MICROORGANISMES RESPONSABLES DINFECTIONS NOSOCOMIALES

Infection
POZZETTO B, Saint Etienne

Janvier 2009

Objectif
Un grand nombre dagents infectieux (parasites, levures, bactries, virus, prions) peuvent tre responsables dinfections nosocomiales (IN). Nanmoins, certains dentre eux sont plus frquemment impliqus ; il est indispensable de les identifier et de connatre leur habitat prfrentiel, leur(s) mode(s) de transmission nosocomiale, leur(s) porte(s) dentre dans lorganisme et les principales pathologies dont ils sont lorigine, afin dorganiser plus efficacement la prvention et la prise en charge de ces dernires.

Techniques et mthodes
PRESENTATION DES PRINCIPAUX AGENTS INFECTIEUX RESPONSABLES DIN
Les tableaux ci-aprs rpertorient par grands types dagents infectieux ceux qui sont le plus souvent rendus responsables dIN, aussi bien chez les patients que chez les soignants. Leur reconnaissance repose, partir dchantillons judicieusement prlevs, sur les techniques microbiologiques et parasitologiques couramment dveloppes dans les laboratoires concerns. Cette liste n'est pas exhaustive, de nombreux autres agents infectieux peuvent tre impliqus de faon ponctuelle dans le survenue d'une IN. Le lecteur est invit se reporter aux ouvrages spcialiss cits dans la rubrique "Pour en savoir plus" pour des information concernant ces pathognes. En cas de suspicion dpidmie nosocomiale (voir fiche conduite tenir devant une pidmie dinfections nosocomiales), il est ncessaire, pour affirmer ce caractre pidmique, didentifier prcisment lagent infectieux en cause et, sil sagit dun germe relativement banal, de recourir des mthodes de typage phnotypiques (biotypage, profil de rsistance aux antibiotiques, srotypage,) ou gnotypiques (ribotypage, lectrophorse en champ puls, profils de restriction des acides nucliques viraux, analyse phylogntique de souches ) pour tablir la parent entre les souches isoles chez les patients, les soignants et/ou lenvironnement hospitalier. Ces informations sont complmentaires des recommandations pour la mise en place des prcautions complmentaires d'hygine dveloppes dans le chapitre prvention de la transmission croise : www.chu-st-etienne.fr/hospitalisation/hygiene_securite/isolement_accueil.asp?pos=h.

Responsables
Le responsable du laboratoire de microbiologie est en charge de la vigilance par rapport l'apparition de nouveaux pathognes, de nouvelles rsistances et de cas groups. Le CLIN et l'quipe oprationnelle dhygine sont responsables de la mise en uvre des procds de surveillance et de prvention adapts. Le mdecin en charge du signalement des IN est responsable de la dclaration la DASS et au CCLIN des cas inhabituels dIN de par leur gravit, leur caractre pidmique, la nature du germe ou son niveau de rsistance aux agents anti-infectieux Le responsable de service doit tre vigilant pour identifier des situations inhabituelles par rapport aux rsultats microbiologiques de son service.

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Pour en savoir plus

Rfrences Avril JL, Carlet J et al. Les infections nosocomiales et leur prvention. Ellipses, Paris, 1998, 687 pages. Pozzetto B. coordonnateur. Infections nosocomiales virales et agents transmissibles non conventionnels coordonnateur. John Libbey Eurotext, Montrouge., 2001, 554 pages.

Guides et recommandations Comit Technique national Des Infections Nosocomiales (CTIN). Isolement septique Recommandations pour les tablissements de soins. Ministre de l'Emploi et de la Solidarit, 1998, 51pages. Socit Franaise de Microbiologie. Le REMIC. Rfrentiel en Microbiologie Mdicale (bactriologie et mycologie), 3me dition. Vivactis plus ditions, Paris, 2007, 232 pages. Socit Franaise de Microbiologie. Le REVIR. Rfrentiel en Virologie Mdicale, 2me dition. Vivactis plus ditions, Paris, 2007, 159 pages.

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HABITAT PREFERENTIEL PARASITES Pediculus capitis (pou de tte) Pediculus corporis (pou de corps) Pediculus pubis (pou de pubis ou morpion) Sarcoptes scabei hominis LEVURES Aspergillus sp (A. flavus, niger, )

MODE(S) DE TRANSMISSION Contact direct Contact indirect

PORTE(S) DENTREE A LHOPITAL Poils, cheveux

PRINCIPALES PATHOLOGIES NOSOCOMIALES Pdiculose

MENTION PARTICULIERE

Humain (zones pileuses) Environnemental (vtements, literie, matriel de toilette ) Humain

Contact direct Contact indirect Aroport (exclusivement partir de l'environnement) Contact direct Contact indirect (manuportage) Aroport

Cutano-muqueux

Gale

Environnemental (vgtaux, sol, poussires) Humain Animal Environnemental Animal (pigeons) Environnemental Humain

Respiratoire

Aspergillose invasive chez limmunodprim (SIDA, transplants) Candidose cutano-muqueuse chez l'immunocomptent et limmunodprim Mningo-encphalite Pneumopathie Septicmie chez limmunodprim Pneumocystose invasive chez limmunodprim Diarrhe post-antibiothrapie Colite pseudo-membraneuse Diffusion d'un clone pidmique dnomm O27 responsable de formes svres, surtout dans les institutions de personnes ges.

Candida sp (C. albicans, glabrata, krusei ) Cryptococcus neoformans

Cutanomuqueuse Digestive Endogne Respiratoire

Pneumocystis carinii hominis BACILLES A GRAM POSITIF Clostridium difficile

Gouttelettes

Respiratoire Endogne Digestive Endogne

Humain (TD) Animal (TD) Environnemental (spores)

Contact indirect (manuportage)

Listeria monocytogenes

Environnemental (vgtaux, sol, poussires, aliments)

Contact direct (rare) Contact indirect

Digestive Respiratoire

Listriose chez limmunodprim (mningite, mningo-encphalite, septicmie )

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HABITAT PREFERENTIEL COCCI A GRAM POSITIF Enterococcus sp (E. faecalis, faecium) (entrocoques) Humain (TD) Animal (TD) Environnemental (eaux, aliments) Humain (peau, rhinopharynx, vagin) Environnemental (poussires, aliments)

MODE(S) DE TRANSMISSION Contact indirect (manuportage)

PORTE(S) DENTREE A LHOPITAL Digestive Endogne

PRINCIPALES PATHOLOGIES NOSOCOMIALES Infection urinaire Bactrimie Suppuration

MENTION PARTICULIERE Emergence de souches rsistantes la vancomycine (ERV) devant faire l'objet de mesures de prvention trs renforces pour viter leur dissmination. Bactries souvent multirsistantes aux antibiotiques : SARM ou S. aureus rsistant la mthicilline ; VISA (ou GISA) ou S. aureus de sensibilit diminue la vancomycine (ou aux glycopeptides). Ces bactries doivent faire l'objet de mesures de prvention trs renforces pour viter leur dissmination.

Staphylococcus aureus (staphylocoque dor)

Contact direct Contact indirect (manuportage)

Cutanomuqueuse Percutane Digestive Respiratoire Endogne

Staphylococcie : Infection de la peau et des parties molles (plaie, brlure) Pneumopathie Bactrimie,septicmie Infection urinaire Infection osteo-articulaire Infection sur cathter et sur prothse Toxi-infection alimentaire

Staphylocoques coagulase negative (S. hominis, S. epidermidis, S. capitis ) Streptococcus agalactiae (streptocoque B)

Humain (peau, muqueuses) Animal (peau, muqueuses) Environnemental Humain (TD, vagin)

Contact direct Contact indirect (manuportage) Contact direct Contact indirect (manuportage)

Cutanomuqueuse Percutane Endogne Cutanomuqueuse Digestive Respiratoire Endogne Materno-foetale Respiratoire Endogne

Staphylococcie Bactrimie Infections sur cathter et sur prothse Mningite Bactrimie , endocardite Pritonite Pneumonie Infection cutanomuqueuse Infection urinaire Infection du nouveau-n l'accouchement Pneumonie Bronchite Infections ORL Bactrimie Mningite Arthrite

Streptococcus pneumoniae (pneumocoque)

Humain et animal (voies ariennes suprieures)

Gouttelettes

Bactries pouvant prsenter une sensibilit diminue l'amoxicilline.

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HABITAT PREFERENTIEL COCCI A GRAM POSITIF Streptococcus pyogenes (streptocoque A) Humain (voies ariennes suprieures)

MODE(S) DE TRANSMISSION Gouttelettes Contact direct Contact indirect (manuportage)

PORTE(S) DENTREE A LHOPITAL Cutanomuqueuse Respiratoire Endogne

PRINCIPALES PATHOLOGIES NOSOCOMIALES Scarlatine Angine Infections de la peau et des parties molles (fascite ncrosante) Erysiple Bactrimie choc toxique Rhumatisme articulaire aigu Erythme noueux Glomrulonphrite Infections gnitales gravissimes post accouchement ou chirurgie gyncologique

MENTION PARTICULIERE

BACILLES A GRAM NEGATIF ENTEROBACTERIES

Une surveillance particulirement vigilante doit tre mise en oeuvre pour dpister les entrobactries porteuses de gnes de multirsistance aux antibiotiques ( lactamases spectre largi ou BLSE, imipnmases) et pour viter leur propagation nosocomiale. Humain (TD) Animal (TD) Environnemental (sol, eau, vgtaux) Humain (TD) Animal (TD) Environnemental (eau, aliments) Humain (TD) Animal (TD) Environnemental (sol, eau, vgtaux) Contact indirect (manuportage) Cutanomuqueuse Digestive Respiratoire Endogne Digestive Endogne Pneumopathie Suppuration Bactrimie Infection urinaire Diarrhe Suppuration Infections urinaire et gnitale Bactrimie Mningite Toxi-infection alimentaire Suppuration Bactrimie Pneumopathie Infection urinaire

Enterobacter sp (E. aerogenes, cloacae )

Escherichia coli

Contact indirect (manuportage)

Klebsiella sp (K. pneumoniae, oxytoca)

Contact indirect (manuportage)

Cutanomuqueuse Digestive Respiratoire Endogne

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HABITAT PREFERENTIEL BACILLES A GRAM NEGATIF ENTEROBACTERIES Proteus sp (P. mirabilis, vulgaris)

MODE(S) DE TRANSMISSION

PORTE(S) DENTREE A LHOPITAL Digestive Endogne Digestive

PRINCIPALES PATHOLOGIES NOSOCOMIALES

MENTION PARTICULIERE

Humain (TD) Animal (TD) Environnemental (sol, eau) Humain (TD) Environnemental (eau, aliments) Humain (TD) Animal (TD) Environnemental (eau, aliments) Humain (TD) Animal (TD) Environnemental (eau, sol, vgtaux) Animal (TD) Environnemental (eau, sol, aliments)

Contact indirect (manuportage) Contact indirect (manuportage)

Infection urinaire Bactrimie

Salmonella enterica - typhi, paratyphi - salmonelles mineures

Fivres typhode et paratyphodes Toxi-infections alimentaires

Serratia sp (S. marcescens, liquefaciens)

Contact indirect (manuportage) Contact direct Contact indirect (manuportage)

Yersinia enterocolitica

Cutanomuqueuse Digestive Endogne Digestive Sanguine

Pneumopathie Infection urinaire Suppuration Bactrimie Diarrhe Bactrimie

Possibilit de transmission par des produits sanguins contamins du fait de la rsistance de cette bactrie au froid. Bactrie souvent multirsistante aux antibiotiques. Recrudescence de cas nosocomiaux du fait d'une attnuation de l'immunit post-vaccinale des adultes jeunes qui constituent un rservoir pour les nourrissons non vaccins susceptibles de faire des infections graves. Rappel vaccinal du personnel fortement recommande.

AUTRES BACILLES A GRAM NEGATIF Acinetobacter baumannii

Bordetella pertussis (bacille de Bordet-Gengou)

Humain (peau et muqueuses) Environnemental (eau, sol) Humain (voies ariennes suprieures)

Contact indirect (manuportage) Gouttelettes

Cutanomuqueuse Digestive Respiratoire

Pneumopathie Bactrimie Coqueluche

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HABITAT PREFERENTIEL AUTRES BACILLES A GRAM NEGATIF Burkholderia cepacia

MODE(S) DE TRANSMISSION

PORTE(S) DENTREE A LHOPITAL Digestive Respiratoire Respiratoire

PRINCIPALES PATHOLOGIES NOSOCOMIALES

MENTION PARTICULIERE

Environnemental (eau, sol) Humain (muqueuses) Animal (muqueuses)

Contact indirect (manuportage) Gouttelettes

Pneumopathie Pneumopathie Bronchite Infections ORL Mningite Epiglottite Lgionellose : Pneumopathie Fivre de Pontiac

Bactrie souvent multirsistante aux antibiotiques.

Haemophilus influenzae

Legionella sp (L. pneumophila, )

Environnemental (eaux tides, climatiseurs)

Gouttelettes

Respiratoire

Contamination partir de rservoirs d'eau chaude ou tide (douches, hydrothrapie, balnothrapie) justifiant une surveillance environnementale. Bactrie souvent multirsistante aux antibiotiques et notamment la ticarcilline. Bactrie souvent multirsistante aux antibiotiques.

Pseudomonas aeruginosa (bacille pyocyanique)

Humain (TD) Environnemental (eau , sol, vgtaux)

Contact indirect (manuportage)

Cutanomuqueuse Digestive Respiratoire Endogne Digestive Respiratoire

Stenotrophomonas maltophilia

Environnemental (sol, vgtaux)

Contact indirect (manuportage)

Pneumopathie Infection urinaire Infection de la peau et des parties molles (plaie, brlure) Bactrimie Suppuration Pneumopathie Bactrimie

AUTRES BACTERIES
Mycobactries tuberculeuses (Mycobacterium tuberculosis, bovis, africanum) atypiques (M. aviumintracellulare, xenopi ) Humain (galement bovin pour M. bovis) Animal Environnemental Humain (voies ariennes suprieures) Aroport Gouttelettes Gouttelettes Contact indirect (eau) Gouttelettes Respiratoire Endogne Cutanomuqueuse Respiratoire Per-opratoire Respiratoire Tuberculose pulmonaire Tuberculose extra-pulmonaire Mningite tuberculeuse Infection respiratoire basse Infection ganglionnaire Infection dissmine chez limmunodprim Pneumopathie atypique Infections ORL et respiratoire haute Formes neurologiques Emergence de souches de mycobactries tuberculeuses multirsistantes aux antituberculeux.

Mycoplasma pneumoniae

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HABITAT PREFERENTIEL

MODE(S) DE TRANSMISSION Gouttelettes Contact indirect (manuportage) Contact direct Contact indirect

PORTE(S) DENTREE A LHOPITAL Cutanomuqueuse Digestive Respiratoire Cutanomuqueuse Sanguine Endogne Percutane Sanguine Cutanomuqueuse Endogne Cutanomuqueuse Respiratoire Endogne Digestive Respiratoire

PRINCIPALES PATHOLOGIES NOSOCOMIALES Infection respiratoire haute et basse Bronchite, bronchiolite Krato-conjonctivite Gastro-entrite Fivre prolonge Syndrome mononuclosique Infection chronique chez limmunodprim (rtinite, pneumopathie, colite ) Hpatite aigu Hpatite chronique Association au cancer primitif du foie Infection cutano-muqueuse Krato-conjonctivite Mningo-encphalite Infection chronique chez limmunodprim Varicelle Zona Mningo-encphalite Infection chronique ou grave (pneumopathie) chez limmunodprim Mningite poliomylite Infection respiratoire Bronchite- angine herpangine Infection cutane Infection oculaire Pricardite Grippe commune Grippe maligne Bronchite, bronchiolite

MENTION PARTICULIERE Vigilance par rapport aux appareils d'ophtalmologie mal dsinfects pouvant tre l'origine d'pidmies de krato-conjonctivite.

VIRUS A ADN
Adnovirus (ADV) Humain (formations lymphodes, TD) Humain (cellules mononucles, cellules pithliales salivaires, rnales, cellules endothliales) Humain (foie) Humain (ganglions nerveux sensitifs) Humain (ganglions nerveux sensitifs)

Cytomgalovirus (CMV)

Virus de lhpatite B (HBV) Virus herps simplex (HSV)

Contact direct Contact indirect Contact direct Contact indirect (manuportage) Aroport Gouttelette Contact direct

Vaccination obligatoire du personnel soignant.

Virus varicelle-zona (VZV)

VIRUS A ARN
Entrovirus Humain (TD) Environnemental (eau) Gouttelettes Contact indirect (manuportage)

Myxovirus influenzae (virus de la grippe)

Humain (arbre respiratoire)

Gouttelettes Contact indirect (manuportage)

Cutanomuqueuse Respiratoire

Vaccination trs fortement recommande chez le personnel soignant en contact avec des patients fragiles ou gs

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HABITAT PREFERENTIEL

MODE(S) DE TRANSMISSION Gouttelettes Contact indirect (manuportage) Contact direct Contact indirect (manuportage) Contact indirect

PORTE(S) DENTREE A LHOPITAL Cutanomuqueuse Respiratoire Digestive Percutane Sanguine

PRINCIPALES PATHOLOGIES NOSOCOMIALES Rhume banal Infection ORL Bronchite, bronchiolite Gastro-entrite Dshydratation Fivres hmorragiques virales de gravit variable

MENTION PARTICULIERE

VIRUS A ARN
Rhinovirus Rotavirus Virus des fivres hmorragiques (Ebola, Marburg, Lassa) Humain (arbre respiratoire) Humain (TD) Environnemental (eau, aliments) Rservoir animal encore mal connu

Epidmies nosocomiales dans les pays en dveloppement en raison du non respect des prcautions lmentaires d'hygine vis-vis du risque sanguin.

Virus de lhpatite A (HAV) Virus de lhpatite C (HCV)

Humain (TD) Environnemental (eau, aliments) Humain (foie)

Contact direct Contact indirect (manuportage) Contact indirect

Digestive Percutane Sanguine Hpatite chronique Transmission nosocomiale souvent conscutive un non respect des rgles d'hygine (exposition des traces de sang, partage de matriel, utilisation multipatients de solutions injectables usage unique).

Virus de limmunodficience humaine (HIV) Virus parainfluenza (PIV) Virus respiratoire syncytial (RSV)

Humain (lymphocytes T) Humain (arbre respiratoire) Humain (arbre respiratoire)

Contact direct Contact indirect Gouttelettes Contact indirect (manuportage) Gouttelettes Contact indirect (manuportage)

Percutane Sanguine Cutanomuqueuse Respiratoire Cutanomuqueuse Respiratoire

Immunodficience SIDA Infection respiratoire haute et basse Infection respiratoire haute et basse (en particulier bronchiolite)

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HABITAT PREFERENTIEL

MODE(S) DE TRANSMISSION Gouttelettes (contact rapproch)

PORTE(S) DENTREE A LHOPITAL Respiratoire

PRINCIPALES PATHOLOGIES NOSOCOMIALES Infection respiratoire grave

MENTION PARTICULIERE Epidmie en 2006 ayant fait plus de 800 morts dont un grand nombre de cas nosocomiaux (personnels de sant contamins partir de patients infects) Transmission possible par les produits sanguins provenant

VIRUS A ARN
Virus du SRAS (Sars-CoV) Rservoir animal encore mal connu

Virus West Nile

Moustiques (arbovirose)

Contact direct

Percutane (piqre de moustique) Sanguine

Fivre isole Mningite Mningoencphalite

AGENTS TRANSMISSIBLES NON CONVENTIONNELS OU PRIONS PrPres

Humain (systme nerveux, oeil) Humain (systme nerveux central, il, amygdales, formations lymphodes associes au tube digestif) Animal (bovins)

Contact direct

PrPres forme variante

Contact direct Contact indirect

Peropratoire Percutane (hormones de croissance ) Peropratoire Sanguine

Encphalopathie spongiforme de pronostic constamment mortel Encphalopathie spongiforme de pronostic constamment mortel Contamination possible par des produits sanguins contamins provenant de donneurs en phase dincubation de la maladie.

* TD : tube digestif

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