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UE Biodiversité
Domaine des Eucaryotes
Les ”protistes”
© Sylvain DEBARD
PRAG Biochimie Génie-Biologique
Université de Strasbourg
Institut de Botanique
sdebard@unistra.fr
Les protistes | Introduction ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 2
Animaux Animaux
Plantes Mycètes Plantes Archaea
Protistes Protistes
1 Chlorobiontes
Ciliés
SAR Alvéolobiontes 2 3 Dinophytes
Apicomplexés Tous les eucaryotes
LECA Radiolaires
unicellulaires, sauf :
1-1,5 Rhizariens Foraminifères
- Les membres de
2 Chlorarachniophytes
Ga la lignée verte
Parabasaliens
Métamonades
Métamonadines
- Les champignons
Excavabiontes (Fornicata)
Percolozoaires
(Levures)
Discobés (Heterobolosea)
2 Euglénobiontes
(Euglenozoa)
Rhizopodes
Amoebozoaires
Mycétozoaires
Les protistes | I – Introduction ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 4
• Protiste : eucaryote unicellulaire, qui peut adopter un état transitoire multicellulaire sans
différenciation en tissu spécialisé
!!
Ces termes sont utilisés couramment car employés depuis de nombreuses années.
Mais ils n’ont pas de significations phylogénétiques !
((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 5
© Philippe Silar
Endocytose de cellules entières
Digestion avec fusion de lysosomes
© Philippe Silar
L’OSMOTROPHIE
Digestion d’aliments extracellulaires par
sécrétion d’enzymes
Imports des micronutriments par des
transporteurs ou canaux membranaires
Les protistes | I – Diversité des protistes | 1 – Des caractères communs ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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!! MITOCHONDRIE
Microtubule de tubuline ( 25 nm)
Lysosome
Reticulum endoplasmique
lisse (REL)
Cytosol
Reticulum endoplasmique
granuleux (REG)
• Evénement datant
d’environ 1,5-2 milliard
d’années
Les protistes | I – Diversité des protistes | 2.a – Diversité de tailles et de morphologies ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Diversité de formes
Sphérique Fusiforme Forme de cloche
Diversité de taille
Ordre de grandeur :
- quelques millions (106) de pb pour les procaryotes (bactéries + archées)
- quelques centaines de millions (108) jusqu’à plusieurs milliards (109-1010)
de pb pour les protistes
((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 12
50 µm
Un flagelle : UNICONTE
Microbiology, Pearson
Microbiology, Pearson
procaryotes :
- Prolongement de la membrane
- Composés de microtubules 10 µm 10 µm
- Mouvement en battements
Flagelle Cils
- Energie fournie par l’ATP
Flagelle Cil
9 doublets
+ 2 centraux
1 seul corpuscule
2 corpuscules basal = 1 kinétosome
basaux
perpendiculaires
= 2 kinétosomes
Les protistes | I – Diversité des protistes | 2.c – Diversité des cycles biologiques ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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• Les cellules peuvent être soit haploïdes, soit diploïdes pour la reproduction asexuée
Fission binaire
Schizogonie
Bourgeonnement
Les protistes | I – Diversité des protistes | 2.c – Diversité des cycles biologiques ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Division
transversale
Division
longitudinale
Les protistes | I – Diversité des protistes | 2.c – Diversité des cycles biologiques ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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A B C
Mitoses
F M Zygote 2n
Mitoses
G
Cycle haplophasique Cycle haplo- Cycle diplophasique
(haplobiontique) F diplophasique
M Zygote 2n (diplobiontique)
n
n
G F n M+G
Mitoses
Mitoses
Gamètes
Dékystement de Giardia
Les protistes | I – Diversité des protistes | 2.c – Diversité des cycles biologiques ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Cycle monoxène
Cycle hétéroxène
Vecteur
ou
Hôte intermédiaire
(chat, chien, ovins…)
Exemples : Exemples :
Balentidium coli (Cilié) Plasmodium falciparum (Apicomplexés)
Entamoeba histolytica (Amoebozoaire) Toxoplasma gondii (Apicomplexés)
Giardia intestinalis (Métamonadines) Leishmania major (Euglénobiontes)
Trypanosoma brucei (Euglénobiontes)
Les protistes | I – Diversité des protistes | 2.c – Diversité des cycles biologiques ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 23
© Microbiology
Métamonadines
Parabasaliens
Euglénobiontes
Amoebozoaires
Apicomplexés
Dinoflagellés
Ciliés
Les protistes | I – Diversité des protistes | 3 – Diversité des compartiments subcellulaires ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Benchimol, 2005
présentent un seul noyau, avec une chromatine
composée d’histones (excepté les Dinoflagellés).
Giardia lamblia
(Excavabiontes | Métamonades | Diplomonadines)
10 µm 10 µm
Exosquelette des Diatomées = frustule en silice
• Les radiolaires contiennent
un endosquelette fait de
silice également = THÈQUE.
• Les dinoflagellés présentent 2 THÈQUES
(endosquelette) semi-rigide en polysaccharides
• Les foraminifères présentent un exosquelette
de carbonate de calcium appelé TEST.
Les protistes | I – Diversité des protistes | 3 – Diversité des compartiments subcellulaires ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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• A leur mort, ils s’accumulent dans les fonds marins ou lacustres, et forment des strates
géologiques : ils permettent de dater rapidement des couches géologiques.
Stabilisant de nitroglycérine
Abrasif (dentifrice) Falaise de craie d’Etretat
Absorbant (litière)
Insecticide
Les protistes | I – Diversité des protistes | 3 – Diversité des compartiments subcellulaires ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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- Mitochondrie anaérobie : l’O2 n’est plus l’accepteur d’électron final, toujours synthèse
d’ATP par osmochimiotrophie avec une chaine membranaire redox
- Hydrogénosome : plus de chaine membranaire, ni ATP synthase. Disparition des crêtes
mitochondriales. Synthèse d’ATP par phosphorylation lié au substrat.
- Mitosome : absence d’activité de synthèse d’ATP
- Absence de mitochondrie : observée chez quelques espèces
Burki, 2016
Les protistes | I – Diversité des protistes | 3 – Diversité des compartiments subcellulaires ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Caractéristique du groupe
des Discobés
Les protistes | I – Diversité des protistes | 4 – Acquisition des plastes | a. Micro-algues et endosymbiose primaire ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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• Au sens strict, les microalgues (vertes ou rouges) sont issues d’une seule endosymbiose
primaire avec une bactérie proche des Cyanobactéria : origine du chloroplaste.
• On observe aussi de nombreuses associations symbiotiques entre certains protistes et des micro-
algues
Takagi et al., 2019
Noyau
• Modèle de Chlorobiontes.
= stigma
© Michel Delarue
Vidéo : avantage du regroupement
en colonie
Stramenopiles
• Les dinoflagellés ont pu réaliser une
endosymbiose tertiaire avec des
endosymbiotes divers.
1 Chlorobiontes
2 Haptophytes
Endosymbiose primaire avec
Haptistes 1 une cyanobactérie
Centroheliozoaires
Diaphotickes Endosymbiose secondaire
2 2 Cryptista
avec une algue rouge
Bicontes
Oomycètes
Perte secondaire du plaste
Straménopiles
Diatomées
Ciliés
Endosymbiose primaire avec
SAR 2 Alvéolobiontes 3 Dinophytes 1 une cyanobactérie
Apicomplexés
Endosymbiose secondaire
Radiolaires
2 avec une algue rouge
Rhizariens Foraminifères
2 Chlorarachniophytes
Perte secondaire du plaste
Parabasaliens
Métamonades Endosymbiose secondaire
Excavabiontes
Métamonadines
(Fornicata)
2 avec une algue verte
Percolozoaires
Discobés (Heterolobosea)
2 Euglénobiontes
3 Endosymbiose tertiaire
(Euglenozoa)
Eumycètes
Champignons
Microsporidies
Opisthocontes Choanoflagellés
Choano-organismes
Unicontes Métazoaires
Rhizopodes
Amoebozoaires (Lobosés)
Mycétozoaires
(Conosés)
((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Le super-groupe SAR
Glaucophytes
Lignée verte
(Archéoplastides)
Métabiontes
Rhodobiontes
(Algues rouges) • Groupe qui rassemble de nombreuses
1 Chlorobiontes
Endosymbiose primaire avec espèces (plus de 150 000)
21 une cyanobactérie
Haptophytes
Haptistes
Centroheliozoaires
Endosymbiose secondaire
Diaphotickes
2
2 avec une algue rouge
Cryptista
Bicontes
Perte secondaire du plaste
Oomycètes
Straménopiles
Ciliés
SAR 2 Alvéolobiontes 3 Dinophytes
- Des parasites
Apicomplexés - Des organismes marins du
Radiolaires
Rhizariens Foraminifères
phytoplancton
2 Chlorarachniophytes
Parabasaliens
Métamonades
Métamonadines
(Fornicata)
• Regroupe les trois classes :
Excavabiontes
Percolozoaires
Discobés (Heterolobosea)
2 Euglénobiontes
(Euglenozoa)
- Straménopiles
Eumycètes - Alvéolobiontes (Alvéolates)
Champignons
Opisthocontes
Microsporidies
- Rhizariens
Choanoflagellés
Choano-organismes
Unicontes Métazoaires
Rhizopodes
Amoebozoaires (Lobosés)
Mycétozoaires
(Conosés)
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | a. Alvéolobiontes ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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• Caractère dérivé :
Présence de vésicules sous-membranaires aplaties appelées ALVÉOLES.
Ciliés
SAR 2 Alvéolobiontes 3 Dinophytes
Apicomplexés
Radiolaires
Toxoplasma gondii
Rhizariens Foraminifères
2 Chlorarachniophytes
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | a. Alvéolobiontes | Apicomplexés ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 40
• Possèdent des fibrilles, des microtubules, des vacuoles et d’autres organites localisés au
pôle apical de la cellule = complexe apical.
Forme sprozoïte
d’Eimeria
Agent de la coccidiose
cécale du poulet
Toxoplasma gondii
Agent de la toxoplasmose
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | a. Alvéolobiontes | Apicomplexés ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Microbiology, Pearson
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | a. Alvéolobiontes | Apicomplexés ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 42
Microbiology, Pearson
Anophele femelle Être humain ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 43
Ookinète Cycle
erythrocytaire Trophozoïte
asexué Lien vidéo :
schizogonie (mitoses)
Zygote Gamétogénèse cycle chez
Schizonte l’Homme
Fécondation (contient 16 à 32 mérozoïtes)
- rupture du schizonte
- libération des mérozoïtes dans le sang
gamète gamète - symptômes
mâle femelle Lien vidéo :
cycle chez le
moustique
repas de sang
gamétocyte gamétocyte gamétocyte gamétocyte
mâle femelle mâle femelle
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | a. Alvéolobiontes | Apicomplexés ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 44
• Chez l’Homme, le
parasite ne reste pas
dans l’intestin, mais se
loge dans les muscles :
kystes tissulaires.
• Chez les
immunodéprimés :
toxoplasmose cérébrale
mortelle.
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | a. Alvéolobiontes | Dinophytes ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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• Alvéoles qui contiennent des plaques de cellulose = THÈQUES, avec parfois de la silice.
• Absence de protéines histones : le noyau est appelé DINOCARYON, avec chromosomes enroulés.
Peridiniopsis berolinensis
(Dinoflagellé lisse) Ceratium hirundinella
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | a. Alvéolobiontes | Dinophytes ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 46
Latz, 2019
Carey, 1992
100 µm 50 µm
Microbiology, Pearson
Cils
Pédoncule
50 µm
Vorticella Stentor roeseli Stylonychia
Le pédoncule permet l’attachement Deux cellules en conjugaison
à une surface
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | a. Alvéolobiontes | Ciliés ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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A. Homolozoon vermiculare
B. Tetrahymena pyriformis
C. Pattersoniella vitiphila
D. Vorticella convallaria
E. Trithgmostoma
F. Paramecium bursaria
G. Acineta
H. Eudiplodinium
I. Cryptopharynx
J. Mesodinium rubrum
K. Stentor coeruleus
L. Lacrymaria olor
M. Litonotus
N. Loxodes
O. Bursaria
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | a. Alvéolobiontes | Ciliés ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Cytopharynx
• Les vacuoles pulsatiles à chaque
extrémité se remplissent d’eau et de
déchets métaboliques, puis se vident de 50 µm = anus cellulaire
• Agent de la balentidiose
Balentidium coli
Ciliés
SAR 2 Alvéolobiontes 3 Dinophytes
Apicomplexés
Radiolaires
Rhizariens Foraminifères
2 Chlorarachniophytes
PL, plaste ; NM, nucléomorphe
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | b. Rhizariens | Radiolaires ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 54
Les radiolaires
• La plupart ont un endosquelette fait de silice (parfois sulfate de strontium, ou aucun squelette)
Acanthometra elasticum
Vishnevskaya, 2010
Science direct
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | b. Rhizariens | Foraminifères ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Les foraminifères
• Sécrétion d’une coquille appelée « test » en carbonate de calcium, de formes et structures variées.
• Test percé de trous (foramen = trou) d’où sortent des réticulopodes = pseudopodes ramifiés
• Présence en milieu marin : en surface (zooplancton) et benthiques (au fond).
• Les test sont très résistants, s’accumulent au fond des océans et fossilisent (formation de
falaises de craie ou calcaire)
Pearson, 2012
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | c. Straménopiles ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 56
Cyclotella meneghiniana
Epithèque
Hypothèque
Marshall, 2009
Les protistes | II – Bicontes | 1- Super-groupe SAR | c. Straménopiles | Diatomées ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Ciliés
SAR 2 Alvéolobiontes 3 Dinophytes
Apicomplexés
Radiolaires
• Sont des micro-organismes marins,
Rhizariens Foraminifères composant les phytoplanctons
2 Chlorarachniophytes
Parabasaliens
Métamonades
Métamonadines
(Fornicata)
Excavabiontes
Percolozoaires
• Présentent un squelette de calcaire
Discobés (Heterolobosea)
2 Euglénobiontes
(Euglenozoa)
(Haptophytes) ou de silice
Eumycètes
Champignons
Microsporidies (Centrohéliozoaires)
Opisthocontes Choanoflagellés
Choano-organismes
Unicontes Métazoaires
Rhizopodes
Amoebozoaires (Lobosés)
Mycétozoaires
(Conosés)
Les protistes | II – Bicontes | 2- Super-groupe des Haptistes ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Les Haptophytes
1 µm Choanocystis sp
Coupe d’un axopode de
Actinosphaerium
Choanocystis aculeata
• Présence également de spicules formant
l’endosquelette de silice qui sont retrouvées
dans les fossiles
Les protistes | II – Bicontes | 3- Super-groupe des Cryptista ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 63
Le supergroupe Cryptista
• Inclut l’ancien taxon des Cryptomonades (Cryptophytes)
Parasite de l’Homme
(Trichomonase)
Les protistes | II – Bicontes | 4- Super-groupe des Excavabiontes | a. Métamonades ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 65
• La plupart sont des commensaux (symbiontes) ou parasites du tube digestif des animaux
(insectes, sangsues, oiseaux, mammifères…)
Forme
trophozoïte © DB medical
Parasite intestinal
Les protistes | II – Bicontes | 4- Super-groupe des Excavabiontes | a. Métamonades | Métamonadines ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 66
Les Euglénobiontes
• Ce groupe contient :
- Des photoautotrophes, par endosymbiose secondaire d’une algue verte (ex : Euglena)
- Des chimioorganotrophes, qui peuvent être des parasites de l’Homme (ex : Trypanosoma)
Microbiology, Pearson
Microbiology, Pearson
Vecteur = phlébotome
(petit moustique)
Réservoirs = canins et
rongeurs
Deux formes :
Phlébotome - Amastigote non
= sandfly flagellé
- Promastigote
flagellé
Les protistes | II – Bicontes | 4- Super-groupe des Excavabiontes | b. Discobés | Euglénobiontes ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 71
Réservoirs = bovins
domestiques et
animaux sauvages
Épimastigotes
Dans le cerveau, le
parasite fait dormir le
patient le jour :
Trypanomastigote inversion du rythme
= trypomastigote nycthéméral.
Les protistes | II – Bicontes | 4- Super-groupe des Excavabiontes | b. Discobés | Euglénobiontes ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Vecteur = punaise
(Triatomine, ou Réduve)
Réservoirs = canins et
rongeurs
Deux formes :
- Amastigote non
flagellé
- Trypanomastigote
(ou trypomastigote)
flagellé
Les protistes | II – Bicontes | 4- Super-groupe des Excavabiontes | b. Discobés | Percolozoaires ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Percolozoaires = Heterolobosea
• De type amibien, pouvant passer d’une forme amiboïde à une forme flagellée selon les
conditions environnementales.
Tetramitus rostratus
1. Les Amoebozoaires
a. Les Rhizopodes (Lobosés)
b. Les Mycétozoaires (Conosés)
2. Les Choanoflagellés
Les protistes | III – Unicontes ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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1
Métabiontes
Chlorobiontes
• Regroupe deux groupes principaux :
21 Haptophytes
Endosymbiose primaire avec - Les Amoebozaires
Haptistes une cyanobactérie
Centroheliozoaires - Les Choanoflagellés
Diaphotickes Endosymbiose secondaire
2 2 Cryptista
avec une algue rouge
Bicontes
Oomycètes
Perte secondaire du plaste
Straménopiles
Diatomées
Métamonades
Parabasaliens
• Présence d’une forme cellulaire lors du
Métamonadines
Excavabiontes (Fornicata)
Percolozoaires
cycle avec un seul flagelle.
Discobés (Heterolobosea)
2 Euglénobiontes
(Euglenozoa)
Eumycètes
Champignons
Microsporidies
Opisthocontes Choanoflagellés
Choano-organismes
Unicontes Métazoaires
Rhizopodes
Amoebozoaires (Lobosés)
Mycétozoaires
(Conosés)
Les protistes | III – Unicontes | 1- Les Amoebozoaires ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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© UPMC
- Pour se déplacer
- Pour se nourrir
!!
Tous les membres des Amoebozoa sont bien des amiboïdes,
mais d’autres amiboïdes sont présents dans d’autres
groupes (Rhizaria ou Exacavabiontes par exemple).
Amoeba proteus
Vidéo : déplacement de l’amibe
• D’autres sont des parasites et provoquent des pathologies chez l’Homme = AMIBIASES
Kyste
Ulcère intestinal
provoqué par
l’amibe
Trophozoïte
• Invasion possible de différents organes, en provoquant des abcès dans le foie, les
poumons ou le cerveau.
Les protistes | III – Unicontes | 1- Les Amoebozoaires | b. Les Mycétozoaires ((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 80
F 2n
n
Cycle Cycle séxué
végétatif G
(n)
M
M Méiose
Documentaire : le blob, un
génie sans cerveau
1 Chlorobiontes
2 Haptophytes
Haptistes
Centroheliozoaires
Diaphotickes
Bicontes
2 Cryptista
Oomycètes
Straménopiles
Diatomées
Ciliés
SAR 2 Alvéolobiontes 3 Dinophytes
Apicomplexés
Radiolaires
Rhizariens Foraminifères
2
Les protistes | III – Unicontes | 2- Les Choanoflagellés
Chlorarachniophytes
((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
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Parabasaliens
2 Euglénobiontes
(Euglenozoa)
Eumycètes
Champignons
Microsporidies
Opisthocontes Choanoflagellés • Opistho = derrière, conte = flagelle :
Choano-organismes
Unicontes Métazoaires flagelle postérieur et propulseur
Rhizopodes
Amoebozoaires (Lobosés)
Mycétozoaires
(Conosés)
Choanoflagellés
• Les Choanoflagellés sont des micro-
organismes marins qui portent une
collerette et des tentacules qui aident à
la nutrition
Spongiaires
Choanoflagellata (Porifera, Metazoan)
((__( Unistra__))___________S._DEBARD____(___________))
© 85
- Connaitre les caractères propres à chaque taxon présenté (cf. fiche récapitulative)
- Connaitre la position des différents taxons dans l’arbre phylogénétique
- Maitrisez les cycles de reproduction de Plasmodium et Dictyostelium (seront revus en TD)
- Connaitre les taxons de protistes utilisés en stratigraphie
- Savoir décrire une cellule du genre Paramecium et Euglena
- Connaitre les noms de certaines espèces et les classer dans leur taxons correspondants :
Paramecium, Plasmodium, Trypanosoma, Dictyostelium.