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Convention de partenariat
entre Le Parc naturel Haute-Sre Fort dAnlier (bnficiaire de la subvention) Chemin du Moulin, 2 B-6630 Martelange Tl : 063/45.74.77 Fax : 063/67.64.84 et LUniversit catholique de Louvain, Facult des Sciences Institut des Sciences de la Vie Croix du Sud, 4, bte L7.07.14 B-1348 Louvain-la-Neuve Tl: 010/47.84.85 Fax: 010/47.38.72
Responsables du projet
Nicolas Mayon : charg de mission PNHSFA Donatien Liesse : directeur Tl: 063/60.80.85 E-mail : nicolas@parcnaturel.be
1.
OBJECTIFS ........................................................................................................................... 3
1. A.
1.A.1. 1.A.2.
3
3 4
1. B.
2.
RESULTATS ......................................................................................................................... 5
2. A.
MATERIEL ANALYSE
5 7
7 8 9 10
2. C.
2.C.1. 2.C.2.
11
11 12
2. D.
2.D.1. 2.D.2. 2.D.3. 2.D.4. 2.D.5.
14
14 15 15 16 16
1. Objectifs
Le projet vise la restauration dirige de la continuit cologique des cours deau du bassin de la Haute-Sre par la leve dobstacles la libre circulation de la faune aquatique. Toutefois, cette restauration se fera au cas par cas, sur base dune analyse pralable des caractristiques gnotypiques des populations de truites isoles par les ouvrages incrimins. Le but tant didentifier puis de prserver dventuelles souches locales peu ou pas introgresses gntiquement.
Du ct luxembourgeois, des truites provenant de la pisciculture domaniale du GrandDuch de Luxembourg Lintgen sont galement dverses. Au laboratoire, nous disposions de truites provenant de la majorit de ces piscicultures, Clment, Xhaflaire, Jeansene et Lintgen exceptes. Th. Xhaflaire a malheureusement arrt son exploitation piscicole avant que nous ne puissions y chantillonner des poissons. Les poissons de la pisciculture de Lintgen nous sont parvenus trop tard pour les premires analyses dcrites dans ce rapport.
1.A.2. Rfrentiel rivire Deux populations de la Sre, Traquebois et Wisbish avaient dj t tudies en 2003 mais gnotypes uniquement sur les 7 marqueurs microsatellites utiliss ce moment l. Depuis, pour plus de prcision dans dans nos analyses, le nombre de marqueurs a t tendu au nombre de 12 pour nos gnotypages de truites. En 2011, en prparation de ce projet, nous avions reu du service de la pche quelques populations qui ont t caractrises gntiquement avec les 12 marqueurs microsatellites utiliss en routine. Il sagit des populations suivantes, localises sur la carte en figure 1: 1. 2. 3. 4. 5. Chiehet, CHIE, Maisoncelle, MAIS, Grande Molscht, GMOL Lutrebois, LUTB, la Bovire, BOVI.
2. Rsultats
2. A. Matriel analys
La liste des populations de truites tudies pour la prsente tude ainsi que leur historique dchantillonnage et de gnotypage sont repris au tableau 1 ci-dessous. Tableau 1 : Populations de truite tudies, dates dchantillonnage et de gnotypage
Populations Rivires Traquebois Wisbisch Lutrebois Chiehet Maisoncelle Gde Molscht aval Bovire Strange, Hompr Strange, Hollange Strange, aval Piscicultures Freux Achouffe Mirwart Javaux Jeansene Clement Anselme SteCcile Dnomination Date chant. Genot. 7M Genot. 12M Nbre
TRAQ WISB LUTB CHIE MAIS GMOL-02 BOVI STRA-01 STRA-02 STRA-03
04/12/2002 04/12/2002 03/12/2009 05/10/2011 05/10/2011 31/08/2011 2011 7/11/2011 10/11/2011 10/11/2011
2003 2003
(+ 5M) 2011 (+ 5M) 2011 2010 2011 2011 2011 2011 2012 2012 2012
58 52 48 48 48 48 48 48 48 48
P-Strange
2002
2002 2002
(+ 5M) 2011 2009 2009 2009 2012 2012 (+ 5M) 2012 (+ 5M) 2012
61 48 48 48 48 48 49 24
Les truites gnotypes depuis le dbut du projet en janvier 2012 sont indiques en bleu. La localisation des populations de rivire du district hydrographique du Rhin tudies jusquici est illustre sur la carte de la figure 1.
Afin davoir une premire ide du caractre natif des populations de la Sre chantillonnes et analyses pour constituer le rfrentiel Rivire-Sre , la nature Rivire ou Pisciculture de ces poissons a tout dabord t identifie par le calcul de leur coefficient dintrogression. Les rfrentiels utiliss sont, dans ce cas, les rfrentiels Rivire et Pisciculture constitus au laboratoire pour ltude des populations du bassin hydrographique de la Meuse. Le nombre et lanne dchantillonnage des truites qui constituent ces rfrentiels sont indiqus au tableau 2. Tableau 2 : Truites des rfrentiels Pisciculture et Rivire , origine et nombre
Pisciculture Bassin Achouffe Blandiaux Freux Piront Compre Mirwart La Gernelle Javaux Ourthe Ourthe Ourthe Ourthe Ourthe Lesse Semois Semois Total Nbre 48 48 61 46 46 48 45 48 390 Anne 2008 2008 2002 2008 2008 2008 2008 2008 Rivire Bois de la H Louba Botn Misdri NanFurnalle Diglette Donneuse Ri des Serpents Viroin Total Lesse Bassin Ourthe Nbre 48 49 40 46 50 50 46 67 396 Anne 2002 2001 2009 2008 2008 2008 2008 2002
Le coefficient dintrogression (CI) est calcul avec le programme Structure 2.2. pour chaque poisson sur 10 runs indpendants et une valeur moyenne est donne pour chacune des populations (Tableau 3). Les truites assignes plus de 85 % au groupe Pisciculture seront considres comme des truites dlevage. De mme, les truites assignes plus de 83 % au groupe Rivire seront de type natif et les truites de pourcentages intermdiaires seront dfinies comme des truites hybrides.
Tableau 3 : Coefficient dintrogression (CI) des populations de la Sre tudies calcul partir des rfrentiels Meuse
Populations CI R Traquebois Wisbisch Lutrebois Chiehet Maisoncelle Grande Molsht Bovire STRA01 STRA02 STRA03 0,033 0,014 0,043 0,045 0,279 0,330 0,992 0,955 0,313 0,357 56 52 43 43 29 27 0 0 26 28 H 2 0 5 4 11 13 0 4 13 13 Nbre P 0 0 0 1 8 8 48 44 9 7 Tot 58 52 48 48 48 48 48 48 48 48
Il apparat clairement que les populations de Traquebois et de Wisbisch sont de bonnes candidates pour constituer le rfrentiel Rivire-Sre mais moins les populations de Maisoncelle, Lutrebois, la grande Molscht (aval) et STRA03 et encore moins la Bovire, STRA02 et STRA01. Le rfrentiel Pisciculture-Sre doit, quant lui, contenir des poissons des populations suivantes (v. 1.A.1.) : Anselme, Javaux (Rossart), J-M Clment, E. Jeansene (P-Strange), Freux, Achouffe, Mirwart, Sainte-Ccile et Lintgen. Pour ce faire, des poissons de la pisciculture dEmile Jeansene (pisciculture de la Strange), et de Jean-Marie Clment ont t gnotyps sur les 12 marqueurs en dbut de projet. Les poissons de la pisciculture domaniale de Lintgen sont arrivs trop tard et nont pas encore t gnotyps. Le gnotypage des poissons de la pisciculture Anselme et Ste Ccile a t tendu aux 5 marqueurs additionnels. Ce qui nous donne au final un total de 374 poissons disponibles pour ce rfrentiel Pisciculture-Sre . Pour information, il vaut mieux avoir un nombre de poissons quasi identique dans les deux rfrentiels pour ne pas apporter de biais lors des assignations des truites tudier aux groupes Rivire ou Pisciculture . 2.B.2. Constitution du rfrentiel Rivire-Sre
Comme prsent au point prcdent, nous disposons de trop peu de populations au caractre natif indiscutable pour constituer un rfrentiel Rivire-Sre .
Vous aurez remarqu (Tableau 3) que seules les populations de Traquebois et de Wisbisch ne sont pas introgresses. Est-ce un hasard ou un trs bon choix dchantillonnage, mais ce sont les seules populations chantillonnes il y a dix ans. Ce point mriterait dtre vrifi. Au lieu de constituer un rfrentiel Rivire avec des populations natives, il ne nous restait plus pour option que de constituer un rfrentiel avec tous les poissons assigns par le programme Structure au groupe Rivire-Sre . Un fichier a donc t constitu avec lensemble des poissons de la Sre analyss jusqu maintenant, auxquels ont t ajout les 374 poissons de piscicultures sus-mentionnes. Nous avons fait tourner le programme Structure en lui demandant de rpartir les poissons en deux groupes, c--d un groupe Pisciculture et un groupe Rivire . Dix runs indpendants ont t raliss et la moyenne dassignation de chaque poisson sur les 10 runs a t calcule. Seuls les poissons assigns plus de 83 % au groupe Rivire ont t conservs pour constituer le rfrentiel Rivire Sre . 276 poissons sur un total de 494 pour lensemble des truites provenant de la Sre analyses correspondaient ce critre. Aucun poisson de la Bovire et de STRA01 na t slectionn. Vous constaterez que le nombre de truites des populations de la Sre assignes au groupe Rivire est plus lev avec ce fichier de donnes que lors du calcul du coefficient dintrogression ralis avec le rfrentiel Meuse (Tableau 3). Nous en discuterons au point 2.B.3.. Vous remarquerez galement que le nombre de poissons Rivire slectionns est moins lev que le nombre de poissons Pisciculture. Cette diffrence pourrait, priori, favoriser lassignation des truites au groupe Pisciculture . 2.B.3. Coefficient calcul partir des rfrentiels Sre
Ce rfrentiel Sre provisoire a t utilis pour calculer, de la mme manire que prcdemment (2.B.1.), le coefficient dintrogression de chacune des rivires tudies dans ce projet. Le tableau 4 reprend les pourcentages ainsi obtenus. Tableau 4 : Coefficient dintrogression (CI) des 10 populations de la Sre tudies calcul partir des rfrentiels Sre
Populations CI R Traquebois Wisbisch Lutrebois Chiehet Maisoncelle Grande Molsht Bovire STRA01 STRA02 STRA03 0,033 0,014 0,043 0,045 0,279 0,330 0,992 0,955 0,313 0,357 56 52 43 43 29 27 0 0 26 28 H 2 0 5 4 11 13 0 4 13 13 Nbre P 0 0 0 1 8 8 48 44 9 7 Tot 58 52 48 48 48 48 48 48 48 48
Il apparat clairement que les CI obtenus avec le rfrentiel Sre sont nettement infrieurs pour les populations comme Lutrebois, la Grande Molscht (aval) ou STRA02 et 03. Ce qui nous amne supposer que le rfrentiel Meuse ntait probablement pas adquat pour tudier les populations de la Sre. Par contre, les populations fortement introgresses comme la Bovire et STRA01 montrent des valeurs dintrogression identiques celles calcules avec les rfrentiels Meuse . Ensuite, les CI des 10 populations de la Sre ont t recalculs avec le rfrentiel Pisciculture-Meuse tout en gardant le rfrentiel Rivire-Sre . Les rsultats ainsi obtenus (non montrs) sont du mme ordre de grandeur, prouvant linfluence unique des poissons de rivire de rfrence. Cependant, il est bien vident que la constitution du rfrentiel Rivire-Sre nen est qu ses balbutiements et devra tre poursuivie.
2.B.4.
AFC
Une AFC a t ralise avec le programme Genetix 2.2. (Figure 2). Elle donne une image trs visuelle de lidentit des truites uniquement sur base des diffrences allliques entre les poissons et permet de concrtiser tout ce qui a t expliqu ci-avant. LAFC est ralise avec les poissons du rfrentiel Pisciculture-Sre , carrs bleus sur pointe, les truites du rfrentiel Rivire-Meuse (carrs fuchsias) auxquelles ont t additionnes les truites des 10 populations de la Sre (triangles jaunes ou ronds de couleurs pour les truites de la Strange). Figure 2 : Analyse factorielle des correspondances sur les truites de la Sre additionnes des truites de rfrence Rivire-Meuse et Pisciculture-Sre .
2,5 2 1,5 1 0,5 0 -0,5 -1 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5 2 Piscicultures-Sre Rivires-Meuse Sre STRA01 STRA02 STRA03
Bovire
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Les truites de rfrence Pisciculture-Sre et Rivire-Meuse forment deux groupes bien distincts lun de lautre. La majorit des poissons de la Sre, ceux de la Bovire excepts (situs en haut droite), forment galement un groupe distinct des poissons de piscicultures. Ils sont cependant moins loigns sur le graphe et donc gntiquement des poissons de pisciculture que ceux du rfrentiel Rivire-Meuse . Cette constatation explique la diffrence de stringeance dans lassignation des truites de la Sre entre les rfrentiels Rivire-Meuse et Rivire-Sre . Les truites de la Bovire sont diffrentes de toutes les autres truites. Elles se situent cependant sur la gauche du graphe, comme les truites de pisciculture. En ce qui concerne les truites de la Strange, il en sera discut au point 2.D.
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Tableau 5 : Variabilit gntique des populations estime sur base de lhtrozygotie observe
(HO), calcule avec biais (HE) et sans biais (Hnb) et FIS pour chaque population. N = nombre dchantillons, NA = nombre moyen dallles par marqueur.
Populations Mirwart Achouffe Javaux Freux Clement Strange Anseme StCecile Chiehet Maisoncelle GMolsht Bovire Traquebois Wisbish Lutrebois STRA01 STRA02 STRA03 N 48 48 48 61 48 48 49 24 48 48 48 48 58 52 48 48 48 48 Hexp 0,757 0,724 0,746 0,736 0,738 0,697 0,666 0,674 0,594 0,660 0,672 0,533 0,525 0,435 0,588 0,703 0,675 0,673 Hn.b. 0,765 0,732 0,754 0,742 0,746 0,704 0,673 0,689 0,600 0,667 0,679 0,539 0,529 0,439 0,594 0,711 0,682 0,680 Hobs 0,734 0,719 0,684 0,689 0,670 0,689 0,647 0,630 0,611 0,651 0,675 0,528 0,542 0,420 0,580 0,705 0,662 0,606 NA 10,00 8,00 9,00 10,25 8,00 7,50 6,50 5,50 6,08 8,08 6,42 3,33 5,50 3,33 5,67 8,17 8,25 8,92 Fis 0,040** 0,018
NS
NS NS NS
0,031*** 0,110
NS
2.C.2. Distance gntique Les distances gntiques entre les paires de populations de truites ont t estimes sous forme de lindicateur FST de Weir et Cockerham, avec le programme FSTAT (Tableau 6). Tableau 6 : Distance FST entre toutes les paires de populations
FST Mirwart Achouffe Javaux Freux Clement Strange Anselme StCecile Chiehet Maisoncelle GMolsht Bovire Traquebois Wisbish Lutrebois STRA03 STRA02 Achouf Javaux 0,0256 0,0135 0,0367 Freux Clemen Strange Anselm StCecil 0,0122 0,0323 0,0231 0,0291 0,0458 0,0252 0,0207 0,0389 0,0676 0,0431 0,0381 0,0455 0,0466 0,0651 0,0653 0,0508 0,0541 0,0758 0,0380 0,0475 0,0579 0,0407 0,0458 0,0901 0,1092 Chie 0,1122 0,1190 0,1018 0,0990 0,1195 0,1475 0,1711 0,1217 Maison Gmols 0,0666 0,0614 0,0686 0,0619 0,0712 0,1062 0,1180 0,0650 0,0383 0,0599 0,0765 0,0507 0,0561 0,0670 0,0883 0,1326 0,0639 0,0725 0,0665 Bovire 0,1749 0,1907 0,1719 0,1400 0,1609 0,1684 0,1954 0,2212 0,2687 0,2292 0,1951 Traque 0,1665 0,1420 0,1507 0,1649 0,1538 0,2240 0,1884 0,1728 0,1020 0,0743 0,1478 0,3468 Wisb 0,1998 0,1917 0,1762 0,1915 0,1986 0,2563 0,2349 0,2239 0,0790 0,0940 0,1512 0,3792 0,0666 Lutreb STRA03 STRA02 STRA01 0,1236 0,1108 0,1194 0,1116 0,1227 0,1666 0,1531 0,1238 0,0739 0,0492 0,1267 0,3004 0,0971 0,1180 0,0636 0,0788 0,0445 0,0583 0,0725 0,0920 0,1221 0,0892 0,0319 0,0406 0,0373 0,2215 0,1058 0,0968 0,0902 0,0499 0,0666 0,0466 0,0489 0,0628 0,0799 0,1023 0,0763 0,0427 0,0399 0,0481 0,2096 0,1119 0,1195 0,0856 0,0125 0,0330 0,0431 0,0385 0,0262 0,0395 0,0186 0,0735 0,0646 0,1123 0,0685 0,0775 0,1642 0,1785 0,2171 0,1282 0,0695 0,0614
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Toutes les valeurs obtenues sont significativement diffrentes de 0, indiquant que les populations sont bien gntiquement diffrencies. Un dendrogramme a t construit, sur base de la matrice obtenue, avec la mthode du neighbour-joinging (Figure 3). Les populations de la Sre sont indiques en bleu, sauf celles de la Strange, en rouge. Figure 3 : Dendogramme bas sur la matrice FST des populations de truites et construit laide de la mthode du neighbourjoining
Bovire
P-Strange
Anselme
Traquebois Chiehet
Lutrebois
0.1
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Les populations de pisciculture sont regroupe ensemble dans le haut de larbre. La majorit des populations de la Sre (en bleu), assez distinctes gntiquement les unes des autres, sont regroupes dans le bas de larbre. Les poissons de la Bovire montrent une forte distance gntique par rapport toute les populations (Tableau 6). Ils sont cependant plus proches des poissons de pisciculture et plus particulirement de ceux de Freux. Il doit probablement sagir dune population forme partir de rempoisonnements qui aura subit, avec le temps, une forte drive gntique de par son isolement et/ou son faible nombre de gniteurs. Les poissons tout en amont de la Strange STRA01, chantillonns gographiquement proche de la pisciculture dEmile Jeansene sont presque identiques gntiquement aux poissons de cette pisciculture ainsi que cela avait t souponn. Les deux populations situes de part et dautre de lobstacle majeur STRA03 et STRA02 sont assez proches gntiquement.
Obstacle majeur lev fin 2011 Hollange (amont obstacle) Obstacle lever Arrt de Burnon (aval obstacle)
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2.D.2. Coefficient dintrogression (CI) Les coefficients dintrogression des populations de la Strange ont t calculs avec les deux rfrentiels Meuse et Sre et sont montrs titre comparatif au tableau 7. La population tout en amont de la Strange (STRA01) et proche de la pisciculture garde, dans les deux cas, un CI lev et quasi identique. Les CI des deux autres populations diminuent fortement avec le rfrentiel Sre , ce qui nous a amen penser que le rfrentiel Meuse ntait probablement pas adquat. STRA02 montre un CI moins lev que STRA03 bien que cette population prsente plus de truites de type pisciculture et moins de truite de rivire que STRA03. Il ne sagit pas dune erreur. Le CI est calcul comme la moyenne des assignations de chaque poisson au groupe Pisciculture . Tableau 7 : Comparaison des valeurs de coefficient dintrogression des populations tudies avec le rfrentiel Meuse ou Sre
Population CI - "Meuse" R STRA01 STRA02 STRA03 0,951 0,882 0,713 0 1 5 Nbre H 7 9 18 P 41 38 25 0,955 0,313 0,357 CI -"Sre" R 0 26 28 H 7 13 13 Nbre P 41 9 7 Tot 48 48 48
2.D.3. AFC LAFC est ralise avec les poissons du rfrentiel Pisciculture-Sre , carrs bleus, et ceux des populations de la Sre, la Bovire excepte (carrs jaunes ou ronds de couleurs pour la Strange). Figure 2 : Analyse factorielle des correspondances sur les truites de la Sre moins la Bovire + les truites de rfrence Pisciculture-Sre .
1 0,8 0,6 0,4 Piscicultures 0,2 0 -0,2 -0,4 -0,6 -0,8 -1 -1,1 Sure Strange1 Strange2 Strange3
-0,6
-0,1
0,4
0,9
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Les poissons de STRA01 sont clairement superposs aux poissons de type Pisciculture . Pour les populations de la Strange situes de part et dautre du barrage, STRA02 et 03, les truites se retrouvent dans les deux groupes. 2.D.4. Diversit gntique Pour des populations de rivire, la diversit gntique des trois populations de la Strange est leve et du mme ordre de grandeur. STRA03 montre un Fis lev, qui pourrait reflter un dficit en htrozygotes du la consanguinit. Cependant, nous remarquons que le nombre dallles est lgrement plus important pour cette population. Cette observation combine au fait que des truitelles de la pisciculture de J.-M. Clment sont dverses cet endroit au contraire de STRA02 (information de N. Mayon), nous amne penser plutt un effet Walhund (mlange de populations). Tableau 5 : Variabilit gntique des populations estime sur base de lhtrozygotie observe
(HO), calcule avec biais (HE) et sans biais (Hnb) et FIS pour chaque population. N = nombre dchantillons, NA = nombre moyen dallles par marqueur.
Populations STRA01 STRA02 STRA03 N 48 48 48 Hexp 0,703 0,675 0,673 Hn.b. 0,711 0,682 0,680 Hobs 0,705 0,662 0,606 NA 8,17 8,25 8,92 Fis 0,008
NS
0,031*** 0,110
NS
2.D.5. Conclusions La leve de lobstacle majeur situ en aval de la Strange permettra la libre circulation des poissons jusquaux obstacles suivants et ne conduira pas la perte dune population relique. Linfluence des poissons de pisciculture est trs importante sur le secteur STRA01, proximit directe de la pisciculture. A linverse, on observe une introgression plus rduite sur laval (STRA02 et STRA03). Il faut souligner que le secteur amont (+/ 10 premiers kilomtres de rivire) a subit une importante pollution aux hydrocarbures en 1998, liminant la quasi-totalit de la population en place. Des chappes continues depuis la pisciculture pourraient avoir contribu grandement la repopulation de ce secteur au dtriment de poissons typs rivire , vu limpossibilit - lpoque - de montaison des sujets sauvages du fait des obstacles prsents en aval.
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