’IFI dans le dépistage Se (%)
sérologique du paludisme 100
90 1/20 1/10
Dilutions Cas de paludisme Sujets sains 1/40
80
1/80
70
IFI Se (%) Sp (%) 60 1/160
50
1/10 100 40 1/320
40
1/20 100 50 30
20
1/40 90 80
10 1/640
1/80 80 90 0
0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
1/160 60 95
1-Sp (%)
1/320 40 99
1/640 10 100
62
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple : courbe ROC.
Performance du test d’IFI dans le dépistage Se (%)
sérologique du paludisme 100
90 1/20 1/10
Dilutions Cas de paludisme Sujets sains 1/40
80
1/80
70
IFI Se (%) Sp (%) 60 1/160
50
1/10 100 40 1/320
40
1/20 100 50 30
20
1/40 90 80
10 1/640
1/80 80 90 0
0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
1/160 60 95
1-Sp (%)
1/320 40 99
1/640 10 100
63
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
64
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
65
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
VPP=
VPN =
66
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
%
100 -
-
-
-
- VPP VPN
-
-
-
-
-
-
-
-
0 Prévalence % 100 67
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
%
100 -
-
-
-
- VPP VPN
-
-
-
-
-
-
-
-
0 Prévalence % 100 68
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
%
100 -
-
-
-
- VPP VPN
-
-
-
-
-
-
-
-
0 Prévalence % 100 69
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
%
100 -
-
-
-
- VPP VPN
-
-
-
-
-
-
-
-
0 Prévalence % 100 70
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
%
100 -
-
-
-
- VPP VPN
-
-
-
-
-
-
-
-
0 Prévalence % 100 71
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
%
100 -
-
-
-
- VPP VPN
-
-
-
-
-
-
-
-
0 Prévalence % 100 72
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple:
Un radiologue spécialisé en mammographie dépiste une
proportion de 20% de femmes atteintes de cancers de sein.
L’examen mammographique qu’il utilise a une sensibilité de
98% et une spécificité de 90%.
Quelles sont les valeurs prédictifs de ce test?
73
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple:
Un radiologue spécialisé en mammographie dépiste une
proportion de 20% de femmes atteintes de cancers de sein.
L’examen mammographique qu’il utilise a une sensibilité de
98% et une spécificité de 90%.
Quelles sont les valeurs prédictifs de ce test?
VPP=
VPN =
74
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple:
Un radiologue spécialisé en mammographie dépiste une
proportion de 20% de femmes atteintes de cancers de sein.
L’examen mammographique qu’il utilise a une sensibilité de
98% et une spécificité de 90%.
Quelles sont les valeurs prédictifs de ce test?
VPP= 71,0%
VPN= 99,4%
75
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple:
Ce radiologue décide de consacrer son installation
exclusivement au programme de dépistage systématique du
cancer du sein. La prévalence de cette affection est de 1%
dans la population cible de ce programme. Sachant que
l’examen mammographique est strictement identique à la
situation précédente, les valeurs prédictives du test ont-elles
changé?
76
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
%
100 -
-
-
-
- VPP VPN
-
-
-
-
-
-
-
-
0 20 Prévalence % 100 77
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
%
100 -
-
-
-
- VPP VPN
-
-
-
-
-
-
-
-
0 1 20 Prévalence % 100 78
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
%
100 -
-
-
-
- VPP VPN
-
-
-
-
-
-
-
-
0 1 20 Prévalence % 100 79
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple:
VPP=9,0% (71,0%)
VPN=99,9% (99,4%)
80
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple:
81
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple:
Afin d’améliorer la VPP de son test, le radiologue décide
d’acheter un nouvel appareillage, fournissant une spécificité
de 95% (au lieu de 90%) avec la même sensibilité.
Quelle est l’amélioration de la VPP?
82
A
A.
Validité
situation expérimentale (Se, Sp) situation réelle (VPP, VPN)
Exemple:
Afin d’améliorer la VPP de son test, le radiologue décide
d’acheter un nouvel appareillage, fournissant une spécificité
de 95% (au lieu de 90%) avec la même sensibilité.
Quelle est l’amélioration de la VPP?
VPP=16,5%
83
B
Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
84
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
85
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
• Coefficient kappa
86
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
• Coefficient kappa
87
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
Coefficient kappa
A
négatif positif
négatif -- -+
B
positif +- ++
88
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
Coefficient kappa
A
négatif positif
négatif -- -+
B
positif +- ++
Cc=
Ca=
89
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
Coefficient kappa
A
négatif positif
K=
négatif -- -+
B
positif +- ++
Cc=
Ca=
90
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
Coefficient kappa
Exemple
N°1 Total
M+ M-
M+ 32 18 50
N°2
M- 9 75 84
Total 41 93 134
91
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
Coefficient kappa
Exemple
N°1 Total
M+ M-
M+ 32 18 50 K=
N°2
M- 9 75 84
Total 41 93 134
92
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
Coefficient kappa
Exemple
N°1 Total
M+ M-
M+ 32 18 50 K=
N°2
M- 9 75 84
Total 41 93 134
Cc=
Ca=
93
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
Coefficient kappa
Exemple
N°1 Total
M+ M-
M+ 32 18 50 K=
N°2
M- 9 75 84
Total 41 93 134
Cc= = 0,799
Ca= = = 0,549
94
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
Coefficient kappa
Exemple
N°1 Total
M+ M-
M+ 32 18 50 K=
N°2
M- 9 75 84
Total 41 93 134
Cc= = 0,799
Ca= = = 0,549
95
B Fiabilité
(reproductibilité et concordance)
Coefficient kappa
Exemple
N°1 Total
M+ M-
M+ 32 18 50
N°2
M- 9 75 84 K = 0,544
Total 41 93 134
96
Conclusion
Conclusion