Université Djilali Bounaama de Khemis Miliana

Département de Biologie
Filière Biotechnologie
Spécialité Biotechnologie microbienne Dr DOUAOURI N.H

Chapitre II

Produits naturels d’origine microbienne

1.2. Produits naturels d’origine fongiques

Les champignons sont répartis dans la nature. Ces micro-organismes eucaryotes hétérotrophes
vivent souvent en symbiose. Les champignons sont utilisés depuis longtemps par l'humanité à
de nombreuses fins, notamment la production alimentaire (bière, vin, pain au levain, aliments à
base de soja), les traitements et la vie quotidienne. Il y a des milliers d'années, les Mayas
utilisaient les champignons pour traiter les maladies intestinales. Depuis la découverte de la
pénicilline, qui a été isolée du champignon Penicillium notatum, les champignons ont été une
riche source de nombreux agents thérapeutique. Les champignons sont une riche source de
métabolites secondaires biologiquement actifs (Figure 01)

Figure 01. Certains composés naturels médicalement importants provenant de

champignons.
De nombreux agents thérapeutiques, tels que la cyclosporine et l'acide mycophénolique (activité
immunosuppressive), l'acide fusidique et la griséofulvine (activité antimicrobienne) et d'autres
nouveaux médicaments antifongiques semi-synthétiques, tels que l'anidulafungine et la
caspafungine, ont été dérivés de métabolites fongiques. Récemment, la cyclosporine a été
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utilisée pour développer Debio 025, dont il a été cliniquement prouvé qu'il avait une puissante
activité antivirale.
L'un des médicaments les plus importants sont les statines, notamment la mévastatine de
Penicillium citrinum (Figure 02) et la lovastatine d'Aspergillus terreus (Figure 03) (Endo et al.,
1976 ; . Les statines, une classe importante de médicaments antilipidémiques pour le traitement
des maladies cardiovasculaires, sont également dérivées de sources microbiennes.

Figure 02. Croissance des colonies de citrinum après 4 jours d'incubation sur gélose
Sabouraud dextrose à 27 °C. (Hesse et al., 2017)

Figure 03. Caractérisation d'Aspergillus terreus. Colonies d'Aspergillus terreus sur plaque PDA
montrant une couleur brun cannelle; B. Conidiophores bisériés d'Aspergillus terreus (100X).
(Upendra et al., 2013)
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Certains des médicaments issus des champignons approuvés par la Food and Drug
Administration (FDA) des États-Unis sont présentés dans le tableau 01.

Tableau 01 : Certains médicaments approuvés par la Food and Drug Administration (FDA)
des États-Unis issus des champignons

Les métabolites fongiques ne sont pas seulement importants pour la médecine mais aussi pour
la protection des plantes. Par exemple, la découverte des strobilurines, qui ont d'abord été isolées
des espèces de Strobilurus, ont conduit à des fongicides synthétiques, tels que la
trifloxystrobine.

1.2.1. Les endophytes végétaux

Ils ont été définis de plusieurs manières. La définition la plus courante est « tous les organismes
habitant des organes végétaux qui, à un moment de leur vie, peuvent coloniser les tissus
végétaux internes sans causer de préjudice apparent à l'hôte ». Les champignons sont plus
fréquemment observés comme endophytes que comme bactéries.
Un champignon endophyte est un champignon qui peut coloniser les tissus sains de la plante
hôte, ne provoquant généralement aucun symptôme apparent de maladie. Il existe des relations
symbiotiques entre l'hôte les plantes et leurs endophytes grâce auxquels l'hôte peut soutenir et
fournir des nutriments au champignon et produire plus tard des métabolites qui sont importants
pour l'hôte. Cette relation symbiotique peut être soudainement inversée en opportuniste si la
plante hôte est affaiblie.
Les endophytes sont un groupe polyphylétique de champignons principalement ascomycètes,
alors que les basidiomycètes, les deutéromycètes et les oomycètes existent rarement. Il n'y a pas
de spécificité d'hôte, mais il a été remarqué que certaines familles colonisent fréquemment
certains hôtes.
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1.2.2. Rôles écologiques des endophytes

La grande diversité et les rôles écologiques des endophytes produisent une variété de
métabolites secondaires prometteurs sur le plan pharmaceutique et agrochimique.
Parmi les produits isolés, la cryptocine, du champignon endophyte Cryptosporiopsis quercina,
un endophyte de Tripterigeum wilfordii, a montré une puissante activité contre le pire ravageur
des plantes au monde, Pyricularia oryzae (Figure 04), et d'autres champignons
phytopathogènes.

Figure 04. Symptômes de la maladie de Paddy Blast (Pyricularia oryzae)

Phemol, une lactone polykétide active qui est isolée de l'endophyte Phomopsis sp., un endophyte
de la plante médicinale Erythrina crista-galli, présente une activité anti inflammatoire ainsi
qu'antimicrobienne.

Plusieurs champignons endophytes peuvent produire des métabolites secondaires qui sont
également biosynthétisés par leurs plantes hôtes (Figure 05). Il s'agit par exemple du paclitaxel
antinéoplasique, de la camptothécine et ses analogues structuraux, les principaux médicaments
anticancéreux, la podophyllotoxine et la désoxypodophyllotoxine, l'antidépresseur hypericine
avec l'émodine, et le médicament naturel insecticides azadirachtine A et B.
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Figure 05 : Quelques composés bioactifs importants de champignons endophytes.

1.3. Produits naturels d’origine algale

Les algues sont une source prolifique dans la chimie des produits naturels et comprennent des
espèces procaryotes (cyanobactéries) et eucaryotes. Ils sont représentés par environ 30 000
espèces qui ont une fonction de fournir de l'oxygène à la biosphère. Ils sont également une très
bonne source nutritionnelle pour les poissons et les humains. De plus, ils peuvent être utilisés
en médecine et dans les engrais. Le groupe le plus important des composés produits par les
algues sont des terpénoïdes, qui comprennent de nombreuses classes, dont les dérivés bromés,
les dérivés de la phénazine, les hétérocycles oxygénés et azotés, les acides aminés et les dérivés
de la guanidine.
L'étude des produits naturels des algues a commencé en 1970. Parmi les composés importants
produits par les algues se trouvent le polycavernoside A de l'algue rouge Polycaverosa tsudai ;
dictyolide A, B (diterpènes), et nordictyolide de l'algue brune, Dictyota dichotoma ; et
crenuladial antimicrobien, qui est isolé de l'algue brune Dilophus ligatus (Figure 06).
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Figure 06. Certains nouveaux composés bioactifs d'algues marines.

Cependant, les algues rouges, en particulier le genre Laurencia (Rhodophyta), produisent

couramment des sesquiterpènes et des diterpènes halogénés. Il convient de mentionner que les
algues sont une source très étendue de nouveaux insecticides et ont remplacé les pesticides de
synthèse chimiquement résistants. Des exemples d'insecticides puissants provenant d'algues
comprennent la (Z)-lauréatine, la laurépinnacine et le 1-(2-E-chlorovinyl)-2,4,5-trichloro-
1,5diméthylcyclohexane et son énantiomère.

Algue brune, Dictyota dichotoma Laurencia sp., Algue rouge

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Références bibliographiques :
 Abdel-Razek, A. S., El-Naggar, M. E., Allam, A., Morsy, O. M., & Othman, S. I. (2020).
Microbial natural products in drug discovery. Processes, 8(4), 470.

 Endo, A., Kuroda, M., & Tsujita, Y. (1976). ML-236A, ML-236B, and ML-236C, new
inhibitors of cholesterogenesis produced by Penicillium citrinum. The Journal of antibiotics,
29(12), 1346-1348.

 Hesse, S. E., Luethy, P. M., Beigel, J. H., & Zelazny, A. M. (2017). Penicillium citrinum:
opportunistic pathogen or idle bystander? A case analysis with demonstration of
galactomannan cross-reactivity. Medical mycology case reports, 17, 8-10.

 Upendra, R. S., Pratima, K., Amiri, Z. R., & Shwetha, L. (2013). Screening and molecular
characterization of natural fungal isolates producing lovastatin.