Master in Chemistry

Sujet de stage de Master 2

Laboratoire : Département de Pharmacochimie Moléculaire (DPM, UMR CNRS 5063)

Directeur : Dr Yung-Sing WONG

Intitulé de l'équipe : COMET Responsable : Dr Yung-Sing WONG

Nom et Qualité du Responsable du Stage : Pr Pierre VERHAEGHE

Adresse : 470 rue de la chimie, bâtiment E, 38041, Grenoble cedex 09
Tél : 04 76 63 53 12 E-mail : pierre.verhaeghe@univ-grenoble-alpes.fr

Titre du sujet : Synthèse de peptoïdes amphiphiles contre C. difficile

Objectifs visés du stage :

Synthèse sur support(s) solide(s) de peptoïdes cationiques amphiphiles présentant des propriétés
antibactériennes contre Clostridioïdes difficile (C. difficile). Ces polypeptoïdes feront l’objet d’une évaluation
biologique à l’Institut Pasteur de Paris (équipe Dr B. Dupuy) et participeront à l’amélioration de l’analyse de
copolypeptoïdes par chromatographie d’exclusion stérique au LCPO de Bordeaux (Dr C. Bonduelle).

Intérêts pédagogiques et compétences visées :

Apprentissage de la synthèse supportée, synthèse et caractérisation de macromolécules, initiation à la
chimie médicinale anti-infectieuse.

Résumé :
Financé par l’ANR en 2023, le projet OBTAC vise au développement de copolypeptoïdes amphiphiles
comme candidats antibiotiques oraux ciblant les infections intestinales à C. difficile, bactérie anaérobie
responsable d’environ 500.000 infections digestives nosocomiales et 30.000 décès chaque année aux USA
selon le CDC [1]. Afin d’étudier plus en détail les relations structure-activité de copolypeptoïdes statistiques
actifs précédemment synthétisés [2-4], des analogues peptoïdiques à séquence contrôlée seront
synthétisés sur support solide [5], caractérisés puis évalués in vitro.

Références bibliographiques :
[1] www.cdc.gov/media/releases/2015/p0225-clostridium-difficile.html
[2] P. Salas et al. J. Am. Chem. Soc. 2021, 143, 3697.
[3] P. Salas et al. Biomacromolecules 2021, 22, 57.
[4] P. Salas et al. Polym. Chem. 2022, 13, 600.
[5] A. M. Clapperton et al. ACS Polym. Au, 2022, 2, 417.

Approches & matériels utilisés :

Synthèse sur support solide, acylation d’amines IIaires, SN2, synthèse assistée par micro-ondes, HPLC,
LC/MS, RMN.

Domaines de compétences souhaitées du candidat :

Le/la candidat(e), curieux(se), rigoureux(se) et méthodique, disposera de solides connaissances en
synthèse organique et chimie analytique. Il/elle présentera une bonne culture de l’interface chimie/biologie
et des compétences rédactionnelles (français et/ou anglais) éprouvées.

Dates du stage : 08/01/2024 au 05/07/2024