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En ville :
E. coli 75 %
A lhopital
SIGNES CLINIQUES
* cystite simple :
* pyelonphrite : fivre + douleurs lombaires. Signes urinaires inconstants.
EXAMEN : ECBU
ITU dfinie par : leucocytes > 104/mL
germes > 104 105/mL
Leuco / mL Bact / mL
N < 104 < 104
ITU > 104 > 104 monobact
Dcapite
Tuberculose > 104 < 104
Prostatite, urtrite
ITU dbutante
Pylonphrite
< 104 > 104
Terrain particulier (diabte, ID)
Contamination
TRAITEMENTS
Cystite rcidivante* ou cystite complique (femme enceinte, diabtique, tat gnral) : ECBU !
Clamoxyl Augmentin
C3G orale :
FQ
Cystite de la femme enceinte : pniA, C3G orale, acide pipmidique, nitrofurandoine : 3j ou 10j
Antibioprophylaxie cystite rcidivante (femme age, fille < 2 ans) : BACTRIM 6 mois + contrle
Pylonphrite non complique : monothrapie 15-21
C3G parentrale :
FQ (relais possible PO)
Pylonphrite complique : bithrapie avec aminoside: C3G, FG,
A lhopital
Abstention thrapeutique
- patiente ge asymptomatique (tt si confusion, rtention urinaire )
- patient sond asymptomatique
Cystite complique :
ECBU
Prlvement : desinfection mat urinaire, rejet premier jet, urines du matin ++,
Examen direct :
Ensemencement
1 L (anse calibre)
milieu chromogne Uriselect (bien pour urine trouble. Colorations parfois trompeuses)
milieu CLED : toutes les bact responsables dITU sont susceptibles dy pousser)
candiselect si levures lexamen direct.
VCA3-sg cuit si gonocoques lexamen direct
Identification
Flore colique
Flore commensale
Flore de passage
S. aureus
P. aeruginosa
Proteus
Levures
Syndromes diarrhiques
Les espces :
Le srogroupage de lAg O des Shigella permet de diffrencier plusieurs espces, dont le pouvoir
pathogne est diffrent.
S. dysenteriae (10 srovars)
S. flexneri (6 srovars)
S. boydii (15 srovars)
S. sonnei (1 srovar)
S. dysenteriae est responsable de la dysentrie bacillaire. Les autres espces peuvent ntre responsables
que de gastro-entrites fbriles.
Epidemiologie
Zone intertropicale +++ : responsable de dysentries mortelles (enfants). S. dysenteriae
En France : rare (< 1% des diarrhes infectieuses). S. flexneri et S. sonnei uniquement.
Transmission
Bactries strictement humaines
Transmission fco-orale (eau +)
Dose infectante faible (100 bact)
Clinique de linfection
Incubation : 1-3 j
Dysentrie : fivre +++
douleurs abdominales violentes
vomissements
diarrhes nombreuses, glairo-sanglantes, purulentes
Evoution : dpend srovar/hte. Formes graves associes S.dysenteriae et S. flexneri
Gurison spontane en 4-5 j ou DC
Physiopathologie
Srotypage :
Traitement
Salmonella non typhiques
Les espces
S. typhii, para A, para B, para C : responsables de la fivre thyode. Pas en France mais cas dimportation.
S. thyphimurium et S. enteridis sont les principales responsables des salmonelloses dig mineures.
Transmission
Rservoir naturel trs large : animaux, hommes
Transmission par voie alimentaire. Dose infectante leve (rupture chaine du froid +)
Les aliments les plus souvent incrimins : ufs, buf hach ..
Clinique
Incubation : 12-24h
Tableau de gastro-entrite fbrile.
Evolution favorable en 2-3j
Physiopathologie
Adhsion aux cellules pithliales du colon et de lilon : remaniement du cytosquelette (ruffles)
Internalisation de la bactrie, persistance dans le phagosome.
Libres dans la lamina propria sans destruction de la celllule intestinale.
Les salmonelles non typhiiques ne diffusent pas au-del de la lamina propria.
Bactrimie transitoire possible, rares septicmies chez ID et jeunes enfants.
Diagnositc :
Traitement
Salmonella typhii et paratyphii - FIVRE THYPHODE
Les espces
S. typhii, para A, para B, para C : responsables de la fivre thyode.
(le vrai nom est S. enterica subsp. enterica srotype Typhi)
Epidemiologie
PEVD +++
Cas dimportation en France (voyageurs)
Transmission
Rservoir strictement humain : selles des malades, convalescents (plusieurs semaines), porteurs sains
Contamination directe (manuporte), surtout indirecte par l'eau (pril fcal, persistance plusieurs mois),
coquillages, lgumes, oeufs, viande contamine l'abattage...
Clinique
Incubation : longue (15 jours)
Tableau de septicmie : fivre continue
douleurs abominales, diarrhes ou constipation
+/- hmorragies intestinales (perforation)
+/- dlires, prostrations (tuphos),
+/- choc CV
+/- erruptions cutanes
Evolution :
Physiopathologie
Libration des salmonelles dans la lamina propria sans destruction de la cellule intestinale (cf. Salmonella)
Septicmie point de dpart lymphatique : colonisation des gg msentriques et diffusion gale
Survie et multiplication dans les macrophages et cellules rticulo-endothliales
Diffusion dans lorganisme: rate, foie, moelle, peau, vsicule biliaire
Diagnostic
Cf. copro. Sur glose SS : lactose H2S+ ure gallerie.
Identification du srotype par srogroupage (O, H, Vi).
Srodiagnostic de Widal et Flix : bcp de faux + et faux
Traitement
Isolement du patient +++ et mesures dhygine !
Antibiothrapie :
Identification
Infections Helicobacter pylori
Coproculture
Prlvement :
Ensemencement :
Glose SS (pour recherche de Shigelles Salmonelles) + bouillon MH (enrichissement) repiqu sur SS 24h
Glose Campylobacter place en microaerophilie. Rendu 5 jours
Glose CIN pour recherche Yersinia + bouillon
Identification
Glose SS : seules les colonies lactose (transparentes) sont tudies. Les coloniges lactose + (roses)
corresspondent aux autres entrobactries.
Colonies lactose
(transparentes)
H2S H2S +
Recherche rapide des toxines A&B de C. difficile : test immuno enzymatique (conjugu + perox).
Infections respiratoires
Nocardia
Les espces : plusieurs espces (N. asterodes ) sans intrt pour la pratique courante.
Transmission :
Bactries ubiquitaires : sol, eau, air
Possibilit de colonisation des voies respiratoires suprieures chez lhomme.
Pouvoir Pathogne
Diagnostic
Prlvement : expectorations, AB, LBA, PDP
Identification : BG+ fins bacilles ramifis
(acido-alcoolo rsistance : peuvent paratre avec Ziehl)
Colonies :
- 5 jours en arobiose strict sur glose au sg (isolement en quadrant)
- aspect poudreux ou crbriforme, incrustes.
- odeur de terre mouille
Confirmation : PCR
Lidentification prcise des espces na pas dintrt en pratique courante.
Traitement
Prlvement : Urine
Identification :
IDENTIFICATIONS
Enteroccoccus
Gram : diplocoque G+
Milieux didentification
Identification
Bouillon hypersal + + +
Bile/esculine - + +
Tellurite - +/- +
Enterocoque id sur E. faecium ? E. faecalis
gallerie faire ATB et
ventullement id sur
gallerie ensuite
Principe de lidentification
Quantification
Haemophilus
Gram :
Le virus :
Picornaviridae
ARN
enveloppe
Transmission
Fco-orale : eau, aliments, manuportage ++++. (excrtion du virus 2me sem 6me semaine contage)
Phase de virmie pendant la phase dincubation (1 mois) : possibilit conta sanguine (rare)
Clinique de linfection
INCUBATION : 1 mois
Asymptomatique +++ surtout chez lenfant
PHASE PR-ICTRIQUE : anorexie, nauses, asthnie
douleurs hypochondre droit
sd pseudogrippal, fivre
PHASE ICTRIQUE : 1-3 semaines aprs
Evolution
Diagnostic biologique
Prophylaxie
Le virus :
Hepadnaviridae
ADN bicatnaire
virus envelopp
Transmission
sang +++ (forte virmie du sujet infect).
sexuelle (et salivaire ).
verticale : transmission prinatale essentiellement
(au moment de laccouchement, transmission salivaire ou en cas dallaitement).
Prvention : HBs-Ag au 6me mois de grossesse.
Risque 10% si virus pas en rplication / 90% si rplication active.
Physiopathologie
La raction immunitaire est responsable de la cytolyse hpatique.
si trop forte : hpatite fulminante
adadpte : infection asymptomatique et gurison
trop faible : tolrance immunitaire avec rplication prolonge bas bruit entrainant une
destruction bas bruit du foie : hpatite chronique avec cirrhose voire chc.
Clinique de linfection
Phase aige
asymptomatique +++ 90%
forme aige avec signes cliniques ( ictre, asthnie, douleur hypochondre ).
forme cholestatique
hpatite svre voire fulminante : 1%
(surveillance TP, et signes dencphalopathie. 80% mortalit. Transplantation ncessaire).
Evolution
hpatite rsolutive : 90%.
pseudo-gurison mais persistance de lADNccc super-enroul dans lhpatocyte avec
risques de ractivation en cas dID svre (chimiothrapie notamment)..
chronicit : 10%
dfinie par un portage HBs-Ag > 6 mois
Ac anti-HBc
Ac totaux : contage
Contage (dlais 2 mois)
IgM anti-HBc Intressants pour diag hpatite aigue
HBs-Ag
Infection en cours + : infection aigue / chronique si >6 mois
(dlais 1 mois)
ADN viral PCR : qualitatif & diag, pr dtect rplicat bas bruit
Rplication virale (dlais 1 mois) Charge virale : test quantitatif pour tt notamment.
Hbe-Ag
Gurison - Vaccination Ac anti HBs
HEPATITE AIGUE
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
HEPATITE CHRONIQUE
1 2 3 4 2a 3a 4a 5a 6a
Cas des mutants pr-core : mutants non producteurs de lAg HBe, souvent slctionns par pression
immunitaire (sujets Ac-Hbe) au cours dune infection chronique.
Sujets moins bons rpondeurs aux tts et volution + svt cirrhose/cancer
Cas des mutants HBs-Ag : HBs-Ag pas reconnu par les techniques habituelles.
Cas des faux HBs-Ag : faux + (techniques) : neutralisation ou utilisation autres marqueurs.
Traitements
NNs de mre porteuse (aigue ou chronique) : vaccination ds la naissance Ig sp anti HBs (IM)
Risque de contamination effecive (AES ) : Ig spcificques anti HBs (IM)
Autres indications Ig :
- transplant hpatique HBs-Ag+ : Ig spcificques anti HBs (IV)
- voyageurs sans vaccin etc
Hpatite chronique :
Indications du traitement : HBs-Ag + ADN
Objectifs : stopper la rplication virale (ADN et HBe-Ag) et les lsions hpatiques (donc risque K).
Vaccin
Indications :
- fortement conseill aux nourrissons ds M2-M3
- profession risque
- Nn mre HBs+
- entourage patient proteur chronique actif
- conduites risque
Schma classique : J0 M1 M6
Rappels
- si 3 injections avant 25 ans : rappel
- sinon : rappel 5 ans + contrle
Le virus :
Flaviviridae
ARN
Jamais mis en vidence
Transmission
sang +++ (toxicos, transfuss, iatrogne .)
sexuelle ou prinatale : trs rare
Clinique
INCUBATION : 15 90 jours
CLINIQUE
- asymptomatique 90%
- hpatite peu marque : cytolyse modre (5N 10N)
- hpatite fulminante rarrissime
EVOLUTION
- gurison 20% : dfinine par PCR et transa N > 6 mois
- chronicit 80% dfinie par persistance > 6 mois de lARN-VHC et de la cytolyse.
asymptomatique et lsions minimes : 20%
hpatite chronique active : 80%
20% cirrhose en 15-20 ans
chc : 5 % par an
NB : possibilits de manifestations auto-immunes : Sd Gougerot-Sjorgen, vascularite, thyrodite .
Diagnostic biologique
SROLOGIE ELISA :
positivit 1 mois aprs contage
tjrs confirmer ngativit 6 mois si transfusion, AES
tjrs confirmer positivit sur 2me prlvement.
PCR QUALITATIVE :
positivit 15 j aprs contage
test de confirmation si ELISA douteux
signe la chronicit
CHARGE VIRALE : quantification pour pronostic et suivi du tt.
Rubole
Le virus
Togaviridae
ARN
Envelopp (fragile ++) / spicules hmagglutinantes ( immunit protectrice)
Physiopathologie
TRANSMISSION :
- voie arienne
- transplacentaire
INCUBATION : 15 j en moyenne
RUBOLE CONGNITALE
CAT : une ITG peut tre propose si contamination avant 3me mois.
Diagnostic biologique
SROLOGIE :
IgM persistent
- 2-3 mois si primo-infection
- 6 mois aprs vaccination
Vaccin
vivant attnu.
95% de rponse positive
Le virus
Herpesviridae
ADN double brin
envelopp
Transmission :
salivaire +++
transplacentaire
sexuelle, lait, urine : excretion intermittente dans les liquides physio, lors de rcurrences.
transfusion sanguine ( du fait de la dleucocytation des concentrs globulaires)
transplantation dorgane (rein)
EVOLUTION : persistance dfinitive du virus ltat latent ds les mononucles su sg, PNN, glandes
salivaires, pithliales rnale, endothliales
poss ractivation si ID cellulaire : VIH, corticodes
TRANSPLANT : CMV est infection opportuniste la plus frquente (30-50% des infections opp)
pneumopathies interstitielles +++ (greffe de moelle bcp)
fivre isole + cytolyse hpatique + leuconeutropnie + thrombopnie
gomrulopathie, myocardite, encephalite
CMV congnitale
40% des femmes enceintes non immunises femmes immunises peuvent transmettre dans
1- 4 % font infect pdt grossesse : 1-3% des cas en cas de ractivation
40 % de passage chez lenfant.
10% symptomatiques :
atteintes neurologiques : cphalies, calcifications intracraniennes : retard psy, surdit
infection viscrale : pneumopathie interstitielle + purpura + hepatosplenomegalie
Diagnostic biologique
pas de srologie syst, mais prcautions universelles (notamment vis--vis des jeunes enfants).
IgM + IgG sur 2 plvmt + avidit des IgG (avidit forte = infection > 3 mois)