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Dpartement de Microbiologie
Department of Microbiology
MYCOLOGIE GENERALE
MIB 202
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Objectifs du cours
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Plan du cours
III-Champignons parasites
III.1-Sant et maladies (mycoses, candidoses, dermatoses)
III.2-Industrie et alimentation (bio dtrioration et dgradation)
III.3-Agriculture et sylviculture (maladies des cultures)
III.4-Environnement (les vnneux : Amanita)
IV-Champignons bnfiques
IV.1-Sant et maladies: antibiotiques, acides amins, autres mdicaments
IV.2-Industrie et alimentation: enzymes, alcools, acides organiques, flaveurs et armes,
IV.3-Agriculture et sylviculture: biofertilisants, biopesticides, hormones de croissance,
IV.4-Environnement: ligno-cellololytiques, biomining,
Conclusion
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MYCOLOGIE GENERALE (MIB 202)
La mycologie est ltude des champignons. On retrouve les champignons partout dans le
monde, ils sont peu diversifis morphologiquement mais possdent une importante
biodiversit, plus grande que celle des plantes, des bactries et des animaux (hors mis les
insectes) ; mais, celle-ci est encore peu dcrite (environ 70 000 100.000 espces
connues). Ils sont essentiels pour le bien tre de la plupart des cosystmes terrestres, car
ils dcomposent la matire organique et recyclent les nutriments vitaux. Leur cologie,
physiologie et mtabolisme diffrent compltement de celle du rgne vgtal et animal.
La connaissance de leur rle et intrt pour lcosystme et la socit est
incommensurable pour de nombreuses raisons : sant (seulement 400 espces sont
responsables de maladies, production de mdicaments), industrie et alimentation
(responsables de dtriorations et obtention de produits), agriculture et sylviculture
(dtriorations alimentaires et augmentation des rendements/protection des cultures,
amlioration de la survie des plants), environnement (conservation des eaux et des sols,
changements climatiques, prservation de la biodiversit). Dans le domaine de la
recherche, ils constituent les organismes majeurs des biotechnologies traditionnelles
(fermentations) et modernes (transformations gntiques ou gnie gntique). Ecologie :
les champignons sont adaptes une grande diversit de milieux on les retrouve dans les
murs, sur du papier les vtements, les aliments ou les fruits frais ou en conservation ; ils
provoquent des moisissures ou alors des altrations graves des graines ; ils sont trs
dangereux pour la sant ; de nombreuses moisissures produisant des toxi-infections
graves exemple de Aspergillus flavus qui produit des aflatoxines que lon retrouve dans
les crales et surtout les graines chtives darachide. Ils peuvent provoquer le cancer du
foie, du poumon, des avortements ; saccumuler dans la chane alimentaire (transfert
mre enfant). Les champignons sont adapts diverses cologies : exemple des
pathognes qui causent les dermatoses de la peau, certains attaquent les poumons et
dautres tels que Saccharomyces cerevisiae ou Aspergillus niger sont des dcomposeurs
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bnfiques pour les industries agroalimentaires. Dans les sols, ils sont dominants et leur
activit est majeure ; par exemple les champignons mycorhiziens tels que Glomus et
Gigaspora sont bnfiques pour les cultures et les arbres, les sols et la conservation des
cosystmes. Un champignon saprophyte vivant sur les cadavres de coloptres,
Cordyceps possde des vertus thrapeutiques et pharmaceutiques utiles pour les sportifs
de haut niveau. Les champignons pathognes des plantes tels que Phytophthora sont
responsables de dgts importants sur les cultures dintrt tels que le cacaoyer (50% de
dgts : 150-200 milliards/an) et Pythium (pourriture racinaire du macabo) sur de
nombreuses cultures vivrires. On distingue aussi les champignons microscopiques
(moisissures) par rapport aux champignons dits suprieurs (champignons chapeau), les
comestibles par rapport aux vnneux.
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1ERE PARTIE : LES BASES DE LA MYCOLOGIE
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-les symbioses bnfiques pour la production agricole, arboricole et lcosystme ; mais
aussi stimulent la tolrance des plantes aux stress du sol (scheresse, acidit, salinit).
Les principales fonctions des champignons pour la recherche sont :
-ils servent pour des tudes fondamentales de gntique classique et applique de gnie
gntique (production de biomolcules). cause de leur facilit de culture, la rapidit de
leur reproduction
Respiration :
Les champignons transforment leur source de carbone pour produire de lnergie pour le
mtabolisme dans la mitochondrie comme toute cellule eucaryote. A travers les voies
mtaboliques : glycolyse, cycle de Krebs, et la chaine de transport dlectrons pour la
production dnergie cellulaire.
Croissance et dveloppement :
Les champignons pluricellulaires (mycliens) se reproduisent par extension apicale ;
alors que les unicellulaires se reproduisent par division binaire comme les bactries.
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Labyrinthulomyctes. Sont saprophytes dans lenvironnement ou parasites des cultures
marachres, exemple Plasmodiophora brassicae des Crucifres.
2-Les Eumycota, ou champignons avec un thalle diffrenci ou champignons vrais. (6
Embranchements : Mastigomycotina, Zygomycotina, Ascomycotina, Basidiomycotina,
Deuteromycotina, Glomeromycotina).
*Thalle siphonn, auparavant appel Phycomyctes. champignons infrieurs
-Mastigomycotina. On trouve 3 classes : Chytridiomyctes (800 espces, paroi
constitue de chitine), Hyphochytridiomyctes (Saprolgniales), Oomyctes
(Pronosporales). La plupart sont aquatiques avec des organes de reproduction asexus
(sporanges et zoospores biflagelles) et sexus (oospores et anthridies).
-Oomyctes (Peronosporales) : parasites des cultures, des arbres et de poissons.
Phytophthora megakarya responsable de la pourriture brune des cabosses du cacaoyer
Pythium myriotylum responsable de la pourriture racinaire du macabo
- Hyphochytridiomyctes (Saprolgniales) : Saprolegnia
- Chytridiomyctes : Olpidium brassicae
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fructification cescostroma) Ascobolus et Trichoderma (saprophytes), Sclerotinia,
Taphrina (parasite), Tuber melanosporum (symbiotiques ectomycorhiziens des arbres).
-Basidiomycotina. On trouve 4 classes : Ustilaginomyctes, Urdinomyctes,
Hymenomyctes et Gasteromyctes. Les organes de reproduction sexus sont des
basidiospores. Ils sont saprophytes, parasites ou symbiotiques ectomycorhiziens.
Exemple Termitomyces et Pleurotus (saprophytes comestibles), Ustilago, Uromyces,
Puccinia, Polyporus (parasites des plantes), Boletus (symbiotique ectomycorhizien
comestible), Amanita (saprophyte vnneux).
1-Ustilaginomyctes : Ustilago,
2-Urdinomyctes : Puccinia, Uromyces, Melamspora
3-Hymenomyctes : Amanita, Coprina, Cortina
4-Gasteromyctes : Phallus.
Ce sont les champignons visibles lil nu ou encore champignons chapeau
(carpophores).
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-Glomeromycotina. On trouve 2 classes : Glomineae et Gigasporineae.
Anciennement classs avec les Zygomycotina dans la famille des Endogonaces,
(Gerdermann et Trappe, 1974 ; Trappe et Schenck, 1982). Actuellement, tous ralisent
la symbiose mycorhizienne arbusculaire appartiennent lembranchement des
Glomeromycota (Schssler et al., 2001). Les champignons symbiotiques des racines de la
majorit des plantes (85%) et des arbres pour les bnfices mutuels. Exemples:
Archeoglomus, Glomus, Gigaspora.
Exemple de classification :
-Domaine : Eukaryota
-Rgne : Champignon (Fungi)
-mycota : embranchement (Phylum),
-mycotina : sous-embranchement,
-mycte : classe
-ales : ordre
-aceae : famille
Domaine : Eucaryota, Rgne: Fungi, Embranchement ou Phylum: Ascomycotina, Sous-
embranchement: Pezizomycotina, Classe: Sordaromyctes, Ordre : Hypocreales,
Famille : Hypocreaceae, Genre : Trichoderma, Espce : viridae.
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Diversit morphologique : taille (les plus petits sont les unicellulaires (levures avec 5
10 micro m) et les plus gros peuvent atteindre 60-80 cm et peser plusieurs kg) et organes
de reproduction (asexus et sexus).
Diversit fonctionnelle : plusieurs types nutritionnels (saprophytes, parasites et
symbiotiques), comestibles ou toxiques, utiles ou nuisibles.
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Encadr 1: Autres assimils champignons phytoparasites
Ces groupes sont parfois classs avec ou en dehors de champignons vrais cause de
certaines particularits de leur constitution morphologique ou chimique!
Phylum Plasmodiophoromycota
Ont souvent t classs avec les champignons ; sont des dcomposeurs ou des parasites
racinaires (renflements similaires aux symptmes de nmatodes) qui possdent des
zoospores et des plasmodes (slime moulds) que lon retrouve chez les plantes telles que
les choux. Ex Plasmodiophora brassicae, agent de la hernie du choux ou symbiotiques
obligatoires (Bacillus subtilis) poussant sur les algues, les champignons ou les plantes.
Spongospora subterranea : agent de la galle poudreuse de la pomme de terre.
Ressemble aux champignons, mais leur paroi est constitue de cellulose, ont un thalle
siphonn et des sporanges capables de librer des zoospores flagelles. Ce sont des
dcomposeurs, des parasites ( water mould ) des plantes ou dautres champignons. Ex
Pythium ultimum, Phytophthora megakarya ou P. infestans, Saprolegnia. Leur
reproduction sexuelle est unique et donne des oospores. Ils provoquent de nombreuses
maladies des cultures dans les rgions tropicales : mildiou duveteux (downy mildew).
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La reproduction sexue contribue augmenter la variabilit gntique, elle est surtout
frquente chez les espces htrothalliques ; elle aboutit la formation dune spore
sexuelle ou zygote partir de la fusion de 2 organes (anthridie et oogone).
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Tableau : Classification et habitat et reproduction des groupes majeurs de champignons
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Tableau : Principales proprits des champignons (Madigan et Martinko, 2007)
*Mastigomycotina sont phylogntiquemnt distinct de tous les autres groupes (arbre phylognique des
Eucarya) : sont-ils vraiment des champignons ou des protistes pluricellulaires ?
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