2014-2015

Bienvenue à

Unité et Diversité du Vivant

1. Biologie des organismes animaux

2. Biologie des organismes végétaux
3. Biologie des organismes microbiens

(9 ECTS – 85 h environ cours, TD, TP)

Responsable : Jean-Pierre RENAUDIN

jean-pierre.renaudin@u-bordeaux.fr
Biologie des organismes végétaux
Jean-Pierre Renaudin* (série A)
Dominique Rolin* (série B)
Chargés
François Barrieu** (série C) des cours
Fréderic Gévaudant* (série D)
Eric Gomes** (série E)
*Laboratoire « Biologie du Fruit et Pathologie »
(UMR INRA - UBx)
** Laboratoire « Ecophysiologie et Génomique
Fonctionnelle de la Vigne » (UMR INRA - UBx)
centre INRA de Villenave d’Ornon
 Unité et diversité du vivant (COSE1001)
TOTAL = 9 ECTS (semestre = 30 ECTS)
Biologie animale : coef 1
Biologie végétale : coef 1
Biologie microb. : coef 1
Biologie végétale coef 3 ECTS (sur 30 ECTS/semestre)
12 cours – 4 TP – 1 TD révision à la fin
CC : 3 CR TP + 1 exam sortie bota coef 0,40
DS1 : 1 DS intermédiaire BV (3-7 nov) coef 0,20
DST : 1 DS terminal (janvier) coef 0,40
 Les 4 TP de Biologie Végétale
TP n°1 « Initiation à la Botanique »
Parc du haut-Carré
RV devant le bureau de l’appariteur dans le bâtiment A22
Départ à 9h le matin, à 14h l’après-midi

TP n°2 , 3 et 4
salles de TP – A22 -3ème étage
RV dans les salles de TP: 8h le matin, 14h l’après-midi
Lire le polycopié de TP avant la séance
Apporter: - polycopiés de TP et de cours
- documents de cours
- une dizaine de feuilles blanches
- pince fine (si possible)

Planning des séances affiché au RC + au 3ème étage

Présence obligatoire (appel) aux TD et TP
•Serveur Internet Moodle (autoinscription)
(avec annales pour BA et BV)

•Ressources Bibliothèque des Sciences

•Amener le poly de cours en cours (BA et BV)

•Travail régulier chaque semaine

• Posez des questions aux enseignants !!

 Biologie des organismes végétaux
Plan du cours :
1. Introduction
2. Classification et évolution des organismes
végétaux
3. Reproduction sexuée et reproduction végétative
chez les végétaux
4. La fonction de nutrition
5. Champignons et lichens
6. Conclusion ; applications
Biologie des organismes végétaux

1. Introduction générale
Définition et origine des organismes végétaux
Les végétaux sont :
Des organismes photosynthétiques (fonction de
nutrition; présence de chlorophylle a) :
Animaux, Champignons
Des organismes Eucaryotes :
Procaryotes
Des organismes qui ont un plan d’organisation
particulier :
• Simple, le thalle (« les thallophytes ») : végétaux
aquatiques (algues)
• Complexe, le cormus (« les cormophytes ») : végétaux
terrestres
Les Champignons ont aussi le plan d’organisation
des thallophytes, mais ne sont pas des végétaux.
2. Classification et évolution des
organismes végétaux
2.1. Bases historiques des classifications

Nommer et classer les individus par

groupes (= taxons)

 taxonomie (taxinomie)
Antiquité Aristote
Renaissance XVIème siècle FIXISME
XVIIIème siècle Linné, Jussieu

Début XIXème siècle TRANSFORMISME Lamarck

Milieu XIXème siècle Darwin : évolution

Milieu XIXème siècle Mendel : génétique
Début XXème siècle Morgan : génétique
1952, Watson, Crick et Collins
ADN et code génétique

NEO-DARWINISME
 Complément
Fixisme = pas de transformation des espèces de cours

S’oppose à toute notion d’évolution

Transformisme = hérédité des caractères acquis

Les organismes placés dans un milieu adoptent des

caractères communs pour s’y adapter et les transfèrent à leur
descendance (tous identiques dans une espèce)

Darwinisme = évolution des espèces

Rôle de la sélection naturelle du milieu de vie dans

l’évolution de populations d’individus (même espèce mais tous
différents)
- apparition de nouveaux caractères
- disparition des individus moins adaptés
Une histoire imaginée par Richard Dawkins Complément
de cours
Cette histoire amusante n'a d'autre but que de bien fixer un point
important de la théorie darwinienne;
Deux brontosaures voient un T-Rex avancer dans leur direction et se
mettent à courir aussi vite qu'ils le peuvent. Puis l'un des deux dit à
l'autre :
"Pourquoi nous fatiguons-nous au juste ? Nous n'avons de toute
façon pas la moindre chance d'arriver à courir plus vite qu'un T-Rex !"
et l'autre lui répond cyniquement :
"Je ne cherche pas à courir plus vite que le T-Rex . Je cherche juste à
courir plus vite que toi ."
L'idée est de rappeler que le processus concerne moins une
compétition entre espèces qu'une compétition à l'intérieur de
chaque espèce.
Représentation schématique d’un arbre phylogénétique
(critères morpho-anatomiques, biochimiques, génétiques,
paléontologiques)
A

B
C

Les organismes B,C,D ont le même ancêtre commun : ils forment

un taxon monophylétique (= clade).
Où sont les autres clades ?
 Complément
de cours

La notion de
« clade »

Article
complet
disponible
sur MOODLE
2. Classification et évolution des
organismes végétaux
2.1. Bases historiques des classifications
2.2. L’apparition du monde végétal dans le
contexte de l‘évolution du vivant
 Apparition de la vie :
19e)
(Pasteur fin
10 000 espèces ? Les procaryotes

Lecointre et le
Guyader
(1977) Classification
400 espèces ?
phylogénétique du
vivant (2001)
Complément
de cours
Cyanobactérie
autres clades

Apparition de la vie :
La photosynthèse
 Complément
de cours
• Terre : 4,5 milliards d’années ; monde minéral (pas
de vie), atmosphère réductrice (pas d’O2, beaucoup
de CO2, formes minérales réduites : NH3, H2S, …..).
• Vie : 4 milliards d’années ; une seule origine
(Procaryote ?)
• Photosynthèse apparue il y a au moins 3,4
milliards d’années, chez des bactéries
(stromatolithes)
• Bactéries photosynthétiques actuelles :
cyanobactéries, etc.
Photosynthèse > 3,4 milliards d’années (« stromato-
lithes »)
Cellules 1 à 10 µm de diamètre; isolées ou coloniales
Pigments : chlorophylle a + phycocyanine et
phycoérythrine
Lecointre et le Guyader « Classification phylogénétique du vivant » (2001)
 (dont Cyanobactéries)

Le vivant

Lecointre et le Guyader « Classification phylogénétique du vivant » (2001)

(dont Cyanobactéries)
Le vivant

Animaux
métazoaires
métazoaires
(Métazoaires)

Champignons
(Eumycètes)

Plantes
(Métaphytes)
 Complément
de cours

Champignons
Archées Animaux
Bacteries
Plantes

Photo credits: Public Health Image Library; NASA; © Dave

LUCA : dernier Powell, USDA Forest Service; tom donald

ancêtre commun

photosynthèse
Une endosymbiose entre une cellule Eucaryote et une
Cyano-bactérie est à l’origine de la cellule végétale
(lignée verte).
L’endosymbiote est à l’origine du chloroplaste des
cellules végétales.
- organite entouré d’une double membrane
- organite possédant de l’ADN
Les Eucaryotes Les végétaux
Lecointre et le Guyader « Classification phylogénétique du vivant » (2001)
2. Classification et évolution des
organismes végétaux
2.1. Bases historiques des classifications
2.2. L’apparition du monde végétal dans le
contexte de l‘évolution du vivant
2.3. Les algues
 Les algues

taxon non monophylétique

2 clades principaux :
•Lignée verte :
Glaucophytes
Rhodobiontes
Chlorobiontes
•Lignée brune :
Straménopiles
Haptophytes
Un thalle
 Algues planctoniques

Vertes brunes rouges

Algues benthiques
Les algues vertes absorbent le rouge et bleu
Les algues brunes absorbent le jaune et le bleu
Les algues rouges absorbent le vert et le bleu.
 Complément
de cours

Les algues vertes absorbent le rouge et bleu, les algues

brunes utilisent le jaune et le bleu et les algues rouges
captent bien le vert et le bleu.
Chlorophylle a
Phycoérythrine
Phycocyanine
Chlorophytes

Chlorophylle a
Chlorophylle b
Les Eucaryotes Les végétaux
Lecointre et le Guyader « Classification phylogénétique du vivant » (2001)
 Chlorophylle a
Chlorophylle c
Fucoxanthine

Diatomées

Straménopiles Haptophytes
(coccolithes, craie)
 Complément
de cours

Magazine SCIENCE vol. 306 1er octobre 2004

L’origine des chloroplastes des algues brunes :
une endosymbiose secondaire impliquant une algue rouge
 Terre : 4,5 milliards d’années Complément
de cours

Vie : 4 milliards d’années (procaryote, anaérobie)

Photosynthèse : 3,4 milliards d’années (cyanobactéries)

v
t i
La lignée verte h e
Eucaryote a
endosymbiose I La lignée brune ll a
Eucaryote o q
1,2 milliard d’années ? p u
algues vertes et rouges endosymbiose II h a
700 millions d’années ? y t
algues brunes t i
e q
s u
e

Nb : Animaux (métazoaires) : 680 millions d’années

Champignons : 380 millions d’années
Conclusion : l’inventaire de la biodiversité