Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
ONT-ELLES
UNE MMOIRE ?
Michel Thellier
Remerciements
Un certain nombre de collgues, amis et parents mont gracieusement aid dans la prparation
de ce livre. Je tiens exprimer ma gratitude Anne Alexandre, Jean-Louis Bonnemain, MarieJos Costil, Claude Gillet, Janine Guespin, Chantal et Yannick Kerdudou, Philippe Lefranois,
Nolwenn Legrand, Herv Le Guyader, Ulrich Lttge, Victor Norris, Sandrine Pesnel, Jeanine
Rens, Camille Ripoll, Marie-Claire Verdus et Alain Vian dont laide ma t prcieuse tant sur
le fond que pour en adapter la forme un lectorat non scientifique et pour en amliorer
lillustration.
ditions Qu
RD 10
78026 Versailles Cedex
www.quae.com
ISBN : 978-2-7592-2326-8
ditions Qu, 2015
Le Code de la proprit intellectuelle interdit la photocopie usage collectif sans autorisation
des ayants droit. Le non-respect de cette disposition met en danger ldition, notamment
scientifique, et est sanctionn pnalement. Toute reproduction, mme partielle, du prsent
ouvrage est interdite sans autorisation du Centre franais dexploitation du droit de copie
(CFC), 20 rue des Grands-Augustins, Paris 6e.
ditions Qu
Sommaire
Remerciements 2
Prface 7
La plante et le souvenir 1 1
Il tait une fois 1 1
Lhistoire dune dcouverte 1 1
C hapitre 1
Premier portrait 1 3
La photosynthse: une capacit exceptionnelle 1 4
la base de lorganisme vgtal 1 5
C hapitre 2
ATTENTION, VGTALSENSIBLE! 1 9
C hapitre 3
LE MEMORANDUM DUNERECHERCHE 3 5
C hapitre 4
sommaire
C hapitre 5
C hapitre 6
C hapitre 7
C hapitre 8
VERS LA SYNTHSE 7 5
pilogue 8 3
A nnexe 1
A nnexe 2
LA MAGIE MOLCULAIRE 8 8
A nnexe 3
CONDENSATION ETDCONDENSATION
DU CALCIUM 9 8
Glossaire (aide-mmoire)
Bibliographie
1 0 1
1 0 9
Prface
Eh oui, les plantes ont de la mmoire! Le lecteur comprend videmment que la rponse
linterrogation du titre de Michel Thellier est positive. Les plantes ont-elles une mmoire?
Imaginons un titre analogue sappliquant aux animaux; on attendrait la mmoire animale,
ou la mmoire des animaux, mais certainement pas les animaux ont-ils une mmoire?,
une question que personne ne se pose, une vidence pour tout un chacun. Par l mme, on
peroit immdiatement lintrt de louvrage. Sa synthse des dcouvertes les plus rcentes
en physiologie vgtale sur la mmoire des plantes prouve linanit de lide reue, et les hypothses sur le rle de cette fonction dans lacclimatation des plantes aux contraintes de lenvironnement lvent les ultimes doutes. En replaant la mmoire dans un cadre volutif, lauteur
convainc quune nouvelle voie de recherche souvre en physiologie vgtale.
Quand on se penche sur la question, ce programme apparat, en ralit, comme une nouvelle
tape dune histoire dj longue, et pourtant si mal connue! En effet, qui dit mmoire dit
perception dun signal, cest--dire sensibilit. Mais comme cest trange de voir comment
la rflexion scientifique sur la sensibilit des plantes a t occulte, alors que bon nombre
de philosophes et botanistes sy sont intresss! trange de voir quon cite encore les ides
simplistes dAristote, pourtant rfutes immdiatement par son successeur! En effet, les
premiers biologistes se sont videmment penchs sur les diffrences entre animaux et
vgtaux. Ainsi, Aristote (384-322 av.J.-C.) considrait que, si chaque tre vivant avait une
me, suivant les cas, celle-ci pouvait prsenter des caractristiques fort diffrentes. Des
troisfonctions de lme humaine vgtative, sensitive et intellectuelle, celle des animaux
nen conservait que les deux premires, tandis que les vgtaux ne disposaient que dune
simple me vgtative, gouvernant gnration, alimentation et croissance. En dautres termes,
les plantes taient dpourvues de sensibilit, a fortiori de mmoire. Or cette vision simpliste
du monde vgtal a t immdiatement remise en cause par Thophraste (371-288 av.J.-C.),
qui sest intress au phototropisme des plantes.
Ds les prmices de la science moderne, de nombreuses discussions tournent autour du
mystre du vgtal. videmment, lpoque, il ny avait ni les techniques ni les concepts
pour approcher rationnellement le problme. Ainsi, au cours de la Renaissance, plusieurs
observations-cls sont rapportes mais, la plupart du temps, avec des interprtations errones. Giambattista Della Porta (1535-1615), plus connu pour ses recherches en optique,
William Gilbert (1544-1603), pre de llectricit moderne, se penchent sur la polarit des
plantes. En risquant une analogie ose avec le comportement des aimants, ils ouvrent la voie
la recherche dune explication matrialiste du mouvement des plantes. Le botaniste portugais Cristobal Acosta (1515-1594) sintresse au mouvement rapide des feuilles de la sensitive (Mimosa pudica) et aux mouvements circadiens de celles du tamarinier (Tamarindus indica)
qui senroulent le soir pour se drouler au matin. Francis Bacon (1561-1626) croit que de tels
mouvements sont le rsultat de simples actions mcaniques, et avance une analogie forte
entre vaisseaux et fibres des plantes et nerfs et vaisseaux sanguins des animaux. William
prface
la reproduction vgtale, plus particulirement celle des orchides et des Fabaces (appeles
alors Papilionaces), avec un accent sur les possibilits dhybridation et sur le rle essentiel des
insectes pollinisateurs (hymnoptres, lpidoptres).
partir des annes 1860, Darwin se passionne pour le mouvement et la sensibilit des plantes,
le cur de notre sujet. Deux ouvrages importants portent sur les plantes grimpantes (On the
Movements and Habits of Climbing Plants, 1865) et sur les plantes insectivores et les mouvements
de capture quelles prsentent (Insectivorous Plants, 1875). Il entrane ensuite son septime
enfant, Francis (1848-1925), dans une srie dobservations et dtudes sur le mouvement des
plantes, vu de manire plus largie. Ce sera la matire de son dernier ouvrage (The Power of
Movement in Plants, 1880). On ne sera pas tonn de trouver, dans louvrage de Michel Thellier,
les mmes espces cites comme exemples, comme la bryone et la dione. Ils sont tellement
spectaculaires!
Les plantes insectivores passionnent Darwin. Cest dabord un hobby, puis il regarde les choses
de plus prs. Ainsi, il montre quune drosra (Drosera rotundifolia) peut distinguer entre diffrents objets, et prsente, son grand dsarroi, un toucher dune sensibilit suprieure celui
de la peau humaine. La fermeture rapide de la feuille de la dione lamne spculer sur un
ventuel systme nerveux de la plante. Afin de tester cette ide, il rend visite, en 1873, John
Burdon-Sanderson (1828-1905) luniversit de Londres. Ce mdecin place des lectrodes sur
une feuille de dione, et, chaque fois quun poil a t touch, enregistre une onde lectrique
analogue au potentiel daction du neurone animal. Quelle belle exprience sur la sensibilit
des plantes! Et Darwin de la mettre en relation avec ladaptation de la plante une nutrition
bien particulire.
En 1871, St George Mivart (1827-1900), professeur Londres, critique sur plusieurs points De
lorigine des espces. Darwin sen meut, et y rpond dans les dernires ditions de son ouvrage
majeur. En particulier, Mivart nonce que la slection naturelle ne peut expliquer la manire
dont est apparue la sensibilit des plantes, en particulier celle des plantes grimpantes. En
rponse, Darwin postule que la circumnutation est universelle, que cest donc un caractre
ancestral qui se spcialise ensuite pour donner les divers autres types de mouvement. Cest,
entre autres, ce qui la amen sintresser au gravitropisme et au phototropisme. Une srie
dexpriences lui permet de postuler que la pointe de la racine est sensible la gravit et
dautres stimulus comme le toucher et la lumire, et quun signal est transmis vers la zone
de croissance, causant la courbure de la racine. Cette root cap hypothesis lentrane dans une
controverse avec Sachs, qui lui reprochait son amateurisme. Mais Darwin ne sarrte pas
l, et formule une root brain hypothesis. Dans les dernires pages de The Power of Movement in
Plants, on peut lire: Il nest gure exagr de dire que lextrmit de la radicule ainsi dote,
et ayant le pouvoir de diriger les mouvements des parties contigus, agit comme le cerveau
des animaux infrieurs.1 Il nest pas all jusqu proposer une mmoire, mais il nen tait pas
loin. Enfin, reprenons une srie dexpriences rappeles par Michel Thellier, celles portant sur
le phototropisme du coloptile. trange que lon prsente habituellement les expriences de
Peter Boysen Jensen (1883-1959) et de Frits Went (1903-1990), sans parler de celles, pionnires,
de Darwin! Cest quand mme lui qui, aid de son fils, montre que le signal lumineux est peru
par la pointe du coloptile, et quun signal migre dans les tissus sous-jacents.
1.It is hardly an exaggeration to say that the tip of the radicle thus endowed, and having the power of directing the movements
of the adjoining parts, acts like the brain of the lower animals.
Il est stupfiant de constater que, dans le monde universitaire anglo-saxon, les mouvements
des plantes se trouvaient inclus, jusquen 1935, dans les livres de psychologie compare! En
fait, cest le dveloppement de la physiologie vgtale qui a amen lautonomie de cette discipline, avec sa propre biochimie, sa propre hormonologie. Si parler de tropisme en psychologie
parat quand mme extravagant, une tentative de vision unitaire du vivant avait lavantage de
ne pas isoler monde animal et monde vgtal, au risque de provoquer ltonnement de tout
un chacun devant lexistence de la sensibilit des plantes!
Dans la majorit des cas, la sensibilit des plantes prsente comme consquence des mouvements irrversibles de croissance, que ce soit la circumnutation des plantes volubiles, ou les
tropismes de racine ou de tige. Darwin avait bien compris lintrt adaptatif de ces mouvements, et lavait replac dans un cadre volutif. En fait, louvrage de Michel Thellier permet
daller un pas plus loin. Il y a mmoire, mais, comme il lexplique sobrement, elle na rien voir
avec la mmoire animale telle que nous la connaissons. Simplement, si les mouvements rsultant de la sensibilit des plantes sont cruciaux pour la vie de la plante la racine vers le sol, la
tige vers la lumire, une mmoire va permettre une adaptation plus labore, plus intgre, quune simple rponse immdiate: si la mmoire contribue permettre un vgtal
dlaborer une rponse adapte aux conditions rgnant lendroit o il se trouve, cela peut,
lvidence, lui tre profitable.
nen pas douter, louvrage de Michel Thellier suscitera des travaux ultrieurs, qui, des biologies cellulaire et molculaire lcophysiologie, participeront la comprhension de la manire
dont les quelque 270000 espces recenses dAngiospermes ont colonis notre plante.
Herv Le Guyader
10
L a plante et le souvenir
Il tait une fois
Il tait une fois un jeune homme et une jeune femme qui saimaient. Comme ils se promenaient en fort, ils arrivrent prs dune fondrire. Les flancs en taient tapisss de myosotis dun bleu intense. La jeune femme sextasia sur la beaut des fleurs. Le jeune homme
entreprit de lui cueillir un bouquet, en saventurant sur le bord du gouffre. Il ne connaissait
pas les fondrires, ni le danger de la boue paisse quelles contenaient. Il perdit pied sur la
paroi humide, glissa jusquau bas du trou et commena de senfoncer. Dun ultime effort, il
lana les fleurs quil tenait en sa main vers la jeune femme en disant: Ne moubliez pas!
Puis il fut englouti pour toujours. On ne sait pas ce que devint la jeune femme, si elle ne vcut
plus que dans la mmoire de son amoureux disparu, ou si elle ne tarda pas se consoler
dans les bras dun nouvel amant. Mais le myosotis devint le symbole du souvenir et sappela
dsormais ne-moubliez-pas en France, forget-me-not en Angleterre, Vergissmeinnicht en
Allemagne, nomeolvides en Espagne, et ainsi de suite dans beaucoup dautres langues.
Mais hors de ce conte romantique, les plantes, plus encore que du symbole du souvenir,
pourraient-elles tre doues dune mmoire propre? Dans le public, les avis sont partags.
Certains sont persuads que les vgtaux ont une mmoire quasiment semblable la ntre,
que les plantes dappartement se souviennent de la tendresse ou de la ngligence avec
lesquelles elles ont t traites, et quelles ragissent en consquence. Il en est dautres pour
penser que, dans le monde vivant, la possession dune mmoire est rserve aux animaux,
tout particulirement aux humains, et que la mmoire des plantes ne saurait tre quun
oxymore. Et si la vrit se trouvait mi-chemin de ces deux opinions extrmes?
11
trouver dautres systmes exprimentaux qui nous permirent den tudier plus simplement
les principales proprits. Dans le mme temps, dautres groupes de chercheurs mettaient
en vidence, partir de systmes trs divers, dautres manifestations de mmoire vgtale.
Ainsi, il se fit peu peu un consensus sur cette ralit. Restait comprendre quoi cette
mmoire pouvait leur servir! Or, les plantes, incapables de se dplacer, doivent parvenir
faire le meilleur usage des stimulations qui leur sont favorables (comme la pluie, lclairement)
tout en rsistant de leur mieux aux plus dfavorables (choc thermique, choc de scheresse,
attaque par des phytophages, etc.) lendroit o elles se sont enracines. Tout laisse penser
que cette mmoire intervient dans leur acclimatation aux conditions de leur environnement.
Ce petit livre retrace lhistoire de cette tude de la mmoire vgtale telle que lauteur la
vcue. Bien que cette tude soit le fruit de travaux de laboratoire, ce texte ambitionne de ne
pas le faire comme le ferait une publication scientifique.
Les hommes et femmes de science sont des gens inhabituels. Professionnellement, ils
sont forms la planification et linterprtation dexpriences, ainsi qu un aller-retour
permanent entre exprimentation et rflexion. Ils ont dvelopp une terminologie, des
symboles et des formules plus ou moins mathmatises, qui leur permettent de sexprimer
entre eux avec concision et prcision, mais qui ne sont pas trs parlants pour les non-initis.
Ici, nous utiliserons autant que possible le langage naturel. Les expriences seront dcrites
de faon arrange et simplifie (avec des renvois bibliographiques aux articles scientifiques
originaux pour ceux qui sont friands dexactitude). Un glossaire, la fin de louvrage rappellera
la signification des termes les moins familiers.
Pour avancer dans ltude de la sensibilit et de la mmoire des plantes, nous allons tre
conduits parler de protines, gnes, ADN, ARNm, etc. Ces termes ne sont pas familiers
tout le monde. Ils impliquent des problmes de codage qui peuvent, premire vue, paratre
un peu abscons. Aussi, nous consacrerons lannexe1 une srie de jeux consistant coder et
dcrypter des messages secrets laide de gommettes de formes et de couleurs diffrentes.
Une fois laise dans ces jeux, les codages dont la vie se sert ne poseront plus de vritables
difficults; et lannexe2 fournira quelques donnes de biologie molculaire, lmentaires
mais suffisantes pour la comprhension du texte principal. Enfin lannexe3 introduira la
notion de condensation ionique, un phnomne souvent mal connu des biologistes et qui,
pourtant, peut jouer un rle clef de commutateur dans le fonctionnement des systmes
biologiques.
Bienvenue dans le monde des plantes, de leur sensibilit aux stimulations de lenvironnement,
et des mises en mmoire quinduisent ces stimulations.
12
C hapitre 1
cet ge, lhypocotyle, qui se chargera de rserves et deviendra la partie comestible du radis,
est dj lgrement teint de rose. Le bourgeon terminal est en croissance active et commence
former une tige et des feuilles. Les bourgeons cotyldonaires sont si petits quon ne les voit pas
sur la photo.
13
sagrandit par sa pointe. Les cotyldons, un peu en forme de cur chez le radis, sont les toutes
premires feuilles; ils prexistent dans la graine et slargissent et verdissent aprs la germination. Lhypocotyle est la partie de la tige comprise entre la racine et les cotyldons. Lapex est
un bourgeon en croissance active. laisselle de chacun des cotyldons, il y a un bourgeon (dit
cotyldonaire); les bourgeons cotyldonaires sont inactifs et si petits quil est difficile de les
distinguer lil nu.
Lapex va former la tige puis de vritables feuilles. Celles du radis rose sont quasi elliptiques et
indentes sur les bords; mais la forme des feuilles est extrmement variable dune espce
vgtale lautre. Leur disposition est galement variable selon les espces: sur une tige, elles
peuvent tre opposes (c.--d. se prsenter par paires o chacune est dispose en face de
lautre, symtriquement par rapport la tige) ou alternes (dcales les unes par rapport aux
autres tout au long de la tige). Les feuilles, y compris les cotyldons, comprennent le limbe (la
partie tale) et le ptiole, qui rattache le limbe la tige. Elles contiennent de la chlorophylle,
un pigment qui leur donne leur couleur verte et leur permet deffectuer la photosynthse2.
Dans le milieu o elle est implante (le sol, dans les conditions naturelles), la racine puise leau
et les sels minraux (nitrates, sulfates, phosphates et sels de potassium, calcium, magnsium,
oligolments, etc.) dont la plante a besoin pour son dveloppement. Labsorption de sels
minraux par la racine prend le nom de nutrition minrale.
14
verts; pour une part, ils utilisent cette alimentation former leur propre substance; pour une
autre part, ils tirent lnergie dont ils ont besoin de loxydation des aliments par loxygne quils
respirent (avec libration de gaz carbonique et deau). leur tour, les carnivores se nourrissent
des herbivores.
Les tres photosynthtiques sont les arbres des forts, les herbes des prairies, les algues deau
douce et de mer, et aussi, et peut-tre surtout, les algues microscopiques du phytoplancton.
Du point de vue du bilan, ces tres photosynthtiques contribuent nous dbarrasser du gaz
carbonique et librent loxygne dont nous avons besoin pour respirer. Ainsi, la vie animale
telle que nous la connaissons sur terre ne pourrait pas se perptuer si les vgtaux p hotosynthtiques nexistaient pas3.
Tant que lhumanit sest contente de consommer et brler de la matire vivante ou immdiatement tire de la matire vivante (bois mort, par exemple), il a pu stablir un tat quasi
stationnaire o la production de gaz carbonique et la consommation doxygne, rsultant
de lactivit des tres non-photosynthtiques, taient peu prs compenses par la production doxygne et la consommation de gaz carbonique rsultant de lactivit des tres photosynthtiques4. Mais lorsque les humains se mirent brler massivement les combustibles
fossiles (charbon, ptrole, gaz combustibles), cet tat quasi stationnaire se trouva rompu
et la concentration du gaz carbonique atmosphrique sest mise augmenter avec les
consquences climatiques que cela risque dentraner.
15
Les systmes conducteurs sont de deux types (dont lensemble forme les faisceaux libroligneux). Dune part, les vaisseaux du bois sont faits de cellules mortes qui sarrangent en vritables tubes aux parois paisses; ils vhiculent la sve brute, laquelle est principalement faite
deau et de sels minraux, depuis les racines (qui absorbent ces substances dans le milieu
extrieur) jusquaux parties ariennes; le moteur principal de lascension de la sve brute est
tout simplement lvaporation de leau au niveau des feuilles. Dautre part, les cellules dites
libriennes sont des cellules vivantes qui transportent la sve labore (sve qui sest enrichie
des substances organiques, spcialement des sucres, synthtiss dans les feuilles) depuis ces
dernires jusquau reste de la plante.
Par opposition aux tissus faits de cellules diffrencies dont il vient dtre question, les
mristmes sont des massifs de cellules embryonnaires (petites et non diffrencies). Dans
lapex (et ventuellement dans dautres bourgeons actifs chez les plantes adultes), ainsi qu la
pointe des racines, il existe des mristmes dont les cellules se divisent rapidement et assurent
la croissance en longueur des organes. Outre ces mristmes dits primaires, on trouve aussi
des mristmes secondaires qui assurent la croissance en paisseur des vgtaux.
Contrairement au cas des cellules animales, il arrive assez frquemment chez les vgtaux
que, sous des influences diverses (hormones, traumatismes, etc.), des cellules diffrencies,
appartenant un tissu adulte, se ddiffrencient et entrent en division, engendrant ainsi de
nouveaux mristmes. Cest, par exemple, ce que nous verrons se passer dans lpiderme de
lhypocotyle de jeunes plants de lin (p.51).
Les cellules vgtales (fig.1.2) sont des systmes compartiments o lon rencontre, de lextrieur vers lintrieur, la paroi, le cytoplasme et une ou plusieurs vacuoles. La paroi est qualifie de
pectocellulosique parce que principalement constitue de fibres de cellulose et dune sorte de
ciment form dun mlange de diverses espces chimiques dites substances pectiques. Le
16
17
C hapitre 2
ATTENTION,
VGTALSENSIBLE!
Une sensibilit cible
Lexistence dune mmoire ne se concevant que sil y a quelque chose mmoriser, il nous
faut commencer par examiner la sensibilit des plantes aux stimulations de lenvironnement.
Les animaux, et spcialement nous, les humains, sommes des tres sensibles. Tout le monde
est daccord l-dessus. Nous percevons des stimulus5 (visuels, sonores, tactiles, olfactifs, etc.)
laide de nos organes des sens, et nous traitons linformation correspondante grce nos
cellules nerveuses (ou neurones). En revanche, il est frquent dadmettre que les vgtaux
sont par nature inertes et insensibles. Ne dit-on pas de quelquun dont le cerveau a subi une
dtrioration irrversible quil est devenu un vritable lgume!
En fait, il y a des stimulus que les plantes peroivent et dautres quelles ne peroivent pas.
Quoi quen pensent certains, il ne semble pas que les plantes soient sensibles la musique
(Braam & Davis, 1990); mais elles ragissent des stimulus abiotiques tels que la dure relative du jour et de la nuit (ou photopriode), la gravitation, le vent, la pluie, un simple contact,
la scheresse, le froid, et mme les rayonnements lectromagntiques tels que ceux des
tlphones mobiles (cf. p.53-54). Elles ragissent aussi aux blessures (par exemple, infliges
par les animaux herbivores) ainsi quaux attaques par diverses pestes (champignons, bactries ou virus).
Les rponses terminales des plantes aux stimulus consistent le plus souvent en une modification du mtabolisme et/ou de la croissance et de la morphogense6. Il arrive quelles soient
accompagnes dun mouvement macroscopique (visible lil nu). Elles peuvent impliquer la
plante entire ou tre parfois locales (c.--d. naffecter que lorgane qui a peru la stimulation)
ou plus ou moins distantes de la zone stimule.
5. Il est courant dutiliser plutt stimuli comme pluriel de stimulus. Mais cela est illogique. Dune part,
si lon veut employer le latin, il faut satisfaire aux dclinaisons et lon devrait alors dire, par exemple, leffet des
stimulorum et non leffet des stimuli! Dautre part, il existe bien dautres mots en us (cursus, ftus, lapsus,
processus, etc.) qui ne scrivent pas en i au pluriel. Dans ce qui suit, nous considrerons donc stimulus
comme un mot invariable (ce qui dailleurs est permis par les dictionnaires).
6. Morphogense = acquisition de la forme.
19
FIGURE2.1
Pour certaines espces, la dure relative du jour et de la nuit joue un rle majeur sur la floraison
de la plante. On distingue alors des plantes de jours courts et des plantes de jours longs:
elles ont besoin, pour fleurir, quau cours de la journe la phase dobscurit soit suffisamment
longue ou suffisamment courte, respectivement (cf.encadr). La lampourde (Xanthium) est
un genre, appartenant la famille des Astraces (les anciennes Composes), maintenant
20
attention , vgtalsensible!
21
Il existe bien des espces de plantes que peu de gens reconnatraient sil leur arrivait den
voir, ventualit dautant moins probable que cette espce est peu commune.
Du temps o jtais assistant au laboratoire de Physiologie vgtale de la Sorbonne, mon
patron, le professeur et remarquable botaniste Pierre Chouard, emmena un t plusieurs de
ses collaborateurs, dont jtais, pour une excursion studieuse dans les Pyrnes. Non seulement il connaissait par leur nom toutes les plantes que nous rencontrions, y compris les
moins frquentes, mais il nous racontait leur volution, leur cologie, les traits particuliers de
leur physiologie et toute une quantit de dtails qui leur taient caractristiques. Un matin,
il nous conduisit vers un rocher, et nous demanda dexaminer ce qui poussait dessous. Nous
ny vmes quun fouillis de tiges, la plupart rampantes et quelques unes dresses, qui portaient des feuilles plus ou moins elliptiques laspect rugueux ainsi que de toutes petites
fleurs bleues a priori rien de bien extraordinaire. Il finit par nous apprendre que ctait l
lun des rares sites dans les Pyrnes o poussait spontanment lAsperugo procumbens,
plante remarquable par son caractre hmropriodique absolu. On entend par l quelle
ne peut monter fleurs quaprs avoir connu des journes o la priode dclairement est
suffisamment longue. Cest la raison pour laquelle on ne la trouve en fleurs dans la nature
que pendant quelques mois encadrant le solstice dt (disons de mai aot). Nous nous
contentmes de faire quelques photos, sans prlever le moindre chantillon, de faon ne
pas risquer de dtriorer le site.
Les protagonistes de cette aventure sont dj morts pour la plupart, ou trop vieux pour avoir
lide de repartir en montagne. Asperugo, sans doute, se trouve toujours sous son rocher, tel
un de ces trsors de pirate dont plus personne aujourdhui ne connat la cache.
22
attention , vgtalsensible!
FIGURE2. 2 Effet
(a) Une plante quon couche horizontalement (en sarrangeant pour que la racine ne se dessche
pas) roriente ses parties ariennes vers le haut et ses racines vers le bas. (b) Une plante installe
horizontalement et perpendiculairement au plan dune roue dispose verticalement, qui tourne
trs lentement (pour que la force centrifuge reste ngligeable) conserve son orientation; en effet,
au cours de la rotation de la roue, la gravit agit successivement dans toutes les directions, et son
effet rsultant est donc nul. (c) Si la roue tourne vite, leffet de la gravit reste ngligeable, mais la
plante roriente sa croissance, les racines poussant dans le sens de la force centrifuge et les parties
ariennes dans le sens oppos. (d) Si la plante est installe verticalement et perpendiculairement au
plan dune roue dispose horizontalement qui tourne vitesse moyenne, elle oriente sa croissance
selon la rsultante de la gravit et de la force centrifuge (les racines dans le sens de la gravit et de
la force centrifuge, et les parties ariennes dans le sens oppos).
Si prs, si loin
La bryone (Bryonia dioica) est une Cucurbitace dioque. Cest une plante grimpante aux
longues tiges grles qui saccrochent et senchevtrent aux buissons (fig.2.3). Elle est commune
dans les haies de nos rgions et porte des fruits, rouge vif maturit, de la taille de grains de
groseille, assez dcoratifs mais vnneux. La tige saccrot partir dun bourgeon terminal
formant des entre-nuds successifs, porteurs de feuilles alternes limbe plus ou moins
dcoup. Lentre-nud terminal, nouvellement form, sallonge rapidement pendant quun
nouvel entre-nud se forme puis sallonge, et ainsi de suite pendant toute la croissance de la
plante. Il est facile dobserver cette croissance en cultivant de jeunes pieds de bryone labri
de toute sollicitation par le vent, la pluie, un contact ou quelque autre stimulus. Ces plantes
vierges de toute stimulation sont dites plantes tmoin. Mais si lon stimule une jeune
bryone en caressant une dizaine de fois son entre-nud terminal au dbut de sa priode
23
dallongement (par exemple, laide dun pinceau daquarelliste), on constate quen fin de
croissance lentre-nud stimul est nettement plus court et plus pais que celui qui lui correspond sur les plantes tmoin et que son quipement en un groupe denzymes7 particulires,
appeles peroxydases, est galement modifi par rapport celui des tmoins (Boyer etal.,
1979). En revanche, la croissance des entre-nuds qui suivent lentre-nud stimul nest pas
sensiblement modifie, pas plus que lquipement en peroxydases des entre-nuds prcdents et suivants. Cest un exemple typique de rponse terminale locale: seul lentre-nud
stimul a son mtabolisme et sa croissance affects.
FIGURE2.3
Toutefois, comme a pu le mettre en vidence pour la premire fois, Roger Cautheret (1935),
qui fut par ailleurs le clbre crateur de la culture des tissus vgtaux, une rponse terminale
peut se produire galement distance de la zone stimule. Lexprience a consist disposer
une jeune plante (de bl, par exemple) de faon que sa racine repose sur une lame de verre
porteuse dun peu deau (pour viter son desschement) et observer ( laide dun microscope ou dune loupe binoculaire quips dun micromtre) le droulement dans le temps de
la croissance de la pointe de la racine. Pour cela, Gautheret mesurait et notait le temps mis par
cette pointe pour parcourir chacune des divisions successives du micromtre. un instant
donn, il pinait ou coupait la racine 1 cm de distance de la pointe, tout en continuant de
mesurer la vitesse de croissance de cette dernire. Il constatait que, peu aprs le stimulus de
pincement ou coupure, la vitesse de croissance de la pointe changeait brusquement. Ainsi,
ces stimulus provoquaient une modification de la croissance de la racine 1 cm de distance.
7. Une enzyme est une protine qui contrle une raction telle que la transformation dune substance en une
autre substance. Par exemple, les peroxydes tant des molcules particulirement oxydantes, les peroxydases
sont des enzymes qui contrlent loxydation de diverses substances par les peroxydes. Les enzymes sont
en gnral trs spcifiques. Cest--dire quelles ne contrlent quun seul type de raction sur un seul type de
substance. Cest ainsi quil existe plusieurs types de peroxydases, chacune contrlant loxydation par un peroxyde
dune substance particulire.
24
attention , vgtalsensible!
Depuis, bien dautres expriences ont confirm lexistence de rponses distance. Par
exemple, lorsqu'Eric Davies et Anne Schuster (1981) eurent inflig des excisions, abrasions ou
piqres de jeunes plants de pois, ils constatrent que ces derniers y rpondaient rapidement,
jusqu 15 cm de la zone lse, par la mise en place de systmes de biosynthse de protines8.
Ne-me-mangez-pas!
Un certain nombre de plantes rpondent lattaque dun herbivore (insecte, mollusque ou
mammifre) sur une ou quelques unes de leurs feuilles, par la biosynthse, dans tout leur
feuillage, de molcules (telles que des alcalodes, des tanins) toxiques pour ces prdateurs, ce
qui dcourage ceux-ci de continuer les consommer. Notons au passage quon a l un remarquable exemple dadaptation double bnfice: lherbivore peut se nourrir de la plante; mais
il ne peut pas le faire jusqu destruction complte de cette dernire (puisquelle devient de
plus en plus toxique, donc de plus en plus dissuasive, au fur et mesure quil la broute); rciproquement, cette plante peut faire lconomie de squiper de molcules de dfense tant
quaucun herbivore ne commence la mettre en danger.
Plus spectaculaire encore dans les rponses de dfense des vgtaux: certaines plantes attaques par un herbivore sen dfendraient en mettant des phromones9 qui attirent un parasite de leur agresseur. Les plantes auraient donc utilis bien avant nous la lutte biologique!
Il semble mme que certaines plantes soient capables davertir dautres plantes, situes
jusqu plusieurs dizaines de mtres, quun danger va les menacer! Lhistoire se passe dans le
FIGURE2.4 Kaligonum.
Cest un genre darbuste qui pousse sur le grand erg saharien. Cette plante possde un double
systme racinaire: une racine pivotante qui senfonce profondment dans le sol pour y trouver de
leau, et des racines superficielles qui rcuprent leau de condensation du matin.
25
FIGURE2.5
Ces petits troupeaux errent apparemment librement dans le dsert et menacent les rares vgtaux
qui parviennent y pousser.
dsert, lequel est loin dtre un milieu totalement dpourvu de vie comme on le croit parfois.
Quelques espces vgtales parviennent y pousser, jusque sur le grand erg saharien (fig.2.4).
Des animaux y vivent galement, souvent trs discrets. Mais on y rencontre aussi des hardes
dantilopes ou de petits groupes de dromadaires (fig.2.5) qui se nourrissent des herbes et de
rares buissons poussant et l. Quand les herbivores commencent brouter lun de ces buissons, on rapporte que non seulement celui-ci se met synthtiser des substances toxiques
mais quil se met aussi scrter des substances volatiles (telles que thylne, phromones)
dclenchant la biosynthse de toxiques par les buissons voisins avant mme que ceux-ci ne
soient attaqus. On trouve dans la littrature bien dautres histoires du mme genre. Certaines
ont t contestes. Mais des expriences de laboratoire, faites dans des conditions de fiabilit qui paraissent incontestables, autorisent penser quil existe vraiment des possibilits de
communication de plante plante par lintermdiaire de substances volatiles (Karban etal.,
2000; Karban & Baldwin, 1997).
26
attention , vgtalsensible!
mouche vient sy poser, les lobes se referment (emprisonnant ainsi linsecte dans la cage que
constituent leurs cils); leur surface interne scrte des enzymes qui hydrolysent les protines
de la proie en acides amins et oligopeptides (enchanements courts dacides amins); et ils
absorbent enfin ces composs azots par des mcanismes classiques dabsorption cellulaire.
Nous avons l un cas o un mouvement (fermeture des lobes) et une raction mtabolique
(scrtion denzymes digestives) constituent une rponse locale au stimulus de contact de
linsecte (cf. aussi encadr).
FIGURE2.6 Dione
La
Les piges de la dione sont spectaculaires, mais le dtail de leur fonctionnement (capture et
digestion) est encore plus stupfiant et vaut la peine quon en dise quelques mots.
Il y a deux niveaux de discrimination permettant que le pige ne capture que ce qui constitue
vritablement une proie pour la plante:
1. Trois poils lintrieur de chacun des deux lobes du pige jouent un rle de vritable gchette. La fermeture ne se dclenche que si deux poils sont touchs lun aprs
lautre, ou si lun des poils est touch deux fois de suite, et cela dans un dlai de quelques
dizaines de secondes. Il est peu probable que cela se produise lorsquun objet inerte (un
petit gravier, par exemple) est tomb par hasard dans le pige; en revanche, en sagitant,
un insecte vivant a toutes chances de raliser la double stimulation;
2. Le pige se referme en deux temps. Dabord les cils qui bordent le pige sentrecroisent, mais en laissant assez despace pour quune proie de toute petite taille parvienne senfuir; et cest seulement si la proie est assez grosse pour rester captive que le
pige se ferme compltement et que commence le processus de digestion.
Dans le cas o le pige sest referm sur quelque chose de peu intressant (objet inerte ou
petite proie qui sest enfuie), il rouvre dans les 24 heures sans poursuivre le processus complet.
Pourquoi une telle sophistication dans la discrimination ? Dune part, cest que la vie des
piges est limite trois captures/digestions en moyenne ; autant donc ne pas gaspiller
les piges les refermer sur nimporte quoi. Dautre part, la digestion se produit sur une
dizaine de jours en moyenne. Cest donc un processus long et coteux en nergie. Il serait
contre-productif de faire fonctionner pour rien tout ce processus
27
La sensitive (Mimosa pudica) est une plante herbace frquente ltat naturel dans les pays
tropicaux, et que lon parvient assez facilement cultiver sous nos latitudes. La tige, grle,
porte des feuilles alternes. Ces feuilles sont faites dun ptiole primaire qui se divise en quatre
ptioles secondaires, dont chacun porte une srie de folioles au bout de ptioles tertiaires
(fig. 2.7). Lorsque la plante est soumise une irritation, elle y rpond par des mouvements
foliaires. Lapplication dun lger stimulus, tel quun simple contact, provoque labaissement de
la foliole stimule et de quelques folioles voisines le long du ptiole secondaire qui les porte;
des stimulus de plus en plus vigoureux se traduisent par labaissement de toutes les folioles
de ce ptiole secondaire, puis par labaissement de ce ptiole secondaire lui-mme, par labaissement des quatre ptioles secondaires de la feuille et par labaissement du ptiole primaire
et de toute la feuille; enfin, les stimulus les plus traumatisants (par exemple, la brlure dune
foliole) peuvent entraner labaissement de plusieurs feuilles. Au bout de quelque temps, les
feuilles reprennent leur position initiale. Dans chacun de ces cas, on voit se propager le mouvement de la zone stimule des zones plus lointaines, ce qui revient voir vritablement se
propager dans la plante linformation particulire induite par le stimulus.
FIGURE2.7 Sensitive.
Les mcanismes moteurs dventuels mouvements sont assez complexes. Chez la sensitive, on observe quil existe des renflements (dits pulvinus) la base des ptioles primaires,
secondaires et tertiaires. Les pulvinus sont forms dun amas de cellules capables de modifier leur gonflement (on dit leur turgescence) en faisant varier (par ractions ou par transport) la concentration de soluts dans leur milieu intrieur (spcialement dans leur vacuole).
Ces modifications de turgescence provoquent une dformation du pulvinus qui entrane le
mouvement du ptiole correspondant.
28
attention , vgtalsensible!
29
Il semble cependant que la zone perceptrice, pour la racine comme pour les parties ariennes,
soit lextrmit de ces organes. En effet, pour un organe donn, lablation de la partie terminale supprime la sensibilit la gravitation. Or il existe, dans la pointe des racines ou un peu
au-dessous de la pointe dans les tiges, des cellules (dites statocytes) contenant de petits
corpuscules riches en amidon, dits statolithes; et ces statolithes tendent sdimenter (se
dposer) dans le sens de la gravitation lorsque cette dernire entre seule en jeu, ou dans le
sens de la rsultante de la gravitation et de la force centrifuge lorsque lon combine les effets
de ces deux forces.
Une interprtation classique est que linteraction des statolithes avec la partie de la
membrane cellulaire sur laquelle ils sdimentent active des protines membranaires, et que
cette activation rend dissymtrique la distribution de lauxine (qui est une hormone vgtale). Ceci entrane finalement lorientation de la croissance des organes ariens vers le haut
et celle des organes souterrains vers le bas. Certaines observations saccordent bien avec
cette interprtation. En particulier, les tiges de mutants dpourvus de statocytes sont incapables de se redresser et deviennent rampantes sur le sol12. Cependant, dautres donnes
exprimentales ne saccordent pas aussi bien, ce qui peut signifier que cette interprtation
est encore incomplte.
30
attention , vgtalsensible!
31
possdaient la protine quorine dans le cytosol de leurs cellules, lequel avait ainsi la capacit dmettre de la lumire sil contenait suffisamment de calcium. En labsence de stimulus,
la concentration du calcium dans le cytosol tait trop faible pour dclencher lmission de
lumire; mais lorsque les plantes percevaient un stimulus, un flash lumineux rvlait linvasion
du cytosol par le calcium, et les caractristiques de ce flash (intensit, dure) permettaient
destimer les caractristiques correspondantes de la vague de calcium.
Lutilisation de cette mthode permit de constater que dune part lamplitude et la dure de
llvation transitoire du calcium cytosolique dpendaient du type de stimulus quavait peru
la plante (simple contact, choc de froid ou autre) et que dautre part cette vague de calcium
pouvait jouer (par lintermdiaire de protines enzymatiques qui ne sont actives quen
prsence de calcium) un rle de dclencheur dune srie de processus cellulaires, tels que louverture de canaux ioniques membranaires, des modifications de protines dj prsentes et
un changement de lexpression de certains gnes (apparition de protines nouvelles ou disparition de protines antrieurement existantes).
Tout cela suggre que llvation transitoire du calcium cytosolique pourrait jouer un rle daiguillage orientant la plante vers un type de rponse approprie au stimulus initialement peru
(Dolmetsch etal., 1997; McAinsh & Hetherington, 1998; Knight etal., 1998).
32
attention , vgtalsensible!
33
C hapitre 3
LE MEMORANDUM
DUNERECHERCHE
35
FIGURE3.1 Dominance
et les stimulations.
Le tout premier croquis (en haut) reprsente la situation de dpart commune aux trois expriences
a, b et c.
36
Le memorandum dunerecherche
quils sont faits dun axe (racine, hypocotyle, apex), de deux cotyldons opposs et de deux
bourgeons cotyldonaires (chacun laisselle de chacun des cotyldons). Les bourgeons cotyldonaires, domins par lapex en croissance, restent normalement trs petits et inactifs; mais
aprs rsection de lapex (ce que lon appelle la dcapitation des plantes), ils entrent immdiatement en croissance. Marie-Odile Desbiez opra alors en une srie de trois expriences.
Dans la premire exprience (fig. 3.1a), elle utilisa des plants de bident gs de 2 3semaines
et cultivs en conditions optimales de lumire et de nutrition minrale. Aprs quelle les eut dcapits
(1ercroquis) le matin la leve du jour on verra plus loin que cette prcision a son importance les deux bourgeons cotyldonaires de chaque plante, jusque l domins par lapex et
si petits quon ne pouvait pas les distinguer lil nu, purent entrer en croissance. Ils le firent
alors peu prs la mme vitesse: aucun des deux ne devint dominant sur lautre (2ecroquis).
Dans la deuxime exprience (fig. 3.1b), elle effectua les mmes oprations, mais sur des
plantes cultives sous un clairement faible et avec une nutrition minrale insuffisante. Comme dans le
cas prcdent, la dcapitation des plantes (le matin, la leve du jour, 1ercroquis) permit aux
bourgeons cotyldonaires dentrer en croissance; mais, cette fois, lun des deux dmarra sa
croissance avant lautre, cest--dire quil devint dominant sur lautre. Ainsi, dans les conditions
dfavorables utilises, sitt que la dcapitation des plantes avait lev la dominance de lapex
sur les bourgeons cotyldonaires, il stablissait une nouvelle relation de dominance, cette fois
entre les bourgeons cotyldonaires eux-mmes. Mais il tait impossible de prvoir, sur chaque
plante, lequel des deux bourgeons allait devenir dominant. Il revient au mme de dire que
chacun des deux bourgeons cotyldonaires avait des chances gales de devenir le bourgeon
dominant (2e et 3ecroquis).
Dans la troisime exprience (fig. 3.1c), elle opra presque comme dans la deuxime, mais en
faisant subir aux plantes un stimulus dissymtrique (quelques piqres dune aiguille de verre
pointe mousse administres un seul des deux cotyldons) en mme temps quelle dcapitait ces
plantes (1ercroquis). Les deux oprations, stimulation et dcapitation, taient encore effectues le matin. Lun des bourgeons cotyldonaires de chaque plante dmarra nouveau sa
croissance avant lautre; mais le bourgeon devenant dominant fut alors le plus souvent, disons
dans 60 100% des cas, celui laisselle du cotyldon non stimul (2e croquis).
Au total, dans les conditions exprimentales indiques, ladministration aux plants de bident
dun stimulus dissymtrique (piqre dun seul des deux cotyldons) fait passer dune situation
o le devenir (dominant/domin) des deux bourgeons cotyldonaires tait indtermin
une situation o il est spcifi (bourgeon dominant surtout du ct non stimul). Nous dirons
que ladministration du stimulus dissymtrique entrane la spcification de la dominance entre
bourgeons cotyldonaires.
37
figure3.1; puis on procda peu aprs lablation symtrique des deux cotyldons16. Il apparut
que les deux bourgeons cotyldonaires avaient des chances gales de devenir le bourgeon
dominant lorsque lintervalle de temps sparant la dcapitation/stimulation et lablation
des cotyldons tait trs court (quelques dizaines de secondes). En revanche, le bourgeon
axillaire du cotyldon non stimul devenait dominant ds que lintervalle de temps devenait
gal 2 ou 3 minutes. On pouvait en dduire que linformation de spcification de la dominance, induite par ladministration de piqres un seul des deux cotyldons, avait besoin dau
moins 2 3 minutes pour atteindre les bourgeons cotyldonaires. La distance entre cette
zone pique et les bourgeons tant denviron 1 3 cm, on trouvait que la vitesse de migration de linformation dans la plante tait de lordre d'un quelques diximes de millimtre
par seconde. On notera que cest une valeur cohrente avec celle trouve dans le cas de
lexprience de Gautheret.
Par ailleurs, laide dlectrodes, il tait possible de dtecter et dtudier la propagation de
signaux lectriques17. Lorsque lon soumettait lun des cotyldons dun jeune plant de bident
un stimulus dune ou plusieurs piqres, deux signaux lectriques diffrents (dits potentiel daction et onde lente) se propageaient partir de la zone ainsi stimule. La vitesse de
propagation du potentiel daction tait trop grande pour correspondre la vitesse de migration de linformation. En revanche, la vitesse de propagation de londe lente tait du mme
ordre de grandeur que la vitesse de migration de linformation, telle quon lavait value plus
haut; de plus, lamplitude de londe lente tait plus leve au niveau du bourgeon axillaire du
cotyldon piqu quau niveau du bourgeon oppos. Sans tre totalement probant, tout ceci
faisait de londe lente un bon candidat au rle de vhicule de la migration de linformation
chez le jeune plant de bident (Frachisse etal., 1985).
38
Le memorandum dunerecherche
FIGURE3. 2 Mise
Comme dans la figure 3.1, le tout premier croquis (en haut) reprsente la situation de dpart
commune aux trois expriences a, b et c.
39
le dominant (celui qui dmarra sa croissance en premier) fut le plus souvent celui laisselle
du cotyldon non stimul (3ecroquis). En bref, au moment o lablation de lapex permettait enfin le dmarrage de croissance des bourgeons cotyldonaires chez les jeunes plants de
bident dcapits avec retard, ceux-ci se rappelaient parfaitement quils avaient subi une
stimulation dissymtrique deux jours plus tt; et ils y rpondaient par la spcification de la
dominance entre leurs bourgeons cotyldonaires (Thellier etal., 1981). Ce qui revient dire
que la stimulation dissymtrique avait induit le stockage en mmoire dune information de
spcification de la dominance entre bourgeons cotyldonaires chez les plantes.
Une information relative la spcification de la dominance entre bourgeons cotyldonaires
avait donc t stocke en mmoire dans les plantes. Elle y tait reste latente pendant les
deux jours sparant la stimulation dissymtrique du dmarrage de croissance des bourgeons;
cest ce que lon appellera le temps de latence ou la priode de mmorisation.
18. Pour plus de brivet et de simplicit, dans ce qui suit, on utilisera le plus souvent la forme abrge de
spcification de la dominance ( la place de spcification de la dominance entre bourgeons cotyldonaires ).
40
Le memorandum dunerecherche
de spcification de la dominance, mais quil avait rendu les plantes inaptes rappeler cette
information (c.--d. en faire usage), tandis que le traitement thermique avait restitu aux
plantes leur aptitude rappeler linformation stocke, leur permettant alors den faire usage
pour favoriser la croissance du bourgeon laisselle du cotyldon non stimul.
Pour rsumer les expriences qui viennent dtre dcrites, on peut dire que la stimulation
dissymtrique des bidents (administration de piqres un seul des deux cotyldons) induit
le stockage dune information de spcification de la dominance entre bourgeons cotyldonaires, et que diverses conditions (ici le moment de la journe o les plantes sont dcapites
ou ladjonction ventuelle dun traitement thermique) rendent les plantes rversiblement
aptes ou inaptes rappeler linformation stocke pour en faire usage, ou non, dans le contrle
de la croissance relative des bourgeons cotyldonaires.
Il intervient en fait deux fonctions dans la mmoire vgtale que nous venons dtudier:
une fonction assurant le stockage dune information (suite la perception dun
stimulus);
et une fonction confrant aux plantes, ou non, laptitude rappeler linformation stocke.
Ce rsultat nest pas tellement surprenant quand on le compare au fonctionnement de notre
propre mmoire. Lorsque, par exemple, nous avons stock en mmoire les dtails du trajet
faire de notre lieu de travail notre logement, cela ne nous servirait rien si nous navions pas
aussi la capacit de rappeler cette information la conscience lorsque nous en avons besoin!
41
en vidence lexistence dune relation quantitative entre le pourcentage de bourgeons dominants du ct du cotyldon non stimul et lintensit du stimulus (par exemple, le nombre
de piqres administres). En bref, une information de spcification de la dominance pouvait
tre stocke suite ladministration dun stimulus de piqres, mais ne pouvait pas ltre plus
ou moins.
Aprs quune information de spcification de la dominance induite par une stimulation de piqres dissymtrique eut t stocke dans les plantes, nous ne sommes jamais
parvenus effacer cette information stocke ni mme linverser (c.--d. faire en sorte
quelle devienne en faveur de lautre bourgeon). Cela restait vrai mme lorsque le premier
stimulus de piqres tait suivi de lapplication dun stimulus oppos plus puissant (par
exemple, quatre piqres sur un cotyldon, suivies de huit piqres sur lautre). Plus gnralement, lorsque lon combinait deux ou plusieurs stimulus de piqres, ctait toujours
le premier stimulus dissymtrique qui induisait le stockage de linformation spcifiant
lequel des deux bourgeons allait devenir le bourgeon dominant. Les stimulus de piqres
suivants (quils soient symtriques ou dissymtriques) restaient sans effet sur le stockage
dinformation et nintervenaient ventuellement que sur laptitude des plantes rappeler
cette information. Linformation stocke se conservait, sans rosion notable, pendant
des intervalles de temps allant jusqu deux semaines (temps au-del duquel les plantes
staient tellement dveloppes que les considrations prcdentes ne leur taient plus
gure applicables). De tout cela, on retiendra que, chez le jeune plant de bident, stimul
par piqre avec une pointe mousse, le stockage dune information de spcification de la
dominance est robuste (si ce nest irrversible) et relve du tout ou rien (cf. encadr).
42
Le memorandum dunerecherche
seulement leffet des stimulus de piqres (stockage dinformation irrversible et non quantitativement dpendant de lintensit du stimulus). En bref, les proprits de la fonction stockage qui ont t dtermines avec un certain type de stimulus ne sont pas forcment les
mmes que celles dtermines avec dautres types de stimulus!
43
que cette aptitude/inaptitude peut tre corrle au rythme circadien19 de ces plantes. De
ces deux observations on peut dduire quil est vraisemblable que la commutation aptitude/
inaptitude au rappel dune information stocke soit en relation avec les rythmes internes du
vgtal tudi.
Possibilit dun rappel multiple dinformation
En combinant habilement un stimulus dissymtrique avec un ou plusieurs stimulus symtriques, et en choisissant des intervalles de temps correspondant des maximums et des
minimums de loscillation prcdente, notre groupe a trouv quil tait possible de rappeler
au moins deux fois une information de spcification de la dominance pralablement stocke
suite la perception dun stimulus dissymtrique.
19. Un rythme circadien est un rythme de priode proche de 24 heures. Cest un rythme tel que lintervalle de
temps entre deux maximums (ou deux minimums) successifs soit d peu prs une journe.
44
Le memorandum dunerecherche
20. Les plantes dicotyldones sont des plantes suprieures possdant deux cotyldons, par opposition aux
monocotyldones qui nont quun seul cotyldon.
45
46
C hapitre 4
AU BONHEUR
DESEXPRIMENTATEURS
Les nouveaux systmes dtude
Le systme des bourgeons cotyldonaires, sur lequel nous avons dcouvert lexistence dune
mmoire de type stockage/rappel, tait dune manipulation dlicate car ces bourgeons
sont petits et profondment enfouis dans les tissus de la plante, donc peu accessibles aux
techniques dtude de la biologie et de la biochimie. De plus, le phnomne tudi, par son
comportement qui sexprime par le pourcentage de bourgeons dominants du ct du cotyldon stimul ou non stimul, na quune signification statistique. Cela peut paratre une
manire bien complique et droutante daborder le problme!
La faon tortueuse, par laquelle nous avons dcouvert que les plantes avaient de la mmoire
au cours dune tude sur les corrlations entre organes, nest pas si rare en sciences. En travaillant sur un certain phnomne, on fait une observation fortuite qui ouvre de nouveaux
horizons. Pour ne rappeler que quelques cas parmi les plus clbres, il est communment
admis que le hasard a jou dans la dcouverte de la vaccination par Jenner, de la radioactivit par Becquerel ou de la pnicilline par Flemming. Tout le mrite de ces dcouvreurs fut
de stre rendu compte de la porte de leur observation et den avoir engag lexploitation.
Ils ntaient pas toujours tombs sur la faon la plus commode daborder le nouveau phnomne ; mais eux-mmes ou leurs successeurs finissaient en gnral par trouver des voies plus
aises pour en poursuivre ltude.
Il y a encore quelques dizaines dannes de cela, ctaient les chercheurs eux-mmes qui choisissaient le sujet sur lequel travailler, et les laboratoires publics recevaient tous un financement pour cela. Ces recherches, souvent, ne menaient qu pas grand-chose, voire rien du
tout. Mais, de temps en temps, il en mergeait une nouvelle faon daborder les problmes,
une association dides originale, un rsultat exprimental inattendu; et la connaissance progressait doucement. Cette faon daller des choses tait conforme au deuxime principe de la
thermodynamique, lequel veut quon ne puisse faire un peu dordre quelque part quen crant
ailleurs un grand dsordre; et tout le monde sen contentait. Aujourdhui, ce ne sont plus les
chercheurs mais les dcideurs (politiques, directoriaux ou autres) qui savent ce quil est bon
de faire et qui le financent exclusivement. Ils promeuvent prfrentiellement les applications
de principes dj connus. On ne voit plus de ces illumins, chercheurs du meilleur moyen de
fendre en quatre les pilosits capillaires ou de faire subir aux diptres les derniers outrages;
largent public est utilis de faon rentable et la technologie progresse grands pas.
Imaginez un instant quon ait appliqu cette politique depuis le palolithique. nen pas douter
nous aurions maintenant des pierres superbement tailles. Aurions-nous galement ces petites
commodits que sont le feu, llectricit, lcriture, la numration dcimale et linformatique?
47
Cest pourtant une situation qui nest pas rare en sciences. En travaillant sur un certain
phnomne, on dcouvre par hasard quelque chose dans un domaine diffrent. Il est
frquent que ce ne soit pas une faon trs commode daborder le nouveau phnomne; mais on finit souvent par trouver des voies plus aises pour en poursuivre ltude
(cf. encadr).
Cest exactement ce qui sest pass dans notre approche de la mmoire des plantes. De
nouveaux systmes exprimentaux, galement caractristiques dune mmoire de type
stockage/rappel, se rvlrent beaucoup plus commodes utiliser et plus faciles
comprendre que la spcification de la dominance entre bourgeons cotyldonaires chez
la bident. Il sagit du stockage et du rappel dune information de rduction de lallongement de lhypocotyle chez le jeune plant de bident; dune information de production de
mristmes pidermiques chez la jeune plante de lin; et dinformations relatives la biosynthse de diffrentes sortes de peroxydases dans des cultures de tissus de bryone. Ces
trois systmes furent tudis, pour le premier, par une collaboration entre notre groupe
( luniversit de Rouen) et celui de Marie-Odile Desbiez ( luniversit de Clermont), pour
le deuxime par notre groupe Rouen et pour le troisime par lquipe de Nicole Boyer
luniversit de Clermont.
48
au bonheur desexprimentateurs
FIGURE4.1 Stockage
Les plantes des deux derniers lots (c1 et c2), dabord cultives sur la solution nutritive, restrent
non stimules (lot c1) ou bien elles furent soumises (comme dans les cas prcdents) un traitement de quatre piqres administres simultanment chacun des deux cotyldons au 6e jour
(lot c2). Puis les plantes des deux lots furent transportes sur la solution extrmement dilue au
8e jour. Lallongement journalier de lhypocotyle des plantes stimules resta normal (analogue
celui des plantes non stimules) tant que les plantes restrent sur la solution nutritive, puis elle fut
rduite denviron 30% ds que ces plantes furent transportes sur la solution dilue.
Ces rsultats sinterprtent aisment en faisant appel lintervention de deux fonctions,
stockage et rappel, comme on lavait fait dans le cas de la spcification de la dominance.
On considre ainsi que le stimulus (quatre piqres administres simultanment chacun des
deux cotyldons) induit dans tous les cas le stockage dune information de rduction de lallongement journalier de lhypocotyle21; mais que les plantes restent inaptes rappeler linformation stocke tant quelles sont cultives sur la solution nutritive; et enfin, que ces plantes
ne deviennent aptes rappeler linformation stocke, et en faire usage dans le contrle de
cetallongement, que lorsquelles sont cultives sur la solution dilue.
Plus prcisment, chez les plantes du lot c2, le stimulus provoque le stockage de linformation
de rduction de lallongement au 6e jour; mais, ces plantes tant alors cultives sur la solution
nutritive, elles ne peuvent pas rappeler linformation stocke et rien ne se passe apparemment;
puis, lorsque les plantes sont transportes sur la solution dilue au 8e jour et deviennent ainsi
aptes rappeler linformation stocke, elles se souviennent parfaitement de la stimulation
21. De mme que nous lavons fait pour voquer la spcification de la dominance entre bourgeons cotyldonaires,
nous utiliserons au besoin dans le cours de notre texte la forme abrge de rduction de lallongement et qui
renverra bien videmment dans notre contexte lallongement journalier de lhypocotyle.
49
quelles ont subie deux jours plus tt et elles y rpondent en rduisant lallongement de leur
hypocotyle. Le temps de latence (ou priode de mmorisation) est ici de deux jours (entre ladministration du stimulus au 6e jour et le transport des plantes sur la solution dilue au 8e jour).
50
au bonheur desexprimentateurs
Des rsultats voisins furent obtenus en soumettant de jeunes plants de lin des stimulus de
piqres cotyldonaires puis en les transportant sur une solution trs dilue. De plus, le dpt
de gouttelettes de solutions de dextrane ou de fructose additionnes dun peu de chlorure de potassium, sur les cotyldons de jeunes plants de lin maintenus sur la solution dilue,
provoquait galement une rduction de lallongement (Thellier etal., 2013).
Ainsi, il apparat nouveau que la bident nest pas la seule plante capable de mmoriser une
information (ici de rduction de lallongement de lhypocotyle) mais que la tomate et le lin
(et sans doute aussi bien dautres plantes) le peuvent galement; et que des gouttelettes de
solutions de certains sucres peuvent constituer des stimulus suffisants pour provoquer le
stockage dune information morphogne22.
FIGURE4. 2 Mristme
Les cellules pidermiques sont des cellules allonges paralllement lhypocotyle. Les mristmes
sont de petits massifs de cellules en division; ils apparaissent souvent au voisinage dun stomate.
22. Morphogne: qui intervient dans la gense de la forme dun organisme (ici, la longueur de lhypocotyle).
51
Les plantes ont t soumises au stimulus de manipulation lge de 4 jours (le jour 0 correspondant au dbut de la germination), puis elles ont t prives de calcium du 4e au 6e jour. On voit que
le nombre de mristmes produits en moyenne par plante (en ordonnes) augmente en fonction
du nombre de jours couls depuis la germination (en abscisses) jusqu atteindre un palier au bout
denviron trois semaines. Les traitements appliqus aux plantes sont rappels schmatiquement
par la ligne situe au-dessous de la courbe de production de mristmes: le stimulus est reprsent par la flche verticale et la priode de privation de calcium par lindentation vers le bas.
52
au bonheur desexprimentateurs
53
Trois lots de plantes ont t soumis un stimulus de manipulation lge de 4 jours; le premier
lot est le mme que celui de la figure 4.3; dans les deux lots suivants on a retard la privation de
calcium de quatre et huit jours respectivement ; la privation de calcium a donc eu lieu du 4e au
6e jours dans le premier lot, du 8e au 10 e jours dans le 2elot et du 12e au 14e jours dans le 3elot. On
voit que la production de mristmes est dcale d peu prs 4 et 8 jours chez les plantes des 2e et
3elots (courbes nos 2 et 3, respectivement) par rapport ce quelle est chez les plantes du premier
lot (courbe n 1). Les traitements appliqus aux plantes sont rappels schmatiquement au-dessous
des courbes avec les mmes numros et avec les symboles suivants: le stimulus est reprsent par
la flche verticale et les priodes de privation de calcium par lindentation vers le bas.
ne pouvons que la constater et ajouter que rien, dans nos expriences comme dans celles de
lquipe de Clermont, nindique, ni dailleurs ninfirme, que lexposition ces rayonnements
puisse avoir un effet dltre sur les vgtaux.
Effet de stimulus successifs
Quelques expriences ont t consacres soumettre les plants de lins plusieurs stimulus
successifs, de natures diffrentes ou non. Par exemple, on a fait suivre un stimulus de manipulation dune srie de chocs de scheresse quelques jours dintervalle (fig.4.5). Il est apparu
que, lorsque ladministration dun premier stimulus tait suivie de celle dautres stimulus (de
natures diffrentes ou non), la production de mristmes tait sensiblement augmente par
rapport celle obtenue aprs administration du seul premier stimulus.
54
au bonheur desexprimentateurs
FIGURE4.5
Deux lots de plantes ont t soumis une privation de calcium du 12e au 14e jours. Auparavant, les
plantes du 1er lot avaient subi un stimulus de manipulation au 4e jour; les plantes du 2elot avaient
galement subi un stimulus de manipulation au 4e jour, puis elles avaient subi trois stimulus de
scheresse aux 6e, 8e et 10 e jours. On voit que les plantes du 2e lot (courbe n 2) produisaient nettement plus de mristmes que celles du premier lot (courbe n 1) toutes les dates de mesure.
Les traitements appliqus aux plantes sont rappels schmatiquement au-dessous des courbes
avec les mmes numros et avec les symboles: flche verticale pour le stimulus de manipulation,
pointes en V pour les stimulus de scheresse, indentation vers le bas pour la priode de privation
de calcium.
55
sest rvle tre de moins de deux minutes pour les stimulus mcaniques et de plus de cinq
minutes pour les autres stimulus abiotiques dont nous avons fait usage (choc de froid, par
exemple). Le stockage dune information de production de mristmes suite ladministration de stimulus mcaniques serait donc particulirement rapide.
56
au bonheur desexprimentateurs
Deux lots de plantes ont t soumis un stimulus de manipulation lge de 4 jours; dans le 1erlot,
les plantes ont subi une seule privation de calcium du 4e au 6e jours; dans le 2elot, les plantes ont
galement subi une privation de calcium du 4e au 6e jours, puis une seconde privation de calcium
du 14e au 16e jours. On voit que la production de mristmes, qui atteignait normalement son palier
chez les plantes du premier lot (courbe n 1), repartait nergiquement chez les plantes du 2e lot ds
le dbut de la seconde privation de calcium (courbe n 2). Comme dans les figures prcdentes, les
traitements appliqus aux plantes sont rappels schmatiquement au-dessous des courbes avec
les mmes numros et les mmes symboles.
57
FIGURE4.7 Effet
Trois lots de plantes ont t soumis un stimulus de manipulation lge de 4 jours; dans le 1erlot,
les plantes ont subi une privation de calcium du 4e au 6e jours; dans le 2elot, elles ont galement subi
une privation de calcium du 4e au 6e jours, puis elles ont subi un excs de calcium du 8eau 10 e jours;
dans le 3elot elles ont subi privation et excs de calcium comme dans le 2elot puis une nouvelle
privation de calcium du 14e au 16e jours. On voit que la production de mristmes, qui atteignait
normalement son palier chez les plantes du premier lot (courbe n 1), tait presque totalement
bloque aprs lexcs de calcium chez celles du deuxime lot (courbe n 2) mais quelle repartait
nergiquement aprs la deuxime privation de calcium chez celles du troisime lot (courbe n 3).
Comme dans les figures prcdentes, les traitements appliqus aux plantes sont rappels schmatiquement au-dessous des courbes avec les mmes numros et avec les symboles: flche verticale
pour le stimulus, indentation vers le bas pour les priodes de privation de calcium et indentation
vers le haut pour la priode dexcs de calcium.
Mmoire et protome
La technique de llectrophorse 2D23 a permis dtudier lquipement en protines de jeunes
plants de lin selon les traitements auxquels ils avaient t soumis (Tafforeau etal., 2002 et
2006). La stimulation des jeunes plants a provoqu lapparition de nouveaux spots ainsi que
des dplacements de spots (dus, par exemple une phosphorylation de la protine correspondante). Certains de ces changements protiques taient prcoces et transitoires alors que
23. Lorsque lon dispose dun extrait contenant des protines, par exemple dun extrait de protines solubles
provenant dun tissu vgtal, on peut sparer (et ventuellement identifier) ces protines par lectrophorse 2D
(ou lectrophorse deux dimensions). Cette technique consiste faire migrer (de haut en bas et de gauche
58
au bonheur desexprimentateurs
dautres taient plus tardifs et de plus longue dure. Certains taient communs diffrents
stimulus et dautres spcifiques des stimulus de contact, de froid ou dirradiation par rayonnements lectromagntiques.
La privation de calcium a galement provoqu quelques dplacements de spots et lapparition
de quelques nouveaux spots dans les lectrophorses.
59
C hapitre 5
61
orienter la pointe du coloptile vers le bas, cette pointe subit un nouveau stimulus gravitropique. Tant que lintervalle de temps entre les deux stimulus est infrieur 90 minutes, le
second stimulus entrane nouveau la courbure de la pointe du coloptile vers le haut. Mais,
au-del de ce temps, leffet du second stimulus ne peut plus contrecarrer celui du premier et
la pointe du coloptile continue de pousser vers le bas (Nick & Schfer, 1988).
La fermeture des lobes dune feuille de dione attrape-mouche peut tre provoque artificiellement par ladministration dun unique stimulus lectrique de valeur suprieure ou gale
un certain seuil. Cependant, une srie de faibles stimulus lectriques (dont chacun est infrieur la valeur seuil) provoque galement la fermeture des lobes ds que leur somme atteint
ou dpasse la valeur seuil (Volkov etal., 2008).
Bien que les micro-organismes que lon appelait autrefois des algues bleues soient maintenant considrs comme des bactries photosynthtiques (ou cyanobactries) et non plus des
plantes, on signalera le cas des cellules dAnabaena variabilis. Lorsque ces cellules sont soumises
un traitement consistant les faire passer dun milieu nutritif pauvre en phosphate des
milieux o lon en augmente graduellement la concentration, elles sadaptent rapidement aux
nouvelles conditions en diminuant lactivit de leurs transporteurs cellulaires du phosphate25.
Or la faon dont elles sadaptent ces nouvelles conditions se fait selon des modalits qui
dpendent des conditions de nutrition en phosphate auxquelles ces cyanobactries ont t
antrieurement soumises (Falkner & Falkner, 2003).
Au total, on voit sur ces quelques exemples que les mmoires de type apprentissage
prsentent dans le dtail une assez grande diversit de fonctionnement.
62
Ainsi, il y a des cas de mmoire vgtale o il est difficile de distinguer si elle est du type stockage/rappel ou du type apprentissage. Cela serait plutt cohrent avec lide que les
mmoires de types stockage/rappel et apprentissage ne sont pas fondamentalement
diffrentes lune de lautre mais ne seraient que deux manifestations dun mme processus.
Pour la commodit, dans ce qui suit, nous conserverons la distinction entre mmoires de type
stockage/rappel et apprentissage, mais en nous rappelant quil nest pas vident pour
autant que les mcanismes sous-jacents soient totalement diffrents.
63
C hapitre 6
MMOIRE VGTALE
ETMMOIRE ANIMALE
OUHUMAINE
Rappel de quelques aspects
des mmoires animales ou humaines
Pour discuter des ressemblances et des diffrences de la mmoire des plantes avec la ntre,
commenons par rsumer quelques aspects de la mmoire des animaux (Lodish etal., 2000).
Chez nombre danimaux et chez les humains, la mmoire met en jeu des mcanismes de type
mmorisation/vocation: des informations (relatives des objets, des vnements, des
sensations, etc.) sont stockes en mmoire (mmorisation) puis elles peuvent tre rappeles
la conscience (vocation) un ou plusieurs moments ultrieurs. Cest ainsi que le Petit Robert
indique, comme dfinition courante de la mmoire, que cest la facult de conserver et de
rappeler des tats de conscience passs []. Lorsque les personnes ges commencent
ne plus trouver les mots dont elles ont besoin pour sexprimer, elles se plaignent couramment
de perdre la mmoire; la vrit, ce nest pas tellement la mmorisation qui est affecte (le
souvenir des mots est toujours bien prsent quelque part dans leur cerveau) mais cest lvocation qui commence dysfonctionner.
ct de la mmoire de type mmorisation/vocation, lapprentissage est un processus
par lequel les animaux modifient leur comportement la suite dexpriences ou de lacquisition dinformations relatives leur environnement. Les comportements acquis par
apprentissage peuvent leur tour tre stocks en mmoire et rappels. Les formes les plus
lmentaires de lapprentissage ont t tudies chez certains animaux infrieurs tels que
laplysie, mollusque marin, parfois dit livre de mer (Bailey & Chen, 1983). Une premire
modalit dapprentissage est laccoutumance (on dit encore familiarisation ou habituation),
processus par lequel lanimal apprend ignorer un stimulus inoffensif. Par exemple, si lon
soumet une aplysie un train de petits jets deau ou de petits attouchements, elle se rtracte
lors du premier stimulus mais ne ragit pratiquement plus au dixime; et si lon soumet
lanimal plusieurs trains successifs de ces petits stimulus, laccoutumance peut se prolonger
pendant plusieurs semaines. Une deuxime modalit, linverse de la prcdente, est la sensibilisation. Si lon soumet laplysie une srie de chocs plus nergiques, sans doute ressentis
comme douloureux, elle finit par se rtracter de faon plus violente que lors du premier choc.
65
66
par exemple, que, chez les plantes, la propagation dondes lectriques se fait au niveau de
cellules du liber (beaucoup moins spcialises que ne le sont les neurones des animaux), quelle
est considrablement plus lente que dans le cas des nerfs et que les ions impliqus ne sont pas
les mmes. De plus, chez les plantes, la consolidation des mmoires long terme se fait au
moment de llvation de la teneur en calcium cytosolique dans des cellules apparemment
banales, et sans quil intervienne quoi que ce soit de comparable aux structures crbrales
spcialises (hippocampe, nocortex) qui sont mises en jeu chez les animaux suprieurs.
Enfin, noublions pas une diffrence fondamentale. Les animaux conservent la mmoire des
faits, objets, vnements, sensations tels quils les ont individuellement perus. En revanche,
nous avons vu que, chez les vgtaux, seules les premires tapes suivant la perception dun
stimulus (par exemple, les modalits de llvation du calcium cytosolique, quelques modifications et biosynthses de protines) sont spcifiques du stimulus peru, alors que ce qui est
finalement stock en mmoire est plutt une sorte dinstruction quant la rponse mtabolique et/ou morphogne faire ce stimulus (spcification de la dominance entre bourgeons
cotyldonaires, rduction de lallongement journalier de lhypocotyle, production de mristmes pidermiques, augmentation dactivits enzymatiques peroxydasiques).
Au total, certes les plantes ont de la mmoire, mais cette mmoire nest pas de mme nature
que la ntre.
67
C hapitre 7
69
70
FIGURE7.1 Une plante doit parvenir sacclimater aux conditions rgnant lendroit o
elle a pouss. Photo: Anne-Lise Prodel.
Ici Cymbalaria muralis, appele aussi Ruine-de-Rome, sur un mur vertical o est tombe la graine
dont elle est issue.
71
72
FIGURE7. 2 Les
trouvons, de manire un peu semblable, limits par les impratifs mmes de la mthode
exprimentale. Celle-ci consiste rduire le systme tudi, c'est--dire ne faire varier
quun seul ou quelques-uns de ses paramtres en contrlant les autres aussi rigoureusement
quil est possible. Pour dcrypter les caractristiques de la mmoire des vgtaux, il a bien
fallu travailler sur des plantes maintenues en laboratoire, dans des conditions largement artificielles et rarement (si ce nest jamais) rencontres dans la nature. Il nest pas tonnant que les
plantes, soumises des contraintes inhabituelles, y aient fait des rponses qui nous paraissent
incongrues, et qui nous ont laiss aveugles ce que lon aurait observ si lon avait pu oprer
en conditions compltement naturelles.
On voit le dilemme: il faut simposer des conditions souvent drastiques pour faire une
bonne exprimentation; mais la connaissance que lon tire de cette exprimentation est
insparable des conditions exprimentales que lon sest imposes! Tentons un raisonnement
qui permettrait den sortir. Nous avons constat que la mmoire des plantes, tout en tant
trs diffrente de celle des animaux, nen tait pas moins complexe et diversifie. Si lvolution a ainsi affin et conserv ce mcanisme, cest quil intervient sans doute sur quelque
chose dessentiel la survie des vgtaux. Identifions donc le genre de rponse quil est vital
pour eux dlaborer suite aux stimulations de lenvironnement en conditions naturelles, et
nous aurons de grandes chances davoir trouv les sortes dinformations quils stockent et
rappellent dans la nature. Certes ce nest pas l une faon trs rigoureuse de raisonner. Cest
du moins une dmarche permettant de continuer avancer.
73
gnralement limites, et quil est donc crucial que cette plante parvienne ajuster lallocation
de ces ressources entre ses principales activits de faon optimiser ses chances de survivre
et de se reproduire. Dans leur approche actuelle, ces cologues ont reconnu aux plantes deux
activits principales: la croissance et la synthse de molcules de dfense, toxiques pour
les animaux ou les micro-organismes susceptibles de les attaquer. Une plante, en effet, doit
crotre suffisamment vite par rapport aux plantes voisines pour que ses parties ariennes
restent exposes la lumire et lui permettent dassurer sa photosynthse; mais elle doit
aussi laborer suffisamment de substances de dfense pour empcher que des herbivores ou
des pathognes ne dtruisent son feuillage au point de rendre sa photosynthse insuffisante.
En suivant le raisonnement des collgues allemands la lettre, on serait tent de dire que,
dans les conditions naturelles, la rponse logique des plantes aux sollicitations de lenvironnement est de dterminer quelle part des ressources doit aller assurer la croissance et quelle
autre fabriquer des molcules de dfense. Mais cest une faon de voir sans doute un peu
restrictive. En effet, en plus dassurer sa croissance et sa dfense, la plante doit dvelopper son
systme de reproduction (de la mise fleur la maturation des graines), rpondre aux stress
abiotiques ventuels (vent violent, choc de froid, scheresse), fabriquer des canaux ioniques
pour les communications distance, etc.
On en arrive ainsi considrer que ce qui est primordial pour une plante, cest dlaborer
une information qui lui permet de rpartir au mieux ses ressources entre ses diffrentes activits vitales, afin de rpondre lensemble des sollicitations de lenvironnement. Comme on
la vu plus haut, les mmoires (quelles soient de type stockage/rappel ou de type apprentissage) permettent alors de stocker et moduler cette information, et de lactualiser en
permanence selon les nouvelles stimulations perues au cours du temps. De plus, la fonction
rappel permet de corrler le rappel et lexpression de linformation stocke aux rythmes
internes de la plante, au droulement dautres processus dans cette plante, la survenue de
nouvelles conditions environnementales, etc.
Au final, la mmoire des plantes, loin dtre une notion un peu abracadabrante comme
cela pouvait sembler le cas a priori, nous apparat finalement, au contraire, tre essentielle
lacclimatation des vgtaux aux contraintes de leur environnement.
74
C hapitre 8
VERS LA SYNTHSE
De la compilation des exprimentations, rsultats et discussions qui prcdent, il se dgage
un tableau assez cohrent de la sensibilit et de la mmoire des plantes, au point que lon
peut commencer en laborer un modle conceptuel. Toutefois, si certains points paraissent
ds maintenant assez solidement tablis, dautres restent spculatifs et quelques uns ne sont
encore que des propositions pour un travail futur.
75
FIGURE8.1
gnes.
Symboles : STO = stockage, RCL = rappel. On notera que certains des stimulus, traitements ou
conditions environnementales initialement perus par la plante sont impliqus seulement dans les
ractions rapides conduisant aux rponses avec ou sans intervention de mmoire (cas A), ou seulement dans les processus conduisant au rappel (cas C), ou encore dans les deux la fois (cas B).
76
vers la synthse
au-dessous) de la valeur critique c (11) causant ainsi la condensation (ou la dcondensation) de Ca 2+ (12) et, par voie de consquence, lactivation ou linactivation des gnes impliqus dans le rappel de linformation stocke (dits gnes RCL) (13). Les gnes RCL une
fois activs (14) formeraient alors leurs produits, dit produits RCL (15), lesquels seraient
prcisment les activateurs (16) permettant que les gnes STO dverrouills soient activs
(8) et fabriquent leurs produits (dits produits STO) (9). Les produits apprentissage
et STO enclencheraient alors les ractions conduisant la rponse terminale de la
plante (17). Ltape 18 correspond la possibilit que la plante fasse une rponse directe
la perception dun stimulus, c'est--dire une rponse nimpliquant lintervention daucune
forme de mmoire.
Adquation du modle
aux donnes observationnelles et exprimentales
Le modle rend compte en particulier:
de lintervention des deux formes de mmoire, apprentissage et stockage/
rappel;
de ce que, dans le cas des mmoires de type apprentissage, la rptition dun
mme stimulus provoque tantt une diminution et tantt une augmentation de lintensit de la rponse une nouvelle perception du mme stimulus (accoutumance ou
sensibilisation, respectivement);
de ce que, dans le cas des mmoires de type stockage/rappel, les sollicitations
(stimulus ou autres) perues par la plante peuvent jouer seulement sur le stockage
dinformation (cas A) ou seulement sur le rappel (cas C) ou encore sur les deux la
fois (cas B);
de ce que le stockage dinformation correspond des processus robustes (verrouillages/dverrouillages de gnes);
de ce que linformation stocke concerne la rponse faire aux stimulus et non les
stimulus eux-mmes;
de ce que la commutation de laptitude linaptitude au rappel dinformation (ou
inversement) peut se faire aisment, et ventuellement plusieurs fois, si la valeur
de nest pas trop loigne de celle de c , mais aussi de ce que la plante peut tre
quasiment bloque en position apte ou inapte quand est trs diffrent de c.
77
compartiments externes et internes riches en calcium. Il semble bien que les caractristiques
de ce signal calcium (amplitude, dure, cintique) orientent la plante vers lenchanement
des processus qui conduiront la rponse terminale (parfois un mouvement dtectable lil
nu, comme chez la dione ou la sensitive, mais le plus souvent, des modifications du mtabolisme ou de la morphogense). Les systmes senseurs des stimulus sont divers, parfois mal
connus, mais de toute faon trs diffrents de nos organes des sens.
On distingue trois grandes voies de rponse des plantes aux stimulations quelles ont perues:
les rponses directes se produisent sans autre dlai que le temps ncessaire la ralisation dventuelles tapes intermdiaires, et elles sont indpendantes des stimulations
antrieurement perues. Ce sont des rponses rapides, strotypes, bien adaptes
ragir aux situations durgence telles que les attaques par des animaux herbivores ou
par des micro-organismes pathognes;
les rponses impliquant lintervention dune mmoire de type apprentissage sont
aussi rapides que les rponses directes; mais leur intensit dpend, en moins ou en
plus, des stimulus antrieurement perus (principalement ceux de mme nature). En
particulier, cela produit des effets daccoutumance permettant la plante de faire
lconomie des moyens quelle aurait dpenss rpondre avec une intensit maximale une stimulation en fait sans danger; et linverse, des effets de sensibilisation
grce auxquels la plante peut amliorer sa capacit de rsistance et sa promptitude de
raction aux stress et agressions les plus nocifs;
les rponses impliquant lintervention dune mmoire de type stockage/rappel
sont des rponses diffres. Une information, potentiellement utile au contrle des
activits vitales de la plante, est stocke suite la perception dun stimulus. Mais cette
information reste latente jusqu ce quun vnement appropri (perception dun
autre stimulus, changement dune condition environnementale, etc.) ait autoris
le rappel de linformation stocke, lui permettant quelle sexprime enfin dans le
contrle du mtabolisme et/ou de la morphogense de la plante. Cela permettrait
en particulier de synchroniser la rponse de la plante avec le droulement dautres
processus (rythmes, activits vitales diverses, etc.).
78
vers la synthse
79
En ce qui concerne la production de mristmes chez le lin, nous navons pu faire commuter
les plantes de linaptitude laptitude au rappel de linformation stocke, ou inversement, que
par des modifications fortes (respectivement diminution ou augmentation), mais transitoires,
de la concentration du calcium dans la solution nutritive des plantes. Par ailleurs, une combinaison de plusieurs stimulus dcals dans le temps modifie linformation stocke par rapport
celle qui serait induite par un seul de ces stimulus. Dans nos expriences, la modification a t
quantitative: elle portait sur le nombre de mristmes finalement produits. Nous avons omis
de rechercher si elle pouvait tre galement qualitative, c'est--dire si elle pouvait aussi modifier des fonctions mtaboliques ou morphognes autres que la production de mristmes;
mais rien ninterdit non plus cette possibilit.
Quant laugmentation dactivits enzymatiques peroxydasiques chez la bryone, le stockage dinformation apparat particulirement robuste, avec des priodes de mmorisation
au moins gales plusieurs mois. Par ailleurs, on ne connat pas, dans ce cas, de stimulus ou de
traitements susceptibles de faire commuter volont la bryone de linaptitude laptitude (ou
inversement) rappeler une information stocke.
Sous une apparente unicit de fonctionnement, les mmoires de type stockage/rappel
prsentent donc une indiscutable diversit de comportement. Par ailleurs, il est remarquable
de constater que ces mmoires interviennent aussi bien dans le contrle de processus de
croissance (croissance des bourgeons cotyldonaires et allongement de lhypocotyle de
bident, croissance des entre-nuds de bryone) que dans celui de la gense de nouveaux
organes (formation de mristmes pidermiques chez le lin) et mme dans celui des
fondements de la machinerie mtabolique (chez la bryone).
Un peu de spculation
Fonctionnement intgr des trois types de raction dune plante
un stimulus
Les trois sortes de rponses que les plantes peuvent faire un stimulus (rponse directe, ou
impliquant des mmoires de type apprentissage ou stockage/rappel) ont t dcrites
ci-dessus comme sil sagissait de processus distincts. Mais il semble surprenant que lvolution
80
vers la synthse
ait slectionn des mcanismes non corrls entre eux pour effectuer des tches somme
toute complmentaires. Dailleurs, nous avons dj relev des parents entre les deux
types de mmoire conduisant se demander sil ne sagissait pas plutt de deux variantes
dun mme processus. Aussi, on peut imaginer le scnario ci-dessous, lequel est tout aussi
compatible que le scnario classique avec les donnes exprimentales.
Lorsquune plante est soumise un stimulus, les choses commenceraient exactement de la
mme faon pour les trois types de rponses: perception du stimulus, invasion du cytosol par
le calcium, et stockage dune information relative la rponse mtabolique et/ou morphogne faire ce stimulus (les caractristiques du signal calcium ayant orient le systme
vers la bonne information stocker en rponse au stimulus peru). Cest seulement une fois
linformation ainsi stocke que les trois voies de rponse divergeraient:
pour les rponses directes, tout se passerait comme si la fonction rappel se trouvait bloque de faon rendre les plantes aptes rappeler linformation stocke,
permettant ainsi lexpression immdiate de cette information;
pour les rponses impliquant une mmoire de type apprentissage, les stimulus
suivants moduleraient (en moins ou en plus) linformation stocke suite un premier
stimulus et, la fonction rappel tant nouveau bloque en position apte, on
observerait un effet daccoutumance ou de sensibilisation, respectivement;
pour les rponses impliquant une mmoire de type stockage/rappel, les stimulus
suivants moduleraient nouveau linformation stocke suite un premier stimulus;
mais, la fonction rappel tant en position inapte, cette information resterait latente et ne pourrait sexprimer quaprs quun vnement appropri ait fait
commuter (parfois beaucoup plus tard) la fonction rappel en position apte.
81
82
pilogue
Arrivs au terme de cette histoire, certains lecteurs vont peut-tre se sentir un peu frustrs.
lide que les plantes sont capables de se rappeler quelque chose, ils pouvaient rver
dsotrisme et sattendre des rvlations sulfureuses, des possibilits de communications
contre nature entre les vgtaux et nous. On voit que, finalement, il nen est rien. La mmoire,
telle que nous lavons dcrite, ne fait que prendre sa place dans la physiologie normale de la
plante.
linverse de cette sensation de dception, on smerveillera plutt de la faon dont lvolution a fait les choses. Aux animaux, elle a confr une mmoire des objets, des lieux et des
vnements, immdiatement utile leurs dplacements et qui sest sophistique pour des
constructions mentales plus labores chez les espces les plus volues. Aux plantes, qui ne
se dplacent pas, elle a attribu une facult de mmoire qui leur permet dadapter leur mtabolisme et leur dveloppement aux conditions locales de leur environnement, en gnrant
une rponse intgre, optimise, lensemble des stimulations, stress et agressions auxquels
elles sont soumises au cours du temps.
Nest-ce pas l, parmi beaucoup dautres, un exemple remarquable de ce que peut russir la
slection naturelle!
83
A n n exe 1
CODES ET MESSAGES
SECRETS
La vie est base sur lexistence et les interactions de macromolcules codes mettant en jeu
des codes 4symboles (acides nucliques) ou 20 symboles (protines). Avant dentrer dans
la description de ces mcanismes, il est commode de commencer par introduire la notion de
code, et de correspondance entre codes, laide de quelques jeux de socit bass sur lutilisation de ces gommettes autocollantes aux formes gomtriques (ronds, carrs, losanges),
noires ou blanches, avec lesquelles jouent les enfants. Les deux premiers jeux vont vous
apprendre manipuler les codes, dans le cas simple de codes quatre symboles (qui seront
ici la forme et la couleur des gommettes). Les trois jeux suivants vous apprendront laborer
et dcrypter des messages secrets, cest--dire utiliser les gommettes pour le codage de
messages, de faon que ceux-ci ne soient intelligibles qu qui en connat le code.
Partant dune squence quelconque vous pourrez vous entraner construire la squence
complmentaire en utilisant la mme rgle de correspondance, et vous constaterez que cela
ne prsente aucune difficult.
84
Deuxime jeu
Pour ce deuxime jeu, on dispose de deux feuilles de gommettes. La premire feuille, sur
laquelle se trouvent toujours des carrs et des ronds noirs ou blancs, va nous servir construire
nouveau la squence n 1. La deuxime bote contient des carrs et des ronds blancs ainsi
que des ronds noirs, mais la place des carrs noirs elle contient des losanges noirs. Le jeu
consiste construire une squence, ou squence n3, qui soit complmentaire de la n1. La
rgle de correspondance consiste toujours associer les ronds blancs aux noirs ou inversement ainsi que les carrs blancs de la n3 aux carrs noirs de la n1; mais on fait maintenant
correspondre les losanges noirs de la n3 aux carrs blancs de la n1. Le rsultat, qui nest
gure plus compliqu obtenir que celui du problme prcdent, est le suivant:
Ici encore, vous pouvez partir dune squence quelconque construite avec les gommettes
de la premire feuille et vous exercer construire la squence complmentaire laide des
gommettes de la deuxime feuille.
Cest dcevant! On ne voit pas quel message utile on pourrait crire laide de ces quelques
mots. Pour faire un bon codage avec la correspondance une gommette/une lettre, il aurait
fallu disposer dautant de gommettes diffrentes quil y a de lettres dans lalphabet, plus une
au moins pour le stop, soit 27 au total. Alors, est-il possible dimaginer un moyen damliorer
85
lefficacit du codage tout en continuant nutiliser que quatre types de gommettes? Si vous
ne trouvez pas la solution, le quatrime jeu va vous mettre sur la voie.
Quatrime jeu
Ce qui nallait pas, dans le troisime jeu, cest que lon faisait une correspondance 1 pour 1 (une
lettre pour un type de gommette). Essayons maintenant de faire correspondre les lettres
des paires de gommettes. Par exemple, adoptons la correspondance:
On voit que lon peut former 16paires de gommettes, donc coder 15lettres (par exemple, de
a o) et une instruction stop. Supposez que vous receviez le message secret ci-aprs que
lon appellera la squence n6, et essayez den trouver la traduction en clair. Le rsultat correct
est donn par la squence n 7 au-dessous:
Lefficacit du codage par paires de gommettes est dj bien meilleure que celle du codage
par gommettes utilis au jeu prcdent. Maintenant, nous pouvons coder et dcoder de vrais
messages, tel que celui de ce malheureux qui appelle laide, jai faim. Mais ce nest pas
encore parfait. Avec ce systme de codage, notre malheureux, par exemple, naurait pas eu
la possibilit denvoyer un message avertissant quil avait soif; il lui aurait manqu la lettre s.
Qu cela ne tienne: puisque les paires de gommettes ne suffisent pas, essayons dutiliser des
triplets de gommettes. Ce sera lobjet du cinquime et dernier jeu.
Cinquime jeu
chaque lettre de lalphabet, faisons correspondre un triplet de gommettes. tablissons la
liste des triplets de faon systmatique, comme nous lavons fait pour la liste des paires de
gommettes au quatrime jeu, soit:
Compltez jusquau bout la liste des triplets. Vous verrez quil en existe 64. Un mathmaticien
aurait t plus vite en calculant quon peut former 43triplets diffrents (ce qui fait bien 64)
partir de quatre types de gommettes. Il saute aux yeux quil y a maintenant beaucoup trop de
triplets, puisquil ny a coder que les 26lettres de lalphabet et le stop! On peut alors trouver
des faons diverses, plus ou moins compliques, de dfinir la clef du codage. On pourra par
exemple:
1. Se contenter de nutiliser que les 27premiers triplets de la liste pour coder les 26lettres
et le stop;
2. Utiliser les 64triplets en faisant correspondre deux triplets chaque lettre (par
exemple, le a tant indiffremment cod par trois carrs blancs ou par un rond blanc
suivi de deux losanges noirs); 52triplets se trouveraient ainsi utiliss pour les 26lettres
de lalphabet, et le stop serait cod indiffremment par les 12 triplets restants;
86
La cryptographie
Bien videmment, la fabrication de messages secrets (on dit encore messages crypts
ou cryptogrammes) ne repose pas uniquement sur lutilisation de codes de gommettes!
La cryptographie est devenue une science, pour laquelle des quipes de mathmaticiens
schinent mettre au point des faons de coder qui soient de plus en plus difficiles dchiffrer par qui nen possde pas la clef. Le plus souvent, ces codages sophistiqus sont destins
des applications commerciales, diplomatiques ou militaires.
Pour clore cette annexe, donnons plutt dans le sentimental. Les messieurs auront une faon
amusante dutiliser des triplets de quatre types de perles (par exemple, diffrant par leur
forme, leur taille et/ou leur couleur) pour dclarer leur flamme leur femme ou leur petite
amie. Pour ce faire, ils enfileront ces perles sur un long fil, de faon que lenchanement des
triplets signifie jestoptstopaimestopichstopliebestopdichstopistoplovestopyoustop etc., en autant
de langues quil sera possible. Ils noueront lune lautre les deux extrmits du fil pour en
faire un collier quils offriront la femme de leur vie. Bien sr, il ne faudra pas oublier de lui
donner la clef du codage. Lorsquelle portera ce collier, elle seule saura ce que contient ce
tendre cryptogramme.
87
A n n exe 2
LA MAGIE MOLCULAIRE
Chez les tres vivants, des entits que lon peut appeler macromolcules informatives ou
macromolcules codes jouent un rle essentiel. Une macromolcule est une molcule
de grande taille, donc une molcule forme dun grand nombre datomes. Les macromolcules codes (parmi lesquelles les protines et les acides nucliques, ADN et ARN,
nous intressent particulirement) sont de longs difices forms dun enchanement de
petites units molculaires. Lordre dans lequel sont disposes ces petites units est un
code qui donne une signification la macromolcule. Cest un peu analogue la faon
dont lordre denchanement des 26lettres de lalphabet et des espaces constitue un
code reprsentatif des mots dans une phrase et donne une signification cette dernire.
Cest analogue aussi la faon dont les gommettes nous ont permis dlaborer des
messages secrets (annexe1).
La comprhension des mcanismes mis en jeu par les macromolcules codes fut le grand
succs des biologistes du xxesicle, dailleurs inspirs par de clbres physiciens (Schrdinger,
1944; Gamow, 1955). On peut dire que ce que la biologie et la gntique molculaires ont
permis de comprendre des fondements de la vie constitue lune des plus belles avances que
la science ait jamais produites. Lexplicitation dtaille en emplit de gros volumes (Alberts etal.,
1983). On en trouvera ici une prsentation succincte, sous la forme de rponses 11questions
que le lecteur peut se poser.
88
la magie molculaire
transporteurs ou encore canaux ioniques dans le cas particulier du transport transmembranaire de certains ions minraux29.
Les enzymes, les transporteurs et les canaux ioniques sont tous de nature protique, parmi
une grande diversit dautres protines impliques dans tous les aspects du fonctionnement
(et mme de la structure) des cellules.
Ainsi, les protines jouent pour les cellules vivantes un rle un peu quivalent celui que
jouent les outils et les machines-outils dans un atelier. Elles sont en gnral trs spcifiques, tant du point de vue des processus quelles contrlent que des substances (ou substrats) impliques et/ou transformes dans le fonctionnement de ces processus. Elles sont
faites denchanements de quelques dizaines quelques centaines dacides amins (petites
molcules porteuses dau moins une fonction acide et une fonction amine). Les chimistes
connaissent de nombreux acides amins, mais seuls 20 dentre eux (dont on trouvera la
liste un peu plus loin, dans le tab.A2.1) entrent dans la constitution des protines rencontres dans les cellules vivantes. Les protines se replient dans lespace de faon complexe,
formant ainsi des sites actifs (par exemple, dans le cas des enzymes, le site catalytique est
un site actif au niveau duquel le substrat se fixe et subit sa transformation). Mais cest lordre
denchanement des acides amins (ce quon appelle la structure primaire) qui impose la
structure spatiale de la protine et conditionne sa signification (c.--d. sa fonction et sa
spcificit).
29. Les ions sont des molcules porteuses dune ou plusieurs charges lectriques lmentaires (la charge
lmentaire tant gale, en valeur absolue, celle de llectron). Il existe des ions porteurs dune charge ngative
(dits anions) et dautres porteurs dune charge positive (dits cations). On distingue classiquement les ions minraux
(tels que Cl, Na+, Ca 2+, etc.) et les ions organiques (tels que CH3COO, CH3NH3+, etc.). Les ions porteurs dune seule
charge lmentaire (par exemple, CH3COO ou Na+) sont dits monovalents, ceux porteurs dune charge double
(par exemple Ca 2+) divalents, etc. Lorsquils sont dissous dans leau, les sels, les acides et les bases sont, en tout ou en
partie, dissocis en cations et anions; cest ainsi que, en solution dans leau, le sel de cuisine, NaCl, se dissocie en ions
Na+ et Cl, lacide chlorhydrique, HCl, en ions H+ et Cl, et la soude caustique, NaOH, en ions Na+ et OH. Il existe
des macromolcules ou des associations molculaires porteuses dun grand nombre de charges lmentaires; on
les caractrise alors par leur densit de charge (charge moyenne par unit de longueur pour les systmes une
seule dimension, par exemple).
30. Ou, plus prcisment, dans les chromosomes, lorsque ceux-ci deviennent apparents au moment de la
division cellulaire.
31. Du point de vue du langage, vous entendrez souvent dire code pour un caractre au lieu de code un
caractre; mais cest un anglicisme. En franais, le verbe coder est transitif.
89
(a) Schma du double brin dADN avec son code quatre lettres (A, C, G, T) et sa structure complmentaire (A dun brin toujours en face de T de lautre brin, et C dun brin toujours en face de G de
lautre brin); dans la ralit, le double brin ne reste pas linaire (comme il a t reprsent ici) mais
il sorganise en double hlice. Traits pleins = liaisons covalentes; traits pointills = liaisons hydrogne. (b) Pour dupliquer lADN, un premier systme enzymatique (flche paisse) spare les deux
brins, puis un deuxime systme enzymatique reconstitue le deuxime brin en face du brin isol
en respectant la complmentarit A/T et C/G; on aboutit ainsi obtenir deux doubles brins identiques entre eux et identiques au double brin initial.
90
la magie molculaire
Les deux brins dADN sont disposs de faon telle quen face dun T il y ait un A et quen face
dun G il y ait un C, et inversement (fig.A2.1a). Dans chaque brin, les nuclotides sont relis,
chacun au suivant, par des liaisons trs solides (dites liaisons covalentes); en revanche, les
liaisons qui stablissent dun brin lautre, entre T et A ou entre G et C, sont des liaisons peu
rsistantes (dites liaisons hydrogne). Les deux brins sont donc complmentaires comme
ltaient les squences de gommettes nos 1 et 2 dans le premier jeu de lannexe1. Les molcules dADN sont de trs grande taille: dployes, elles peuvent atteindre plusieurs mtres.
Elles sarrangent dans lespace en une double hlice. Pour lessentiel, elles se trouvent (sous
une forme replie et compacte) dans le noyau des cellules; et, dans ce qui suit, nous nous
intresserons surtout cet ADN nuclaire. Cependant, il existe galement de petites quantits dADN dans les mitochondries et les chloroplastes; nous en dirons quelques mots
p.96-97.
On sait aujourdhui que le support matriel des gnes est la macromolcule dADN, ou, plus
exactement, une petite fraction de lADN dite ADN codant. Plus prcisment, un gne est
constitu par une squence de nuclotides sur une fraction codante dun des brins dADN;
il joue le rle dune sorte de patron (au sens des couturires) reprsentatif de la structure
primaire dune protine. LADN reprsente la mmoire gntique de la cellule. Sauf accident
(voir la notion de mutation p.95), lADN nuclaire se transmet lidentique au cours des divisions cellulaires et il est le mme dans toutes les cellules dun individu.
Dans le dtail, les choses sont assez compliques. Cest ainsi que le rle exact de lADN non
codant nest pas encore clairement identifi; il semble quil ait surtout des fonctions de rgulation. De plus, il arrive quun mme gne code des protines diffrentes ou que, inversement,
le codage dune protine ncessite la participation de plusieurs gnes.
91
dun organisme quelconque (une plante, par exemple) proviennent dune mme cellule initiale
par divisions successives, elles possdent donc, toujours sauf accident, toutes exactement le
mme ADN nuclaire.
92
la magie molculaire
TABLE AU A 2.1 Correspondance des codons dADN et dARNm avec les acides amins
constitutifs des protines
Codon
(ADN)
Codon
(ARNm)
TTT
TTG
TTC
TTA
TGT
TGG
TGC
TGA
TCT
TCG
TCC
TCA
TAT
TAG
TAC
TAA
GTT
GTG
GTC
GTA
GGT
GGG
GGC
GGA
GCT
GCG
GCC
GCA
GAT
GAG
GAC
GAA
AAA
AAC
AAG
AAU
ACA
ACC
ACG
ACU
AGA
AGC
AGG
AGU
AUA
AUC
AUG
AUU
CAA
CAC
CAG
CAU
CCA
CCC
CCG
CCU
CGA
CGC
CGG
CGU
CUA
CUC
CUG
CUU
Acide amin
Nom
Symbole
Lysine
Asparagine
Lysine
Asparagine
Thronine
Thronine
Thronine
Thronine
Arginine
Srine
Arginine
Srine
Isoleucine
Isoleucine
Methionine
Isoleucine
Glutamine
Histidine
Glutamine
Histidine
Proline
Proline
Proline
Proline
Arginine
Arginine
Arginine
Arginine
Leucine
Leucine
Leucine
Leucine
Lys
Asp
Lys
Asp
Thr
Thr
Thr
Thr
Arg
Ser
Arg
Ser
Ile
Ile
Met
Ile
Gln
His
Gln
His
Pro
Pro
Pro
Pro
Arg
Arg
Arg
Arg
Leu
Leu
Leu
Leu
Codon
(ADN)
Codon
(ARNm)
CTT
CTG
CTC
CTA
CGT
CGG
CGC
CGA
CCT
CCG
CCC
CCA
CAT
CAG
CAC
CAA
ATT
ATG
ATC
ATA
AGT
AGG
AGC
AGA
ACT
ACG
ACC
ACA
AAT
AAG
AAC
AAA
GAA
GAC
GAG
GAU
GCA
GCC
GCG
GCU
GGA
GGC
GGG
GGU
GUA
GUC
GUG
GUU
UAA
UAC
UAG
UAU
UCA
UCC
UCG
UCU
UGA
UGC
UGG
UGU
UUA
UUC
UUG
UUU
Acide amin
Nom
Symbole
Acide glutamique
Acide aspartique
Acide glutamique
Acide aspartique
Alanine
Alanine
Alanine
Alanine
Glycine
Glycine
Glycine
Glycine
Valine
Valine
Valine
Valine
STOP
Tyrosine
STOP
Tyrosine
Srine
Srine
Srine
Srine
STOP
Cystine
Tryptophane
Cystine
Leucine
Phenylalanine
Leucine
Phenylalanine
Glu
Asp
Glu
Asp
Ala
Ala
Ala
Ala
Gly
Gly
Gly
Gly
Val
Val
Val
Val
Tyr
Tyr
Ser
Ser
Ser
Ser
Cys
Try
Cys
Leu
Phe
Leu
Phe
quune correspondance lettre lettre ne peut pas convenir. On raisonne comme on la fait
dans les troisime, quatrime et cinquime jeux de lannexe1. Si lon considre les paires de
lettres de lADN (TT, TG, TC, TA, GT, GG, etc.) ou celles de lARNm (AA, AC, AG, AU, CA,
CC, etc.), on constate facilement quil nen existe que 16, ce qui est encore insuffisant pour
coder les 20 acides amins des protines. La solution la plus conomique est donc que ce
soit des triplets de lettres des acides nucliques qui codent les acides amins des protines.
Cest effectivement la solution qua retenue la vie. Mais il y a maintenant beaucoup plus de
triplets (43 = 64) que les 20 acides amins des protines! La slection naturelle a retenu la
solution la plus complique (la solution n3 du cinquime jeu) pour en tenir compte; cest-dire que certains acides amins et le stop sont cods par plusieurs triplets diffrents. Le
tableau A2.1 donne la correspondance entre les triplets, on dit plus frquemment les codons,
de lADN ou de lARNm et les acides amins des protines. Ce tableau de correspondance
est appel le code gntique. On voit quil peut y avoir jusqu six codons diffrents pour un
seul acide amin (cest le cas de la srine, par exemple) alors quil ny a quun seul codon pour
la mthionine. Quant aux codons stop, ils se trouvent la fin de tous les gnes; dans les
cas o un seul ARNm code plusieurs protines la fois, ils servent indiquer que le code de la
93
FIGUREA 2. 2 Biosynthse
de lARNm en protine.
(a) Double brin dADN. (b) Le simple brin dADN qui servira de patron, aprs la rupture locale des
liaisons hydrogne du double brin. (c) Positionnement des units constitutives du futur ARNm.
(d)Libration de lARNm aprs ltablissement de liaisons covalentes entre ses units constitutives
et rupture des liaisons hydrognes entre ADN et ARNm. (e) Lecture des triplets (ou codons) de
lARNm par un ribosome (symbolis par une ellipse) et construction de la protine.
premire protine est termin et que commence le code de la seconde, etc. Pour traduire le
fait que plusieurs codons diffrents peuvent coder un mme acide amin, on dit que le code
gntique est dgnr.
La ralisation de la traduction se fait grce lintervention des ribosomes, petits organites
forms par lassociation de quelques ARNr et dun certain nombre de protines. Les ribosomes senfilent sur les ARNm o ils jouent un rle un peu quivalent celui dune tte de
lecture lisant un ruban magntique: ils progressent de codon en codon en positionnant
chaque fois lacide amin correspondant au codon en cours (fig. A2.2e) et en reliant entre eux
les acides amins ainsi disposs dans lordre impos par le patron dARNm. Lorsquun ribosome est suffisamment avanc sur un ARNm, un deuxime ribosome vient se positionner sur
le mme ARNm, puis un troisime lorsque le deuxime est suffisamment avanc, et ainsi de
suite. On appelle polysome un ARNm porteur dune srie de ribosomes en train de le lire et
de synthtiser chacun la/les protine(s) correspondante(s).
94
la magie molculaire
en cellules pidermiques, parenchymateuses, libriennes, etc. La raison en est que, lors de cette
diffrenciation, certains gnes cessent de pouvoir tre transcrits: ils se verrouillent sous
leffet de ractions chimiques (comme la mthylation) ou de la prsence de certaines protines (comme les histones) ou de certains ARNs. Finalement, dans les cellules de chaque tissu,
seuls les gnes codant les protines utiles dans ce tissu restent non verrouills et continuent
pouvoir sexprimer. Encore arrive-t-il que des gnes non verrouills ne sexpriment effectivement quen prsence de certaines substances spcifiques (dites activateurs) ou en labsence
de certaines autres substances (dites rpresseurs). Il peut arriver aussi que, dans des cellules
diffrencies, certains gnes se dverrouillent sous leffet de ractions (comme lactylation,
la dmthylation) ou dune modification des histones, etc., et reprennent leur activit. Cela
dit, en principe, les verrouillages/dverrouillages sont des oprations robustes, peu facilement
rversibles, alors que les activations/rpressions ne demandent que la prsence dun activateur ou dun rpresseur convenables.
Chez la plante Arabidopsis, il a effectivement t constat que de notables changements
de ltat de mthylation des gnes (donc des changements des nombres relatifs de
gnes verrouills et non verrouills) accompagnaient le dveloppement (Gehring etal.,
2009). De plus, des ractions de dmthylation (donc des dverrouillages de gnes)
ont t mises en vidence lors de la formation de tissus contenant finalement de
lADN peu mthyl.
95
FIGUREA 2.3 Un
Sur ce fusain (Euonymus japonicus), la mutation somatique sest produite dans la cellule lorigine
du bourgeon qui a donn naissance une petite branche. Les cellules porteuses de la mutation ont
perdu la capacit de fabriquer la chlorophylle. Ainsi les feuilles de la petite branche mute apparaissent blanches, au milieu des feuilles non porteuses de la mutation qui sont normalement vertes.
En bref, la rplication de lADN nest biologiquement satisfaisante, permettant la fois la permanence des espces sur des dures suffisamment courtes et leur volution sur des dures suffisamment longues, que parce quelle fait des erreurs, mais des erreurs peu frquentes.
96
la magie molculaire
qui ont fini par sintgrer aux cellules. Des tudes prcises de comparaison de squences
ont montr que ces organites descendent effectivement de bactries voisines de certaines
bactries actuelles, et lon a mme pu prciser de quelles familles bactriennes il sagissait.
Quoi quil en soit, lADN des mitochondries et des plastes code des protines ou, parfois, des
fragments de protines; en effet, il existe quelques protines dont une partie seulement est
code par lADN mitochondrial ou chloroplastique, le reste de la protine tant cod par de
lADN nuclaire.
Lors de la formation des cellules sexuelles (ou gamtes), il est frquent que seule la cellule
femelle (lovule) contienne des mitochondries et des plastes. Dans ce cas, contrairement ce
qui se passe pour lADN nuclaire de luf fcond et de lorganisme qui en drive (ADN qui
provient galit des gamtes mle et femelle), lADN des mitochondries et des chloroplastes
provient seulement de lovule.
97
A n n exe 3
CONDENSATION
ETDCONDENSATION
DUCALCIUM
Nous allons dcrire brivement la condensation/dcondensation des ions, spcialement de
lion Ca2+ (Manning, 1969). Souvent ignore des manuels, elle peut jouer pourtant un rle de
commutateur dans les processus biologiques comme on le voit dans notre essai de modlisation des mmoires vgtales.
La condensation ionique
Considrons maintenant (fig.A3.1) des structures fixes 1D33, porteuses de charges lectriques
ngatives et plonges dans une solution (ou un gel) contenant des ions libres ngatifs et
33. Par structure fixe, on entend quil sagit de molcules ou ddifices multimolculaires de taille suffisamment
grande pour quils restent quasiment immobiles dans le milieu cellulaire; loppos, les petits ions et autres petits
98
positifs (dont lion divalent calcium, Ca2+). De telles structures se rencontrent frquemment
dans les milieux cellulaires (acides nucliques, files de protines associes, constituants du
cytosquelette, etc.).
(a) Lorsque la densit de charges ngatives de la structure fixe 1D est faible (infrieure une valeur
critique, c), les petits ions mono- et divalents diffusent librement dans la solution. (b) Lorsque la
densit de charges ngatives de la structure fixe 1D devient suprieure c, les petits ions divalents
(ici Ca2+) se condensent sur la structure fixe charge. La neutralit lectrique locale est statistiquement respecte, cest--dire qu un endroit quelconque du systme, le nombre de charges
ngatives est toujours trs voisin du nombre de charges positives. La structure fixe 1D peut avoir
une forme plus ou moins tortueuse quand sa densit de charge est faible [cas (a)]; mais, sous leffet
de la rpulsion lectrique, elle tend se redresser quand sa densit de charge augmente [cas (b)].
On reprsente conventionnellement la densit de sites ngatifs sur une structure fixe 1D par
la lettre grecque (prononcer ksi). Quand cette densit de sites ngatifs, , est faible, les
ions libres diffusent sans contrainte dans la solution (ou le gel). Mais si quelque vnement fait
que augmente une valeur suprieure un seuil (reprsent conventionnellement par le
symbole c), les ions libres Ca2+ seffondrent sur la structure fixe 1D de faon que tende
baisser vers la valeur critique, c. On dit quils se condensent sur cette structure fixe 1D. La
condensation ionique (la condensation des ions Ca2+ dans le cas qui nous intresse) prsente
deux proprits remarquables: elle est de tout ou rien, et, contrairement aux processus
chimiques habituels, elle nobit pas la loi daction de masse, et quand les ions Ca2+ sont
condenss sur une structure fixe 1D, ils continuent se mouvoir le long de cette structure,
mais ils ne peuvent plus sen loigner. Par ailleurs, la condensation ionique est rversible: si
quelque vnement fait que devient infrieur c, du calcium va se dcondenser (repasser
sous la forme dions Ca2+ libres) de faon que tende remonter vers la valeur critique, c.
soluts qui diffusent dans le milieu cellulaire sont donc mobiles (on dit encore libres). Structure 1D =structure
une seule dimension, ou, du moins, ayant une dimension principale. Par exemple, notre chelle, un fil (quil soit
tir ou plus ou moins tortill) est une structure 1D. lchelle molculaire, lADN, les ARN, les filaments et tubules
du cytosquelette, etc., sont des structures 1D.
99
Il y a une vidente parent dans les caractristiques de leffondrement des molcules deau
sur une paroi froide et leffondrement des ions Ca2+ sur une structure 1D ngativement
charge. Cest ce qui fait que lon utilise le mme mot de condensation pour caractriser
ces deux processus. Cela dit, il est clair que la condensation de la vapeur deau et la condensation ionique ne sont pas une seule et mme chose. La premire peut se produire dans
une atmosphre gazeuse sur des surfaces (qui sont des structures deux dimensions) avec
la temprature comme variable principale, alors que la deuxime ne se produit que sur des
structures une dimension dans une solution aqueuse ou un gel, et cest la densit de charge
lectrique qui est la variable principale. Disons que le phnomne familier de la condensation
de leau sur une paroi froide est une image commode, aidant se reprsenter intuitivement
le phnomne plus mystrieux quest la condensation des ions Ca2+ sur une structure fixe 1D
lectriquement charge.
Implications biologiques
Du point de vue biologique, lorsque lion Ca2+ se condense sur une structure fixe 1D, la
concentration du calcium devient particulirement leve au niveau de cette structure, alors
quelle y est beaucoup plus faible tant que les ions Ca2+ ne sont pas condenss. Parmi les
nombreux systmes cellulaires dont lactivit dpend de la prsence dions Ca2+ (par exemple
les enzymes dites calcium-dpendantes), ceux qui sont lis la structure fixe se trouvent donc
activs quand lion Ca2+ est condens alors que ceux loigns de cette structure se trouvent
inactivs (et inversement quand lion Ca2+ nest pas condens). Lorsque quelque vnement
provoque (directement ou indirectement) une modification de la valeur de (le rendant
suprieur ou infrieur c) sur une structure fixe 1D dune cellule, le processus de condensation/dcondensation peut donc jouer un rle de commutateur faisant passer dune situation
o les systmes Ca2+-dpendants lis la structure fixe 1D sont inactifs et ceux non lis sont
actifs, une situation o les systmes Ca2+-dpendants lis aux structures fixes 1D sont actifs
et ceux non lis sont inactifs (ou inversement).
100
Glossaire (aide-mmoire)
Note: sont suivis dun astrisque dans la dfinition, les mots donnant lieu une dfinition
complmentaire.
Abiotique. Un stimulus abiotique est un stimulus autre que caus par un tre vivant, donc
autre quune attaque par bactries, virus ou champignons ou quune blessure inflige par un
herbivore. Il peut sagir du vent, de la pluie, dun choc thermique (chaud ou froid), etc.
Acide amin. Un acide amin est une molcule de petite taille porteuse dune fonction acide
(COOH) et dune fonction amine (NH2). La formule gnrale dun acide amin est donc
HOOCRNH2 o R a une forme plus ou moins complique. Par exemple R prend la forme
HCCH3 ou HCCH2 CH2 SCH3 pour les acides amins dits alanine et mthionine,
respectivement. La chimie nous apprend quun acide peut ragir avec une amine pour donner
un amide avec perte deau. Lexistence des deux fonctions acide et amine confre aux acides
amins la capacit de se lier entre eux (avec perte deau) pour donner un dipeptide HOOC
R1NHCOR2NH2 (o R1 et R2 sont caractristiques des deux acides amins impliqus).
Le dipeptide possde son tour une fonction acide et une fonction amine; il peut donc se
lier un troisime acide amin (avec perte deau) et ainsi de suite, jusqu former des enchanements plus ou moins longs. Les protines sont des enchanements de quelques dizaines
quelques centaines dacides amins.
ADN (acide dsoxyribonuclique). LADN est le support de linformation gntique que
contiennent les cellules. Pour plus de dtail, voir p.90-91.
quorine. Protine, que possde la mduse bioluminescente Aequorea victoria, et qui, en
prsence de calcium, permet de transformer en lumire une partie de lnergie mtabolique
dont dispose la mduse.
Alterne, voir feuille.
Anion. Ion* ngatif.
Apex. Employ souvent comme synonyme de bourgeon terminal dune tige.
ARN (acide ribonuclique). Il existe plusieurs sortes dARN, lARNm (ARN messager), les
ARNr (ARN ribosomiques) et les ARNs (ARN solubles). Pour plus de dtail, voir p.92.
ARNm (acide ribonuclique messager). Form dans le noyau des cellules par transcription*
de lADN, il migre ensuite dans le cytoplasme o il est traduit (voir traduction) en protine.
ARNr (acide ribonuclique ribosomique). Les ARNr entrent dans la constitution des
ribosomes, petits organites cytoplasmiques qui participent la traduction* des ARNm en
protines.
ARNs (acides ribonucliques solubles). Molcules dacide ribonuclique de petite taille
impliques dans le verrouillage* des gnes.
101
Atome. Particule constituant la plus petite quantit concevable dun lment chimique.
Latome nest pas inscable, contrairement ce que lon a cru initialement. Il est form
dun noyau, lui-mme constitu de deux sortes de particules, les protons* et les neutrons*,
autour duquel gravite un cortge dlectrons*. Dans latome non ionis (voir ion), le nombre
dlectrons dans le cortge est gal au nombre de protons dans le noyau; ce nombre
caractrise llment considr, que lon reprsente conventionnellement par son symbole
chimique. Ainsi, lhydrogne, de symbole H, contient 1 proton dans son noyau et 1 lectron
dans son cortge; lhlium, de symbole He, contient 2 protons dans son noyau et
2 lectrons dans son cortge; le lithium, de symbole Li, contient 3 protons dans son
noyau et 3 lectrons dans son cortge, et ainsi de suite. Lensemble des lments chimiques
et leur constitution est reprsente dans le tableau de Mendeleev.
Auxine. Appele aussi acide indole-actiquepar les chimistes, cette hormone vgtale est
implique dans des processus divers tels que la croissance, lorganogense (formation de
nouveaux organes), la reproduction, la rponse certains stimulus, etc.
Bioluminescence. Proprit quont certaines espces vivantes de dtourner une partie de
leur nergie mtabolique vers une mission de lumire.
Bivalent. Un ion* bivalent est un ion porteur dune double charge lectrique.
Bourgeons cotyldonaires. Bourgeons situs laisselle du (des) cotyldon(s)*. En cas de
dominance apicale*, les bourgeons cotyldonaires sont inactifs et si petits quil est difficile de
les distinguer lil nu.
Cation. Ion* positif.
Cellule vgtale. Dans une cellule vgtale typique, on rencontre trois compartiments
majeurs de lextrieur vers lintrieur: la paroi pecto-cellulosique, le cytoplasme avec le noyau
et les organites (mitochondries, chloroplastes, etc.), et la (les) vacuole(s) (remplies dun milieu
aqueux non structur). Le cytoplasme est spar de la paroi par une membrane lipoprotique
dite plasmalemme (ou membrane plasmique) et il est spar de la (les) vacuole(s) par une
autre membrane lipoprotique dite tonoplaste. Le noyau contient lessentiel de linformation
gntique, les mitochondries sont les organites de la respiration, et les chloroplastes ceux de
la photosynthse. Pour plus de dtail, voir p.15-17.
Chlorophylle. Pigment de couleur verte grce auquel les vgtaux verts effectuent la
photosynthse.
Chloroplaste. Organite cellulaire contenant de la chlorophylle.
Chromoprotine. Molcule forme dune protine et dun groupement color non
protique.
Chromosome. Au cours de la division cellulaire, lADN accompagn de protines sarrange
en lments figurs appels chromosomes.
Circadien. On dit dun rythme quil est circadien lorsque sa priode est voisine de 24heures.
Par exemple, le rythme veille/sommeil des humains est un rythme circadien.
CNRS = Centre national de la recherche scientifique.
Code gntique. Tableau de correspondance entre les acides amins et les codons (ou
triplets) de lADN et de lARNm, lors de la synthse des protines (tab.A2.1).
102
glossaire
Codons. Dans une chane dADN ou dARNm, triplets de nuclotides codant un acide
amin. Par exemple, le codon TCT de lADN, ainsi que le codon AGA de lARNm correspondant, codent lacide amin arginine lors de la synthse des protines. Pour plus de dtail, voir
p.92-94 et tab.A2.1.
Cotyldons. Toutes premires feuilles des plantes. Ils prexistent dans la graine et slargissent et verdissent aprs la germination. On distingue les plantes monocotyldones et dicotyldones qui possdent, respectivement, un seul et deux cotyldons.
Culture de tissus. Massifs de cellules plus ou moins ddiffrencies obtenus par culture en
conditions aseptiques partir dun fragment vgtal initial.
Cyanobactries. Bactries photosynthtiques anciennement dnommes algues bleues.
Cytoplasme, voir cellule vgtale.
Cytosol. Dans le cytoplasme des cellules, milieu aqueux complexe au sein duquel baignent le
noyau et les organites tels que les mitochondries, les plastes, etc.
Cytosquelette. Rseau de microfilaments et de microtubules qui structure le cytoplasme
des cellules.
Dcapitation. Ablation du bourgeon terminal (ou apex) dune jeune plante. On dit alors que
cette jeune plante est dcapite.
Ddiffrenciation cellulaire, voir diffrenciation.
Dverrouillage dun gne. On dit quun gne verrouill (voir verrouillage dun gne) se dverrouille lorsque, la suite de ractions chimiques (par exemple, dmthylation, actylation) ou
du dpart de certaines protines (par exemple, histones) ou ARNs, il redevient capable dtre
transcrit.
Dicotyldone. Plantes suprieures possdant deux cotyldons; par exemple, parmi les
plantes voques dans cet ouvrage, larabette, la bident, la lampourde, le lin, le radis, le tabac,
la tomate sont des dicotyldones.
Diffrenciation cellulaire. Apparition de proprits spcifiques dans les cellules, qui leur
permet de se spcialiser (en cellules parenchymateuses, pidermiques, stomatiques, etc.) au
cours du dveloppement dun organisme. Les cellules, encore indiffrencies, de lembryon
do provient cet organisme taient au dpart toutes semblables. Le verrouillage*/dverrouillage* de certains gnes permet la diffrenciation cellulaire. Il est relativement frquent que
des cellules vgtales diffrencies se ddiffrencient et retournent vers un tat proche de
ltat embryonnaire.
Dioque. Qualifie une plante aux sexes spars, chez laquelle il existe des pieds mles et des
pieds femelles. Les plantes dioques ne sont pas trs courantes. Parmi celles quil est facile de
rencontrer, on peut citer la bryone, le chanvre, le houblon.
Dione attrape-mouche. Plante carnivore qui capture de petits insectes laide de piges
foliaires se refermant sur les proies qui sy aventurent.
Dominance apicale. On dit quil y a dominance apicale lorsque le bourgeon terminal, ou
apex*, dune tige se dveloppe activement tout en inhibant la croissance des bourgeons
sous-jacents.
103
104
glossaire
105
OGM (organisme gntiquement modifi). Les OGM vgtaux sont aussi appels PGM
(plantes gntiquement modifies). Pour plus de dtail, voir p.97.
Oppose, voir feuille.
Oxymore (ou oxymoron). Expression qui contient une contradiction interne. Lobscure
clart quvoque le dramaturge Pierre Corneille dans la tragdie du Cid en est un exemple.
Parenchyme. Tissu interne des plantes. Par exemple, le parenchyme des feuilles est fait de
cellules arrondies qui contiennent de la chlorophylle et effectuent la photosynthse.
Paroi, voir cellule vgtale.
Ptiole, voir feuille.
Phromones. Substances volatiles, de natures chimiques diverses, mises trs faibles doses
dans latmosphre par les tres vivants (y compris les plantes), et qui peuvent provoquer des
modifications du comportement des animaux et des vgtaux qui y sont sensibles.
Photopriode. Dure relative du jour et de la nuit.
Photosynthse. Mcanisme par lequel les vgtaux verts librent de loxygne et fabriquent
des sucres partir de gaz carbonique et deau grce lnergie quils tirent de la fixation de la
lumire.
Phytochrome. Molcule forme dune partie protique et dune partie pigmente non-protique. Elle existe sous deux formes isomres*, que nous appelons ici phytochrome1 et phytochrome2. Le phytochrome passe sous la forme phytochrome1 quand il est irradi par une
lumire rouge sombre (proche de linfrarouge), et sous la forme phytochrome2 quand il est
irradi par une lumire rouge clair (proche de lorang). En clairage naturel, les deuxformes
de phytochrome coexistent, et cest le rapport phytochrome2/phytochrome1 qui contrle
la sensibilit des plantes la dure relative du jour et de la nuit.
Phytoplancton. Ensemble des organismes photosynthtiques de petite taille vivant en
suspension dans leau. Il existe du phytoplancton deau douce et du phytoplancton marin.
Plasmalemme, voir cellule vgtale.
Polysome. Un polysome est fait dun ARNm sur lequel sont enfils plusieurs ribosomes*.
Chacun de ces ribosomes est en train de construire une protine en faisant correspondre les
acides amins constitutifs de la protine aux triplets (ou codons) successifs de lARNm conformment au code gntique.
Protines. Molcules formes dun ou plusieurs enchanements dacides amins*, chaque
liaison stablissant avec perte dune molcule deau.
Protome. quipement en protines propre une cellule, un organisme, etc.
Proton. Une des particules constitutives du noyau des atomes. Le proton porte une charge
lectrique positive gale en valeur absolue celle de llectron et sa masse est denviron
1840fois celle de llectron.
Pulvinus. Renflement moteur prsent la base des ptioles de la sensitive. Ce sont des modifications du gonflement des cellules des pulvinus qui permettent les mouvements des folioles
et des feuilles.
106
glossaire
107
Structure 1D. Structure qui ne possde quune seule dimension (ou, du moins, qui a une
dimension principale). notre chelle, un fil (quil soit tir ou plus ou moins tortill) est une
structure 1D. lchelle molculaire, lADN et les ARN, ainsi que les filaments et tubules du
cytosquelette*, etc., sont des structures 1D.
Substrat. Le substrat dun processus de raction ou de transport catalys par une protine
est la substance implique (c.--d. transforme ou transporte) dans ce processus.
Symbiose. Association durable entre deux organismes vivants, profitable aux deux partenaires. Par exemple, un lichen est une symbiose entre un champignon et une algue.
Symbiote. Chacun des deux tres associs dans une symbiose.
Tonoplaste, voir cellule vgtale.
Traduction. La traduction dun ARNm consiste construire une protine sur le patron de
cet ARNm.
Transcription. La transcription dun gne consiste construire un ARNm sur le patron de
lADN du gne. La transcription se produit dans le noyau de la cellule. Puis lARNm migre vers
le cytoplasme. La transcription revient donc faire passer linformation porte par les gnes
depuis le noyau jusquau cytoplasme.
Transgne. Lorsque lon fabrique un OGM*, le transgne est le fragment dADN tranger
que lon incorpore dans le gnome de lorganisme rcepteur (ici une plante).
Transgnse. Opration qui consiste fabriquer un OGM*, cest--dire qui consiste incorporer un ou plusieurs gnes trangers dans le gnome dun organisme (ici une plante).
Triplet. Ensemble de trois nuclotides sur une chane dADN ou dARN. En utilisant les
symboles classiques dcriture des nuclotides, TCA et AGU sont des exemples de triplets
dune chane dADN et dARN, respectivement.
Trivalent. Qualifie un ion* porteur dune triple charge lectrique.
Turgescence. tat de gonflement des cellules vgtales.
Vacuole, voir cellule vgtale.
Verrouillage dun gne. On dit quun gne se verrouille lorsquil cesse de pouvoir tre transcrit sous leffet de ractions chimiques (mthylation) ou de la prsence de certaines protines
(histones) ou dARNs.
108
Bibliographie
Alberts B., Bray D., Lewis J., Raff M., Roberts K., Watson J.D., 1983. Molecular Biology of the Cell.
Garland Publishing, Inc., New York, 1146 p. (plusieurs fois rdit et mis jour depuis).
Bailey C., Chen M., 1983. Morphological basis of long-term habituation and sensitization in
Aplysia. Science, 220, 91-93.
Baroin Tourancheau A., Tsao N., Klobutcher L.A., Pearlman R.E., Adoutte A., 1995. Genetic
code deviations in the ciliates: Evidence for multiple and independent events. EMBO J, 14 (13),
3262-3267.
Beyl C.A., Mitchell C.A., 1977. Automated mechanical stress: Application for height control of
greenhouse chrysanthemum. HortSci, 12, 575-577.
Bourgeade P., Boyer N., De Jaegher G., Gaspar T., 1989. Carry-over of thigmomorphogenesic
characteristics in calli derived from Bryonia dioica internodes. Plant Cell Tissue Organ Cult., 19, 199-211.
Boyer N., Gaspar T., Lamand M., 1979. Modification des isoperoxydases et de lallongement des
entre-nuds de bryone la suite dirritations mcaniques. ZPflanzenphysiol, 93, 459-470.
Braam J., Davis R.W., 1990. Rain-, wind- and touch-induced expression of calmodulin and
calmodulin-related genes in Arabidopsis. Cell, 60, 357-364.
Davies E., Schuster A., 1981. Intercellular communication in plants: Evidence for a rapidly
generated, bidirectionally transmitted wound signal. Proc Natl Acad Sci USA, 78, 2422-2426.
Davies E., Stankovic B., Vian A., Wood A.J. 2012. Where has all the message gone? Plant Sci,
185-186, 23-32.
Desbiez M.-O., Gaspar T., Crouzillat D., Frachisse J.-M., Thellier M., 1987. Effect of
cotyledonary prickings on growth, ethylene metabolism and peroxidase activity in Bidens pilosus.
Plant Physiol Biochem, 25, 137-143.
Desbiez M.-O., Kergosien Y., Champagnat P., Thellier M., 1984. Memorization and delayed
expression of regulatory messages in plants. Planta, 160, 392-399.
Desbiez M.-O., Tort M., Monnier C., Thellier M., 1998. Asymmetrical triggering of the cell cycle
in opposite buds of a young plant, after a slight cotyledonary wound. CR Acad Sci Paris (Sciences de la
Vie/Life Sciences), 321, 403-407.
Dolmetsch R.E., Lewis R.S., Goodnow C.C., Healy J.J., 1997. Differential activation of
transcription factors induced by Ca2+ response amplitude and duration. Nature, 386, 855-858
Dudai Y., 2004. The Neurobiology of consolidations, or, how stable is the engram? Annu Rev
Psychol, 55, 51-86.
Falkner R., Falkner G., 2003. Distinct adaptability during phosphate uptake by the
Cyanobacterium Anabaena variabilis reflects information processing about preceding phosphate
supply. J Trace Microprobe Techn, 21, 363-375.
Farineau J., Morot-Gaudry J.-F., 2011. La Photosynthse, Qu, Versailles, 412p.
Frachisse J.-M., Desbiez M.-O., Champagnat P., Thellier M., 1985. Transmission of a traumatic
signal via a wave of electric depolarization and induction of correlation between the cotyledonary
buds in Bidens pilosus. PhysiolPlant, 64, 48-52.
Gamow G., 1955. M. Tompkins sexplore lui-mme, Dunod, Paris, 286p.
109
Gautheret R.J., 1935. Recherches sur la culture des tissus vgtaux. Rev Cytol Cytophysiol Veg, 1,
1-279.
Gayler S., 2010. Modlisation de leffet de facteurs de lenvironnement sur la rpartition des
ressources dans un systme vgtal mixte. CR Acad Agric France, 96, 89-90.
Gayler S., Grams T.E.E., Heller W., Treutter D., Priesack E., 2008. A dynamic model of
environmental effects on allocation to carbon-based secondary compounds in juvenile trees.
Annals Bot, 101, 1089-1098.
Gayler S., Grams T.E.E., Kozovits A., Luedemann G., Winkler J.B., Priesack E., 2006. Analysis
of competition effects in mono- and mixed cultures of juvenile beech and spruce by means of the
plant growth simulation model PLATHO. Plant Biol, 8, 503-514.
Gehring M., Bubb K.L., Henikoff S., 2009. Extensive demethylation of repetitive elements
during seed development underlies gene imprinting. Science, 324, 1447-1451.
Hammer P.A., Mitchell C.A., Weiler T.C., 1974. Height control in greenhouse chrysanthemum
by mechanical stress. HortSci, 9, 474-475.
Henry-Vian C., Vian A., Dietrich A., Ledoigt G., Desbiez M.-O., 1995. Changes in the polysomal
mRNA population upon wound signal expression or storage in Bidens pilosa. Plant Physiol Biochem, 33,
337-344.
Herms D.A., Mattson W.J., 1992. The Dilemma of plants: To grow or defend. Quarterly Rev Biol,
67, 283-335.
Karban R., Baldwin I.T., 1997. Induced Responses to Herbivores, The University of Chicago Press,
Chicago, 330 p.
Karban C., Baldwin I.T., Baxter K.J., Laue G., Felton G.W., 2000. Communication between
plants: Induced resistance of wild tobacco plants following clipping of neighbouring sagebrush.
Oecologia, 125, 66-71.
Knight H., Brandt S., Knight M.R., 1998. A history of stress alters drought calcium signalling
pathways in Arabidopsis. Plant J, 16, 681-687.
Knight M.R., Campbell A.K., Smith S.M., Trewavas A.J., 1991. Transgenic plant aequorin
reports the effect of touch and cold-shock and elicitors on cytoplasmic calcium. Nature, 352,
524-526.
Knight M.R., Smith S.M., Trewavas A.J., 1992. Wind-induced plant motion immediately
increases cytosolic calcium. Proc Natl Acad Sci USA, 89, 4967-4971.
Lefvre J., Boyer N., Gaspar T., Desbiez M.-O., 1993. Change of peroxidase activity related to
storage of information and immediate or delayed expression of the effect of cotyledon pricking
on hypocotyl growth in tomato. In: Plant peroxidases: biochemistry and physiology, K.G.Welinder,
S.K.Rasmussen, C.Penel, H.Greppin, eds.), Publications de lUniversit, Genve, 345-348.
Lesburgures E., Gobbo O.L., Alaux-Cantin S., Hambucken A., Trifilieff P., Bontempi B.,
2011. Early tagging of cortical networks is required for the formation of enduring associative
memory. Science, 331, 924-928.
Lodish H., Berk A., Zipursky S.L., Matsudaira P., Baltimore D., Darnell J., 2000. Learning and
Memory. In: Molecular Cell Biology, 4th edition, W.H. Freeman, New York, section 21-7.
Manning G.S., 1969. Limiting laws and counterion condensation in polyelectrolyte solutions.
I. Colligative properties. J Chem Phys, 51, 924-933.
McAinsh M.R., Hetherington A.M., 1998. Encoding specificity in Ca2+ signalling systems. Trends
Plant Sci, 3, 32-36.
Nick P., Schfer E., 1988. Spatial memory during the tropism of maize. Planta, 175, 380-388.
110
bibliographie
Plieth C., Hansen U.P., Knight H., Knight M.R., 1999. Temperature sensing by plants: The
primary characteristics of signal perception and calcium response. Plant J, 18, 491-497.
Roux D., Vian A., Girard S., Bonnet P., Paladian F., Davies E., Ledoigt G., 2006. Electromagnetic
fields (900 MHz) evoke consistent molecular responses in tomato plants. Physiol Plant, 128, 283-288.
Schrdinger E., 1944. What is Life? The Physical Aspect of the Living Cell, University Printing House,
Cambridge, UK, 96 p.
Tafforeau M., Verdus M.-C., Charlionet R., Cabin-Flaman A., Ripoll C., 2002. Two-dimensional
electrophoresis investigation of short-term response of flax seedlings to cold shock. Electrophoresis,
23, 2534-2540.
Tafforeau M., Verdus M.-C., Norris V., Ripoll C., Thellier M., 2006. Memory processes in the
response of plants to environmental signals. Plant Signal Behav, 1, 9-14.
Tafforeau M., Verdus M.-C., Norris V., White G., Demarty M., Thellier M., Ripoll C., 2002.
SIMS study of the calcium-deprivation step related to epidermal meristem production induced in
flax by cold shock or radiation from a GSM telephone. J. Trace Microprobe Techn, 20, 611-623.
Tafforeau M., Verdus M.-C., Norris V., White G.J., Cole M., Demarty M., Thellier M., Ripoll
C., 2004. Plant sensitivity to low intensity 105 GHz electromagnetic radiation. Bioelectromagnetics,
25, 403-407.
Thellier M., Desbiez M.-O., Kergosien Y., Champagnat P., 1981. Mise en mmoire de signaux
morphognes chez Bidens pilosus L. CR Acad Sci Paris (srie III), 292, 1187-1190.
Thellier M., Lttge U., 2013. Plant memory. Plant Biology, 15, 1-12.
Thellier M., Ripoll C., Norris V., 2013. Memory processes in the control of plant growth and
metabolism. Nova Acta Leopoldina NF 114, 391, 21-42.
Trewavas A., 1999. Le Calcium cest la vie: Calcium waves. Plant Physiol., 120, 1-6.
Trewavas A., 2003. Aspects of plant intelligence. Ann Bot, 92, 1-20 (voir en particulier la section
"Plant memory and information retrieval").
Ueda M., Nakamura Y., 2006. Metabolites involved in plant movement and memory:
Nyctinasty of legumes and trap movement in the Venus flytrap. Nat Prod Rep, 23, 548-557.
Verdus M.-C., Cabin-Flaman A., Ripoll C., Thellier M., 1996. Calcium-dependant storage/
retrieval of environmental signals in plant development. CR Acad Sci Paris (Sciences de la Vie/Life
Sciences), 319, 779-782.
Verdus M.-C., Le Sceller L., Norris V., Thellier M., Ripoll C., 2007. Pharmacological evidence
for calcium involvement in the long-term processing of abiotic stimuli in plants. Plant Signal Behav,
2, 212-220.
Verdus M.-C., Ripoll C., Norris V., Thellier M., 2012. The Role of calcium in the recall of stored
morphogenetic information by plants. Acta Biotheor, 60, 83-97.
Verdus M.-C., Thellier M., Ripoll C., 1997. Storage of environmental signals in flax: Their
morphogenetic effect as enabled by a transient depletion of calcium. Plant J, 12, 1399-1410.
Vian A., Roux D., Girard S., Bonnet P., Paladian F., Davies E., Ledoigt G., 2006. Microwave
irradiation affects gene expression in plants. Plant Signal Behav., 1, 67-70.
Volkov A.G., Carrel H., Adesina T., Markin V.S., Jovanov E., 2008. Plant electrical memory.
Plant Signal Behav., 3, 490-492.
Wheeler R.M., Salisbury F.B., 1979. Water spray as a convenient means of imparting mechanical
stimulation to plants. HortSci, 14, 270-271.
111
19 `
ISBN : 978-2-7592-2325-1
Rf. : 02477