Université de Gabes A.U.

: 2022-2023
FACULTE DES SCIENCES DE GABES

SECTION : MRMGB1

Epreuve de : Bioinformatique

Nature de l’épreuve : DC DS EF Documents : autorisés  non autorisés 

Date de l’épreuve : 17-05-2023 Calculatrice : autorisée non autorisée
Durée de l’épreuve : 1h30min Session : principale contrôle

I. Vous avez une séquence génomique que vous allez étudier

>NC_003076.8
CGGCAAAGCTTTGTGGAACCACAAGTGATTAATTTTGGAGAAAACCACTTCTACCAGAAATTTTTAGCAT
GGGGAGTGAAGTCAACCGTCCACTAGCTGATTTTCCAGCAAATATCTGGGAAGATCCATTAACTTCTTTC
TCAAAGTCTGACCTCGTACGTATATCCTTTTCATATTGAATCATGTCATGTAGTATTTAATATTAGTAGC
CTACTCTGTGACTATATATTCCATTGCGATATAGGGAACTGAGACGTTCAAAGAGAAGCATAGTACGCTA
AAGGAGGCGGTGAAGGAAGCTTTTATGTCTTCCAAAGCGAATCCGATAGAGAACATCAAATTCATCGATG
CTCTATGTCGCCTTGGTGTCTCCTATCACTTTGAGAAAGATATCGTAGAACAATTGGATAAGTCATTTGA
TTGTCTTGATTTTCCTCAGATGGTAAGACAAGAGGGATGCGATTTGTACACGGTTGGAATAATTTTCCAA
GTTTTCAGGCAATTCGGCTTTAAACTTTCTGCCGGTAAAAATACTTATAATATATGAATTATGAACAACA
CTACACATTTTGCATGGTTTTTTATTTAATCCAAAATTTTTATTTTTACGTCTCAAGATGTGTTTGAGAA
GTTCAAGGACGAAAATGGGAAGTTCAAAGGACACTTGGTGACAGATGCATACGGGATGTTAAGTTTGTAC
GAAGCTGCACAATGGGGCACTCACGGAGAAGACATTATTGACGAAGCTCTCGCTTTCTCACGTTCTCATT
TAGAAGAAATTTCGTCTCGGTCTAGCCCTCATCTCGCAATTCGCATCAAGAATGCTCTAAAACATCCATA
CCATAAAGGCATCTCTAGGATAGAAACAAGACAATATATCTCATACTACGAGGAGGAAGAGTCGTGCGAC
CCAACATTACTTGAGTTCGCAAAGATAGATTTTAATTTGCTGCAAATATTACACCGCGAAGAGCTTGCTT
GCGTCACAAGGTAACAAATAATATCATGGCCACTCAACATATATAAACATATTGTCTTGCATAAATTGTT
GAAATTCTTTTCATTACATTCCAGGTGGCACCATGAAATGGAGTTTAAATCTAAAGTAACATACACAAGG

Notre but est de chercher cette séquence appartient à quel chromosome

 Donner le nom du programme à utiliser
……………………………………………………………………………………………………..

 La figure ci-dessous montre les résultats de comparaison de notre séquence

 Donner le nom du programme utilisé

……………………………………………………………………………………….
 Donner la longueur du query
……………………………………………………………………………
 Donner le nom de la banque de comparaison

1
…………………………………………………………………………………….

 Notre séquence appartient à quelle espèce ? À quell chromosome?

………………………………………………………………………………………………

 Donner la fonction de notre séquence

………………………………………………………………………………….
 La figure ci-dessous montre le résultat de comparaison de notre séquence et mRNA

 Donner l’utilité de cette comparaison

…………………………………………………………………………………………………..
 Donner le numéro d’accéssion du subject
……………………………………………………………………………………………….
 Donner le nombre des exons dans notre gene
………………………………………………………………………………………………..
 On donne la sequence du mRNA de notre gene

2
 Donner le nom du programme pour vérifier si cette séquence code pour une protéine
complète ou non
…………………………………………………………………………………………

 La figure ci-dessous est le résultat de comapraison de mRNA et la banque

 Est-ce que notre mRNA est complète ? Justifier

…………………………………………………………………………………………………
 Vous
avez

maintenant la séquence protéique du gène

 Donner le nom du programme qui prédit les domaines conserves de cette protéine
……………………………………………………………………………………
 Donner le nom de la banque qui stocke les domains concevés proteiques
…………………………………………………………………………………………

3
 D’après les figures ci-dessus
 Cette protéine appartient à quelle famille
…………………………………………………………………………….
 Donner la fonction moléculaire et le processus biologique de cette protein
……………………………………………………………………………………………….
 Cette protéine est secrétée ou nom ? justifié ? Donner le nom du programme utilisé
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………………………………………………………………………………………………
 Cette protéine est membranaire ? justifié ? Donner le nom du programme
……………………………………………………………………………………………………
…………………………………………………………………………………………………
 Donner la localisation cellulaire de cette protéine
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