UNIVERSITE IBNOU ZOHR ANNEE UNIVERSITAIRE 012-013

FACULTE DES SCIENCES Durée : 1h 30

DEPARTEMENT DE BIOLOGIE
AGADIR

Contrôle Génétique quantitative

SV5

Question 1 :
On a mesuré le gain moyen quotidien (GMQ) chez dix lapins adultes mâles :
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
GMQ 500 530 560 510 620 560 540 610 600 580

a) Calculer la différentielle de sélection, l’intensité de sélection et la réponse à la sélection si

on sélectionne les 4 meilleurs individus sachant que (h2 = 0.40).
b) Calculer l’héritabilité et la réponse à la sélection si on dispose des valeurs des GMQ de 5
descendants (demi frères) de chaque individu.

Question 2 :
Considérons un caractère quantitatif contrôlé par deux gènes à deux allèles chacun. Les
valeurs génotypiques sont données dans le tableau ci-dessous. La population est supposée en
équilibre gamétique et les fréquences de l’allèle A et de l’allèle B sont égales respectivement
à 0.4 et à 0.8. Calculer les composantes de la variance génotypique.

AABB AABb AAbb AaBB AaBb Aabb aaBB aaBb aabb

gi 50 45 30 50 40 28 25 25 20

Question 3 :
On a recensé le nombre d’individus mâles et femelles chez une population d’otarie australe au
large du Pérou avant et après passage d’une tempête tropicale (El Nino).

Avant tempête Après tempête

Mâles 35 10
Femelles 420 125

a) Calculer l’effectif génétique efficace après la tempête et l’effectif génétique efficace global
de cette population. b) Calculer le coefficient de consanguinité et le pourcentage de perte de la
variabilité génétique à 6ème génération après la tempête.
Question 1 :
n

∑x
i =1
i
5610
a) x P = == 561
n 10
620 + 610 + 600 + 580
xS = = 602.5
4
Calcul de la différentielle de sélection (différence entre la moyenne des individus sélectionnés
et la moyenne tous les individus).
S = xS - x P = 41.5
L’intensité de sélection avec la proportion des individus sélectionnés (p = 0.4) :
φ (u1− p ) φ (u 0.6 )
i = =
p 0.4
1 −( 0.262 / 2)
Avec u 0.6 = 0.26 ⇒ φ (0.26) = e = 0.39894 x 0.96676 = 0.38568
2π
0.38568
i= = 0.964
0 .4
La réponse à la sélection est donc égale à :
R = h2 S = 0.40 x 41.5 = 16.6
b) Calculer l’héritabilité et la réponse à la sélection avec 5 descendants (demi frères).
2n 10
hn2 = h2 = 0.4 = 0.71
4 + (n − 1)h 2
4 + 1 .6

4n 20
Rn = 0.5 R = 0.5 16.6 = 8.3 x 1.89 = 15.68
4 + (n − 1)h 2 4 + 1.6

Question 2 :

AA Aa aa
BB 50 50 25
Bb 45 40 25
bb 30 28 20

Avec Pr(A) =0.4 et Pr(B) = 0.8

AA Aa aa
BB 0.1024 0.3072 0.2304 0.64
Bb 0.0512 0.1536 0.1152 0.32
bb 0.0064 0.0192 0.0144 0.04
0.16 0.48 0.36 1
génotype gi fi fi x gi fi (gi)2
AABB 50 0.1024 5.12 256
AABb 45 0.0512 2.304 103.68
AAbb 30 0.0064 0.192 5.76
AaBB 50 0.3072 15.36 768
AaBb 40 0.1536 6.144 245.76
Aabb 28 0.0192 0.5376 15.0528
aaBB 25 0.2304 5.76 144
aaBb 25 0.1152 2.88 72
aabb 20 0.0144 0.288 5.76
1 38.5856 1616.0128

On obtient alors :
mG = ∑ f i g i = 38.59

∑ f i g i2 = 1616.013

VG = ∑fg i
2
i − mG2 = 1616.0128 – (38.5856)2 = = 127.165

Calculer les composantes de la variance génotypique avec interaction épistatique :

Interaction (AxB)

60
50
40 BB
30 Bb
20 bb
10
0
AA Aa aa

Calcul des valeurs génotypiques moyennes :

Pour le locus A et le génotype AA :
f1 g1 + f 2 g 2 + f 3 g 3 0.1024 x50 + 0.0512 x 45 + 0.00064 x30
g AA = = = 47.6
f1 + f 2 + f 3 0.16
Les valeurs génotypiques moyennes sont données dans le tableau suivant :
g AA 47.6 g BB 41
g Aa 45.92 g Bb 35.4
g aa 24.8 g bb 25.44

Calcul des variances génétiques additives et les variances des dominances :

( g AA + g aa ) / 2 = (47.6 +24.8) / 2 = 36.2
aA = 47.6 – 36.2 = 11.4
dA = 45.92 – 36.2 = 9.72
( g BB + g bb ) / 2 = (41 + 25.44) / 2 = 33.22
aB = 41 – 33.22 = 7.78
dB = 35.4 – 33.22 = 2.18
V A1 = 2 x0.4 x0.6 [11.4 + (0.6 − 0.4) x9.72] = 85.46
2

V D1 = [2 x0.4 x0.6 x9.72] = 21.77

2

V A2 = 2 x0.8 x0.2 [7.78 + (0.2 − 0.8) x 2.18] = 13.40

2

V D2 = [2 x0.8 x0.2 x 2.18] = 0.49

2

La variance due à l’interaction est alors égale à :

VAxB = VG – ( V A1 + V D1 + V A2 + V D2 ) = 127.165 – (98.86 + 22.26) = 6.05
Question 3 :

L’effectif génétique efficace après la tempête :

4( N m N f ) 4(10 x125)
Ne = = = 37
Nm + N f 135

L’effectif génétique efficace avant la tempête :

4(35 x 420)
Ne = = 129
455

L’effectif génétique efficace global :

t 2 2 2
Ne = = = = = 57.64 ≈ 58
t
1 1 1 0 . 027 + 0 . 00775 0.0347
∑N
i =1
+
37 129
i
Le coefficient de consanguinité après 6 générations après la tempête :
6 6 6
 1   1   1 
F(6) = 1 - 1 −  = 1 - 1 −  =1- 1 −  = 1 – (1 – 0.0135)6 =
 2Ne   2 x37   74 

1 – 0.9217 = 0.0783
Le pourcentage de perte de la variabilité génétique à 6ème génération après la tempête :

t
Ht  1  H t H 6
= 1 −  d’où : Ln t = - = Ln 6 = - = - 0.081
H0  2N e  H0 2N e H0 2 x37

H6
= e −0.081 = 0.92 ⇒ le pourcentage de perte est 8 % .
H0