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Département de Biologie
Laboratoire de Microbiologie Appliquée
THESE DE DOCTORAT
Spécialité : Microbiologie appliquée
Contrôle microbiologique et hygiène alimentaire
Présentée par
Soutenue :
Devant le jury:
J’adresse mes plus sincères remerciements à mon directeur de thèse, le Professeur KIHAL
Mebrouk, Directeur du Laboratoire de Microbiologie Appliquée à l'Université Oran 1, pour
m'avoir accueillie au sein du laboratoire et m'avoir encadrée et dirigée tout le long de cette
thèse, partageant ses connaissances scientifiques et son savoir. Je vous serai toujours
reconnaissante pour votre disponibilité, votre soutien continu et votre patience qui m'ont
permis de mener à bien mon travail.
En second lieu, mes plus vifs remerciements vont à ma co-directrice de thèse Madame Del
Rio Beatriz, qui m'a dirigée durant mon stage au sein de l'Institut des Produits Laitiers des
Asturies (IPLA) en Espagne. Toute ma gratitude pour tous les précieux conseils donnés, ton
temps, ton dévouement, et surtout ta gentillesse et ta disponibilité malgré la distance. J'y ai
vraiment rencontré une personne qui m'est devenue chère. Pour tout ceci, un grand merci.
Je tiens tout particulièrement à remercier Dr. Miguel Angel ALVAREZ pour m'avoir
accueilli au sein de son laboratoire à l'IPLA - Espagne et avoir mis à ma disposition tout le
matériel nécessaire pour que je puisse réaliser les expériences nécessaires à mon travail. J'y ai
rencontré une équipe extraordinaire qui m'a beaucoup aidé à réaliser ce travail.
Je remercie également du fond du cœur Dr. Victor Ladero, qui a su aussi me guider durant
mon stage au sein de l'Institut. J'y ai passé des moments inoubliables tant humainement que
professionnellement. Merci pour tout.
À mon très cher mari HADI, sans qui rien n'aurait été possible, qui a toujours été là pour
moi et qui m'a toujours soutenue et encouragée dans les décisions que j'ai prise. Merci pour ta
À mes enfants LEYLA et MALIK, mes amours, ma lumière que dieu les protègent.
À mon père, mon pilier, mon modèle, ma fierté. Je tiens à te remercier du plus profond de
mon cœur pour tous tes encouragements afin de me dépasser et d'aller toujours plus loin.
À ma mère, mon deuxième pilier dans la vie, qui me permet de poursuivre mon chemin tout en
étant à mes côtés. Merci pour tes encouragements, ton amour et ton assistance. Je suis
À mon cher frère RAMZI, qui est un soutien indéfectible quelque soit la situation.
À ma très chère belle-mère. Merci pour tes encouragements, ton aide et ton soutien moral tu
À mes belles-sœurs, mes sœurs de cœur, ainsi qu'à toute ma belle famille.
À mes amies de toujours Zola et Nassima, mon soutien de toujours, mes sœurs.
À la mémoire de mes grands-parents et mon beau père, je sais que vous auriez été fière de
moi.
À toutes les personnes qui ont participé de près ou de loin à la réalisation de ce travail.
Je dédie ce travail
SAIDI Yasmine
SOMMAIRE
........................................................................................................................................... I
Résumé ..................................................................................................................................... II
Abstract .................................................................................................................................. III
Liste des abréviations .............................................................................................................IV
Liste des figures ....................................................................................................................... V
Liste des tableaux ................................................................................................................. VII
Rappel bibliographique
1. Données sur les dromadaires .............................................................................................. 3
1.1. Taxonomie et origine des dromadaires ........................................................................ 3
1.2. Importance et rôle des dromadaires ............................................................................. 4
1.3. Répartition géographique des dromadaires ................................................................. 4
1.3.1. Distribution dans le monde .................................................................................. 4
1.3.2. Distribution en Algérie ......................................................................................... 5
1.3.3. Races camelines en Algérie.................................................................................. 6
1.4. Caractéristiques du lait de dromadaire ........................................................................ 8
1.4.1. Caractéristiques organoleptiques.......................................................................... 8
1.4.2. Caractéristiques physico-chimiques ..................................................................... 9
1.5. Composition chimique du lait de dromadaire.............................................................. 9
1.6. Industrialisation du lait de dromadaire ...................................................................... 12
1.7. Propriétés thérapeutiques et fonctionnelles du lait de dromadaire ............................ 13
1.7.1. Propriétés antimicrobiennes ............................................................................... 13
1.7.2. Propriétés anti-oxydantes ................................................................................... 14
1.7.3. Propriétés inhibitrices de l'enzyme de conversion de l'angiotensine (ECA) ...... 15
1.7.4. Propriétés anti-inflammatoires et hépato-protectrices ........................................ 16
1.7.5. Propriétés anticancéreuses.................................................................................. 17
1.7.6. Propriétés antiallergiques ................................................................................... 18
1.7.7. Propriétés contre l'autisme ................................................................................. 19
1.8. Flore microbienne du lait de dromadaire ................................................................... 21
2. Rappel sur les bactéries lactiques ..................................................................................... 22
2.1. Définition et caractéristiques des bactéries lactiques ................................................ 22
2.2. Classification et taxonomie des bactéries lactiques ................................................... 23
2.3. Métabolisme des bactéries lactiques.......................................................................... 25
2.3.1. Métabolisme du sucre......................................................................................... 26
2.3.2. Métabolisme des protéines ................................................................................. 27
2.3.3. Métabolisme des lipides ..................................................................................... 28
2.4. Intérêt des bactéries lactiques .................................................................................... 30
2.5. Propriétés technologiques des bactéries lactiques ..................................................... 31
2.5.1. Propriétés acidifiantes et production d'acide lactique ........................................ 31
2.5.2. Propriétés aromatiques des bactéries lactiques .................................................. 33
2.5.3. Propriétés rhéologiques des bactéries lactiques ................................................. 34
2.5.4. Propriétés de bioconservation des bactéries lactiques ........................................... 34
2.5.5. Propriétés probiotiques des bactéries lactiques .................................................. 37
2.6. Méthodes d'étude et d'identification des bactéries lactiques ..................................... 38
2.6.1. Méthodes phénotypiques .................................................................................... 39
2.6.2. Méthodes génotypiques ...................................................................................... 39
2.7. Composés volatils produits par les bactéries lactiques .............................................. 41
2.7.1. Analyse des composés volatils ........................................................................... 41
2.7.2. Séparation et quantification des composés volatiles par chromatographie en
phase gazeuse (CPG) ........................................................................................................ 42
2.8. Amines biogènes........................................................................................................ 43
2.8.1. Définition et origine ........................................................................................... 43
2.8.2. Classification ...................................................................................................... 44
2.8.3. Effet toxicologique ............................................................................................. 44
2.8.4. Les bactéries lactiques productrices d'amines biogènes ..................................... 45
Matériels et méthodes
1. Cadre de l'étude ................................................................................................................ 46
2. Provenance des échantillons............................................................................................. 46
3. Analyse physico-chimique des échantillons de lait.......................................................... 46
3.1. Le pH ......................................................................................................................... 46
3.2. L'acidité Dornic ......................................................................................................... 46
3.3. La densité ................................................................................................................... 46
3.4. Dosage de la vitamine C ............................................................................................ 47
4. Isolement des souches lactiques et étude de leurs conditions de croissance .................... 47
5. Purification des bactéries lactiques .................................................................................. 48
6. Conservation des isolats purs ........................................................................................... 48
7. Caractérisation des souches lactiques .............................................................................. 49
7.1. Pré-identification des isolats ...................................................................................... 49
7.1.1. Caractérisation morphologique .......................................................................... 49
7.1.2. Test de la catalase ............................................................................................... 49
7.2. Identification phénotypique des isolats ..................................................................... 49
7.2.1. Production de gaz à partir du glucose ................................................................ 50
7.2.2. Hydrolyse de l’arginine ...................................................................................... 50
7.2.3. Test de la thermo-résistance et croissance à 45 °C ............................................ 50
7.2.4. Résistance à la salinité........................................................................................ 51
7.2.5. Capacité de croissance en milieu pH 9,6............................................................ 51
7.3. Identification génotypique des souches pures ........................................................... 51
7.3.1. Extraction de l’ADN génomique et amplification de l'ADN par PCR .............. 51
7.3.2. Electrophorèse sur gel d'agarose des produits de la PCR................................... 51
7.4. Séquençage partiel du gène de la superoxyde dismutase (SOD) ............................... 52
7.4.1. Amplification de l'ADN par PCR....................................................................... 52
7.4.2. Electrophorèse sur gel d'agarose des produits de la PCR................................... 52
7.5. Caractérisation technologique des isolats purs .......................................................... 53
7.5.1. Pouvoir acidifiant des isolats purs ...................................................................... 53
7.5.2. Activité protéolytique ......................................................................................... 53
7.5.3. Activité lipolytique ............................................................................................. 55
7.5.4. Production d'exopolysaccharides (EPS) ............................................................. 55
7.5.5. Utilisation du citrate ........................................................................................... 55
7.5.6. Production d’acétoïne ......................................................................................... 55
7.5.7. Production de composés volatils dans le milieu lait .......................................... 56
7.5.8. Cinétique d'acidification et de croissance dans le milieu lait ............................. 57
7.5.9. Production de substances antimicrobiennes ....................................................... 61
7.6. Production des amines biogènes ................................................................................ 62
7.6.1. Préparation des milieux de culture spécifique.................................................... 62
7.6.2. Dérivation des échantillons ................................................................................ 62
7.6.3. Equipement et conditions chromatographiques ................................................. 62
8. Analyse de cluster ............................................................................................................ 63
Résultats et discussion
1. Les tests physico-chimiques du lait cru de dromadaire.................................................... 64
2. Isolement et sélection des bactéries lactiques du lait cru de dromadaire ......................... 65
2.1. Etude morphologique des isolats ............................................................................... 66
3. Identification des isolats retenus ...................................................................................... 67
4. Identification génotypique des isolats purs ...................................................................... 68
5. Caractérisations technologiques des différents isolats ..................................................... 74
5.1. Pouvoir acidifiant ...................................................................................................... 74
5.2. Activité protéolytique ................................................................................................ 77
5.3. Activité lipolytique .................................................................................................... 81
5.4. Production d'exopolysaccharides (EPS) .................................................................... 82
5.5. Utilisation du citrate .................................................................................................. 83
5.6. Production d'acétoïne ................................................................................................. 84
5.7. Dosage des composés volatils par CPG .................................................................... 86
5.8. Cinétique de croissance et d'acidification .................................................................. 90
5.9. Activité antibactérienne ............................................................................................. 94
6. Production des amines biogènes par les bactéries lactiques ............................................ 97
7. Analyse de cluster .......................................................................................................... 100
Conclusion générale ............................................................................................................. 102
Références bibliographiques ............................................................................................... 106
Annexes ................................................................................................................................. 130
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I
Résumé
A partir de 12 échantillons de lait cru de dromadaire provenant de l'Ouest et du Sud-ouest
Algérien, 41 bactéries lactiques isolées ont été phénotypiquement caractérisées et
génétiquement identifiées. Sur la base de leur forme ainsi que de leur métabolisme
fermentaire, 27 isolats sous formes de cocci homofermentaire ont été subdivisés en 2 genres
présomptifs, Enterococcus (23 isolats) et Lactococcus (4 isolats) ; les 7 cocci
hétérofermentaires ont été considérées comme appartenant au genre Leuconostoc. Les 7 autres
isolats sous forme de bâtonnets ont été assignés au genre Lactobacillus. L'identification
moléculaire par le séquençage des gènes codant pour l'ARNr 16S et pour la superoxyde
dismutase a montré qu'ils appartenaient aux espèces du genre : Enterococcus faecium (19
isolats), Enterococcus hirae (2 isolats), Leuconostoc mesenteroides (7 isolats), Lactobacillus
rhamnosus (7 isolats) et Lactococcus lactis (6 isolats). Tous les isolats ont été caractérisés en
déterminant certaines propriétés technologiques et de sécurité. Leur capacité d'acidification,
d’activité protéolytique et lipolytique, d’utilisation du citrate et de production de dextrane et
d'acétoïne a montré le potentiel technologique de certains isolats. Le dosage par CPG à espace
de tête couplé à la spectrométrie de masse a montré que les composés volatils majeurs
produits sont l'éthanol, l'acétaldéhyde, l’acétate de méthyle, l'acétoïne et l'acide acétique. Le
potentiel d'acidification de 5 isolats représentant chaque espèce identifiée a été testé en
effectuant une cinétique d'acidification durant 48 h. Les résultats ont montré que la plus forte
acidification a été obtenue avec la souche de Lactococcus lactis (pH final de 4,00),
contrairement à la souche de Leuconostoc mesenteroides qui a été considérée comme une
espèce faiblement acidifiante (valeur maximale du pH = 5,80). Par ailleurs, l'activité
antimicrobienne des espèces isolées a été testée par la méthode indirecte contre 6 souches
indicatrices, montrant que les souches ayant la plus forte activité sont les souches
d'Enterococcus faecium. La capacité de ces isolats à produire les amines biogènes a été
vérifiée; il a été observé que toutes les espèces d'Enterococcus faecium ont produit de la
tyramine et que toutes les espèces de Lactococcus lactis ont produit de la putrescine. Enfin,
une analyse de cluster des bactéries lactiques isolées, basée sur l'analyse de l'ensemble des
caractéristiques phénotypiques investiguées (n= 40), a été effectuée en utilisant une méthode
de groupe non pondéré avec moyenne arithmétique (UPGMA). Un dendrogramme a été
construit, montrant ainsi des distances entre les différents isolats. L'ensemble des résultats
obtenus permettent de montrer la grande diversité des bactéries lactiques indigènes qui
peuvent coloniser le lait de dromadaire et de dévoiler leurs performances technologiques pour
les intégrer dans l'industrie laitière.
Mots clés :
Lait de dromadaire ; bactéries lactiques ; diversité ; propriétés technologiques ; activité
protéolytique ; composés volatils ; culture starter ; amines biogènes.
II
Abstract
Biodiversity of 41 lactic acid bacteria isolates obtained from 12 Algerian raw camel's milk
samples, was determined by means of microbiological, biochemical, technological and
genetic methods. Based on their shape and fermented metabolism, 27 isolates, shaped as cocci
and homofermentative, were subdivided into 2 presumptive genera, Enterococcus (23
isolates) and Lactococcus (4 isolates); the 7 heterofermentative cocci isolates were considered
as Leuconostoc and the rods forms were assigned to Lactobacillus genus (7 isolates). The
molecular identification by sequencing the 16S rRNA and superoxide dismutase (SOD) genes
allow us to identify them as Enterococcus faecium (19 isolates), Enterococcus hirae (2
isolates), Lactococcus lactis (6 isolates), Leuconostoc mesenteroides (7 isolates) and
Lactobacillus rhamnosus (7 isolates). All the isolates were characterised by defining some
technological and safety traits. Their acidifying capability, lipolytic and proteolytic activities,
citrate's use and the production of both dextran and acetoin, showed the technological
potential of some isolates. The volatile compounds produced were assessed using gas
chromatography, where ethanol, acetaldehyde, acetate de methyl, acetoin and acetic acid were
the major substances produced by these camel’s milk lactic acid bacteria isolates. The ability
to acidify milk of 5 isolates representing each identified species was assessed by performing
an acidification kinetic during 48 h. The results showed that the strongest acidification was
obtained with the strain Lactococcus lactis with a final pH of 4.00, in contrast with the strain
of Leuconostoc mesenteroides which was considered as a weak acidifier, where the pH
reached a maximum value of 5.80. In addition, the antimicrobial activity of the tested isolates
was performed using the indirect method against six indicator strains, showing that
Enterococcus faecium isolates had the strongest activity. Moreover, their ability to produce
biogenic amines was verified; Enterococcus faecium and Lactococcus lactis isolates were
shown to produce tyramine and putrescine respectively. Finally, a cluster analysis based on all
the phenotypic characteristics tested (n=40) of all the isolated lactic acid bacteria was
determined using an unweighted group method, arithmetic average method, where a
dendrogram was built, showing that differences exist between the same species. All the
obtained results, reflected the large diversity source that camel's milk can be for the isolation
of indigenous lactic acid bacteria and their technological performances for further application
as fermentation cultures in the industrial dairy
Key words:
Camel's milk; lactic acid bacteria; diversity; technological properties; proteolytic activity;
volatile compounds; starter culture; biogenic amines.
III
Liste des abréviations
IV
Liste des figures
Figure 1 : Les deux espèces de Camelidae (a) : Camelus bacterianus, (b) : Camelus dromedarius . ... 3
Figure 2 : Aire de dispersion du genre Camelus dans le monde, (la couleur foncée indique une grande
population cameline). .............................................................................................................................. 5
Figure 3 : Aires de distribution du dromadaire en Algérie..................................................................... 6
Figure 4 : Localisation des principales races de dromadaires en Algérie .............................................. 8
Figure 5 : Arbre consensus, basé sur l’analyse comparative de l’ADN ribosomique (ADNr) montrant
les différents groupes phylogénétiques des bactéries lactiques à faible (GC%) et les genres Gram
positif non reliés Propionibacterium et Bifidobacterium ...................................................................... 24
Figure 6 : Principales voies métaboliques des bactéries lactiques ....................................................... 26
Figure 7 : Représentation schématique des principales voies de fermentation des hexoses chez les
bactéries lactiques.................................................................................................................................. 27
Figure 8 : Aperçu des voies générales de conversion des protéines pertinentes pour la formation
d'arômes dans les fermentations laitières .............................................................................................. 28
Figure 9 : Principales voies de dégradation des acides gras du lait durant sa fermentation ................. 29
Figure 10 : Utilisation industrielle des bactéries lactiques ................................................................... 31
Figure 11 : Voies de métabolisme du lactose chez les bactéries lactiques ........................................... 32
Figure 12 : Métabolisme du citrate chez les bactéries lactiques........................................................... 33
Figure 13 : Différentes approches moléculaires appliquées à l'écologie microbiennes des aliments .. 40
Figure 14 : Préparation des séries de dilutions au 1/10ème des échantillons de lait de dromadaire pour
isolement de bactéries lactiques. ........................................................................................................... 47
Figure 15 : Schéma résumant la technique de conservation longue durée des isolats purifiés. ........... 48
Figure 16 : Courbe d'étalonnage de la glycine pour l'évaluation de l'activité protéolytique par les
bactéries lactiques par la méthode spectrophotométrique OPA. ........................................................... 54
Figure 17 : Schéma du protocole appliqué pour l'étude de la cinétique d'acidification en culture pure
dans le lait écrémé. ................................................................................................................................ 58
Figure 18 : Schéma du protocole appliqué pour l'étude de la cinétique de croissance des bactéries en
culture pure dans le lait écrémé. ............................................................................................................ 60
Figure 19 : Aspect des colonies en milieu solide. ................................................................................ 66
Figure 20 : Aspect de la culture en milieu liquide (A : Cocci, B : bâtonnets)...................................... 66
Figure 21 : (A) : Petites cellules arrondies associées en diplocoques, (B) : Cellules ovoïdes associées
en diplocoques, (C) : Bâtonnets regroupés en chainettes courtes.......................................................... 67
Figure 22 : Croissance des isolats de bactéries lactiques dans differents conditions de cultures, (A) :
Croissance en milieu hypersalé 6,5 %, (B) : Croissance à pH 9,6. ....................................................... 68
Figure 23 : Croissance des isolats de bactéries lactiques dans différentes conditions de cultures, (A) :
types fermentaires, (B) : hydrolyse de l'arginine. .................................................................................. 68
Figure 24: Bandes électro-phorétiques de 1500 pb correspondant au poids moléculaire de l'ADN des
bactéries lactiques (exemple des espèces de Lactococcus lactis).......................................................... 69
Figure 25: Distribution des différentes espèces de bactéries lactiques isolées à partir du lait cru de
dromadaire et identifiées génotypiquement (méthode ARNr 16S). ...................................................... 69
Figure 26 : Cinétique d'acidification de la souche Lactococcus lactis LEY6 durant une période de
18h. ........................................................................................................................................................ 75
Figure 27 : Coagulation du lait écrémé par 3 souches de Lactococcus lactis après 18 h d'incubation au
bain-marie à 32 °C................................................................................................................................. 75
Figure 28 : Activité protéolytique sur milieu PCA additionné de 2 % de lait écrémé stérile chez 4
espèces de Lactococcus lactis testées (LEY8, LEY11, LEY12, LEY13). ............................................ 78
Figure 29 : Activité protéolytique des souches de bactéries lactiques isolées à partir du lait cru de
dromadaire déterminée par la méthode spectrophotométrique OPA..................................................... 80
Figure 30 : Activité lipolytique chez les espèces de Leuconostoc mesenteroides (LEY1, LEY2, LEY3,
LEY4, LEY9 et LEY10). ...................................................................................................................... 81
Figure 31 : Activité lipolytique chez 6 espèces d'Enterococcus faecium (LMA6, LMA7, LMA8,
LMA9, LMA10 et LMA11). ................................................................................................................. 82
Figure 32 : Production de dextrane par 2 espèces de Leuconostoc mesenteroides LEY1 (dextrane -),
LEY2 (dextrane +)................................................................................................................................. 82
V
Figure 33 : Utilisation du citrate dans un milieu synthétique KMK par des espèces de Lactococcus
lactis (LEY12 et LEY13) et des espèces de Lactobacillus rhamnosus (LEY14, LEY15, LEY16). ..... 84
Figure 34 : Production d'acétoïne dans le milieu Clarck et Lubs par les souches (A) : Leuconstoc
mesenteroides (LEY10), (B) : Enterococcus faecium (LMA5), (C) : Lactobacillus rhamnosus
(LEY17). ............................................................................................................................................... 86
Figure 35: Cinétique de croissance et d'acidification (évolution du pH et de l'acidité Dornic) de
l'espèce Leuconostoc mesenteroides (LEY5) dans du lait écrémé stérile UHT. ................................... 90
Figure 36: Cinétique de croissance et d'acidification (évolution du pH et de l'acidité Dornic) de
l'espèce Lactobacillus rhamnosus (LEY15) dans du lait écrémé stérile UHT. ..................................... 90
Figure 37: Cinétique de croissance et d'acidification (évolution du pH et de l'acidité Dornic) de
l'espèce Lactococcus lactis (LEY12) dans du lait écrémé stérile UHT. ................................................ 91
Figure 38: Cinétique de croissance et d'acidification (évolution du pH et de l'acidité Dornic) de
l'espèce Enterococcus faecium (LMA9) dans du lait écrémé stérile UHT. ........................................... 91
Figure 39: Cinétique de croissance et d'acidification (évolution du pH et de l'acidité Dornic) de
l'espèce Enterococcus hirae (LMA18) dans du lait écrémé stérile UHT. ............................................. 91
Figure 40: Activité antimicrobienne de 6 souches d'Enterococcus faecium (LMA1, LMA2, LMA4,
LMA5, LMA6, LMA7) contre Listeria innocua CECT 910T. .............................................................. 97
Figure 41: Activité antimicrobienne de 3 souches d'Enterococcus faecium (LMA1, LMA5, LMA6
(A), et de 3 souches de Lactobacillus rhamnosus (LEY15, LEY16, LEY20) (B), contre la souche
indicatrice Lactobacillus sakei CECT 906T. ......................................................................................... 97
Figure 42: Dendrogramme obtenu à partir de l'analyse de cluster basé sur la comparaison de 40
caractères phénotypiques des 41 souches de bactéries lactiques isolées à partir du lait cru de
dromadaire algérien. ............................................................................................................................ 100
Figure 43: Chromatogramme UHPLC d'une solution standard (1 mM) d'amino-énones dérivés
d'acides aminés, des ions ammonium et amines biogènes à 280 nm. .................................................. 136
Figure 44: Chromatogramme de tyramine produite par la souche Enterococcus faecium LMA1. .... 137
Figure 45: Chromatogramme de putrescine produite par la souche Lactococcus lactis LEY13........ 137
Figure 46: Exemple de la souche Leuconostoc mesenteroides LEY9 non productrices d'amines
biogènes. .............................................................................................................................................. 138
VI
Liste des tableaux
VII
Introduction générale
Introduction générale
Dans ces régions, on estime que la production du lait camelin, appelé également "or
blanc du désert" (Kula, 2016), varie de 4 à 14 kg avec un maximum de 19 kg par dromadaire
laitière par jour (Boudjenah-Haroun et al., 2012). Ce produit est considéré non seulement
comme un aliment essentiel du fait qu’il couvre une part substantielle des besoins
nutritionnels quantitatifs et qualitatifs des populations, mais parce qu’il est aussi utilisé
comme un remède contre divers maladies (Konuspayeva et al., 2004, Kula, 2016). Dans le but
de bénéficier de ses vertus avérées ou supposées, le lait de dromadaire est principalement
consommé par la population locale à l'état cru ou fermenté spontanément.
Jusqu'à ce jour, l'application la plus importante des BL est d'en faire des cultures
starter permettant la production d'aliments fermentés en particulier dans l'industrie laitière.
L'addition directe de cultures starters sélectionnées aux matières premières a constitué une
avancée décisive dans le traitement des aliments fermentés, ce qui a permis un contrôle élevé
du processus de fermentation et une standardisation du produit final. Une estimation récente
1
Introduction générale
Ainsi le lait camelin, à l'instar du lait bovin ou caprin, pourrait constituer une source
supplémentaire d'espèces de BL (Abu-Tarboush, 1994, Khedid et al., 2009, Quigley et al.,
2013). Ces BL indigènes, à qui on attribue un statut d'innocuité les rendant comme sûrs (statut
GRAS), peuvent être isolées et caractérisées à travers leur utilisation en tant que cultures
starter pour l'élaboration de produits sains et de haute qualité. Leur caractérisation est
principalement centrée sur leurs potentiels technologiques tels que l'activité protéolytique,
leur pouvoir acidifiant et de production de divers produits d'intérêt comme les substances
antimicrobiennes, les composés aromatiques et texturisant (Kihal et al., 1996, Benmechernene
et al., 2013, Zarour et al., 2018, Benhouna et al., 2019, Ouiddir et al., 2019). La présence de
gènes considérés comme des caractères potentiellement pathogènes, telle que la capacité à
produire des hémolysines doit être testée avant son utilisation en tant que culture starter. En
outre la production de composés toxiques tels que les amines biogènes (BA), en particulier
dans le cas des produits fermentés, devrait également être un critère d'élimination des BL
productrices (Linares et al., 2012, Ladero et al., 2015).
Dans le but d'apporter plus de connaissances sur les BL présents dans le lait de
dromadaire, le présent travail a été entrepris avec l'objectif de :
2
Rappel bibliographique
Rappel bibliographique
Le nom dromadaire dérive du grec ancien "dromados", génitif de dromas, qui signifie
"qui court", pour leur utilisation dans le transport (Lhoste et al., 1993). Le dromadaire
appartient au genre Camelus et à la famille des Camelidae. La famille des Camelidae ne
comprend que deux genres : Camelus et Lama. Le genre Camelus occupe les régions
désertiques de l’Ancien Monde (Afrique, Asie et Europe) alors que le genre Lama est
spécifique des déserts d’altitude du Nouveau Monde (les Amériques) où il a donné naissance
à quatre espèces distinctes. Faye (1997) a signalé que les Camelidae d’Asie, confrontés au
froid et à l’aridité comme dans le désert de Gobi, évoluèrent en chameau à deux bosses : le
chameau de Bactriane Camelus bacterianus (Fig. 1a) et ceux qui se déplacèrent dans les
régions chaudes et arides, Afrique et Moyen-Orient, et qui évoluèrent en chameau à une bosse
: le dromadaire Camelus dromedarius (Fig. 1b).
a b
Figure 1 : Les deux espèces de Camelidae (a) : Camelus bacterianus, (b) : Camelus dromedarius
(Kadim et Mahgoub, 2004).
Les dromadaires d’Algérie appartiennent à la famille des Camelidae, qui sont des
mammifères artiodactyles d'origine nord-américaine, mais qui ont disparu de ce continent
alors qu'ils se répandaient en Amérique du Sud, en Asie, puis en Afrique, continents où ils ont
survécu pour donner naissance aux espèces modernes.
3
Rappel bibliographique
Taxonomie
Règne Animal
Embranchement Vertébrés
Classe Mammifères
Sous classe Placentaires
Ordre Artiodactyles
Sous ordre Tylopodes
Famille Camelidae
Genre Camelus
Espèce Camelus dromedarius
L'élevage camelin occupe une place importante dans le monde. Un total de 25,89
millions de chameaux a été estimé dans le monde par la FAO où 89 % de cette population
4
Rappel bibliographique
sont représentés par les dromadaires à une seule bosse alors que le reste est représenté par les
chameaux à deux bosses (Kula, 2016). (Fig. 2)
Figure 2 : Aire de dispersion du genre Camelus dans le monde, (la couleur foncée indique une grande
population cameline).
(FAO, 2009) (Boussouar, 2017).
L’élevage du dromadaire dans le monde est orienté vers son utilisation pour le
transport, la production de viande, de peau et surtout de lait (Gizachew et al., 2014). En
Algérie, l'élevage du dromadaire est surtout orienté vers la production laitière. Le lait produit
est généralement consommé à l’état cru ou fermenté, ou sert pour sevrer les jeunes chamelons
(Boudjenah-Haroun et al., 2012).
5
Rappel bibliographique
Les différentes races camelines rencontrées en Algérie se retrouvent dans les trois pays
d'Afrique du Nord (Maroc, Algérie, Tunisie) ; ce sont des races de selle, de bât et de traite,
leur répartition est indiquée dans la figure 4, Il s'agit des races suivantes :
La race Chaambi. Un dromadaire médialigne, possédant une grande musculature et un fort
squelette osseux, avec des poils de couleur foncée. Il est très bon pour le transport mais
moyen pour la selle. Sa répartition va du grand erg occidental au grand erg oriental. On le
retrouve aussi dans le Metlili des Chaambas (Ben-Aissa, 1989, Titaouine, 2006).
La race Ouled Sidi Cheikh. C'est un dromadaire adapté aussi bien au sol caillouteux qu’au
sol sableux. C’est un animal de selle ou de bât. Il est assez grand, sa taille variant entre 1,80 m
et 1,83 m. On le trouve dans les hauts plateaux du grand erg occidental (Titaouine, 2006).
6
Rappel bibliographique
La race Sahraoui. C’est un dromadaire issu du croisement de Chaambi et Ouled Sidi Cheikh.
Dur et résistant, c’est un excellent Méhari de troupe ; son territoire va du grand erg occidental
au centre du Sahara (Titaouine, 2006).
La race Ait Khebbach. C’est un dromadaire bréviligne de taille moyenne. C’est un animal de
bât puissant et robuste. Il est présent dans l'aire Sud-ouest (Titaouine, 2006).
Le dromadaire de la Steppe. C’est un dromadaire commun, petit bréviligne. Il est utilisé
pour le nomadisme rapproché. On le trouve aux limites Sud de la steppe (Titaouine, 2006).
La race Targui ou race des Touaregs du Nord. Les dromadaires Targuis sont des animaux
habitués aussi bien aux escarpements arides du Tassili et du Massif central du Hoggar, qu’aux
sables. Leur taille dépasse généralement les 2 m. C'est un excellent Méhari, animal de selle
par excellence souvent recherché au Sahara comme reproducteur. Il est réparti dans le Hoggar
et le Sahara Central, on le retrouve aussi dans d'autres pays tels que le Niger et le Mali
(Titaouine, 2006).
La race Berberi. Très proche du Chaambi et du Ouled Sidi Cheikh, c’est un dromadaire de
forme fine, avec une arrière main bien musclée, rencontré surtout dans les zones sahariennes
et telliennes (Titaouine, 2006).
La race Ajjer. Dromadaire bréviligne de petite taille adapté à la montée. Bon marcheur est
utilisé pour le transport et le tourisme. Il est présent dans le Tassili d'Ajjer (Titaouine, 2006).
La race Reguibi. Ce dromadaire se trouve dans l’ouest saharien. C'est un animal d'assez
grande taille, bien adapté à la course. (Ben-Aissa, 1989, Titaouine, 2006).
La race Aftouth. Il est utilisé comme un dromadaire de trait et de bât. On le trouve dans la
région de Tindouf et Bechar. Le terme Aftouth est un terme générique qui regroupe plusieurs
types de dromadaires de la région du Sahara occidental et se caractérise par une grande
variété de la couleur de robe allant de jaune clair à presque noir (Ben-Aissa, 1989, Titaouine,
2006).
7
Rappel bibliographique
Le lait de dromadaire est mousseux quand on le secoue légèrement car il renferme des
quantités plus importantes de composant-3 des protéose-peptones par rapport au lait bovin.
Cette glycoprotéine lacto-sérique native est un bon agent tensioactif, ayant aussi un rôle
comme agent inhibiteur de la lipolyse spontanée du lait (Siboukeur, 2007, Al Kanhal, 2010).
8
Rappel bibliographique
Les données de la littérature ont montré une large gamme de variations dans la
composition du lait de dromadaire en raison de divers facteurs saisonniers et
environnementaux ainsi que du stade de lactation, de l'âge et du nombre de vêlages (Musaad
et al., 2013), avec néanmoins des teneurs importantes et équilibrées en nutriments de base que
sont les protéines, la matière grasse et le lactose (Tab. 2), avec des proportions plus ou moins
similaires au lait de vache.
Tableau 2: Teneur en % des différents composants du lait de dromadaire par rapport au lait
de vache (El-Agamy, 2006).
9
Rappel bibliographique
protéines totales, 4,46 ± 1,03 pour le lactose, 12,47 ± 1,53 pour la matière sèche et 0,79 ± 0,09
pour les cendres (Konuspayeva et al., 2009).
10
Rappel bibliographique
11
Rappel bibliographique
cette dernière dans le lait camelin sont rapportées, il n’en demeure pas moins que les teneurs
signalées sont en moyenne trois fois plus élevées que celles présentes dans le lait de vache (Al
Kanhal, 2010).
Différents essais ont été entrepris notamment en Algérie pour pouvoir préparer des
fromages à partir du lait de dromadaire. Des études ont montré une meilleure aptitude à la
coagulation du lait camelin sous l'effet des enzymes gastriques extraites d'estomacs du jeune
dromadaire (Boudjenah-Haroun et al., 2012).
Parmi les produits dérivés traditionnels du lait de dromadaire on peut citer les laits
fermentés (Gariss, Shubat, Tarag, Kefir, Dahi), la poudre de lait et certains beurres (Khoa,
12
Rappel bibliographique
Rabbri) et fromages artisanaux (Domiati, Afig) (Mehaia, 2006, Mohamed et al., 2013, Asresie
et Adugna, 2014)
Récemment, Alhaj et al. (2018) ont indiqué que le lait de dromadaire fermenté avec
Lactobacillus acidophilus ou helveticus et avec le Streptococcus thermophilus par rapport au
lait de dromadaire non fermenté pouvait inhiber la croissance cellulaire de Bacillus cereus,
Salmonella typhimurium et Staphylococcus aureus pendant une durée de conservation de 15
jours.
Salami et al. (2010) ont montré que la protéolyse limitée des protéines du
lactosérum de dromadaire entraînait une amélioration plus significative de l'activité
antimicrobienne. Kumar et al. (2016) ont également signalé que des protéases telles que
13
Rappel bibliographique
15
Rappel bibliographique
16
Rappel bibliographique
l'apoptose du côlon, ainsi que par la diminution des stress oxydatifs induits par les principales
espèces d'oxygène réactif (ROS) et d'azote (RNS) peut agir comme un complément très
efficace pour atténuer les maladies inflammatoires de l'intestin. En général, les effets anti-
inflammatoires du lait de dromadaire fermenté et non fermenté, sont principalement dus à la
teneur élevée en LF, en vitamine C et en peptides bioactifs (Al Juboori et al., 2013, Habib et
al., 2013).
Redwan and Tabll (2007) ont prouvé que par rapport aux LF humaines et bovines, la
LF du lait de dromadaire avait une capacité antivirale plus forte pour inhiber l'entrée du virus
de l'hépatite C dans les globules blancs. El‑Fakharany et al. (2017) ont également indiqué que
le lait de dromadaire entier avait une efficacité in vivo élevée contre le virus de l'hépatite C en
réduisant la charge virale sérique d'individus infectés et en modifiant le profil d'isotype IgG
en cellule T helper de type 1 (Th1). Ibrahim et al. (2017) ont constaté que l'alimentation
combinée à base de lait de dromadaire et d'huile d'olive extra vierge, améliorait nettement la
toxicité induite par l'effet analgésique du paracétamol dans le foie.
Ces dernières années, le nombre d’études sur les effets anticancéreux du lait de
dromadaire fermenté et non fermenté a considérablement augmenté. Badawy et al. (2018) ont
décrit les effets anticancéreux in vitro et in vivo du lait de dromadaire frais et de ses exosomes
sur les cellules cancéreuses du sein MCF-7 via la voie de l'apoptose et la prévention du stress
oxydatif / inflammatoire, de l'angiogénèse et métastases dans les modèles tumoraux.
Krishnankutty et al. (2018) ont également expliqué que la LF du lait camelin avait un puissant
effet antiprolifératif sur les cellules cancéreuses colorectales (HCT-116) et du sein (MCF-7)
chez l'humain en induisant la mort par autophagie.
Shariatikia et al. (2017) ont comparé l'efficacité anticancéreuse des laits issus de
différents ruminants (dromadaires, vaches, moutons, chèvres, juments et ânes) et leurs
protéines constitutives. Selon l'effet anti-prolifération contre la lignée cellulaire MCF-7, ils
ont déduit que le lait de dromadaire, ainsi que le lait de jument et d'ânesse, sont des produits
anticancéreux prometteurs pour le traitement des cellules cancéreuses du sein. L’effet de la
prolifération in vitro du lait de dromadaire liquide et lyophilisé sur les lignées cellulaires du
cancer de l’hépatome humain (HepG2) et du sein (MCF-7 et BT-474) a été étudié (Korashy et
al., 2012, Hasson et al., 2015). Les résultats ont révélé que le lait camelin, en augmentant
l'activité d'expression génique de l'ARNm de la caspase-3, et également l'expression des
17
Rappel bibliographique
récepteurs de la mort dans les cellules cancéreuses, pourrait empêcher la prolifération des
cellules HepG2, MCF-7 et BT-474. Ayyash et al. (2018) ont examiné l'activité anticancéreuse
in vitro du lait de dromadaire et du lait de vache fermentés par l'inocula unique de souches
probiotiques de Lactococcus lactis KX881782 et Lactobacillus acidophilus DSM9126. Les
résultats ont montré que le lait camelin fermenté par Lactococcus lactis KX881782 avait le
potentiel antiprolifératif maximum contre les cellules Caco-2 (cellules du cancer du côlon),
HELA (lignée cellulaire cervicale) et MCF-7. Une forte association entre l'activité
anticancéreuse et la capacité de piégeage de DPPH˙ dans cette étude a montré que les peptides
bioactifs dérivés du lait de dromadaire fermenté par Lactobacillus acidophilus DSM9126 sont
responsables de l'activité antiproliférative.
En général, l'allergie alimentaire, en tant que trouble nutritionnel croissant, est une
réponse anormale à médiation immunologique aux aliments (Kaskous, 2016). Cette allergie
courante peut sérieusement entraîner des réactions anaphylactiques bénignes, voire mortelles,
chez les enfants et les adultes. L’allergie aux protéines de lait de vache (APLV), principale
allergie alimentaire chez les nourrissons et les enfants, induit des réactions d’hypersensibilité
de type I induites par les IgE et améliore le processus de dégranulation des mastocytes. Ce
phénomène entraîne la libération de médiateurs inflammatoires tels que l'histamine, la 5-
hydroxytryptamine (5HT) et la prostaglandine E2 (PGE2), susceptibles d'intensifier
considérablement la sécrétion de Cl- des cellules épithéliales dans l'intestin (Swar, 2011).
Beaucoup d’efforts ont été faits récemment pour trouver des solutions ou des solutions de
rechange pour surmonter ce problème. Remplacer le lait de vache par des laits formulés avec
des protéines de soja ou des protéines de lait entièrement hydrolysées en plus de nourrir les
enfants avec d'autres types de lait tels que les laits de brebis, de chèvre, de buffle, d'ânesse et
de jument ont été les premières étapes pour éliminer ce problème nutritionnel. Cependant,
l’existence d’allergies secondaires avec l’absorption de protéines de soja (Zeiger et al., 1999),
ainsi que les réactions immunologiques croisées entre les protéines présentes dans le lait de
vache et d’autres types de lait ont amené les chercheurs à rechercher des alternatives plus
sûres et meilleures (El-Agamy et al., 2009).
18
Rappel bibliographique
al., 2010, Ehlayel et al., 2011, Abderrahmane et al., 2015, Navarrete-Rodríguez et al., 2018).
Ils ont signalé qu'il n'existait aucune similitude immunologique entre les protéines présentes
dans le lait de vache et le lait de dromadaire, de sorte que les IgE des enfants plus sensibles
aux protéines du lait bovin ne réagissaient pas avec le lait camelin. Il n'y a pas de β-
lactoglobuline dans le lait camelin, qui est considéré comme un allergène majeur dans le lait
de vache (Gizachew et al., 2014). De plus, la présence d’immunoglobulines similaires dans le
lait maternel et le lait de dromadaire peut potentiellement réduire les réactions allergiques
chez les enfants (Shabo et al., 2005, Boughellout et al., 2016). Abderrahmane et al. (2015)
ont évalué la digestion gastro-intestinale in vitro des protéines de lactosérum du lait de
dromadaire et du lait de vache. Il a été confirmé que les protéines de lactosérum au lait de
dromadaire présentaient une meilleure digestibilité, en raison du degré d'hydrolyse plus élevé
et de la longueur plus courte des chaînes peptidiques. Par conséquent, le lait de dromadaire
sous une forme originale et modifiée peut être donné aux nourrissons et aux enfants sensibles
au lait de vache.
De nos jours, il est révélé que l’utilisation de régimes alimentaires sains et fonctionnels
permet aux enfants atteints de trouble autistique de mieux se comprendre et d'améliorer leur
qualité de vie. Par conséquent, trouver les stratégies nutritionnelles appropriées pour préparer
les meilleurs aliments dotés d'attributs sensoriels attrayants tels que le goût, l'odorat, la
couleur et la texture peut jouer un rôle clé dans la promotion des capacités de communication
et des capacités cognitives et sociales des enfants autistes. Selon les données de base obtenues
comprenant l’échelle d’évaluation du traitement de l’autisme (ATEC), des évaluations
récentes de l’autisme (CARS), de la réactivité sociale (SRS), de récentes études ont montré
que la consommation quotidienne de lait de dromadaire avait un effet thérapeutique dans
l'amélioration du comportement autistique chez les enfants (Shabo et Yagil, 2005, Wernery et
al., 2012, Al-Ayadhi et Elamin, 2013, Al-Ayadhi et al., 2015, Hamzawy et al., 2018). Les
résultats du traitement du syndrome de l'autisme avec du lait camelin se sont avérés
prometteurs et intéressants. Dans l’ensemble, l’état de santé des enfants autistes après sa
consommation s’est considérablement amélioré. Dans certains cas, la disparition complète du
comportement autistique a été détectée et, dans d'autres cas, il y a eu une réduction partielle
significative des symptômes de la maladie, de sorte que les enfants autistes se comportent de
manière moins destructive, plus productive et plus silencieuse, avec une meilleure manière
communicative, émotionnelle et sociale.
19
Rappel bibliographique
Adams (2013) a rapporté que la consommation régulière de lait camelin cru pendant
six années consécutives pourrait considérablement améliorer les symptômes de l'autisme chez
un garçon américain de 9 ans atteint du syndrome. Al-Ayadhi et al. (2015), se basant sur la
comparaison des données CARS, SRS et ATEC avant et après 14 jours de traitement au lait
de dromadaire brut chez 65 enfants âgés de 2 à 12 ans atteints d'autisme, ont révélé qu'un
apport alimentaire au lait camelin avait un effet substantiel sur certains patients avec un
comportement autistique. Le traitement du comportement autistique avec la consommation
quotidienne de lait de dromadaire pendant six jours chez des rats autistes induits par l'acide
valproïque a été récemment évalué (Hamzawy et al., 2018), ils ont montré que la
consommation régulière de lait de dromadaire pouvait potentiellement améliorer les
symptômes de l'autisme, en ajustant les voies inflammatoires et apoptotiques. Ce fait a révélé
que les effets thérapeutiques du lait de dromadaire sur la réduction des symptômes de
l'autisme sont étroitement liés aux composants antioxydants et aux protéines protectrices
telles que la LF dans la structure du lait camelin. Al-Ayadhi et Elamin (2013) ont souligné
que l'utilisation du lait camelin peut augmenter de manière significative les niveaux de
glutathion, de superoxyde dismutase (SOD) et de myéloperoxydase. On peut en conclure que
la présence de quantités élevées d'enzymes anti-oxydantes (par exemple, la LF) et
d'antioxydants non enzymatiques (par exemple, les vitamines C et E et le glutathion) dans le
lait de dromadaire joue un rôle important dans l'amélioration du comportement des enfants
atteints d'autisme. De plus, la présence de certains minéraux tels que le Zn et le Mg dans le
lait de dromadaire impliqués dans l'amélioration du pouvoir antioxydant est bien connue. Des
concentrations élevées de Mg peuvent diminuer le stress oxydatif en augmentant le taux
d'absorption des vitamines anti-oxydantes C et E, tandis que le Zn augmente la concentration
totale de glutathion, de SOD et de glutathion peroxydase dans les systèmes biologiques
(Ashwood et al., 2011, Al-Ayadhi et Elamin, 2013).
20
Rappel bibliographique
Tableau 6: Utilisation du lait camelin cru comme agent thérapeutique dans certaines maladies
(Dubey et al., 2016).
Traitement contre les maladies Molécules impliquées
Diabète Insuline comme molécule (Nano-bodies)
Virus de l'hépatite C Amylase et Lactoferrine
Allergie Faible teneur en β-caséine et absence de β-
lactoglobuline
Fonction hépatique et rénale Alanine amino-transférase et aspartate amino-
transférase
Propriétés minceur Faible teneur en protéines en en cholestérol
Infections bactériennes Lysozyme et lactoperoxidase
Suppléments nutritionnels Acides gras insaturés
Renforcement du système immunitaire Reconnaissance du peptidoglycane
Carence en lactate et assimilation facile L-lactate
Formation osseuse Taux élevé en Calcium
La diarrhée Taux élevé en sodium et potassium
21
Rappel bibliographique
Par définition les BL sont des cellules à Gram positif, sous forme de coques, bâtonnets
ou coccobacilles. Ces cellules sont généralement immobiles, non-sporulées et micro-
aérophiles ou anaérobies. Elles ne possèdent ni catalase, ni nitrate réductase, ni cytochrome-
22
Rappel bibliographique
Les BL dont le nom en est lui même évocateur, ont pour caractéristique commune et
emblématique la production d'acide lactique, souvent associée aux fermentations alimentaires.
Leur capacité d'utiliser plusieurs sources carbonées conduit à la formation de l'acide lactique
comme seul produit final si elles sont homofermentaires (voie d'Embden Meyerhof-Parnas)
ou à la synthèse de CO2, d'acide acétique et d'éthanol en plus de l'acide lactique dans le cas où
ces bactéries entreprennent la voie dite hétérofermentaire ou hétérolactique connue aussi
comme la voie du 6-phosphogluconate ou encore la voie des hexose mono-phosphates.
Dans les premiers temps la taxonomie des BL reposait sur des caractéristiques
morphologiques et physiologiques. La première définition technique, par Orla-Jensen (1919),
a reconnu les BL comme des cocci ou des bâtonnets à Gram positif, non sporulant, non
mobiles et capables de cataboliser les sucres en acide lactique. Ces critères de classification
ont conduit à une large définition des BL comprenant diverses bactéries. La taxonomie des
BL a été révolutionnée en introduisant la phylogénie moléculaire basée sur la séquence des
ARN ribosomiques qui a conduit à une reclassification importante de certaines espèces et
sous-espèces. Plusieurs méthodes génotypiques, basées sur les acides nucléiques, sont
utilisées en classification, tel que le pourcentage en GC qui est retenu comme un élément
principal dans la répartition des BL (König et Fröhlich, 2017), les BL ayant une faible teneur
en GC (-50 mol %), tandis que certaines lactobacilles atteindraient jusqu'à 57 mol % (Sun et
al., 2015).
Selon les dernières revues sur la taxonomie des BL (Fig. 5), ceux-ci appartiennent au
Règne des Bacteria, Phylum: Firmicutes, Classe: Bacilli, Ordre: Lactobacillales, renfermant 6
familles avec 38 genres et plus de 400 espèces (Vandamme et Peeters, 2014). Les genres de
BL considérés comme les plus communs sont Lactobacillus, Lactococcus, Streptococcus,
Enterococcus, Pediococcus, Leuconostoc, Oenococcus, Vagococcus, Tetragenococcus,
Carnobacterium et Weissella. Les familles Bifidobacteriaceae et Propionibacteriaceae
partagent la même caractéristique principale des BL qui est la production de l'acide lactique.
23
Rappel bibliographique
Tableau 8: Classification des grands groupes des bactéries lactiques (Stiles et Holzapfel,
1997, Carr et al., 2002).
Nitrate
Famille Formes Catalase Fermentation Genres bactériens
réductase
Lactobacillus
Betabacterium Bacille - - Hétérofermentaire
Weissella
Thermobacterium Bacille - - Homofermentaire Lactobacillus
Lactobacillus
Streptobacterium Bacille - - Homofermentaire
Carnobacterium
Streptococcus
Enterococcus
Streptococcus Coque - - Homofermentaire
Lactococcus
Vagococcus
Leuconostoc
Betacoccus Coque - - Hétérofermentaire Oenococcus
Weissella
Pediococcus
Tetracoccus Coque + + Homofermentaire
Tetragenococcus
Bifidobacteria polymorphe - - Homofermentaire Bifidobacterium
Figure 5 : Arbre consensus, basé sur l’analyse comparative de l’ADN ribosomique (ADNr) montrant
les différents groupes phylogénétiques des bactéries lactiques à faible (GC%) et les genres Gram
positif non reliés Propionibacterium et Bifidobacterium
(Holzapfel et al., 2001).
24
Rappel bibliographique
Tableau 9: Les bactéries lactiques isolées du lait cru de dromadaire et des produits fermentés
(Senouci, 2018).
L'utilisation des sucres et le métabolisme des sources azotées dans les produits
alimentaires par les BL sont considérés comme étant des événements biochimiques très
importants dans le développement des caractères organoleptiques et texturaux d'un aliment
donné d'où leur implication en industrie agro-alimentaire. Par ailleurs, la production d'acides
organiques dans les aliments assure ainsi un abaissement du pH et crée un milieu défavorable
pour la majorité des bactéries pathogènes. La synthèse de composés volatiles et aromatiques
avec élaboration de polymères de sucres déterminent elle aussi un certains nombres de
caractères sensoriels et rhéologiques désirés dans les produits alimentaires. La figure 6
montre les principales voies métaboliques des BL.
25
Rappel bibliographique
Les sucres représentent la principale source de carbone et d'énergie chez les BL. Au
cours de la cette fermentation, il ya production d'acide lactique. Ce métabolisme chez les BL
s'effectue selon la voie homolactique ou hétérolactique (Fig. 7), conduisant ainsi à une
diminution du pH par la production d'acides organiques.
Les BL transportent le glucose contenu dans les aliments et les milieux de culture à
l'intérieur de la cellule à travers des systèmes spécifiques comme le système phospho-
transférase (PTS) ou les perméases multiples (Georges et François-Marie, 2008). Cependant
en l'absence de sucres fermentescibles, ces BL maintiennent leur croissance grâce à des acides
organiques tels que le citrate (Dudley et Steele, 2005), les carbones dérivés de l'hydrolyse des
macro-peptides et des caséines laitières ou même les pentoses issus de la lyse d'autres
bactéries (Settanni et Moschetti, 2010).
Dans l'industrie laitière, l'acidification laitière joue de multiples rôles participant ainsi :
à la coagulation du lait, activant la synérèse du caillé et à la solubilisation du calcium
micellaire influençant la texture des fromages. Elle contribue aussi aux qualités
organoleptiques des produits fermentés et inhibe la croissance des microorganismes nuisibles.
Selon la variété du fromage et de la flore présente, les produits issus de la glycolyse peuvent
26
Rappel bibliographique
être métabolisés selon différentes voies pour la formation de divers composés aromatiques
(McSweeney et Sousa, 2000).
Figure 7 : Représentation schématique des principales voies de fermentation des hexoses chez les
bactéries lactiques (Caplice et Fitzgerald, 1999).
Figure 8 : Aperçu des voies générales de conversion des protéines pertinentes pour la formation
d'arômes dans les fermentations laitières
(Smit et al., 2005).
Tel que rapporté par Montel et al. (1998), les estérases et les lipases microbiennes sont
des enzymes intracellulaires dont l'activité est maximale pendant la phase exponentielle de la
croissance bactérienne et dépend des milieux de culture. Il a été observé que les milieux à
base de lait stimulaient la production de ces enzymes chez les lactocoques et que l'addition du
glutathion augmentait l'activité estérasique des sous espèces lactis et cremoris avec une plus
grande activité pour cette dernière. Les estérases des bactéries lactiques hydrolysent
préférentiellement les substrats estérifiés avec des acides gras à chaîne courte, mais avec des
spécificités différentes, caractéristiques des souches.
Figure 9 : Principales voies de dégradation des acides gras du lait durant sa fermentation
(McSweeney et Sousa, 2000).
29
Rappel bibliographique
Les BL ont été parmi les premières bactéries étudiées en raison de leur implication
dans les fermentations alimentaires ainsi que dans la santé humaine. Elles ont bénéficié d'une
attention précoce des scientifiques aboutissant à un premier isolement d'une culture
bactérienne pure Bacterium lactis par Lister en 1873. L'utilisation de ferments lactiques pour
la production de fromage et de lait caillé a été introduite presque simultanément par
Weigmann (Stiles et Holzapfel, 1997), mais les premières preuves de fermentation impliquant
fort probablement des BL, remontent à 7000 ans avant J.-C. Elles consistent en la découverte,
principalement en Egypte, en Mésopotamie et dans le bassin méditerranéen, d'ustensiles et de
contenants ayant servi à la fabrication de produits laitiers fermentés. De nombreux documents
et monuments historiques font référence à la production de fromage, de yaourt et de beurre
(Muñoz et al., 2010), leur assurant un statut communément appelé GRAS (Generelly
Recongnized As Safe).
30
Rappel bibliographique
L'acidification constitue le rôle principal des BL utilisés comme ferments ayant pour
but: (i) la coagulation du lait (en facilitant l'action de l'enzyme de la présure) et l'augmentation
de la synérèse du caillé, (ii) la participation aux propriétés rhéologiques du produit final, (iii)
l'inhibition de la croissance des nuisibles (Papamanoli et al., 2003).
Dans le lait, la principale source de sucre est le lactose. C'est un disaccharide, composé
de glucose et de galactose, dont la dégradation conduit à la production d'énergie
intracellulaire et d'acide lactique. L'évolution des concentrations en lactose et en acide
lactique est variable suivant le type de pâte et la flore microbienne utilisée.
31
Rappel bibliographique
32
Rappel bibliographique
Le métabolisme du citrate par les BL (Fig. 12) commence par son transport à
l'intérieur de la cellule à travers une citrate perméase. Une fois à l'intérieur, il est transformé
en oxaloacétate et en acétate par une citrate lyase. L'oxaloacétate est par la suite converti en
CO2 et en pyruvate par l'enzyme oxaloacétate déhydrogénase (OADH). La formation de l'α-
acétolactate est effectuée en 2 réactions distinctes catalysées par l'enzyme α-acétolactate
synthase (ALS). Avec la thiamine pyrophosphate (TPP) agissant à titre de coenzyme, une
molécule de pyruvate est d'abord décarboxylée, formant l'hydroxyéthyl-TPP ou acétaldéhyde
actif. Cet intermédiaire réagit ensuite avec une seconde molécule de pyruvate, assurant la
formation d'α-acétolactate décarboxylase (ALD) ou de façon oxydative en diacétyle.
L'acétoïne et le diacétyle produits peuvent par la suite être respectivement réduits en 2,3-
butanediol ou acétoïne par les réductases. L'acétate, le formate, l'éthanol et le lactate sont
généralement formés en quantités variées à partir du pyruvate via les enzymes pyruvate
formate lyase (PFL), pyruvate déshydrogénase (PDH) et lactate déshydrogénase (LDH)
(Papagianni, 2012).
Figure 12 : Métabolisme du citrate chez les bactéries lactiques. (A) voie de fermentation de citrate
donnant de l'acétoïne. Enzymes : CL, citrate lyase; OAD, oxaloacétate décarboxylase; ALS, α-
acétolactate synthase; ALD, α-acétolactate décarboxylase. (B) Modes de cinétique du trans du citrate
CitP (citrate perméase). (C) Mécanisme de transport du l-lactate (Pudlik et Lolkema, 2011).
33
Rappel bibliographique
Le pouvoir texturant des BL est lié à leur capacité de produire des polysaccharides.
Ces polymères de sucre permettent d'augmenter la viscosité et l'onctuosité du produit
fermenté et ont la capacité d'empêcher la précipitation au fond des fruits additionnés aux
yaourts, rendant ainsi la présentation des laits fermentés agréables (Vijayendra et Sharath
Babu, 2008).
Ces EPS sont formées par une succession d'unités répétitives linéaires ou ramifiées de
monosaccharides reliés entre eux par des liens osidiques. Ces unités sont principalement le
glucose, la galactose, le mannose, la N-acétylglucosamine, la N-acétylgalactosamine, le
rhamnose et le fructose, en proportions variables, parfois avec d'autres résidus inorganiques et
organiques tels que le phosphate, le sulfate, le succinate, l'acétate, le pyruvate et le glycérol
(Khue et Ngoc, 2013, Finore et al., 2014, Zarour, 2018).
antimicrobiennes, confèrent également des saveurs et des textures uniques aux produits
alimentaires. Traditionnellement, un grand nombre d'aliments a été protégé contre la
détérioration par des processus naturels de fermentation. Actuellement, les aliments fermentés
ont une popularité croissante (60 % du régime dans les pays industrialisés) et, pour assurer
l’homogénéité, la qualité et la sécurité des produits, ils sont fabriqués par addition
intentionnelle de différents systèmes microbiens dans les aliments crus (starter/culture de
protection) (Ananou et al., 2007). Parmi les substances antimicrobiennes produites par les
BL, on peut citer :
Les acides organiques (acide lactique, acide acétique, acide formique et acide
propionique conduisent à l'abaissement du pH extérieur et cytoplasmique. Cette acidification
inhibe l'activité de la majorité des enzymes cytoplasmiques. Une fois accumulés dans le
milieu de culture, ces acides s'associent aux phospholipides de la membrane entrainant ainsi
un dysfonctionnement des systèmes de transports membranaires (Ammor et al., 2006).
2.5.4.4. Le diacétyle
35
Rappel bibliographique
une interférence avec l'utilisation de l'arginine (De Vuyst et Vandamme, 1994). Le diacétyle
est rarement présent dans les fermentations alimentaires à des niveaux suffisants pour
apporter une contribution majeure à l'activité antibactérienne (Caplice et Fitzgerald, 1999).
Outre les mécanismes suscités, les propriétés antimicrobiennes des BL sont aussi
associées à leur capacité de synthétiser les bactériocines. Ces peptides de faible poids
moléculaire interagissent avec la membrane plasmique de la bactérie cible par des interactions
électrostatiques. Ces liaisons conduisent à la formation de pores dans la membrane de la
bactérie cible. Le spectre des bactériocines est plutôt étroit, limité aux espèces
taxonomiquement proches du producteur (Hechard et al., 1993). Toutes les bactériocines
produites par des BL décrites jusqu'à présent, ont une activité dirigée contre les bactéries à
Gram positif aucune contre les bactéries à Gram négatif (Dortu et Thonart, 2009).
Ces substances représentent un intérêt dans la conservation des denrées alimentaires par leur
capacité à réguler la microflore existant dans les produits fermentés et inhibe la croissance des
germes pathogènes (Dortu et Thonart, 2009).
36
Rappel bibliographique
En 1989, Fuller a proposé une définition plus proche du sens actuel : « supplément
alimentaire microbien vivant qui affecte de façon bénéfique l’hôte en améliorant l’équilibre
de sa flore intestinale » (Fuller, 1989). C’est en 2002 que la FAO et l’OMS ont formulé la
définition suivante : « microorganismes vivants qui lorsqu’ils sont administrés en quantités
adéquates, exercent une action bénéfique sur la santé de l’hôte qui les ingère».
Les probiotiques agissent généralement, après contact avec la cible, par inhibition des
bactéries indésirables, par neutralisation des produits toxiques, par amélioration de la
digestibilité alimentaire surtout du lactose, par diminution du cholestérol sérique ou par
stimulation de l'immunité humaine (Syukur et al., 2013).
A ce jour, les souches des BL ayant un rôle probiotique les plus rapportées dans la
littérature sont les souches du genre Bifidobacterium et Lactobacillus, mais il faut aussi
mentionner des souches du genre Enterococcus, Streptococcus et saccharomyces (Rokka et
Rantamäki, 2010, Gbassi et al., 2011). Parmi les bienfaits apportés: la prévention des cancers
(tumeurs coliques diminuées par Lactobacillus acidophilus, Bifidobacterium longum et
vésicales diminuées par Lactobacillus casei), la prévention et le traitement des diarrhées
infectieuses dues à Clostridium difficile (Bifidobacterium bifidum et Streptococcus
thermophilus), le traitement des troubles digestifs liés à l'antibiothérapie (Lactobacillus
rhamnosus) et la diminution du cholestérol sérique surtout sous l'effet des probiotiques
dénommés "LactoSacc" (Lactobacillus acidophilus, Saccharomyces cerevisiae) (Lee et al.,
37
Rappel bibliographique
2013, Xie et al., 2015, Shehata et al., 2016). Le tableau 10 représente les principales espèces
de BL à activité probiotique ainsi que d’autres microorganismes à potentiel probiotique.
Tableau 10: Espèces de bactéries lactiques ayant un rôle probiotique (Holzapfel et al., 2001).
38
Rappel bibliographique
Pendant des décennies la différenciation entre les genres lactiques était basée sur les
caractères phénotypiques, morphologiques, physiologiques et biochimiques des bactéries.
La caractérisation physiologique des BL est basée par exemple sur leur type
respiratoire, leur croissance à différentes températures et en présence de diverses valeurs de
pH et concentrations de NaCl permettant ainsi la différenciation des genres (Temmerman et
al., 2004).
39
Rappel bibliographique
Les gènes
es cibles couramment utilisés lors de l'analyse
l analyse de communautés microbiennes
sont ceux de l'opéron
opéron ribosomal, particulièrement l'ARNr 16S chez les bactéries. L'utilisation
L
des régions ITS permet une meilleure séparation taxonomique des levures et de certaines
certain
bactéries d'un écosystème (Jany et Barbier, 2008). Les gènes codant pour les ARNr
ARN sont
ubiquistes et possèdent en parallèle des régions conservées (utilisés comme cibles pour des
amorces spécifiques ou universelles)
iverselles) et variables pour l'identification spécifique
spécifique d'espèces
d' et
pour la détermination de la diversité globale d'un
d un écosystème par une analyse comparative des
séquences d'ADNr 16S.
Les méthodes utilisant ces marqueurs sont très nombreuses et mettent en jeux
plusieurs approches généralement couplées
couplées à la réaction de polymérisation en chaîne (PCR).
D'autres techniques incluent l''association et la réassociation d'ADN, l'hybridation
hybridation ADN-ADN
ADN
ou ARNm-ADN,
ADN, ne font pas appel à la PCR (Cocolin et al., 2013). Ces méthodes peuvent
déterminer l'espèce puis la souche à laquelle la bactérie peut appartenir avec un degré élevé de
certitude si les conditions de l'expérience et les amorces sont bien optimisées (Felis et
Dellaglio, 2007, Singh et al., 2009). La figure 13 représente les différentes approches
moléculaires appliquées à l'écologie microbienne des aliments.
40
Rappel bibliographique
Par définition, ces composés sont de faible poids moléculaire induisant des
sensations odorantes qui interagissent directement avec le système olfactif de l'homme
(González-Martín et al., 2014). Pour les atteindre, ces odeurs doivent être volatiles, c'est
pourquoi elles ont une pression de vapeur élevée et un poids moléculaire faible (inférieur à
300 Da) (Jeleń et al., 2012).
Les composés volatils ne sont perceptibles par le système olfactif humain que si leur
concentration dans l'aliment est supérieure au seuil odorant (Domínguez et al., 2014). Ces
derniers montrent parfois des valeurs de seuils odorants très faibles, parfois en nanogramme
par litre ou par kilogramme rendant leur identification et leur quantification difficiles, surtout
dans les aliments caractérisés par un nombre élevé de composés volatils. L'utilisation de
techniques rapides et très sensibles est souhaitable car la quantification et l'identification de
tous ces composés volatils dépendront en premier lieu des techniques de séparation et
d'identification utilisées (Jeleń et al., 2012).
Les composés volatils ont souvent été utilisés comme indicateurs additionnels de la
qualité du lait et des produits laitiers (Attaie, 2009, Dan et al., 2017, Bertuzzi et al., 2018).
Par conséquent, pour le développement de produits laitiers formulés avec les BL, ces
composés doivent être examinés de près, où il est essentiel de comprendre leurs possibles
41
Rappel bibliographique
attributs sensoriels ainsi que leur effet sur la qualité de la saveur afin de concevoir des
aliments avec un gout et des arômes acceptables (Salmerón et al., 2015).
42
Rappel bibliographique
Les amines biogènes (BA) sont des composés organiques basiques, azotés, de faible
poids moléculaire principalement synthétisés par la décarboxylation des acides aminés. Ils
sont formés à la suite des activités métaboliques normales chez l'homme, les animaux, les
plantes et les micro-organismes. Ils participent à de nombreux processus biologiques, tels que
la transmission synaptique, le contrôle de la pression artérielle, la réponse immunitaire et le
contrôle de la division cellulaire. Bien que les BA soient normalement présents en faibles
concentrations dans les aliments, ils peuvent s'y accumuler en raison de l'activité microbienne.
De même, l'ingestion de concentrations élevées de ces substances peut être dangereuse pour la
santé (Ladero et al., 2017). Des concentrations élevées dans les aliments sont donc
indésirables (EFSA, 2011). Il est important de noter que les BA sont thermostables et ne sont
donc pas inactivés par la chaleur pendant la transformation ou la préparation des aliments.
plus importantes dans les produits laitiers (Linares et al., 2011, Linares et al., 2012, del Rio et
al., 2016).
2.8.2. Classification
Il existe plusieurs façons de classer les BA. Selon leur structure chimique, ils
peuvent être classés en aliphatiques (putrescine, cadavérine, spermine et spermidine), ou
cycliques (β-phényléthylamine, tyramine, histamine, tryptamine). Ils peuvent être alors
subdivisés en aromatiques (tyramine, phényléthylamine) ou hétérocycliques (histamine,
tryptamine). Ils peuvent aussi, en fonction du nombre de leurs groupes amines, être divisés en
monoamines (tyramine, phényléthylamine), diamines (putrescine, cadavérine) ou polyamines
(spermine et spermidine) (Linares et al., 2011, Ladero et al., 2017). Certains auteurs indiquent
que, puisqu'elles sont produites par un processus de condensation après la décarboxylation,
les polyamines telles que la spermine et la spermidine ne devraient pas du tout être classées
BA (Bardócz, 1999).
44
Rappel bibliographique
Les principaux producteurs de BA dans les produits laitiers sont les lactobacilles, les
lactocoques et les entérocoques (Linares et al., 2011, Ladero et al., 2010b, Ladero et al.,
2017). Une bonne corrélation a été trouvée entre le nombre de ces producteurs de BA (estimé
par réaction en chaîne de polymérase quantitative ciblée - PCR [qPCR]) et la concentration
finale de BA (Ladero et al., 2008, Ladero et al., 2010c).
Les principaux producteurs d'histamine dans les produits laitiers comprennent des
souches de Lb. buchneri, Lb. parabuchneri, Lb. curvatus, Lb. helveticus, Lb. vaginalis et St.
thermophilus. Les principaux producteurs de tyramine sont des souches d’E. casseliflavus, E.
durans, E. faecalis, E. faecium, E. hirae, Lb. brevis, Lb. curvatus, Ln. mesenteroides subsp.
mesenteroides et St. thermophilus. Les souches d'E. faecalis, E. faecium, E. Hirae, Lb. brevis,
Lb. curvatus et Lc. lactis ont été décrits comme producteurs de putrescine (Martín et al., 2005,
Lucas et al., 2007, Llácer et al., 2007, Bonetta et al., 2008, Calles-Enríquez et al., 2010,
Ladero et al., 2011, Ladero et al., 2012a, Alvarez et Moreno-Arribas, 2014, Diaz et al., 2015,
Diaz et al., 2016).
45
Rappel bibliographique
46
Matériels et méthodes
Matériels et méthodes
1. Cadre de l'étude
Au total, 12 échantillons de lait cru d'espèce cameline ont été recueillis dans des
conditions d’hygiène parfaites à partir de plusieurs régions de l'Ouest et du Sud-ouest
Algérien (Abadla, Adrar, Bechar, Ghardaia, Mecheria, Oran, Saida et Tindouf). Les
prélèvements effectués dans des flacons stériles de 200 mL ont été par la suite acheminés au
laboratoire pour être analysés en respectant les conditions de conservation adéquates (+ 4 °C).
Les paramètres physico-chimiques ont été déterminés au niveau du laboratoire privé El-Fath
3.1. Le pH
3.3. La densité
La densité nous renseigne sur le taux de matières solides ainsi que sur la viscosité de la
solution. Le principe consiste à plonger un lactodensimètre dans une éprouvette contenant 100
mL de lait à tester. Une lecture directe nous donne le résultat.
46
Matériels et méthodes
Figure 14 : Préparation des séries de dilutions au 1/10ème des échantillons de lait de dromadaire pour
isolement de bactéries lactiques.
47
Matériels et méthodes
Tableau 11: Milieux de culture et différentes conditions d'incubation pour l'isolement des
bactéries lactiques du lait de dromadaire.
Après incubation, les colonies isolées ont été purifiées par la méthode des stries
(isolement et repiquage sur le milieu gélosé spécifique). La pureté de chaque culture a été
vérifiée par la détermination des caractères morphologiques macroscopique et microscopique.
Les isolats purs à Gram positif et catalase négative, non sporulés ont été retenus.
Les cellules sont récoltées après une culture de 18 h sur le milieu approprié par
centrifugation (6000 tours/min pendant 10 min à 4 °C). La conservation de courte durée a été
effectuée sur milieu solide incliné à 4 °C et les cultures sont repiquées une fois toutes les
quatre semaines. La conservation de longue durée (Fig. 15) consiste à les garder dans un
mélange MRS ou M17 / glycérol pur (70 / 30 %) dans des tubes Eppendorf à - 20 °C (Herrero
et al., 1996).
Conservation à – 20 °C
Figure 15 : Schéma résumant la technique de conservation longue durée des isolats purifiés.
48
Matériels et méthodes
Après purification, une pré-identification des isolats basée sur une caractérisation
morphologique et la recherche de l'enzyme catalase a été effectuée.
La catalase est une enzyme présente chez la plupart des bactéries aérobies strictes et
anaérobies facultatives. Elle décompose l’eau oxygénée formée, en eau et en oxygène qui se
dégage. La réaction catalysée est la suivante :
Catalase
2H2O2 O2 + 2H2O
Cette enzyme est mise en évidence par l’émulsion de la suspension bactérienne dans
une goutte d’eau oxygénée à 10 volumes sur une lame. Le dégagement de bulles de gaz
indique la présence de la catalase (Delarras, 2007).
Parmi plus de 256 isolats, qui ont subi la coloration de Gram et le test de la catalase,
134 étaient Gram + et catalase -. Parmi ces isolats, 41 isolats représentatifs ont été retenus
pour poursuivre la caractérisation phénotypique, génotypique et la détermination de certaines
49
Matériels et méthodes
aptitudes technologiques.
Ce test permet d’apprécier le type de métabolisme par lequel le substrat carboné est
transformé. Depuis 1920, Orla-Jansen a montré que les BL peuvent se subdiviser en deux
groupes biochimiques : les homofermentaires et les hétérofermentaires. La différence entre
ces deux groupes est détectable par le dégagement de CO2 (Bourgeois et al., 1996). Donc ce
test permet de mettre en évidence le CO2 produit. Il est effectué dans un milieu dépourvu de
citrate pour éviter la formation de CO2 liée à ce métabolisme particulier (Dicks et Van
Vuuren, 1987). La méthode consiste à ensemencer des tubes à essai contenant le bouillon
MRS ou M17 avec cloche de Durham qui sont inoculés par les différents isolats purs et
incubés à 30 °C ou 45 °C pendant 48 h. La production de gaz se manifeste par la montée de la
cloche et l’apparition de bulles d’air. Les isolats qui ont produit du gaz dans les cloches ont
été notés hétérofermentaires ; les autres isolats sont homofermentaires (Hayward, 1957,
La recherche de l’enzyme arginine déhydrolase (ADH) est faite sur le milieu M16
BCP. Ce milieu contient du lactose (2 mg/mL), de l’arginine (4 mg / mL) et un indicateur de
pH le pourpre de bromocrésol (0,05 mg/mL). La croissance des BL sur ce milieu permet de
révéler la fermentation du lactose, et la production d’acide lactique qui provoque le virage de
l’indicateur de pH au jaune. En revanche les BL possédant une ADH vont métaboliser
l’arginine et libérer ainsi le NH4 qui va neutraliser l’acide lactique, cette neutralisation
empêche le virage de l’indicateur de pH gardant ainsi la couleur initiale du milieu (Thomas,
1973).
La thermo-résistance est réalisée pour les cocci selon la procédure suivante. Un tube
contenant 10 mL de M17 liquide est inoculé par la souche isolée, ensuite il est déposé dans un
bain marie à 63,5 °C pendant 30 min. Après refroidissement brusque, la souche est incubée à
30 °C pendant 48 à 72 h. Un résultat positif se traduit par l'apparition d'un trouble (Badis et
al., 2005). Le test de la croissance à 45°C permet de différencier les bactéries mésophiles des
bactéries thermophiles. Il consiste en l'inoculation de cultures jeunes pures dans un bouillon
MRS ou M17 à 45 °C. Les signes de la croissance bactérienne se traduisent par l'apparition
50
Matériels et méthodes
Ce test permet de vérifier l’aptitude des souches à croitre dans un bouillon MRS ou
M17 ajustés à pH 9,6. Ce dernier pH permet de sélectionner les espèces du genre
Enterococcus (Guiraud, 2003).
L’ADN génomique total des isolats a été extrait à l’aide du kit d’ADN génomique
bactérien GenElute (Sigma-Aldrich, Madrid, Espagne), en suivant les recommandations du
fabricant. L'ADN purifié a ensuite été stocké à 4 °C jusqu'à l'analyse. L'ADN génomique
purifié a été utilisé comme matrice pour l'amplification PCR d'un fragment du gène de l'ARNr
16S en utilisant les amorces procaryotes universelles SD-Bact0008-aS-20 (27F) (5'-
AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3 ') et S - * - Univ1492R-bA- 21 (1492R) (5'-
GGTTACCTTGTTACGACTT-3 ') (Weisburg et al., 1991, Cherif-Antar et al., 2016). Les
conditions de la PCR étaient les suivantes: une étape de dénaturation à 95 °C pendant 4 min,
35 cycles d'amplification (comprenant une étape de dénaturation à 94 °C pendant 30 s, une
étape d'hybridation à 50 °C pendant 30 s et une étape de polymérisation à 72 °C pendant 1
min 30 s) et enfin une étape d'extension finale à 72 °C pendant 7 min (Alegría et al., 2013).
Une électrophorèse horizontale sur gel d'agarose a été effectuée afin de déterminer et
de vérifier la taille des produits de la PCR. Celle-ci permet de séparer les fragments d'ADN en
fonction de leur taille et de les visualiser sous forme de bandes.
Le gel d'agarose utilisé pour l'électrophorèse a été préparé à une concentration de 0,8 % dans
du TAE (Tris base Acide acétique glacial EDTA 0,5 M à pH 8).
51
Matériels et méthodes
Les échantillons ainsi que le marqueur sont déposés au niveau des puits du gel
d'agarose, la migration est effectuée à 150 V pendant 30 min en utilisant le tampon TAE et la
visualisation des fragments d'ADN a été effectuée en lumière UV en présence de bromure
d'éthidium.
Les amplicons obtenus ont été purifiés à l'aide du kit de purification ATPTM Gel PCR
fragment (ATP Biotech Inc., Taipei, Taiwan), puis séquencés à l'aide de l'amorce 27F chez
Macrogen (Amsterdam, Pays-Bas). Les séquences obtenues ont été comparées à celles
contenues dans la base de données Genebank du NCBI (National Center for Biotechnology
Information) en utilisant le logiciel BLAST Suite (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/).
Une séquence partielle du gène de la superoxyde dismutase (SOD) a été réalisée sur
les isolats d'Enterococcus spp., afin de différentier l’espèce Enterococcus durans de l'espèce
Enterococcus faecium (Poyart et al., 1995). L’ADN total (1 µL) a été utilisé comme matrice
pour l’amplification par PCR d’un fragment interne du gène SOD dans un volume final de 25
µL contenant 2,5 µL de tampon 10 X, 2,5 µL de dNTP 2 mM, 0,2 µL de Dream taq
polymérase, 1 µL de chaque amorce dégénérée sodAd1 (5′-
CCITAYICITAYGAYGCIYTIGARCC-3 ′) et sodAd2 (5′-
ARRTARTAIGCRTGYTCCCAIACRTC-3 ′) (Poyart et al., 2000). Les conditions de la
réaction PCR comprenaient une étape de dénaturation (3 min à 95 °C), suivie de 35 cycles
d’amplification (30 s de dénaturation à 95 °C, 30 s d’hybridation à 42 °C, 90 s de
polymérisation à 72 °C) et par une dernière étape d’extension (7 min à 72 ° C) (Poyart et al.,
1995, Alber et al., 2004).
Une électrophorèse horizontale sur gel d'agarose a été effectuée afin de déterminer et
de vérifier la taille des produits de la PCR. Cette technique permet de séparer les fragments
d'ADN en fonction de leur taille et de les visualiser sous forme de bandes.
52
Matériels et méthodes
Les échantillons ainsi que le marqueur sont déposés au niveau des puits du gel
d'agarose, la migration est effectuée à 150 V pendant 30 min en utilisant le tampon TAE et la
visualisation des fragments d'ADN a été effectuée en lumière UV en présence de bromure
d'éthidium.
Les amplicons obtenus ont été purifiés à l’aide du kit de purification ADN ATPTM Gel
PCR fragment, puis séquencé à l’aide de l'amorce sodAd1 chez Macrogen (Amsterdam, Pays-
Bas). Les séquences obtenues ont été comparées à celles contenues dans la base de données
Genebank du NCBI à l'aide du logiciel BLAST Suite (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/).
L'acidification du lait par les BL est essentiellement due à leur capacité de produire de
l'acide lactique à partir de glucides. La mesure de ce pouvoir consiste à inoculer 5 mL de lait
écrémé stérile UHT par 50 µL de chaque culture jeune testée et à suivre l'évolution du pH
toute les 30 min durant 18 h. La coagulation du lait a été évaluée visuellement au cours de la
fermentation. Le test de mesure a été répété trois fois.
Lors de ce travail, 2 méthodes ont été utilisées afin d'étudier l'activité protéolytique
des isolats.
53
Matériels et méthodes
Courbe d'étalonnage
2
y = 0,221x - 0,02
R² = 0,991
1,5
Do
0,5
0
0 1 2 3 4 5 6 7 8
Concentration de la glycine (mM)
Figure 16 : Courbe d'étalonnage de la glycine pour l'évaluation de l'activité protéolytique par les
bactéries lactiques par la méthode spectrophotométrique OPA.
54
Matériels et méthodes
La production d'EPS à partir du saccharose est mise en évidence sur milieu solide
MSE (Mayeux et al., 1962) hypersaccharosé (additionné de 10 % de saccharose). Les souches
productrices de dextrane sont caractérisées par la formation de colonies larges, visqueuses et
gluantes (Mayeux et al., 1962, Zarour et al., 2017, Benhouna et al., 2019).
Les BL peuvent utiliser l'acide citrique comme source de carbone pour leur croissance
avec une vitesse assez lente, produisant en plus de l'acide lactique, différents produits
aromatiques tel que l'acétoïne, le diacétyle, l'acétaldéhyde et le dioxyde de carbone.
L'utilisation du citrate a été mise en évidence sur milieu KMK (Kempler et McKay,
1980), contenant une solution de ferrocyanure de potassium et une solution de citrate ferrique.
La présence de citrate dans le milieu inhibe la réaction entre l'ion ferrique et le ferrocyanure
de potassium. Les isolats capables d'utiliser le citrate vont initier la réaction entre ces ions
entraînant la formation de colonies bleu foncé (bleu de Prusse) (signe de l'utilisation du
citrate) ; les colonies incapables d'utiliser le citrate restent blanches (Kihal et al., 1996, Drici
et al., 2010).
Dans des tubes à hémolyse, 2 mL de cette culture sont transvasés, auxquels on rajoute
0,5 mL d’une solution de soude (NaOH) à 16 % préparée dans l’eau distillée (VP1) et 0,5 ml
de réactif α-naphtol à 6 % préparé dans l’alcool absolu (VP2). On agite soigneusement les
55
Matériels et méthodes
Les composés volatils ont été identifiés en comparant leur spectre de masse avec ceux
tenus dans la librairie HP-Wiley 138 (Agilent) et en comparant leurs temps de rétention aux
temps de rétention des étalons correspondant (Sigma). Ils ont été quantifiés comme étant la
valeur normalisée de la surface de leur chromatogramme en utilisant le cyclohexanone
comme étalon interne à qui la valeur de 100 est donnée.
56
Matériels et méthodes
Les pré-cultures des isolats retenus ont été inoculées dans des tubes de 10 mL de lait
écrémé stérile (stérilisé à 110 °C pendant 10 min). Une fois que le lait est coagulé, 2,5 mL de
la culture sont transférés dans un flacon contenant 250 mL de lait écrémé stérile, le tout est
mélangé et homogénéisé. Le contenu du flacon est réparti dans des tubes stériles à raison de
10 mL par tube qui sont incubés à 30 °C dans un bain-marie. La quantité d'acide lactique
produit, ainsi que le pH sont vérifiés chaque 2 h aux intervalles de temps suivants : (0 h, 2 h, 4
h, 6 h, 8 h, 10 h, 12 h, 14 h, 16 h et 18 h) ensuite à 24 h et à 48 h. La mesure du pH est
réalisée à l'aide d'un pH-mètre. L'acidité Dornic totale (°D) est déterminée par titrimétrie, où
10 mL de culture sont titrés avec une solution de soude (NaOH) N/9 en utilisant l'indicateur
de pH phénolphtaléine (Fig. 17) (Moulay et al., 2006). L'acidité Dornic est calculée par la
formule suivante :
1 °D = V NaOH x 10
Où :
V NaOH : Volume de NaOH utilisé pour titrer l'acide lactique contenu dans 10 mL de lait.
1°D correspond à l'acidité apportée par 0,1 g d'acide lactique dans un litre de lait.
57
Matériels et méthodes
Figure 17 : Schéma du protocole appliqué pour l'étude de la cinétique d'acidification en culture pure
dans le lait écrémé.
58
Matériels et méthodes
G = 60min / µ
59
Matériels et méthodes
Figure 18 : Schéma du protocole appliqué pour l'étude de la cinétique de croissance des bactéries en
culture pure dans le lait écrémé.
60
Matériels et méthodes
L'activité antimicrobienne des différents isolats a été effectuée par diffusion sur milieu
solide selon la méthode décrite par Schillinger et Lücke (1989). Les différentes souches
indicatrices utilisées sont mentionnées dans le tableau 12.
7.5.9.1. Méthode
Des aliquotes de 40 µL de chaque surnageant ont été placées dans des puits de 4 mm
excavés dans les plaques de gélose. L'activité antimicrobienne a été déterminée en mesurant
le diamètre du halo d'inhibition sur la croissance des indicateurs après 24 h d'incubation dans
les conditions appropriées.
Température
Souche Milieu de culture
d'incubation
Lactobacillus sakei CECT 906T MRS 37 °C
Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 M17 32 °C
Listeria innocua CECT 910T TSB 32 °C
Micrococcus luteus NCIMB 8166 TSB 32 °C
Streptococcus thermophilus LMD9 M17 42 °C
Streptococcus thermophilus CNRZ 1066 M17 42 °C
61
Matériels et méthodes
Des cultures jeunes de chaque isolat testé ont été inoculées dans du MRS ou M17
liquide supplémenté de 1mM de substrat précurseur spécifique pour chaque BA recherchée :
1 mM de tyrosine pour la recherche de la tyramine, 1 mM d’histidine pour la
recherche de l’histamine, 1 mM de lysine pour la recherche de cadaverine, 1 mM d’ornithine
et de 1 mM d’agmatine pour la recherche de la putrescine. L’incubation s'est faite pendant 48
h à 30 °C. Les cultures obtenues ont été centrifugées (3000 g pendant 10 min), 100 µl du
surnageant ont été utilisés pour le dosage des BA.
Une étape de dérivation est nécessaire afin de détecter les BA. L’agent de dérivation
utilisé est le diéthyléthoxymethylènemalonate, appelé DEEMM. Il réagit avec les fonctions
NH2 pour former des amino-énones. Le mélange réactionnel contient : 175 µl de tampon
borate 1M à pH 9, 75 µL de méthanol, 3 µL de DEEMM et 2 µL d’un standard interne (2,4,6-
triméthylphénéthylamine hydrochloride) à 2 g/L dans HCl 0,1N, stocké à + 4 °C. Le mélange
ainsi obtenu est homogénéisé au vortex. 225 µl de ce mélange sont ajoutés à 100 µl du
surnageant précèdent et le tout est mélangé pendant quelques secondes. Les solutions sont
placées ensuite dans un bain à ultra-son pendant 45 mn à 30 °C, puis mises dans un bain-
marie pendant 2 h à 70 °C, permettant ainsi la dégradation totale du DEEMM en excès. Les
échantillons ont été par la suite filtrés à travers un filtre avec des pores de 0,22 µm de
diamètre couplé à une aiguille de seringue (VWR). Le liquide ainsi filtré est récupéré dans des
petits flacons coniques (Waters, Milford, MA, USA).
échantillon a été élué à travers la colonne à un débit de 0,45 mL/min en fonction d'un gradient
d'élution ternaire, comme indiqué dans le tableau 13. La colonne a été remise en condition
initiale en 0,5 min et équilibrée pendant 3 min avant la prochaine injection (Redruello et al.,
2013).
Tableau 13: Gradient d'élution ternaire pour le dosage des amino-énones dérivés des amines
biogènes par UHPLC (Redruello et al., 2013).
Temps (min) 0,00 1,20 1,90 2,00 3,02 4,03 4,32 5,70 6,50 10,00 10,50 11,00 14,50
Eluant A (%) 90,0 92,0 92,0 90,0 90,0 83,0 83,0 71,0 78,0 40,0 18,0 - -
Eluant B (%) 2,0 1,6 1,6 2,0 2,0 3,4 3,4 5,8 - - - 20,0 20,0
Eluant C (%) 8,0 6,4 6,4 8,0 8,0 13,6 13,6 23,0 22,0 60,0 82,0 80,0 80,0
Les composés cibles ont été identifiés en fonction de leur temps de rétention et de
leurs caractéristiques spectrales à 280 nm et ont été quantifiés en utilisant la méthode de
standard interne (Redruello et al., 2013).
8. Analyse de cluster
63
Résultats et discussion
Résultats et discussion
L’ensemble des résultats obtenus dans le cadre de la préparation de cette thèse est
décliné dans les parties suivantes : caractéristiques physico-chimiques des échantillons de lait
testés, isolement et identification des BL du point de vue phénotypique et génotypique,
caractérisation technologique des espèces lactiques, étude des composés volatils par CPG,
cinétique de croissance, activité antibactérienne, screening des souches lactiques productrices
d'amines biogènes et étude de clusters des différentes espèces obtenues.
Le lait, quelle que soit son origine (vache, chèvre, brebis, chamelle ...), constitue une
niche écologique importante pour une large diversité de microorganismes, dont les bactéries
lactiques. Jusqu’à l’heure actuelle, on dénombre 11 genres de bactéries lactiques utilisées
dans les produits fermentés alimentaires : Carnobacterium, Enterococcus, Lactobacillus,
Lactococcus, Leuconostoc, Oenococcus, Pediococcus, Streptococcus, Tetragenococcus,
Vagococcus et Weissella (Stiles et Holzapfel, 1997).
La qualité des échantillons de lait cru de dromadaire peut être influencée par les
méthodes d’échantillonnage, de transport, et par l’état de santé de l’animal. Des
contaminations importantes du lait cru signifieraient une modification de l’équilibre de la
microflore, et entraîneraient des problèmes au cours des opérations d’isolement des BL. D’où
l’intérêt de prélever les colonies bactériennes le plus rapidement possible, après la traite, et
d’apprécier la qualité hygiénique et microbiologique des échantillons de lait cru, avant
l’isolement des BL. Pour cela, une prise du pH ainsi que la mesure de l’acidité Dornic et de la
densité ont été effectuées.
64
Résultats et discussion
La densité des échantillons du lait de dromadaire enregistrée est de 1,03 ± 0,02. Elle
est comparable aux valeurs rapportées par Farah (1993), Zergui (2015) et Senouci (2018).
Dans notre travail, la teneur en vitamine C du lait de dromadaire est de 42,62 ± 0,15
mg/L. Elle est comparable aux données de Zergui (2015), mais elle reste très largement
supérieure à celle du lait de vache (20,26 mg/L) (Farah, 1993).
Cette vitamine est particulièrement intéressante, car elle permet au lait de cette espèce,
par son apport important, de répondre aux besoins nutritionnels, aussi bien du jeune chamelon
que des populations locales qui vivent dans un environnement où l’apport en ce type de
vitamine est particulièrement limité (Farah, 1993). Compte tenu de ces particularités, le lait de
dromadaire devrait par conséquent, être classé parmi les produits ayant une grande valeur
nutritive et pourrait de ce fait répondre en grande partie aux besoins nutritionnels de la
population du sud du pays.
L'isolement des LAB sur différents milieux de culture (MRS et M17) a été effectué sur
12 échantillons différents de lait cru de dromadaire prélevés entre 2015 et 2018 dans les
régions Ouest et Sud-ouest de l'Algérie.
Bien que plusieurs schémas d’identification bactérienne par des méthodes classiques
restent toujours d’actualité sans qu’elles soient très exactes, les nouvelles méthodes
d’identification fondées sur les relations phylogénétiques entre bactéries en comparant une
65
Résultats et discussion
A partir des boites contenant les dilutions les plus élevées, 256 bactéries ont été isolées
sur milieu MRS et M17 et ont été pré-identifiées
pré identifiées (étude macroscopique, microscopique et test
de la catalase).
A B
Cocci (n = 105):
): (i) petites cellules arrondies associées en chainettes, (ii): petites cocci
66
Résultats et discussion
arrondies associées en diplocoques ou en petites chainettes (Fig. 21A), (iii): cellules ovoides
associées en diplocoques ou en petites chainettes (Fig. 21B).
Bâtonnets (n= 29): de forme longue ou courte, regroupés en chainette ou en palissade (Fig.
21C).
Figure 21 : (A) : Petites cellules arrondies associées en diplocoques, (B) : Cellules ovoïdes associées
en diplocoques, (C) : Bâtonnets regroupés en chainettes courtes.
Après purification, 41 isolats ont été retenus pour une caractérisation phénotypique
comprenant des tests physiologiques et biochimiques. Les résultats sont indiqués dans le
tableau 14.
Les 41 isolats avaient une distribution morphologique indiquant une domination de la
forme cocci avec 66 % (n = 27 isolats), suivi de la forme coccobacilli représentant 17 % (n= 7
isolats) et enfin la forme bâtonnet représentant aussi 17 % (n = 7 isolats).
La caractérisation physiologique et biochimique comprenant la production de gaz à
partir du glucose, la thermo-résistance et la croissance à 45 °C, la croissance à différentes
concentration de NaCl (4 et 6,5 %) (Fig. 22A) et la croissance en milieu alcalin pH 9,6 (Fig.
22B), a permis de diviser les cocci en 2 genres présomptifs: le genre Enterococcus avec 85 %
(n = 23 isolats) et le genre Lactococcus avec 15 % (n = 4 isolats).
Le genre présumé Enterococcus a été caractérisé comme étant homofermentatif,
capable de résister à une température de 63,5 °C, de croitre à 45 °C en présence de NaCl à 6,5
% et en milieu alcalin pH 9,6. A noter que certains lactoques présumés, étaient capables de
croitre en milieu pH 9,6 et/ou à une température de 45 °C (Tab. 14), ce qui est en adéquation
avec ce qui a été décrit par Drici et al. (2010).
Les cellules sous forme de coccobacilles, caractérisées comme étant
hétérofermentaires (Fig. 243A), étaient toutes incapables d'hydrolyser l'arginine signifiant
l'absence de l'enzyme ADH (Fig. 23B), les assignant au genre Leuconostoc (Tab. 14) (Kihal
et al., 2007, Zarour et al., 2013).
67
Résultats et discussion
Enfin, les isolats sous formes de bâtonnets classés comme étant des Lactobacillus
étaient tous homofermentaires thermophiles, capables d'hydrolyser l'arginine et de croitre en
milieu acide pH 5,4.
A B
Figure 22 : Croissance des isolats de bactéries lactiques dans differents conditions de cultures, (A) :
Croissance en milieu hypersalé 6,5 %, (B) : Croissance à pH 9,6.
A B
L'espèce la plus fréquente parmi les différents isolats est Enterococcus faecium (E. faecium)
et représente 46 % (n = 19), suivie
suivi par Leuconostoc mesenteroides (Ln. mesenteroides et
Ln. mesenteroides)
Lactobacillus rhamnosus (Lb. rhamnosus avec 17 % (n = 7), Lactococcus lactis (Lc. lactis)
Lb. rhamnosus)
avec 15 % (n = 6) et enfin Enterococcus hirae (E. hirae)) avec 5 % (n = 2). La figure 25
indique la distribution des différentes espèces de BL isolées à partir du lait cru de dromadaire.
15% 5% E. faecium
46% Ln. mesenteroides
17%
Lb. rhamnosus
Figure 25: Distribution des différentes espèces de bactéries lactiques isolées à partir du lait cru de
dromadaire et identifiées génotypiquement (méthode ARNr 16S).
69
Résultats et discussion
d'entérocoques avec des taux supérieurs à 34,60 % dans le lait de dromadaire algérien. Ismaili
et al. (2016), ont décrit une nette dominance du genre Enterococcus dans le lait de dromadaire
marocain à 53,60 %. Enfin en chine, dans le shubat, (lait de dromadaire naturellement
fermenté), Rahman et al. (2009) ont décrit que les entérocoques étaient présent avec un
pourcentage de 19,00 %.
L'espèce Ln. mesenteroides a été isolée dans 17,00 % des cas. Cette espèce est
naturellement trouvée dans les produits laitiers et dérivés (Hemme et Foucaud-Scheunemann,
2004, Hemme, 2012, Benmechernene et al., 2013), malgré leur difficulté à croître dans le
milieu lait (McSweeney et Sousa, 2000, Nieto-Arribas et al., 2010). Les Leuconostocs sont
des espèces ayant des propriétés technologiques intéressantes dans l'industrie laitière, elles
sont capables de synthétiser des produits de flaveur tels que l'acétoïne, l'acétaldéhyde et le
diacétyle à partir du lactate et du citrate mais aussi de produire du dextrane à partir du
saccharose ce qui permet leur utilisation en tant qu'épaississant et texturisant dans les laits
fermentés (Nieto-Arribas et al., 2010). Cependant, il est important de souligner que certaines
espèces de Leuconostocs peuvent induire une déterioration dans le fromage par la production
d'amines biogènes (Bover-Cid et Holzapfel, 1999, Fernández-García et al., 2000).
70
Résultats et discussion
appel à des méthodes génotypiques. Nos résultats indiquent la présence des Lactobacillus
dans 17,00 %, des cas représentés uniquement par l'espèce Lb. rhamnosus. Cette espèce est
fréquemment trouvée en tant que flore naturelle dans divers produits laitiers fermentés et
aussi utilisée en tant qu'agent probiotique, participant aux effets bénéfiques de la microflore
sur l'hôte, que se soit au niveau métabolique, trophique ou immunitaire (Maragkoudakis et al.,
2010). Cependant, certaines espèces de lactobacilles sont liées à certains cas de bactériémies,
endocardites ou infections locales (Cannon et al., 2005), notamment, la souche Lb. rhamnosus
GG (Salminen et al., 2004).
71
Résultat et discussion
Tableau 15: Identification phénotypique et génotypique des bactéries lactiques isolées à partir du lait cru de dromadaire.
Espèces (basée sur l'identification Résistance à
Isolats CO2 ADH 45 °C pH 5,4 pH 9,6 NaCl 4 % NaCl 6,5 %
moléculaire) 63,5 °C
LEY1 Leuconostoc mesenteroides + - - - - - + -
LEY2 Leuconostoc mesenteroides + - - - - - + -
LEY3 Leuconostoc mesenteroides + - - - - - + -
LEY4 Leuconostoc mesenteroides + - - - - - + -
LEY5 Leuconostoc mesenteroides + - - - - - + -
LEY9 Leuconostoc mesenteroides + - - - - - + -
LEY10 Leuconostoc mesenteroides + - - - - - + -
LEY6 Lactococcus lactis - + + + - + + -
LEY7 Lactococcus lactis - + - - - + + -
LEY8 Lactococcus lactis - + - - - + + -
LEY11 Lactococcus lactis - + + + - + + -
LEY12 Lactococcus lactis - + + + - - + -
LEY13 Lactococcus lactis - + + + - - + -
LEY14 Lactobacillus rhamnosus - + + - + - + -
LEY15 Lactobacillus rhamnosus - + + - + - + -
LEY16 Lactobacillus rhamnosus - + + - + - + -
LEY17 Lactobacillus rhamnosus - + + - + - + -
LEY18 Lactobacillus rhamnosus - + + - + - + -
LEY19 Lactobacillus rhamnosus - + + - + - + -
LEY20 Lactobacillus rhamnosus - + + - + - + -
LMA16 Enterococcus hirae - + + + - + + +
LMA18 Enterococcus hirae - + + + - + + +
LMA1 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA2 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA3 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA4 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA5 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA6 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA7 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA8 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA9 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA10 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA11 Enterococcus faecium - + + + - + + +
72
Résultat et discussion
(Suite du tableau 15 : Identification phénotypique et génotypique des bactéries lactiques isolées à partir du lait cru de dromadaire).
Espèces (basée sur l'identification Résistance à
Isolats CO2 ADH 45 °C pH 5,4 pH 9,6 NaCl 4 % NaCl 6,5 %
moléculaire) 63,5 °C
LMA12 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA13 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA14 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA15 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA17 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA19 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA20 Enterococcus faecium - + + + - + + +
LMA21 Enterococcus faecium - + + + - + + +
(-) : pas de croissance
(+) : Croissance
73
Résultat et discussion
La capacité d'acidification des souches à produire de l'acide dans le lait écrémé a été
testée en mesurant la diminution du pH pendant 18 h. La cinétique d'acidification a montré
deux schémas d'acidification : les acidifiants rapides et les acidifiants lents.
La capacité d'acidification des souches à produire de l'acide dans le lait écrémé a été
testée en mesurant la diminution du pH pendant 18 h. La cinétique d'acidification a montré
deux schémas d'acidification : les acidifiants rapides et les acidifiants lents.
Nos résultats indiquent que les espèces de lactocoques ont la capacité d'acidification la
plus élevée en abaissant le pH de plus d'une unité durant les 6 premières heures. Et c’est la
souche LEY6 qui possède le pouvoir acidifiant le plus élevé. Elle diminue en effet la valeur
du pH du lait écrémé de 1,6 unité qui passe à 5,12, avant d’atteindre le pH le plus bas après 18
h (pH = 4,21) (Fig. 26). Tous les lactocoques ont été capables de coaguler le lait écrémé après
cette période (Fig. 27). Ce pouvoir d'acidification rapide ainsi que la faculté de tous les isolats
de lactocoques testés de pouvoir faire coaguler le lait écrémé, témoignent de leur potentiel
avéré d'utilisation en tant que cultures starter dans l'industrie laitière. Ces résultats sont en
accord avec ceux de Cogan et al. (1997), Nieto‐Arribas et al. (2009), Alegría et al. (2010), qui
indiquent le rôle important de l'utilisation des lactocoques en tant que cultures starter.
74
Résultat et discussion
(1997), ont rapporté que la capacité de produire rapidement de l'acide était probablement la
propriété la plus importante des bactéries utilisées en tant que cultures starter. Ceci aboutit à
la diminution du pH, qui en retour augmente l'expulsion du lactosérum du caillé et diminue la
teneur en humidité. Un pH bas et une humidité diminués sont des facteurs importants dans la
réduction de la dégradation microbienne du fromage. De plus, la présence de l'activité
peptidase est essentielle pour le renforcement de la protéolyse dans le fromage ainsi que le
développement des arômes et flaveurs en favorisant l'augmentation de la production de petits
peptides et amines libres dans le fromage (Hannon et al., 2003, Nieto‐Arribas et al., 2009).
LEY6
7,00
6,50
6,00
pH
5,50
5,00
4,50
4,00
0 2 4 6 8 10 12 14 16 18
Temps (h)
Figure 26 : Cinétique d'acidification de la souche Lactococcus lactis LEY6 durant une période de
18h.
Lait coagulé
Figure 27 : Coagulation du lait écrémé par 3 souches de Lactococcus lactis après 18 h d'incubation au
bain-marie à 32 °C.
75
Résultat et discussion
Tableau 16 : Cinétique d'acidification des souches isolées à partir du lait cru de dromadaire
dans le lait écrémé UHT
Incubation dans du lait écrémé UHT a
Ln. mesenteroides
LEY1 6,28 ± 0,32 5,19 ± 0,48 -
LEY2 6,09 ± 0,14 5,34 ± 0,30 -
LEY3 6,52 ± 0,13 6,14 ± 0,10 -
LEY4 6,37 ± 0,08 6,06 ± 0,13 -
LEY5 6,44 ± 0,26 5,42 ± 0,19 -
LEY9 6,50 ± 0,06 5,61 ± 0,21 -
LEY10 6,36 ± 0,17 5,87 ± 0,48 -
Lc. lactis
LEY6 5,12 ± 0,26 4,21 ± 0,13 +++
LEY7 5,33 ± 0,54 4,32 ± 0,31 +++
LEY8 5,14 ± 0,31 4,14 ± 0,07 +++
LEY11 5,63 ± 0,33 4,22 ± 0,12 +++
LEY12 5,71 ± 0,50 4,18 ± 0,09 +++
LEY13 5,42 ± 0,13 4,12 ± 0,03 +++
Lb. rhamnosus
LEY14 6,46 ± 0,22 5,29 ± 0,27 -
LEY15 6,34 ± 0,14 4,84 ± 0,37 +/-
LEY16 6,57 ± 0,10 5,60 ± 0,50 -
LEY17 6,60 ± 0,19 4,95 ± 0,49 -
LEY18 6,55 ± 0,15 4,77 ± 0,21 -
LEY19 6,65 ± 0,16 5,67 ± 0,50 -
LEY20 6,46 ± 0,13 5,30 ± 0,59 -
E. hirae
LMA16 6,06 ± 0,15 4,98 ± 0,09 +/-
LMA18 6,04 ± 0,05 4,71 ± 0,16 +/-
E. faecium
LMA1 6,34 ± 0,11 5,72 ± 0,04 -
LMA2 6,44 ± 0,08 5,60 ± 0,50 -
LMA3 6,33 ± 0,12 5,61 ± 0,32 -
LMA4 6,27 ± 0,26 5,58 ± 0,30 -
LMA5 6,34 ± 0,19 5,62 ± 0,22 -
LMA6 6,12 ± 0,19 5,22 ± 0,48 -
LMA7 6,23 ± 0,34 5,49 ± 0,38 -
LMA8 6,49 ± 0,09 5,78 ± 0,15 -
LMA9 6,34 ± 0,28 4,88 ± 0,23 +/-
LMA10 6,55 ± 0,18 6,01 ± 0,03 -
LMA11 6,27 ± 0,02 5,62 ± 0,28 -
LMA12 6,27 ± 0,23 5,42 ± 0,18 -
LMA13 6,47 ± 0,06 5,26 ± 0,41 -
LMA14 6,31 ± 0,23 4,98 ± 0,56 -
LMA15 6,38 ± 0,22 5,14 ± 0,33 -
LMA17 6,38 ± 0,19 5,76 ± 0,18 -
LMA19 6,30 ± 0,31 5,09 ± 0,43 -
LMA20 6,28 ± 0,17 5,06 ± 0,28 -
LMA21 6,47 ± 0,08 5,34 ± 0,09 -
a
pH du lait écrémé UHT non inoculé 6,77.
b
les résultats sont exprimés comme la valeur moyenne ± SD pour chaque espèce à partir de l'expérience menée
en triplicata.
+++ Coagulation totale.
+/- Coagulation partielle au fond du tube.
- Pas de coagulation.
76
Résultat et discussion
L'activité protéolytique sur les caséines du lait est une autre propriété importante à
rechercher dans les souches afin d'être introduites dans les cultures starter (Cogan et al., 1997,
Widyastuti et Febrisiantosa, 2014). Cette faculté est essentielle pour les BL afin qu'elles
puissent croître dans le milieu lait (Akabanda et al., 2014, Zhang et al., 2014). On en
distingue deux sortes, les BL starter qui croissent rapidement dans le milieu lait et sont
impliquées dans la production d'acide lactique, déclenchant ainsi rapidement la fermentation
du lait, et la microflore secondaire comprenant les BL non-starter, mais jouant un rôle
important durant la maturation des fromages grâce à leurs enzymes protéolytiques
intracellulaires (Beresford et al., 2001).
Tous les isolats testés présentent un halo dans le milieu PCA supplémenté de lait
écrémé UHT traduisant un potentiel de protéolyse (Fig. 28). Le dosage spectrophotométrique
utilisant l'OPA a été plus sensible, car il montre des différences inter et intra-espèces dans
l'activité protéolytique des différents isolats.
Telle que présentée dans le tableau 17 et la figure 29, l'activité la plus importante au
niveau de l’espèce a été observée chez les lactococci, montrant une importante libération
d'acides aminés à partir des protéines de lait. LEY12 constitue l'isolat qui possède la plus forte
activité avec un équivalent de 1,36 ± 0,20 mMGly. Tous les lactobacilles isolés ont une
activité protéolytique de l'ordre de ± 1,00 mMGly, exceptés LEY14 qui possède l'activité la
plus faible et LEY15 qui présente l'activité la plus forte avec respectivement 0,70 ± 0,05
mMGly et 1,27 ± 0,13 mMGly. Concernant les 2 isolats E. hirae LMA16 et LMA18, le test
n'a pas montré de différence significative entre leurs activités (0,92 ± 0,34 mMGly et 0,90 ±
0,19 mMGly, respectivement). Pour les espèces d'E. faecium, l'activité protéolytique
maximale a été observée chez la souche LMA17 tandis que l'activité minimale est présente
chez la souche LMA5, avec des valeurs respectives de 1,12 ± 0,28 mMGly et 0,66 ± 0,08
mMGly, indiquant une variabilité intra-espèces. Par ailleurs, cette méthode a permis de
détecter une variation intra-espèces considérable dans les isolats de Leuconostoc, où la souche
LEY10 se distingue par une importante activité protéolytique équivalent à 1,23 ± 0,44
mMGly, contrastant avec l'activité du reste des isolats de Leuconostoc qui n'a pas dépassé les
0,78 mMGly. Plusieurs auteurs décrivent les espèces du genre Leuconostoc comme peu
77
Résultat et discussion
protéolytiques, ne leur permettant pas une bonne croissance dans le milieu lait (McSweeney et
Sousa, 2000, Nieto-Arribas et al., 2010), mais la forte activité protéolytique de l'espèce de Ln.
mesenteroides LEY10 peut être expliquée par une lyse cellulaire libérant ainsi les enzymes
protéolytiques nécessaires (Alegría et al., 2013).
Comme décrit par d'autres auteurs, le pouvoir protéolytique est une caractéristique
montrant des variabilités inter et intra-espèces pour les souches isolées à partir de sources
naturelles (Giraffa et al., 2001, Domingos-Lopes et al., 2017), indiquant ainsi que cette
capacité était dépendante de la souche (Ayad et al., 2004, Franciosi et al., 2009, Nieto-Arribas
et al., 2011). D'après nos résultats, certains isolats (Lc. lactis LEY12, Lb. rhamnosus LEY15,
Ln. mesenteroides LEY10), ont montré une activité protéolytique intéressante, suggérant leur
utilité pour une application comme cultures starter et pouvant être responsables de la
libération de peptides et d'acides aminés, impliqués dans la formation de certaines
caractéristiques organoleptiques de grande importance dans l'industrie laitière comme la
texture et l'aromatisation (Kongo, 2013, Pisano et al., 2015). Certains acides aminés étant
impliqués dans la production de composés aromatiques, soit directement ou indirectement,
servant de précurseurs pour les aldéhydes, acides, alcools ou esters (Ayad et al., 2001),
contribuant ainsi à l'amélioration du profil sensoriel agréable du produit fini (Leroy et De
Vuyst, 2004).
Zone d'hydrolyse
Figure 28 : Activité protéolytique sur milieu PCA additionné de 2 % de lait écrémé stérile chez 4
espèces de Lactococcus lactis testées (LEY8, LEY11, LEY12, LEY13).
78
Résultat et discussion
Tableau 17: Activité protéolytique des souches isolées à partir du lait cru de dromadaire,
déterminée par la méthode spectrophotométrique OPA.
Espèce / Souche mMGly
Ln. mesenteroides
LEY1 0,71 ± 0,09
LEY2 0,75 ± 0,16
LEY3 0,78 ± 0,06
LEY4 0,75 ± 0,06
LEY5 0,74 ± 0,06
LEY9 0,74 ± 0,02
LEY10 1,23 ± 0,44
Lc. lactis
LEY6 1,25 ± 0,10
LEY7 1,24 ± 0,15
LEY8 1,18 ± 0,05
LEY11 1,31 ± 0,31
LEY12 1,36 ± 0,20
LEY13 1,29 ± 0,21
Lb. rhamnosus
LEY14 0,70 ± 0,05
LEY15 1,27 ± 0,13
LEY16 0,90 ± 0,32
LEY17 0,99 ± 0,39
LEY18 0,97 ± 0,33
LEY19 1,00 ± 0,14
LEY20 0,88 ± 0,11
E. hirae
LMA16 0,92 ± 0,34
LMA18 0,90 ± 0,19
E. faecium
LMA1 0,76 ± 0,06
LMA2 0,77 ± 0,12
LMA3 0,67 ± 0,10
LMA4 0,76 ± 0,09
LMA5 0,66 ± 0,08
LMA6 0,85 ± 0,24
LMA7 0,80 ± 0,13
LMA8 0,83 ± 0,03
LMA9 1,05 ± 0,25
LMA10 0,86 ± 0,30
LMA11 0,87 ± 0,28
LMA12 0,88 ± 0,12
LMA13 0,73 ± 0,06
LMA14 0,83 ± 0,09
LMA15 0,95 ± 0,21
LMA17 1,12 ± 0,28
LMA19 0,85 ± 0,17
LMA20 0,86 ± 0,16
LMA21 1,00 ± 0,33
79
Résultat et discussion
1,80
1,60
1,40
1,20
1,00
0,80
0,60
0,40
0,20
0,00
LEY1
LEY2
LEY3
LEY4
LEY5
LEY9
LEY10
LEY6
LEY7
LEY8
LEY11
LEY12
LEY13
LEY14
LEY15
LEY16
LEY17
LEY18
LEY19
LEY20
LMA16
LMA18
LMA1
LMA2
LMA3
LMA4
LMA5
LMA6
LMA7
LMA8
LMA9
LMA10
LMA11
LMA12
LMA13
LMA14
LMA15
LMA17
LMA19
LMA20
LMA21
L. lactis NCDO 604T
L. lactis 4109
Ln. mesenteroides Lc. lactis Lb. rhamnosus E. hirae E. faecium
Figure 29 : Activité protéolytique des souches de bactéries lactiques isolées à partir du lait cru de dromadaire déterminée par la méthode
spectrophotométrique OPA.
80
Résultat et discussion
Les activités lipolytique et estérasique, au même titre que l'activité protéolytique, sont
des traits importants contribuant à la maturation, l'aromatisation et la texturisation des
fromages mais ne sont pas nécessaires pour leur croissance dans le milieu lait (Domingos-
Lopes et al., 2017). Les estérases intracellulaires ont été détectées chez de nombreuses
espèces de BL (Lactobacillus, Leuconostoc (Belkheir,
Lactobacillus, Lactococcus, Pediococcus, Weissella, Leuconostoc)
2017).
Les résultats rapportés dans le tableau 18 et les figures 30 et 31,, montrent une légère
activité lipolytique (faible halo clair entourant la culture bactérienne) de toutes les espèces de
Leuconostoc testées, ainsi que 6 souches d'E.
d' faecium (LMA6, LMA7, LMA8, LMA8,
LMA10, LMA11). Le reste des espèces testées n'ont montré aucune activité lipolytique.
Ces résultats concordent avec les données de la littérature qui décrivent certaines
espèces de BL comme peu lipolytiques comparativement à d'autres espèces bactériennes telles
que Pseudomonas, Actinobacter et Bacillus, ou levures et moisissures (Pérez et al., 2003,
Moreno et al., 2006, Sahnouni et al., 2012). D'après Herrero et al. (1996) et Pérez et al.
(2003), cette faible activité lipolytique des BL présente un avantage quant à leur utilisation en
tant que cultures starter, provoquant ainsi une dégradation limitée des composés gras du lait,
juste suffisante pour produire les produits aromatiques sans provoquer
provoquer la rancidité du produit
fini.
Lipolyse +
Figure 30 : Activité lipolytique chez les espèces de Leuconostoc mesenteroides (LEY1, LEY2, LEY3,
LEY4, LEY9 et LEY10).
81
Résultat et discussion
Lipolyse +
La capacité de production d'EPS par les isolats a été testée sur milieu MSE
additionnée de 10 % de saccharose. Seules 6 espèces de Ln. mesenteroides ont été capables de
produire du dextrane (LEY2, LEY3, LEY4, LEY5, LEY9, LEY10). Quant à la souche LEY1,
étant
nt incapable d'en produire, elle peut être identifiée comme étant Ln. mesenteroides subsp.
cremoris (Badis et al., 2005, Zarour et al., 2013) (Fig. 32). Ces espèces de Leuconostoc
seraient de bons candidats en tant que flore secondaire dans l'industrie laitière
tière du fait de leur
l
habilité à produire du dextrane et de son importance dans les produits laitiers fermentés.
fermentés Les
résultats obtenus sont présentés dans le tableau 18.
Dextrane - Dextrane +
Figure 32 : Production de dextrane par 2 espèces de Leuconostoc mesenteroides LEY1 (dextrane -),
LEY2 (dextrane +).
Certaines espèces de BL, notamment les espèces de Leuconostoc, sont connues pour
produire des EPS au cours de leur métabolisme (Maina et al., 2008). Ces bio-polymères
bio
jouent un rôle important dans l'industrie laitière, en particulier dans la fabrication des produits
laitiers fermentés tels que les yaourts et les fromages. Ils permettent en effet d’améliorer leur
apparence, leur stabilité ainsi que leurs propriétés rhéologiques (Domingos-Lopes et al., 2017,
Zarour et al., 2018).. De même, ils peuvent être utilisés en remplacement de certains additifs
alimentaires et stabilisants tels que les protéines de lait, l’amidon, les pectines et autres hydro-
hydro
82
Résultat et discussion
colloïdes, fournissant ainsi un label de qualité à moindre coût (Benhouna et al., 2019). De
plus, on leur accorde une attention croissante ces dernières années en raison de leurs
propriétés potentiellement bénéfiques pour la santé humaine (propriétés immunogènes,
protection contre les ulcères gastriques, amélioration du transit digestif, activité
hypocholestérolémiante, antivirale, anti-tumorale, etc…) (Ruas-Madiedo et al., 2010,
Benhouna et al., 2019).
Zarour en 2018, en étudiant la production des EPS par les souches de Ln.
mesenteroides isolées du lait cru de dromadaire a observé des niveaux de production variables
avec des formes différentes sur MRS-Saccharose, tandis qu’aucune production n’a été
remarquée sur MRS-Glucose. Ce qui a permis de classer les Leuconostoc en différents
groupes :
1. Les souches fortement productrices, possédant de grandes colonies gélatineuses d’aspect
liquide, au départ, évoluant en fonction du temps et devenant de plus en plus semi-liquide
jusqu’à formation de tapis de colonies presque lysées et présentant des niveaux de
production entre 2 et 3 g/L.
2. Les souches ayant une production moyenne à basse, possédant des colonies gluantes de
forme moyenne et d’aspect rigide, liées fortement à l’agar tout en gardant le même aspect
durant toute la durée d’incubation et présentant des niveaux de production entre 0,5 et 2
g/L.
3. Les souches non productrices, possédant le même aspect observé en présence de glucose
avec des colonies blanches, petites et lenticulaires.
Selon nos résultats indiqués dans le tableau 18, tous les isolats de lactococci et de
lactobacilli présentent un profil positif pour l'utilisation du citrate (Fig. 33). C’est le cas
également de toutes les espèces de Leuconostoc, sauf pour l'isolat LEY10. Concernant les
entérocoques, les deux espèces d'E. hirae sont également capables d'utiliser le citrate comme
source de carbone ainsi que toutes les espèces d'E. faecium, sauf les 3 espèces : LMA1,
LMA5 et LMA8. Nos résultats sont en accord avec ceux décrits par de Figueroa et al. (2000)
et Drici et al. (2010) qui rapportent l'utilisation du citrate respectivement par les espèces de
83
Résultat et discussion
Lb. rhamnosus et Lc. lactis comme source de carbone. Concernant les espèces de Ln.
mesenteroides,, nos résultats concordent avec les données de Zarour (2018),
(2018) sauf pour l'isolat
LEY10 qui est citrate -.. Ceci peut s’expliquer, selon Kihal et al. (1996),
(1996) par la perte de
plasmide contenant le gène codant pour la citrate perméase P. Cette dernière a pour rôle de
transporter le citrate vers le cytoplasme, permettant ainsi aux bactéries de le métaboliser
(Kempler et McKay, 1980).
Citrate +
Figure 33 : Utilisation du citrate dans un milieu synthétique KMK par des espèces de Lactococcus
lactis (LEY12 et LEY13) et des espèces de Lactobacillus rhamnosus (LEY14, LEY15, LEY16).
La production d'acétoïne, reflétée par la présence d'un anneau rose dans le bouillon
Clarck et Lubs (Fig. 34A, 34B,
34 34C),, est positive pour tous les entérocoques testées (E.
(
faecium et E. hirae),
), tous les Lb. rhamnosus et pour une seule espèce de Leuconostoc
(LEY10), tandis que tous les isolats de lactococci ont eu un résultat négatif.
84
Résultat et discussion
85
Résultat et discussion
Acétoïne +
A B C
Figure 34 : Production d'acétoïne dans le milieu Clarck et Lubs par les souches (A) : Leuconstoc
mesenteroides (LEY10), (B) : Enterococcus faecium (LMA5), (C) : Lactobacillus
acillus rhamnosus
(LEY17).
La production des composés volatils a été évaluée par HS/GC/MS (Salazar et al.,
2008).. 18 différents composés ont été identifiés par CPG (Tab. 19).. Nos résultats, montrent
l’existence d’une grande variabilité en termes
termes de diversité et de quantité de composés volatils
produits par les différents isolats, où les composés les plus fréquemment produits sont
l'alcool, l'acétaldéhyde, l'acétate de méthyle, l'acétoïne et l'acide acétique.
L'acétaldéhyde a été produit par toutes les espèces sauf pour les Leuconostoc,
Leuconostoc où seule
la souche LEY10 la produit.
86
Résultat et discussion
fois inférieure à celles des autres isolats qui ont donné un résultat positif. D'un autre coté,
l'espèce Ln. mesenteroides LEY10 a été testée phénotypiquement positive, alors qu’elle n’a
fait preuve d’aucune activité d'acétoïne détectable par CPG au cours de sa croissance dans le
lait. Il faut également tenir compte du fait que les deux méthodes peuvent sensiblement
différer et que la production dans d'autres conditions peut être différente.
Les espèces produisant le moins de composés volatils sont représentées par les isolats
de Ln. mesenteroides, montrant moins de diversité en composés volatils ; ceci peut-être
expliqué par le fait que leur croissance dans le lait est faible et qu'ils doivent être combinés
aux lactococci producteurs d'acide, afin de jouer le rôle de producteurs d'arômes dans les
cultures starter mixtes (Ayad et al., 2001, Sánchez et al., 2005, Alegría et al., 2013). Les
espèces de Lb. rhamnosus, bien qu'elles soient considérées comme des isolats à acidification
lente, peuvent jouer un rôle important dans le développement des arômes de fromage en tant
que culture secondaire, compte tenu de leur habilité à produire des composés de flaveur tels
que le diacétyle et l'acétoïne.
87
Résultat et discussion
Tableau 19: Evaluation par HS/CG/MS des composés volatils produits par les bactéries lactiques isolées à partir du lait cru de dromadaire.
Acide butanoïque
1,3 ó 2,3 Butanol
Methyl1butanol
Acide acétique
2,2,4,6,6 PTHa
Hexanoate de
Acétaldéhyde
2 Me butanal
3 Me butanal
Butanoate de
2 Propanone
Propanol-2
2 Méthyl 1
Acétate de
Diacétyle
propanal
propanol
2 Méthyl
Acétoïne
Ethanol
méthyle
méthyle
méthyle
Espèces /
2ó3
souches
Ln. mesenteroides
LEY1 - 331,0 - - - - 342,7 3319,7 171,8 - - - - - - - - -
LEY2 - - - - - - - 6281,9 182,4 - - - - - - - - -
LEY3 - - - - - - - 13903,0 1874,9 - 39,3 - 33,1 - - - - -
LEY4 - - - - - - - 3296,0 1248,0 - 41,3 - 40,1 - - - - -
LEY5 - - - - - - - 6224,4 394,9 - 25,5 - 19,5 - - 359,5 107,4 143,1
LEY9 72,6 - - - - - - 3044,1 89,7 - 3,7 - 30,4 - - - - -
LEY10 276,9 64,5 - - - - - 5877,9 1818,9 - 63,7 - 51,8 - - 111,0 - -
Lc. lactis
LEY6 76,9 - 179,1 - 72,6 877,7 - 396,5 - - - 55,6 16,4 322,9 - - - -
LEY7 25,7 - 123,5 - 80,1 796,1 - 353,5 95,0 - - 101,4 - 367,6 - - - -
LEY8 57,7 - 180,0 - 61,8 797,0 - 340,6 66,4 - 5,1 41,4 - 298,7 - - - -
LEY11 23,9 - 121,3 26,1 - 852,8 - 351,8 - - - 30,7 3,6 198,4 - 21,9 - -
LEY12 21,9 - 99,8 25,2 - 588,8 - 315,3 51,1 - - 35,7 2,8 213,2 2,6 22,1 - -
LEY13 26,2 - 131,8 26,9 - 897,9 - 362,6 83,6 - - 31,7 9,0 205,0 - 17,7 - -
Lb. rhamnosus
LEY14 15,0 - - 50,7 - - - 29,5 88,5 19,5 - - 4,7 - 122,5 86,4 - -
LEY15 - - - 36,8 - - - 74,1 - 13,5 - - - - 130,5 128,6 - -
LEY16 7,9 - - 30,1 - - - 28,1 81,4 21,5 - - - - 128,9 161,1 - -
LEY17 9,2 - - 35,6 - - - 27,8 63,8 8,1 - - 4,7 - 88,7 111,6 - -
LEY18 8,8 - - 37,7 - - - 31,4 - 18,7 - - - - 96,3 94,1 - -
LEY19 12,4 - - 31,7 - - - 56,6 49,1 24,5 - - - - 132,8 144,9 - -
LEY20 13,6 - - 42,4 - - - 30,0 89,0 20,4 - - 6,6 - 131,6 82,2 - -
E. hirae
LMA16 7,6 - - 73,7 - - - 36,6 105,5 16,0 2,2 - - - 33,6 3,8 - -
LMA18 4,5 - - 77,4 - - - 36,4 95,3 - - - - - 25,1 6,8 - -
88
Résultat et discussion
(Suite du tableau 19 : Evaluation par HS/CG/MS des composés volatils produits par les bactéries lactiques isolées à partir du lait cru de
dromadaire).
Acide butanoïque
1,3 ó 2,3 Butanol
Methyl1butanol
Acide acétique
2,2,4,6,6 PTHa
Hexanoate de
Acétaldéhyde
2 Me butanal
3 Me butanal
Butanoate de
2 Propanone
Propanol-2
2 Méthyl 1
Acétate de
Diacétyle
propanal
propanol
2 Méthyl
Acétoïne
Ethanol
méthyle
méthyle
méthyle
Espèces /
2ó3
souches
E. faecium
LMA1 32,3 - - 45,7 - - - 17,7 - - - - 4,8 - 51,2 86,5 - 11,6
LMA2 51,7 - - - - - - 70,2 95,0 - 9,9 - 21,4 - 16,0 18,9 - -
LMA3 27,2 - 18,4 18,4 - - - - - - - - 3,4 - 36,2 18,8 - -
LMA4 45,6 - 32,8 32,8 - - - - 116,0 - 8,1 - 18,2 - 56,6 29,7 - -
LMA5 35,0 - 41,0 41,0 - - - - 99,3 - 5,8 - 14,1 - 53,1 32,7 - -
LMA6 83,9 - 64,4 64,4 - - - 275,4 118,2 - 9,1 - 20,3 - 15,7 9,2 - -
LMA7 85,5 - 15,7 15,7 - - - 305,4 - - 10,8 - 21,2 - 20,5 - - -
LMA8 47,4 - 37,9 37,9 - - - 13,6 - - 8,5 - 10,8 - 34,5 - - -
LMA9 147,4 - 27,5 63,7 11,3 242,3 - 30,5 - - 12,7 8,8 24,6 126,1 94,0 68,9 - -
LMA10 41,5 - - 34,5 - - - - - - - - 3,2 - 34,0 73,5 - -
LMA11 60,4 - - 47,7 - - - 18,0 130,7 - - - - - 47,7 39,7 - -
LMA12 35,1 - 18,2 46,3 - - - 8,6 104,7 - 4,1 - 14,8 - 52,1 41,1 - -
LMA13 73,8 - - 66,3 - - - 325,2 118,3 - 8,1 - 14,5 - 6,7 53,1 - -
LMA14 44,6 - - 37,1 - - - 101,2 65,5 - 12,9 - 21,3 - 20,0 22,7 - -
LMA15 44,6 - - 24,1 - - - 91,0 102,3 - 15,0 - 41,0 - 20,5 - - -
LMA17 56,8 - - 21,6 - - - 102,6 122,6 - 12,7 - 27,5 - 17,2 5,8 - -
LMA19 78,2 - - 32,4 - - - 338,4 121,7 - - - 3,6 - 9,2 14,2 - -
LMA20 66,7 - - 48,6 - - - 318,9 136,5 - - - 15,8 - 6,7 - - -
LMA21 40,9 - - 21,6 - - - 85,7 107,6 - 15,3 - 26,7 - 17,6 - - -
a
2,2,4,6,6 pentamethyl heptane
- non détecté
89
Résultats et discussion
9
35
8
30
7
25
20 6
15 5
0 4 8 12 16 20 24 28 32 36 40 44 48
Temps (h)
°D pH Log ufc/mL
9
65
Acidité Dornic (° D)
8,5
55 8
7,5
45 7
6,5
35 6
25 5,5
5
15 4,5
0 4 8 12 16 20 24 28 32 36 40 44 48
Temps (h)
°D pH Log ufc/mL
90
Résultats et discussion
Acidité Dornic (° D)
90 8,5
75 7,5
60 6,5
45 5,5
30 4,5
15 3,5
0 4 8 12 16 20 24 28 32 36 40 44 48
Temps (h)
°D pH Log ufc/mL
E. faecium LMA9
75 10
55 8
45 7
35 6
25 5
15 4
0 4 8 12 16 20 24 28 32 36 40 44 48
Temps (h)
°D pH Log ufc/mL
E. hirae LMA18
75 10
pH et croissance (Log ufc/mL)
65 9
Acidité Dornic (° D)
55 8
45 7
35 6
25 5
15 4
0 4 8 12 16 20 24 28 32 36 40 44 48
Temps (min)
°D pH Log ufc/mL
91
Résultats et discussion
Pour suivre le comportement des souches sélectionnées dans le milieu lait, une
cinétique d'acidification et de croissance a été effectuée durant 48 h.
La croissance bactérienne est estimée par dénombrement sur milieu MRS ou M17 et la
valeur est exprimée en log ufc/mL qui a permis le calcul du taux de croissance ainsi que le
temps de génération pour chaque souche.
La concentration initiale de la souche de Lc. lactis (LEY12) était de 6,30 log10 ufc/mL.
Il n'y a pas eu de phase de latence, la phase exponentielle a commencé directement et a duré
16 h, pour atteindre une biomasse cellulaire de 10,00 log10 ufc/mL avec un taux de croissance
de µ = 0,77 h-1 et un temps de génération G = 78 min. Le pH durant cette période a diminué
de 2,50 unités (avec une vitesse de 0,15 unités/h) et le taux d'acide lactique a atteint une
valeur de 131 mM après 48 h de croissance (Fig. 37).
La concentration initiale de la souche d'E. faecium LMA9 était de 6,03 log10 ufc/mL.
La croissance bactérienne s'est caractérisée par l'absence de la phase de latence et la phase
exponentielle a commencé directement et a duré 20 h, pour atteindre une biomasse cellulaire
de 9,80 log10 ufc/mL avec un taux de croissance de µ = 0,63 h-1 et un temps de génération G =
96 min. Le pH durant cette période a diminué de 1,80 unités (avec une vitesse de 0,09
unités/h) et le taux d'acide lactique a atteint une valeur de 78 mM après 48 h de croissance
(Fig. 38).
92
Résultats et discussion
La concentration initiale de la souche d'E. hirae LMA18 était de 6,08 log10 ufc/mL
avec une phase de latence de 2 h. La phase exponentielle a duré 18 h, pour atteindre une
biomasse cellulaire de 9,71 log10 ufc/mL avec un taux de croissance de µ = 0,67 h-1 et un
temps de génération G = 90 min. Le pH durant cette période a diminué de 1,85 unités (avec
une vitesse de 0,10 unités/h) et le taux d'acide lactique a atteint une valeur de 83 mM après 48
h de croissance (Fig. 39).
Tableau 20: Résumé des résultats obtenus lors de la cinétique de croissance et d'acidification
dans le lait écrémé stérile de 5 souches isolées à partir du lait de dromadaire
Log10 UFC/mL Taux d'acide
Souche µ (h-1) G (min) pH final °D final
final lactique final (mM)
Ln. mesenteroides LEY5 0,46 141 8,87 5,80 43 48
Lb. rhamnosus LEY15 0,35 172 8,80 4,85 65 72
Lc. lactis LEY12 0,77 78 9,40 3,80 118 131
E. faecium LMA9 0,63 96 9,75 4,50 70 78
E. hirae LMA18 0,67 90 9,68 4,20 75 83
Les résultats obtenus au cours de cette cinétique d'acidification sont en accord avec les
données de Moulay et al. (2006) qui ont décrit les lactocoques comme étant des espèces
acidifiantes, contrairement à Ayad et al. (2001), qui ont constaté que l'activité acidifiante
globale de plusieurs souches de lactocoques sauvages est plutôt faible. Les Ln. mesenteroides
ont été décrites comme étant des espèces faiblement acidifiantes dans le milieu lait en culture
pure (Kihal et al., 2009, Nieto-Arribas et al., 2010), et c’est pourquoi Server-busson et al.
(1999) ont suggéré que les isolats de Leuconostoc devraient être utilisés combinés avec des
producteurs d'acides tels que les lactocoques. La cinétique d'acidification de l'espèce Lb.
rhamnosus est comparable à celle rapportée par Marroki et al. (2011) qui indiquent qu’après
24 h d'incubation, le pH n’atteint qu’une valeur de 5,39 la décrivant alors comme une espèce
faiblement acidifiante.
Concernant la croissance en milieu lait, l'espèce la plus rapide à croître est Lc. lactis
avec un temps de génération G de 78 min, contrairement à l'espèce Lb. rhamnosus dont le
93
Résultats et discussion
temps de génération G est le plus long (172 min), la classant de ce fait comme étant l'espèce
la plus lente à se multiplier.
- L'indicateur Lb. Sakei CECT 906T a été inhibé par tous les isolats de Lb. rhamnosus sauf par
une (LEY20) et par 42 % d'E. faecium.
- Micrococcus luteus NCIMB 8166 n’a été inhibée que par 52 % des isolats de Leuconostoc,
- Lactococcus lactis subsp. Cremoris MG1363 n’a été inhibée que par 16 % des isolats d'E.
faecium,
- L'activité antibactérienne la plus importante a été détectée au sein des isolats d'E. faecium
qui ont été capables d'inhiber la croissance de 4 souches indicatrices (toutes sauf,
Streptococcus thermophilus CNRZ 1066 et Micrococcus luteus).
- E. faecium LMA5, a montré la plus forte activité antibactérienne contre toutes les souches
indicatrices susmentionnées.
- Aucun isolat de Lc. lactis n'a été capable d'inhiber la croissance des souches indicatrices
utilisées lors de ce travail, bien que la production de différentes bactériocines, y compris la
nisine, ait été rapportée chez les souches de Lc. lactis isolées à partir de produits laitiers
artisanaux (Alegría et al., 2010, Benmechernene et al., 2013).
Dans une étude sur les BL isolées du lait de dromadaire présentée par Zergui et al.
(2014) et sur un total de 55 isolats de BL criblées sur la base de leur forte activité
antibactérienne, une seule a été sélectionnée afin d'être caractérisée morphologiquement,
biochimiquement, en testant les profils fermentaires des glucides ainsi que sa classification
phylogénétique basée sur l'approche de l'ADNr 16S.
94
Résultats et discussion
L’identification par une homologie de séquence de l'ADNr 16S de l’isolat a révélé que
la souche sélectionnée correspond à Lactobacillus plantarum, qui a été surnommée par la
suite DU10. Une fois la séquence déposée dans la banque de données Genebank, un numéro
d’accession unique lui a été attribué : KF724943. Cette souche a montré une forte activité
antibactérienne contre différents pathogènes à Gram + et Gram - dont le halo d’inhibition ne
dépassait pas les 24 mm de diamètre. Les bactériocines de la souche DU10 ont été
caractérisées et purifiées jusqu'à homogénéité. La purification de la bactériocine a été
confirmée par HPLC après l’observation de deux pics distincts. La masse moléculaire de
Plantaricine M et Plantaricine Z a été déterminée par MALDI-TOF/MS. Les poids
moléculaires sont de 6,31 kDa et 7,19 kDa respectivement. Ces deux bactériocines
démontrent un large spectre d’activité antibactérienne contre les bactéries à Gram + et à Gram
- lorsqu’elles agissent simultanément. L’activité est nulle si chacune est testée séparément
(Zergui et al., 2014).
Les BL ont une large activité antibactérienne (Senouci et al., 2018) et sont capables de
produire des substances bactériocine-like tels que les entérocines A et P produites par E.
faecium et les leucocines produites par Ln. mesenteroides, ce qui est souvent rapporté dans la
littérature (De Vuyst et Leroy, 2007, Sawa et al., 2010, Benmechernene et al., 2013).
Nos résultats concordent avec les données de la littérature, mais des travaux ultérieurs
devraient être effectués pour tester la capacité de ces isolats à inhiber la croissance de
bactéries pathogènes telles que Listeria monocytogenes et à évaluer leur potentiel pour être
utilisés en tant que culture secondaire afin de contribuer à la sécurité et à la conservation des
aliments.
95
Résultats et discussion
96
Résultats et discussion
Halo d'inhibition
Halo d'inhibition
Halo d'inhibition
Les produits laitiers font parties des matières qui accumulent la plus grande diversité
et quantité de BA (EFSA,
EFSA, 2011).
2011 . La consommation d'aliments avec des concentrations
élevées en BA peut entrainer des symptômes d'intoxication (Linares et al.,
al. 2011). Il existe
donc un consensus général pour réduire la présence des BA dans les
les aliments en général et
dans les produits laitiers en particulier. Une des mesures de prévention pouvant être appliquée
est la sélection de souches utilisées comme cultures starter ou co-starter,
starter, afin de s'assurer
qu'elles ne produisent pas de BA (Linares et al., 2012).. Dans ce travail, la capacité de
produire les BA : tyramine, histamine, putrescine et cadaverine, a été évaluée par la méthode
de chromatographie liquide ultra haute performance UHPLC (Redruello
Redruello et al., 2013), les
résultats obtenus sont indiqués dans le tableau 22.
Tous les isolats de Lc. lactis ont produit de la putrescine en utilisant l'agmatine comme
précurseur via l'agmatine deiminase (entre 0,18 et 0,56 mM de putrescine). Plusieurs espèces
de Lc. lactis ont été décrites comme productrices de putrescine (del Rio et al., 2016) en
utilisant l'agmatine comme précurseurs, qui est la voie prédominante dans les produits laitiers
(Linares et al., 2013, Ladero et al., 2017). Même si les isolats de Lc. lactis, qui peuvent être
utilisées dans des cultures starters, étaient producteurs de putrescine, la production de BA,
peut être contrôlée en assurant des conditions de fermentation adéquates pour prévenir
l'accumulation de ces composés toxiques (Ladero et al., 2017).
98
Résultats et discussion
Tableau 22: Amines biogènes détectés dans la culture des bactéries lactiques isolées à partir
du lait cru de dromadaire (mM).
Putrescine Putrescine
Espèces / Souches Tyramine Histamine Cadaverine
(AGDI1) (ODC2)
Ln. mesenteroides
LEY1 - - - - -
LEY2 - - - - -
LEY3 - - - - -
LEY4 - - - - -
LEY5 - - - - -
LEY9 - - - - -
LEY10 - - - - -
Lc. lactis
LEY6 - - 0,35 - -
LEY7 - - 0,56 - -
LEY8 - - 0,49 - -
LEY11 - - 0,18 - -
LEY12 - - 0,18 - -
LEY13 - - 0,19 - -
Lb. rhamnosus
LEY14 - - - - -
LEY15 - - - - -
LEY16 - - - - -
LEY17 - - - - -
LEY18 - - - - -
LEY19 - - - - -
LEY20 - - - - -
E. hirae
LMA16 - - - - -
LMA18 - - - - -
E. faecium
LMA1 1,32 - - - -
LMA2 1,32 - - - -
LMA3 0,94 - - - -
LMA4 0,91 - - - -
LMA4 0,24 - - - -
LMA6 1,27 - - - -
LMA7 1,32 - - - -
LMA8 1,13 - - - -
LMA9 1,08 - - - -
LMA10 1,12 - - - -
LMA11 1,03 - - - -
LMA12 1,20 - - - -
LMA13 1,31 - - - -
LMA14 1,21 - - - -
LMA15 1,17 - - - -
LMA17 1,24 - - - -
LMA19 1,27 - - - -
LMA20 1,30 - - - -
LMA21 1,22 - - - -
1
AGDI: agmatine déiminase
2
ODC: ornithine décarboxylase
99
Résultats et discussion
7. Analyse de cluster
Pour effectuer une différenciation des isolats et les classer comme différentes souches,
toutes les BL isolées (41) ont été comparées en utilisant leurs propriétés phénotypiques,
obtenues à partir de différentes caractéristiques testées durant ce travail (40 caractères) en se
basant sur l'analyse du cluster. La figure 42 montre un dendrogramme résultant de cette
analyse du cluster (UPGMA).
Figure 42: Dendrogramme obtenu à partir de l'analyse de cluster basé sur la comparaison de 40
caractères phénotypiques des 41 souches de bactéries lactiques isolées à partir du lait cru de
dromadaire algérien.
L'étude des groupes obtenus lors de l'analyse de cluster, en termes de diversité inter-
inter
espèces, nous permet de considérer tous les isolats comme étant des souches différentes. A
l'exception des isolats Ln. mesenteroides LEY3 et LEY4, qui ont été groupés ensembles et qui
devraient donc être considérées comme 2 isolats d'une même souche.
Par ailleurs, tous les isolats ont été groupés par espèces, malgré quelques exceptions
(E. faecium LMA9, classée avec le groupe des Lc. lactis,, et les souches de E. hirae groupées
100
Résultats et discussion
avec les espèces de Lb. rhamnosus). Tout ceci montre bien que la classification de différentes
espèces basée sur leurs caractéristiques phénotypiques est beaucoup moins précise que la
méthode qui se base sur l’analyse moléculaire et qu'elle ne constitue pas une méthode fiable
pour la taxonomie des BL. Cependant elle suppose que pour ces souches, même si elles sont
génétiquement distantes, elles peuvent avoir des comportements et caractéristiques similaires
(telles que la production des mêmes composés volatils, leur activité protéolytique, leur
habilité à acidifier et à coaguler le lait).
101
Conclusion générale
102
Conclusion générale
Le lait frais du dromadaire et ses produits sont une bonne source nutritionnelle pour
les habitants vivant dans les zones arides et urbaines. En Algérie, au cours des dernières
années, la production de lait de dromadaire a augmenté progressivement en raison d'un intérêt
accru par les consommateurs. Certains de ses aspects diffèrent légèrement des laits des autres
espèces animales, tel que le lait de vache. Des variations observées dans la composition du
lait de dromadaire ont été attribués à plusieurs facteurs, tels que les différentes procédures
d'analyse, les lieux géographiques, les variations saisonnières, les conditions d'alimentation et
l'élevage des dromadaires. L’effet de ces différents facteurs physico-chimiques peut agir sur
la microflore lactique du lait camelin et par conséquent modifier le microbiome de cet
écosystème.
Nous pouvons aussi conclure que ces souches bactériennes isolées du lait de
dromadaire avaient des caractéristiques technologiques intéressantes faisant d’elles de très
bonnes candidates pour d’éventuelles applications en industrie alimentaire, et pourraient
devenir des levains pour fermenter différents sortes de laits, notamment celui du dromadaire,
qui représente l’écosystème dont elles sont issues. Ainsi:
• Les souches de Lc. lactis semblent être des candidats prometteurs afin d'être utilisées
en tant que culture starter dans les produits laitiers fermentés. Ces espèces ont été
capables de se développer rapidement dans le lait, grâce à leur activité protéolytique
produisant des acides, responsables de la réduction du pH, assurant ainsi une
protection contre une éventuelle détérioration microbienne et produisant de nombreux
composés aromatisants.
• Toutes les souches de Ln. mesenteroides ont montré une activité lipolytique et la
souche Ln. mesenteroides LEY10, a montré une activité protéolytique et a produit de
l'acétaldéhyde dans le lait ainsi que du dextrane.
• Toutes les souches de Lb. rhamnosus, ont produit des composés volatils intéressants
tels que le diacétyle et l'acétoïne dans le lait et ont montré un bon potentiel en terme
d'activité protéolytique.
103
Conclusion générale
Les résultats concernant la production d'amines biogènes ont montré sans surprise que
les espèces d'E. faecium pouvaient produire de la tyramine, et que les espèces de Lc. Lactis
étaient productrices de putrescine.
Enfin les résultats de l'analyse de cluster, basé uniquement sur les caractéristiques
phénotypiques examinés, ont révélé clairement une diversité inter-espèces; cette méthode
pourrait donc être utilisée pour la typification d'autres isolats lorsqu'aucune information
génétique n'est disponible.
Toutes ces caractéristiques font de ces souches bactériennes des candidats intéressants
pour une utilisation en technologie laitière, non seulement en Algérie, mais aussi dans des
applications biotechnologiques mondiales. Dans le futur, la possible valorisation de ces
travaux dans la technologie laitière requiert au préalable des expériences complémentaires
avec des tests relatifs aux qualités organoleptiques des produits fermentés obtenus lors de
l’utilisation de ces souches comme ferments lactiques.
Pour compléter ce travail, des études plus approfondies doivent être menées,
notamment :
En effectuant une caractérisation plus profonde sur les souches les plus prometteuses telles
que la résistance aux antibiotiques, l'activité antimicrobienne contre les bactéries pathogènes
(ex Listeria monocytogenes).
Un essai de fabrication d'un lait fermenté avec les souches ayant montré de bonnes propriétés
technologiques et pourquoi pas essayer de transformer le lait de dromadaire.
104
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Références bibliographiques
123
Annexes
Annexe 1
Annexes
Annexe 1 : Milieux de culture
130
Annexe 1
131
Annexe 1
132
Annexe 2
133
Annexe 3
Annexe 3 : Séquences partielles du gène codant pour l'ARNr 16S de certaines souches
identifiées
134
Annexe 3
GTTGTTGGAGAAGAATGGTCGGCAGAATAACTGTTGTCGGCGTGACGGTATCCAACCAGAAAGCC
ACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGG
CGTAAAGCGAGCGCAGGCGGTTTTTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCTCGGCTTAACCGAGGAAGTGC
ATCGGAAACTGGGAAACTTGAGTGCAGAAGAGGACAGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGAAATGC
GTAGATATATGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTGTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAAGCTC
GAAAGCATGGGTAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCATGCCGTAAACGATGAATGCTAG
GTGTTGGAGGGTTTCCGCCCTTCAGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACG
ACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGG.
135
Annexe 4
Figure 43: Chromatogramme UHPLC d'une solution standard (1 mM) d'amino-énones dérivés d'acides aminés,
des ions ammonium et amines biogènes à 280 nm.
Désignation des pics: 1, acide aspartique; 2, acide glutamique; IS, standard interne (L-2-acide aminoadipique); 3,
asparagine; 4, serine; 5, glutamine; 6, histidine; 7, glycine; 8, alanine; 9, thréonine; 10, arginine; 11, GABA; 12,
proline; 13, tyrosine; 14, ions ammonium; 15, agmatine; 16, histamine; 17, valine; 18, méthionine; 19, cystéine;
20, tryptophane; 21, isoleucine; 22, leucine; 23, phénylalanine; 24, ornithine; 25, lysine; 26, tyramine; 27,
putrescine; 28, tryptamine; 29, cadaverine; 30, phényléthylamine
136
Annexe 4
137
Annexe 4
Figure 46: Exemple de la souche Leuconostoc mesenteroides LEY9 non productrices d'amines
biogènes.
138
Publications et communications
139
Publication et communications
Communications:
140
Résumé
A partir de 12 échantillons de lait cru de dromadaire provenant de l'Ouest et du Sud-ouest
Algérien, 41 bactéries lactiques isolées ont été phénotypiquement caractérisées et
génétiquement identifiées. Sur la base de leur forme ainsi que de leur métabolisme
fermentaire, 27 isolats sous formes de cocci homofermentaire ont été subdivisés en 2 genres
présomptifs, Enterococcus (23 isolats) et Lactococcus (4 isolats) ; les 7 cocci
hétérofermentaires ont été considérées comme appartenant au genre Leuconostoc. Les 7 autres
isolats sous forme de bâtonnets ont été assignés au genre Lactobacillus. L'identification
moléculaire par le séquençage des gènes codant pour l'ARNr 16S et pour la superoxyde
dismutase a montré qu'ils appartenaient aux espèces du genre : Enterococcus faecium (19
isolats), Enterococcus hirae (2 isolats), Leuconostoc mesenteroides (7 isolats), Lactobacillus
rhamnosus (7 isolats) et Lactococcus lactis (6 isolats). Tous les isolats ont été caractérisés en
déterminant certaines propriétés technologiques et de sécurité. Leur capacité d'acidification,
d’activité protéolytique et lipolytique, d’utilisation du citrate et de production de dextrane et
d'acétoïne a montré le potentiel technologique de certains isolats. Le dosage par CPG à espace
de tête couplé à la spectrométrie de masse a montré que les composés volatils majeurs
produits sont l'éthanol, l'acétaldéhyde, l’acétate de méthyle, l'acétoïne et l'acide acétique. Le
potentiel d'acidification de 5 isolats représentant chaque espèce identifiée a été testé en
effectuant une cinétique d'acidification durant 48 h. Les résultats ont montré que la plus forte
acidification a été obtenue avec la souche de Lactococcus lactis (pH final de 4,00),
contrairement à la souche de Leuconostoc mesenteroides qui a été considérée comme une
espèce faiblement acidifiante (valeur maximale du pH = 5,80). Par ailleurs, l'activité
antimicrobienne des espèces isolées a été testée par la méthode indirecte contre 6 souches
indicatrices, montrant que les souches ayant la plus forte activité sont les souches
d'Enterococcus faecium. La capacité de ces isolats à produire les amines biogènes a été
vérifiée; il a été observé que toutes les espèces d'Enterococcus faecium ont produit de la
tyramine et que toutes les espèces de Lactococcus lactis ont produit de la putrescine. Enfin,
une analyse de cluster des bactéries lactiques isolées, basée sur l'analyse de l'ensemble des
caractéristiques phénotypiques investiguées (n= 40), a été effectuée en utilisant une méthode
de groupe non pondéré avec moyenne arithmétique (UPGMA). Un dendrogramme a été
construit, montrant ainsi des distances entre les différents isolats. L'ensemble des résultats
obtenus permettent de montrer la grande diversité des bactéries lactiques indigènes qui
peuvent coloniser le lait de dromadaire et de dévoiler leurs performances technologiques pour
les intégrer dans l'industrie laitière.
Mots clés :
Lait de dromadaire ; bactéries lactiques ; diversité ; propriétés technologiques ; activité
protéolytique ; composés volatils ; culture starter ; amines biogènes.