Direction Générale de la Rénovation Universitaire

Commission ad hocde Biologie et de Sciences de la Terre

Plans d’étude et syllabus

Parcours de la mention
Sciences de la Vie et de la Terre

Affectation du parcours
Domaine des Sciences & Technologies

Mention Sciences de la Vie et de la Terre

(SVT)
‫علوم الحياة واألرض‬

Parcours
Biologie-Géologie
(BG)
‫بيولوجيا وجيولوجيا‬

Année universitaire 2019-2020

1
 Fiche de présentation de la Licence BG
Identification de la Licence
Domaine Sciences et Technologies
Mention Sciences de la Vie et de la Terre (SVT)‫علوم الحياة واألرض‬
Absence de tronc commun
Parcours proposés
Biologie-Géologie (BG) ‫بيولوجيا وجيولوجيا‬

Métiers visés

La licence Sciences de la Vie et de la Terre SVT, parcours BG(niveau bac +3) offre un large panel de
possibilités dans les métiers de l’enseignement, de l’éducation et de la formation, de l'Environnement et
de l'aménagement, de l'Écologie. Elle prépare aussi à des poursuites d’études en Mastères puis en
Doctorat.
Cette licence forme aux métiers suivants : K2106, K2107, A1302, A1303, A1413, J1302:
 Professeur d'enseignement de SVT. Le recrutement à cette fonction publique s'effectue par voie de
concours (CAPES). La profession s'exerce au sein d'établissements d'enseignement de base (collège) ou
secondaire (lycée) et nécessite le contact avec différents intervenants (élèves, parents, enseignants,
personnel médical, administratif, social...). Elle varie selon l'établissement, l'âge des élèves et le niveau
d'enseignement.
 Technicien/Technicienne supérieur(e) dans tout secteur d’emploi à l’interface de la biologie-Géologie
comme:
 Technicien/Technicienne supérieur(e) biologiste : réalisation des analyses biologiques et des contrôles
de produits dans des laboratoires publics et privés.
 Technicien/Technicienne de laboratoire : travaillant dans les laboratoires universitaires ou scolaires de
biologie ou de géologie ou de SVT, dans les entreprises pharmaceutiques ou cosmétiques, dans les
laboratoires de biologie médicale et dans les entreprises agroalimentaires.
 Cadre technique d’études scientifiques
 Chargé de mission
 Animateur scientifique
 Technicien et Animateur muséologique de SVT (histoire naturelle)
Métiers envisageables si évolution
1. Une formation complémentaire,exemple en mastère de sciences de l’éducation,peut être requise
pour l'éducation spécialisée. Ainsi, cette formation professionnelle est obligatoire pour les postes de :
 K1403 - Manageur de structure socioéducative
 K1601 - Gestionnaire de l'information, de la communication et de la documentation
 K2101 - Conseiller en formation pédagogique
 K2102 - Coordinateur pédagogique
 K2111 - Formateur professionnel au métier d’enseignant
 K2103 - Directeur d'établissement d'enseignement primaire, préparatoire ou secondaire
 K2112 - Orienteur scolaire et professionnel
 K2402 - Chercheur en sciences de l'univers, de la matière et du vivant
2. La poursuite des études dans le domaine de la recherche scientifique peut aussi être envisagée après
la licence et peut conduire à former:
 Des enseignants chercheurs universitaires dans les différentes spécialités de la Biologie ou de la
Géologie
 Des chercheurs dans des centres de recherches en Biologie ou géologie

2
Compétences développées

Cette Licence assure une formation pluridisciplinaire en Sciences de la Vie et de la Terreet vise à former
des licenciés capables d'intégrer les établissements d'enseignement de base ou secondaire, publics ou
privés, nationaux ou internationaux et donc capables de socialiser, d'éduquer et d'instruire les
générations futures.
A la fin de la formation, les participants doivent être capables
Compétences cognitives (Savoir)
 Comprendre, analyser, réfléchir et discuter autour des connaissances fondamentales et appliquées
(comme les questions environnementales et biotechnologiques) en Sciences biologiques et
géologiques.
 Développer des situations problèmes autour de ces sciences.
 Maitriser les notions de base des théories d’apprentissage, de l’épistémologie et de la didactique des
SVT (problématisation, démarche d’investigation, approche par compétence).
 Maitriser les langues d’enseignement (Arabe et Français)
 Réussir le CAPES pour accéder à l’enseignement de base et secondaire comme Professeur de SVT.
 Accéder aux concours nationaux d’Ingénieurs (sur dossiers) et aux différents Mastères des sciences
biologiques et sciences de la terre.
Compétences procédurales (Savoir-faire)
 Enseigner les matières et disciplines de biologie et géologie dispensées au collège et au lycée (en arabe
et en Français) selon les programmes d'enseignement nationaux.
 Tenir une classe et assurer l’approche active par compétence avec les élèves
 Développer des problématiques qui touchent aux domaines de vie pour motiver et impliquer les élèves
 Impliquer les élèves dans la méthode de problématisation et/ou dans la démarche d’investigation qui
apprennent à réfléchir et à construire et résoudre le savoir problématisé
 Eduquer les élèves à l’environnement et au développement durable
Compétences comportementales (Savoir-être)
 Négocier avec les élèves et les impliquer à assumer leurs responsabilités et à prendre et défendre leurs
positions
 Initier à la gouvernance et à la démocratie en classe
 Développer le sens de la citoyenneté et de l’appartenance chez eux

Principales matières de la première année

Ce parcours très spécialisé dans le métier d’enseignement, d’orientation scolaire, de conseiller

pédagogique ou d’inspecteur d’enseignement, a son propre tronc commun composé, en plus des
modules de mathématiques, de physique et de chimie en relation avec les domaines de la biologie-
géologie, de modules de Biologie et de Géologie avec des proportions (2/3 1/3) respectant les contenus
de l’enseignement scolaire :
 Biologie cellulaire & Génétique
 Biologie Animale & Biologie Végétale
 Biochimie et Microbiologie
 Géologie du Globe et Matériaux de la lithosphère
 Géodynamique

Durée du tronc commun

X Pas de tronc commun

3
Conditions d'accès à la formation

Nature du Bac Oui Non Nature du Bac Oui Non

Bac Mathématiques X Bac Economie et Gestion X
Bac Sciences expérimentales X Bac Lettres X
Bac Informatique X Bac Sport X
Bac Technique X Autres (à préciser) :

Test d’admission : Oui X Non

Inter-liaisons entre les semestres

La licence 1 (semestres S1 et S2) : Acquisition des bases indispensables en biologie et géologie

générale, chimie, mathématiques et physique à travers un ensemble d’enseignements obligatoires
regroupés en 8 UEs (biologie cellulaire, génétique, biologie animale et végétale, microbiologie,
biochimie structurale, géologie dynamique, chimie générale et organique, sciences physiques,
mathématiques pour les sciences de la vie et de la terre, 2CN et anglais)
La licence 2, en semestre 3 et 4: Approfondissement progressif des connaissances pour donner
aux étudiants une formation scientifique dans les différents domaines de la biologie : biologie
animale, botanique, physiologie animale et végétale, biochimie métabolique, biologie moléculaire et
Géologie : pétrologie, géologie structurale et stratigraphie ainsi que compétences nécessaires aux
méthodologies expérimentale pour sensibiliser les étudiants à leur projet professionnel.
En licence 3 (semestres 5 et 6),la licence SVT met l’accent sur la géologie de la Tunisie et
géoressources, ainsi sur les domaines de biologie enseignés en collège et lycée (physiologie animale
et cellulaire, immunologie, génétique et biotechnologie) en intégrant une formation aux études de
terrain, une formation à la pédagogie-didactique et épistémologie de la discipline (SVT) et un stage
pédagogique pratique d'observation et de réalisation de leçons dans les établissements de
l’enseignement secondaire (collèges et lycées).
Les compétences transversales dispensées à chaque semestre concernent : les compétences
linguistiques, (Français, Anglais, arabe scientifique) les compétences digitales pour l’utilisation de
l’outil informatique (éventuellement 2CN), la bioinformatique, d’analyses de données statistiques les
statistiques.

4
Maquettes et Syllabus de la
ère
1 année

5
 Maquette du 1erSemestre de la 1ère année de Licence (S1-L1) du parcours
Biologie-Géologie (BG)‫بيولوجيا وجيولوجيا‬
Volume des heures de Nombre de Modalité
Unité d'enseignement (UE) / code Coefficient
code UE Elément constitutif d'UE (ECUE) formation présentielle Crédits d’évaluation
Compétences ECUE
Cours TD TP ECUE UE ECUE UE CC RM
Chimie UEF111 Chimie générale 1h30 1h00 0h30 3 1,5 X
UEF 110 6 6
Comp : Outils nécessaires à BG UEF112 Chimie organique 1h30 1h00 0h30 3 1,5 X
Biologie cellulaire et Génétique UEF121 Biologie Cellulaire 1h30 0h30 1h00 3 1,5
UEF120 Comp. Structure, fonction et variabilité Stabilité et Variabilité 6 3
UEF122 1h30 1h00 0h30 3 1,5
de l’Unité de base du vivant. de l’Information Génétique
Biologie de la reproduction et
Biologie Animale/ Végétale UEF131 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
du développement animal
UEF130 6 3
Morphologie et anatomie des
Comp : Bases de l'évolution UEF132 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
Angiospermes
Géologie du Globe et Matériaux de la
Structure et dynamique du
lithosphère UEF141 1h30 1h00 2 1 X
Globe
UEF140 6 3
Comp : La terre, sa dynamique et ses UEF142 Matériaux de la lithosphère 1h30 1h00 2 1 X
matériaux
UEF143 Pédologie 1h30 1h00 2 1 X

Unité transversale UET111 Anglais (1) 1h30 3 1,5 X

UET110 Culture et Compétences 6 3
UET112 1 1h30 3 1,5 X
Numériques-2CN (D1 )
total 28h30 30 30 15 15
Les couleurs des cases du tableau sont comme suit :
Les ECUEs transversauxen bleu ciel, ceux de base en blanc, ceux de Biologie en jaune, ceux de Géologie en violet

1
Domaine de Compétence D1 Information et données: Mener une recherche ; Gérer, stocker et organiser des données ; Analyser, traiter et synthétiser des données
6
 Syllabus des Eléments constitutifs (ECUEs) des Unités
d’enseignement fondamental (UEF) et de l’Unité d’Activités
Pratiques (UAP) de S1-L1

UEF 110 : Chimie

ECUEF 111 : Chimie générale

Objectifs
Maîtriser et connaître différents dosages avec des applications concrètes sur les dosages
volumétriques
Programme du cours
Chapitre 1. Atomistique et liaison chimique
1.1. Structure des atomes
1.2. Classification périodique des éléments
1.3. Liaison chimique
1.4. Théorie L.C.A.O.
1.5. Hybridation sp3, sp2, sp de l’atome de carbone

Chapitre 2. Thermodynamique chimique

2.1. Système
2.2. Variable et fonction d’état
2.3. Transfert
2.4. Réactions réversibles ou irréversibles
2.5. Le premier principe : Transfert de travail et transfert de chaleur
2.6. Condition d’équilibre
2.7. Le deuxième principe : énoncé, expression et fonction thermodynamique
2.8. Loi d’action de masse, constante d’équilibre
2.9. Calcul du PH des solutions aqueuses
2.10. Etude expérimentale des vitesses de réaction : Réaction d’ordre 1et 2

Chapitre 3. Cinétique chimique

3.1. Effet de la température sur la vitesse de réaction
3.2. Formule d’ARRHENIUS
3.3. Notion de catalyseur

Programme des TP/TD

1. Méthodes de calcul
2. Préparation de solutions titrées
 Acide/base, permanganate de potassium, iode, nitrate d’argent
3. Acidimétrie
 Dosage des sulfites, de l’acidité du vin ou des jus, de l’acidité de la matière grasse
4. Manganimétrie
 Dosage direct de l’acide oxalique et dosage indirect des sucres réducteurs
5. Iodométrie
 Degré colorimétrique de l’eau de Javel et Indice d’Iode de la matière grasse
6. Argentimétrie
 Méthode de Mohr

7
 ECUEF 112 : Chimie organique

Programme du cours
Chapitre 1. Analyse élémentaire d’un composé organique
1.1. Formule brute
1.2. Formule composée

Chapitre 2. Représentation spatiale d’un carbone saturé

2.1. Représentation de CRAM
2.2. Projection de FISHER et de NEWMAN

Chapitre 3. Propriétés chimiques des Hydrocarbures

3.1. Alcanes
3.2. Alcènes
3.3. Alcynes

Chapitre 4. Propriétés des alcools

Chapitre 5. Les amines

Chapitre 6. Les dérivés carbonylés

6.1. Aldéhydes
6.2. Cétones

Chapitre 7. Les acides et leurs dérivés

Programme des TP/TD

 Extraction de produits organiques : Liquide/Liquide
 Synthèse d’acide salicylique
 Identification par chromatographie en couche mince

8
 UEF 120 : Biologie cellulaire / Génétique

ECUEF 121 : Biologie cellulaire

Objectifs
Acquérir autant une vision globale des mécanismes fondamentaux des cellules des organismes
vivants que desbases solides, à la fois théoriques et pratiques, en Biologie Cellulaire :
 Approfondissement des connaissances sur les constituants cellulaires et leurs rôles.
 Compréhension des grands mécanismes de la régulation de la dynamique cellulaire :
compartimentation et trafic intracellulaire, jonctions cellulaires, adhérence cellulaire, matrice
extracellulaire, cytosquelette et motilité intracellulaire.
 Approfondissement des techniques d’étude en biologie cellulaire et de leurs applications.

Programme du cours
Chapitre 1. Organisation générale de la cellule
1. Propriétés fondamentales communes aux différents types de cellules
2. Classification des cellules
2.1. Cellules procaryotes : Organisation d’une Bactérie et d’un Procaryote autotrophe.
2.2. Cellules eucaryotes : organisation de la cellule animale, de la cellule végétale, exemple
d’un Eucaryote Unicellulaire
3. Constituants de base de la cellule et compartiments cellulaires
3.1. L’eau
3.2. Molécules organiques (protéines, glucides, lipides, acides nucléiques)
3.3. Sels minéraux

Chapitre 2. Membrane plasmique et Mécanismes de contrôle des échanges

1. Propriétés de la membrane plasmique
1.1. Structure et ultrastructure
1.2. Le modèle de la mosaïque fluide
2. Rôle de la membrane plasmique
2.1. Transport à travers la membrane plasmique
2.1.1. Simple diffusion
2.1.2. Diffusion facilitée ou transport passif (les perméases ; les canaux ioniques, les
ionophores)
2.1.3. Transport actif (pompes ATP à Na+ / K+ ; les pompes à Ca++ ; les pompes à protons
H+ ; exemples de transports couplés)
2.2. Pénétration cellulaire par endocytose
2.2.1. Pinocytose
2.2.2. Phagocytose
2.3. L’exocytose
2.4. L’adhésion cellulaire
2.5. Les jonctions cellulaires

Chapitre 3. Le cytosquelette
1. Les microtubules
1.1. Structure moléculaire
1.2. Organisation (Centrosome, Centriole, Corpuscules basaux, cils et flagelles)
1.3. Interaction des microtubules avec les organites cellulaires
2. Les microfilaments
2.1. Structure, composition et localisation
2.2. Fonctions

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 3. Filaments intermédiaires
3.1. Structure et localisation
3.2. Fonctions

Chapitre 4. Organites et Compartiments cellulaires

1. Organites à double membrane assurant la conversion d’énergie : les mitochondries et les
chloroplastes
1.1. Structure, ultrastructure et principales fonctions des mitochondries
1.2. Structure, ultrastructure et principales fonctions des chloroplastes
2. Le noyau
2.1. Structure et organisation du noyau interphasique
2.1.1. Nombre, taille et forme du noyau
2.1.2. Les chromosomes en interphase
2.1.3. Organisation de la chromatine
2.1.4. Le nucléole
2.1.5. L’enveloppe nucléaire
2.2. La reproduction cellulaire chez les eucaryotes
2.2.1. Reproduction et cycle cellulaire
2.2.2. Déroulement du cycle cellulaire : Phase G1, S, G2 et M ; Les étapes de la mitose ; le
caryotype ; Les étapes de la méiose (division réductionnelle et division
équationnelle)
3. Le système endomembranaire
3.1. Réticulum endoplasmique : Structure, Rôle physiologique,
3.2. Appareil de Golgi : Structure et Rôle physiologique
3.3. Les lysosomes : Structure et différentes voies d’évolution des lysosomes
4. Les Peroxysomes : Structure et Rôle physiologique

Programme des TP
TP1. Initiation à l’usage du microscope photonique : préparation, coloration et observation de
cellules eucaryotes animales et eucaryotes végétales (épithélium buccal, frottis sanguin,
amibe, cellule d’oignon…)
TP2. Etude de l’ultrastructure des organites cellulaires (Mitochondrie, Chloroplaste, Réticulum
endoplasmique, Appareil de golgi)
TP3. La perméabilité membranaire (phénomènes osmotiques et non osmotiques)
TP4. Le noyau interphasique et la division cellulaire (Mitose)
TP5. La méiose : Etudes des différentes étapes de la division méiotique

Programme des TD
TD 1. Microscopie : Microscope photonique – microscopes électroniques à transmission et à
balayage
TD2. Fractionnement cellulaire : Fractionnement cellulaire (centrifugations et ultracentrifugation)
TD3. Technique de marquage
 Techniques de marquage radioactif
 Utilisation des isotopes radioactifs en biologie cellulaire
 Hybridation in situ

10
 ECUEF 122 : Stabilité et Variabilité de l’Information Génétique

Programme du cours
Objectifs
Comprendre les mécanismes à l’origine de l’extraordinaire plasticité des génomes qui leur permet de
se diversifier et d’évoluer tout en maintenant une certaine stabilité.
Démontrer, approches expérimentales à l’appui, que l'ADN est le support de l'information génétique,
formé par un arrangement caractéristique de l'espèce. La précision et la modulabilité
de l’organisation structurale des génomes est importante dans les activités métaboliques associées à
l’ADN et dans la ségrégation de l’information génétique.

Programme du cours
Chapitre 1. Introduction et caractéristiques Génétiques du monde vivant
1. Stabilité de l’espèce / variabilité des individus
1.1. Cycles de vie et reproduction sexuée : alternance phase haploïde / phase diploïde
1.2. La méiose et la fécondation assurent la stabilité de l’espèce par la Conservation du caryotype
1.3. La méiose et la fécondation assurent la variabilité de l’individu par lességrégations aléatoires
des chromosomes lors de la gamétogenèse et les Brassages génétiques aléatoires lors dela
fécondation
2. Les sources de l’innovation génétique
2.1. A l’origine des nouveaux allèles : les mutations géniques
2.1.1. Polymorphisme génétique / phénotypique : notion de polymorphisme
2.1.2. Nature des mutations
2.1.3. Conséquences des mutations : notion de valeur sélective des mutations
2.2. A l’origine des nouveaux gènes : les mutations chromosomiques
2.3. Le génome actuel des espèces témoigne de l’évolution génétique: génome et évolution
(exemples d’évolution de familles multigéniques)

Chapitre 2. Nature du matériel génétique : mise en évidence et démarches expérimentales

1. Les travaux préliminaires
1.1. Les travaux de Garrod et la démonstration de la nature chimique du phénotype (exemple de
l'alcaptonurie)
1.2. Les travaux de Beadle et Tatum et la démonstration de la relation gène/enzyme
2. Matériel Génétique des procaryotes
2.1. Les expériences de Griffith (1928) et mise en évidence de la transformation
2.2. Les expériences d’Avery et al. (1944) : l’ADN est le support de l’information génétique
3. Matériel Génétique des virus
2.3. Les travaux de Herschey et Chase (1952)sur le phage T2 (marquage radioactif au S35 et au
P32)et de Fraenkel-Conrat et Williams (1955) sur le TMV (expériences de reconstitution in
vitro à partir de protéines et d’ARN de 2 souches): les acides nucléiques sont le support de
l’information génétique virale
4. Matériel Génétique des Eucaryotes
4.1. Les travaux de Sutton et mise en évidence de la relation caractères héréditaires /
chromosomes
4.2. Les travaux de Morgan et al. :Arguments par la théorie chromosomique de l’hérédité et par
les chromosomes sexuels

Chapitre 3. Stabilité structurale du support de l'information génétique

1. L’information génétique in vitro : Structures de l’ADN, les propriétés informatives de l’ADN sont
liées à sa structure
1.1. Universalité de la structure et de l’enchainement des nucléotides
11
 1.2. Stabilité et reproductibilité de la molécule d’ADN : Les travaux de Chargaff et de Wilkins &
Franklin et mise en évidence de la structure secondaire
2. Organisation structurale de l’information génétique et relation structure/fonction
2.1. Organisation structurale in vivo de l’information génétique
2.1.1. Les génomes des virus
2.1.2. Lesgénomes bactériens(génome chromosomique et génome plasmidique)
2.1.3. Lesgénomes des Eucaryotes (taille, organisation des gènes, familles des gènes...)
2.1.4. Précision et modulabilité de l’organisation structurale des chromosomes : importance
dans les activités métaboliques associées à l’ADN et dans la ségrégation de l’information
génétique

Chapitre 4. Reproduction et Fonctionnement du matériel génétique

1. Réplication de l’ADN : Perpétuation conservative de l’information génétique. Les travaux de
Meselson et Stahl et démonstration du modèle semi conservatif : argument de la stabilité
génétique
2.Expression du matériel génétique : Comment le message porté par la molécule d’ADN est traduit
sous forme de protéines ?
2.1. L’ARN un intermédiaire indispensable : la transcription (notion de brin transcrit/non
transcrit).
2.2. La traduction de l’ARN messager et code génétique (travaux de Matthaei et Nierenberg).

Programme des TD/TP

TP:
 Mise en évidence de la stabilité génétique et notion de clone bactérien
 Détermination du titre d’une suspension bactérienne
 Mise en évidence de la mutation et variabilité
 Extraction de l'ADN chromosomique et de l'ADN plasmidique, quantification par DO et sur gel,
contrôle de la qualité (pureté)...
 Réaction de Transcription in vitro, quantification et contrôle de l'intégrité de l'ARN...
TD:
Séries d'exercices basés sur des expériences se rapportant à la réplication, la transcription et la
traduction.

12
 UEF 130 : Biologie Animale/ Végétale

ECUEF 131 : Modes de la reproduction et du développement animal

Les objectifs
Cette introduction générale à la biologie animale est nécessaire car, non seulement, elle nous
renseigne sur la diversité des cycles animaux et de leurs adaptations à l'environnement, mais aussi,
elle s’ouvre sur l’étude de cette diversité qui prépare le cours de Biologie Animale se rapportant aux
aspects phylogénétique et organisationnel des Animaux.
La reproduction et le développement animal sont donc, des disciplines de base nécessaires à tous les
parcours existant dans la réforme LMD. C'est la raison pour laquelle le cours s'y rapportant est
programmé au premier semestre (S1) de la première année de licence (L1) et se limitera à l'approche
descriptive qui prépare à comprendre la classification animale et les liens de parenté entre les
groupes (S2 et S3).
Les parties se rapportant aux mécanismes expérimentaux et moléculaires (Biologie de la
Reproduction et du Développement) seront proposées en S4 de la L2. Par son essor expérimental et
moléculaire actuel, elles ouvrent sur les applications biotechnologiques multiples (parties pouvant
être détaillées en L3 selon les parcours).

Programme du cours
Chapitre 1.L’organisme animal en interaction avec son environnement: Vue à travers différents
cycles vitaux des animaux
1. Continuité de la reproduction et du développement
(Introduire dans un cycle ces deux concepts ainsi que les notions d'ovulation, de ponte, d'éclosion,
de naissance, d’oozoïde, de blastozoïde, etc.
2. Comment les animaux se reproduisent et se développent-ils?
2.1. Les deux grands modes de reproduction et leur signification
 La reproduction asexuée (développement sans œuf)
 La reproduction sexuée (développement à partir d'un œuf)
2.2. Le développement et sa signification
2.2.1. Le développement embryonnaire
 L’embryogenèse oogénétique à partir des œufs
 L'embryogenèse somatique ou blastogenèse
2.2.2. Le développement post-embryonnaire oogénétique
 Le développement direct
 Le développement indirect
Tous ces modes peuvent être schématisés dans le cycle

Chapitre 2: Reproduction et développement pourquoi? L'organisme mortel: besoin de perpétuité

1. Les caractéristiques des cellules de la reproduction et du développement des animaux: la survie
2. Quelle est cette partie qui survit et assure la reproduction-développement des animaux? Les
cellules souches
2.1. Les différents types cellulaires d'un organisme animal: soma et germen
2.2. Caractéristiques et différents types de cellules somatiques et germinales
 Les cellules somatiques: différenciées, indifférenciées ou souches
 Les cellules souches germinales
2.2. Localisation des cellules souches et différence entre animaux
 Cas des animaux à alternance de phases sexuée et asexuée: cellules souches réparties
dans tout le corps
 Cas des animaux à reproduction sexuée seule: cellules souches germinales bien localisées
13
Dans ce qui suit, ne sera tenu compte que de l'embryogenèse oogénétique

Chapitre 3 : Etude comparative des principaux types de développement

Première partie : Les différentes phases du développement embryonnaire
1. La phase de la fécondation et son rôle
1.1. L'ovocyte anisotrope et l’acquisition de la première polarité embryonnaire (PA/PV)
1.2. La fécondation et l'activation de l'œuf
1.3. Les différents types d'œufs selon la charge vitelline
2. Les modes de production de descendance
2.1. Oviparité (éclosion)
2.1.1. Ovuliparité et développement externe, avec et sans rapprochement
2.1.2. Oviparité immédiate après fécondation interne
2.1.3. Ovoviviparité : développement interne sans contact trophique
2.2. Viviparité (naissance, mise-bas)
2.2.1. Viviparité histotrophe: aplacentaire
2.2.2. Viviparité vraie : placentaire : présence d'organes d'échange materno-foetaux
3. La phase de la segmentation et son rôle: Compartimentation de l’œuf, formation du blastocoele
et son rôle
4. La phase de la gastrulation et son rôle
4.1. Formation des feuillets embryonnaires par mouvement cellulaire
4.2. Rôle des molécules d’adhérence cellulaire dans ces mouvements
4.3. Notion de carte des territoires présomptifs
5. La phase de l’organogenèse et son rôle
5.1. Rapport entre Organogenèse et Histogenèse
5.1.1. Étape préorganogénétique
5.1.2. Étape organogénétique de différenciation ou histogenèse des feuillets en plusieurs
catégories cellulaires (nerveuse, musculaire, épithéliale et conjonctive)
5.2. L’histogenèse des tissus à partir de deux types de structures cellulaires embryonnaires
5.2.1. Les mésenchymes donnant les tissus conjonctifs et leurs dérivés
5.2.2. Les épithéliums donnant les tissus épithéliaux et leurs dérivés
5.2.3. Généralités sur les différences tissulaires(détail vu en histologie)

Deuxième partie : Exemples types de développement embryonnaire

1. Les différents types de segmentation et de blastula : étude comparée d'exemples
1.1. Segmentation totale radiaire, spirale, rotationnelle. Subégale ou inégale
1.2. Segmentation partielle discoïdale, superficielle
1.3. Coeloblastula régulière / irrégulière, sterroblastula, discoblastula, périblastula
1.4. Cas particulier des Mammifères
2. Les différents types de gastrulation : étude comparée d'exemples: Embolie, épibolie, involution,
immigration, délamination
3. Les principales étapes de l’organogenèse : cas de l’oursin et des Vertébrés
3.1. Organogenèse de l'oursin
3.2. Préorganogenèse des Vertébrés. L'exemple traité en détail est celui des Amphibiens :
neurulation, compartimentation mésodermique, formation du bourgeon caudal
4. Cas particuliers des Amniotes
4.1. Nécessité des annexes embryonnaires en réponse aux contraintes de la vie terrestre
4.2. Différences entre les annexes des Sauropsidés et des Mammifères
4.2.1. Annexes des Sauropsides: vésicule vitelline, allantoïde, amnios
4.2.2. Annexes des Mammifères : vésicule vitelline, allantoïde, amnios, placenta 20

14
Conclusion : Les ouvertures du cours
1. Ouverture sur la classification animale phylogénétique: Introduction au programme de BA2 et
BA3 (diversité et phylogénie du Règne Animal)
2. Ouverture sur l'Écologie: Introduction à l'Ecologie et l'Evolution biologique
2.1. La Reproduction montre la diversité des cycles en relation avec leurs stratégies adaptatives
2.2. Le développement permet de comprendre que certaines ressemblances ne sont pas
phylogénétiquesmais des adaptations écologiques
3. Ouverture sur les aspects moléculaires, cellulaires et Biotechnologiques : Clonage et
transgénèse: Introduction au programme de la Biologie de la reproduction et du développement
(mécanismes), Introduction aux Biotechnologies animales

Programme des TP/TD

Séance 1: Développement embryonnaire des Échinodermes (l’oursin) Observation de la
segmentation, gastrulation et organogenèse (dessin des différents stades) Tableau récapitulatif à
donner en fin de séance avec les dessins

Séance 2: Développement embryonnaire des Amphibiens: Observation de la segmentation,

gastrulation et organogenèse (dessins des différents stades), Tableau récapitulatif à donner en fin de
séance avec les dessins

Séance 3: Développement embryonnaire des Oiseaux et des Mammifères: Observation détaillée du

développement des Oiseaux (dessin stade 28h ou plus avancé), Explication des différences avec les
Mammifères (travail personnel annoté), Tableau comparatif (à domicile annoté)

Séance 4 et 5: Comparaison de cycle direct et cycle indirect: Exemples en relation avec la richesse de
l'œuf en vitellus et le milieu de vie (exemple des Mollusques marins et terrestres, des Annélides
marins et terrestres) (exposés annotés)

Séance 6 si possible: comparaison entre les 4 types de tissus: Étude d'un exemple d'organes
montrant la différence structurale des tissus : épithélial, conjonctif, nerveux, musculaire (Exemples :
coupe transversale de l'intestin, de l'utérus, du spermiducte ou de la peau); Dessin d'un secteur bien
choisi

ECUEF 132 : Morphologie et anatomie des Angiospermes

Objectifs
Cet ECUE montre l’importance du monde végétal dans l’enseignement des sciences biologiques.
 Dans une première étape, on donne un aperçu succinct sur la classification générale des végétaux.
 Ensuite, sera réalisée une étude détaillée de la particularité de la cellule végétale, puis des
différents tissus végétaux. Cette étude décrit aussi l’agencement des tissus au sein des différents
organes, en dégageant les différentes structures spécifiques à chaque organe et à chaque classe
des Angiospermes.
 En outre, cet ECUE mettra l’accent sur la morphologie de chaque organe de la plante (racines, tiges
et feuilles) et les modes d’adaptation à l’environnement.

Programme du cours
Introduction : Importance de la lignée verte dans la biosphère et grandes lignes de la classification et
de la diversité de la lignée verte(Aperçu succinct)
1. Les Algues Eucaryotes sensulato
2. Les Embryophytes non vasculaires
3. Les Embryophytes vasculaires (vers les Angiospermes)
15
Chapitre 1. Cellule végétale et différents tissus végétaux
1. Les particularités de la cellule végétale
2. Les tissus végétaux
2.1. Les méristèmes
2.2. Les tissus primaires
2.3. Les tissus secondaires

Chapitre 2. Étude morphologique et anatomique de la tige

1. Organisation morphologique de la tige
2. Ramifications de la tige
3. Adaptations fonctionnelles de la tige
4. Structure anatomique primaire de la tige (Liliopsida et Magnoliopsida)
5. Structure anatomique secondaire de la tige (Magnoliopsida)

Chapitre 3. Étude morphologique et anatomique de la racine

1. Organisation morphologique de la racine
2. Ramifications de la racine
3. Adaptations fonctionnelles de la racine
4. Structure anatomique primaire de la racine (Liliopsida et Magnoliopsida)
5. Structure anatomique secondaire de la racine (Magnolopsida)

Chapitre 4. Étude morphologique et anatomique de la feuille

1. Organisation et diversité morphologique de la feuille
3. Modifications de la structure de la feuille
4. Adaptations fonctionnelles de la feuille (Phyllotaxie)
4. Structure anatomique primaire (Liliopsida et Magnoliopsda)
5. Structure anatomique secondaire (Magnoliopsda)

Programme des TP/TD

TP/TD 1 : Initiation aux techniques des coupes histologiques et Reconnaissance des tissus primaires
TP/TD 2 : Réalisation des coupes histologiques et Reconnaissance des tissus secondaires
TP/TD 3 : Etude morphologique, adaptations fonctionnelles et étude de la structure anatomique de
la tige (Liliopsida et Magnoliopsida)
TP/TD 4 : Etude morphologique, adaptations fonctionnelles et étude de la structure anatomique de
la racine (Liliopsida et Magnoliopsida)
TP/TD 5 : Etude morphologique, adaptations fonctionnelles et étude de la structure anatomique de
la feuille (Liliopsida et Magnoliopsida)

16
 UEF 140 : Géologie du globe et Matériaux de la lithosphère

ECUEF 141 : Structure et dynamique du globe

Objectifs
L’objectif de ce cours est de décrire la structure interne du globe terrestre, constitué d’enveloppes
concentriques qui se distinguent par leur nature et leurs propriétés physico-chimiques et qui sont en
mouvement à l’horizontale, grâce aux cellules de convection, et à la verticale, grâce à l’équilibre
dynamique isostatique.
Programme du cours
Chapitre 1. Structure de la terre
1. Caractéristiques de la Terre
1.1. La bimodalité des altitudes
1.2. Le cycle annuel de la Terre
2. Les études sismiques renseignent sur la structure interne du globe
2.1. Les séismes
2.2. Les ondes sismiques renseignent sur la structure interne du globe
2.3. Le modèle radial de la terre solide PREM (Preliminary Reference Earth Model)
2.4. La nature minéralogique et la composition chimique des enveloppes du globe terrestre
2.5. Relation entre les limites des plaques et la répartition géographique des séismes et des
volcans
2.6. Les contextes géodynamiques
2.6.1. Les dorsales océaniques : limites d’accrétion
2.6.2. Les zones de subduction : limites de résorption
2.6.3. Les zones de collision
2.7. La géodésie pour la surveillance des failles actives

Chapitre 2. Dynamique du globe

1. Tomographie sismique et contexte géodynamique
2. Les principales sources de chaleur interne du globe
3. Le gradient géothermique
4. Exploitation d’un géotherme pour expliquer la présence de courants de convection
5. La dérive des continents
5.1. Les faits : les arguments de Wegner
5.2. Les cellules de convection : moteur de la dérive et de la tectonique des plaques
6. L’expansion des fonds océaniques
6.1. Les anomalies magnétiques
6.2. L’hypothèse de Heiss et Vine & Matthews
7. Gravimétrie et exploitation des cartes gravimétriques
8. L’isostasie et la mobilité verticale de la lithosphère

Programme des TD
Exercices sur la dérive des continents, exercices de tomographie sismique, l'isostasie : calculs
d’équilibre vertical dans des contextes géologiques de chaîne de montagne, d’océan et de rift
continental, calculs de la vitesse de l'ouverture des océans, quantification de la dynamique du globe

17
 ECUEF 142 : Matériaux de la lithosphère
Objectifs
Etudier les principaux minéraux et roches formant les enveloppes du globe terrestre (la croûte
continentale, la croûte océanique et le manteau).

Programme du cours
Chapitre 1. Minéralogie
1. Notions élémentaires de cristallochimie et de cristallographie
2. Les minéraux silicatés
2.1. Propriétés
2.2. Classification
3. Les minéraux non silicatés
3.1. Propriétés
3.2. Classification

Chapitre 2. Pétrographie
1. Cycle des roches
2. Magmatisme et roches magmatiques
2.1. Production des magmas
2.2. L’évolution des liquides
2.3. Les modes d’expression des magmas
3. Le métamorphisme et les roches métamorphiques
3.1. Les associations minéralogiques indicatrices de pression et de température
3.2. Distribution spatiale des roches métamorphiques
3.3. Variations temporelles des associations minéralogiques
4. Du sédiment à la roche : Les roches sédimentaires
4.1. Les processus d’altération
4.2. Erosion et entraînement de matière
4.3. Sédimentation et formation de roches

Programme des TP
Examen macroscopique des minéraux et des roches

ECUEF 143 : Pédologie

Objectifs
 Etudier les conditions de formation des sols à l’interface atmosphère-hydrosphère-biosphère, les
principales propriétés physico-chimiques des sols, la pédogenèse et l’évolution des sols ainsi que
l’organisation de base des horizons pédologiques.

Programme du cours
1. Rappel : les constituants originaux des sols
2. Les mécanismes de formation des sols
3. Les types des sols
4. La carte pédologique de la Tunisie
5. Sols et environnement
6. Paléosols
Programme des TP
Etude de :
 pH eau et pH + KCl du sol
 Conductivité électrique

18
 Carbone organique et Matière organique
 granulométrie des sols
 Calcaire total
 Calcaire actif
 Pouvoir tampon des sols

19
 Maquette du 2èmeSemestre de la 1ère année de Licence (S2-L1) du parcours
Biologie-Géologie (BG)‫بيولوجيا وجيولوجيا‬
Volume des heures de Nombre de Modalité
Coefficient
Unité d'enseignement (UE) / code Elément constitutif d'UE formation présentielles Crédits d’évaluation
code UE
Compétences ECUE (ECUE) Contrôle Régime
Cours TD TP Autre ECUE UE ECUE UE continu mixte
Maths/ Physique UEF210 Mathématiques 1h30 1h00 - 3 1,5 X
UEF 210 6 3
Comp : Outils nécessaires à BG UEF210 Physique 1h30 1h00 0h30 3 1,5 X
Biochimie et Microbiologie UEF221 Biochimie structurale 2h00 1h00 1h00 4 2 X
UEF220 Comp : structure du vivant 7 3,5
UEF222 Microbiologie générale 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
et diversité microbienne
Diversité et phylogénie
Biologie animale et végétale UEF231 animale (des Parazoaires aux 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
UEF230 Protostomiens) 6 3
Reproduction des
Comp : Diversité du vivant UEF232 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
Angiospermes
Géologie dynamique UEF241 Géodynamique externe 1h30 1h00 2 1 X

UEF240 UEF242 Milieux de sédimentation 1h30 1h00 2 7 1 3,5 X

Comp : Géodynamique Géomorphologie
UEF243 1h30 1h00 0h30 3 1,5 X
et climats-paléoclimats
Unité transversale UET211 Anglais (2) 1h30 2 1 X
UET210 Culture et Compétences 4 2
UET212 2 1h30 2 1 X
Numériques-2CN (D2 )
Total 29h30 30 30 15 15
Les couleurs des cases du tableau sont comme suit :
Les ECUEs transversauxen bleu ciel, ceux de base en blanc, ceux de Biologie en jaune, ceux de Géologie en violet

2
Domaine de compétence D2 Communication et collaboration : Interagir, Communiquer et S'insérer dans le monde numérique

20
 Syllabus des Eléments constitutifs (ECUEs) des Unités
d’enseignement fondamental (UEF) et de l’Unité d’Activités
Pratiques (UAP) de S2-L1

UEF 210 : Mathématiques et Physique

ECUEF 211 : Mathématiques

Objectifs
Le cours de mathématiques vise à assurer des bases communes à tous les étudiants, quelle que soit
leur formation antérieure.Ces outils mathématiques sont indispensables pour suivre efficacement un
enseignement de sciences expérimentales.
Compétences recherchées
Mathématiques: Représentation graphique des fonctions, Calculs élémentaires avec les fonctions,
Fonctions de plusieursvariables et applications.

Programme du cours
Chapitre 1. Introduction et rappel
1. Les nombres et les ensembles
2. La trigonométrie - Le cercle trigonométrique
3. La complétion d'un carré - le binôme de Newton
4. Formule de Leibniz.
5. Règle de l'Hospital

Chapitre 2. Les fonctions et leurs représentations graphiques

1. Le logarithme - la fonction exponentielle - les fonctions hyperboliques et leurs réciproques
2. Les fonctions circulaires (ou trigonométriques) et leurs réciproques
 Il faut représenter les courbes de toutes ces fonctions, étudier leurs variations, continuité,
dérivabilité, la tangente en un point.
3. Développement limité
 Formule de Taylor, approximation d'une fonction par un polynôme, calcul de limite, position de la
courbe par rapport à une tangente

ECUEF 212 : Physique

Objectifs
Programme du cours
Chapitre 11 Introduction à la physique
1. La physique: ses buts et ses outils
2. Mesure, loi, modèle, théorie
3. Interactions fondamentales

Chapitre 2. Notions de base en mécanique

1. Repérage, trajectoire, vitesse, accélération
2. Force - Travail
3. Energie cinétique - Energie potentielle - Energie (diverses formes, conservation de l'énergie)

Chapitre 3. Notions de base en électricité

1. Charge électrique - Loi de Coulomb - Champ électrique

21
2. Le dipôle électrique et ses applications
3. Potentiel - Energie potentielle
4. Courant électrique, intensité, tension, Lois d'Ohm - Champ magnétique
5. Force magnétique - Notions sur les propriétés magnétiques de la matière

Chapitre 4. Notions de base en optique et atomistique

1. Lumière: Modèle de l'optique géométrique, réflexion, réfraction, dispersion.
2. nature ondulatoire de la lumière, interférence, diffraction, réseaux _ Photon, effet photoélectrique
3. Conception actuelle de l'atome - Nombres quantiques - Structure du noyau – Radioactivité.

Programme des TD/TP

22
 UEF 220 : Biochimie et Microbiologie

ECUEF 221 : Biochimie structurale

Objectifs
Le principal objectif de la biochimie est la compréhension au niveau moléculaire de tous les
processus chimiques associés aux cellules vivantes. Cet objectif est notamment atteint par l'étude
des molécules, par la détermination de leur structure et l'analyse de leur fonctionnement. Cet
enseignement doit s'efforcer de :
 Prendre connaissance de la composition macromoléculaire commune à tous les êtres vivants, leurs
caractéristiques structurales ainsi que les méthodes d’analyse permettant de les identifier, de les
doser et de les purifier. Le rôle biologique est évoqué, en relation avec la structure.
 Prendre connaissance des particularités structurales des catégories de macromolécules fortement
liées au métabolisme énergétique de la cellule (les glucides et les lipides) : classement,
identification, méthodes de dosage et d’analyse. La classification permet de comprendre la source
structurale de la diversité moléculaire et la conséquence sur le rôle essentiel que jouent ces
macromolécules, par leur diversité, aux différentes structures et aux différentes fonctions
physiologiques des êtres vivants.
 Prendre connaissance des particularités structurales des Protéines, deux catégories de
macromolécules fortement associées dans les processus liés à l’hérédité, à la différentiation
cellulaire et à sa spécialisation. Leur étude structurale, et les méthodes d’études sont une occasion
pour connaitre la démarche scientifique et les techniques d’analyses mises en place pour les isoler,
les doser, et déterminer leur rôle dans le fonctionnement cellulaire.
 Une introduction aux acides nucléiques sera apportée dans ce cours. Ce volet sera traité dans le
cours de Biologie moléculaire

Programme du cours
Chapitre 1. Les Glucides
Introduction: Définition générale et classification
1. Monosaccharides ou oses ou sucres simples
1.1. Structure linéaire
1.1.1. Isomérie
1.1.2. Épimérie
1.2. Structure cyclique
1.2.1. Anomalie de la représentation linéaire des oses
1.2.2. Représentation cyclique de Tollens
1.2.3. Représentation de Haworth
1.3. Propriétés chimiques des oses
1.3.1. Propriétés liées à la présence de la fonction réductrice
1.3.2. Propriétés liées aux fonctions alcools
1.3.3. Propriétés dues à la présence des groupements carbonyle et alcool portés par 2
carbones adjacents
1.4. Propriétés physiques des oses
1.5. Nomenclature
2. Les osides
2.1. Liaison glycosidique
2.2. Les diholosides
2.2.1. Les diholosides réducteurs
2.2.2. Les diholosides non réducteurs
2.3. Les triholosides
2.4. Les oligosaccharides réducteurs et non rédusteurs

23
 2.5. Les polyosides, les polyholosides, les polysaccharides
2.5.1. Les homopolysaccharides :
* L’amidon
* Le glycogène
* La cellulose
2.5.2. Les Hétéropolysaccharides
3. Les hétérosides
3.1. Les glycoprotéines
3.2. Les glycolipides
3.3. Les nucléosides

Chapitre 2. Les Lipides

Introduction générale
1. Les acides gras
1.1. Définition
1.2. Classification
1.2.1. Les acides gras saturés
1.2.2. Les acides gras insaturés
1.3. Propriétés physiques des acides gras
1.3.1. Solubilité
1.3.2. Point de fusion
1.4. Propriétés chimiques
1.4.1. Propriétés dues à la présence de la fonction acide
1.4.2. Propriétés dues à la présence de la double liaison
1.5. Séparation et analyse des acides gras
2. Les lipides simples
2.1. Les glycérides ou acyl-glycérols
2.2. Propriétés chimiques :
2.2.1. Hydrolyse
2.2.2. Saponification
2.2.3. Réactions d’addition
2.2.4. Détermination des indices caractéristiques des Triglycérides
2.3. Séparation des glycérides
2.3.1. Les stérides
2.3.2. Les cérides
2.3.3. Les étholides
3. Les lipides complexes
3.1. Les glycérophosiphatides ou phosphoglycérolipides ou phosphoglyérides.
3.1.1. Les acides phosphatidiques
3.1.2. Les phosphoaminolipides
3.1.3. Les inositides ou inositophosphatides ou phosphatidylinositol
3.1.4. Les plasmalogènes
3.2. Glycosyldiglycérides
3.3. Les sphingolipides
3.3.1. Les céramides
3.3.2. Les sphingomyélines
3.3.3. Les cérébrosides
3.3.4. Les sulfatides
Les vitamines et coenzymes peuvent être ajoutés au programme des lipides et glucides.

24
Chapitre 3. Les Protéines (Composition, structure, propriétés et méthodes d’études)
Introduction générale
1. Les acides aminés
1.1. Structure générale
1.2. Classification des acides aminés
1.3. Propriétés physiques des acides aminés
1.3.1. La stéréochimie des acides aminés
1.3.2. Adsorption à l’Ultraviolet
1.3.3. Les propriétés ioniques des acides aminés
1.3.4. Titrage des amines aminés
1.4. Propriétés chimiques des acides aminés.
1.4.1. Réactions dues à la présence du groupement carboxyle
1.4.2. Réactions dues à la présence du groupement aminé.
1.4.3. Réactions nécessitant la présence simultanée d’un α-carboxyle et d’un α-amine
1.5. Méthodes d’analyse et de séparation des acides aminés
1.5.1. Séparation des acides aminés : Chromatographie& Electrophorèse
1.5.2. Analyse des acides aminés
2. Les peptides
2.1. Définition
2.2. Convention d’écriture et nomenclature
2.3. Propriétés physico-chimiques
2.3.1. Les propriétés physiques
2.3.2. Les propriétés chimiques
2.4. Etude de quelques peptides biologiquement actifs
3. Les protéines
3.1. Conformation des protéines
3.2. Etude de la structure primaire des peptides et des protéines
3.2.1. Détermination de la composition globale en acides aminés
3.2.2. Détermination de la séquence en acides aminés
3.3. Propriétés physico-chimiques des protéines
3.3.1. Solubilité
3.3.2. Propriétés optiques
3.3.3. Propriétés chimiques
3.4. Principaux types de protéines

Chapitre 4. Les Acides Nucléiques

Introduction
Définition, Localisation cellulaire, différents types en relation avec le rôle.
Ce cours sera détaillé en biologie moléculaire

Programme des TD/TP

Exercices d'application
Les TD sont réalisés sous forme d’exercices dont les données porteront sur les méthodes
d’identification d’isolement et de dosage des acides nucléiques et des protéines ou de leurs
constituants, amenant l’étudiant à apprendre à exploiter des informations expérimentales pour en
déduire une structure. L’exercice inverse serait d’exploiter les propriétés structurales pour trouver la
méthode de purification et de dosage adéquate.

Les TP
1ère séance TP : Séance d’introduction sur le matériel en biochimie
* Organisation du travail durant le semestre, contrôle continu et examen

25
* Rappels des bonnes pratiques de laboratoires
* Rappels sur le principe des dosages colorimétriques : gamme étalon, solution mère et dilutions,
traçage des courbes

2ème séance: Les Glucides

* Identification des sucres de l’hydrolysat d’ADN (réaction de Foulger, osazone etc.
* Ou, dosage des sucres réducteurs dans différentes boissons et quelques aliments (jus, coca light,
lait, miel...)
* Propriétés et réactions caractéristiques des glucides

3ème séance: Les Lipides

Détermination des indices caractéristiques d’acide gras (Indice d’acide, de saponification, d’ester et
d’iode d’une huile vierge et d’une huile partiellement dégradée (relation entre les indices et la
structure)

4ème séance: Les Acides Aminés: propriétés de charge ; identification

pHmétrie (Titration d’un acide aminé) et électrophorèse d’un mélange protéique tel que le blanc
d’œuf.

5ème séance: Les Protéines

* Analyse qualitative et quantitative des protéines (chromatographie en couche mince d’un mélange
d’acides aminés et dosage protéique par la méthode de Lowry ou Bradford
* Protéines : dosage colorimétrique des protéines solubles dans un extrait alimentaire (levure de
boulangerie, œuf, lait…)

ECUEF 222 : Microbiologie générale

Programme du cours
Chapitre 1. Introduction à la Microbiologie - le monde microbien
1. Historique et découverte des microorganismes
2. Microorganismes et maladies: La bactériologie médicale
3. Le monde microbien: Diversité et classification

Chapitre 2. Bactériologie: La cellule bactérienne

1. Constitution chimique globale des bactéries
1.1. Teneur en eau
1.2. Composition chimique élémentaire
1.3. Constituants organiques
2. Formes et associations des bactéries
2.1. Forme sphérique ou coccoïde
2.2. Forme cylindrique ou en bâtonnets
2.3. Forme spiralée ou hélicoïdale
3. Structure et composition de la cellule bactérienne
3.1. Schéma d’une cellule bactérienne
3.2. Structure anatomique d’une bactérie
3.2.1. Les enveloppes.
3.2.1.1. Les capsules et les couches muqueuses
3.2.1.2. La paroi bactérienne
*La paroi des bactéries à Gram positif
*La paroi des bactéries à Gram négatif
3.2.1.3. Les couches S

26
 3.2.1.4. Les protéines M
3.2.1.5. La membrane cytoplasmique
3.2.2. Les constituants internes
3.2.2.1. Le système membranaire interne
3.2.2.2. Le nucléoïde
3.2.2.3. Le cytoplasme
3.2.2.4. Les ribosomes
3.2.2.5. Les granules de réserves
3.2.2.6. Les vacuoles
3.2.2.7. Les carboxysomes
3.2.2.8. Les tylacoïdes
3.2.3. Les appendices
3.2.3.1. Les flagelles
3.2.3.2. Les fimbriae
3.2.3.3. Les pili
3.2.4. Les cellules quiescentes
3.2.4.1. Les endospores
3.2.4.2. Les exospores
3.2.4.3. Les cystes bactériens

Chapitre 3. Bactériologie: Nutrition & Croissance bactérienne

1. Besoins nutritifs des microorganismes
1.1. Source d’énergie
1.2. Source de carbone
1.3. Source d’azote
1.4. Source de soufre et de phosphore
1.5. Autres éléments minéraux
1.6. Facteurs de croissance
2. Conditions physico-chimiques de culture
3. Paramètres de la croissance en milieu liquide
3.1. Temps de génération
3.2. Taux de la croissance horaire
4. Croissance en milieu liquide non renouvelé ou culture en "Batch"
4.1. Courbe de croissance
4.2. Croissance synchrone
4.3. Croissance diauxique

Chapitre 4. Bactériologie: Systématique bactérienne

1. Identifications de bactéries
2. Classification des bactéries

Chapitre 5. Virologie: Composition, Structure & Classification des Virus

1. Historique et découverte des virus
2. Définition
3. Capside virale
3.1. Capsides tubulaires à symétrie hélicoïdales
3.2. Capsides icosaédriques à symétrie cubique
3.3. Virus complexes
4. Génome viral
5. Enveloppe virale
6. Classification des virus

27
Chapitre 6. Virologie: Interaction Virus-Cellule & Cycle viral
1. Les étapes précoces de la multiplication virale
1.1. Attachement
1.2. Pénétration
1.3. Décapsidation
2. Synthèse des macromolécules
2.1. Transcription
2.2. Traduction
2.3. Réplication
2.4. Assemblage & libération des virus
2.4.1. Assemblage & libération des virus nus
2.4.2. Maturation & sortie des virus enveloppés

Programme des TD/TP

TP1: Organisation d'un laboratoire de Microbiologie, techniques de stérilisation et de manipulations
stériles et règles d'hygiène et de biosécurité.
TP2: Milieux de culture et techniques d'ensemencement
TP3: Identifications morphologiques des bactéries: caractères culturaux, mobilité, coloration Gram...
TP4: Identifications biochimiques et moléculaires des bactéries: tests enzymatiques, galeries Api,
initiation aux techniques de biologie moléculaire
TP5: Etude de la cinétique de la croissance bactérienne
TP6: Techniques d'étude des virus: Techniques d'isolement en culture cellulaire, titrage des virus,
séroneutralisation, inhibition de l'hémaglutination...

28
 UEF 230 : Biologie animale et végétale

ECUEF 231 : Diversité animale

Phylogénie des Parazoaires aux Métazoaires Protostomiens
Objectifs
Ce programme présentera la diversité du règne animal par une approche d'étude des relations de
parenté phylogénétiques actuelles. Étudiées non seulement par l’analyse des ressemblances et des
différences, mais, aussi par la recherche de la parenté proche grâce à l’analyse des deux états de
chaque caractère: ancestral ou plésiomorphe et dérivé ou apomorphe ce qui permet de distinguer
les vraies similitudes (homologies) des fausses (homoplasies), de réviser les classifications et
d’expliquer les liens de parenté (mono-, para- ou polyphylie). En même temps, cette approche
permettra de réviser la relativité des ressemblances phénétiques qui peuvent être dues à des
phénomènes de convergence adaptative à un même milieu de vie.
Cette approche, non seulement, elle actualise les connaissances sur la classification animale, mais,
elle sensibilise également les étudiants à la compréhension et l'acceptation de l'évolution des êtres
vivants.
Une introduction des nouvelles méthodes classificatoires est nécessaire.

Programme du cours

Introduction générale
1. La diversité biologique
2. Quelques concepts clés de la classification
2.1. Le caractère
2.2. Le taxon
3. Les méthodes de classification des êtres vivants: entre phénétique et cladistique
1.1. La phénétique: ses principes, ses avantages, et ses faiblesses
1.2. La cladistique: ses principes, ses avantages et ses faiblesses; les notions d'apomorphie,
plésiomorphie, symplésiomorphie et synapomorphie
1.3. L’éclectique: synthèse des deux avec l’étude paléontologique et écologique

Chapitre 1. Place phylogénétique des Métazoaires dans le monde vivant

1. Les animaux ou Métazoaires: Origine ancestrale et synapomorphies
2. Phylogénie des Métazoaires : Présentation générale de l’arbre phylogénétique des Métazoaires
(explication dans les chapitres suivants)

Chapitre 2. Les Parazoaires et leurs relations Phylogénétiques

1. Synapomorphies des Parazoaires
1.1. Organisation générale
1.2. Cycle vital
2. Phylogénie des Parazoaires: éclatement des Spongiaires en groupes séparés: Démosponges,
Hexactinellides et Calcisponges.
2.1. Les Desmosponges: caractères dérivés. Ex: Eponges d’eau douce, Eponges de cuisine et
Eponges de toilette.
2.2. Les Hexactinellide: caractères dérivés: Ex : Euplectelle
2.3. Les Calcisponges et les caractères qui les rapprochent des Eumétazoaires; Ex : Leucosolenia
et Sycon raphanus.
3. Importance écologique et économique (filtreurs bio-indicateurs, éponges de toilette, extraction
de molécules utilisées en pharmaceutique).

29
Chapitre 3. Les Eumétazoaires
1. Synapomorphies du taxon
2. Phylogénie des Eumétazoaires
2.1. Les Diploblastiques : les Cnidaires forment le taxon le plus important
2.1.1. Synapomorphies des Cnidaires: Etude de l’organisation de l’hydre verte (Chlorohydra
viridissima)
2.1.2. Etude d'un cycle avec l’alternance des deux phases fixée et libre : Cycle d’Obelia
geniculata.
2.1.3. Etude succincte de leur phylogénie insistant sur la dérivation récente de la phase
méduse à partir du polype et de l’acquisition du polymorphisme chez les Cnidaires.
2.1.4. Importance écologique et économique (corail, méduses)
2.2. Les Triploblastiques, Bilatériens, Coelomates
2.2.1. Synapomorphies du taxon
2.2.2. Phylogénie du taxon avec les synapomorphies principales
2.2.2.1. Les Protostomiens
2.2.2.2. Les Deutérostomiens

Chapitre 4: Phylogénie des Protostomiens

Ne seront mentionnés que les grands taxons actuels qui appartiennent à deux lignées : les
Trochozoaires et les Ecdysozoaires.

Chapitre 5. Les Trochozoaires

1. Les synapomorphies principales
1.1 Les Platyzoaires: représentés essentiellement par le taxon des Plathelminthes
1.1.1. Synapomorphies: musculature, protonéphridies, appareil reproducteur très différencié
1.1.2. Phylogénie et détail des taxons suivants:
1.2.2.1. Les Plathelminthes libres (anciens Turbellariés): ex. planaire
1.2.2.2. Les Trématodes: ex. grande douve Fasciola hepatica: organisation et cycle vital
1.2.2.3. Les Cestodes: ex. Taenia saginata: organisation et cycle vital
1.1.3. Importance de l'hermaphrodisme et de la reproduction asexuée en relation avec le
parasitisme
1.2. Les Spiralia: 2 groupes principaux : les Annélides et les Mollusques
1.2.1. Synapomorphies: segmentation spirale, larve trochophore et/ou dérivée (véligère),
schizométamérie des Annélides, développement dorsoventral des Mollusques
1.2.2. Les Annélides: ex. Nereis sp.
1.2.2.1. Synapomorphies: locomotion, nutrition-digestion, circulation close,
métanéphridies, système nerveux ganglioneure ou cordoneure, appareil
reproducteur adapté au mode de vie, conquête du milieu terrestre chez deux
grandes subdivisions: les Oligochètes et les Achètes.
1.2.2.2. Phylogénie succincte: paraphylie des Oligochètes et des Achètes
1.2.2.3. Importances écologique et économique (sangsue, ver de terre)
1.2.3. Les Mollusques
1.2.3.1. Synapomorphies: tête et bulbe buccal, pied, manteau et cavité palléale, coquille,
masse viscérale
1.2.3.2. Diversité des Mollusques: Les grandes subdivisions phylogénétiques (à mettre
l’accent surtout sur les Bivalves, Céphalopodes et Gastéropodes)
1.2.3.3. Importances écologique et économique (huître perlière, conchyliculture,
médecine…)

Chapitre 6. Les Ecdysozoaires

1. Synapomorphies principales
2. Phylogénie: clades principaux et détail des clades suivants :
30
 2.1. Les Némathelminthes: ex. Ascaris lumbricoides
2.1.1. Synapomorphies et cycle vital
2.1.3. Importance écologique: Parasitisme, aération des sédiments aquatiques, faune du sol
2.2. Les Euarthropodes
2.2.1. Synapomorphies
2.2.1.1. Appendice arthropodien: Archétype et adaptations (crevette)
2.2.1.2. Structure de la cuticule et la mue
2.2.2. Développement post-embryonnaire des Hexapodes: Amétabole, Paurométabole,
Hémimétabole, Holométabole (types de larves et nymphes)
2.2.3. Diversité des Euarthropodes : Phylogénie des grands taxons
2.2.3.1. Les Chélicératomorphes: Arachnides et paraphylie des Mérostomes
2.2.3.2. Les Antennates-Mandibulates : Myriapodes (polyphylie avec les Hexapodes),
relations phylogénétiques entre Crustacés et Hexapodes
2.2.3.3. Phylogénie des Hexapodes (relation cycle vital avec l’évolution des pièces
buccales et des ailes)
2.2.4. Importances écologique et économique

Conclusion générale: ouvertures du cours

Ce cours donne un argument très puissant en faveur de l'évolution biologique qui sera étudiée
ultérieurement
Programme des TD/TP
 Un travail personnel sous forme d'exposés oraux sur les adaptations au parasitisme chez les
différents groupes étudiés.
Des séances de Travaux pratiques subdivisées en:
 Séance 1 : Les Eponges et les Cnidaires: dessins d'éponges calcaires (Ascon ou Sycon) et
observation de Desmosponges, dessin de l’hydre Chlorohydra viridissima et d’Obelia geniculata.
Phylogénie des Cnidaires
 Séance 2: Les Plathelminthes: dessin de la petite douve in toto Dicrocoelium dendriticum et
observation des stades larvaires.Dessinde Taenia saginata ou T. solium: scolex et proglottis
immature, mature et cucurbitain
 Séance 3 : Les Némathelminthes: - Exemple : Ascaris : observation et dessin d’une Coupe
transversale)
 Séance 4 : Les Annélides et les Mollusques: Morphologie des Polychètes (Nereis sp): observation
de la région antérieure et parapode (schémas à légender): Morphologie des Gastéropodes ou
Céphalopodes (au choix) : dissection et dessin. Observation des exemples de Bivalves et de
Gastéropodes
 Séance 5 : Les Euarthropodes: Observation et comparaison entre les grands groupes : Arachnides
(scorpion, araignée), Myriapode (mille-pattes ou scolopendre), Crustacés (crevette) et Insectes
(criquet) sous forme d’un tableau.
 Séance 6 : Les Insectes : Métamorphoses et adaptations aux régimes alimentaires: Les
métamorphoses chez les Insectes. Les pièces buccales des Insectes, dissection du criquet,
comparaison des régimes alimentaires et adaptations

31
 ECUEF 232 : Biologie Végétale : Reproduction des Angiospermes
Objectifs
Cet ECUE montre à l’étudiant l’importance de la reproduction sexuée et de la multiplication
végétative chez les Angiospermes. Il décrit tout d’abord, la morphologie de la fleur et les
inflorescences en analysant les diagrammes et les formules floraux. Ensuite, l’organogenèse des
appareils reproducteurs et la double fécondation sont décrites. Une étude détaillée du fruit
(formation et type) et des graines (formation, types, germination) est aussi incluse dans cet ECUE.
Finalement, la multiplication végétative est abordée.

Programme du cours
Introduction
Importance de la Reproduction Sexuée et de la multiplication végétative chez les Angiospermes
Quelques exemples d’Angiospermes

Chapitre 1. La fleur et les organes reproducteurs

1. Formation de la fleur
2. Morphologie de la fleur
3. Différents types d’inflorescences
4. Disposition et nombre des pièces florales
5. Diagramme floral et formule florale

Chapitre 2.La reproduction sexuée

1. Organogenèse et gamétogenèse mâle et femelle
2. Pollinisation
3. Double fécondation
4. Graine (embryogénèse, types, dissémination, germination)
5. Fruit (formation, types, dissémination)

Chapitre 3.La multiplication végétative

1. Multiplication végétative naturelle
2. Multiplication végétative artificielle

Programme des TD/TP

TP/TD 1 :Étude de la fleur d’Angiosperme (pièces florales et disposition, formule florale et
diagramme floral)et des inflorescences
TP/TD 2 :Étude des organes mâles et femelle de la fleur (coupe de l'ovaire et coupe de l'anthère) et
des différents types d’inflorescences simples et composées)
TP/TD 3 :Étude des différents types de fruits [simple (sec, charnu), multiple, complexe et composé]
TP/TD 4 :Étude des différents types de graines et de germination
TP/TD 5 :Étude des différents types de multiplication végétative

32
 UEF 240 : Géologie dynamique

ECUEF 241 : Géodynamique externe

Objectifs
Présentation de phénomènes exprimant une dynamique de la partie superficielle de l'écorce
terrestre, pouvant avoir des effets destructifs (érosion) ou constructifs (dépôt, conservation).

Programme du cours
1- L'altération: mécanique et chimique
 Processus et produits (Diagramme de Goldshmidt)
 Théories de bio-rhexistasie

2- Les agents de transport en masse

 Entrainement par chute et par glissement
 Influence du climat sur le terrain en masse
 Les différentes modalités du déplacement en masse (reptation des sols, avalanches, glissement de
terrain, coulées de débris)

3- Les actions éoliennes

 Lieux et limites des actions éoliennes
 Actions éoliennes destructives
 Structures construites par le vent
 Dépôts et édifices éoliens: les dunes et les loess

4- L'action des eaux courantes

 Les eaux de ruissellement (écoulements, érosion-transport-sédimentation, étude de cas: courbe
de Hjulstrom)
 Les cours d'eau: caractères, parcours

5- Les glaciers et morphologie glaciaire

 Lieux, modes de genèse, morphologie
 Modalités d'action des glaciers : érosion, transport et sédimentation

6- Les mouvements de la mer et édifices construits

 Notions de base sur les mouvements de la houle et des vagues (habituels, exceptionnels)
 Notions sur les courants marins

7- Notions de dynamique littorale

 Dérive littorale
 Edifices littoraux : dunes, cordons etc.

Programme des TP
 Lecture des cartes topographiques et reconnaissance des formes élémentaires des reliefs et de
leurs agencements et établissement des profils topographiques.
 Examen de l'évolution du littoral au cours du temps.
 Exploitation du diagramme de Hjulstrom

33
 ECUEF 242 : Milieux de Sédimentation
Objectifs
 Etudier les mécanismes de sédimentation (physiques, chimiques, biochimiques)
 Reconnaitre les milieux de sédimentation (continentaux, de transition mer-continent, marins)

Programme du cours
Chapitre 1. Rappels
1. Cycle des roches
2. Etapes de formation des roches sédimentaires
3. Classification des roches sédimentaires

Chapitre 2. Les milieux continentaux

1. Les fleuves
2. Les lacs
3. Les sebkhas et les chotts

Chapitre 3. La marge littorale

1. Les deltas et estuaires
2. Les lagunes et lagons

Chapitre 4. La plateforme continentale

Chapitre 5. Les talus

Chapitre 6. Les bassins

Programme des TD/TP

Détermination des milieux de dépôt en se basant sur l'examen des microfaciès.

ECUEF 243 : Géomorphologie et Climats-Paléoclimats

Objectifs
L’objectif de ce cours est d’étudier l'érosion mécanique, les processus et la géomorphologie dans les
milieux glaciaires et périglaciaires ainsi que l'érosion chimique, les processus et la géomorphologie
dans les milieux tropicaux et arides. L’incidence du réchauffement climatique sur ces milieux est en
particulier présentée.
Programme du cours
Chapitre 1. Diversité des paysages

Chapitre 2. Evolution des paysages

1. Facteurs structuraux (relief, pente)
2. Facteurs lithologiques (perméable ou non perméable)
3. Facteurs climatiques (température, pluviométrie)

Chapitre 3. Milieu glaciaire

1. Différents systèmes existants: les calottes antartiques et du Groeland, les glaciers de montagnes
2. Bilan de masse, mécanisme d'écoulement, dynamique, vitesse,
3. Dynamique des glaciers de montagne, leur réseau et rôle
4. Sensibilité des différents systèmes au réchauffement climatique

34
Chapitre 3. Milieu périglaciaire
1. Zone périglaciaire
2. Le pergélisol
3. Les conséquences de la fonte du pergélisol en lien avec le réchauffement climatique

Chapitre 4. Les agents de transport Milieu intertropical

1. Les processus dominants liés à la pluie, au ruissellement, à la présence d'un fort manteau
d'altération
2. Spécificité des rivières
3. Impact de l'urbanisation et du déboisement
4. Les surfaces d'érosion, le modelé et les mécanismes de formations des morphologies spécifiques
en milieu intertropical.

Chapitre 5. Milieu aride

1. Les causes de l'aridité et les caractéristiques des différents milieux
2. Les zones de transport par l'eau et le vent
3. Les zones de dépôts (les zones dunaires, etc.)

Chapitre 6. Climats et paléoclimats

1. Climats actuels à l'échelle du globe
2. Paléoclimats
 Principaux changements climatiques à travers les temps géologiques et critères de reconstitution
(faune, flore, sédiments)

Programme des TD/TP

La cartographie en géomorphologie (étude de cas), l'utilisation d'un Modèle Numérique de Terrain
pour l’étude de la géographie physique.
TD: Lecture, commentaires et interprétation de cartes climatiques et paléoclimatiques

35
Maquettes et Syllabus de la
ème
2 année

36
 Maquette du 3ème Semestre de la 2ème année de Licence (S3-L2) du parcours
Biologie-Géologie (BG)) ‫بيولوجيا وجيولوجيا‬
Volume des heures de Nombre de Modalité
Unité d'enseignement (UE) / code Elément constitutif d'UE Coefficient
code UE formation présentielles Crédits d’évaluation
Compétences ECUE (ECUE)
Cours TD TP Autre ECUE UE ECUE UE CC RM
Pétrologie endogène
UEF311 Pétrologie endogène 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
UEF310 et sédimentaire 6 3
UEF312 Pétrologie sédimentaire 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
Physiologie de la germination,
UEF321 de la nutrition, des échanges 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
UEF320 hydriques et de la floraison 6 3
Comp : Les grandes fonctions Les grandes fonctions
UEF322 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
animales et végétales animales et homéostasie 1
Biochimie et Biologie Biochimie métabolique
UEF331 2h00 1h00 1h00 4 2 X
moléculaire et enzymologie
UEF330 7 3,5
Comp : Propriétés des
UEF332 Biologie moléculaire 1h30 1h00 0h30 3 1,5 X
biomolécules et métabolisme
Option obligatoire (Diversité
Comp : UEO311 végétale : des algues aux 1h30 0h30 1h00 3 1,5
UEO310 ptéridophytes) 6 3
Physiologie animale et
UEO312 Option de géologie 1h30 0h30 1h00 3 1,5
végétale 1
Unité transversale UET311 Anglais (3) 1h30 2 1 X
UET310 Culture et Compétences 5 2,5
UET312 3 2h00 3 1,5 X
Numériques-2CN (D3)
Total 28h30 30 30 15 15
Les couleurs des cases du tableau sont comme suit :
Les ECUEs transversaux en bleu ciel, ceux de Biologie en jaune, ceux de Géologie en violet, les options en rose

3
Domaine de compétence D3 Création de contenu : Développer des documents multimédia, Développer des documents textuels, Programmer et Diffuser
37
 Syllabus des Eléments constitutifs (ECUEs) des Unités
d’enseignement fondamental (UEF), de l’Unité d’Enseignement
Optionnel (UEO) et de l’Unité d’Activités Pratiques (UAP) de S3-L2

UEF 310 : Pétrologie endogène et sédimentaire

Objectifs
 Apprendre à reconstituer les origines et les modes de genèse des roches et établir leurs
classifications
 Appréhender le lien existant entre les principaux facteurs contrôlant la genèse des roches, les
caractéristiques structurales et texturales et la nature des éléments constitutifs.
 Montrer le lien entre la genèse des roches et le contexte géodynamique, surtout la tectonique des
plaques et dynamique externe du globe terrestre (pour les roches sédimentaires).
 Identifier les différentes modifications diagénétiques en établissant une chronologie relative par
rapport à la sédimentation
 Montrer l’intérêt et l’utilisation des roches sur le plan économique

ECUEF 311 : Pétrologie endogène

Programme du cours
Chapitre 1. Généralités
1. Définitions
2. Relation pétrologie endogène et tectonique des plaques
3. Situation thermique de la lithosphère

Chapitre 2. La pétrologie du manteau

1. Minéralogie et pétrographie du manteau supérieur
2. Fusion partielle : genèse et extraction des liquides basaltiques

Chapitre 3. Genèse de la croûte océanique (CO)

1. Lithologie de la CO
2. Genèse de la CO à la ride
3. Les modèles ophiolitiques
4. Hydrothermalisme et métamorphisme

Chapitre 4. Les séries magmatiques

1. Principales catégories des basaltes
2. Le magmatisme de la plaque océanique
3. Le magmatisme de la plaque continentale
4. Les andésites

Chapitre 5. Le magmatisme des marges actives

1. Diversité du magmatisme d’arc
2. Origine et évolution du magmatisme d’arc
3. Les deux modèles pétrogénétiques

Chapitre 6. Genèse et évolution de la croûte continentale (CC)

1. La croissance crustale
2. Lithologie de la CC

38
3. Les roches métamorphiques

Chapitre 7. Les granites dans la CC

1. Classification et modes de gisements
2. Métamorphisme et anatexie
3. Origine et contexte géodynamique des granites.

Programme des TD/TP

Travaux dirigés
Influence de la composition chimique des roches sur leurs paragenèses et Représentation graphique
des paragenèses métamorphiques.

Travaux pratiques
 Microtextures des roches métamorphiques ; relations cristallisation - déformation ; principales
lithologies et paragenèses.
 Microtextures des roches magmatiques
 Le métamorphisme de Moyennes Pressions - Hautes Températures : élaboration du gradient
métamorphique grâce à l'étude de lames minces.
 Elaboration de la trajectoire P T t d'un gabbro de la croûte océanique impliqué dans une collision
intra continentale

ECUEF 312 : Pétrologie sédimentaire

L'objet de ce cours est d'identifier les différents types de roches sédimentaires, de comprendre leur
genèse et leur contexte paléogéographique.

Programme du cours

Chapitre 1. Modes de genèse (cycle d’évolution) et classifications des roches sédimentaires

Chapitre 2. Les roches d’origine chimique et biochimique

1. Les Roches carbonatées
 Composition des roches carbonatées
 Ciments et matrice
 Textures des roches carbonatées
 Classification des roches carbonatées : de Folk, de Dunham et autres
 Diagenèse des roches carbonatées
2. Les Roches phosphatées
 Composition minéralogique et organique
 Classification des roches phosphatées
3. Les Roches siliceuses
 Principaux composants des sédiments siliceux biogéniques
 Classification des roches siliceuses: biogéniques et chimiques
4. Les Roches évaporitiques
 Les principaux minéraux évaporitiques (sulfates, chlorures etc.)
 Exemples de séquences évaporitiques
 Intérêts économiques des évaporites actuelles et fossiles
5. Les Roches carbonées (combustibles)
 Les principaux composants
 Intérêts économiques des roches carbonées

39
Chapitre 3. Les roches détritiques terrigènes
 Classifications : Rudites, arénites et lutites
 Composition des roches détritiques terrigènes
 Propriétés texturales des roches détritiques : Taille, morphologie des grains (sphéricité, rondeur),
arrangement des grains, porosité – perméabilité
 Diagenèse des roches détritiques terrigènes
 Intérêts économiques des roches détritiques

Chapitre 4. Les roches résiduelles (bauxites etc.)

Programme des TD/TP

Travaux dirigés
Détermination des noms des roches en se basant sur des diagrammes ternaires (composition
chimique ou /et minéralogique) et sur les chartes de classification des roches (Dunham, Folk, etc….)

Travaux pratiques
Examen microscopique des différentes roches sédimentaires

40
 UEF 320 : Physiologie animale et végétale 1

ECUEF 321 : Physiologie végétale : Germination, nutrition, floraison et

échanges hydriques
Objectifs
Programme du cours
Introduction.Physiologie végétale et applications en Biotechnologie
Chapitre 1. Physiologie de la germination – dormance des semences
1. Introduction
2. Dormance des graines
2.1. Dormance primaire
2.1.1. Dormance tégumentaire
2.1.2. Dormance embryonnaire
2.2. Dormance secondaire
3. Germination des graines
3.1. Les conditions de germination
3.1.1. Les facteurs internes
3.1.2. Les facteurs externes
3.2. Les phases de la germination
3.2.1. Phase d'imbibition
3.2.2. Phase de germination
3.2.3. Phase de croissance
3.3. Mobilisation des réserves
3.3.1. Mobilisation des lipides chez les graines oléagineuses
3.3.2. Mobilisation des glucides chez les céréales
3.4. Effets des hormones

Chapitre 2. Les relations hydriques chez les plantes

Introduction
1. Importance et Rôle de l’eau dans la matière végétale
1.1. La teneur en eau des végétaux.
1.2. Les différents états de l’eau dans la matière végétale
2. Pénétration de l’eau dans la plante (Absorption)
2.1. L’eau du sol
2.2. L’absorption de l’eau par les racines
2.2.1. Les facteurs contrôlant l’absorption de l’eau par les racines
2.2.2. Méthodes de mesure de l’absorption de l’eau par les racines
2.2.3. Mécanismes de l’absorption
3. Transit de l’eau dans la plante
3.1. Dans les racines
3.2. Dans la tige et la sève brute
4. Transpiration
4.1. Mécanisme
4.2. Facteurs influençant la transpiration
5. Adaptation des plantes au déficit hydrique

Chapitre 3. Nutrition minérale des plantes

Introduction
1. Détermination des besoins nutritifs
1.1. Les éléments minéraux et la fertilité du sol
41
 1.2. L’origine des minéraux
2. Modalités et mécanismes d’absorption
3. Rôle des éléments minéraux nécessaires
3.1. Rôle physique
3.2. Rôle physiologique
3.3. Quelques particularités
4. Notions de carence et toxicité

Chapitre 4. Physiologie de la floraison

1. Introduction
2. Les étapes de la floraison
2.1. Le virage floral
2.1.1. L'induction florale
2.1.2. L'évocation florale
2.2. La morphogenèse florale
2.2.1. Initiation florale
2.2.2. Floraison
3. La physiologie de l'induction florale
3.1. Vernalisation
3.2. Exigences spécifiques
3.3. Facteurs nutritionnels
3.4. Thermopériodisme
3.5. Facteurs trophiques
3.6. Photopériodisme

Programme des TD/TP

TP/TD 1: Germination et dormance des graines
1- Test de viabilité des semences
2- Mobilisation des réserves
3- Germination des semences
4- Dormance des graines
TP/TD 2: Etude de la transpiration
1- Transpiration stomatique
2- Transpiration cuticulaire
3-Mécanisme de la transpiration
4- Vitesse de la transpiration
5- Manipulation
TP/TD 3: Pression osmotique, succion et pression membranaire de la carotte
1- Principe
2- Manipulation
3- Mesure des indices de réfraction
TP/TD 4: Dosage du phosphore dans la matière végétale
1- Principe de la photocolorimétrie
2- Manipulation
3- Dosage du phosphore dans le minéralisât

Travaux dirigés
TD : Notions carence/ toxicité des minéraux chez les végétaux
1. Etude de carence des éléments minéraux sur la croissance des plantes
2. Etude de toxicité des éléments minéraux sur la croissance des plantes.

42
 ECUEF 322 : Physiologie animale : Les grandes fonctions et homéostasie 1
Objectifs
L'objectif principal est de maîtriser les grands principes de physiologie générale qui permettra aux
étudiants d’aborder par la suite les autres modules de physiologie animale et/ou humaine et
régulations physiologiques. Les enseignements pratiques réalisés sur du matériel dédié à
l’expérimentation animale, par une approche intégrée allant de l'activité cellulaire à la réponse de
l'organisme. Les enseignements de cette unité vise à
 Expliquer les grands principes de l’homéostasie et de régulation du milieu intérieur.
 Expliquer les échanges membranaires et les échanges entre les différents compartiments de
l’organisme animal.
 Expliquer l’organisation structurale et fonctionnelle de la fibre nerveuse et du système nerveux
central et périphérique et les modes et mécanismes de la communication nerveuse.
 Définir les composants du système endocrinien, étudier les différentes classes d’hormones et leurs
mécanismes d’action
 Connaître l’organisation du système musculaire,les mécanismes et bases cellulaires et moléculaires
de la contraction musculaire et l’énergétique de la contraction.

Programme du cours
Chapitre 1. Milieux intérieurs et Homéostasie
1. Les compartiments liquidiens
1.1. Définition et caractéristiques du milieu intérieur
1.2. Classification des compartiments liquidiens de l’organisme
1.3. Volume des composants liquidiens de l’organisme
2. Propriétés physico-chimiques des compartiments liquidiens
2.1. Compartiment plasmatique
2.2. Compartiment interstitiel
2.3. Compartiment lymphatique : organeslymphoïdes et circulation lymphatique
2.4. Compartiment intracellulaire
3. Les échanges liquidiens entre les compartiments
3.1. Les gradients osmotiques et ioniques
3.2. Les mécanismes homéostatiques

Chapitre 2. Le sang et système vasculaire

1. Hématologie
1.1. Etude des éléments figurés du sang ; composition organique et ionique du sang;
hématopoïèse, érythropoïèse et facteurs régulateurs
1.2. Fonctions du sang : Structure et fonction de l’hémoglobine, transport des gaz dans le
sang et équilibre acido-basique
2. Structure et caractéristiques des vaisseaux du système vasculaire
2.1. Structure de la paroi des artères, des veines et des capillaires de la micro-circulation
2.2. Notions de débit sanguin, résistance et pression sanguine: Définitions ; Influences de la
viscosité du sang, longueur et diamètre des vaisseaux

Chapitre 3.Hormones et Système endocrinien

1. Structure et biosynthèse des hormones
2. Mécanisme d’action des hormones : Activation des récepteurs membranaires, activation des
récepteurs intracellulaires - action via les seconds messages – action via les facteurs de transcription
et activation génique
3. L’axe hypothalamo-hypophysaire – Les cellules neurosécrétrices – Les glandes endocrines
périphériques
43
Chapitre 4.Physiologie Nerveuse
1. Anatomie du système nerveux : organisation structurale et fonctionnelle du système nerveux
central et périphérique
2. Physiologie du neurone : Classification, Excitabilité et fonctions
3. Physiologie du nerf : Classification, Excitabilité, Mode et vitesse de la conduction de l’influx
nerveux
4. Système nerveux végétatif : système nerveux somatique, entérique et autonome, structure des
voies efférentes, les ganglions du système nerveux autonome, pharmacologie des neurones pré-
et post- ganglionnaire.
5. Les potentiels membranaires: potentiel de repos, potentiels électrotoniques et potentiel d’action.
6. Les synapses : les synapses électriques, les synapses chimiques, les synapses gazeuses (NO).
7. La neurotransmission : les messagers chimiques, rôles et mécanismes d’action
8. Intégration des signaux électriques et circuits neuronaux

Chapitre 5.Structure et physiologie de la fibre musculaire

1. Les cellules musculaires : organisation structurale, caractères communs et classification (muscle
lisse, muscle strié et myocardique)
2. Le muscle squelettique:
2.1. La fibre musculaire striée (fibre glycolytique, fibres oxydative), le tissu conjonctif du muscle
squelettique et cellules satellites
2.2. Les protéines contractiles du muscle
2.3. Métabolisme énergétique du muscle squelettique
2.4. Mécanique de la contraction de la fibre musculaire
2.5. La jonction neuro-musculaire ou la plaque motrice : Notion d’unité motrice, Couplage
activités électrique et mécanique du muscle
2.6. Régulation de la contraction musculaire : activation des ponts transversaux, sources du
calcium et rôles de l’ATP. Rôle hormonal et des facteurs locaux.
3. Contrôle et reflexes médullaires
3.1. Innervation du muscle squelettique : Motoneurones α, ɤ et β
3.2. Reflexes extéroceptifs, proprioceptifs, intéroceptifs

Programme des TD/TP

Objectifs
Etudier les fonctions animales non pathologiques en se basant sur des Techniques
variées :Contention, Dissection, Micro-manipulation permettant de se familiariser à l'utilisation des
matériels de laboratoire diversifié, et l’introduction de l’ExAO (Système Expérimentation Assisté par
Ordinateur)
Les TP sont continués par des analyses et discussion des résultats expérimentaux.
 Séance TP/TD1 : Frottis sanguin, mesure du volume sanguin et détermination de l’hématocrite chez
le rat
 Séance TP/TD2 : Immuno-phénotypage du groupe sanguin (système ABO et Rhésus) et étude de la
perméabilité cellulaire.
 Séance TP/TD3: Etude anatomique et histologique des principales glandes endocrines chez le rat.
 Séance TP/TD4: Etude d'une préparation nerf-muscle chez le rongeur : Contrôle nerveux de la
motricité musculaire et étude de la transmission synaptique
 Séance TP/TD5 : Etude de l’action reflexe et intégrative de la moelle épinière (étude des reflexes
médullaires)

44
 UEF 330 : Biochimie métabolique-Enzymologie et Biologie
moléculaire

ECUEF 331 : Biochimie métabolique et enzymologie

Objectifs
Programme du cours

Partie 1 : Métabolisme
Introduction
Chapitre 1. Notion de bioénergétique
1. Rappel sur la thermodynamique
2. Notions : enthalpie, entropie, énergie libre, constante d’équilibre d’une réaction, couplage
énergétique et molécules riches en énergie
3. Réactions d’oxydoréduction : potentiel redox, systèmes redox biologiques (ΔE, ΔG, chaine
respiratoire…)

Chapitre 2. Métabolisme des glucides

1. Glycolyse
2. Cycle de Krebs
3. Néoglucogenèse
4. Voie des pentoses phosphates
5. Dégradation et synthèse du glycogène

Chapitre 3. Métabolisme des lipides

1. Catabolisme des acides gras (β-oxydation)
2. Biosynthèse des acides gras
3. Cétogenèse

Chapitre 4. Métabolisme des acides aminés

1. Vue générale du métabolisme des acides aminés
2. Transamination et Désamination
3. Exemple de métabolisme de quelques acides aminés
4. Cycle de l’urée

Partie 2 : Enzymologie
Introduction
Chapitre 1.Les propriétés générales des enzymes
1. Structure des enzymes, notion de cofacteurs
2. Spécificité de la catalyse enzymatique
3. Nomenclature et classification des enzymes

Chapitre 2. Cinétique Michaelienne à un seul substrat

1. Rappel de cinétique chimique
2. Unités d’activité enzymatique, Activité spécifique, Turn Over…..
3. Vitesse initiale de la réaction enzymatique
4. Variation de Vi en fonction de [S] et [E]
5. Equation de Michaelis et Menten et constantes cinétiques (Km, V max)
6. Différentes représentations graphiques

45
Chapitre 3. Les effecteurs de la réaction enzymatique
1. Les différents types d’effecteurs (température, pH, …)
2. Inhibition de l’activité enzymatique

Chapitre 4. Enzymologie Appliquée

1. Les enzymes industrielles
2. Méthodes d’immobilisation des enzymes

Chapitre 5. Enzymes issues de la biotechnologie

Programme des TD/TP

1: Dosage du glucose, des triglycérides
2. Dosage du cholestérol et des transaminases
3. Extraction de l’invertase de la levure de boulangerie
4. Mesure de l’activité en fonction du temps
5. Effet de la concentration du substrat en fonction du temps
6. Détermination des paramètres cinétiques - Inhibition de l’invertase

ECUEF 332 : Biologie moléculaire

Objectifs
Etude de la structure, des propriétés et des modes d’expression et de synthèse des acides nucléiques

Programme du cours
Chapitre 1. Structure des Acides Nucléiques
1. Définitions, Nucléosides, Nucléotides, Nomenclature (NMP, NDP, NTP)
2. Les bases azotées :bases Puriques (Pu : A, G), bases Pyrimidiques (Py : U, T, C)
3. Tautomérie des bases (Forme lactame, Forme Lactime)
4. Le sucre (Aldopentose)
5. Le groupement Phosphoryle
6. Liaison Base-Ose=Nucléoside
7. Liaison Base-Ose-Groupement Phosphoryle=Nucléotide
8. Associations des Nucléotides=Polynucléotide=Acide Nucléique

Chapitre 2. Les Acides Désoxyribonucléiques (ADN)

1. Structure de l’ADN (Double Hélice, Double brin, Bi-caténaire, Séquence de l’ADN
2. Propriétés de l’ADN (Solubilité, Absorption UV, Dénaturation thermique, Effet Hyperchrome)
3. Différents types d’ADN (ADN bactérien, ADN viral, ADN des Eucaryotes)

Chapitre 3. Les Acides Ribonucléiques (ARN)

1. Structure de l’ARN
2. Propriétés de l’ARN (Solubilité, Absorption UV, hydrolyse)
3. Différents types d’ARN

Chapitre 4. Biosynthèse de l’ADN=Réplication

1. Introduction, les différentes formes topologiques natives du DNA
2. Propriétés de la réplication : Semi-conservatisme, semi-conservative, semi-discontinue, fourche
de réplication
3. Les ADN-Polymérases, Equation de polymérisation
4. Réplication chez les Procaryotes (les ADN-Pol bactériennes, les Déroulases=Hélicases, les
Gyrases : topoisomérases, les protéines SSB, la Primase, l’ADN-ligase
46
 5. Particularités de la Réplication chez les Eucaryotes (les différentes ADN-Pol, les Protéines
accessoires de la réplication

Chapitre 5. Biosynthèse de l’ARN=Transcription

1. Généralités, les ARN-Polymérases, Notion de Promoteur
2. Transcription chez les Procaryotes (l’ARN-Polymérase bactérienne, Initiation, Elongation,
Terminaison)
3. Transcription chez les Eucaryotes (Transcription et maturation des gènes codant pour les ARN
ribosomaux=ARNr, Transcription des ARN messagers=ARNm, l’ARN-Polymérase III, les ARN de
transfert, ARNt)

Chapitre 6. Biosynthèse des protéines=Traduction

1. Le code génétique (propriétés et déchiffrage)
2. Les RNAt et l’Aminoacylation
3. Les Ribosomes
4. Mécanisme de la traduction (Initiation, Elongation, Terminaison).

Programme des TD/TP

TP
* Extraction de l'ADN chromosomique et de l'ADN plasmidique, quantification par DO et sur gel,
contrôle de la qualité (pureté)...
* Réaction de Transcription in vitro, quantification et contrôle de l'intégrité de l'ARN...
TD :
Séries d'exercices basés sur des expériences se rapportant sur la réplication, la transcription et la
traduction.

UEO 310 : Options de Biologie / Géologie

ECUEO 311 : Option obligatoire- Diversité végétale:

Des Algues aux Ptéridophytes

Objectifs
Cet ECUE fait découvrir aux étudiants le monde des végétaux inférieurs qui sont constitués d’un
vaste ensemble hétérogène des thallophytes et des cormophytes. Dans une première étape, on
donne un aperçu sur la classification et la phylogénie des végétaux. Ensuite, on discerne aux
étudiants une connaissance détaillée sur les différents groupes végétaux en commençant par les
Algues (procaryotes et eucaryotes). En outre, cet ECUE se penche sur la description des mycophytes.
Enfin, on décrit, de point de vue morphologique et anatomique, les plantes terrestres non vasculaires
(les bryophytes) et vasculaires (les ptéridophytes).

Programme du cours
Introduction: Classification & Phylogénie des végétaux
1. Classification morphologique
2. Classification phylogénétique
3. Phylogénie des Végétaux
3.1. Classification Phylogénétique de la Lignée Verte: Glaucophytes & Métaphytes (Chlorobiontes
et Rhodobiontes)
3.1.1. Glaucophytes
3.1.2. Chlorobiontes
47
 3.1.2.1. Ulvophyte/Charophytes (Algues vertes)
3.1.2.2. Embryophytes ou archégoniates (Bryophytes, Ptéridophyte et Spermaphytes)
3.1.3. Rhodobionthes : Algues rouges
3.2. Classification phylogénétique de la Lignée brune : (Ochrophytes, Haptophytes, Dinophytes)

Chapitre 1: Algues Procaryotes = Cyanophytes (super-règne des Eubactéries)

1. Caractères généraux
2. Caractères cytologiques
3. Caractère morphologique
4. Classification
5. Reproduction

Chapitre 2: Algues eucaryotes

1. Algues de la lignée verte
1.1. Glaucophytes
1.2. Phycophycophytes (Métaphytes, Chlorobiontes)
1.2.1. Caractères généraux
1.2.2. Etude de Spirogyra et d’Ulva
1.3. Rhodophycophytes (Métaphytes, Rhodobiontes)
1.3.1. Caractères généraux
1.3.2. Etude de Polysiphonia
2. Algues de la lignée brune
2.1. Caractères généraux
2.2. Etude de Fucus vesiculosus

Chapitre 3: Mycophytes (règne des Eumycètes)

1. Caractères généraux et morphologiques
2. Classification
3. Reproduction
4. Étude d’une siphomycète (Mucor mucedo = Rhizopusnigrican)
5. Étude de septomycètes
5.1. Étude d’un ascomycète Peziza vesiculosa
5.2. Etude d’un basidiomycète Psalliota hortensis
6. Etude des Lichens

Chapitre 4: Embryophytes ou Archégoniates

Sous-chapitre 4.1. Bryophytes (Embryophyte non vasculaires)
1. Caractères généraux
2. Classification
3. Etude d’une mousse (Embryophyte, stomatophyte) : Polytrichum formosum
4. Etude d’une hépathique (Embryophyte, Marchantiophyte) : Marchantia polymorpha

Sous-Chapitre 4.2. Ptéridophytes (Embryophytes vasculiares)

1. Caractères généraux
2. Classification

48
3. Etude d’une filicophyte (Embryophyte, trachéophyte, euphyllophyte) : Polypodium vulgare
4. Etude d’une lycophyte (Embryophyte, trachéophyte) : Selaginella

Programme des TD/TP

TP/TD 1 : Etude des Algues : Thalles – Reproduction – Cycle de développement
Etude d’une cyanophyte (Nostoc)
Etude d’algues eucaryotes unicellulaires (diatomées, dinophycées)
Etude de Polysiphonia ,Fucus vesiculosus, Spirogyra
TP/TD 2 : Etude des Mycophytes
Etude de Rhizopus nigricans
Etude de Peziza vesiculosa
Etude de Coprinus
Etude des exemples des Lichens
TP/TD 3 : Etude des Bryophytes
Etude de Polytrichum formosum
Etude de Marchantia polymorpha
TP/TD 4 : Etude des Ptéridophytes (I : Morphologie, reproduction, cycle)
Etude de Polypodium vulgare
Etude de Selaginella
TP/TD 5 : Etude des Ptéridophytes (II : Anatomie)
Etude des tissus conducteurs, trachéides
Etude des stèles

ECUEO 312 : Option1 de Géologie

Objectifs
Programme du cours

Programme des TD/TP

ECUEO 312 : Option2 de Géologie

Objectifs
Programme du cours

Programme des TD/TP

49
 Maquette du 4èmeSemestre de la 2ème année de Licence (S4-L2) du parcours
Biologie-Géologie (BG))‫بيولوجيا وجيولوجيا‬
Volume des heures de Nombre de Modalité
Unité d'enseignement (UE) / code Elément constitutif d'UE Coefficient
code UE formation présentielles Crédits d’évaluation
Compétences ECUE (ECUE)
Cours TD TP Autre ECUE UE ECUE UE CC RM
Géologie structurale
UEF411 Géologie structurale 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
UEF410 et Stratigraphie 6 3
Comp : UEF412 Stratigraphie 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
Physiologie de la dormance,
Physiologie Animale
UEF421 photosynthèse, respiration et 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
et Végétale (suite)
UEF420 du développement végétal 6 3
Comp : Les grandes fonctions Les grandes fonctions
UEF422 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
et leurs régulations (suite) animales et homéostasie 2
Diversité phylogénétique des
Biologie animale et végétale UEF431 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
UEF430 Deutérostomiens 6 3
Comp : Diversité du vivant UEF432 Diversité des Spermaphytes 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X

Unité optionnelle UEO411 Option de biologie 1h30 0h30 1h00 3 1,5

UEO410 6 3
Comp : UEO412 Option de géologie 1h30 0h30 1h00 3 1,5
Français & Techniques de
Unité transversale UET411 2h00 3 1,5 X
communication
UET410 6 3
Culture et Compétences
UET412 4 2h00 3 1,5 X
Numériques-2CN (D4)
Total 28h 30 30 15 15
Les couleurs des cases du tableau sont comme suit :
Les ECUEs transversauxen bleu ciel, ceux de Biologie en jaune, ceux de Géologie en violet, les options en rose

4
Domaine de compétence D4 Protection et sécurité : Sécuriser l'environnement numérique
50
 Syllabus des Eléments constitutifs (ECUEs) des Unités
d’enseignement fondamental (UEF), de l’Unité d’Enseignement
Optionnel (UEO) et de l’Unité d’Activités Pratiques (UAP) de S4-L2

UEF 410 : Géologie structurale et Stratigraphie

Objectifs
 Acquérir les principes et notions de base de la stratigraphie et se familiariser avec les méthodes
de datation des séries sédimentaires utilisant les fossiles et les autres moyens de la
chronostratigraphie relative et absolue
 connaître les structures géologiques à des échelles différentes en accordant une attention
particulière aux déformations des couches et identifier les objets tectoniques

ECUEF 411 : Géologie structurale

Programme du cours
Chapitre 1. Introduction
Introduction aux méthodes de la cartographie géologique, repérage géométrique (direction,
pendage), repérage chronologique et polarité des couches (séries à l’endroit ou à l’envers),
notions de discordance et de concordance, de lacune.

Chapitre 2. Différents types de structures

*Structures simples
*Structures complexes et terminologie relative (chevauchement, charriage, structures polyphasées,
notions de rampes etc.)

Chapitre 3. Notions de phases et de cycles orogéniques

Chapitre 4. Notions du niveau structural

Caractérisation et types de déformations (Domaine cassant, domaine de plissement, domaine de
linéation-foliation-shistosité)

Chapitre 5. Eléments et outils de cartographie géologique

carte topographique, photographies aériennes, images satellitaires

Programme des TD/TP

- Photo-interprétations
- Analyses, commentaires et schémas structuraux à partir de cartes géologiques
- Elaboration de coupes géologiques

51
 ECUEF 412 : Stratigraphie

Programme du cours
Chapitre 1. Notion de temps en géologie et ses subdivisions relatives
Notion d’échelle stratigraphique ; nomenclature

Chapitre 2. Les principes de la stratigraphie relative

Superposition, continuité, identité paléontologique, notion de faciès faunistiques et variation latérale
de faciès, etc.

Chapitre 3. Les différentes unités stratigraphiques

Chapitre 4. Les méthodes de la biostratigraphie et de l’histoire des temps géologiques

Evènements et crises biologiques

Chapitre 5. Les méthodes physico-chimiques de la stratigraphie

Notions de chimiostratigraphie, de radiochronologie, de magnétostratigraphie, etc.

Chapitre 6. Les principes de corrélations lithostratigraphiques et biostratigraphiques

Chapitre 7. Stratigraphie de la Tunisie

Programme des TD/TP
 Applications des méthodes physico-chimiques utilisées en Stratigraphie (chimiostratigraphie,
radiochronologie, magnétostratigraphie)
 Subdivisions et corrélations lithostratigraphiques

52
 UEF 420 : Physiologie animale et végétale 2

ECUEF 421 : Physiologie animale : les grandes fonctions et homéostasie 2

Objectifs
1. Approfondir les connaissances sur les deux fonctions étudiées en S3 en relation avec l’équilibre
homéostasique (Physiologie endocrine et Echanges membranaires)
2. Continuer l’étude des grands principes de physiologie générale par l’étude de la physiologie de la
reproduction. Les enseignements de cette unité visent donc à comprendre:
 La physiologie endocrine en continuité avec le chapitre Hormones et système endocrinien (S3) : le
fonctionnement normal et pathologique des niveaux de régulation notamment par le système
nerveux et endocrinien
 L’Excrétion et la régulation de l’équilibre hydrominéral en continuité avec le chapitre Le milieu
intérieur et homéostasie (S3) : physiologie de la fonction excrétoire et ses régulations.
 La physiologie de la fonction reproductrice et ses régulations
Les enseignements pratiques sont réalisés sur du matériel dédié à l’expérimentation animale, par
une approche intégrée allant de l'activité cellulaire à la réponse de l'organisme.

Programme du cours
Chapitre 1. Physiologie Endocrine : Rappel et approfondissements
1. Structure et biosynthèse des hormones
2. Transport des hormones dans le sang
3. Mécanismes d’action des hormones
4. Mécanismes de régulation de la sécrétion hormonale (régulation neuronale, par d’autres
hormones et par les [ions] ou [nutriments] plasmatiques
5. Mécanismes de la rétroaction hormonale (feedback positif ou négatif)
6. L’axe hypothalamo-hypophysaire, les cellules neurosécrétrices
7. Méthodes de dosage des hormones plasmatiques : RIA, ELISA.

Chapitre 2.Excrétion et régulation de l’équilibre hydrominéral

1. Organisation fonctionnelle des reins et de l’appareil urinaire
1.1. Disposition générale
1.2. Le néphron : glomérule, tubule et filtration glomérulaire
1.3. Mécanisme général de la formation de l’urine
2. Régulation de l’équilibre hydro électrique du sodium, de l’eau et du potassium
2.1. Régulation du taux de filtration glomérulaire et de réabsorption du sodium (rôle de
l’aldostérone, du système rénine-angiotensine, de NAF (hormone cardiaque))
2.2. Régulation rénale de la réabsorption de l’eau (rôle de l’ADH)
2.3. Excrétion et adaptation au stress hydrique
3. Régulation du métabolisme phosphocalcique : Équilibre phosphocalcique
3.1. Réabsorption rénale du calcium
3.2. Réabsorption rénale des phosphates
3.3. Contrôle hormonal de l’homéostasie calcique : rôle de la PTH, de la calcitonine

Chapitre 3. Physiologie de la Reproduction

1. Les appareils reproducteurs : organisation chez les mammifères
2. Mécanismes cellulaires et moléculaires de la gamétogenèse
3. La fonction reproductrice chez le mâle
3.1. Régulation hormonale de l’activité testiculaire : Cellules cibles et mode d’action des
hormones de l’axe gonadotrope et des hormones sexuelles mâles
3.2. Physiologie de la barrière sang-testicule

53
4. La fonction reproductrice chez la femelle
4.1. Régulation hormonale de la fonction ovarienne : Cellules cibles et mode d’action des
hormones de l’axe gonadotrope et des hormones sexuelles femelles ; facteurs moléculaires de
l’arrêt et de la reprise méiotique de l’ovocyte, Contrôle moléculaire des étapes de la
folliculogenèse.
4.2. Modifications physiologiques au cours du cycle sexuel chez la femelle
4.3. Mécanismes cellulaire et moléculaire de la fécondation
5. Chronologie de la fonction de reproduction chez les mammifères:
5.1. Contrôle génétique du déterminisme du sexe (Rôle des gènes SRY, SOX9, DAX, SF1, WT1,
AMH…)
5.2. Contrôle hormonal du déterminisme du sexe (Rôle des hormones protéiques, AMH, InsL3, et
stéroïdiennes)
5.3. La différenciation sexuelle chez les mammifères

Programme des TP/TD

Programme des Travaux Pratiques
Séance 1: Etude anatomique et histologique des principales glandes endocrines chez le rat.
Séance 2: Exploration de la fonction reproductrice chez le mâle : cytologie des spermatozoïdes,
analyse d’un spermogramme.
Séance 3: Exploration de la fonction reproductrice chez femelle : Etude du cycle sexuel chez la ratte
et frottis vaginal
Séance 4 : Mise en évidence de la HCG : test de grossesse.

Programme des Travaux Dirigés

Séance 1: Exemples d’étude de la régulation hormonale et des pathologies associées à leur
dérèglement, exemple le diabète de type II
Séance 2: Régulation de la natrémie et de la kaliémie : l’aldostérone.

ECUE 422 : Physiologie végétale 2: dormance, photosynthèse, respiration et

développement
Objectifs
Programme du cours
Chapitre 1. La dormance végétale
1. Introduction
2. La vie latente
2.1. Caractères de la vie latente
2.2. Entrée et sortie de la vie latente
3. Notion de dormance
4. Dormance des bourgeons
4.1. Entrée en dormance
4.2. Levée de la dormance

Chapitre 2. La photosynthèse (métabolisme carboné des végétaux)

1. Généralités
1.1. Définition
1.2. Formulation
1.3. Localisation : Le chloroplaste, siège de la photosynthèse
2. Mesure de l'activité photosynthétique
2.1. Mesure des échanges gazeux
2.2. Emploi d’isotopes

54
3. Intensité de la photosynthèse
4. Photosynthèse et facteur du milieu
5. Réactions métaboliques
5.1. Transport des électrons dans la phase claire
5.2. Les mécanismes de la phase sombre
5.2.1. Le cycle de Calvin
5.2.2. Synthèse des sucres
5.2.3. Bilan
6. Rendement de la photosynthèse
7. Photosynthèse et plante en C3
8. Photosynthèse et plante en C4 et CAM
8.1. Les plantes en C4
8.2. Les plantes en CAM

Chapitre 3. La respiration chez la plante (métabolisme énergétique des végétaux)

1. Généralités
Localisation
2. Formation d'ATP à partir des glucides
3. Déroulement de la Respiration cellulaire
3.1. Première étape : la glycolyse
3.2. Deuxième étape : le Cycle de Krebs
3.3. Troisième étape : la chaîne respiratoire
3.4. Transport des molécules d'ATP formées
4. Bilan de la respiration cellulaire

Chapitre 4. Les régulateurs de croissance : Les hormones végétales

1. Introduction
2. Les hormones végétales
2.1. Auxine
2.1.1. Biosynthèse et transport
2.1.2. Auxine et élongation cellulaire
2.1.3. Auxine et phototropisme
2.1.4. Auxine et dominance apicale
2.1.5. Auxine et développement des fruits
2.2. Acide abscissique
2.2.1. Biosynthèse et transport
2.2.2. Propriétés physiologiques de l'ABA
2.3. Ethylène
2.3.1. Biosynthèse et transport
2.3.2. Maturation des fruits
2.3.3. Sénescence des organes
2.3.4. Abscission des feuilles
2.3.5. Mouvements d'épinastie
2.3.6. Floraison
2.4. Cytokinine
2.4.1. Biosynthèse et transport
2.4.2. Effets physiologiques
2.4.3. Croissance cellulaire
2.4.4. Division cellulaire
2.4.5. Formation des jeunes pousses
2.4.6. Sénescence foliaire
2.5. Les gibbérellines
55
 2.5.1. Biosynthèse et transport
2.5.2. Stimulation de croissance
2.5.3. Levée de la dormance
2.5.4. Floraison
2.5.5. Allongement des entrenœuds
3. Régulation de développement végétal

Programme des TD/TP

TP/TD 1: Etude des pigments photosynthétiques chez les plantes

1. Chromatographie de partage sur papier
1.1. But et principe
1.2. Extraction des pigments photosynthétiques
1.3. Analyse chromatographique
2. Dosage spectrophotométrique des pigments chlorophylliens
2.1. But et principe
2.2. Extraction des pigments chlorophylliens
2.3. Dosage des chlorophylles
TP/TD 2 : Préparation des milieux synthétiques de croissance des plantes
1. But et principe
2. Calculs et préparation de différents milieux synthétiques
TP/TD 3: Dosage de l'azote dans de la matière végétale
1. Introduction: Importance de l'azote
2. Manipulation: dosage de l’azote
TP/TD 4: Dosage de l'auxine végétale
1. Effets de l'auxine sur la croissance
2. Dosage de l'auxine
Travaux dirigés
TD 1: Mesure et expression de la croissance végétale
TD 2: Etude de la photosynthèse et la respiration

56
 UEF 430 : Biologie animale et végétale

ECUEF 431 : Diversité phylogénétique des Deutérostomiens

Objectifs
Prendre connaissance de la diversité biologique et écologique des principaux taxons zoologiques
appartenant aux Deutérostomiens. Ces informations permettent à l’étudiant de compléter les
connaissances qui ont été acquises au cours de la L1 et d'avoir une idée générale sur l’ensemble de la
diversité animale et sur les synapomorphies qui différencient les grands branchements
phylogénétiques.
Programme du cours
Introduction
1. Rappel des principes de la phylogénie
2. Rappel des concepts monophylie, paraphylie et polyphylie (exemples dans la suite du cours)

Chapitre 1. Les Deutérostomiens et leur phylogénie

1. Caractères dérivés et distinctifs des Protostomiens: tableau comparatif
2. Les Echinodermes (principaux caractères dérivés et principaux branchements)
3. Les pharyngotrèmes (caractères dérivés)
3.1. Les Hémichordés (caractères dérivés)
3.2. Les chordés (caractères dérivés)
3.2.1. Les Urochordés (caractères dérivés, écologie d’un exemple, Intérêts...)
3.2.2. Les Myomérozoaires (caractères dérivés)
3.2.2.1. Les Céphalocordés (caractères dérivés, écologie de l’amphioxus, Intérêt…)
3.2.2.2. Les Crâniates (caractères dérivés)
- Les Myxinoïdes (caractères dérivés, écologie de la myxine, Intérêt...)
- Les Vertébrés

Chapitre 2. Les Vertébrés et leur phylogénie

1. Caractères dérivés et plan d'organisation général du taxon
2. Ressemblance des stades embryonnaires précoces et application du principe ontogénétique
3. Des premiers Vertébrés aux Tétrapodes (caractères dérivés de chaque taxon)
4. Phylogénie des Tétrapodes (caractères dérivés de chaque taxon)

Chapitre 3. Diversité des principaux taxons de Vertébrés

On suit dans ce chapitre le même plan: écologie d’une espèce appartenant à chaque taxon en axant
sur l'intérêt scientifique et/ou économique de celui-ci (milieu de vie, adaptations variées
(locomotion, régime alimentaire, respiration, reproduction…), de préférence, autochtone à la
Tunisie)
1. Diversité des Chondrichtyens
2. Diversité des Actinoptérygiens
3. Diversité des Amphibiens
4. Diversité des grands taxons de "Reptiles" (Chéloniens, Sauriens, Ophidiens, Crocodiliens)
5. Diversité des Oiseaux
6. Diversité des Mammifères
Programme des TD/TP

L'objectif de ces TP/TD est d'étudier la diversité des Vertébrés en Tunisie. Les séances peuvent être
enrichies de comptes rendus faits par les étudiants et des exposés annotés. Cinq séances peuvent
être conçues
Séance 1: Diversité des Poissons (particulièrement les Actinoptérygiens

57
Séance 2: Diversité des Amphibiens
Séance 3: Diversité des "Reptiles"
Séance 4: Diversité des Oiseaux
Séance 5: Diversité des Mammifères

ECUEF 432 : Diversité des Spermaphytes

Objectifs
Cet ECUE offre aux étudiants des connaissances actualisées et une bonne compréhension de la
diversité, la phylogénie, la systématique et l’évolution des trachéophytes (végétaux vasculaires) et
plus particulièrement des plantes à fleurs (végétaux phanérogames) et à graines (végétaux
spermaphytes). Dans une première étape, on donne un aperçu sur la systématique en général et sur
la systématique phylogénétique en particulier, origine et diversité des phanérogames, spermaphytes.
Ensuite, on discerne aux étudiants une connaissance détaillée sur la systématique des
gymnospermes, leur diversité et les principales caractéristiques. Enfin, on présente la diversité des
angiospermes en décrivant les principales familles (avec l’étude des exemples).
Une sortie d’herborisation d’une journée permettra aux étudiants de reconnaître, sur le terrain les
représentants des différents taxons étudiés et de réaliser un herbier

Programme du cours
1. Introduction : Systèmes de classification des Végétaux Spermatophytes
1. Introduction
2. Historique de la systématique botanique
3. Classification phylogénétique
3.1. Classique
3.2. Moléculaire
4. Caractères évolutifs
4.1. Appareil végétatif
4.2. Appareil reproducteur

Chapitre 1: Gymnospermes (su sens large)

(Embryophytes, stomatophytes, trachéophytes, Euphyllophytes, spermatophytes)
1. Caractère généraux
2. Classification
2.1. Ginkgophytes (Ginkgopsida)
2.2. Cycadophytes (Cycadopsida)
2.3. Gnétophytes (Gnétopsida)
2.4. Coniférophytes ou Pinophytes (Pinopsida)
3. Etude d’une pinacée : Pinus halepensis (Coniférophyte)
3.1. Etude morphologique
3.2. Structure anatomique
3.3. Appareil reproducteur
3.4. Reproduction (pollinisation, fécondation, embryogénèse)
3.5. Cycle de développement
4. Évolution de la reproduction chez les Gymnospermes

Chapitre 2 : Angiospermes (plantes à fruits)

(Embryophytes, stomatophytes, trachéophytes, Euphyllophytes, spermatophytes )
1. Rappel des caractères généraux
1.1. Caractères morphologiques

58
 1.2. Caractères reproductifs
1.3. Évolution de la reproduction chez les angiospermes
2. Classification
3. Systématique des Liliopsida
3.1. Sous-classe des Alismatidae
3.2. Sous-classe des Arecidae
3.3. Sous-classe des Commelinidae
3.4. Sous-classe des Liliidae
4. Étude de quelques familles des Liliopsida
4.1. Famille peu évoluée : F. Arecaceae (Palmiers)
4.2. Familles évoluées : F. Poaceae (Graminées), F. Alliaceae, F. Liliaceae, F. Asparagaceae, F.
Orchidaceae
5. Systématique des Magnoliopsida
5.1. Sous-classe des Magnoliidae
5.2. Sous-classe desHamamelidae
5.3. Sous-classe des Caryophyllidae
5.4. Sous-classe des Dilleniidae
5.5. Sous-classe des Rosidae
5.6. Sous-classe des Asteridae
6. Caractéristiques botaniques des familles des Magnoliopsida (les plus importantes dans la
biosphère)
6.1. Famille peu évoluée : F. Ranunculaceae (= Renonculacea), F. Papaveraceae
6.2. Familles évoluées : F. Rosaceae, F. Fabaceae, Asteraceae, F. Solanaceae, F. Lamiaceae, F.
Apisceae, F. Oleaceae, etc.
Programme des TD/TP
TP/TD 1 : Etude des Gymnospermes I : Morphologie et anatomie de Pinus halepensis
TP/TD 2 : Etude des Gymnospermes II : Appareil reproducteurs et reproduction de Pinus halepensis
TP/TD 3 : Diversité des Angiospermes : Fleur (rappel) + diversité florale
TP/TD 4 : Diversité des Angiospermes: Etude des familles
TP/TD 5 : Utilisation de la Flore, sortie botanique et confection d'un herbier

59
 UEO 410 : Options de Biologie et de Géologie

ECUEO 411 : Option1 de Biologie

Objectifs

Programme du cours

Programme des TD/TP

ECUEO 411 : Option2 de Biologie

Objectifs

Programme du cours

Programme des TD/TP

ECUE 412 : Option1 de Géologie

Objectifs

Programme du cours

Programme des TD/TP

ECUE 412 : Option2 de Géologie

Objectifs

Programme du cours

Programme des TD/TP

60
Maquettes et Syllabus de la
ème
3 année

61
 Maquette du 5èmeSemestre de la 3ème année de Licence (S5-L3) du parcours
Biologie-Géologie (BG))‫بيولوجيا وجيولوجيا‬
Volume des heures de Nombre de Modalité
Coefficient
Unité d'enseignement (UE) / code formation présentielles Crédits d’évaluation
code UE Elément constitutif d'UE (ECUE)
Compétences ECUE Contrôle Régime
Cours TD TP Autre ECUE UE ECUE UE continu mixte
Géologie de la Tunisie
UEF511 Géologie de la Tunisie 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
et ses Géoressources
UEF510 Comp : Géologie& Géo- 6 3
Géo-ressources
ressources exploitables de la UEF512 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
et exploitation
Tunisie
Immunologie, Biotechnologie Immunologie et
UEF521 1h30 1h00 2 1 X
et Génie génétique immunotechnologie
UEF520 UEF522 Biotechnologies animales 1h30 0h30 0h30 2 6 1 3
Comp : Outils
UEF523 Génie génétique 1h30 0h30 0h30 2 1 X
Biotechnologiques
Activités pratiques (AP)
UAP511 Stage pédagogique à l'ISEFC 3h30’ /semaine 5 2,5 X
UEF530 10 5
Comp : Préparation à la vie
UAP512 Stage pédagogique au collège 3h30’ /semaine 5 2,5 X
professionnelle
Unité optionnelle UEO511 Option de Biologie 1h30 0h30 0h30 2 1
UEO510 4 2
Comp : UEO512 Option de géologie 1h30 0h30 0h30 2 1

Unité transversale UET511 Bio-statistique 2h00 2 1 X

UET510 4 2
Arabe scientifique
UET512 2h00 2 1 X
(Programme SVT du collège)
total 29h30 30 30 15 15
Les couleurs des cases du tableau sont comme suit :
Les ECUEs transversauxen bleu ciel, ceux de Biologie en jaune, ceux de Géologie en violet, les options en roseet les activités pratiques en vert

62
 Syllabus des Eléments constitutifs (ECUEs) des Unités
d’enseignement fondamental (UEF), de l’Unité d’Enseignement
Optionnel (UEO) et de l’Unité d’Activités Pratiques (UAP) de S5-L3

UEF 510 : Géologie de la Tunisie et ses Géoressources

ECUEF511 : Géologie de la Tunisie

Objectifs

Programme du cours

Chapitre 1. Rappels des principales unités lithostratigraphiques de la Tunisie

Chapitre 2. Zone des nappes
Chapitre 3. Atlas Septentrional
1. Zone des écailles
2. Zone des diapirs
Chapitre 4. Atlas Central
1. Zone des plis atlasiques
2. Les fossés

Chapitre 5. Atlas Méridional

Chapitre 6. L'axe N-S
Chapitre 7. La plateforme orientale
Chapitre 8. La plateforme saharienne

Programme des TD/TP

 Lecture et analyse de la carte géologique de la Tunisie à l'échelle 1/500000
 Interprétation des cartes paléogéographiques des différents domaines structuraux
 Commentaire de cartes de base et élaboration de coupes géologiques des différents domaines
structuraux de la Tunisie (et de l’Algérie si c’est possible)
 Etablissement de schémas structuraux

ECUEF 512 : Géo-ressources et Exploitation

Objectifs
Les minéraux industriels est un secteur d'activités soufrant d'un déficit des cadres d'exécution. Cette
formation vise à former des jeunes diplômés ayant la capacité de réaliser des analyses de
reconnaissance des ressources minérales et de visualiser les techniques adéquates d'exploitation
respectant l'environnement et les clauses de la législation en vigueur.
Pré-requis: connaissances théoriques et pratiques de Minéralogie, Pétrographie

Programme du cours

Chapitre 1. Ressources en Eaux, sol et Energie

1. Les Ressources en Eau
1.1. Définition des sciences de l’eau (hydrologie – hydrogéologie – hydrogéochimie)
1.2. Cycle de l’eau et bilan hydrologique
1.3. Les ressources en eaux superficielles

63
 1.4. Les Ressources en eaux souterraines
1.5. Les Ressources en eau de la Tunisie
1.6. Impacts de l’action de l’Homme sur les ressources en eau(quantitatifs et qualitatifs)
1.7. Mesures de préservation des ressources en eau

2. Les Ressources en Sol

2.1. Notions de Pédologie
* Processus d’altération et d’humification
* Interactions organo-minérales et le transfert de matière
* Horizons pédologiques
2.2. Propriétés et les fonctions écologiques du sol
* Propriétés physico-chimiques
* Propriétés biologiques
* Fonctions du sol
2.3. Les ressources en sol
* Environnement naturel, types de sols et modes d’occupation des terres
* Les principaux types de sol en Tunisie
* Etat des ressources
- Les menaces de dégradation : surexploitation, érosion, désertification
- Les mesures et les moyens de protection du sol

Chapitre 2. Les Ressources minérales et énergétiques

1. Classification des Minerais, gisements et substances minérales
2. Les mines et les carrières de la Tunisie
3. Ressources énergétiques
3. Exploitation des ressources minérales et protection de l’environnement
4. Impacts des processus de transformation et de valorisation des ressources minérales et
énergétiques sur la qualité de l’air (cimenterie, raffinerie de pétrole, usines de traitements des
phosphates…)
5. Impacts des rejets d’hydrocarbures sur les milieux terrestres et sur les écosystèmes marins

Chapitre 3. Exploitation des Géoressources

Programme des TD/TP

* Etablissement des cartes des substances utiles
- Examen des lames minces des substances minérales utiles
- Réalisation de quelques analyses de reconnaissance des substances minérales utiles

64
 UEF 520 : Immunologie, Biotechnologie et Génie génétique

ECUEF 521 : Immunologie et Immunotehcnologie

Objectifs
L’utilisation des propriétés des réponses immunes, des anticorps et des techniques immunologiques
dans divers domaines de recherche, de contrôle, d’analyse biomédicale et de production doit
apparaître à travers les exemples et les applications

Programme du cours
Introduction à l’immunologie
1. Notion d’antigène
2. Définition et rôle du système immunitaire

Chapitre 1. Les organes et les cellules de l’immunité

1. Les organes lymphoïdes : localisation, structure et fonction
2. Les différentes cellules immunitaires : morphologie, fonction, marqueurs de différenciation
3. La circulation des cellules de l’immunité

Chapitre 2. L’immunité innée

1. Les barrières naturelles
2. La réaction inflammatoire

Chapitre 3. L’immunité adaptative

1. Propriétés : notion de spécificité, diversité et mémoire, application à la vaccination et la
sérothérapie
2. Les étapes de la réponse : activation, prolifération, différenciation
3. Les mécanismes effecteurs

Chapitre 4. Les anticorps monoclonaux et recombinants

1. Principe d’obtention
2. Banques combinatoires d’anticorps et banques de peptides
3. Applications
Programme des TP/TD
1. Structure et diversité des anticorps : purification des Ig et d’anticorps par chromatographie.
2. La réaction antigène anticorps et techniques d’étude (immunoprécipitation et ELISA)
3. Les techniques de western-blot
4. Immunohistochimie, Immunofluorescence et cytométrie de flux
5. Techniques de production d’anticorps (polyclonaux, monoclonaux et recombinants).

ECUEF522 : Biotechnologies animales

Objectifs
Ce cours se base sur les cours de Biologie et Physiologie de la reproduction et du développement
animal. Il se focalise sur les technologies utilisées dans ces domaines étroitement liés et qui peuvent
apporter des améliorations en qualité et quantité au niveau agronomique et médical. Mais, comme il
s’agit de technologies qui manipulent le vivant, un autre aspect sera traité en parallèle dans ce cours.
C’est l’aspect éthique et règlementaire.

65
 Programme du cours
Introduction générale
1. Les Biotechnologies, leurs champs d’intérêt et place des Biotechnologies animales dans ces
champs
2. Un des aspects des Biotechnologies animales sera pris comme exemple: les biotechnologies de la
reproduction et du développement ou biotechnologies de l'embryon
3. Visées des biotechnologies de l’embryon (rapide)
 Fondamentales
 Appliquées aux secteurs de l’agriculture et de la santé humaine
 Ethiques

Chapitre 1. Biotechnologies de la reproduction

1. Chez les animaux : objectifs d'amélioration génétique et productive de la reproduction animale
1.1. Méthodes in vivo
1.1.1. Insémination artificielle (IA) : méthode, collecte et conservation du sperme, avantages et
limites
1.1.2. Ovulation multiple avec transfert d’embryons in vivo (MOET) : méthode, conservation
d’ovocytes et d’embryons, avantages et limites
1.2. Méthodes in vitro
1.2.1. Prélèvement d’ovocytes, maturation in vitro, fécondation in vitro (OPU-FIV) : méthode,
avantages et limites
1.2.2. Sexage : méthode, avantages et limites
1.3. Manipulations embryonnaires : clonage et transgénèse (voir chapitre 3)
1.4. Questionnements éthiques
2. Chez l’Homme : objectif génétique et reproducteur
2.1. Prévention des maladies génétiques : méthodes directes et indirectes, avantages et limites
2.2. Procréation médicalement assistée (PMA) en cas de stérilité
2.2.1. Causes de la stérilité
2.2.2. Méthodes avec toujours les avantages, les limites
2.2.2.1. Insémination artificielle in vivo
2.2.2.2. Fécondation in vitro et transfert d’embryon (FIV), culture et conservation
2.2.2.3. Techniques dérivées de la FIV : MIV, GIFT, ZIFT, ICSI et autres
2.2.2.4. Manipulations embryonnaires : clonage et transgénèse (chap. 3 et 4).
2.3. Questionnements éthiques

Chapitre 2. Biotechnologies du développement: le clonage

1. Le clonage animal
1.1. Définition et bref historique
1.2. Techniques : fission embryonnaire, énucléation et transfert de noyau somatique
1.3. Applications : amélioration, production (autre méthode de reproduction), avantages, limites
2. Le clonage humain
2.1. Caractéristiques du cycle vital humain en relation avec l’état des cellules
2.2. Découverte des cellules souches humaines
2.3. Rôle, types et sources des cellules souches humaines: germinales, embryonnaires,
ombilicales, adultes, carcinomales, induites
2.4. Expérimentation des cellules souches: Objectifs : vers la thérapie cellulaire
Culture, maitrise de la prolifération et maintien de l’état souche ; maitrise de la différenciation
cellulaire et de l’état différencié ; maitrise de la dédifférenciation et de la transdifférenciation ;
manipulation génétique
2.5. Thérapie cellulaire : allogreffes, autogreffes, clonage thérapeutique, xénogreffes
2.6. Questionnement éthique et réglementation

66
Chapitre 3. Biotechnologies du génome embryonnaire : la transgénèse
1. La sélection assistée par marqueurs (SAM) (voir génie génétique)
2. La transgénèse: addition, remplacement ou inactivation de gènes
2.1. Quelques définitions : transgénèse, recombinaison, transgène, thérapie génique, OGM
2.2. Techniques possibles : Fusion cellulaire, transfection, électroporation, microinjection,
hybridome, utilisation des vecteurs viraux, vecteurs épisomaux, ou vecteurs à séquences
répétées, les transposons, la recombinaison… (voir génie génétique)
2.3. Applications
2.3.1. Etudes fondamentales : percer le rôle et l’expression des gènes
2.3.2. Elevage
2.3.2.1. Sélection SAM
2.3.2.2. Nouvelles lignées d’animaux plus résistants aux maladies
2.3.2.3. Amélioration de la qualité et quantité de la production animale. Exemple le lait
2.3.3. Recherche médicale et thérapie
2.3.3.1. Modèles animaux transgéniques mimant des pathologies humaines
2.3.3.2. Thérapie génique : traitement des pathologies humaines
2.3.3.3. Xénogreffe
2.4. Limites et aspects éthiques et règlementaires

Programme des TD/TP

1. Des TD sont réalisés sous la forme d'exposé oral et de vidéos pour expliquer les cas pratiques. A la
fin de chaque séance, les étudiants font des comptes-rendus.
 TD1. Biotechnologie de l’Embryon : Définition, Techniques, Cas pratique (IA des bovins)
 TD2. Les techniques de la Procréation Médicalement Assistée (PMA) : Techniques, Ethique et
Lois qui la régissent dans le monde et surtout en Tunisie.
 TD3. La Transgénèse et ses Applications (cas du lait par exemple)

2. Des exposés dans les thèmes

 La reproduction animale artificielle en milieu marin (Exemples et Utilité)
 Transgénèse animale: élevage des poissons et du bétail (Exemples et Utilité)
 PGS ou Screening Génétique Pré-implantation
 Time-Lapse Embryo-Imaging

3. Séance de TP : Culture in vitro des cellules rétiniennes de l’œil de bœuf.

5. Sortie au Centre d'Amélioration Génétique de Sidi Thabet: observation d'IA des bovins,
explication théorique du cas des ovins, suivie d'un compte rendu.

ECUEF523 : Génie génétique

Objectifs
Les différentes techniques utilisées dans les manipulations génétiques. Cours basé sur la génétique et
la biologie moléculaire

Programme du cours
Rappels de génétique
Structure et propriétés de l’ADN, structure de l’ARN et différentes classes, - réplication : modèle et
mécanisme - transcription : mécanisme, signaux, spécificité eucaryote-procaryote, maturation -
traduction : initiation élongation et terminaison et notion d’ORF - stratégies de traduction
procaryote/eucaryote, régulation de l’expression des gènes : exemple de l’opéron lactose

67
Chapitre 1. Les Outils du génie génétique
Chapitre 2. Les Outils enzymatiques
1. Les Enzymes de restriction
1.1. Définition
1.2. Différents types d’enzymes
1.3. Nomenclature
1.4. Type de coupure
1.5. Applications: Préparation de fragments à cloner, Etude du polymorphisme par RFLP, ou par
Southern-Blot. Établissement des cartes de restriction,
2. Autres enzymes Dnase I ; Nucléase S1 ; Terminal transférase ; Ligases ; ADN Pol I, ARN pol ;
Phosphatase Alcaline; T4PK; Taq Polymérase, TR II.

Chapitre 3. Les vecteurs

1. Plasmides : pBR322 & pUC18
2. Bactériophage
3. Cycle du phage lambda ; Carte génétique du chromosome du phage lambda ; comme vecteur
4. Les cosmides ; Utilisation des cosmides pour la constitution d'une banque.
5. Chromosomes artificiels
6. pYAC ; Carte d'un plasmide YAC. ; Le mini chromosome après ligation
7. pBAC : Chromosome artificiel bactérien, BAC
8. Autres vecteurs (vecteurs viraux eucaryotes...)

Chapitre 4. Les cellules hôtes: Bactéries, Levures, Cellules animales

1. Les Méthodes de clonage
1.1. Vecteurs de clonage, Vecteurs d’expression
1.2. Importance des marqueurs de sélection
1.3. Etapes de clonage
2. Banques génomiques, d’ADN complémentaires: Sélection et criblage : Méthodes de sélection de
clones recombinants
3. La PCR et le séquençage

Programme des TD/TP

Méthodes d'étude et de manipulation de l'ADN
 Digestion enzymatique d’ADN et visualisation
 Clonage dans un vecteur plasmidique
 Méthodes de Séquençage et PCR

68
 UEO 510 : Options de Biologie et de Géologie

ECUEO 511 : Option1 de Biologie

Objectifs

Programme du cours

Programme des TD/TP

ECUEO 511 : Option2 de Biologie

Objectifs

Programme du cours

Programme des TD/TP

ECUE 512 : Option1 de Géologie : Risques naturels

Objectifs
Ce cours est dédié à l’étude des risques naturels liés à la géodynamique externe et à la
géodynamique interne du globe terrestre.
Programme du cours
Chapitre 1. Notions de risque
1. Les aléas
1.1. Définition
1.2. Types d’aléas
2. Les enjeux
2.1. Définition
2.2. Types d’enjeux

Chapitre 2. Exemples de risques majeurs

1. Les tsunamis
1.1. Définition
1.2. Les causes
1.3. Les enjeux
2. Les cyclones
2.1. Définition
2.2. Les causes
2.3. Les enjeux
Programme des TD/TP
Cartographie de risque naturel (étude de cas), mini-projets sur les risques naturels et leurs impacts
sur l’homme, estimation des dégâts.

69
 ECUE 512 : Option2 de Géologie
Objectifs

Programme du cours

Programme des TD/TP

70
 UAP 510 : Activités Pratiques

ECUAP 511 : Activités pratiques : démarche d’investigation et démarche de

problématisation

Exemple d’activités pratiques : mise en œuvre d’une démarche d’investigation et d’une démarche
de problématisation dans le cadre d’un enseignement d’écologie, de géologie ou de biologie
L’étudiant (futur enseignant) prépare les conditions d’un processus d’apprentissage visant à
permettre aux apprenants de résoudre ou à construire des problèmes selon des modalités
d’investigation ou de problématisation comme l’observation directe, la visite et l’enquête.
Dans le curriculum tunisien de l’enseignement secondaire des sciences de la vie et de la terre
plusieurs séquences d’apprentissages offrent l’opportunité de mise en œuvre d’une démarche
d’investigation ou d’une problématisation. Ces séquences sont épistémologiquement ancrées en
biologie expérimentale ou en géologie ou en écologie.
Exemples de séquences d’apprentissage offrant l’opportunité de la mise en œuvre d’une démarche
d’investigation ou de problématisation (à titre indicatif)
- Expliquer les mécanismes de l’absorption et de la conduction
- s’informer sur les techniques permettant d’améliorer le rendement des cultures
- Expliquer le mécanisme de la photosynthèse
- Expliquer comment le relief est représenté sur une carte topographique
- Dégager les caractères adaptatifs des êtres vivants aux conditions climatiques du milieu exploré
- Etablir le lien entre la répartition des végétaux et les facteurs climatiques
- Distinguer les principaux types de relations trophiques dans l’écosystème
- Expliquer le mécanisme de la digestion des aliments (glucides, protides et lipides) par l’action des
enzymes
- Expliquer le mécanisme de la respiration cellulaire
- Expliquer le mécanisme de l’excrétion urinaire en tant que facteur d’homéostasie
- Expliquer le mécanisme de l’expression de l’information génétique et son interaction avec des
facteurs de l’environnement
- Expliquer les phénomènes géodynamiques (séisme, volcan, orogenèse...) par la théorie de la
tectonique des plaques
- Mettre en relation l’évolution de l’environnement géologique et l’évolution biologique
- Expliquer les fonctions du testicule et leur régulation
- Expliquer les fonctions de l’ovaire et leur régulation
- Expliquer le mécanisme de la régulation de la pression artérielle
- Expliquer les mécanismes de la réponse immunitaire spécifique
- ……..
Mise en œuvre de la démarche d’investigation
La mise en oeuvre d’une démarche d’investigation pour un enseignement scientifique en géologie ou
en écologie ou en biologie expérimentale comprend, génériquement, deux grandes étapes dont
chacune se compose de différents moments :
La préparation contient les moments suivants:
- Le choix et l’élaboration d’une situation de départ par l’étudiant (futur enseignant);
- La formulation d’un questionnement par les apprenants ;
-L’élaboration d’hypothèses et la conception de la démarche de validation/invalidation ;

La conduite contient les moments suivants :

- l’investigation conduite par les apprenants (expérimentation, recherche documentaire, etc.) ;
- La structuration des savoirs (sous la conduite de l’étudiant comme futur enseignant).

71
Mise en œuvre de la démarche par problématisation
La mise en ouvre d’une démarche de problématisation pour un enseignement scientifique en
géologie ou en écologie ou en biologie expérimentale comprend, génériquement, deux grandes
étapes dont chacune se compose de différents moments :
La préparation contient les moments suivants:
- Le choix d’une situation problème de départ par l’étudiant guidé par l’enseignant de tutelle;
- Expérimentation, recherche documentaire, Enquête autour de la situation etc.)
- L’élaboration des registres empirique et de modèles possibles grâce à un questionnement mené par
l’enseignant à des groupes d’étudiants séparés ;

La problématisation comprend les moments suivants :

- La confrontation des différents registres construits par les différents groupes;
- La structuration des savoirs (sous la conduite de l’étudiant comme futur enseignant).

UAP 512 : Activités Pratiques : Stage au Collège

Choix du collège selon les maîtres d’applications
Observation de réalisations d’enseignement : discussion avec le maître d’application et entente sur la
leçon à réaliser
Réalisation d’une leçon et évaluation par le maitre d’application et par l’enseignant universitaire de
tutelle.

72
 Maquette du 6èmeSemestre de la 3ème année de Licence (S6-L3)
Biologie-Géologie (BG))‫بيولوجيا وجيولوجيا‬
Volume des heures de Nombre de Modalité
Coefficient
Unité d'enseignement (UE) code Elément constitutif d'UE formation présentielles Crédits d’évaluation
code UE
/ Compétences ECUE (ECUE) Contrôle Régime
Cours TD TP Autre ECUE UE ECUE UE continu mixte
Génétique UEF611 Génétique formelle 1h30 1h00 0h30 3 1,5 X
UEF610 Comp : Génétique moléculaire et 5 2,5
UEF612 Génétique moléculaire 1h00 1h00 0h30 2 1 X
formelle
Ecologie et Physiologie animale UEF621 Ecologie générale 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
UEF620 6 3
Comp : Ecologie et Régulation du Régulation des grandes
UEF622 1h30 0h30 1h00 3 1,5 X
fonctionnement des organsimes fonctions physiologiques
Ecole de terrain : sorties
Activités pratiques : UAP611 3h30’ /semaine 5 2 X
Biologie-Géologie
UAP610 10 5
Comp : Apprentissage pratique à
UAP612 Stage pédagogique au Lycée 3h30’ /semaine 5 2 X
l’exercice du métier

Unité optionnelle obligatoire UEO611 Evolution 1h30 1h00 2 1

UEO610 Paléontologie évolutive- 5 2,5
Comp : UEO612 1h30 0h30 1h00 3 1,5
Stratigraphie intégrée
Unité transversale UET611 Bio-informatique 2h00 2 1 X
UET610 4 2
Ethique du métier
UET612 2h00 2 1 X
d’enseignant
Total 27h00 30 30 15 15
Les couleurs des cases du tableau sont comme suit :
Les ECUEs transversauxen bleu ciel, ceux de Biologie en jaune, ceux de Géologie en violet, les options en roseet les activités pratiques en vert

73
 Syllabus des Eléments constitutifs (ECUEs) des Unités
d’enseignement fondamental (UEF), de l’Unité d’Enseignement
Optionnel (UEO) et de l’Unité d’Activités Pratiques (UAP) de S6-L3

UEF 610 : Génétique formelle et Génétique moléculaire

ECUEF 611 : Génétique formelle

Objectifs
Programme du cours
Introduction et Historique de la génétique
Rappel sur les cycles biologiques, la mitose et la méiose
Reproduction sexuée et transmission des caractères héréditaires
1. Lois de ségrégation des gènes à travers la RS chez les organismes haploides
1.1. Cycle du champignon Neurospora crassa
1.2. Transmission d'un gène ou couple d'allèles
1.3. Ségrégation de deux gènes
1.3.1. Indépendance génétique
1.3.2. Liaison génétique ou linkage
1.3.3. Test 3 points et interférence
2. Ségrégation des gènes chez les diploïdes
2.1. Transmission d'un couple d'allèles
2.1.1. Dominance / récessivité
2.1.2. Codominance et dominance intermédiaire
2.1.3. La létalité
2.1.4. Systèmes multialléliques
2.1.5. Gène lié au sexe
2.2. Transmission de deux couples d'Allèles
2.2.1. Indépendance génétique
2.2.1.1. En absence d'interactions entre les gènes.
2.2.1.2. Avec une interaction entre gènes : Exemples d’épistasie : Effet complémentaire 9-
7 ; Epistasie dominante (Suppression d'un allèle dominant par l'autre allèle dominant) 13-
3 ; Epistasie récessive 9-3-4
2.2.2. Liaison génétique
Montage en cis et en trans
Cas particulier de la drosophile
3. Cartographie génétique chez les microorganismes
3.1. Transformation bactérienne
3.2. Conjugaison
3.2.1. Le facteur sexuel F
3.2.2. Le transfert polarisé ou transfert chromosomique
3.2.3. Gradient de transfert et cartographie fine
3.2.4. La sexduction
3.3. Transduction
3.3.1. Rappel sur les bactériophages
3.3.2. Transduction généralisée
3.3.3. Le phage lambda () et la transduction spécialisée
3.4. Recombinaison génétique chez les virus
Programme des TD/TP

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 ECUEF 612 : Génétique moléculaire
Objectifs
Programme du cours
Chapitre 1. La définition du gène
1. Mutants d’auxotrophie, chaînes de biosynthèse
2. Relation gène-enzyme
3. La complémentation fonctionnelle

Chapitre 2. Les mutations

1. Propriétés des mutations
2. Notion de mutation germinale et de mutation somatique
3. Les agents mutagènes et leurs modes d’action
3.1. Agents physiques
3.2. Agents chimiques
4. Notion d’épigénétique
5. Les différents types de mutations et leurs conséquences
5.1. Substitution
5.2. Insertion/délétion/duplication
5.3. Mutations de Répétition (microsatellites et VNTR)
5.4. Transposition

Chapitre 3. La réversion et la suppression intra et extracistronique

Chapitre 4. Génomes extra-chromosomiques

1. Diversité des génomes mitochondriaux
2. Génomes chloroplastiques
3. Fluidité des génomes et évolution des séquences

Chapitre 5. Régulation de l’expression des gènes : Opéron Lactose

Programme des TD/TP

1. Test de complémentation et test de recombinaison
2. Suppressions intra et extracistronique
3. Régulation de l’expression des gènes

UEF 620 : Physiologie animale et Ecologie

ECUEF 621 : Ecologie générale

Objectifs
Programme du cours
Introduction à l'écologie
Chapitre 1. L’organisme vivant dans son environnement (autoécologie) : Action des facteurs
abiotiques
1. Les facteurs écologiques abiotiques
2. Les facteurs limitants et Limites de tolérance
3. La valence écologique
4. Action de quelques facteurs écologiques sur les êtres vivants (animaux et végétaux) : Température
– Humidité - Eau - Lumière – O2 - Salinité ….

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Chapitre 2. Interactions entre les organismes vivants (synécologie) - Action des facteurs biotiques
1. Les Coactions homotypiques (effet de groupe, effet de masse et compétition intraspécifique).
2. Les Coactions hétérotypiques (mutualisme et symbiose, coopération, commensalisme,
amensalisme, parasitisme, prédation, compétition interspécifique).
3. Importance de la compétition interspécifique et Etude des niches écologiques.

Chapitre 3. Démographie des populations animales

1. Effectif et Densité
2. Sex-ratio
3. Classes d’âge et Cohortes
4. Courbes de survie et Pyramides d’âge.

Chapitre 4. Biocénotique & Phytoécologie

1. Les peuplements animaux (abondance relative, fréquence et indices de présence, constance,
sociabilité et indices d’association….).
2. Méthodes d’études des communautés végétales (classification des formes végétales notion de
groupements végétaux, dynamique des associations végétales : notion de Climax)

Chapitre 5. Diversité et Structure des écosystèmes

1. Définition : relation Biocénose – Biotope
2. Diversité des écosystèmes (Terrestres forestiers, steppiques, désertiques, marins, limniques,
insulaires…)
3. Structure des écosystèmes (caractéristiques physicochimiques, structure spatiale, hétérogénéité et
complexité des écosystèmes, structure trophique des écosystèmes : chaînes et réseaux trophiques
dans divers types d’écosystèmes).
4. Importance des équilibres écologiques des écosystèmes.
5. Anthropisation et Dégradation des écosystèmes.

Chapitre 6. Transfert de la matière et Bilans énergétiques

1. Flux de l’énergie et cycle de la matière dans les écosystèmes terrestres
1.1. Partitionnement de l’énergie au niveau des organismes vivants
1.2. Transfert d’énergie le long d’une chaine trophique
1.3. Flux de l’énergie à l’échelle de l’écosystème
 Flux d’énergie biologique
 Flux d’énergie auxiliaire
2. Rendements écologique, de croissance, énergétique, d’assimilation, de croissance et efficacité
écologique.
2.1. Bilans énergétiques
2.2. Productivité biologique
 Productivité primaire
 Productivité secondaire

Programme des TP/TD

1. Action des facteurs abiotiques sur un organisme vivant
2. Illustration des coactions hétérotypiques
3. Exercices (courbes de survies, pyramides d'âge…)
4. Etude de cartes phytosociologiques
5. Illustration des réseaux et chaînes trophiques par l'étude du régime alimentaire d'un organisme.

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 ECUEF622 : Régulation des grandes fonctions Physiologiques animales

Objectifs
En continuité aves la physiologie animale 1 (S3) et 2 (S4), Permettre aux étudiants de mieux
comprendre les mécanismes qui sous-tendent les fonctions suivantes (respiration, circulation,
digestion, fonction rénale et thermorégulation) et de les analyser à tous les niveaux d’intégration
dans les conditions normales et pathologiques.

Programme du cours
Chapitre 1. Physiologie du système respiratoire et de la ventilation
1. Le système respiratoire et description anatomique des poumons
2. La Ventilation et mécanique ventilatoire
3. Les échanges et le transport des gaz
4. La régulation de la respiration : contrôle nerveux ; régulation par les modifications de la PO2 et PCO2
et le pH sanguin
5. Bronchomotricité et contrôle de la ventilation
6. La plasticité et l’adaptabilité du contrôle ventilatoire
7. Troubles de la fonction respiratoire

Chapitre 2. Régulation de la Fonction cardiovasculaire

1. L’anatomie du cœur physiologie de la pompe cardiaque
2. L’automatisme cardiaque: les potentiels d’action cardiaques, le rythme cardiaque
3. La contraction du muscle cardiaque et les événements du cycle cardiaque
4. Contrôle nerveux, hormonal et local de l’activité cardiaque et de pression artérielle
5. Intégration de la fonction cardio-vasculaire : centres nerveux cardio-vasculaire fonctionnement du
baroreflexe
6. Bases moléculaires des pathologies cardiaques
7. Le système endocrinien cardiaque

Chapitre 3. Physiologie du système digestif : Transfert des substances nutritives

1. La cavité buccale, le pharynx et l’œsophage
2. L’estomac
2.1. Anatomie de l’estomac
2.2. Le suc gastrique et le contrôle de la sécrétion acide
2.3. La motricité gastrique
3. Le pancréas exocrine
3.1. Anatomie du pancréas
3.2. Le suc pancréatique et le contrôle de la sécrétion pancréatique
4. Le foie et la sécrétion biliaire
4.1. Anatomie du foie
4.2. La sécrétion biliaire et le rôle de la bile
5. L’intestin grêle
5.1. Anatomie de l’intestin
5.2. Le suc intestinal
5.3. La motilité de l’intestin grêle
5.4. L’absorption intestinale
6. Innervation du tube digestif et contrôle nerveux

Chapitre 4. Système d’élimination : Physiologie rénale et système urinaire

1. Anatomie fonctionnelle du rein

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 1.1. Anatomie fonctionnelle du néphron: Corpuscule rénale, tubule rénale, artériole afférente,
artériole efférente
1.2. Innervation du néphron
1.3. Ultrastructure des cellules du néphron : corpuscule, endothélium glomérulaire, membrane
basale, épithélium de la capsule de Bowman (podocytes), tissu méasangial, d. Appareil
juxtagloméulaire: rôle des cellules juxtaglomérulaires dans le stockage et la libération de
rénine, facteurs inducteur de la sécrétion de la rénine
2. Régulation de la filtration glomérulaire et phénomènes tubulaires
2.1. La filtration glomérulaire
2.2. Barrière glomérulaire et macromolécule
2.3. Facteurs de la filtration glomérulaire: Forces physiques, Débit Plasmatique Rénal (DPR),
résistances artériolaire, Perméabilité du filtre
2.4. Facteurs influençant le Débit de filtration glomérulaire (DFG)
2.5. Régulation du Débit Sanguin Rénal (DSR) et du Débit de Filtration Glomérulaire (DFG)-
Mécanismes l’autorégulation du DSR et du DFG : Mécanisme vasculaire myogénique ; -
rétrocontrôle tubulo-glomérulaire - Régulation du DSR: Contrôle nerveux sympathique ;
Contrôle hormonale par des substances vasoactives
3. La clairance rénale

Chapitre 5. Régulation du métabolisme organique et du bilan énérgétique

1. Homéostasie des substrats énergétiques au cours de l’exercice et du stress
2. Rôle des hormones thyroïdiennes
3. Contrôle hormonal
3.1. Activation de la vitamine D (calcitriol) et rôle dans la croissance
3.2. Production de prostaglandines (PGE2, PGI2)
3.3. Dégradation de protéines et peptides (insuline, glucagon, GH…)
3.4. Gluconéogénèse
4. Thermorégulation et bilan énergétique
4.1. La Peau : Les échanges Caloriques
4.2. Mécanismes de gain et de déperdition de chaleur
4.3. Les principales sources organiques de la thermogenèse
4.4. Reflexes thermorégulateurs
4.5. L’acclimatation à la température : à la chaleur et au froid

Programme des TD/TP

Les séances de TP permettront de renforcer les connaissances acquises en cours. Les TD sont intégrés
avec les TP et comportent les exposés au début de chaque expérimentation.

1. Régulation de la ventilation, chez le rat

2. Régulation endocrine (rôle de l’histamine) et nerveuse (nerf X) de la sécrétion gastrique acide (
rat)
3. Régulation nerveuse et humorale du système cardio-vasculaire
4. Pharmacologique de la motricité intestinale, modèle intestin isolé de rat ou lapin
5. Régulation de la diurèse chez le rat : Etude de l’effet d’injection d’extrait hypophysaire et de
facteur diurétique (mannitol, ou autres…).

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 UEO 610 : Options de Biologie et de Géologie

ECUEO 611 : Option obligatoire de Biologie : Evolution

Objectifs
1. Montrer que la science évolue par une succession de théories qui peuvent s’ajouter, s’améliorer,
se compléter ou se rejeter les unes les autres.
2. Etudier, en se basant sur les connaissances antérieures en paléontologie, morphologie, anatomie,
embryologie, génétique et écologiques, les arguments qui ont permis l’émergence et le progrès de la
théorie de l’évolution et de ses principes d’établissement des liens de parenté.
3. Analyser les mécanismes de l’évolution
4. Faire une synthèse des grandes étapes de l’apparition et de la diversification de la vie

Programme du cours
Introduction
Evolution de la terre et découpage des temps géologiques

Chapitre 1. Les grandes étapes de l’origine et de l’évolution de la vie sur la terre

1. Origine de la vie
2. De la vie sans oxygène à l’aérobiose
3. Des Procaryotes aux Eucaryotes
4. Des cellules isolées aux organismes pluricellulaires

Chapitre 2. Emergence des principes de reconstitution évolutive à partir d’Arguments en faveur de

l’évolution du vivant
1. Arguments paléontologiques : principe paléontologique
2. Arguments anatomiques: principe de l’identité de localisation des caractères
3. Arguments embryologiques: principe ontogénétique de la récapitulation
4. Arguments génétiques et apport de la Biologie moléculaire au principe de l’identité de localisation
5. Arguments de la génétique du développement et apport au principe ontogénétique : l’Evo-Dévo
6. Arguments écologiques et notion de niche écologique : principe de l’éco-évo-dévo

Chapitre 3. Mécanismes de l’évolution et de la diversification des êtres vivants

Introduction et Définitions de l’espèce
1. L’espèce et les mécanismes de l’isolement reproductif
1.1. Les barrières Pré-zygotiques
1.2. Les barrières Post-zygotiques
Conclusion : Théorie du "Renforcement"
2. La microévolution
2.1. Définition
2.2. Les Processus de la Microévolution
2.3. Modes - Modalités de la Sélection Naturelle
3. Modalités et processus de la spéciation
3.1. La spéciation allopatrique : péripatrique et dichopatrique (Vicariance)
3.2. Le Spéciation Sympatrique
3.3. Radiations adaptatives et Spéciation par essaims
4. La Macroévolution
4.1. Le modèle classique du Gradualisme (Théorie de Simpson) - Anagenèse et Cladogenèse.
4.2. Le Modèle des Equilibres Ponctués (Théorie d’Elredge et Gould).

Conclusion générale : de la systématique classique à la Phylogénie

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 Programme des TD/TP

1. Etude de quelques arguments en faveur de l’évolution

2. Etude des mécanismes de l’évolution
3. Etude de la co-évolution
4. Etude du rapport entre classification et phylogénie
5. Travail personnel sur une thématique de l’évolution.

ECUE 612 : Option obligatoire de Géologie : Paléontologie évolutive-

Stratigraphie intégrée

Programme du cours
A1. Paléontologie évolutive-Stratigraphie intégrée
1. Introduction: la Paléontologie au carrefour des Sciences de la Vie et de la Terre
2. Hiérarchie des caractères et taxinomie paléontologique
3. Variabilité intraspécifique et intragénérique, notions de variants et transiants
4. Hétérochronie de développement et relations ontogenèse-phylogenèse en paléontologie
5. Modélisation numérique de la morphodiversité

A2. Stratigraphie intégrée

1. Introduction: rappels sur les principes et unités stratigraphiques
2. Méthodes physiques et chimiques de la stratigraphie
3. Astrochronologie et Cyclostratigraphie
4. Calage des échelles et stratigraphie intégrée

Programme des TD/TP

B1. Paléontologie évolutive
TPs sur les Techniques et Méthodes de la Paléontologie et ses disciplines: à propos de quelques
groupes marqueurs dégagés ou vus en lames minces (Ammonites, radiolaires, foraminifères,
calpionelles)
Exercices sur:
1. Quantification des caractères et biométrie: analyses mono-, bi- et multivariées. Etablissement d'un
cladogramme
2. Modélisation mathématique de la morphodiversité: approche à la notion biologique de l'espèce.

B2. Stratigraphie intégrée

Séries d'exercices sur:
1. la magnétostratigraphie et la chimiostratigraphie; découpage en unités correspondantes.
2. le traitement de données astrochronologiques et cyclostratigraphiques. Etablissement de chartes
et calage des échelles en stratigraphie intégrée.

UAP 610 : Activités Pratiques

ECUAP 611 : Activités pratiques : sortie de terrain de biologie-géologie

UAP 612 : Activités Pratiques : stage au Lycée

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Choix du Lycée selon les maîtres d’applications
Observation de réalisation d’enseignement : discussion avec le maître d’application et entente sur la
leçon à réaliser
Réalisation d’une leçon et évaluation par le maitre d’application et par l’enseignant universitaire de
tutelle.

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