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SIGNAUX

 ET  DEVELOPPEMENT  DES  PLANTES  


 

Généralités  
 
Pr. Serge DELROT
UMR Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne,
ISVV, 210 Chemin de Leysotte, 33882 Villenave d’Ornon
05 57 57 59 00/5901
serge.delrot@bordeaux.inra.fr; serge.delrot@u-bordeaux.fr
SIGNAUX  ET  DEVELOPPEMENT  DES  PLANTES  
 

Généralités  
•   Pourquoi  étudier  les  plantes  ?  
 
POURQUOI  ETUDIER  LES  PLANTES?  
Nous ne pourrions pas vivre sans les végétaux.
Ils produisent:
• l’essentiel de l’oxygène
que nous respirons

• l’essentiel de l’énergie
stockée que nous utilisons
comme aliment et brûlons
comme combustible.

• une grande diversité de


molécules utiles pour la
santé
Intérêt écologique

Photosynthèse  
hν  

CO2  +  H20                          (CHOH)  +  O2  

RespiraHon  
Co2now.org  

Dioxyde  de  carbone  


 
 
 
Température  
           Life  expectancy                    
Atmospheric  CO2  (ppm)  

Comparaison  entre  l’espérance  de  vie  et  


l’augmentaDon  du  CO2  atmosphérique  
La population mondiale croît et croit ...
Un objectif majeur de la
biologie végétale est
d’augmenter la production
de nourriture; les
estimations actuelles
indiquent qu’il faudra
l’augmenter de 70% au
cours des 40 prochaines
années.
Plus d’un milliard de personnes
souffrent de faim chronique
C’est plus que la population rassemblée de l’Amérique du
Nord et de l’Europe

(Source: FAO news release, 19 June 2009)


Plus de 2 milliards de personnes souffrent
d’anémie chronique du fait de la carence
en fer
Cela correspond environ à la population totale de l’Amérique du Nord,
de l’Europe et de la Chine

(Source: World Health Organization, WHO


Global Database on Anaemia)
L’amélioration des propriétés nutritives de
plantes peut soulager la malnutrition

Notre corps a besoin autant de


vitamines et de minéraux que de
calories. La malnutrition est
surtout liée à la pauvreté.
Faim  

Carence en Vitamine A Anémie (jeunes enfants)

Images: Petaholmes d’après WHO data; WHO


Besoins  en  eau  (m  3/tonne  produite,  ou  litre/kg)  pour  diverses  producDons  
Le bois et les fibres sont partout

Vêtements faits Les fibres végétales


à partir de fibres sont utilisées pour la
(coton, lin). fabrication du papier.

Bois utilisé pour La toile est faite


la construction et à partir de lin et
les meubles. de chanvre .

Rembrandt van Rijn (1631)


Les végétaux peuvent être une source de biofuels

Sucres,  amidon  et  


cellulose  peuvent  être  
Energie fermentés  en  éthanol  
solaire

Source: Genome Management Information System, Oak Ridge National Laboratory


L’éthanol provenant de la cellulose pariétale est une
source importante d’énergie

La  cellulose  est  composée  de  dimères  de  glucose  


 (appelés  cellobiose)  

Les parois
cellulaires
des tiges Ethanol
de Maïs et
d’autres
résidus
agricoles
 

Source: Genome Management Information System, Oak Ridge National Laboratory


Les végétaux peuvent être une source de biodiesel

Le  biodiesel  produit  à  parHr  du  colza,  des  algues  


et  du  soja  peut  remplacer  le  diesel  dérivé  du  
pétrole  

Image : Tilo Hauke, University of Minnesota, Iowa State University Extension.


Les végétaux produisent une variété
(d)étonnante de molécules actives

CO2
vitamine A

vanilline vitamine C

cafféine

morphine
Les cultures “bioénergétiques” ne devraient pas affecter
les productions alimentaires et leur prix

Miscanthus giganteus
est une plante
“bioénergétique”
pérenne à croissance
rapide qui pousse sur
des terres impropres à
la culture de plantes
alimentaires

Photo: S. Long Lab, University of Illinois, 2006


Les végétaux fournissent des centaines de
composés utilisés comme médicaments ou
drogues
• Saule (Salix) l’écorce est une source d’ aspirine
(acide acétylsalicylique)
• Digitale (Digitalis purpurea) : source de digitaline
(tonicardiaque)
• If du Pacifique (Taxus brevifolia) : source de taxol
(anti-cancéreux)
• Cafféier (Coffea arabica) and Théier (Camellia
sinensis) : sources de caféine (stimulant)
Artemisia annua est une plante présentant de
nouvelles activités anti-malaria

Artémisinine

Artemisia a été utilisée par les herboristes chinois pendant


des milliers d’années. Le principe actif (artémisinine) a été
purifié et caractérisé en 1972.

Crédit photo: www.anamed.net


Les scientifiques développent des génotypes
d’Artemisia fortement producteurs d’artémisinine

Photo: www.york.ac.uk/org/cnap/artemisiaproject/
On peut préparer des plantes contenant des
vaccins ou des anticorps sûrs et peu coûteux

OU ?
Les végétaux peuvent être des sources de matériaux
biorenouvelables et biodégradables

Energie
solaire

Production de
plastiques
biodégradables de
matériaux végétaux
biorenouvelables
Photo: S. Long Lab, University of Illinois, 2006
La recherche en physiologie végétale peut contribuer à
soulager la faim en développant des plantes qui :

! sont plus nutritives


! résistent mieux aux stress biotiques et abiotiques
! requièrent moins d’eau et d’engrais
Le mildiou détruit les plants de Pomme de terre

• Les épidémies de mildiou de la


Pomme de Terre (Phytophthora
infestans) ont provoqué plus d’un million
de morts en Europe vers les années
1840 .

Infecté Traité

Crédit photo: USDA; Scott Bauer


Identification de gènes de résistance

Inoculé Témoin

Resistant Sensible
Les généticiens ont
identifié un gène conférant
la résistance au mildiou et
l’ont introduit dans des
variétés comestibles La plante à gauche contient un
gène de résistance et est
dépourvue de symptômes

Song, J., Bradeen, J.M., Naess, S.K., Raasch, J.A., Wielgus, S.M., Haberlach, G.T., Liu, J., Kuang, H., Austin-Phillips, S., Buell,
C.R., Helgeson, J.P., Jiang, J. (2003) Gene RB cloned from Solanum bulbocastanum confers broad spectrum resistance to potato late
blight. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100:9128–9133.
La modification d’un seul gène peut augmenter la
résistance à la sécheresse

Résistant à la
sécheresse

Sauvage
Arrosage normal 10 jours sans eau 20 jours sans eau Après ré-arrosage

Yu, H., Chen, X., Hong, Y.-Y., Wang, Y., Xu, P., Ke, S.-D., Liu, H.-Y., Zhu, J.-K., Oliver, D.J., Xiang, C.-B. (2008) Activated
expression of an Arabidopsis HD-START protein confers drought tolerance with improved root system and reduced stomatal
density. Plant Cell 20:1134-1151.
Les végétaux nous
fournissent plus
que de la
nourriture:

Ils sont:
• une source de nouveaux médicaments
• une source de fibres pour le papier et les meubles
• pourvoyeurs de produits biorenouvelables
• pourvoyeurs de sources d’énergie renouvelables  

Credit photo: tom donald


POURQUOI ETUDIER LES PLANTES ?

L’étude des végétaux augmente notre connaissance des


processus biologiques et nous permet de rester alimentés,
habillés, soignés, protégés, et heureux.
SIGNAUX  ET  DEVELOPPEMENT  DES  PLANTES  
 

Généralités  
•   Pourquoi  étudier  les  plantes  ?  
• Développement  et  signalisaHon  
 
Arbre évolutif: plantes et algues vertes

Algues vertes Plantes

Gymnospermes

Angiospermes
Chlorophytes

Charophytes

Lycophytes
Bryophytes

Fougères
Fleurs
Graines 300
360
Tissus vasculaires
400
Stomates
Conquête du milieu terrestre 450

1200?

D’après Hay, A. and Tsiantis, M. (2010). KNOX genes: versatile regulators of plant development and diversity. Development. 137: 3153-3165 and Prigge, M.J.
and Bezanilla, M. (2010). Evolutionary crossroads in developmental biology: Physcomitrella patens. Development. 137: 3535-3543.
Les algues vertes sont des eucaryotes
photosynthétiques
Chlorophytes Charophytes Spirogyra spp
Ostreococcus
tauri

Volvox spp
10 µm
Chara braunii
Chlamydomonas reinhardtii

Images: JGI; Spike Walker Wellcome Images; Jaspser Nance; Show_ryu


Les bryophytes sont des plantes
“non-vasculaires”

Hépatiques Mousses Anthocérotes Plantes  


(~7000 – 8500 (~10,000 – 17 000 espèces) (~200 espèces) vasculaires  
espèces)

Algues  vertes  

Plantes terrestres

D’après Chang, Y. and Graham, S.W. (2011). Inferring the higher-order phylogeny of mosses (Bryophyta) and relatives using a large, multigene plastid data set. Am. J. Bot. 98: 839-849 and Ligrone, R., Duckett, J.G. and
Renzaglia, K.S. (2012). Major transitions in the evolution of early land plants: a bryological perspective. Ann. Bot. 109: 851-871. Photo credits Tom Donald, Mary Williams and gjshepherd_br / Foter.com / CC BY-NC-SA
Les trachéophytes sont des plantes
vasculaires

Lycophytes Fougères Gymnospermes Angiospermes


(~ 1200 espèces) (~ 13 000 espèces) (~ 1000 espèces) (~ 350 000 espèces)

Bryophytes  

Graines
Tissus vasculaires

Photos: Tom Donald


Opportunités et défis de l’environnement terrestre

Il  y  a  plus  de  450  millions  d’années,  les  plantes  se  sont  déplacées  en  
milieu  sec  

Initialement, le milieu
L’ environment aquatique
terrestre était moins
était compétitif, et rempli
compétitif, et il y avait
d’herbivores
moins d’herbivores

Mais les plantes ont dû vaincre


différents défis et s’adapter à un
environnement sec
L’environnement terrestre est difficile

Trop  lourd,  sec,  chaud  et  froid  et  lumineux  

Environnement aquatique:
Flottabilité
Eau abondante
Températures modérées
Lumière filtrée

Environnement terrestre:
Non flottabilité
Peu d’eau
Températures extrêmes
Trop de lumière, y compris UV
Les plantes sont pluricellulaires

Avantages:
• La taille présente un
avantage compétitif pour
capter la lumière et les
nutriments
• Les cellules peuvent se
spécialiser

Inconvénients:
• Nécessité de transporter
les ressources et
l’information, et
coordonner ses réponses Photo: Tom Donald
La plupart des cellules végétales sont
connectées par des plasmodesmes
Les plasmodesmes
sont des ponts
cytoplasmiques
entre cellules,
bordés par la
membrane
plasmique
Les cellules de
garde sont
symplastiquement
isolées
Les signaux, les
nutriments et l’eau Les virus
peuvent se peuvent se
déplacer vers les propager à
cellules travers la plante
adjacentes, ou à par les
plus longue plasmodesmes
distance par le
phloème D’après Lee, J.-Y. and Lu, H. (2011). Plasmodesmata: the battleground against intruders. Trends Plant Sci. 16: 201-210 with permission from Elsevier.
Transport chez les bryophytes –
quelques cellules spécialisées
Les bryophytes absorbent l’eau à partir de l’air et du substrat

L’eau  se  déplace  le  long   Quelques


des  surfaces  externes,   bryophytes ont
à  l’intérieur  des   des cellules
cellules,  entre  les   conductrices de
cellules  et  à  travers  des   nutriments: les
cellules  conductrices   leptoïdes (l)
spécialisées:  les  
hydroïdes  (h)  

Les parois
transversales des
Hydroïdes (h) en leptoïdes ont des
section transversale plasmodesmes
élargis
D’après Ligrone, R., Duckett, J.G. and Renzaglia, K.S. (2000). Conducting tissues and phyletic relationships of bryophytes. Philosophical Transactions
of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences. 355: 795-813 by permission of the Royal Society.
Les plantes vasculaires ont des
systèmes de transport à longue distance

XYLEME PHLOEME
Transport de l’eau Les assimilats et
du sol jusqu’à d’autres molécules se
l’atmosphère par déplacent des sources
les cellules mortes (organes autotrophes)
du xylème vers les puits (organes
hétérotrophes) par le
phloème
Le phloème est également responsable
de la signalisation à distance

Moment de la
reproduction:
FT Dans des conditions
eupériodiques (selon les
Coordination des saisons) la protéine
miR399
fonctions des tiges et
FLOWERING LOCUS T
des racines:
(FT) et ses orthologues
Quand les feuilles sont
se déplacent des feuilles
carencées en phosphate,
vers l’apex caulinaire, et
un microRNA (miR399) se induisent la transition
déplace dans le phloème vers la croissance
vers les racines et
reproductive
promeut l’absorption du
phosphate

Chiou, T.-J., et al. (2006). Regulation of phosphate homeostasis by microRNA in Arabidopsis. Plant Cell. 18: 412-421; McGarry, R.C. and Kragler, F. (2013). Phloem-mobile signals affecting flowers: applications for
crop breeding. Trends Plant Sci. 18: 198-206; Lucas, W.J. et al. (2013). The plant vascular system: Evolution, development and functions. J. Integr. Plant Biol. 55: 294-388.
SIGNAUX  ET  DEVELOPPEMENT  DES  PLANTES  
 

Généralités  
• Pourquoi  étudier  les  plantes  ?  
• Développement  et  signalisaHon  
• Développement  et  environnement  
 
Phénotype    =  [Génotype]  
  x  [Environnement]  

SignalisaHon  

Aspects  généHques  
La fleur du tournesol, Helianthus annuus
Sequoia  (Gymnospermes)  
Plasticité phénotypique

Capacité d’un individu (ou d’un génotype) à présenter différents


phénotypes en réponse à des variations de l’environnement

Rouge: rouge Rouge: rouge


Lumière faible Lumière forte lointain faible lointain élevé
[phosphate] faible
[phosphate] forte
[phosphate] faible

Polygonum lapathifolium Nicotiana tabacum

D’après Wiley from Drew, M.C. (1975). Comparison of the effects of a localised supply of phosphate, nitrate and ammonium and potassium on the growth of the seminal root system, and the shoot, in barley. New Phytol. 75: 479-490. Reprinted from
Vandenbussche, F., et al. (2005). Reaching out of the shade. Curr. Opin. Plant Biol. 8: 462-468 with permission from Elsevier, Reprinted from Sultan, S.E. (2000). Phenotypic plasticity for plant development, function and life history. Trends Plant Sci.
5: 537-542 with permission from Elsevier. See also Bradshaw, A. D. (1965). Evolutionary significance of phenotypic plasticity in plants. Adv. Genet. 13: 115–155.

©    2013  American  Society  of  Plant  Biologists  


Le comportement des végétaux est affecté par
de nombreux paramètres de l’environnement

Facteurs
abiotiques: Génome et Résultats
Lumière, épigénome phénotypiques:
humidité, • Nombre et longueur
nutriments, des racines et des
etc. tiges
• Nombre, taille et
Facteurs architecture des
biotiques: feuilles, branches et
compétiteurs racines latérales
symbiontes, • Production de
pathogènes, metabolites
herbivores, • Etc.
etc.

La réponse des plantes met en jeu la plasticité phénotypique

©    2013  American  Society  of  Plant  Biologists  


Phototropisme  
EHolement  
NycHnasHe  
Un  autre  exemple  de  nycHnasHe:  l’oxalis  

Jour  

Nuit  
Les plantes peuvent s’adapter et s’acclimater
aux températures extrêmes
Les plantes de désert sont
acclimatées aux

Photosyntèse
Photosynthèse

Plantes de températures élevées


désert

Quelques plantes ont


Espèces
évolué pour tolérer les
températures élevées Acclimatées aux
littorales
températures
fraîches
10 20 30 40 50 10 20 30 40 50
Température foliaire (°C) Température foliaire (°C)
Dans une certaine mesure,
Larrea tridentata, une
la plupart des plantes
plante de désert
extrêmement peuvent s’acclimater aux
thermotolérante températures les plus
froides ou les plus chaudes
en percevant et en
répondant aux
changements de
D’après Berry, J., and Björkman, O. (1980). Photosynthetic response and adaptation to temperature in higher plants. Annu. Rev. Plant Physiol. 31: 491 – 543. Photo credit Sue in Az
températures
Port en drapeau  
ThigmonasHe  (séismonasHe):  Mimosa  pudica  (Légumineuses)  
Dionea  muscipula  (Droseraceae)  
Gravitropisme  (géotropisme)  :  réponse  à  la  gravité  
Botrytis cinerea, ascomycète, (Botrytinia fuckeliana)
agent de la pourriture grise et de la pourriture noble
Des signaux émis par des plantes peuvent préparer
d’autres plantes à la défense ou la tolérance
Les signaux d’alarme sont bien
décrits chez les animaux
sociaux. Les plantes stressées
peuvent émettre des signaux
auxquels d’autres plantes
répondent
Prépare-
toi!

signaux

signaux

D’après Glinwood, R., Ninkovic, V. and Pettersson, J. (2011). Chemical interaction between undamaged plants – Effects on herbivores
and natural enemies. Phytochemistry. 72: 1683-1689 with permission from Elsevier. Photos: Snowmanradio, Justin Johnsen,
D. Gordon E. Robertson

©    2013  American  Society  of  Plant  Biologists  


Les composés volatils émis par les plantes
endommagées peuvent déclencher des réactions de
défenses chez d’autres plantes

The signal(s) travel through air

Armoise
(Artemisia
tridentata)

Tabac sauvage
(Nicotiana Volatile compounds
When nearby sagebrush was attenuata) emitted by damaged
mechanically damaged, wild plants can induce
tobacco increased production of defenses in their
defense compounds (PPO) and neighbors
suffered less herbivore damage
Karban, R., Baldwin, I.T., Baxter, K.J., Laue, G. and Felton, G.W. (2000). Communication between plants: Induced resistance in wild tobacco plants following clipping of neighboring
sagebrush. Oecologia. 125: 66-71. see also Kessler, A., Halitschke, R., Diezel, C. and Baldwin, I. (2006). Priming of plant defense responses in nature by airborne signaling between Artemisia
tridentata and Nicotiana attenuata. Oecologia. 148: 280-292. Photo courtesy Ian Baldwin Copyright Max Planck Institute for Chemical Ecology, Jena, Germany / Rayko Halitschke

©    2013  American  Society  of  Plant  Biologists  


Les karrikines sont des composés des
fumées qui promeuvent la germination

La germination induite par le feu


permet aux jeunes pousses de s’établir
avec une compétitition moindre de la
part des plantes plus grandes.

Les karrikines sont des signaux


contenus dans la fumée qui stimulent
la germination.

Toutefois, après le feu, la compétition


entre jeunes pousses de même taille
est maintenues….
D’après Chiwocha, S.D.S., Dixon, K.W., Flematti, G.R., Ghisalberti, E.L., Merritt, D.J., Nelson, D.C., Riseborough, J.-A.M., Smith, S.M. and Stevens, J.C. (2009). Karrikins: A new family of plant
growth regulators in smoke. Plant Science. 177: 252-256 avec la permission d’ Elsevier. Voir aussi Flematti, G. R., et al., (2004). A compound from smoke that promotes seed germination. Science
305: 977.

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