Techniques d’apprentissage

Recherche documentaire dans les bases de

données bibliographiques :
l'exemple de Medline (PubMed)
Professeur Jacques BONIVER

Françoise PASLEAU & Jean-Michel RIGO

François XHIGNESSE

2003-2004

Bibliographie
 Liste des références des documents consultés par un
auteur et utilisés pour la rédaction d ’un article

 Liste complète ou sélective de documents sur un sujet

Exemples de bibliographies médicales "papier":

Index Medicus (USA)
Excerpta Medica (NL)

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1
 Index Medicus
 Depuis 1879, à l'initiative de Dr. John Shaw Billings,
chirurgien général de l’armée US

 Publication papier, mensuelle

 Liste de références à des articles (= citations) :

titre, auteurs, source

 Classement thématique des références

 Basé sur l'utilisation d'un langage documentaire

conventionnel (MeSH)
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Classement thématique des citations

 Myocardial infarction

³
Blood
Complications
Diagnosis
Drug Therapy
Clés de recherche =
…….
Descripteurs MeSH
 Myocardial revascularization
 Myocarditis
Blood
Complications
Diagnosis
Etiology
…..
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2
 Informatisation des bibliothèques
 Bibliographies papier º bases de donnés
Index Medicus º Medline
Excerpta Medica º Embase

 En évolution constante
Accès élargi
CD-ROM en monoposte > CD-ROM en réseau local > Intranet >
Internet

Capacités accrues de stockage

Puissance des outils de recherche

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Structure d ’une citation

Authors
Chaque citation est composée
de plusieurs champs
Source

Title

Abstract } Î Authors
Journal

³
MeSH Subject Î
Headings
Î Title et / ou Abstract
Type de publication Î Enter subject
Année de publication

Langue
} Î Individual Fields
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3
 Analogie avec Excel
Champs

Citations

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Medline
 Base de données bibliographique

 National Library of Medicine (NLM)

 Disciplines
Médecine, nursing, dentisterie, soins de santé
Médecine vétérinaire
Sciences précliniques
 ~4 600 périodiques; >11 millions de citations

 Continuellement remise à jour

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4
 Langage d’interrogation
³  Langage naturel (mots-clés)
Titre
Abstract

³  Langage documentaire = descripteurs MeSH

Conventionnel
Sert à décrire le contenu des documents en vue du
stockage et de la recherche
Commun aux producteurs et utilisateurs de l’information
Attribué "manuellement" à chaque citation

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MeSH = Medical Subject Heading

/
Descripteurs Sous-descripteurs
MeSH headings Subheadings
(± 18.000 ) (82)

Breast Neoplasms /su [Surgery ]………….. 5.702

³ Aspirin / ae [Adverse Effects ]……………… 1.233

Liver Cirrhosis / dt [Drug Therapy ]………..… 413

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5
 Production de Medline
Arrivée des journaux
NLM
Dépouillement des articles PreMedline

Saisie automatique des citations

(source, auteurs, titre, abstract,….)

Attribution manuelle du MeSH

Medline
Mise à jour de la base de données

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Logiciels d’interrogation
 NLM
Interface Web sur le site PubMed

 Autres
Ovid
SilverPlatter
Elsevier
Nombreux sites médicaux

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6
 Medline
via PubMed
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi

Présentation du site

 Accès gratuit à Medline, Pre-Medline

 Collaborations avec les éditeurs

Citations fournies en direct par les éditeurs
Liens vers des articles en texte intégral

 Fonctions particulières

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7
 Apprendre à
 Rechercher
 Visionner les citations
 Sélectionner les citations pour les
Imprimer
Sauvegarder
 Liens vers des livres, du texte intégral

Apprentissage - © ULg 2003-2004 Recherche documentaire 15

Ecran de recherche

oesophagitis

8
 Requête : règles d ’encodage
 Le logiciel interprète les requêtes
Opérateur "AND" est implicite

 Les opérateurs "OR" et "NOT" doivent être en majuscules

 Les expressions composées de deux ou plusieurs mots

(phrases) doivent etre entre guillemets
"single cells"
"hormone replacement therapy"

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Opérateurs booléens
Combinaison des descripteurs et/ou des mots-clés

a b
a AND b

a OR b a b

a b
a NOT b

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9
Ecran d'affichage des résultats

Details

10
 Détails de la stratégie de recherche
 Le premier concept = Infarctus = myocardial infarction
est recherché en temps que
 Mot-clé = Textword (Titre + Abstract)
3 champs
 Descripteur MeSH

 Le second concept = Cigarette = cigarette

est recherché en temps que mot-clé dans tous les
champs qui contiennent du texte

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Lien vers la référence

11
Affichage au format "abstract"

TITRE

Affichage au format "citation"

12
La citation comprend les descripteurs MeSH

ABSTRACT

Recherche en MeSH & Limites

13
 Limiter la recherche
 Réduire le nombre de citations en fonction de
Année de publication
Type de publication
Revues
Randomized Control Trial (étude clinique)
Caractéristiques du patient
Age
Sexe
Langue de la publication

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Imposer des limites

14
Rechercher avec le MeSH

15
Afficher la stratégie de recherche

Recherche par auteur et

sélection des citations

16
 Add to Clipboard (calepin)
 Sélectionner les citations intéressantes au fur et à
mesure des recherches en vue de les :
Imprimer
Sauvegarder

 Possibilité de choisir les champs

(à imprimer / sauvegarder)

 Possibilité de trier les citations

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17
 Accès au document complet
 Retour à la bibliothèque papier

 Utiliser le catalogue des périodiques

 Accès en ligne au texte électronique

Via la page d’accueil de la bibliothèque
Via PubMed (voir dia 23)

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Check-list des compétences

 Utiliser les ouvrages de référence
 Utiliser les outils de recherche
Table des matières
Index thématique ou par nom d’auteur
Catalogues
Bibliographies
 Comprendre la différence entre un catalogue et
une bibliographie
 Se familiariser avec Medline et PubMed

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18
 Vérifier la qualité de l’information
 en provenance des périodiques scientifiques
avec ou sans peer-reviewing
information précise, pertinente, fiable, complète,
actuelle
approche expérimentale et méthodes adaptées à la
question
 en provenance de l’Internet
grille d’évaluation des sites Web

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19