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BIOLO IE MAROC
www.biologie-maroc.com
rganism
s O es
e
d
Vé
Biologie
gét
aux
SCIENCES DE LA
VIE ET DE LA TERRE
Objectifs du cours
Exploration de la diversité du monde végétal au travers de son
organisation taxonomique
• Évolution des appareils végétatifs
• Évolution des modes de reproduction
BV2: Biologie Végétale 2
Plan du cours
1. Introduction. Classification phylogénétique des végétaux
2. L'origine des plastes: théorie de l'endosymbiose Y. Lemoine
3. Le groupe des champignons J.
J.-L.
L. Hilbert
4. Les groupes d'algues: A. Créach; F. Gevaert
5. Les Trachéophytes I: "Ptéridophytes"
A.-S. Blervacq/M.-H. Bouchet
6. Les Trachéophytes II: Spermaphytes X.Vekemans/L. Amsellem
Ouvrages de référence
• Objectifs de la classification:
– définir un vocabulaire commun Æ définition internationale non
équivoque des noms d'organismes/de groupes d'organismes
– assurer au max. la cohérence et la stabilité du vocabulaire
– assurer la valeur prédictive de ll'appartenance
appartenance à un groupe
d'organismes Æ informations sur caractéristiques végétatives et
reproductives
p de l'organisme
g
1.Introduction. Classification phylogénétique des végétaux
• Etapes de construction d'une classification
1. délimiter et nommer les groupes d'organismes
2. assigner un rang à chaque groupe d'organismes Æ
classification hiérarchique
Rang Groupe
règne Viridiplantae (plantes vertes)
Æ Historique
q de la classification des végétaux
g
1.1.Evolution de la place des lignées végétales dans monde vivant
orientation progressive:
i
végétal Æ animal
(éponges, corail)
1.1.Evolution de la place des lignées végétales dans monde vivant
La vision
ision à 3 règnes du i ant (Æ1ère moitié XXème siècle)
d monde ddu vivant
=cyanobactér.
Î Règne végétal
= groupe "hétérogène"
2002)
Riviers, 2
= embryo-
phytes
(tirré de de R
= plantes
terrestres
1.1. Evolution de la place des lignées végétales dans monde vivant
Le système à 5 règnes de Whittaker (1969)
plantae fungi = champignons animalia
= fixés,
fi é non
prédateurs mais
hétérotrophes
de Rivierss, 2002)
∃ algues vertes protista
unicellulaires
((tiré de d
= eucaryotes unicellulaires
monera
= procaryotes
1.1. Evolution de la place des lignées végétales dans monde vivant
02)
de de Rivviers, 200
- pigments
(tiré d
1 1 Evolution de la place des lignées végétales dans monde vivant
1.1.
classification phylogénétique
1.2. Classification phylogénétique: principe et méthodes
• Principe de base: évolution biologique Ö tous êtres vivants
ont un ancêtre commun Ö reliés par branches Æ arbre
phylogénétique du vivant
(cf. "Tree of life": http://tolweb.org/tree/phylogeny.html)
Racine du vivant:
Eucaryotes:
1.2. Classification phylogénétique: principe et méthodes
Groupe "homogène" = groupe monophylétique:
Définition: Un groupe monophylétique est un
groupe de taxons qui comprend de manière
exhaustive
h ti tous t l descendants
les d d t d'd'un ancêtre
êt
Æ appellé un clade
Î Règne Viridiplantae
02)
= plantes
l vertes
de de Rivviers, 200
= groupe monophylétique
- ggroupes
p d'"algues
g vertes"
- Embryophytes = plantes
terrestres
(tiré d
Introduction à la classification des végétaux:
é l i de
évolution d la
l place
l des
d lignées
li é végétales
é é l dans
d monde
d vivant
i
Distinction entre
• Floristique Î inventaire et identification des espèces
• Classification Î forme des ggroupes
p hiérarchiques
q d'espèces
p
A. Acquisition
i i i ded données
d moléculaires
l l i
(séquences d'ADN) populat.
1
ind.
1
RAPD1 RAPD2 RAPD3 RAPD4 RAPD5 RAPD6
1 0 1 1 0 1
1 2 1 1 0 1 0 1
1 3 1 1 1 1 0 1
1 4 0 0 0 0 0 1
1 5 1 0 1 1 0 1
1 6 1 1 1 1 0 1
1 7 0 0 1 1 0 0
2 1 1 0 1 0 0 0
2 2 1 1 1 1 0 1
2 3 1 0 0 1 0 1
2 4 1 0 1 1 0 1
2 5 1 0 1 1 0 0
2 6 1 1 1 1 0 1
2 7 1 1 0 1 0 1
2 8 1 0 0 1 0 1
B. Reconstructions phylogénétiques
…AGACTTACGG…
Les méthodes de la systématique moléculaire:
A A
A. Acquisition
i iti de
d données
d é moléculaires
lé l i
• Comparaison de séquences ADN entre elles:
Alignement de séquences partielles du gène X
Comparaisons:
Õ ⇔ b : 2 sites nucléot. ≠ Æ p = 2/18 = 0.111 = 11.1 %
⇔ b : 6 sites lé ≠ Æ p = 6/18 = 0.333
i nucléot. 0 333 = 33.3
33 3 %
Les méthodes de la systématique moléculaire:
B Méthodes
B. Mé h d ded reconstruction
i phylogénétique
h l é éi
– Comparaison des séquences d'ADN homologues au sein d'un
échantillon d'espèces Ö élaboration d'un arbre phylogénétique
• Méthodes de maximum de
parcimonie/vraisemblance:
– Exploration d'arbres
– Calcul d'un score
– Choix de l'arbre avec le meilleur
score
B. Méthodes de reconstruction phylogénétique
p y g q
Représentation d'un arbre phylogénétique
• nœuds: A, B, C,…I (nombre de nœuds = 2m-1)
• branches: FA, FB, IG,… (nombre branches = 2m-2)
nœuds
d externes = unités
i é taxonomiques
i
= OTU ("Operational Taxonomic Units")
branches externes
branches internes
1.3. Classification pphylogénétique
y g q des végétaux
g
• Les 3 domaines de Woese
– séquences petite sous-unité ARN ribosomique
Volvox
V l ∈ Polytrichum ∈
Embryophytes
Chlorophytes =
(Bryophytes s.s.
algues vertes s.s. = mousses))
1.3. Classification phylogénétique des végétaux
Arbre phylogénétique des Viridiplantae = plantes vertes
"algues vertes" s.l.
= algues vertes s.s.
ss
divers groupes
Chlorophytes
Chlamydomonas Charophytes
Ulva
Coléochaetophytes
Marchantiophytes
= hépatiques
Anthocérophytes
Bryophytes s.s.
= mousses
Trachéophytes
= plantes
vasculaires
1.3. Classification phylogénétique des végétaux
• groupe "Algues vertes" s.l. Æ paraphylétique
– contient:
• Chlorophytes = algues vertes s.s. Æ groupe monophylétique
• Charophytes et apparentés = plusieurs clades phylogénétiquement plus
proches des Embryophytes que des Chlorophytes
Ulva ∈ Chara ∈
Ch l h
Coleochaete ∈
Chlorophytes Charophytes Coléochaetophytes
1.3. Classification phylogénétique des végétaux
Arbre phylogénétique des Viridiplantae = plantes vertes
"algues vertes" s.l.
= algues vertes s.s.
ss
divers groupes
Chlorophytes
Chlamydomonas Charophytes
Ulva
Coléochaetophytes
Marchantiophytes
"B
E
Embryop
Bryophyttes" s.l.
= hépatiques
Anthocérophytes
Trachéophytes
= plantes
vasculaires
1.3. Classification phylogénétique des végétaux
• Ex.2. Phylum des Embryophytes = plantes terrestres
(=Cormophytes)
– contient: {"Bryophytes s.l." + Trachéophytes (= pl. vasculaires)}
– caractères prédictifs: ∃ stade embryon Ædéveloppement du sporophyte;
∃ structures reproductives multicellulaires (anthéridies,
(anthéridies archégones,
archégones
sporanges); ∃ cuticule (cire Æépiderme)
– terme Embryophyte préférable à "plante terrestre" car ∃ "algues terrestres"
– apparaît il y a 450 106 ans
Marchantia ∈
Bryophytes s.l. Heracleum ∈
Æ
ÆMarchantiophytes
h i h Trachéophytes
(= hépatiques) (Angiosperme
Apiaceae
= Ombellifère)
1.3. Classification phylogénétique des végétaux
• groupe "Bryophytes s.l." Æ paraphylétique
– contient:
• Marchantiophytes = hépatiques (angl. liverworts)
• Anthocérophytes (angl. hornworts) Å (stomates)
s = mousses Å (xylème/phloème)
• Bryophytes ss.s.
Polytrichum ∈
Marchantia ∈
Anthoceros
A h ∈ B
Bryophytes
h t s.s.
Marchantiophytes (= mousses)
Anthocérophytes
(= hépatiques)
1.3. Classification phylogénétique des végétaux
Arbre phylogénétique des Viridiplantae = plantes vertes
= algues vertes s.s.
ss
divers groupes
Chlorophytes
Chlamydomonas Charophytes
Ulva
Coléochaetophytes
Marchantiophytes
E
Embryop
"Bryophy
= hépatiques
Anthocérophytes
Trachéophytes
= plantes
vasculaires
1.3. Classification phylogénétique des végétaux
• Ex.3. Sous-phylum des Trachéophytes = plantes vasculaires
– contient: {Lycophytes + "Ptéridophytes s.l." (= fougères) + Spermaphytes
(= pl. à graines)}
– caractères prédictifs: ∃ tissu vasculaire; ∃ xylème avec trachéides
– apparaît il y a 420 106 ans
Dryopteris
y p ∈ Heracleum ∈
Ptéridophytes s.l. Spermaphytes
Selaginella ∈
L
Lycophytes
h t
1.3. Classification phylogénétique des végétaux
Diversification des Embryophytes
Trachéophytes
Ptéridophytes s.l. Spermaphytes
Lyco- Sphéno- Ptérido-
Bryophytes s.l. phytes phytes phytes s.s Gymnospermes
y p Angiospermes
g p
Ovule/graine
360 Ma
Xylème
y avec trachéides
Embryon 420 Ma
450 Ma
BV2: Biologie Végétale 2
Plan du cours
1. Introduction. Classification phylogénétique des végétaux
2. L'origine des plastes: théorie de l'endosymbiose Y. Lemoine
3. Le groupe des champignons J.
J.-L.
L. Hilbert
4. Les groupes d'algues: A. Créach; F. Gevaert
5. Les Trachéophytes I: "Ptéridophytes s.l. "
A.-S. Blervacq/M.-H. Bouchet
6. Les Trachéophytes II: Spermaphytes X.Vekemans/L. Amsellem
BV2: Biologie
g Végétale
g 2
Enseignants: X. Vekemans et M.-H. Bouchet (responsables);
L. Amsellem; A. Créach; F. Gevaert; J.-L. Hilbert;
Y. Lemoine
Responsable T.D./T.P.: M.-H. Bouchet
Prof. Xavier Vekemans:
Prof
bureau SN2.203
xavier.vekemans@univ-lille1.fr
i k @ i lill 1 f
Objectifs du cours
Exploration de la diversité du monde végétal au travers de son
organisation taxonomique
• Évolution des appareils végétatifs
• Évolution des modes de reproduction
6. Les embryophytes II: Spermaphytes
Heracleum ∈
Taxus (if) ∈ Angiospermes
Gymnospermes
6.2.1. Origine des Gymnospermes
Les étapes majeures de l'évolution des Spermaphytes
Trachéophytes
P é id h
Ptéridophytes s.l.
l Spermaphytes
Lyco- Sphéno- Ptérido-
Bryophytes s.l. phytes phytes phytes s.s Gymnospermes Angiospermes
Ovaire/fruit
140 Ma
Ovule/graine
360 Ma
Mégaphylles
380 Ma
Xylème avec trachéides
Embryon 400 Ma
M
450 Ma
6 2 1 Origine des Gymnospermes
6.2.1.
• Ancêtres les plus
pl s directs seraient les Progymnospermes:
– Arbres fossiles apparus au Dévonien et éteints au Carbonifère (-380
à -340
340 Ma): ex. Archaeopteris
– Caractères évolués: arbres avec structure "eustèle" de la tige,
cambium, xylème secondaire
– Caractères primitifs: feuillage = port de fougères arborescentes;
reproduction par spores
6.2.1. Origine
g des Gymnospermes
y p
Progymnospermes:
gy p Archaeopteris
p ((-380 à -340 Ma))
Progymno-
spermes Ovaire/fruit
140 Ma
Ovule/graine
360 Ma
Mégaphylles
380 Ma
Xylème avec trachéides
Embryon 400 Ma
M
450 Ma
6 2 1 Origine des Gymnospermes
6.2.1.
• Les premiers Gymnospermes:
G mnospermes:
–Pteridospermophytes (=Ptéridospermales): "fougères à graines"
• gro
groupe
pe fossile
• apparition vers -360 Ma (fin Dévonien); extinction vers -150 Ma (fin
Jurassique)
• port de fougères arborescentes
• ovules pprimitifs pprésents Æ ggraines
• spermatozoïdes ciliés
• embryon se développe souvent après la dispersion de l'ovule fécondé
(graine aembryonnée)
6 2 1 Origine des Gymnospermes
6.2.1.
• Les premiers Gymnospermes:
G mnospermes:
–Pteridospermophytes (=Ptéridospermales): "fougères à graines"
Pté id
Ptéridosperme primitif:
i itif Medullosa
M d ll
Structure ♂
ovule Structure ♀
Couronne
de feuilles
radiation
apparition des Angiospermes
Gymnospermes
radiation
Gymnospermes
= groupe
monophylétique
6 2 2 Les 4 embranchements de Gymnospermes
6.2.2.
• Cycadophytes: (Cycadales)
(C cadales)
– apparition vers -280 Ma (Permien); apogée au Secondaire (Mésozoïque)
– 130 espèces actuelles
– port de petits palmiers
– grandes feuilles composées pennées
– croissance très lente
– 2 ggroupes
p ggéographiques:
g p q Amérique
q (Zamia,
( , Dioon)) et Afrique
q +
Australie + Asie (Cycas, Encephalartos)
6 2 2 Les 4 embranchements de Gymnospermes
6.2.2.
• Cycadophytes: (Cycadales)
(C cadales)
Encephalartos:
cône ♀
Encephalartos
Zamia
sac pollinique
(microsporange) (Bracegirdle & Miles, 1978)
6.2.2. Les 4 embranchements de Gymnospermes
• Croissance du tube pollinique et production de spermatozoïdes
ciliés
ilié chez
h les
l Cycadophytes
C d h t ett Ginkgophytes
Gi k h t
99)
(Raven eet al., 199
croissance du tube pollinique
activation de la production
libération des spermatozoïdes
des spermatozoïdes
p
dans la chambre polliniq
polliniquee
Ö zoïdogamie
6.2.2. Les 4 embranchements de Gymnospermes
y p
nucelle (2n)
endosperme
p
(n)
libération des 2
al., 1999))
noyaux spermatiques
directement
dans ll'oosphère
oosphère
Raven et a
(R
Ö siphonogamie
6 2 2 Les 4 embranchements de Gymnospermes
6.2.2.
• Cycadophytes:
y p y ((Cycadales)
y )
–structure reproductive femelle:
• Cycas (ancestral): mégasporophylle foliacée avec plusieurs
ovules sur 2 rangées
• autres: cône ♀; écailles = mégasporophylles
g p p y à 2 ovules
6 2 2 Les 4 embranchements de Gymnospermes
6.2.2.
• Cycadophytes: structures reproductives ♀ (Gaussen et al., 1982)
Mégasporophylle
g p p y de Zamia, Dioon
"Fleur
Fleur ♀
♀" de Cycas
Mégasporophylle
g p p y de Cycas
y
6 2 2 Les 4 embranchements de Gymnospermes
6.2.2.
• Ginkgophytes: (Ginkgoales)
– apparition vers -280 Ma (Permien); apogée au Secondaire (Mésozoïque)
– une seule espèce actuelle: Ginkgo biloba (découvert par les Européens en
1690), existe à l'état spontané en Chine
– arbres p
parfois de grande
g taille (Æ40m),
( ), dioïques
q ((individus ♂ et ind.♀)
♀)
– petites feuilles multilobées (di-, tri-, ou tétra-lobées)
– structure reprod. ♂ = châton (= "fleur")
• microsporophylles à 2 sacs polliniques
– pollen à 4 cellules (2 cell. prothalliennes; 1 cell. anthéridiale; 1 cell.
végétative)
i )
– production de 2 spermatozoïdes ciliés
– structure reprod.
reprod ♀ réduite à un pédoncule bifide à 2 ovules
6 2 2 Les 4 embranchements de Gymnospermes
6.2.2.
étamine
• Ginkgophytes:
Ginkgo biloba
fleurs ♂
mésoblaste
fl
fleurs ♀
(K
(Kramer & Green,
G 1990)
graines
6 2 2 Les 4 embranchements de Gymnospermes
6.2.2.
graine ailée
g
(Kramer & Green, 1990)
6 2 2 Les 4 embranchements de Gymnospermes
6.2.2.
brachyblaste
y écaille ov.
(gaine)
écusson
(Kramer & Green, 1990) graine ailée
6 2 2 Les 4 embranchements de Gymnospermes
6.2.2.
• Coniferophyta
p y - Famille des Cupressaceae
p
– actuellement 20 genres et 125 espèces (Cyprès, Thuya,
Genévrier)
– large distribution géographique actuelle
– arbres ou arbustes à feuilles souvent réduites à des écailles,
opposées ou verticillées par 3, souvent décurrentes
– 1-20 ovules par écaille ovulifère
– pollen sans ballonnets aérifères
6.2.2. Les 4 embranchements de Gymnospermes
• Coniferophyta - Famille des Cupressaceae
feuilles opposées
type thuyoïde
(rameau aplati)
Thuya: Thuja
Cyprès: Chamaecyparis
cône ♀ à écailles
cône ♂ peltées valvaires
é
étamines
i
feuilles opposées
t
type cupressoïde
ïd cône
ô ♀ à écailles
é ill
(rameau cylindrique) allongées imbriquées
(Kramer & Green, 1990)
6.2.2. Les 4 embranchements de Gymnospermes
• Coniferophyta - Famille des Cupressaceae
cône ♂
G è i Juniperus
Genèvrier: J i
cône
ô ♀ à écailles
é ill
se soudant et devenant
charnues à mâturité
sac tégument
cône
ô ♂ pollinique nucelle
b té
bractées
6.2.2.
6. . . Les
es 4 embranchements
e b a c e e s de Gymnospermes
Gy ospe es
• Gnetophytes
– groupe d'origine récente (-200 Ma)
– 3 genres , chacun définissant une famille (Ephedraceae, Gnetaceae,
Welwitschiaceae),
l i hi ) avec 700 espèces
è
– 4 caractéristiques communes "évoluées":
• "fleurs" ♂ et ♀ groupées en "inflorescences"
• ∃ enveloppe autour des ovules
• ovule: tégument
g se pprolonge
g au-delà du micropyle
py → tube = "stigmate"
g
• ∃ vaisseaux dans xylème secondaire
Ö ancêtre direct des Angiospermes?
– Mais: endosperme haploïde , production d'archégones, croissance
du tube pollinique typique pour Gymnospermes
6.2.2. Les 4 embranchements de Gymnospermes
• Gnetophytes: genre Ephedra, famille des Ephedraceae
tégument=
enveloppe "stigmate"
microsporophylle
avec nbreux sacs pollin. bractées
vaisseaux
vaisseaux du xylème
du xylème
Progymno-
spermes Ovaire/fruit
140 Ma
Ovule/graine
360 Ma
Mégaphylles
380 Ma
Xylème avec trachéides
Embryon 400 Ma
M
450 Ma
Bon courage
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