Annales Pharmaceutiques Françaises (2021) 79, 216—226

Disponible en ligne sur

ScienceDirect
www.sciencedirect.com

ARTICLE ORIGINAL

Spécificités épidémiologiques de la
COVID-19 en Afrique : préoccupation de
santé publique actuelle ou future ?
Epidemiological specificities of COVID-19 in Africa: Current or future public
health concern?

É.J.L. Hardy a, P. Flori a,b,∗

a
Biologie Sans Frontières, 31, rue Mazenod, 69003 Lyon, France
b
EA-3064-groupe immunité des muqueuses et agents pathogènes, faculté de médecine,
université Jean-Monnet, 42055 Saint-Étienne, France

Reçu le 29 juillet 2020 ; accepté le 13 octobre 2020

Disponible sur Internet le 19 octobre 2020

HIGHLIGHTS
• L’Afrique (17 % de la population mondiale) ne regroupe en août 2020 que 5 % des cas mondiaux de COVID-19.
• Des facteurs climatiques et démographiques limitent l’épidémie de COVID-19.
• Les données officielles de l’OMS sont impactées par la capacité diagnostique africaine.
• Les projets de santé publique africains (non COVID-19) sont interrompus ou ralentis.

MOTS CLÉS Résumé

COVID-19 ; Objectifs. — L’Afrique est le continent le moins armé pour lutter contre l’épidémie de COVID-
Afrique ; 19. Cependant, l’Afrique qui regroupe 17 % de la population mondiale, ne pèserait que 5 % des
Climat ; cas mondiaux (source : OMS à la date du 04/08/2020). Dans ce travail, les auteurs essaient
Démographie ; d’identifier et de comprendre les raisons de ces données épidémiologiques.
PIB ; Méthode. — De nombreux suivis d’indicateurs ont été réalisés grâce principalement aux rapports
Capacité de l’OMS. Ces données ont été confrontées à la littérature, ainsi qu’à l’expertise de terrain de
diagnostique l’association « biologie sans frontières » en Afrique.

∗ Auteur correspondant.
Adresse e-mail : pierre.flori@chu-st-etienne.fr (P. Flori).

https://doi.org/10.1016/j.pharma.2020.10.011
0003-4509/© 2020 Académie Nationale de Pharmacie. Publié par Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
Spécificités épidémiologiques de la COVID-19 en Afrique 217

Résultats. — Les points suivants marquent la singularité de la COVID-19 en Afrique : (1) une capa-
cité diagnostique insuffisante liée au produit intérieur brut, (2) une population jeune réduisant
la population à risque et le nombre de décès, (3) un climat favorable (chaud et humide) limitant
la transmission virale, (4) de nombreux facteurs socioculturels pouvant limiter la déclaration
des cas.
Conclusion. — Aujourd’hui, cette crise sanitaire est médiatiquement omniprésente alors que le
nombre de décès reste limité en Afrique. En parallèle, des actions concernant les réelles priori-
tés de santé publique africaines (paludisme, diarrhées, SIDA. . .) sont ralenties ou interrompues.
© 2020 Académie Nationale de Pharmacie. Publié par Elsevier Masson SAS. Tous droits
réservés.

KEYWORDS Summary
COVID-19; Objectives. — Africa is the continent which is the least equipped to fight the COVID-19 epidemic.
Africa; However, Africa, which represents 17 % of the world’s population, is estimated to have only 5 %
Climate; of global cases (source: WHO on 2020/08/04). In this work, the authors try to identify and
Demography; understand the reasons for these epidemiological data.
GDP; Method. — Some follow-up indicators have been carried out, mainly through WHO reports. These
Diagnostic capacity data were compared with the literature and the field expertise of the association ‘‘Biologie sans
frontières’’ in Africa.
Results. — The following points mark the particularity of COVID-19 in Africa: (1) insufficient
diagnostic capacity (linked to gross national product), (2) a younger population limiting the
population at risk and the number of deaths, (3) a favourable climate (hot and humid) which is
decreasing viral transmission, (4) some socio-cultural factors that can reduce cases reporting.
Conclusion. — Today, this health crisis is omnipresent while the number of deaths remains
limited in Africa. Simultaneously, actions concerning African public health priorities (malaria,
diarrhoea, AIDS. . .) are interrupted or slowed down.
© 2020 Académie Nationale de Pharmacie. Published by Elsevier Masson SAS. All rights reserved.

Introduction pas frappées de la même manière par la pandémie. Le conti-

Le monde entier connaît désormais cette ville, Wuhan. Capi-
tale de la province d’Hubei, en Chine et point de départ
de la pandémie de COVID-19 (COronaVIrus Disease 2019).
Le 31 décembre 2019, la commission sanitaire municipale
de Wuhan signale officiellement la présence d’un groupe
de cas de pneumonie dans la ville [1]. Les autorités sani-
taires chinoises et l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS)
déclarent conjointement, le 9 janvier 2020, que cette mala-
die infectieuse respiratoire est causée par une nouvelle
souche de bêtacoronavirus, le SARS-CoV-2 (Severe Acute
Respiratory Syndrome COronaVirus 2) [2]. La séquence de
ce virus, préalablement appelé 2019-nCoV (Novel COronaVi-
rus), est partagée publiquement par les autorités chinoises
le 12 janvier 2020 [3].
Alors que le SARS-CoV-2 s’est propagé rapidement sur
tous les continents, le directeur général de l’OMS, Dr. Tedros
Adhanom Ghebreyesus, déclare le 11 mars 2020 lors d’une
conférence de presse que « la COVID-19 peut être qualifiée
de pandémie » [4]. Au moment de finaliser l’écriture de cet
article, le bulletin quotidien de l’OMS du 4 août [5] annonce
18 millions de cas de COVID-19 répartis dans l’intégralité
des pays du monde. Bien que l’ensemble de l’humanité soit
touché, on constate que toutes les régions du monde ne sont
nent africain, qui regroupe 17 % de la population mondiale,
ne pèse que 5 % des cas mondiaux de COVID-19. Une catas-
trophe était pourtant attendue en Afrique en raison de ses
liens commerciaux privilégiés avec la Chine et de la fragilité
de son système de santé [6].
Contre toute attente, les données épidémiologiques four-
nies par l’OMS indiquent que l’Afrique s’en sortirait mieux
que les autres continents. Les chiffres reflètent-ils la réa-
lité de terrain africaine ? Si oui, quelles en seraient les
raisons ? Eclairés par l’observation des données épidémiolo-
giques de l’OMS et de la bibliographie disponible, les auteurs
(= association biologie sans frontières, acteur de santé en
Afrique pour le développement de la biologie médicale)
discuteront des différentes problématiques et hypothèses
pouvant expliquer la singularité de la situation africaine et
de son évolution.
Méthode
Pour simplifier l’expression des figures présentées, une
comparaison de données de 3 continents (Amérique, Europe,
Afrique) subdivisés en 11 régions est réalisée. Cette
comparaison exclut les données concernant les continents
218
Figure 1. Nombre de cas cumulés de COVID-19 pour 10 millions d’habitants de différentes régions du monde en fonction du temps.
Cumulative number of cases of COVID-19 per 10 million people in different regions of the world.
asiatique et océanique, continents multiculturels et com-
posites. Cette régionalisation est basée sur des critères
géographiques et diffère de celle de l’OMS basée sur des
critères géopolitiques.
Pour l’Afrique, 5 régions ont été définies : Afrique du Nord
(Algérie, Egypte, Libye, Maroc, Tunisie), Afrique de l’Ouest
(Bénin, Burkina Faso, Cap Vert, Côte d’ivoire, Gambie,
Ghana, Guinée, Guinée-Bissau, Libéria, Mali, Mauritanie,
Niger, Nigeria, Sénégal, Sierra Leone, Togo), Afrique Cen-
trale (Angola, Cameroun, République Centrafricaine, Tchad,
Congo, République Démocratique du Congo, Guinée Equa-
toriale, Gabon, Sao Tomé-et-Príncipe), Afrique de l’Est
(Burundi, Djibouti, Erythrée, Ethiopie, Kenya, Madagascar,
Malawi, Maurice, Mozambique, Rwanda, Seychelles, Soma-
lie, Soudan, Soudan du Sud, Ouganda, Tanzanie, Zambie,
Zimbabwe) et Afrique du Sud (Botswana, Eswatini, Namibie
et Afrique du Sud).
Pour l’Europe, 3 régions ont été définies : Europe
du Nord (Norvège, Suède, Allemagne, Royaume Uni, Pays
Bas, Belgique, Autriche, Suisse, Irlande, Danemark, Fin-
lande, Luxembourg, Islande), Europe méditerranéenne
(Italie, France, Espagne, Portugal, Serbie, Grèce, Bosnie
Herzégovine, Croatie, Slovénie, Albanie, Chypre, Malte,
Monténégro, Macédoine) et Europe de l’Est (Hongrie, Slova-
quie, Pologne, République Tchèque, Roumanie, Biélorussie,
Ukraine, Moldavie, Bulgarie, Estonie, Lituanie, Lettonie).
Pour l’Amérique, 3 régions ont été définies : Amérique
du Nord (États-Unis, Canada), Amérique Centrale (Mexique,
Panama, Honduras, Guatemala, Salvador, Costa Rica, Nica-
ragua, Belize) et Amérique du Sud (Equateur, Brésil, Pérou,
Colombie, Chili, Argentine, Bolivie, Venezuela, Paraguay,
Uruguay, Guyane, Suriname).
Dans cet article, des indicateurs simples et compréhen-
sibles par le plus grand nombre (pas seulement par des
épidémiologistes spécialisés) sont définis :
É.J.L. Hardy, P. Flori
• nombre de cas de COVID-19 par population standardisée
(Fig. 1) ;
• « temps de passage » du virus (Fig. 1) ;
• produit intérieur brut (PIB) pondéré par habitant
(Tableau 1) ;
• nombre de tests réalisés par technique de biologie molé-
culaire (RT-qPCR COVID-19) par population standardisée
(Fig. 2) ;
• pourcentage de cas positifs par nombre de tests réalisés
(Fig. 2) ;
• nombre de décès de COVID-19 par population standardi-
sée (Fig. 3) ;
• taux de mortalité par population standardisée et taux de
mortalité par cas de COVID-19 (Fig. 3).
Le nombre de cas et de décès de COVID-19 par pays est
extrait hebdomadairement des rapports quotidiens de l’OMS
[7], dans un intervalle de temps de 6 mois (du 4 février
au 4 août 2020) et additionné par région. La population de
chaque pays provient des estimations des Nations Unies [8].
Le nombre de cas et de décès de COVID-19 est standardisé
pour 10 millions d’habitants pour chacune des régions mon-
diales identifiées. Ces données permettent de déterminer
des cinétiques d’évolution épidémiologique exprimées sur
une échelle logarithmique.
Un nouvel indicateur a été défini pour caractériser la
cinétique du nombre de cas de COVID-19 par population
standardisée, nommé le « temps de passage ». Celui-ci
correspond au temps nécessaire (exprimé en semaines)
pour que le nombre de virus passe de 10 à 1000 cas de
COVID-19 pour une population standardisée de 10 millions
d’habitants. Cet indicateur « neutre » semble plus adapté
que le taux de reproduction (Ro, Re ou Rt) qui est souvent
plus difficilement compréhensible et interprétable.
Les PIB par habitant proviennent des estimations des
Nations Unies [9]. Les PIB ont été pondérés en fonction de la
Spécificités épidémiologiques de la COVID-19 en Afrique 219

Tableau 1 PIB par habitant en dollars de différentes régions du monde pondéré en fonction de leur population.
Population-weighted GDP per capita in dollars in different regions of the world.
Pays tempérés
Région du monde Pays PIB pondéré par
habitant 2018
Amérique du Nord Canada, Etats-Unis 61,206
Europe du Nord Norvège, Suède, Allemagne, Royaume-Uni, Pays-Bas, Belgique, 50,444
Autriche, Suisse, Irlande, Danemark, Finlande, Luxembourg,
Islande
Europe Italie, France, Espagne, Portugal, Serbie, Grèce, Bosnie 31,734
méditérané-enne Herzegovine, Croatie, Slovénie, Albanie, Chypre, Malte,
Monténégro, Macédonie
Europe de l’Est Hongrie, Slovaquie, Pologne, République Tchèque, Roumanie, 11,189
Biélorussie, Ukraine, Moldavie, Bulgarie, Estonie, Lituanie,
Lettonie

Pays tropicaux

Région du monde Pays PIB pondéré par

Amérique Centrale
Amérique du Sud
Afrique du Nord
Afrique de l’Est
Afrique Centrale
Afrique de l’Ouest
Afrique du Sud
habitant 2018
Mexique, Panama, Honduras, Guatemala, Salvador, Costa Rica, 8496
Nicaragua, Belize
Equateur, Brésil, Pérou, Colombie, Chili, Argentine, Bolivie, 8743
Vénézuela, Paraguay, Uruguay, Guyane, Suriname
Algérie, Egypte, Libye, Maroc, Tunisie 3157
Burundi, Djibouti, Erithrée, Ethiopie, Kenya, Madagascar, 924
Malawi, Maurice, Mozambique, Rwanda, Seychelles, Somalie,
Soudan, Soudan du Sud, Ouganda, Tanzanie, Zambie, Zimbabwe
Angola, Cameroun, République centrafricaine, Tchas, Congo, 1480
République Démocratique du Congo, Guinée Equatoriale, Gabon,
Sao Tomé-et-Principe
Bénin, Burkina Faso, Cap Vert, Côte d’Ivoire, Gambie, Ghana, 1693
Guinée, Guinée-Bissau, Libéria, Mali, Mauritanie, Niger, Nigéria,
Sénégal, Sierra Leone, Togo
Botswana, Eswatini, Nambie, Afrique du Sud 6381

Figure 2. Évaluation de la capacité diagnostique de différentes régions du monde.

Assessment of diagnostic capacity in different regions of the world.
220
Figure 3. Nombre de décès cumulés de COVID-19 pour 10 millions d’habitants de différentes régions du monde en fonction du temps.
Cumulative number of deaths of COVID-19 per 10 million people in different regions of the world.
population de chaque pays pour obtenir un PIB moyen d’une
région mondiale.
Le nombre de tests diagnostiques réalisés par pays est
tiré de la base de données « SARS-CoV-2 test tracker » du site
FIND [10], additionné par région et standardisé pour 10 mil-
lions d’habitants. Le pourcentage de cas positifs par nombre
de tests réalisés d’une région est calculé par la somme des
cas positifs d’une région, rapporté à la somme des tests
réalisés.
Le taux de mortalité d’une région est calculé par le
rapport entre le nombre de décès de COVID-19 au 4 Août
2020 standardisé pour 10 millions d’habitants ou pour 10 mil-
lions de cas de COVID-19.
Résultats
Nombre de cas de COVID-19 par population
standardisée et leur évolution (temps de
passage)
Les données réactualisées de l’OMS ont été compilées afin
d’obtenir les tendances épidémiologiques de chaque région
africaine et de différentes régions du monde (Fig. 1). La
pente de ces courbes (représentant le nombre de nouveaux
cas cumulés et standardisés pour 10 millions d’habitants)
illustre la vitesse de propagation du virus. Plus la pente est
verticale, plus le virus se propage rapidement au sein de la
population ; plus elle est horizontale, plus la vitesse de pro-
pagation est lente. Nous caractérisons cette pente par un
indicateur, le « temps de passage » du virus. Pour chaque
région mondiale, cet indicateur (encadré vert — Fig. 1)
permet d’observer la vitesse de propagation du virus dans
son état initial et quasi-parfait en début d’épidémie. Par
exemple, en Amérique du Nord (courbe jaune — Fig. 1) et
en Europe (courbes bleues — Fig. 1), la vitesse de propaga-
tion croît de manière intense, avec un « temps de passage »
du virus de 2 à 4 semaines, soit une augmentation du nombre
de cas de COVID-19 de presque 1 logarithme par semaine.
É.J.L. Hardy, P. Flori
Par la suite, le nombre de nouveaux cas de COVID-19 dimi-
nue chaque semaine et tend vers l’absence de nouveau cas,
ce qui est caractéristique d’une croissance asymptotique.
Une absence totale de nouveaux cas serait caractérisée par
une pente horizontale. Dans les régions d’Afrique subsa-
harienne, on observe un ralentissement très prononcé du
temps de passage, de 10 semaines pour l’Afrique de l’Ouest
et l’Afrique Centrale jusqu’à 15 semaines pour l’Afrique de
l’Est. L’Afrique du Sud et l’Afrique du Nord sont respecti-
vement à 7 et 8 semaines alors que l’Amérique du Sud et
l’Amérique Centrale sont à 4 et 6 semaines.
Richesse des régions mondiales (PIB) et
saturation diagnostique
Les régions présentant les temps de passage les plus longs
(courbes oranges et rouges — Fig. 1) correspondent à
l’ensemble des pays tropicaux et équatoriaux au climat
chaud et humide (Amérique Centrale, Amérique du Sud et
Afrique). Elles correspondent également à l’ensemble des
régions mondiales présentant un PIB inférieur à 10 000 dol-
lars par habitant (Tableau 1). En outre, le PIB des régions
subsaharienne (Afrique de l’Est, Afrique Centrale, Afrique
de l’Ouest) qui détiennent des temps de passage maximum
(10 et 15 semaines) ne dépassent pas les 2000 dollars par
habitant. La même tendance est également observable dans
les régions du Nord au climat tempéré (Europe et l’Amérique
du Nord) où plus le PIB d’une région est élevé, plus le temps
de passage du virus est faible. Le PIB serait-il proportionnel
aux moyens médicaux (infrastructures hospitalières, person-
nel soignant, accès aux soins. . .) dont dispose ces régions
pour lutter contre la COVID-19 ?
Afin d’évaluer leur capacité diagnostique, le nombre
cumulatif des tests réalisés par population standardisée
(Fig. 2a) de chaque région mondiale est comparée [données
accessibles sur le site FIND SARS-CoV-2 test tracker [10]]. On
observe que les régions d’Afrique subsaharienne caractéri-
sée par des temps de passage du virus très long et un PIB
très faible possèdent une capacité cumulative inférieure à
Spécificités épidémiologiques de la COVID-19 en Afrique
50 000 tests pour 10 millions d’habitants. Ce chiffre est 20 à
70 fois plus faible que celui des 3 régions au temps de pas-
sage les plus courts et au PIB les plus élevés, soit l’Amérique
du Nord, l’Europe du Nord et l’Europe méditerranéenne, qui
ont dépassé le million de tests pour 10 millions d’habitants.
Pourcentage de cas positifs par nombre de
tests réalisés
Le pourcentage de cas positifs par rapport au nombre de
tests réalisés (Fig. 2b) [données brutes accessibles sur le
site FIND SARS-CoV-2 test tracker [10]] est un bon indicateur
de présence du virus. Par expérience européenne, ce pour-
centage croît proportionnellement à l’endémicité du virus
pour atteindre (au pic) des valeurs supérieures à 30 %. Les
régions à forts revenus (PIB > 10 000 dollars par habitant)
présentent un pourcentage moyen de cas positifs par nombre
de tests réalisés de 2 à 7 %. Ces pourcentages sont plus dispa-
rates dans les régions plus modestes (PIB < 10 000 dollars par
habitant). Alors que l’Afrique du Nord, l’Afrique de l’Ouest,
l’Afrique Centrale et l’Afrique du Sud présentent des résul-
tats proches de 7 à 15 %, l’Amérique Centrale et l’Amérique
du Sud atteignent des pourcentages très élevés de respec-
tivement 19 et 35 %. À l’opposé, l’Afrique de l’Est possède
un pourcentage de cas positifs par nombre de tests réalisés
extrêmement faible de 4 %.
Nombre de décès de COVID-19 par population
standardisée
Si le nombre de cas en Afrique subsaharienne par population
standardisée est globalement 10 fois plus faible par rapport
aux régions européennes, le nombre de décès par population
standardisée est encore plus dérisoire avec un facteur diffé-
rentiel d’environ 100 (Fig. 3). Bien que réduite, la tendance
est identique pour l’Afrique du Nord qui présente 5 fois
moins de cas et 10 fois moins de décès par population stan-
dardisée que les régions d’Europe. L’Afrique du Sud, région
africaine comptabilisant le plus grand nombre de cas et de
décès par population standardisée en Afrique, déclare 3 fois
plus de cas que les régions européennes et décompte 3 fois
moins de décès que ses homologues européens par popula-
tion standardisée. Par ailleurs et de manière indépendante,
il est intéressant de noter un croisement net des courbes de
décès (Fig. 3) entre la région Afrique du Nord (en évolution
vers une stabilisation) et Afrique du Sud (en augmentation
régulière) jusqu’à la date du 4 août (fin de la période de
notre étude).
Nombre de décès de COVID-19 et
caractéristique démographique
Devant de tels chiffres (facteur différentiel entre le nombre
de décès des régions de l’hémisphère Nord et celles du conti-
nent africain), nous avons voulu voir quelle était l’influence
de la singularité démographique du continent africain. La
population africaine est très jeune, composée de 29 % à 45 %
d’enfants de moins de 15 ans, pour seulement 3 % à 5 % de
personnes âgées de 65 ans et plus (Fig. 4). À l’inverse, la
population européenne est vieillissante et possède 2 à 3 fois
221
moins d’enfants de moins de 15 ans, pour 3 à 7 fois plus de
personnes âgées de 65 ans et plus.
Discussion
Chronologie épidémiologique et impact des
mesures sanitaires
Les régions européennes et d’Amérique du Nord sont les pre-
mières régions du monde à être touchées par la pandémie
après l’Asie. Lors de l’intervalle choisi pour déterminer le
temps de passage du virus dans ces régions (10 à 1000 cas
pour 10 millions d’habitants), le virus se propage librement
dans la population puisque les mesures sanitaires de lutte
contre la propagation du virus ne sont pas encore clairement
définies et obligatoires. L’établissement de politiques de dis-
tanciation sociale et de confinement, ainsi que l’adoption
des gestes barrières, ralentissent drastiquement la vitesse
de propagation du virus et viennent « casser » les courbes
épidémiologiques (situation de mai à août en France).
Les régions tropicales d’Amérique Centrale, d’Amérique
du Sud et d’Afrique sont les dernières régions du monde à
être touchées par la COVID-19. Cet ordre chronologique a
probablement eu un impact sur la pente et sur « le temps
de passage ». Face à la surmédiatisation de la crise sani-
taire mondiale, les gouvernements étaient sensibilisés et
ont appliqué rapidement des mesures sanitaires, certes par-
fois minimalistes, suite à l’apparition des premiers cas. Cela
a probablement contribué au rallongement du temps de
passage, synonyme d’une propagation ralentie du virus, ce
qui profite aux régions du Sud qui bénéficient de plus de
temps pour organiser rigoureusement leur lutte anti-COVID-
19.
L’évaluation du temps de passage nous permet de
conclure que la progression du virus est fortement ralen-
tie dans les régions du Sud en comparaison aux régions du
Nord. Le gradient Nord-Sud de cet indicateur est surpre-
nant et important. Est-il simplement lié à la précocité des
mesures sanitaires ou à d’autres paramètres ?
Impact de la chaleur et de l’humidité sur la
propagation du virus
La saisonnalité de ce nouveau virus respiratoire a été
largement évoquée : la chaleur et l’humidité africaine
seraient-elles partie prenante dans la transmission du virus ?
Effectivement, on remarque, que sans exception, les pentes
des pays chauds (courbes rouge et orange — Fig. 1) sont sys-
tématiquement plus basses que celles des pays tempérés
(courbes jaune et bleue — Fig. 1). On remarque aussi un
croisement net du nombre de décès entre l’Afrique du Nord
(en ralentissement car débutant la saison estivale) et de
l’Afrique du Sud (en augmentation car débutant la période
hivernale) à partir du mois de Mai (Fig. 3).
Bukhari et al. observent dans leur étude la même ten-
dance entre les états du Nord et du Sud des États-Unis [11].
Ils ajoutent que les régions qui ont démontré le plus grand
nombre de nouveaux cas se trouvent dans une fourchette
de faible température (4 à 10 ◦ C) et de faible humidité (3 à
9 g/m3 ). Sajadi et al. arrivent à des conclusions semblables
222
Figure 4. Impact de la pyramide des âges de différentes régions du monde sur la gravité, la contagiosité et la charge virale des cas de
COVID-19.
Impact of the age pyramid in different regions of the world on the severity, contagiousness and viral load of COVID-19 cases.
et observent que les plus gros foyers épidémiques mondiaux
se trouvent dans un couloir de température moyenne de 5 à
11 ◦ C avec un faible taux d’humidité de 4 à 7 g/m3 [12].
D’un point de vue biologique, la chaleur et le taux
d’humidité sont déjà connus pour avoir un impact négatif
sur la transmission des virus respiratoires. Dans le cas de
la grippe, les études montrent qu’une hausse de la tempé-
rature (20 ◦ C et 30 ◦ C versus 5 ◦ C) limite la réplication du
virus [13]. D’une part, un faible taux d’humidité assèche
les muqueuses nasales et altère l’intégrité fonctionnelle des
épithéliums pulmonaires. D’autre part, il favorise la stabilité
des particules virales contenues à l’intérieur des goutte-
lettes d’aérosol dans lesquelles elles sont transportées [14].
La taille des gouttelettes est également impactée par le
taux d’humidité qui modifie leur capacité à persister et à
se déplacer dans l’air. La hausse du taux d’humidité va pro-
voquer un grossissement de la taille des gouttelettes qui
retomberont plus rapidement au sol après avoir été expul-
sées par l’appareil respiratoire, ce qui réduira ainsi leur
capacité à infecter un autre hôte [15].
Les conditions climatiques semblent donc limiter la
transmission du virus en Afrique. Elles s’associeraient aux
mesures sanitaires pour moduler la pente de nos courbes
(Fig. 1 et 3) et ralentir notre indicateur de « temps de
passage » (Fig. 1). Cependant, l’impact du climat reste
difficilement évaluable aujourd’hui, mais une ou deux sai-
sons supplémentaires devraient permettre de modéliser cet
impact plus précisément.
É.J.L. Hardy, P. Flori
Richesse des régions mondiales (PIB) et
saturation diagnostique
Alors que la circulation du virus présente une corrélation
inverse à la chaleur, elle semble également reliée à la
richesse du territoire. En effet, le PIB d’un pays ou d’une
région est étroitement corrélé à sa capacité diagnostique,
facteur déterminant de la gestion de la pandémie. Un pays
au faible PIB n’a pas les ressources matérielles, humaines et
technologiques suffisantes pour effectuer le même volume
de tests diagnostiques qu’un pays plus aisé. Les centres de
dépistage en Afrique sont trop peu nombreux pour répondre
de manière quantitative à la demande de la population.
La réalisation d’un nombre quotidien de tests de détection
d’ARN viral par RT-qPCR requiert une grande rigueur orga-
nisationnelle et logistique. Dans ce contexte épidémique,
même les pays « riches » se sont heurtés à des probléma-
tiques de pénurie et d’organisation. Les pays d’Afrique sont
confrontés aux mêmes écueils et présentent un risque accru
de saturation du système diagnostique, ce qui favoriserait
la circulation « incognito » du virus.
On constate effectivement que les régions d’Afrique
subsaharienne ont réalisé environ 20 à 70 fois moins de
tests diagnostiques par habitant que les 3 régions occiden-
tales les plus aisées (Amérique du Nord, Europe du Nord
et Europe méditerranéenne) et ont, en parallèle, identifié
environ 10 à 60 fois moins de cas de COVID-19. Par consé-
quence, plus une région dépiste à grande échelle, plus elle
Spécificités épidémiologiques de la COVID-19 en Afrique
identifie un grand nombre de cas de COVID-19. Une capacité
diagnostique insuffisante mène nécessairement à une sous-
évaluation de la circulation du virus au sein de la population.
La croissance moins explosive du nombre de cas identifiés en
Afrique et de notre indicateur du « temps de passage » pour-
rait être liée à une saturation de leur capacité diagnostique
et ceci même à la phase précoce de l’épidémie.
Le faible pourcentage de cas positifs par nombre de tests
réalisés en Europe (environ 3 %) est le résultat d’une cam-
pagne de dépistage à grande échelle, cumulée à de fortes
restrictions sanitaires (confinement), limitant efficacement
la propagation du virus. Un pourcentage 2 fois plus important
en Amérique du Nord semble cohérent avec la progression du
nombre de cas qui continue de croître significativement par
rapport à l’Europe. Les pourcentages d’Amérique Centrale
et d’Amérique du Sud sont quand à eux extrêmement éle-
vés. Sont-ils le reflet d’une politique de diagnostic associée
à un meilleur ciblage des personnes malades ou le mar-
queur d’une circulation virale très importante ? En Afrique,
la différence (de 3 % à 15 %) entre des régions à la grande
proximité géographique et au faible PIB interroge sur la fia-
bilité et la représentativité des données. Il est étonnant que
l’Afrique de l’Est qui est la région la plus pauvre possède
un pourcentage de cas positifs par nombre de tests réalisés
semblable à l’Europe qui s’explique par l’application d’un
dépistage de masse. Est-ce que les personnes malades ont
réellement accès aux tests diagnostics ou le dépistage est-il
un luxe réservé à la tranche la plus aisée de la population ?
Est-ce que les statistiques relatives au nombre de tests et de
cas de COVID-19 sont-ils uniformément traités dans toutes
les infrastructures hospitalières du continent ? Est-ce que
l’ensemble des pays africains fait preuve de la même trans-
parence et méthodologie lors de la communication de ces
données sensibles ?
Sans la publication d’études africaines multicentriques
et indépendantes, il semble légitime de s’interroger sur la
concordance entre les données communiquées et la réelle
propagation du virus sur le continent africain.
Vulnérabilité de la population africaine en
fonction de la pyramide des âges et des
facteurs de comorbidité
Le faible taux de mortalité lié à la COVID-19 en Afrique
surprend et déjoue les prédictions [6]. L’état d’urgence
sanitaire partagé par de nombreux pays européens en avril
2020 et marqué par une saturation complète des infra-
structures de réanimation, ainsi que des établissements
funéraires ne s’est pas produit en Afrique.
La singularité de la pyramide des âges africaine, carac-
térisée par une population très jeune et un très faible
nombre de personnes âgées, semble avoir un impact consi-
dérable sur ce plus faible taux mortalité. En effet, en France
et par extension dans les pays développés, les personnes
âgées de plus de 65 ans représentent 55 % des cas graves
de COVID-19 admis en réanimation et 75 % des décès en
réanimation [16]. De plus, une étude britannique de grande
échelle publiée dans le journal Nature identifie les facteurs
de comorbidité de la COVID-19 associés à la grande majo-
rité des décès COVID-19 tels que l’obésité, la démence, le
cancer ainsi que les maladies cardiovasculaire, pulmonaires
223
et rénales. . . [17]. Ces facteurs de comorbidité, fortement
présents dans les pays à fort revenus et chez les personnes
âgées, sont de plus en plus fréquents en Afrique. Cepen-
dant, leur incidence reste encore beaucoup plus faible qu’en
Europe et Amérique du Nord, ce qui limite le nombre de per-
sonnes susceptibles de développer des formes graves de la
COVID-19 et d’en décéder.
De manière associée, les personnes présentant des
formes graves de la COVID-19 (personnes âgées et présen-
tant des facteurs de comorbidité) détiennent une charge
virale plus élevée [18] et seraient de ce fait les plus conta-
gieuses [19]. À l’inverse, les cas pédiatriques ne regroupant
que 1 % à 5 % des cas mondiaux [20] développent des
formes peu graves [21]. Ils sont rarement retrouvés en réani-
mation [16] et seraient associés à une charge virale plus
réduite [22]. En conséquence et à contrario de la grippe,
les enfants et les jeunes adultes, majoritaires en Afrique,
ne présenteraient qu’un rôle épidémiologique limité dans la
transmission de la COVID-19 [23].
La combinaison d’une population jeune, à une faible pré-
valence des facteurs de comorbidité dans la population,
convergent vers la même tendance épidémiologique concer-
nant la COVID-19 : un nombre de décès réduit et un frein
important dans la transmission du virus (Fig. 4). Cette parti-
cularité démographique confère ainsi à l’Afrique un bouclier
naturel qui contribue largement à l’obtention d’un taux de
mortalité significativement moins important qu’en Europe.
Enjeux diplomatiques, politiques, stratégiques
et socio-culturels
La pandémie étant mondiale, la gestion de la crise devient
un exercice diplomatique des plus périlleux. La crédibi-
lité des gouvernements est en jeu et chacun sait que les
moindres décisions sont disséquées et soumises à la cri-
tique des médias. Dans ce contexte, il est difficile pour les
gouvernements d’admettre qu’ils sont dépassés par les évè-
nements. Les recommandations de l’OMS, aussi soumises à
des critiques populaires systématiques, ne sont pas appli-
quées dans tous les pays et continents avec la même rigueur
et la même vitesse d’exécution. L’incapacité de dépister
à grande échelle la population, de mettre rapidement en
place un confinement total et de faire respecter les gestes
barrières ont largement conditionné l’ampleur de la crise.
Les gouvernements asiatiques ont été très réactifs et ont
mis en place sans tarder les mesures nécessaires, bien que
jugées très restrictives pour les libertés individuelles. Ils ont
pu compter sur le soutien de l’ensemble de leur population
qui, de part leur culture de la catastrophe, est préparée à ce
genre de situation et sait appliquer les consignes restrictives
avec une grande discipline. À l’inverse, les gouvernements
européens et américains bien moins préparés ont mis plus
de temps à réagir. Les questions éthiques et les conséquen-
ces économiques ont pris une grande place dans les débats
et ont ralenti la prise de décision indispensable à la bonne
gestion de l’urgence sanitaire.
L’Afrique a eu quelques semaines de plus pour préparer
sa stratégie de lutte contre la COVID-19. De nombreux pays
africains ont voulu imiter les politiques de confinement et
d’application des gestes barrières observées en Occident.
Cependant, le contexte africain est totalement différent
224
et ne permet pas de reproduire à la lettre ces mesures
« occidentales ». Les gestes barrières sont difficilement
applicables lorsque 2 africains sur 3 ne peuvent pas se laver
les mains quand ils le souhaitent par manque d’accès à une
source d’eau [24]. La distanciation physique est également
impossible à respecter dans de nombreux quartiers précaires
et surpeuplés. De nombreux pays ont choisi d’établir un
confinement et ont rapidement dû faire marche arrière. Les
chaînes de production et d’approvisionnement étant plus
fragiles, l’alimentation en produits de première nécessité
n’a pas pu être maintenue à un état acceptable. Une plus
large part de l’économie et des revenus gravitent autour
des marchés, du troc et des services de proximité. Sans
les mesures de protection sociale déployées par les gou-
vernements occidentaux, une politique de confinement met
beaucoup plus en péril les populations précaires africaines
que ne le fait la COVID-19.
Spectatrice impuissante de l’« hypermédiatisation » mon-
diale de la pandémie, l’Afrique reste dans l’attente et dans
la crainte d’être dépassée à son tour. Cela génère une cer-
taine stigmatisation des personnes atteintes par la maladie.
Sans traitement connu à ce jour, l’hôpital est davantage
perçu comme un lieu à risque qu’une structure soignante.
Cela incite les populations à ne pas se rendre à l’hôpital,
mais plutôt à se soigner en famille, à l’abri des regards. Les
rassemblements religieux ont eu un impact majeur dans la
création de foyers épidémiques (période de Ramadan, fête
de Pâques. . .). La place des aînés dans la société est éga-
lement différente d’une culture à l’autre. En Afrique, les
personnes âgées ne sont pas placées en maison de retraite
mais prises en charge par les familles. Cela limite grande-
ment le regroupement et la propagation du virus au sein
de cette population vulnérable, comme observé dans les
établissements d’hébergement pour personnes âgées dépen-
dantes (EHPAD ou maison de retraite). Dernier point majeur,
les enterrements profondément ancrés dans la culture et
la tradition africaine sont inconcevables sans le corps du
défunt. C’est une raison suffisante pour un grand nombre de
famille africaine de ne pas déclarer un cas suspect qui, s’il
est confirmé et décède, serait associé à l’impossibilité de
disposer du corps en l’état.
Tous ces facteurs diplomatiques, politiques, stratégiques
et socio-culturels réduisent encore plus le nombre de décès
déclarés. Le nombre reconnu par les autorités sanitaires
locales, n’est probablement qu’un reflet parcellaire de la
situation africaine. . .
Impact de la COVID-19 sur la santé globale en
Afrique
Cependant et malgré l’impossibilité d’obtenir des données
épidémiologiques exhaustives et fiables en Afrique (confère
chapitre précédent), chaque acteur de santé africain doit se
poser la question suivante concernant cette nouvelle pan-
démie : s’agit-il d’une priorité de santé publique ? Pour
répondre à cette question, voici quelques chiffres mar-
quants les 6 premiers mois de la pandémie (février à août
2020) pour ce continent :
• 1 million de cas (5,3 % des cas mondiaux) et seulement
20 000 décès de COVID-19 (3 % des cas mondiaux) et prin-
cipalement âgés de plus de 50 ans [7].
É.J.L. Hardy, P. Flori
Alors que pendant la même durée de temps (estimation
faite sur les données des années antérieures), il y a eu en
Afrique :
• 100 millions de nouveaux cas de paludisme (93 % des cas
mondiaux) et plus de 200 000 décès liés à cette maladie
(94 % des décès mondiaux, exclusivement pédiatriques)
[25] ;
• 0,6 million de nouveaux cas de SIDA (60 % des nouveaux
cas mondiaux) et 400 000 décès liés à cette maladie (65 %
des décès mondiaux) [26] ;
• 300 millions de nouveaux cas de diarrhées infectieuses et
plus de 100 000 décès d’enfants de moins de 5 ans [24].
La COVID-19 prend tout le terrain médiatique et agrège
l’ensemble des financements internationaux au détriment
des réelles priorités de santé publique africaines (palu-
disme, diarrhées, SIDA. . .). Les programmes de soins
préventifs, curatifs et palliatifs concernant ces maladies
sont également perturbés par la pandémie de COVID-19.
L’OMS estime que le manque actuel d’approvisionnement
en médicaments anti-paludéens et de moustiquaires impré-
gnées d’insecticide sera responsable d’un doublement des
décès lié au paludisme en Afrique sub-saharienne en 2020
[27]. Elle prévoit également un doublement du nombre de
décès lié au SIDA si la pénurie d’antirétroviraux qui frappe
l’Afrique sub-saharienne se prolonge durant 6 mois de plus
[28]. La lutte contre la COVID-19 ne doit pas se faire au
détriment des priorités de santé publique africaines au
risque d’observer à la fin de l’année une augmentation des
pertes humaines qui dépasseront très largement celles asso-
ciées directement à la COVID-19. Notre étude, ainsi que de
nombreuses autres revues africaines et mondiales [29—31],
montrent la singularité de la situation africaine face à la
COVID-19.
Conclusion
Aujourd’hui, l’évolution de l’épidémie de COVID-19 en
Afrique semble globalement maîtrisée et donc moins inquié-
tante qu’en Europe et en Amérique. La jeunesse et la faible
vulnérabilité de la population africaine nous permettent de
rester optimiste et de penser que la catastrophe annoncée
en Afrique n’arrivera pas, du moins pas tant que le virus
n’évolue pas vers une forme plus virulente. En revanche,
il est certain que le manque de moyens (financiers, tech-
nologiques, logistiques. . .) de l’Afrique a un impact sur
l’application des mesures sanitaires, sur le diagnostic, sur
la prise en charge, mais aussi sur la déclaration de ces
cas en Afrique. Les publications épidémiologiques de ter-
rain manquent encore, empêchant une vision précise de la
situation de chaque pays, zones, ou villes africain(e)s.
Face à cette situation, les décideurs et gouvernements
africains doivent proposer une stratégie de santé face à
la COVID-19 qui soit propre à leur continent. Cela inclut
d’étendre à l’ensemble de la population des mesures
d’éducation et prévention, de fabriquer des masques loca-
lement, ainsi que de miser sur des techniques de diagnostic
alternatives à la biologie moléculaire utilisant des tests
simples et de qualité. L’Afrique doit prendre les rênes de
sa lutte anti-COVID-19 et déployer des solutions adaptées à
ses réalités épidémiologiques et à ses moyens.
Spécificités épidémiologiques de la COVID-19 en Afrique
Remerciements
Nous tenons particulièrement à remercier nos nombreux
contacts en Guinée Conakry, au Bénin, au Burkina Faso, au
Cameroun, à Madagascar, au Tchad et au Togo pour leur
avis de terrain sur cette thématique, au Dr Cognat pour
son avis éclairés en tant que personnel et spécialiste OMS,
à l’ensemble du Conseil d’administration de Biologie Sans
Frontières pour leur relecture attentive.
Déclaration de liens d’intérêts
Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d’intérêts.
Supplément en ligne. Matériel
complémentaire
Le matériel complémentaire accompagnant la ver-
sion en ligne de cet article est disponible sur
https://doi.org/10.1016/j.pharma.2020.10.011.
Références
[1] Organisation Mondiale de la Santé. COVID-
19 — Chronologie de l’action de l’OMS; 2020
[Internet], [cited 2020 Jun 16]. Available from:
https://www.who.int/fr/news-room/detail/27-04-2020-who-
timeline—covid-19.
[2] Organisation Mondiale de la Santé. WHO Statement
regarding cluster of pneumonia cases in Wuhan, China;
2020 [Internet], [cited 2020 Jun 16]. Available from:
https://www.who.int/china/news/detail/09-01-2020-who-
statement-regarding-cluster-of-pneumonia-cases-in-wuhan-
china.
[3] Organisation Mondiale de la Santé. Novel Coronavirus — China;
2020 [Internet], [cited 2020 Jun 16]. Available from:
https://www.who.int/csr/don/12-january-2020-novel-
coronavirus-china/en/.
[4] Organisation des Nations Unies. L’épidémie de
coronavirus est désormais une pandémie, estime
l’OMS; 2020 [cited 2020 Jun 16]. Available from:
https://news.un.org/fr/story/2020/03/1063761.
[5] Organisation Mondiale de la Santé. Coronavirus
disease 2019 (COVID-19) Situation Report - 197;
2020 [Internet], [cited 2020 Oct 7]. Available from
https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/
situation-reports/20200804-covid-19-sitrep-197.pdf.
[6] Gilbert M, Pullano G, Pinotti F, Valdano E, Poletto C,
et al. Preparedness and vulnerability of African countries
against importations of COVID-19: a modelling study. Lancet
2020;395(10227):871—7.
[7] Organisation Mondiale de la Santé. Coronavirus disease 2019
(COVID-19) situation reports; 2020 [Internet], [cited 2020 Oct
7]. Available from: https://covid19.who.int/.
[8] United Nations, Department of Economic and Social
Affairs, Population Division, World Population Prospects
2019. Total Population - Both Sexes; 2020 [Internet],
[cited 2020 Jun 16]. Available from: https://population.
un.org/wpp/Download/Standard/Population.
[9] United Nations, Department of Economic and Social Affairs,
Statistics Division, National Accounts. Per Capita GDP in US
225
Dollars; 2020 [Internet], [cited 2020 Jun 16]. Available from:
https://unstats.un.org/unsd/snaama/Downloads.
[10] FIND. SARS-CoV-2 test tracker; 2020 [Inter-
net], [cited 2020 Jun 16]. Available from:
https://www.finddx.org/covid-19/test-tracker/.
[11] Bukhari Q, Jameel Y, Massaro JM, D’Agostino Sr RB, Khan S.
Periodic oscillations in daily reported infections and deaths
for Coronavirus Disease 2019. JAMA Netw Open 2020;3(8),
e2017521.
[12] Sajadi MM, Habibzadeh P, Vintzileos A, Shokouhi S, Miralles-
Wilhelm F, et al. Temperature, humidity, and latitude
analysis to estimate potential spread and seasonality of
Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). JAMA Netw Open
2020;3(6):e2011834.
[13] Lowen AC, Mubareka S, Steel J, Palese P. Influenza virus trans-
mission is dependent on relative humidity and temperature.
PLoS Pathog 2007;3(10):1470—6.
[14] Schaffer FL, Soergel ME, Straube DC. Survival of airborne
influenza virus: effects of propagating host, relative humidity,
and composition of spray fluids. Arch Virol 1976;51(4):263—73.
[15] Bhardwaj R, Agrawal A. Likelihood of survival of coronavirus in
a respiratory droplet deposited on a solid surface. Phys Fluids
(1994) 2020;32(6):061704.
[16] Santé Public France. COVID-19 : point épidémiolo-
gique du 4 juin 2020; 2020 [Internet], [cited 2020 Jun
16]. Available from: https://www.santepubliquefrance.
fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-
respiratoires/infection-a-coronavirus/documents/bulletin-
national/covid-19-point-epidemiologique-du-4-juin-2020.
[17] Williamson E, Walker AJ, Bhaskaran KJ, Bacon S, Bates C, et al.
Factors associated with COVID-19-related death using OpenSA-
FELY. Nature 2020;584(7821):430—6.
[18] Liu Y, Yan LM, Wan L, Xiang TX, Le A, et al. Viral dyna-
mics in mild and severe cases of COVID-19. Lancet Infect Dis
2020;20(6):656—7.
[19] Wölfel R, Corman VM, Guggemos W, Seilmaier M, Zange S, et al.
Virological assessment of hospitalized patients with COVID-
2019. Nature 2020;581(7809):465—9.
[20] Ludvigsson JF. Systematic review of COVID-19 in children shows
milder cases and a better prognosis than adults. Acta Paediatr
2020;109(6):1088—95.
[21] de Souza TH, Nadal JA, Nogueira RJN, Pereira RM, Brandão MB.
Clinical manifestations of children with COVID-19: a systematic
review. Pediatr Pulmonol 2020;55(8):1892—9.
[22] Levy C, Basmaci R, Bensaid P, Bost bru C, Coinde E, et al.
Changes in RT-PCR-positive SARS-CoV-2 rates in adults and chil-
dren according to the epidemic stages. Pediatr Infect Dis J
2020;39(11):e369—72.
[23] Munro APS, Faust SN. Children are not COVID-19 super
spreaders: time to go back to school. Arch Dis Child
2020;105(7):618—9.
[24] Organisation Mondiale de la Santé. Principaux repères
sur les maladies diarrhéiques; 2020 [Internet], [cited
2020 Jul 10]. Available from: https://www.who.
int/fr/news-room/fact-sheets/detail/diarrhoeal-disease/.
[25] Organisation Mondiale de la Santé. Principaux repères sur le
paludisme; 2020 [Internet], [cited 2020 Jul 10]. Available from:
https://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs094/fr/.
[26] Organisation Mondiale de la Santé. VIH/Sida, Principaux
repère; 2020 [Internet], [cited 2020 Jul 10]. Available from:
https://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs360/fr/.
[27] Organisation Mondiale de la Santé. L’OMS exhorte les pays
à agir rapidement pour sauver des vies du paludisme en
Afrique subsaharienne; 2020 [Internet], [cited 2020 Jul 10].
Available from: [Internet], [cited 2020 Jul 21]. Available from:
https://www.who.int/fr/news-room/detail/23-04-2020-who-
urges-countries-to-move-quickly-to-save-lives-from-malaria-
in-sub-saharan-africa.
226
[28] Organisation Mondiale de la Santé. Selon l’OMS, l’accès
aux médicaments contre le VIH est gravement perturbé
par la COVID-19 alors que la riposte au sida ne progresse
plus; 2020 [Internet], [cited 2020 Jul 21]. Available from:
https://www.who.int/fr/news-room/detail/06-07-2020-who-
access-to-hiv-medicines-severely-impacted-by-covid-19-as-
aids-response-stalls.
É.J.L. Hardy, P. Flori
[29] Kobia F, Gitaka J. COVID-19: Are Africa’s diagnostic challenges
blunting response effectiveness? AAS Open Res 2020;3:4.
[30] El-Sadr WM, Justman J. Africa in the Path of Covid-19. N Engl
J Med 2020;383(3):e11.
[31] Martinez-Alvarez M, Jarde A, Usuf E, Brotherton H, Bittaye M,
et al. COVID-19 pandemic in west Africa. Lancet Glob Health
2020;8(5):e631—2.