CHAPITRE 6 

: ECOLOGIE
MICROBIENNE

HENGY Ophelie
[NOM DE LA SOCIÉTÉ]  [Adresse de la société]
 Sommaire
I) Présentation générale d’un écosystème microbien
II) Les interactions microbiennes
• 1. Les différents types d’interactions
• 2. Les relations entre les micro-organismes
III) Conclusion

I) Présentation générale d’un écosystème microbien

 L’écosystème microbien est un ensemble de vie équilibré, autonome stable et complexe.

Définition :

Un écosystème est un ensemble vivant composé de 3 éléments :

• L’environnement physico-chimique = le biotope

 • Les êtres vivant (les micro-organismes) = la biocénose
• Les interactions entre les micro-organismes et leur environnement  réseaux de
dépendances, d’échanges et d’énergies

Schéma bilan : écosystème microbien

Action des micro-

organismes sur le milieu

Ensemble des micro- Schéma bilan: écosystème microbien L’environnement

organismes présents physique et chimique

= Biocénose
= Biotope

Interactions microbiennes Action des facteurs du milieu

sur les micro-organismes

Les facteurs abiotiques qui influencent les MO de l’écosystème :

• Température
• pH
• Aw
• Oxygène
• Nutriments

II) Les interactions microbiennes

Les différents types d’interactions au sein de l’écosystème

1 2

3
 Interactions interspécifiques (entre différentes espèces microbiennes)

Interactions intraspécifiques (même espèce microbienne)

1. La symbiose ou mutualisme

Interaction dans laquelle chacun des êtres vivants tirent un bénéfice,

La relation est essentielle à la survie,
Les espèces ont un meilleur développement lorsqu’elles sont réunies.

Exemple 1 : Bactéries Rhizobium et légumineuses

Racines de plantes : excroissances appelées nodosités

 La bactérie fixe l’azote de l’air et donne l’azote à la plante, la plante

fournit des molécules carbonées et sert d’abris. Conclusion, c’est une
relation gagnant/gagnant.

Exemple 2 : Satellitisme (croissance améliorée)

Haemophilus influenzae qui pousse en co-culture avec Staphylococcus aureus

Symbiose mycorhizienne : Association entre le champignon du sol et la plante.

Échange entre le champignon et la plante : sucre, eau, azote et
phosphore

2. Le parasitisme

Une espèce tire profit aux dépends d’un hôte. Le parasite a un effet néfaste, il peut aller
jusqu’à éliminer son hôte.

Exemple : le bactériophage
  Bactéries lactiques : sensibilité importante aux bactériophages

3. La prédation

Une espèce se nourrit d’une autre. Relation proie / prédateur.

Exemple : consommation d’un champignon filamenteux par des Amibes.

A gauche : la
paroi de l’hyphe est
percée par l’Amibe A droite : le cytoplasme est
aspiré par l’Amibe

Prédateur: Amibe
Proie: Champignon filamenteux (hyche)

4. Le commensalisme

Une espèce tire bénéfice de la présence d’une autre sans lui porter préjudice, effet neutre.
C’est un mode de vie d’un micro-organisme vivant avec un hôte.
 5. La compétition

Les deux espèces se gênent entre elles, et ont un développement moins rapide lorsqu’elles
sont ensemble.
Les espèces utilisent les mêmes ressources, en général éléments nutritifs.

Exemple : compétition pour une source nutritive (C,N…), comme E.coli et S.aureus dans la
viande

6. La coopération ou synergisme

Les deux micro-organismes associés retirent des bénéfices. La synergie est un type de
phénomène par laquelle plusieurs facteurs agissent ensemble pour créer un effet global.

Exemple 1 : les bactéries du yaourt

Lactobacillus bulgaricus et Streptococcus

thermophiles en culture dans le yaourt
  Coopération des bactéries du yaourt
 Une association bénéfique des 2 souches de bactéries lactiques :
 Un accroissement de la vitesse d’acidification
 Une diminution du pH final du produit
 Une stimulation de production de composés aromatiques (acétaldéhyde)
 Une meilleure stabilité dans le temps du produit finale

Exemple 2 : le quorum sensing, les biofilms

Quorum sensing = mécanisme de communication entre les bactéries, basé sur des signaux
chimiques.

Biofilm de Pseudomonas :

Population planctonique, signaux

chimiques (HSL) en faible concentration
lorsqu’ils sont dans l’eau  pas de
changement de l’expression génique

Dans biofilm, la matrice extracellulaire

maintient les cellules rapprochées 
 population danse, ainsi signaux chimiques sécrétées sont suffisants et en concentration
élevée.
Donc modification de l’activité génétique.

7. Amensalisme

Interaction ou un microorganisme inflige des dommages à un autre sans avantages reçus par
lui-même.

Exemple 1 : Inhibition des bactéries à cause de la production d’éthanol par les levures dans
les boissons fermentées.

Exemple 2 : Un Pénicillium qui sécrète un antibiotique dirigé contre une espèce bactérienne
alentour (comme Staph).

Zone inhibition de croissance de staphylocoque

8. Le neutralisme

Les espèces n’ont aucun effet l’un sur l’autre : pas de réelle infraction.

 Bilan des relations entre micro-organismes

Type d’interactions Espèce A Espèce B

Symbiose (ou mutualisme) + +

Parasitisme + -
(A parasite et B hôte)
prédation + -
(A prédateur et B proie)
Commensalisme + 0
(A commensale de B)
Amensalisme - 0
(B amensale de A)
Compétition - -

Neutralisme 0 0

Coopération (ou synergisme) + +

+ : Bénéfice
- : Néfaste/ préjudice
0 : neutre