UNIVERSITE DE MONTPELLIER Référence GALAXIE : 41

Numéro dans le SI local : 0884

Référence GESUP : -
Corps : Maître de conférences
Article : 33
Chaire : Non
Section 1 : 65-Biologie cellulaire
Section 2 :
Section 3 :
Profil : Biologie cellulaire et du développement
Job profile : Associate Professor of cell and developmental biology at the University of Montpellier-
Faculty of Sciences- Department of Education Bio-MV.
Research fields EURAXESS : Biological sciences Biology
Implantation du poste : 0342490X - UNIVERSITE DE MONTPELLIER
Localisation : Montpellier
Code postal de la localisation : 34000
Etat du poste : Suceptible d'être vacant
Adresse d'envoi du 5, BOULEVARD HENRI IV
dossier :

34967 - MONTPELLIER CEDEX 2

Contact Estelle CANDEIL
administratif : Gestionnaire recrutement
N° de téléphone : 0467149906 0467149928
N° de Fax : -
Email : anne.ly@umontpellier.fr
Date d'ouverture des candidatures
: 12/04/2022
Date de fermeture des
candidatures : 12/05/2022, 16 heures 00, heure de Paris
Date de prise de fonction : 01/09/2022
Mots-clés : imagerie ; biologie cellulaire ;
Profil enseignement :
Composante ou UFR : Faculte des sciences
Référence UFR :
Profil recherche :
Laboratoire 1 : UMR5237 (200711904N) - Centre de Recherche en Biologie cellulaire de Montpellier
Application Galaxie OUI

Poste ouvert également aux personnes 'Bénéficiaires de l'Obligation d'Emploi' mentionnées à l'article 27 de la loi n° 84-
16 du 11 janvier 1984 modifiée portant dispositions statutaires relatives à la fonction publique de l'Etat (situations de
handicap).

Le poste sur lequel vous candidatez est susceptible d'être situé dans une "zone à régime restrictif" au sens de l'article
R.413-5-1 du code pénal. Si tel est le cas, votre nomination et/ou votre affectation ne pourront intervenir qu'après
autorisation d'accès délivrée par le chef d'établissement, conformément aux dispositions de l'article 20-4 du décret n°84-
431 du 6 juin 1984.

Le profil détaillé se trouve en pages suivantes

 CAMPAGNE D’EMPLOIS ENSEIGNANTS-CHERCHEURS
2022

ETABLISSEMENT : Université de Montpellier COMPOSANTE : Faculté des Sciences

SITE : Montpellier

IDENTIFICATION DU POSTE :

N° Galaxie : 41
N° : 0884
Corps : MCF
Section CNU : 65
Article de référence : 33
Poste susceptible d’être vacant

Mots clefs : embryologie, biologie cellulaire, imagerie, approches quantitatives

du vivant

Profil pour publication : Biologie cellulaire et du développement

Job profile: Associate Professor of cell and developmental biology at the

University of Montpellier-Faculty of Sciences- Department of Education Bio-MV.

Research field: Biology

ENSEIGNEMENT :

Profil d’enseignement :

La personne recrutée intégrera le département d’enseignement Biologie :

Mécanismes du Vivant (Dept Bio-MV). Il/Elle interviendra principalement dans
l’enseignement de Biologie Cellulaire et Moléculaire depuis le niveau L1 (Licence
Sciences de la Vie) jusqu’au M2 (Masters du Dept Bio-MV). Plus spécifiquement,
ses enseignements porteront sur les mécanismes cellulaires fondamentaux
(cycle cellulaire, mitose, méïose, apoptose, adhérence, migration) ainsi que sur
la biologie du Développement. Des enseignements de Biologie Moléculaire
seront aussi prodigués. Il/Elle interviendra dans les Travaux Pratiques associés à
ces formations.
A terme, la personne recrutée pourra s’impliquer dans la gestion des
enseignements en prenant la responsabilité pédagogique d’UE de son domaine.
Lieu d’exercice : Faculté des Sciences
Nom du Directeur département : Michel Vignes
Tél. directeur département : 04.67.61.36.69
Email directeur département : michel.vignes@umontpellier.fr
URL département : https://biologie-mv-fds.edu.umontpellier.fr

RECHERCHE :

Profil recherche :

Le profil est fléché sur l’équipe « contrôle transcriptionnel de la morphogenèse

des chordés » au CRBM.

La personne recrutée viendra consolider l’équipe « contrôle transcriptionnel de la

morphogenèse des chordés » animée par Patrick Lemaire au CRBM. L’objectif de
cette équipe est de comprendre comment la morphogenèse très stéréotypée des
ascidies peut être conservée à l’échelle de la cellule depuis plusieurs centaines
de millions d’années, malgré une divergence très profonde de leurs génomes.
La/Ie candidat.e. devra posséder une forte expertise en biologie cellulaire du
développement des organismes marins, en particulier des ascidies, ainsi qu’une
très bonne connaissance des approches en imagerie d’organismes vivants
couplée à l’utilisation de marqueurs fluorescents de structure cellulaire.
Idéalement la/le candidat.e. aura des connaissances en étude comparative
(evo/devo).
Le MCF recruté bénéficiera de l’environnement bien équipé et financé de
l’équipe et d’un réseau important de collaborations interdisciplinaires locales
(LIRMM), nationales (INRIA Morpheme, Sophia ; INRIA Mosaic, Lyon ; Laboratoire
Matière et Systèmes Complexes, Paris ; entreprise Bioself communication) et
internationales (U. Chicago, USA ; Northwestern University, USA ; UC Santa
Barbara, USA ; U. Osaka, Japon).

Département scientifique : Biologie-Santé

Structure de recherche : Centre de Recherche de Biologie cellulaire de
Montpellier (CRBM)
N° de la structure de recherche (UMR, EA, UMS…) : UMR 5237
Intitulé de l’équipe : Contrôle transcriptionnel de la morphogenèse des chordés

Nom du chef d’équipe : Patrick Lemaire

Composition de l’équipe : 1 DR, 1 MCF, 2 doctorants, 4 ITA (+ 1 post-doc ANR à
recruter à l’été 2022).
L’emploi vient-il en soutien à une activité établie ou à l’émergence d’une
nouvelle thématique ?

L’emploi viendra renforcer les compétences en biologie cellulaire de l’équipe,

traditionnellement plus centrée sur les approches d’embryologie moléculaire, de
génomique, d’informatique. Le développement d’outils puissants d’imagerie à
l’échelle cellulaire ouvre la porte à l’étude de la robustesse de la morphogenèse
embryonnaire à des perturbations environnementales ou génétiques et à son
contrôle par des mécanismes de signalisation cellulaire et de génération de force
à l’échelle subcellulaire.

Contexte scientifique local, national et international :

L’équipe a une approche originale au sein de la communauté de biologistes du

développement, qui privilégie l’étude, la formalisation et la modélisation
mathématique des processus et de leur variabilité naturelle, plutôt que
l’identification de gènes individuels impliqués dans ces processus. L’imagerie du
vivant par microscopie multi-vue à feuille de lumière, complétée par la
segmentation le traçage et le nommage automatisés des cellules est notre outil
de travail principal.
Cette approche quantitative du développement embryonnaire nécessite un
équipement en imagerie avancé, et un environnement collaboratif étroit avec
des informaticiens, des physiciens et des mathématiciens que nous avons tissés
au cours des 10 dernières années. Nous avons de ce fait que relativement peu
de compétiteurs au niveau international. Parmi les équipes qui s’engagent dans
ce type de directions, celles de Stas Shvartsman (Siegler institute, Princeton,
USA) et, côté théorie, de notre collaborateur Madhav Mani (Northwestern
University, Evanston, USA) sont les plus proches. Le Chang Zuckerberg BioHub
(San, Francisco, USA) soutient aussi des approches quantitatives en biologie
cellulaire et du développement. Des financements ciblés à l’interface des
sciences formelles et de la biologie se mettent peu à peu en place, comme par
exemple ceux de la Simons Foundation, ou l’appel à proposition ANR-NSF : «
Physics from Molecules to Cells ».

Collaborations locales, nationales et internationales :

Nous coordonnons plusieurs collaborations soutenues par l’ANR, avec des

équipes françaises (ANR Cell whisper : avec C. Godin, INRIA Mosaic, Lyon ; G.
Malandain, INRIA Morpheme, Sophia-Antippolis ; E. Faure, CNRS LIRMM,
Montpellier. ANR-NSF scEmbryoMech : avec A. Asnacios, MSC Sorbonne
Université ; E. Munro, U. Chicago, Chicago, USA ; M. Mani, Northwestern U.,
Evanston, USA). Nous sommes également partenaires de l’Equipex Morphoscope
2 (coordinateur E. Beaurepaire) et de l’ANR-DoE Cionaconnect (coord. WC Smith
UC Santa Barbara, USA ; partenaire T. Horie, U. Osaka, Japon). Avec le soutien de
Muse, nous sommes en train de monter une demande de contrat ERC synergy
avec E. Faure (LIRMM) et M. Mani (Northwestern U.).
Utilisation de plateformes :

Notre travail est rendu possible par la présence de la plateforme Biocampus MRI,
qui héberge un microscope multi-vue à feuille de lumière Luxendo, notre
instrument principal de travail. Nous avons aussi des contacts avec les
plateformes BioCampus en génomique (MGX) et en protéomique (PPM).

Nom directeur de la structure de recherche : Claude Prigent

Tel directeur de la structure de recherche : 06.31.12.27.57
Email directeur de la structure de recherche : claude.prigent@crbm.cnrs.fr
URL de la structure de recherche : https://www.crbm.cnrs.fr/
Fiche AERES de la structure de recherche : https://www.hceres.fr/fr/rechercher-
une-publication/crbm-centre-de-recherche-en-biologie-cellulaire-de-montpellier

Descriptif de la structure de recherche :

Le CRBM a acquis ses lettres de noblesse en particulier à travers la thématique «

cycle cellulaire » qui a fait la renommée internationale du laboratoire grâce à la
découverte des mécanismes moléculaires qui contrôlent la division cellulaire
avec les travaux initiés par Marcel Dorée et son équipe. Cette thématique reste
extrêmement active au CRBM, et de nombreux projets de recherche développés
visent à comprendre les mécanismes moléculaires régissant la mitose, dans des
conditions normales ou pathologiques. Depuis une dizaine d’années, les
thématiques abordées au sein de l’institut se sont élargies, avec un accent sur la
biologie cellulaire ou subcellulaire quantitative grâce un plateau MRI d’imagerie
du vivant très performant, que le CRBM soutient fortement.

Descriptif projet :

La/Le MCF recruté développera un projet de recherche s’inscrivant dans l’étude

de la variabilité naturelle et expérimentale de l’embryogenèse des ascidies. Ce
projet se caractérise par une étude comparative entre plusieurs espèces
d’ascidies et s’articule autour de 2 axes principaux :

1- Essayer de mieux comprendre les mécanismes de tamponnage qui rendent le

développement des ascidies très peu variable malgré une rapide divergence de
leurs génomes. Il s’agira notamment d’identifier et de caractériser, dans un
premier temps sur la base de critère morphologiques, les aspects du
développement les plus sensibles à des perturbations génétiques ou
environnementales, par des approches de microscopie à feuillet de lumière
couplées à des outils de segmentation et d’analyse d’images développés dans
l’équipe.

2- Étudier le lien potentiel entre la reproductibilité de la morphogenèse et

l’adhésion cellules-cellules. Pour cela, les cadhérines impliquées dans
l’embryogenèse des ascidies (phylogénie, profil d’expression) seront
caractérisées. Le rôle des cadhérines, et du complexe mécano-sensible
Cadhérine /β-caténine, dans la spécification des destins cellulaires sera alors
étudié.

Description Activités Complémentaires :

L’équipe d’accueil dispose de l’équipement nécessaire au projet (plateau

d’imagerie, animalerie marine, pièce d’embryologie, soutien infrastructure
informatique) et a développé avec ses collaborateurs les outils informatiques
nécessaires à l’analyse des données du projet (notamment outils de
segmentation, de visualisation inetractive 3D+t et d’analyse statistique).

Moyens humains :

- L’équipe est composée d’un DRCE, d’un MCU (détaché de Sorbonne

Université pour ses activités de recherche), de trois ingénieur.e.s
informaticien.ne.s, de deux doctorant.e.s et une ingénieure
expérimentalistes. Elle accueille en moyenne 2 étudiant.e.s stagiaires (M1
et M2) par an.
- Plusieurs ingénieur.e.s MRI nous aident dans nos travaux d’imagerie

Moyens financiers :

Coordination de 2 contrats de recherche ANR en cours; partenaire d’un contrat

ANR-DoE USA qui vient de commencer ; partenaire de l’Equipex Morphoscope 2,
contrat tremplin ERC Muse.

Autres Informations :

Compétences expérimentales :
- Expertise en biologie cellulaire et moléculaire, en imagerie du vivant et en
embryologie des ascidies

Autres compétences :
- Capacité à conduire des projets de recherche de façon autonome
- Encadrement d’étudiant.e.s, doctorant.e.s et/ou post-doctorant.e.s
- Présentation des résultats à des séminaires nationaux et internationaux
- Rédaction d’articles scientifiques
- Participation à la réflexion stratégique sur les orientations de l’équipe, et à
l’écriture de demandes de financements.
Evolution du poste :

La/Le MCF recruté.e aura l'opportunité d'encadrer des étudiants de Master et des
doctorants. Elle/il sera encouragé.e - à moyen terme - à demander des
financements indépendants.

MODALITES DE TRANSMISSION DES CANDIDATURES :

Dépôt des dossiers dématérialisés sur l’application Galaxie du 12/04/2022 au

12/05/2022 :
https://galaxie.enseignementsup-recherche.gouv.fr/antares/can/index.jsp