Les mammifères de

Rhône-Alpes
Traces et indices de présence
Les fèces
Atlas des mammifères sauvages de Rhône-Alpes

Christophe Gilles / FRAPNA / 2018

 Préambule
De l’intérêt de la recherche et de l’étude des fèces…

Intérêts pour le naturaliste

- détecter la présence de l’espèce

- appréhender le territoire (fèces souvent utilisés pour le marquage territorial des
carnivores)
- connaitre le régime alimentaire (restes non assimilés dans les excréments)
- mieux connaitre le rythme d’activité, quotidien et saisonnier (marquage fluctuant dans
le temps)
- identifier l’individu (analyse génétique des cellules anales, des poils ingérés lors de la
toilette ou déposés lors de l’expulsion de l’excrément)
Ou chercher ?

- lieu de gagnage (ou de chasse)

- coulées de déplacement
- chemins, lisières, berges des cours d’eau et des plans d’eau
- bornes territoriales (blocs, souches)
- près des restes de proies (pour les carnivores)
Quoi regarder ?

- la forme générale
- la taille (L : longueur et l : largeur)
- le contenu (végétaux, poils, os, débris d’insectes,…)
- le lieu du dépôt (milieu, coulée, borne territoriale,…)
Précaution à prendre

- ne pas toucher les mains nues (risques de maladies)

- ne pas sentir (même si parfois bon critère d’identification, mais risque de parasitisme)
- si prise de photo, utiliser une réglette ou un objet usuel (stylo, clés, cache d’appareil
photos) pour l’échelle
- si prélèvement, bien noter la date, le lieu, le milieu, la présence d’autres indices à
proximité…et mettre rapidement au congélateur

Précision concernant les données de répartition des espèces présentées dans ce document

L’état de présence en Rhône-Alpes est donné à titre indicatif. Il a été évalué à partir des
cartes de distribution de l’état des connaissances pour l’atlas des mammifères de
Rhône-Alpes, période 2005-2017, et autres sources documentaires (cartographie
Carmen ONCFS, notamment)

Traces et indices de présence : les fèces © Christophe Gilles / FRAPNA

Les fèces : laissées, épreintes, crottes, moquettes
et fumées

Les « grains de riz », « tic-tac » et « noyaux d’olive » = crottes de

mulots, souris, musaraignes, campagnols, rats, rat musqué, loir, lérot
et muscardin
Souris domestique Mus musculus
Mulot sylvestre Apodemus sylvaticus
Mulot à gorge jaune Apodemus flavicollis
L : 4 à 5 mm
l : 2 mm
Aspect : crottes cylindriques avec bouts arrondis, vertes
l’été, brunes le reste de l’année
Contenu : végétaux
Milieux : boisements, parcs, jardins, habitations
Crédit photo © Christophe Gilles
Présence des espèces en Rhône-Alpes : commune à très
commune, selon les espèces
Crédit photo © Christophe Gilles

Rats gris Rattus norvegicus, Rat noir Rattus Musaraignes

rattus
L : 1,5 à 2 cm (rat gris) et 1 à 1,2 cm (rat noir)
l : 5 à 6 mm (rat gris) et 2 à 3 mm (rat noir)
Aspect : crottes brunes à noires, en forme de petite
banane pour le rat noir. Un bout pointu, l’autre arrondi
et aspect général grossier et irrégulier. Ressemblent à
un noyau d’olive.
Contenu : divers
L : 2 à 4 mm
l : 1 à 2 mm
Aspect : crottes foncées, en général pointues à un
bout et arrondies à l’autre bout
Contenu : restes d’insectes
Milieux : haies, boisements, jardins, parcs, sous les
pierres et les feuilles…au hasard des déplacements

Milieux : très variés (y compris habitations) et plutôt
humides pour le rat gris, milieux diversifiés mais plus
secs pour le rat noir (y compris habitations)
Présence des espèces en Rhône-Alpes : très commune
dans tout Rhône-Alpes pour le rat gris, rare et
ponctuelle sur l’ensemble des départements pour le rat
noir
Crédit photo © Christophe Gilles
Présence des espèces en Rhône-Alpes : variable
selon les espèces. Pachyure étrusque en Drôme et
Ardèche, musaraigne alpine en Savoie, Haute-
Savoie, Isère et Ain.
Campagnols
Petits campagnols (des champs, agreste, roussâtre,…)
L : 5 mm et l : 2 à 3 mm
Gros campagnols (campagnols « terrestres »)
L : 1 cm et l : 4 mm
Aspect : crottes assez régulières, cylindriques avec bouts
arrondis, vertes l’été, brunes le reste de l’année
Contenu : végétaux
Milieux : variables selon l’espèce
Présence des espèces en Rhône-Alpes : variable selon les
espèces. Campagnol de Scherman (rat taupier) présent dans
l’ensemble des départements, mais plus rare en Drôme et
Ardèche, campagnol des neiges présent dans les départements
alpins et en Ardèche. Campagnol provençal au sud de la région
(Drôme, Ardèche, sud Isère)

Traces et indices de présence : les fèces © Christophe Gilles / FRAPNA

 Campagnol amphibie Arvicola sapidus
L : 1 à 1,5 cm
l : 5 mm
Aspect : crottes à bouts arrondis, régulières et aspect gras,
souvent déposées en tas, de couleur verte
Contenu : restes de végétaux fins
Milieux : plans d’eau, cours d’eau, fossés avec berge meuble
et végétation herbacée rivulaire
Présence de l’espèce en Rhône-Alpes : présent
principalement à l’ouest de Rhône-Alpes, absent des
départements savoyards. Crédit photo © Christophe Gilles

Crédit photo © Christophe Gilles

Rat musqué Ondatra zibethicus
L : 1 à 1,5 cm
l : 5 mm Crédit photo © Christophe G

Aspect : crottes à bouts arrondis, régulières et

aspect gras, souvent déposées en tas
Contenu : restes de végétaux fins
Milieux : plans d’eau
Présence de l’espèce en Rhône-Alpes : espèce
introduite, principalement présente dans les
départements de la Loire, du Rhône, de l’Ain, de
Crédit photo © Christophe Gilles
l’Isère. Plus rare et localisé en Drôme, Ardèche,
Savoie et Haute-Savoie.

Loir gris Glis glis

Lérot Eliomys quercinus
Muscardin Muscardinus avellanarius
L : 8 à 10 mm
l : 5 mm (loir) et 3 à 4 mm (lérot) L : 7 mm
l : 1 mm
Aspect : crottes noires
Aspect : crottes noires
Contenu : principalement graines, fruits
Contenu : principalement fruits
Milieux : boisements, vergers, parcs, jardins, bocage,
habitations Milieux : boisements, parcs, jardins, bocage,
roselières
Présence des espèces en Rhône-Alpes : Loir gris
présent dans tous les départements, mais plus rare Présence de l’espèce en Rhône-Alpes : Muscardin
dans le Rhône et la Loire. Lérot présent dans présent dans l’ensemble des départements, mais
l’ensemble des départements, mais plus rares dans plus rare en Ardèche et Savoie.
les départements savoyards.

Les « cornichons » = crottes de ragondin

Ragondin Myocastor coypus
L : 3 à 5 cm
l : 1 cm
Aspect : cornichon avec fins sillons parallèles
Contenu : végétaux fins
Milieux : berges des plans d’eau et des cours d’eau.

Présence en Rhône-Alpes : bien présent dans les

départements de la Loire, du Rhône, de l’Ain, de l’Isère.
Présence moindre en Drôme et Ardèche. Colonisation des
franges occidentales des deux départements savoyards.
Crédit photo © Christophe Gilles

Traces et indices de présence : les fèces © Christophe Gilles / FRAPNA

Crédit photo © Christophe

Les « grosses boules de végétaux » = crottes de castor

Castor d’Europe Castor fiber

L : 2 à 4 cm
l : 2 à 3 cm
Aspect : grosse boule brune avec souvent un bout
effilé
Contenu : végétaux grossiers (type boule de sciure)
Milieux : plans d’eau et cours d’eau
Présence de l’espèce en Rhône-Alpes : espèce
présente dans tous les départements rhônalpins.

A savoir : le castor fait parfois ses crottes dans l’eau et celles-ci

sont alors entrainées sur les rives
Crédit photo © Christophe Gilles

Crédit photo © Christophe Gilles

Les « saucisses ou cigares » et les « boudins »= canidés, félidés,

sanglier

Loup gris Canis lupus

L : 8 à 10 cm
l : 2 à 3 cm
Aspect : laissées consistantes, cylindriques, en
plusieurs morceaux, avec une extrémité étirée en
pointe. Forte odeur musquée.
Contenu : principalement poils, parfois esquilles
d’os
Milieux : boisements
Présence en Rhône-Alpes : principalement en
Savoie, Isère et Drôme, plus rare en Haute-Savoie
et Ardèche. Données ponctuelles dans l’Ain.
Crédit photo © Christophe Gilles

Renard roux Vulpes vulpes

L : 5 à 10 cm
l : 2 à 2,5 cm
Aspect : laissées arrondies à un bout, effilées par
la présence de poils à l’autre bout. Odeur
nauséabonde.
Contenu : variable, principalement poils et petits
os, nombreuses baies en été et en automne
Milieux : diversifiés (boisements, prairies, parcs,…)
Présence en Rhône-Alpes : espèce très commune,
dans tous les départements.
Crédit photo © Christophe Gilles
A savoir : le renard utilise fréquemment des bornes territoriales
(souche, bloc) pour déposer ses laissées

Traces et indices de présence : les fèces © Christophe Gilles / FRAPNA

Chien viverrin Nyctereutes procyonoides Chacal doré Canis aureus
L : 5 à 8 cm L : 6 à 12 cm
l : 1 cm l : 2 cm
Aspect : parfois torsadées Aspect : grosse crotte de renard
Contenu : très varié (poils de campagnols, plumes, Contenu : très varié (poils, petits os, plumes,…)
végétaux,…)
Milieux : très diversifiés, comparables à ceux du renard
Milieux : assez diversifiés, mais nette préférence pour
les forêts mixtes de basse altitude avec plans d’eau Présence en Rhône-Alpes : en tout début de
colonisation via la Suisse. Uniquement détecté en
Présence en Rhône-Alpes : peu connue, probablement Haute-Savoie (Chablais) pour le moment.
très rare et ponctuelle. Quelques rares données en
Savoie, Isère, Rhône, Drôme, Ain et Ardèche.

Chat forestier Felis silvestris

L : 6 à 20 cm
l : 1,8 à 3 cm
Aspect : grandes laissées noires en plusieurs morceaux
(2 à 8) s’emboitant. Odeur pestilentielle. Diamètre :
pièce d’un euro.
Contenu : poils, os, parfois plumes
Milieux : boisements et prairies à proximité
Présence en Rhône-Alpes : principalement dans l’Ain,
dans les départements de la Loire et du Rhône, à Crédit photo © Christophe Gilles
l’ouest de la Savoie et de la Haute-Savoie, au nord de
A savoir : le chat forestier recouvre parfois ses laissées avec de la terre
l’Isère, de la Drôme et de l’Ardèche. En cours de ou des feuilles mortes
colonisation vers l’est et le sud de Rhône-Alpes. Crédit photo © Christophe Gilles

Lynx boréal Lynx lynx

L : 4 à 10 cm
l : 2 à 3 cm
Aspect : laissées plutôt cylindriques, arrondies aux
extrémités, même si parfois un bout légèrement effilé.
Laissées en plusieurs éléments. Diamètre : pièce de 2
euros.
Contenu : principalement poils d’ongulés, parfois os
Milieux : forêts
Présence en Rhône-Alpes : principalement dans Ain, mais
Crédit photophoto
Crédit © Christophe Gilles
© Christophe Gilles
aussi en Haute-Savoie, Savoie et Isère. Absent ou très
ponctuel ailleurs.
A savoir : Les fèces de lynx peuvent être confondues avec celles du chat
forestier ou du renard

Sanglier Sus scrofa

L : 7 à 9 cm
l : 6 à 8 cm
Aspect : boudin en forme approximative de tonneau
ou de cône de pin, composé de plusieurs morceaux
aplatis et agglomérés. Surface irrégulière.
Contenu : principalement végétaux, mais aussi
insectes, poils…
Milieux : boisements, cultures, prairies
Présence en Rhône-Alpes : espèce très commune
dans tous les départements, en plaine et en
montagne, jusqu’à 2000 m (voire plus) Crédit photo © Christophe Gilles

Traces et indices de présence : les fèces © Christophe Gilles / FRAPNA

Les « torsades ou bouts de ficelles » : les mustélidés (hors loutre et
blaireau)
Hermine Mustela erminea
Belette d’Europe Mustela nivalis
L : 3 à 5 cm
l : 6 à 9 mm
Aspect : laissées très torsadées et foncées, déposées sur
bornes territoriales, principalement sur substrat minéral
Contenu : principalement poils, parfois petits os, plumes,
baies
Milieux : très variés (agricoles, périurbains, prairies, chemins,
lisières, zones humides)
Crédit photo © Christophe Gilles
Présence en Rhône-Alpes : hermine commune, présente dans
tous les départements, bien que plus rare en Drôme et
Ardèche. Belette probablement commune, présente dans tous
les départements. Crédit photo © Christophe Gilles

Crédit photo © Christophe Gilles

Crédit photo © Christophe
Gilles
Martre des pins Martes martes
Fouine Martes foina
L : 6 à 10 cm
l : 1 à 1,5 cm
Aspect : laissées foncées, au diamètre souvent
décroissant, souvent torsadées et vrillées, parfois repliées
sur elle même
Contenu : poils, os, nombreuses baies en été et en
automne
Milieux : zones urbanisées (y compris dans les
habitations), prairies, bois de feuillus pour la fouine.
Boisement avec résineux pour la martre.
Présence des espèces en Rhône-Alpes : martre assez
commune, présente dans tous les départements. Fouine Crédit photo © Christophe Gilles
très commune, présente dans tous les départements.

A savoir : les laissées de la martre ont une odeur musquée, celles de

la fouine ont une odeur très repoussante Crédit photo © Christophe Gilles

Putois d’Europe Mustela putorius

Vison d’Amérique Neovison vison
L : 5 à 8 cm
l : 0,9 à 1,1 cm
Aspect : laissées foncées, longues et fines, quelquefois
torsadées. Parfois laissées molles et coulantes si
consommation de poissons ou d’amphibiens. Odeur très
forte et désagréable des laissées de putois.
Contenu : poils, os, arrêtes de poissons
Milieux : aquatiques, déposés sur blocs ou souches dans les
cours d’eau.
Présence des espèces en Rhône-Alpes : putois
principalement dans les départements du nord (Loire,
Rhône, Ain), présence plus rare et ponctuelle dans les
Crédit photo © Christophe Gilles départements du sud et dans les départements alpins.
Vison d’Amérique avec présence ponctuelle et localisée
dans les départements de la Loire, du Rhône, de l’Ain, de
l’Isère.

Traces et indices de présence : les fèces © Christophe Gilles / FRAPNA

Les « fers à cheval » : la genette commune Genetta genetta
L : 9 à 20 cm
l : 1,5 à 2 cm
Aspect : laissées noires quand fraiches, souvent en
fer cheval, longues et fines, non vrillées, surface
régulière sur laquelle on peut déceler le contenu
de l’excrément. Odeur non pestilentielle.
Contenu : principalement poils, mais aussi parfois
os, plumes et herbe
Milieux : boisements bien exposés, zones
rocailleuses, bocage
Présence en Rhône-Alpes : principalement en
Drôme et Ardèche, présence localisée dans la
Loire, le Rhône et l’Isère, absence ou présence très Crédit photo © JH Leprince
ponctuelle dans les autres départements. A savoir : la genette dépose souvent ses fèces dans des crottiers (troncs,
Probablement en cours de colonisation. rochers)

Les « petites crottes agrégées »

Bouquetin des Alpes Capra ibex

L : 1 à 1,5 cm
l : 1 à 1,5 cm
Aspect : agrégat de petites crottes rondes ou
ovales d’environ 1,5 cm
Contenu : végétaux
Milieux : secteurs rocheux
Présence en Rhône-Alpes : Haute-Savoie,
Savoie, Isère et Drôme

Crédit photo © Christophe Gilles

Chamois Rupicapra rupicapra

L : 0,9 1,3 cm
l : 0,9 à 1,3 cm
Aspect : agrégat de petites crottes partiellement
Crédit photo © Christophe Gilles
aplaties ou amas de crottes hétérogènes
dissociées
Contenu : végétaux
Milieux : prairies, lisières, boisements (y compris à
basse altitude), pierriers
Présence en Rhône-Alpes : commune dans les
départements de l’est (Haute-Savoie, Savoie, Isère,
Drôme) présence ponctuelle et localisée dans les
autres départements
Crédit photo © Christophe Gilles

Milieux :
Présence de l’espèce en Haute-Savoie : introduite
et localisés sur Bauges, Tournette, Aravis,Mont de
Traces et indices de présence : les fèces © Christophe Gilles / FRAPNA
grange, les hauts forts, cornette de bise et Roc
d’enfer
 Mouflon méditerranéen Ovis. g.
musimon x Ovis sp
L : 1,3 cm
l : 1 cm
Aspect : crottes anguleuses
Contenu : végétaux
Milieux : plutôt ouverts et escarpés,
principalement en altitude moyenne
Présence en Rhône-Alpes : espèce
méditerranéenne introduite et localisée,
principalement en Haute-Savoie, Savoie, Isère
et Drôme
Crédit photo © Christophe Gilles

Les « petites crottes plus ou moins rondes » : Léporidés, Cervidés,

Sciuridés
Lièvre d’Europe Lepus europaeus
Lièvre variable Lepus timidus
Diamètre : 1,5 à 2 cm
Contenu : végétaux grossiers
Milieux : cultures, espaces ouverts, forêts. Jusqu’à 2000 m
pour le lièvre d’Europe et à partir de 1500 m pour le lièvre
variable. Crottes souvent en petits tas disséminés.
Présence en Rhône-Alpes : lièvre d’Europe présent dans
l’ensemble des départements, lièvre variable
essentiellement dans les départements alpins.

Lapin de Garenne Oryctolagus cuniculus

Crédit photo © Christophe Gilles
A savoir : Les lagomorphes pratiquent la caecotrophie, à savoir une
ingestion de leurs crottes afin d’en tirer le plus de nutriments possibles
Cerf élaphe Cervus elaphus
Diamètre : 0,7 à 1 cm
Contenu : végétaux
Aspect : crottes plus ou moins rondes, brunes à noires,
souvent regroupées en tas denses sur des emplacements
élevés
Milieux : variés (forêts, espaces ouverts), avec substrat
sableux
Présence en Rhône-Alpes : présent dans l’ensemble des
départements, plus rare en Haute-Savoie et Savoie.

L : 2 à 2,5 cm
l : 1,3 à 1,8 cm
Contenu : végétaux
Aspect : un bout légèrement pointu et l’autre arrondi,
voire avec une légère dépression. L’été, les crottes
peuvent être agrégées entre elles.
Milieux : grandes forêts, prairies à proximité
Présence en Rhône-Alpes : espèce commune dans les
départements de l’est (Haute-Savoie, Savoie, Isère,
Drôme), rare ou plus localisée dans les départements
de l’ouest

A savoir : les crottes du cerf s’appellent les fumées Crédit photo © Christophe Gilles

Traces et indices de présence : les fèces © Christophe Gilles / FRAPNA


Crédit photo © Christophe Gilles
Crédit photo © Christophe Gilles
Marmotte des Alpes Marmotta marmotta
Diamètre : 1 cm
Contenu : végétaux
Aspect : crottes lisses et régulières
Milieux : pelouses et prairies d’altitude. Crottes
déposées au sein du domaine familial.
Présence en Rhône-Alpes : espèce assez commune
dans les départements alpins, présence aussi dans le
sud du département de la Loire et à l’ouest du
département de l’Ardèche
Traces et indices de présence : les fèces
Chevreuil européen Capreolus capreolus
L : 1 à 1,4 cm
l : 0,7 à 1 cm
Contenu : végétaux
Aspect : Crottes avec un bout légèrement pointu et
l’autre arrondi. Souvent en tas (sur les lieux de
gagnage), parfois disséminés (lors des déplacements).
Parfois agglomérées entre elles.
Milieux : boisements, prairies, cultures
Présence en Rhône-Alpes : espèce très commune
dans l’ensemble des départements
A savoir : les crottes du chevreuil s’appellent les moquettes
Daim Dama dama
L : 1,5 cm
l : 0,8 à 1 cm
Contenu : végétaux
Aspect : crottes allongées, lisses et régulières, assez
semblables aux moquettes de chevreuil
Milieux : forêts
Présence en Rhône-Alpes : espèce introduite,
présence ponctuelle, principalement en Isère,
Rhône et Loire
Ecureuil roux Sciurius vulgaris
Diamètre : 1 cm
Contenu : végétaux grossiers, rarement insectes
Aspect : crottes globuleuses et assez irrégulières
dû aux débris végétaux visibles en surface
Milieux : boisements (avec résineux), parcs,
jardins. Crottes difficiles à trouver.
Présence en Rhône-Alpes : espèce assez
commune, présente dans tous les départements.
© Christophe Gilles / FRAPNA
Les cas particuliers
La Loutre Lutra lutra et ses
épreintes

L : 3 à 5 cm
l : 1 à 1,5 cm
Aspect: fèces noires, gluantes et goudronneuses
quand fraiches, grises et friables avec le temps.
Contenu : écailles, ossements de poissons ou
d’amphibiens, chitines d’écrevisses
Milieux : aquatiques, principalement sur blocs et Crédit photo © Christophe Gilles
souches surélevés, mais aussi sur les berges et sous
les ponts

Présence en Rhône-Alpes : essentiellement dans les

départements de la Loire, de l’Ardèche, de la
Drôme. Présence plus rare et localisée dans les
autres départements.

A savoir : l’excrément de la Loutre s’appelle l’épreinte

A retenir: odeur caractéristique d’huile de lin, de poisson séché, voire de miel Crédit photo © Christophe Gilles

Le Blaireau Meles meles et ses toilettes

L : 5 à 8 cm
l : 1,5 à 3 cm
Allure : laissées souvent en épais boudins
cylindriques, parfois molles (style bouse de vache)
Contenu : chitine d’insectes (été), hyménoptères,
graines, baies (été et automne), parfois poils et
petits os (hiver)
Milieux : boisements (souvent de pente), bocage,
prairies
Présence en Rhône-Alpes : espèce commune, dans
tous les départements.

Crédit photo © Christophe Gilles

Crédit photo © Christophe Gilles

Crédit photo © Christophe Gilles

A savoir : les laissées sont déposées dans des petits pots concentrées
Crédit photo © Christophe Gilles dans des latrines

Traces et indices de présence : les fèces © Christophe Gilles / FRAPNA

Les « brillantes » du Hérisson Erinecaus europeaus

L : 3 à 4 cm
l : 8 à 10 mm
Aspect : excréments granuleux, noirs et très luisants
du fait des fragments de chitine d’insectes, se
désagrégeant facilement au toucher.
Contenu : principalement chitine d’insectes, parfois
baies en automne
Milieux : jardins, parcs, prairies, boisements,
chemins
Présence en Rhône-Alpes : espèce assez commune
dans l’ensemble des départements, mais très
probablement en régression
Crédit photo © Christophe Gilles

A savoir : les excréments sont déposés au hasard des déplacements,

sans volonté de marquage

Crédits photos : Christophe. Gilles (tous droits réservés). En dehors de ce document, utilisation des photos interdite sans autorisation de
l’auteur.

Avec le partenariat technique de la LPO AURA et le soutien financier de la DREAL Auvergne-Rhône-Alpes et du conseil Régional
Auvergne-Rhône-Alpes

Traces et indices de présence : les fèces © Christophe Gilles / FRAPNA