Thme 2 : Stabilit et variabilit des gnomes et Evolution

Le gnome est lensemble des gnes dune espce. Il caractrise chaque espce et est donc stable au sein de celle ci. --> Stabilit gntique de lespce Les gnes sont des portions dADN codant pour des caractres morphologique, anatomique, physiologique, cellulaire et molculaire. Si tous les individus dune mme espce possde le mme gnome ils nont pas pour autant le mme gnotype. (= ensemble des combinaisons alllique dun individu) : il y a unit gnomique des individus dune espces mais unicit alllique de lindividu au sein dune espce. Ainsi lapparente stabilit dune gnome cache une extrme variabilit des individus expliquer par le polymorphisme gnique (diffrente forme du gne) lie la polyalllie (diffrents allles) de la majorit des gnes (une gne pouvant exister sous plusieurs formes que sont les allles cest dire des versions diffrentes dun mme gne). Ce polyalllisme rsulte dune volution dans les innovations gntiques que sont les mutations alatoires survenue au cours du temps Outre les allles les gnomes ce sont galement complexifi et multipli ce qui a ajout de nouvelles fonctions aux fonctions existantes, cette volution gnomique implique alors la cration de gnes.

Chapitre 1 : Les innovations gntiques

p 83 102 Le monde actuel prsente une grande diversit des espces et les individus dune mme espce prsente une grand diversit gntique. Polymorphisme gnique et cration de gnes sont les deux manifestations de lvolution des gnomes : ce sont des innovations gntiques PB = Comment les innovations gntiques peuvent elle apparatre dans une espce, au cours des temps gologiques ?
Quest-ce que les innovations gntiques entranent :

I- Le polymorphisme gnique
A) 1) Quelques exemples de polymorphisme gnique humain Le gne du systme ABO

Lappartenance un des 4 groupes sanguins A,AB,O,B est dterminer par la prsence ou labsence de marqueurs cellulaires sur la surface dhmaties. La synthse de ces marqueurs se fait par tapes dont la dernire est catalyse par une enzyme cod par une gne du chromosome 9 (K9, K= chromosome) qui prsente plusieurs allles. Lallle A code pour lenzyme A et permet la fixation de la N -actyl-galactosamine (NAC) sur le prcurseur H ce qui forme le marqueur A. Lallle B code pour une enzyme B qui permet la fixation du galactose sur le prcurseur H et produit le marqueur B. Lallle O code pour une enzyme O non fonctionnel qui ne permet la fixation daucune substance sur le prcurseur : aucun marqueur nest donc synthtis . De plus la synthse du prcurseur H, est cod par une gne du K5 prsentant deux allles, lallle

H qui permet la synthse du prcurseur H et lallle h qui empche la synthse du prcurseur. 1) le gne de la -globine

L'hmoglobine est constitue de 4 chanes polypeptidiques : deux chanes (alpha) deux chanes dont plusieurs allles sont responsable de maladies : HbA est considr comme normale HbS est responsable de la drpanocytose HbC est responsable de lhmoglobinose C Hb -thalassmie est responsable de la thalassmie. Lorsquon observe les squences de nuclotides dun mme gne chez des individus appartenant la mme espce on observe des diffrences de squences. Cest diffrentes squences qui codent diffrentes protines sont des allles. On dit quun gne est polymorphe si au moins deux de ces allles sont prsents dans une espces une frquence suprieur ou gal 1%. Ce polymorphisme entrane une trs grande proportion dindividu qui vont tre qualifis dhtrozygotes car il possde deux allles diffrentes pour un mme gne. ( linverse dHomozygote qui sont des individus possdant possdant deux allles identiques pour le mme gnes)

A)

Origine du polymorphisme gnique p87

En comparant les allles dun mme gnes on constate des diffrences dans la squence de nuclotides. Ces diffrence sont des accident produits lors de la duplication de lADN. Ces modifications de la squence du gne sont appel mutations et cest lorigine de nouveaux allles. Il peut sagir de mutations ponctuelles (qui touche un seul nuclotide de lADN) ou des mutations tendues (qui touchent plusieurs bases (nuclotides)). Parmi les mutations ponctuelles (elle sont loignes elles se suivent pas) on distingue : - les substitutions = remplacement dun ou plusieurs ou de nuclotide par un autre - Les insertions ou Additions = ajout dun ou plusieurs nuclotides - Les dltions ou suppressions = perte dun ou plusieurs nuclotides --> dcalage du cadre de lecture puisquil se fait partir de 3 nuclotides pour form un codon. Ces mutations sont rares ( frquence normalement infrieur 1 pour 1 Ma de rplication) spontane (rien ne les provoque) et alatoires (elles sont dues au hasard). Mais leur frquence peuvent tre augmentes par des agents mutagnes (cigarette, radioactivit, UV). I) Les consquences du polymorphisme gnique (p90-91)

Les mutations peuvent tre classes en fonction des consquences quelles induisent au niveau des phnotypes (ensemble des caractre visible observable) molculaire, cellulaire et macroscopique. On distingue :

1)

des mutations silencieuses Elles sont sans consquences sur la protines codes qui est strictement identique celle qui existait avant la mutation. Elles sont la consquences de substitutions qui du faite de la redondance du code gntique font apparatre un codon synonyme. La protine reste fonctionnelle.

1)

Les mutations neutres Elles induisent un nouveau phnotype molculaire sans consquences sur les phnotypes cellulaires et macroscopique : la protine a gard intacte sont site actif, le nouvel acide amin intervenant en dehors de celui ci : la protine reste fonctionnelle.

1)

Les mutations faux-sens Un acide amin est remplac par un autre et la configuration spatiale du site actif est modifie.Elle peut tre tellement diffrence que la protine en perd sa fonctionnalit. (il ny a donc plus de complmentarit avec le substrat)

4) Les mutations non-sens La mutation fait apparatre un codon stop sur lARN messager (donc pas de nuclotides associs) ce qui arrte la protosynthse et ne permet pas la portion de protines synthtises dtre fonctionnelle . 1) Les mutations dcalantes (--> mutations tendues) Elles sont dues une ou plusieurs (sauf multiple de 3) addition ou dltion qui entrainent un dcalage du cadre de lecture, de nombreuses modifications dacides amins et souvent lapparition prmature dun codon stop (donc peut tre gal la mutation de non sens)

Ainsi la graduation des consquences des mutations retentit sur les phnotypes cellulaires et macroscopiques de manire plus ou moins svre suivant les dommages fonctionnels lis la nature de la protine. --> Les maladies gntique sont lies des mutations de lADN

NB = Certaines mutations sont galement trs lourdes de consquences lorsquelles modifient les gnes homotiques impliqus dans le dveloppement des organismes et que leur changement provoquent lmergence de nouvelles fonctions ou de nouveaux plans dorganisations. Les gnes homotiques sexpriment pendant la priode embryonnaire pour contrler les tapes du

dveloppement leur chronologie et leur dure. Cest ainsi que sexplique les diffrences crnienne entre hommes et chimpanzs : alors que le squelette crnien de ces deux espces est trs ressemblant chez le foetus le crne de lHomme garde la mme forme lge adulte alors que celui du chimpanz est fortement modifi. Tous ce passe comme si la vitesse de dveloppement du crne tait plus faible chez lHomme que chez le singe. On peut expliquer cette diffrence par une mutation qui aurait affecte le gne contrlant cet tat : tous les gnes homotiques codent pour des protines possdant un HOMODOMAINE capable de se fixer sur une rgion prcise de lADN pour solliciter ou inhiber une cascade de gne. Au final un organe ou une fonction seront mis en service pour la construction et le fonctionnement dun organe. De toutes vidences les mutations de gne homotiques du dveloppement on t responsable de lacclration de lvolution des tre vivants.

D) Mutations et cellules porteuses de mutations

Un organisme sexu est compose de deux sorte de cellules : - les cellules somatiques (non sexuel) qui forment tous le corps de lindividu lexception des cellules des glandes sexuelles (ovaires et testicules) - Des cellules germinales qui sont lorigine des gamtes (ovules et spermatozodes)

Seules les mutations germinales sont transmises la descendance et intresse les gnticiens pour ltude des maladie gntique et du polymorphisme gnique.

II- La cration de gnes

En comparant les gnomes des espces volutives on constate que lacquisition de nouvelles fonctions et de nouvelles modalit de dveloppement sont associes lexistence dune nouvelle protine . Or qui dit nouvelle protine dit nouveau gne et non nouveau allle.

1) Les familles multigniques - Les diffrentes globines humaines : la comparaison des 6 globines humaines montrent de grandes similitudes dans la squences dacide amin et donc de nuclotides. On considre que des similitudes entre protines suprieurs 20 % ne peuvent pas tre du au hasard. Ces protines sont dites homologues et son codes par des gnes homologues ce qui suppose une filiation entre gnes. Les diffrents gnes homologues dune mme espces forment une famille de gne ou famille multignique cad un ensemble de gnes disperss dans le gnomes codant pour des protines homologues et issues dun gne ancestrale. Autre familles des gnes humains : lanalyse des gnomes permet de reprer des gnes codant pour des protines qui bien quayant des fonctions biologiques diffrentes appartiennent la mme famille (plus de 20% de similitudes dans la squences peptidiques codes)

1) Les mcanismes de la cration des gnes - un gne ancestrale inconnu ou hypothtique subit une duplication donnant deux gnes identiques (appels duplicata) cte cte sur le mme chromosome. - Lun des deux gnes sintgre un autre endroit du gnome soit sur le mme chromosome un nouveau locus, soit sur un autre chromosome : cest la transposition. - Chacun de ces gnes peut subir des mutations ponctuelles qui les font volues de faon indpendantes et aboutit les diffrencies. A partir dun gne le gnome senrichit de nouveaux gnes. Dans une famille multignique la cration de chaque gne sinscrit dans le processus duplication transposition mutation.

1) la complexification du gnome au cours de lvolution En fonction des mutations subies diffrentes volutions sont possibles : - la divergence des copies est faibles : les gnes homologues conservent une fonction identiques celle du gne ancestral mais ne vont pas sexprimer dans les mme organes ou au mme moment de la vie. Ex = famille multignique des globines humaine (puisque il y a des globine pour le foetus et pour quand on est hors du ventre) : outre le gne de myoglobine les globines comportent 6 gne codant pour 6 globines : (alpha), (bta), (gamma), (delta ), (epsilon), (zeta), rpartis sur les chromosomes 11 et 16. En mesurant les diffrences entre les squences les gnticiens ont labors la matrice des distances et construit larbre de filiation o sont positionn les duplications successives (au noeud) qui ont pu tre dats grce aux donn biologiques et palontologiques. Il en rsulte que le gne ancestral, devant tre prsent chez les vertbrs les plus anciens, est celui de la myoglobine et quil a subit 5 processus duplication-transpositionmutation (d-t-m) formant la famille multignique connue. Une duplication sera dautant plus rcente que les deux gnes qui en rsultent seront semblables.