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SYMPOSIUM
a
Département de génétique, hôpital Charles-Nicolle, CHU de Rouen, 1, rue de Germont,
76031 Rouen cedex, France
b
Inserm U1079, institut de recherche et d’innovation biomédicale, université de Rouen,
Rouen, France
0242-6498/$ — see front matter © 2012 Publié par Elsevier Masson SAS.
http://dx.doi.org/10.1016/j.annpat.2012.09.194
La révolution du séquençage de nouvelle génération S21
dans les laboratoires de génétique médicale, ce qui néces- de choix pour la détection de la maladie résiduelle dans
site une réorganisation des laboratoires vu le nombre de les hémopathies et la détection d’ADN tumoral circulant
prélèvements analysables et la masse de données générées, dans le sang, avec pour intérêt la détection de marqueurs
une formation au NGS des généticiens moléculaires et des de résistance ou de sensibilité aux thérapies ciblées chez
techniciens, l’intégration d’une expertise bio-informatique le patient métastatique, la détection précoce de muta-
et la mise sur le marché par les sociétés de réactifs dont la tions secondaires à l’origine d’une résistance aux thérapies
qualité est compatible avec une activité diagnostique. ciblées chez les patients traités et le suivi biologique de
Dans le domaine de la génétique somatique, le NGS déve- l’évolutivité de la maladie cancéreuse. Il est probable que
loppé au titre de la recherche permet l’analyse globale le NGS appliquée aux tumeurs bouleversera rapidement
du génome tumoral. Les analyses comparatives d’exomes l’utilisation des thérapeutiques ciblées actuellement décli-
tumoraux et d’exomes constitutionnels réalisées sur des nées et évaluées par localisation tumorale. En effet, chez
grandes séries de tumeurs, telles les mélanomes, les un patient présentant un cancer, l’analyse de l’exome de sa
tumeurs cérébrales, les adénocarcinomes pancréatiques ou tumeur permettra l’identification de mutations prédictives
les lymphomes ont permis l’identification de mutations d’une sensibilité aux thérapies ciblées et il est probable que
récurrentes, d’intérêt nosologique, pronostique ou dans le la détection de telles mutations conduira, dans le futur,
cadre des thérapeutiques ciblées et a révélé l’hétérogénéité à l’utilisation de la thérapie correspondante indépendam-
génétique des tumeurs. Le NGS se déploie progressivement ment de la localisation tumorale. Ainsi, l’intégration du NGS
dans les laboratoires de génétique somatique des tumeurs. dans les laboratoires de génétique somatique des tumeurs et
Compte tenu du nombre limité de gènes dont l’analyse médi- d’anatomopathologie devrait permettre le passage de la chi-
cale a actuellement un intérêt médical démontré dans les miothérapie globalisée à la chimiothérapie personnalisée.
tumeurs solides (KRAS, BRAF EGFR, PI3KCA, HER2, ALK, KIT,
PDGFRA, HER2. . .), l’apport du NGS dans de tels laboratoires
est de réaliser une analyse globale de tous ces gènes sur un Déclaration d’intérêts
grand nombre de patients et de réduire les délais.
La sensibilité considérable du NGS, permise par la pro- L’auteur n’a pas transmis de déclaration de conflits
fondeur de lecture, en fera probablement une méthode d’intérêts.