Fiche technique : Utilisation du logiciel « Rastop »

AFFICHER UNE MOLECULE

Dans le menu principal Fichier > Ouvrir… permet d’afficher une molécule dans une nouvelle fenêtre

Le bouton Cascade de la barre d’outil permet d’afficher plusieurs fenêtres sur le même écran une fois les fichiers ouverts.

MODIFIER LA REPRESENTATION DE LA MOLECULE ou de la séléction

Boutons de la barre d’outil: Choisir de préférence la
représentation "Boules et
Sphères Cacher tout bâtonnets" ou « Sphères »
Étoiles Bâtonnets
Fil de fer Boules et bâtonnets

MODIFIER LE MODE D'OBSERVATION DE LA MOLECULE

Rotation de la molécule : Clic gauche maintenu et glissé (de haut en bas ou de droite à gauche)
Déplacement de la molécule : Clic droit maintenu et glissé (de haut en bas ou de droite à gauche)
Zoom avant (grossir) : Maj + Clic gauche maintenu et glissé vers le haut
Zoom arrière (réduire) : Maj + Clic gauche maintenu et glissé vers le bas

S’INFORMER SUR LES MOLECULES ET LES CHAINES A L’ECRAN.

Déplacer le curseur sur la molécule, des informations apparaissent en bas de l’écran sur la fenêtre de dialogue.

Nom donné à l’ensemble

de la molécule DG= le nom d’un des éléments
constitutifs de la chaine qui à la
Nom d’une des chaines de la position 1803 dans la molécule
molécule pointé par le curseur

SELECTIONNER UNE PARTIE DE LA MOLECULE

Sélectionner grâce à l’éditeur de commande Sélectionner grâce aux icones de la barre d’outils
Choisir l’outil « expression » de la barre d’outils . Sélectionner pour :
Taper pour :
 Pour une chaine : * puis la lettre donnée par la fenêtre de  Pour une chaine =
dialogue Chain (dans cet ex *C)
 Pour un type d’éléments : la lettre donnée par la fenêtre de
dialogue Res (ici tous les DG de la molécule= DG)  Pour un élément =
 Pour un élément : le numéro de l’élément (ici= 1803)
Un type d’élément n’est pas sélectionnable par cette voie.

Le nombre d’atomes sélectionnés s’affiche sur la fenêtre de dialogue et montrent qu’un élément à été sélectionné

MODIFIER LA MOLECULE

Modifier l’élément sélectionné : En cliquant sur - ,

on revient aux couleurs CPK
 Modifier sa couleur : puis
En cliquant sur + ,
on obtient davantage de couleurs
Et/ou son apparence
Faire disparaitre les autres éléments :
 Une fois l’élément voulu sélectionné et modifié comme expliqué précédemment

 Sélectionner « inverser la sélection »

 Puis sélectionner « cacher tout »

 COLORER LE FOND D’ECRAN

1. Afficher la palette de couleurs

2. Sélectionner « Fond » à la fin du menu déroulant de la palette
3. Cliquer sur la couleur voulue

INSERER UNE IMAGE MOLECULAIRE DE « RASTOP » DANS UN FICHIER « WORD »

1. Si plusieurs fenêtres sont ouvertes (affichage en cascade), cliquer sur la fenêtre correspondant à la
molécule choisie La molécule doit être
2. Dans le menu principal : Cliquer sur Editer / Copier / Image affichée dans la position
3. Placer le curseur dans la zone voulue du fichier « Word », faire un clic gauche, puis cliquer sur souhaitée et colorée de la
« Coller ». façon voulue avant d’être
copiée : elle ne sera pas
Une fois l’image insérée, il est possible de modifier sa taille en cliquant dessus, puis en réalisant des modifiable par la suite.
clics droits maintenus pour déplacer les marqueurs carrés délimitant les côtés de l’image