BIOSTATISTIQUE

C.1: Introduction à la Biostatistique

M. Boubacar CISSOKHO
Biologie Animale|Génétique des Population
+221 77 056 22 13 | boubacar4.cissokho@ucad.edu.sn
1 PLAN

Introduction
But de la Statistique
Notion de base

Echantillonnage

Prise à main du logiciel R

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 Introduction
La « biostatistique » est l’utilisation de la statistique dans le domaine du
vivant.
Les Statistiques = ensemble de méthodes mathématiques à partir du recueil
et de l’analyse de données réelles, permettent l’élaboration de modèles
probabilistes autorisant les prévisions.

La biostatistique utilise ces statistiques pour permettre de mieux comprendre

les phénomènes biologiques. Ex : employer un modèle de biomathématique
dans le but de mieux comprendre les causes qui impactent le développement
d’une pathologie.
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 1 But de la Statistique

Elle permettent de confirmer ou d’infirmer une hypothèse avec une

marge d’erreur la plus petite possible, et/ou prédire un évènement à
l’aide d’outils. Il existe deux types de statistiques :

❑Les statistiques descriptives, permettant de décrire une série de

données

❑ Les statistiques inférentielles, consistant en des tests permettant de

confirmer ou infirmer une hypothèse
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 1 Notion de base
Types de données
❑ Une donnée (data en anglais) est une valeur attribuée à une entité ( un objet,
une personne, un événement, etc.) pour la décrire.
Le type de données est l'ensemble des valeurs représentables

✓ Selon le traitement

o Données brutes : est une donnée n’ayant subi aucune transformation depuis son observation initiale.
o Données traitées : données brutes ayant subies un traitement mathématique. Ex. IMC=Poids/taille2

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 1 Notion de base
Types de données
❑ Une donnée (data en anglais) est une valeur attribuée à une entité ( un objet,
une personne, un événement, etc.) pour la décrire.
Le type de données est l'ensemble des valeurs représentables

✓ Selon la source
o Données primaires : collectées spécialement pour les besoins de l’étude.
o Données secondaires : disponibles dans les bases de données. Ex. bases de données FAO, OMS

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 1 Notion de base
Types de variables
❑ Une variable est un paramètre étudié sur un individu ou le caractère étudié. Il peut prend plusieurs
valeur ou modalité.

❖ Variable Qualitative
C’est une variable statistique qui exprime une qualité, ou une caractéristique, de l'objet ou de l'individu en
question.

Les types de variables qualitatives sont les suivants :

✓ Dichotomique ou binaire : Ils n'admettent que deux possibilités. Ex. national ou étranger.
✓ Politique: peuvent avoir plus de deux valeurs. Elle est soit :
o Nominal : nommées et non ordonnées (classes non hiérarchisées). Ex. la profession.
o Ordinaux : ordonnées selon une échelle de valeur ou un ordre défini. Ex. le niveau d'une
langue : basique, intermédiaire, avancé ou natif.
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 1 Notions de bases
Types de variables
❑ Paramètre étudié sur un individu ou le caractère étudié. Il peut prend plusieurs valeur ou
modalité.
❖ Variable Quantitative
C’est une variable qui peut être représentée par des nombres sur lesquels les opérations
arithmétiques de base ont un sens. Nb : souvent exprimée en unités de mesure de référence.

Elle peut être :

o discrète (un nombre fini de valeurs possibles). Ex : un nombre de logements, rappel d’un
vaccin
o continue (a priori, toutes les valeurs possibles). Ex: la pression artérielle (cm de Hg), le taux
d’Hb, taux de cholestérol (g/L)

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 1

❖ Remarques
Selon le lien de causalité: 2 types de variables
❑ Variables dépendantes (VD): les valeurs d’une variable peut être utilisées pour définir
les valeurs des autres variables. Cas souvent des données appariées. Les VD sont
presque toujours quantitatives.
Ex: poids des bébés (t0..t1), poids des enfants avant et après un traitement…

❑ Variables indépendantes (VI): pas de lien entre variables. VI sont qualitatives ou

quantitatives.
Ex: tailles et couleurs des feuilles de manioc

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 Echantillonnage et population
❑ Population : Ensemble d’individus ayant des caractéristiques qui leurs sont propres (senegalais.es
présentant des problèmes d’hypertension artérielle, ...); Nombre d’individu souvent important

❑ L’échantillonnage est un procédé qui permet de définir un échantillon dans un travail d’enquête.

❑ En d’autres termes, l’échantillonnage est une sélection précise de personnes ciblées pour réaliser
un entretien, un focus group, un sondage ou un questionnaire.

L’échantillon (sample) est le fragment d’un ensemble prélevé pour juger de cet ensemble.
Pour effectuer un échantillonnage, vous avez deux options :

1.L’échantillonnage représentatif.

2.L’échantillonnage aléatoire (aussi appelée « méthode probabiliste »).

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 1. Echantillonnage représentatif
❑ Un échantillon représentatif, souvent utilisé dans une étude quantitative (questionnaire ou sondage),
est défini comme représentatif lorsqu’il a les mêmes caractéristiques que la population étudiée
(population mère). Un échantillon représentatif peut se faire à travers l’utilisation de la technique des
quotas. Exemple : Cas pratique

Dans le cadre d’un mémoire sur la consommation d’alcool à Dakar, l’étudiant chercheur doit

réaliser un échantillon représentatif de la population en terme d’âge, de genre etc. L’étudiant

étudiera donc un échantillon de 1 000 personnes ayant les caractéristiques suivantes :

– 51 % de femmes et 49 % d’hommes

– 20 % de population rurale et 80 % de population urbaine

– 20,5 % d’ouvriers, 27,5 % d’employés, 25,5 % de professions intermédiaires, 18,5 % de cadres,

6,5 % d’artisans et 1,5 % d’agriculteurs. 10

 2. Echantillonnage aléatoire

❑ L’échantillonnage aléatoire (ou “méthode d’échantillonnage probabiliste”) est déterminé à partir

d’une procédure de tirage aléatoire statistique.

Malgré le hasard, la représentativité de l’échantillon aléatoire est assurée par les lois statistiques de la

probabilité.

Exemple : Cas pratique

Pour connaître les habitudes radiophoniques de la population dakarois, un étudiant pourrait réaliser

un échantillonnage aléatoire et contacter des personnes au hasard. C’est la technique utilisée par

Médiamétrie, une entreprise qui étudie les audiences radiophoniques Dakar.

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 Préparer un échantillonnage en 6 étapes

Avant de se lancer dans son enquête, il est utile de préparer son échantillonnage en suivant plusieurs étapes importantes.
1. Définir une problématique et des hypothèses.
2. Choisir le type d’étude (qualitative ou quantitative).
(entretien, focus group, questionnaire, sondage) car la taille de
3. Choisir l’outil le plus adéquat l’échantillon n’est pas la même selon l’outil employé.
un questionnaire ou un sondage demanderons un échantillon
4. Définir un échantillon efficace large de personnes (+500) alors qu’un focus group ou entretien
beaucoup moins (une dizaine d’individus, voir juste 1 ou 2).

5. Constituer un échantillon vous devez effectuer un échantillonnage représentatif de la population

concernée par votre sujet.

6. Cadrer votre échantillonnage définissez un début et une fin à votre étude (“saturation théorique”).

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 Prise à main du logiciel R
Travaux Pratiques

❖Installation de R et Rstudio

❖Initiation sur la syntaxe de R

❖Exercice d’application

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 Pourquoi R

❑ Gratuit

❑ Langage de programmation,

❑ Environnement de travail,

❑ Multiplateformes

❑ Documentation complet intégré

❑ Interface graphique (Rstudio)