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BACTERIOLOGI E
Rdsum~ 1. Introduction
Uexamen cyto-bact6riologique des urines est I'une des analyses I infection du tractus urinaire est s~rement I'infection bact6rienne
microbiologiques les plus demand6es. De nombreux param~tres L la plus fr6quente en milieux communautaire et hospitalier. Cela
pre-analytiques (prel~vement, transport) et analytiques (examen explique que I'examen cyto-bact6riologique des urines (ECBU) soit
microscopique, tests rapides de d6pistage, culture quantitative) I'examen bact6riologique le plus demande. Son apparente simplicit~
d'ex6cution ne dolt pas faire oublier que de nombreux parametres
interviennent pour le diagnostic bacteriologique de I'infection
propres & cet examen influent sur I'interpr6tation des resultats. II
urinaire.
convient donc de respecter en toutes circonstances une m6thodologie
Urine - infection urinaire - e x a m e n bact6riologique - rigoureuse de pr~l~vement et de fournir au microbiologiste les ren-
e x a m e n microscopique. seignements cliniques n~cessaires ~_la bonne interpretation des don-
n~es analytiques. Les param~tres critiques intervenant dans I'inter-
pr~tation de I'ECBU sent d~tailles dans cet article.
S u m m a r y : Difficulties o f i n t e r p r e t a t i o n
in c y t o - b a c t e r i o l o g i c a l examination of the urines
Pour la recherche de certaines bacteries fragiles ou d'identification dif- il est utile de reconnaitre et de quantifier les hematies et les cylindres.
ficile (Chlamydia, premier jet pour la recherche de gonocoque et myco- La presence de cylindres granuleux, hematiques, leucocytaires ou
plasmes, par exemple), le prelevement dolt etre inocule dans un milieu cireux doit etre signalee et confrontee avec la clinique.
de transport adapt& Pour la recherche de mycobacteries, la premiere En complement de resultat, les cristaux urinairespeuvent etre identi-
miction du matin est collectee en totalite trois jours de suite. ties et semi-quantifies. Ceux-ci sent physiologiquement presents darts
En cas de traitement antibiotique, la numeration bacterienne peut etre I'urine. Seuls, les cristaux de cystine et une quantite abondante de cris-
diminuee ou les cultures etre infructueuses. taux d'acide urique sent anormaux.
2.2. T r a n s p o r t
Le transport vers le laboratoire dolt se faire en moins de deux heures, 4. Tests rapides de depistage
sauf si le recueil a ete effectue dans un pot contenant un stabilisateur d'une infection urinaire
de croissance bacterienne. Un delai de transport court (moins de
2 heures) permet de reduire la multiplication des contaminants et de Les tests rapides permettent de realiser un criblage instantane pour
garder intactes les cellules presentes dans rurine avant qu'elles ne se la recherche simultanee ,, au lit du malade ,, de stigmates biologiques
deferment ou ne se lysent. Ainsi, il peut y avoir jusqu'& 50 % d'elements habituellement associes & une bacteriurie (recherche d'une nitrate-
cellulaires lyses apres la 2 e heure. reductase presente essentiellement chez les enterobacteries) et d'une
En I'absence de conservateur et Iorsque la duree du transport est supe- leucocyturie (recherche d'une leucocyte-esterase). Ces tests neces-
rieure & deux heures, les urines doivent etre conservees & + 4 °C pour sitent des urines frafchement emises ou des urines ayant sejourne plus
une duree maximale de 24 heures. Dans ce cas, le denombrement des de 3 h dans la vessie. Le temps de lecture des bandelettes reactives
bacteries est realisable mais les leucocytes peuvent etre alteres. est de 2 minutes pour la recherche des leucocytes et de 30 secendes
pour la detection de I'activite nitrate reductase des enterobacteries.
- Salmonella (rare) ;
que responsables de reelles infections ;
- Acinetobacter baumannfi ;
- Mycobact6ries (rare).
- S t e n o t r o p h o m o n a s maltophilia ;
- B u r k h o l d e r i a cepacia ;
5.1.2. Bactdries du groupe I I - Oligella urethrafis ;
Ces bacteries sont moins frequemment responsables d'infection - A e r o c o c c u s urinae.
urinaire. Ces infections sont le plus souvent d'origine nosocomiale
Iorsqu'il existe des facteurs anatomiques ou iatrogbnes favorisants : 5.1.4. Bact~ries du groupe IV
- les autres enterobacteries (Klebsiella spp., P r o t e u s spp., Entero-
bacter spp., Morganella spp.) ; Ce sont des bacteries de la flore ur~trale ou genitale de proximit~ pour
- E n t e r o c o c c u s spp. ; lesquelles ridentification et I'antibiogramme ne doivent pas ~tre r~a-
- P s e u d o m o n a s aeruginosa ; tises en routine :
- S t a p h y l o c o c c u s aureus ; - streptocoques alpha hemolytiques ;
- C o r y n e b a c t e r i u m urealyticum ; - Gardnerella vaginalis ;
- H a e m o p h i l u s spp. (rare) ; - Lactobacillus spp. ;
- S t r e p t o c o c c u s p n e u m o n i a e (rare). - bacilles coryneformes (a I'exception de C. urealyficum).
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- les conditions de prelevement et de transport, - le seuil de 105 CFU/mL n'est pas fiable & 100 %. Ainsi, on estirne qu'il
- le caractere rnono ou plurimicrobien des cultures, est fiable & 88 O/o,soit environ 1 chance sur 9 d'etre faussement positif ;
- les r6sultats d'EOBU precedents. - pour les pr616vernents d'urine par ponction sus-pubienne, Stamrn
recornrnande d'abaisser le seuil de pathogenicit6 & 102 CFU/rnL.
Les tableaux I, II, et III prennent en compte I'ensemble des para- Toutefois, plus bas est ce seuil, plus grand est le risque de confusion
metres significatifs et pertinents n6cessaires & une interpretation entre contamination et infection ;
de qualit& Ces tableaux ne peuvent etre utilis6s que si t o u s l e s - la ponction sus-pubienne perrnettrait un meilleur isolernent des bac-
parametres de la phase pre-analytique ont 6t6 pr6alablement t6ries de croissance difficile relies que U. urealyticum, M. hominis,
respect6s. Gardnerella vaginalis, Haemophilus spp., les streptocoques ,, d6fi-
cients ,,, et les bacteries ana6robies strictes ;
5.3. Difficultes d ' i n t e r p r e t a t i o n d e s r 6 s u l t a t s - la numeration des bacteries n'a aucun sens chez les sujets qui sont
porteurs d'une sonde urinaire & demeure ;
Les principaux cas de discordances clinico-bact6riologiques s'ob- - selon certains auteurs, 26 & 69 % des patients ayant des syrnpt6mes
servent dans les circonstances suivantes : urinaires ne pr6sentent aucune bact6riurie et demeurent donc sans
- mictions r6p6t6es emp6chant la multiplication bacterienne dans la 6tiologie precise ;
vessie - les personnes &g6es et les jeunes enfants pr6sentent frequemment
- colonisation sans infection ; une bacteriurie asymptornatique. II est n6cessaire de rep6ter le pr6-
- traitement antibiotique ; levement & quelques jours d'intervalle.
- pH urinaire alcalin lysant les leucocytes (idem avec Proteus spp.) ;
- obstruction ur6t6rale complete ;
infection Iocalisee ailleurs que dans la vessie ;
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