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Chez les eucaryotes (organismes dont les cellules possèdent un noyau), l’épissage (ou
épissure) est un processus par lequel les ARN transcrits à partir de l'ADN génomique peuvent
subir des étapes de coupure et ligature qui conduisent à la suppression de certaines régions
dans l'ARN final. Les segments conservés s'appellent des exons et ceux qui sont éliminés
s'appellent des introns. Les gènes sont donc constitués d'une suite d'exons et d'introns
alternés : Exon1-Intron1-Exon2-Intron2-Exon3… Ceci s'observe principalement dans les
gènes codant des protéines, mais aussi dans certains gènes d'ARN non-codants comme les
.gènes d'ARNt
Lors de la transcription de gènes codant des protéines, un pre-ARNm est synthétisé, puis
celui-ci est épissé dans le noyau de la cellule pour donner lieu à l'ARNm dit mature. L'ARNm
mature, constitué des seuls exons, est alors exporté vers le cytoplasme pour être traduit en
.protéine
L'épissage est assuré par un ensemble de complexes ribonucléoprotéiques appelé
collectivement spliceosome (épissage = splicing en anglais). Chaque complexe, appelé snRNP
.pour Small Nuclear Ribonucleoprotein, contient un ARN et plusieurs protéines
Il existe également des introns appelés auto-épissa blés ou auto-catalytiques, c’est-à-dire
capable de s'exciser sans intervention d'un spliceosome, dans les mitochondries, les plastes et
certaines bactéries. Cependant, au moins dans les mitochondries et les chloroplastes, certains
.de ces introns nécessitent l'intervention de protéines nucléaires
Par analogie avec le fonctionnement du ribosome, on pense que dans le spliceosome, c'est
l'ARN qui est catalytique et donc que le spliceosome est un ribozyme. Le mécanisme
.catalytique exact du spliceosome est encore inconnu
Schéma de l'organisation des jonctions exon-intron-exon. Les exons amont et aval sont en
.orange et l'intron est en gris. Les nucléotides conservés sont indiqués
L'épissage proprement dit s'effectue en deux temps, on a tout d'abord une attaque nucléophile
du 2'-OH du ribose de l'adénosine de la boite de branchement sur le phosphate de la jonction
exon-intron en 5'. Après cette coupure, le 3'-OH libéré au niveau de l'exon amont attaque le
phosphate de la jonction intron-exon en aval. Les produits de cette réaction sont d'une part les
deux exons ligaturés correctement et d'autre part, l'intron cyclisé au niveau de l'adénosine de
la boite de branchement. En raison de sa forme particulière, cette forme de l'intron est appelée
lasso (en: lariat). Le lasso est finalement ouvert par une enzyme de débranchement afin de
pouvoir être recyclé
Mécanisme de l'épissage
Mécanisme d'épissage [modifier
[
[Les snRNP [modifier
Les snRNP ou small nuclear ribonucleoproteins sont des composants du spliceosome présents
dans le noyau des cellules eucaryotes. Le processus d'épissage canonique fait appel à cinq
snRNP, appelés U1, U2, U4, U5 et U6. Chacun de ces snRNP est composé d'un ARN, appelé
ARNpn, qui adopte une structure secondaire et tertiaire spécifique, et de plusieurs proteines.
Parmi les protéines associées, certaines sont communes à tous les snRNP et d'autres sont
spécifiques de chacun d'entre eux. Les proteines communes sont appelées protéines Sm, elles
sont au nombre de sept et s'associent pour former un anneau heptamérique entourant un
.segment du snARN
Les protéines spécifiques sont en nombre variable, il y en a par exemple trois pour U1: U1A,
.U1C et U1-70K
[Processus d'épissage [modifier
Mécanisme d'épissage d'un intron par le spliceosome. Les deux exons sont représentés par des
.barres bleues et l'intron par un trait noir
Le processus d'épissage est un mécanisme dynamique qui suit une succession précise
d'évènements au cours de laquelle les différents snRNP s'assemblent et se désassemblent du
: spliceosome. La séquence est la suivante
.U1 s'associe à la jonction 5' de l'intron.1
.U2 s'associe à la boite de branchement.2
U4 associé à U6 rapproche U1 et U2, réalisant ainsi un pont entre la jonction 5' de.3
.l'intron et la boite de branchement
.U5 s'associe à son tour et rapproche les bords 3' et 5' des exons à suturer.4
.U4 et U1 quittent le complexe.5
.Le 2'-OH du A de la boite de branchement coupe la jonction 5' de l'intron.6
.Le 3'-OH du nucléotide en 3' de l'exon amont coupe l'autre jonction.7
.L'ARNm épissé et l'intron en "lasso" sont libérés.8
[Association des composants du spliceosome [modifier
La plupart des interactions entre l'ARNm et le les snRNP passent par des appariements de
base entre portions de séquences nucléotidiques complémentaires. Ainsi par exemple le
snARN U1 contient une séquence complémentaire de la séquence consensus retrouvée à la
jonction exon-intron en 5', ce qui lui permet de se lier à cette région des pré-ARN messagers.
.Il existe également des appariements ARN-ARN entre les différents snARN
[Introns autocatalytiques [modifier
Chez certains protozoaires (organismes eucaryotes uni-cellulaires), certains ARN introniques
n'ont pas besoin de spliceosomes, ils suffisent à catalyser les réactions d'épissage ("self-
splicing") sans apport de protéines extérieures. Ce phénomène relativement rare concerne les
introns formants un ribozyme. On trouve deux sortes d'introns autocatalytiques : Les groupes
.1 et 2
[Épissage alternatif [modifier
Chez les Eucaryotes uniquement, c'est une étape nécessaire pour rendre un ARN messager
viable à la traduction. Cette étape consiste à la délétion des introns ou des exons qui ne seront
pas nécessaires au codage de la protéine, à l'addition d'une coiffe méthylée en 5' et d'une
queue poly(A) en 3'. Ces derniers éléments seront nécessaires au déplacement de l'ARN
messager du noyau vers le cytoplasme, où il sera traduit par les ribosomes, ainsi qu'à sa
.stabilité, puisqu'il ne sera plus attaquable par les ARNs nucléosidases
En effet le spliceosome reconnaît des signaux d'épissage, comme pour un signal radio, ces
signaux d'épissage sont plus ou moins forts, ce qui implique que le spliceosome les reconnait
.plus ou moins bien
.Ces signaux sont simplement des séquences spécifiques de nucléotides
Les signaux faibles sont appelés « signaux d'épissage alternatif », ils vont permettre à un pre-
ARNm d'être épissé en plusieurs ARNm matures. Par opposition les signaux forts sont
.« appelés « signaux constitutifs