Docteur LORETTA BOLGAN

Docteur en chimie et technologie pharmaceutiques - Docteur en sciences pharmaceutiques

- Consultant scientifique Lg. 210, maladies professionnelles, contamination de
l'environnement
loretta.bolgan@gmail.com

COVID-19
LE VACCIN

Table des matières

INTRODUCTION …………………………………………………………………………………………………………………………. 2
LES VACCINS PROPOSES CONTRE LE SERAS-COV-2……………………………………………………………………. 4
APPROFONDISSEMENT …………………………………………………………………………………………………………….. 6
Discussion sur la nécessité d’autoriser la procédure accélérée …………………………………………….... 6
COMMENT LES AUTORISATIONS POUR LA PRODUCTION DE VACCINS ANTISARS-COV-2 ONT
ETE ACCORDEES ………………………………………………………………………………………………………………………… 11
EFFICACITE ET SECURITE DES FUTURS VACCINS CONTRE LE SRAS-COV-2 …………………………………. 16
Efficacité …………………………………………………………………………………………………………………………………. 16
APPROFONDISSEMENT ……………………………………………………………………………………………………………… 18
Les Quasi-espèces …………………………………………………………………………………………………………………… 18
DEFINITIONS ……………………………………………………………………………………………………………………………… 24
L’épitope …………………………………………………………………………………………………………………………………. 24
Les anticorps …………………………………………………………………………………………………………………………… 25
TOXICITE ……………………………………………………………………………………………………………………………………. 26
Le péché antigénique original …………………………………………………………………………………………………. 27
APPROFONDISSEMENT ……………………………………………………………………………………………………………… 28
Le péché antigénique originel …………………………………………………………………………………………………. 28
Suppression liée aux épitopes …………………………………………………………………………………………………. 30
AMÉLIORATION DÉPENDANTE DES ANTICORPS ……………………………………………………………………….. 34
IMMUNOPATHOLOGIE DU SRAS-COV-2 ET DE SES VACCINS ……………………………………………………. 38
AUTRES MECANISMES D’INDUCTION DES DOMMAGES……………………………………………………………. 48
Syndrome auto-immun/inflammatoire …………………………………………………………………………………… 48
LE VACCIN ChadOx1 nCov-19 ITALIEN SOUS EXPERIMENTATION ……………………………………………… 50
Procédure d’enregistrement – DIAGRAMMES ………………………………………………………………………... 50
Autorisation de mise sur le marché (AIC) ………………………………………………………………………………... 51
Tests précliniques pour le vaccin contre le SRAS-COV-2 ………………………………………………………….. 52
Etudes précliniques pour l’évaluation de la toxicité animale …………………………………………………… 53
PLATEFORMES VACCINALES POTENTIELLES SARS-COV-2 ………………………………………………………….. 54
METHODE DE PREPARATION DE L’ANTIGENE VIRAL POUR LE VACCIN ChadOx1 nCov-19………... 64
Construction du vecteur …………………………………………………………………………………………………………. 64
REPONSE CELLULAIRE AU VACCIN …………………………………………………………………………………………….. 69
CRITICALITE POUR LA QUALITE DU PRODUIT FINI …………………………………………………………………….. 70
PROTOCOLE D’ETUDE CLINIQUE POUR LE VACCIN ChadOy1 nCov-19 ………………………………………. 73
CONCLUSIONS …………………………………………………………………………………………………………………………… 77

EBOOK DISPONIBLE SUR

https://www.corvelva.it/speciale-corvelva/corvelva-ebook/covid-19-il-vaccino-che-verra.html

1
 INTRODUCTION

Dans l'article « SARS-Cov-2 et COVID-19: les questions de recherche les plus importantes » publié
récemment dans Cell and Bioscience1, neuf questions sont énumérées concernant : la transmission
du virus, la propagation asymptomatique et présymptomatique, le diagnostic, traitement,
développement d'un éventuel vaccin, origine virale et pathogenèse virale. À ce jour, il n'y a pas de
réponses à ces questions, mais seulement des hypothèses contradictoires. En ce qui concerne les
thérapies possibles et les moyens de prévention, il convient de noter qu’au terme de recherche
« Coronavirus », les archives internationales de la recherche scientifique et clinique Pubmed
enregistrent 20’772 publications dont la première remonte à 19492.En 2020, après 70 ans, l'équilibre
de cette charge de travail massive se résume en un mot: la faillite. Échec pour la recherche
scientifique et échec pour la pratique clinique.

Il convient de mentionner quelques chiffres que nous oublions trop souvent: la mortalité
dans les pays développés - due aux maladies liées au progrès - est en constante
augmentation (cancer: 9,6 millions de décès en 2018, maladies cardiovasculaires : 17,6
millions de décès en 2016, maladies auto-immunes: environ 10% de la population mondiale
est touchée3), proportionellement avec la croissancedu chiffre d'affaires de
l'industriepharmaceutique qui atteint actuellement une valeur globale de près de 1’000
milliards d'euros et qui en 2017, avec une production de 31,2 milliards d'euros, a atteint,en
Italie,une position de leader au sein de l'Union Europea. Bien que le véritable fléau
imparable soit précisément l'augmentation exponentielle des maladies chroniques
incurables - et non des maladies infectieuses - le monde des biotechnologies a trouvé dans la
nouvelle pandémie de coronavirus un débouché supplémentaire pour utiliser toutes les
techniques médicales les plus avancées et a commencé à travailler avec une vigueur
renouvelée vers la recherche de l'arme magique : « le vaccin »qui devra vaincre l'implacable
« infection » ennemie.

1
Cel Bioscience. 2020; 10: 40. Publié 2020 16 mars. Doi: 10.1186 / s13578-020-00404-4 SARS-CoV-2 et COVID-
19: Les questions de recherche les plus importantes. Yuen KS, Ye ZW, Fung SY, Chan CP, Jin DY.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7074995/pdf/13578_2020_Article_404.pdf

2
J Bacteriol. 1949; 58 (1): 23-32 Démonstration d'un phénomène d'interférence associé au virus de la bronchite
infectieuse des poulets. .Groupe V

3
Décès dus au cancer 2018 https://www.who.int/health-topics/cancer#tab=tab_1 Décès dus à une maladie
cardiovasculaire https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/cardiovascular- Maladies (MCV)
Autoimmun Rev.2020 29 mars: 102531. doi: 10.1016 / j.autrev.2020.102531. Tendances mondiales de la
mortalité toutes causes confondues des maladies systémiques auto-immunes entre 2001 et 2014.
Scherlinger M1, Mertz P2, Sagez F2, Meyer A2, Felten R2, Chatelus E2, Javier RM2, Sordet C2, Martin
T3, Korganow AS3, Guffroy A3, Poindron V4, Richez C1, Truchetet ME1, Blanco P5, Schaeverbeke T6, Sibilia J5,
Devillers H7, Arnaud L8. https://www.farmindustria.it/app/uploads/2018/07/i-numeri-dellindustria-
farmaceutica-in-italia_luglio_2018.pdf
Décès dus au cancer 2018 https://www.who.int/health-topics/cancer#tab=tab_1
Décès dus aux maladies cardiovasculaires https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/cardiovascular-
diseases-(cvds) Autoimmun Rev. 2020 Mar 29: 102531. doi: 10.1016 / j.autrev.2020.102531.
Tendances mondiales de la mortalité toutes causes des maladies auto-immunes systémiques entre 2001 et
2014. Scherlinger M1, Mertz P2, Sagez F2, Meyer A2, Felten R2, Chatelus E2, Javier RM2, Sordet C2, Martin T3,
Korganow AS3, Guffroy A3 , Poindron V4, Richez C1, Truchetet ME1, Blanco P5, Schaeverbeke T6, Sibilia J5,
Devillers H7, Arnaud L8. https://www.farmindustria.it/app/uploads/2018/07/i-numeri-dellindustria-
farmaceutica-in-italia_luglio_2018.pdf

2
Il n'y a qu'une seule comparaison de l'échec de cette approche pharmacologique qui
survient spontanément: dans les années 80, le VIH redouté est apparu avec le fardeau
pathologique du SIDA. La guerre a été déclarée contre le virus et la course au «vaccin contre
le VIH» a commencé. Le budget à ce jour est que des milliards (d'euros) ont été dépensés et
le «vaccin contre le VIH» n'existe pas. Après environ 30 ans de tentatives infructueuses, en
2017 a été lancé le énième protocole expérimental qui, à ce jour est, comme prévu, sans
résultats4 . Il est donc rationnel et nécessaire que nous essayions de répondre à la question
que la société pose à la communauté scientifique et clinique: les vaccins sont-ils une option
viable ? Pourquoi poursuivez-vous un objectif de vaccination qui ne semble pas réalisable,
n'offre pas de garanties d'efficacité et, au contraire, conduit à des effets indésirables fatals ?

4
https://www.niaid.nih.gov/news-events/nih-and-partners-launch-hiv-vaccine-efficacy-study

3
 LES VACCINS PROPOSÉS CONTRE LE SRAS-COV-2

Les vaccins proposés contre le SRAS-CoV-2 sont basés en grande partie sur l'utilisation de
technologies d'ingénierie moléculaire et ciblent généralement la glycoprotéine S de surface,
pic. Actuellement (20.04.2020) les vaccins expérimentaux sont 765, dont 5 déjà en phase
clinique I sur l'homme, autorisés par la procédure d'urgence.

Dans cette liste établie et mise à jour par l'OMS (destinée à augmenter encore) le futur
vaccin contre l'adénovirus, « tout italien » (et qui selon toute probabilité sera aussi celui que
nous allons acquérir en premier) a été inclus: ChAdOx1 nCoV-19. Advent6, section
scientifique de l'IRBM de Pomezia (voir détails), en collaboration avec le Jenner Institute de
l'Université d'Oxford, sera responsable de la production des vaccins, pour lesquels une
« utilisation compassionnelle » est prévue, à partir de septembre 2020, sur les agents de
santé par application des lois7. Des essais cliniques de phase I ont déjà commencé fin avril à
l'Université d'Oxford (Royaume-Uni) en collaboration avec le Jenner Institute sur 510
volontaires.

Bien que les résultats des tests précliniques in vitro et sur les animaux, cependant très
limités, n'aient pas encore été publiés et qu'il n'y a toujours pas de données sur l'homme, la
chercheuse de l'Université d'Oxford, Sarah Gilbert, responsable de l'expérimentation, a déjà
prophétisé que le vaccin sera efficace à 80% et totalement sûr8. En l'absence de données
cliniques et sur la base de ces prévisions, le Jenner Institute a établi un consortium avec
Advent, Merck, Millipore Sigma et Halix B.V. pour la production à grande échelle de millions
de doses à saisirsur le marché à l'automne 20209.

À ce stade, on se demande si les études cliniques, déjà limitées pour donner même une
réponse préliminaire sur l'innocuité et l'efficacité éventuelle d'un nouveau vaccin pour
l'ensemble de la population, (composé de personnes de différents groupes d'âge et avec
différents types de maladies et non par des volontaires adultes en bonne santé) ne
devraient-elles pas donner les résultats souhaités? Et si le vaccin est inefficace et trop
dangereux? Que deviendront les millions de doses produites pour ce vaccin et les millions de
doses produites également pour les autres vaccins testés dans d'autres pays du monde?

5
https://www.who.int/ (...) novel-coronavirus-landscape-ncov.pdf

6
https://www.IRBM.com (...) - jenner-institute-signs-an-agreement-with-advent-to-develop-a-novel

7
https://covid19vaccinetrial.co.uk/
http://www.salute.gov.it/portale/news (...) italien & menu = news & p = dalministero & id = 4464

8
https://www.medscape.com/viewarticle/928941#vp_5
https://www.fr24news.com/a/2020/04/scientist-leading-british-coronavirus-vaccine-urges-government-
toproduce-millions-of-doses.html

9
https://www.prnewswire.com (...) institut-to-reach-first-milestone-in-covid-19-fabrication de vaccins
https://www.prnewswire.com/news-releases/milliporesigma-soutient-jenner-institute-to-reach-first-
milestonein-covid-19-vaccin-manufacturing-301039361.html
https://european-biotechnology.com/up-to-date/latest-news/news/covid-19-halix-ready-for-
vaccineproduction.html

4
Les producteurs de vaccins anti-COVID-19 parlent déjà de milliards de doses qui pourraient
être versées sur le marché à court terme10. Ces coûts seront-ils supportés par la population,
déjà harcelée par les conséquences du SRAS-CoV-2? Les industries font pression sur les
agences et les gouvernements pour accélérer l'autorisation et disposer d'installations pour la
production de vaccins à grande échelle, mais nous savons que la production selon les bonnes
pratiques de fabrication (BPF) coûte cher : coût des matières premières de haute qualité,
coût des contrôles qualité des produits ... et plus les doses sont produites, plus il est difficile
de garantir la qualité d'un produit pharmaceutique. (Voir les résultats de VACCINEGATE ...).

Comment peuvent-ils garantir, en travaillant à ce rythme de recherche et de production

cliniques, d'abord la qualité du vaccin (exigence de base pour pouvoir être commercialisé)
puis la sécurité et l'efficacité (exigence de base à administrer dans son ensemble) - phases
qui nécessitent des temps très longs et des protocoles d’études très rigoureux - où le monde
scientifique et clinique n’a pas réussi à définir un vaccin efficace contre le VIH et pour de
nombreuses autres infections telles que la dengue, le cytomégalovirus ou le paludisme ?

Les vaccins proposés contre le SRAS-CoV-2 ont obtenu l'autorisation des organismes de
réglementation - FDA, EMA et national - pour poursuivre les essais cliniques de phase I(c'est-
à-dire sur un échantillon limité de volontaires sains) selon la procédure accélérée, selon
laquelle les données de sécurité précliniques in vitro et sur les animaux ont été omises. Pour
chaque vaccin, l'OMS communique les données sur le type de vaccin, la société qui le
produit, pour quelle maladie il est produit, la phase de l'étude clinique, le numéro de l'étude
clinique de référence et pour quel autre vaccin de la même société a été utilisé la même
plate-forme11.

Le fait que la société teste déjà des vaccins produits avec la même plate-forme a été accepté
par les organismes de réglementation comme la seule et unique condition préalable pour
garantir la sécurité. Les questions critiques liées à ce choix seront discutées plus loin.

10https://www.techtimes.com/articles/248972/20200420/covid-19-update-coronavirus-vaccine-makers-

asksgovernments-help-to-make-millions-of-doses-by-september.htm

11
https://www.who.int/blueprint/priority-diseases/key-action/novel-coronavirus-landscape-ncov.pdf

5
 APPROFONDISSEMENT

Discussion sur la nécessité d'autoriser la procédure accélérée12

Sur le site de l'EMA : PROCÉDURES D'AUTORISATION13

« Des procédures ont été mises en place dans l'Union européenne pour accélérer la
disponibilité des vaccins pouvant être utilisés pour protéger la population contre la grippe
pandémique.

Ces procédures, gérées par l'Agence européenne des médicaments, vous permettent
d'autoriser un vaccin contre la grippe plus rapidement que les 18 à 24 mois normalement
requis pour l'autorisation d'un médicament dans l'UE.

Les deux principales procédures d'autorisation des vaccins contre la grippe pandémique sont
les suivantes :

 La « procédure de maquette », qui vous permet de développer et d'autoriser un vaccin

avant une pandémie, sur la base d'informations générées avec une souche virale qui
pourrait potentiellement provoquer une pandémie. Une fois que la souche virale
réelle à l'origine de la pandémie a été identifiée, le fabricant peut inclure cette souche
dans le vaccin de simulation et demander à ce qu'elle soit autorisée comme vaccin
pandémique « final ».
 La « procédure d'urgence », qui permet l'approbation accélérée d'un nouveau vaccin
développé après qu'une pandémie a déjà été déclarée. L'autorisation de ces vaccins
pandémiques est plus rapide qu'un vaccin normal, car les informations fournies par le
fabricant sont évaluées dans un délai accéléré (environ 70 jours au lieu de 210 jours).
 Une troisième procédure permet de modifier les vaccins autorisés contre la grippe non
pandémique, la « grippe saisonnière », pour offrir une protection contre la grippe
pandémique.
(...) L'Agence a également mis en place une voie d'approbation accélérée des nouveaux
vaccins développés lors d'une pandémie. Contrairement à l'approche simulée [maquette],
l'autorisation de ces vaccins nécessite la soumission d'un nouveau dossier complet
d'informations. Les entreprises qui développent de nouveaux vaccins doivent donc collecter
plus de données que nécessaire pour transformer la souche virale en un vaccin simulé. Cela
comprend un dossier d'informations plus complet montrant comment le vaccin fonctionne
lorsqu'il est administré à des volontaires humains et ses effets secondaires. Dans la
procédure d'urgence, les entreprises utilisent le processus de « révision continue »,
fournissant des données sur les vaccins en cours de développement dès qu'ils sont
disponibles, plutôt que d'attendre d'avoir collecté l'ensemble des données. Cela permet au
CHMP d'évaluer les données en temps réel, afin que le vaccin final puisse être approuvé le
plus rapidement possible.

12
https://www.fda.gov/news-events/fda-meetings-conferences-and-workshops/summary-fda-ema-global-
regulators-meeting-data-requirements-supporting-first-human-clinical-trials

13
https://www.ema.europa.eu/en/authorisation-procedure

6
Une fois que des données suffisantes ont été collectées pour démontrer que les avantages du
vaccin l'emportent sur ses risques, la société est obligée de soumettre une demande officielle
à l'Agence européenne des médicaments, afin que l'utilisation du vaccin puisse être
autorisée. Le CHMP procède ensuite à une évaluation accélérée de l'ensemble du dossier
d'information, en émettant un avis après environ 70 jours. Cet avis est transmis à la
Commission européenne, dont la décision devrait prendre entre 25 et 45 jours.

Le vaccin peut ensuite être mis à disposition pour utilisation. Les vaccins autorisés par la
procédure d'urgence reçoivent une approbation conditionnelle. Cela signifie que bien que les
avantages du vaccin l'emportent sur ses risques, les données utilisées pour étayer
l'autorisation ne sont pas encore complètes. L'autorisation est accordée à condition que la
société fournisse les informations supplémentaires demandées, telles que les résultats
d'autres études, une fois le vaccin mis sur le marché. Une fois autorisé, de nouvelles mesures
sont prises pour surveiller l'innocuité et l'efficacité des vaccins contre la grippe pandémique.

Autorisation de vaccins contre la grippe pandémique par la procédure d'urgence :

EU, European Union; EMA, European Medicines Agency; CHMP Committee for Medicinal
Products for Human Use; EC, European Commission tratta da
https://www.researchgate.net/publication/257740127_Vaccine_development

Pour comparaison, voir la figure suivante qui montre toutes les étapes pour obtenir
l'autorisation d'un vaccin (discutée en détail plus loin).
Comme on peut le voir, les études précliniques, fondamentales pour évaluer la faisabilité du
vaccin, ont été limitées au minimum pour obtenir une autorisation d'urgence, et les études
cliniques de phase II et III ne seront pas réalisées avant la commercialisation, alors qu'elles le
seront dans le même temps, les études de phase I / II et la préparation de processus de
production à grande échelle, qui devraient plutôt être mis en œuvre seulement après la fin
de la phase III. Il est clair que tout cela se fera au détriment d'une évaluation précise de la

7
qualité, de la sécurité et de l'efficacité, face à un risque provoqué par COVID-19 qui est
encore loin d'être bien défini aujourd'hui.

Ag, antigene; GMP, good manufacturing practice; IND, investigational new drug; GLP, good
laboratory practice.
Extrait de : https://www.researchgate.net/publication/257740127_Vaccine_development

Nous rapportons intégralement ce qui a été discuté par la FDA et l'EMA sur la nécessité
d'autoriser la procédure accélérée :

Les fabricants de vaccins commerciaux et d'autres entités mettent au point des vaccins
candidats contre le SRAS-CoV-2 en utilisant diverses technologies et plates-formes,
notamment l'ARN, l'ADN, les protéines et les vaccins à vecteur viral. La propagation rapide du
SARS-CoV-2 nécessite un temps de développement accéléré. afin que les candidats au vaccin
contre le SRAS-CoV-2 puissent accéder rapidement aux essais cliniques de phase I(...) La
téléconférence des organismes de réglementation mondiaux du 18 mars 2020 convoquée
conjointement par l'Agence européenne des médicaments (EMA) et la Food and Drug
Administartion (FDA) des États-Uni, sous les auspices de l'International Coalition of Medicinal
Regulators (ICMRA), ont examiné les considérations réglementaires liées au développement
de vaccins candidats contre le SRAS-COV-2 et les exigences de données précliniques pour le
processus d'essai clinique sur le premier homme (FIH).

Thèmes clés : ● Données précliniques requises pour soutenir la poursuite des essais cliniques
de la FIH ● Nécessité d'aborder le risque théorique d'amélioration des maladies induites par
le vaccin contre le SRAS-CoV-2 avant de procéder aux essais cliniques de la FIH.

8
Ce qui suit représente une relation de positions généralement acceptée entre les régulateurs
mondiaux présents.

Enregistrement par les régulateurs mondiaux des données précliniques pour soutenir le
processus des essais cliniques FIH

● Les participants ont reconnu que l'extension des données précliniques pour soutenir la
conduite des essais cliniques sur la FIH dépend de la construction du vaccin, les données de
soutien disponibles pour sa construction et à partir de données produits étroitement liées.
[Ndlr : « construire » signifie le virus génétiquement modifié pour créer l'antigène du vaccin].

● Les participants ont noté que les opportunités de tirer parti des connaissances accumulées
avec la technologie de construction devraient être envisagées pour accélérer le
développement d'un vaccin contre le SRAS -CoV-2 produit en utilisant la même construction.

Par exemple, si une technologie de construction utilisée pour fabriquer un vaccin autorisé ou
d'autres vaccins expérimentaux est bien caractérisée, des données toxicologiques (par
exemple des données d'études de toxicité à doses répétées, des études de biodistribution) et
des données cliniques peuvent être utilisées. Accumulé avec d'autres produits utilisant la
même construction pour soutenir les essais cliniques sur FIH pour un candidat pour le vaccin
contre le SRAS-CoV-2.

● Les participants ont noté que le fabricant du vaccin devrait fournir une logique basée sur
les données pour justifier pourquoi certaines études précliniques, telles que les études de
toxicité, ne devraient pas être menées avant de procéder aux essais cliniques de la FIH.

● La caractérisation du CMC [éd. Chimie, fabrication et contrôles] devrait être appropriée

pour soutenir l'innocuité de la construction du vaccin contre le SRAS-CoV-2 avant de mener
des essais cliniques sur la FIH.

● Pour tous les candidats-vaccins contre le SRAS-CoV-2, il est nécessaire d'obtenir des
données animales et de caractériser la réponse immunitaire induite par un candidat-vacciné
contre le SRAS-CoV-2.

● Il n'est pas nécessaire de démontrer l'efficacité du candidat vaccin contre le SRAS-CoV-2

dans des modèles de provocation animale avant de procéder à des essais cliniques sur la FIH.
Le test de provocation consiste à infecter l'animal vacciné pour vérifier si le vaccin est
efficace]

Discussion des régulateurs mondiaux sur le risque théorique de potentialisation de la maladie

induite par le vaccin contre le SRAS-CoV-2 avant les essais cliniques sur la FIH :

● Les participants ont reconnu l'urgence de mener des études FIH avec le vaccin candidat
SARS-CoV-2 à la lumière de la pandémie actuelle, mais ont souligné l'importance des
stratégies d'atténuation des risques afin que les sujets humains inscrits dans les essais
cliniques ne doivent pas être exposés à des risques déraisonnables

● La plausibilité de la potentialisation des maladies induites par le vaccin est une

circonstance spéciale qui doit être évaluée sur la base des données scientifiques disponibles,

9
ce qui peut inclure l'utilisation de modèles animaux pertinents actuellement en cours de
développement.

● Bien qu'il existe des limites dans les connaissances et la compréhension actuelles du risque
d'amélioration de la maladie et de la valeur de ces modèles pour prédire la probabilité de
survenue chez l'homme, les études sur modèles animaux sont considérées comme
importantes pour comprendre la plausibilité de l'amélioration de la maladie induite par la
maladie, par vaccin avec des candidats pour le vaccin SARS-CoV-2.

● Les participants ont reconnu qu'il existe une disponibilité limitée de primates non humains
et qu'il n'est pas possible de demander de telles études avec un candidat vaccin contre le
SRAS-CoV2 avant les études FIH et que cela retarderait considérablement le développement
clinique du vaccin.

Les participants ont discuté de la nécessité d'aborder la plausibilité de la potentialisation des

maladies induites par les vaccins en permettant les essais cliniques et la FIH avec les vaccins
contre le SRAS-CoV-2, sur la base de toutes les données disponibles liées au vaccin candidat
SARS-CoV-2 particulier la construction du vaccin, la réponse immunitaire induite par celle-ci,
par exemple, les réponses immunitaires de type Th1 déformées et les titres d'anticorps
neutralisants, et la conception de l'essai clinique FIH.

Bien qu'ils ne soient pas unanimes, les participants conviennent généralement que:

● Certains modèles de vaccins pour lesquels des informations et un soutien adéquats ont été
fournis sur la base des connaissances sur la réponse immunitaire induite, peuvent être
autorisés à poursuivre les études FIH sans avoir terminé au préalable les études animales.
Evaluer la plausibilité de l'amélioration de la maladie à condition que des stratégies
adéquates d'atténuation des risques soient mises en œuvre dans ces tests FIH.

● Pour certains vaccins, des données précliniques (par exemple, des données de provocation
post-vaccination provenant de modèles animaux, des études d'immunopathologie sur des
modèles animaux, etc.) peuvent être nécessaires avant de passer aux essais cliniques sur la
FIH. Dans le cas où les essais cliniques sur la FIH sont autorisés à se poursuivre en l'absence
d'études animales qui pourraient évaluer la potentialisation de la maladie mais avec d'autres
informations adéquates, ces études devraient, en général, être menées en parallèle avec les
études FIH afin que ces données sont disponibles avant de recruter un grand nombre de
sujets humains dans les essais cliniques de phases 2 et 3.

● Les stratégies d'atténuation des risques à envisager pour les études cliniques de la FIH
comprennent le recrutement de jeunes adultes en bonne santé, un consentement éclairé
adéquat pour garantir que les sujets sont conscients des risques théoriques et un suivi
soigneux de la sécurité et surveillance fréquente.

●Les régulateurs ont exprimé le besoin de développer des mécanismes permettant le partage
des données des modèles animaux et des essais cliniques pour informer la communauté
réglementaire mondiale des résultats de l'étude de manière continue et en temps
opportun. »

10
 COMMENT LES AUTORISATIONS POUR LA PRODUCTION DE VACCINS
ANTI-SARS-COV-2 ONT ÉTÉ ACCORDÉES

Les organismes de réglementation ont donc décidé d'accorder une autorisation accélérée
pour les vaccins contre le SRAS-CoV-2 sur la base des essais cliniques d'autres vaccins contre
d'autres infections. Ceci est très grave car le risque de potentialisation de l'infection à
prévenir par la vaccination est connu. En d'autres termes, une fois commercialisé, ce vaccin
présentera un certain risque de renforcer la maladie dont vous souhaitez protéger les
vaccinés, ce qui, comme vous le verrez, peut également entraîner des complications fatales14

Malheureusement, l'organisme de réglementation exige des études précliniques sur les

animaux pour tester la capacité de former des anticorps contre les antigènes vaccinaux, mais
n'exige pas d'études toxicologiques ou d'études de surveillance pour l'évaluation des effets
indésirables, en particulier en cas de réinfection. On ne comprend pas pourquoi d'une part
les tests de provocation sur les animaux (c'est-à-dire la réinfection après vaccination) ont été
supprimés, mais d'autre part nous essayons de les proposer sur des volontaires vaccinés lors
d'essais cliniques pour accélérer encore le processus d'agrément15. Les raisons peuvent être
doubles: premièrement, les tests sur les animaux ne sont pas compatibles avec le calendrier
de l'approbation d'urgence en phase pandémique (motivation officielle mais absolument
non valable du point de vue de la protection de la santé, selon que les résultats des études
de sécurité animale ne sont pas très fiables pour être extrapolés à l'homme (c'est un peu
moins officiel, car cela remettrait en cause les données de sécurité de tous les vaccins déjà
sur le marché16).

14
Is antibody-dependent enhancement playing a role in COVID-19 pathogenesis?
DOI: https://doi.org/10.4414/smw.2020.20249
Swiss Med Wkly. 16.04.2020;150:w20249
https://smw.ch/article/doi/smw.2020.20249

15
J Infect Dis. 2020 Mar 31. pii: jiaa152. doi: 10.1093/infdis/jiaa152.
Human challenge studies to accelerate coronavirus vaccine licensure.
Eyal N1,2, Lipsitch M3, Smith PG4.
https://academic.oup.com/jid/article/doi/10.1093/infdis/jiaa152/5814216

Nature. 2020 Apr 22. doi: 10.1038/d41586-020-01179-x.

Hundreds of people volunteer to be infected with coronavirus.
Callaway E.
https://www.nature.com/articles/d41586-020-01179-x

https://it.blastingnews.com/cronaca/2020/04/video/covid-19-burioni-inoculare-virus-a-giovani-vaccinati-
peraccorciare-sperimentazione-005346069.html

16
Biologicals. 2020 Jan;63:101-105. doi: 10.1016/j.biologicals.2019.10.007.
Global harmonization of vaccine testing requirements: Making elimination of the ATT and TABST a concrete
global achievement.
Viviani L1, Halder M2, Gruber M3, Bruckner L4, Cussler K5, Sanyal G6, Srinivas G7, Goel S8, Kaashoek M9,
Litthauer D10, Lopes da Silva AL11, Sakanyan E12, Aprea P13, Jin H14, Vandeputte J15, Seidle T16, Yakunin D17
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1045105619301137

11
La nécessité de se précipiter vers la production du vaccin est liée à deux facteurs très
importants: le premier que nous devons rester en état d'alerte pandémique jusqu'à la fin de
la première phase des essais cliniques (nous devons donc nous attendre à ce que les médias
accordent une grande importance aux cas de réinfection et de nouvelles flambées qui
émergeront dans le monde après l'atténuation du verrouillage); la seconde, que pour le
COVID-19, il ne doit pas y avoir de traitement permettant de réduire le taux de mortalité au
niveau des décès attendus, et en fait les traitements continuent d'être tous en phase de
test15 et approuvés sans trop de limites éthiques aussi pour les médicaments connus pour la
danger17 ; cependant, malgré la complication de l'infection SARSCov-2 inventée sous un
nouveau nom (COVID-19), il ne s'agit pas en fait d'une nouvelle maladie, mais du syndrome
auto-immun / inflammatoire bien connu des rhumatologues et immunologistes (syndrome
cytokine storm) qui est probablement liée à des réactions de réactivité croisée avec les
protéines humaines de l'épithélium alvéolaire et vasculaire, pour lesquelles des traitements
de première ligne (plus ou moins efficaces et toxiques) sont déjà utilisés dans la pratique
clinique tels que immunosuppresseurs18.

Sans ces deux conditions (toutes deux, comme nous l'avons vu, non valides), la nécessité
d'une autorisation d'urgence cesse automatiquement.

Il est intéressant de noter que la troisième modalité d'enregistrement accélérée fournie par
l'EMA est la modification du vaccin contre la grippe, dans lequel le nouvel antigène du vaccin
pandémique est également introduit dans ce vaccin multivalent:

Tiré du site Web de l'EMA19 - Les vaccins contre la grippe saisonnière sont changés chaque
année pour s'assurer qu'ils peuvent protéger contre les souches de grippe qui pourraient
causer la grippe dans la prochaine saison de grippe hivernale. Certains de ces vaccins
peuvent être modifiés pour se protéger contre la grippe pandémique. Cela peut être fait en

17
https://www.gazzettaufficiale.it/atto/serie_generale/caricaDettaglioAtto/originario?atto.dataPubblicazioneG
azzetta=2020-03-17&atto.codiceRedazionale=20A01705&elenco30giorni=true
https://www.gazzettaufficiale.it/eli/id/2020/03/25/20A01850/SG

https://www.iltempo.it/cronache/2020/04/01/news/coronavirus-ai-malati-farmaco-killer-aifa-autorizza-
poiritira-avonex-interferone-beta-1-contro-covid-19-insufficienza-respiratoria-1306393/

18
Clin Immunol. 2020;215:108426. doi:10.1016/j.clim.2020.108426
On the molecular determinants of the SARS-CoV-2 attack.
Kanduc D, Shoenfeld Y.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7165084/pdf/main.pdf

Autoimmun Rev. 2020 Apr 5:102538. doi: 10.1016/j.autrev.2020.102538.

Corona (COVID-19) time musings: Our involvement in COVID-19 pathogenesis, diagnosis, treatment and vaccine
planning.
Shoenfeld Y1.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7131471/
How doctors can potentially significantly reduce the number of deaths from Covid-19
https://www.vox.com/2020/3/12/21176783/coronavirus-covid-19-deaths-china-treatment-cytokine-
stormsyndrome

19
https://www.ema.europa.eu/en/authorisation-procedures

12
remplaçant la souche du virus de la grippe qu'ils contiennent par la souche provoquant la
pandémie.
Il n'existe pas de voie spéciale permettant aux entreprises d'obtenir plus rapidement une
autorisation de mise sur le marché lors de la conversion d'un vaccin contre la grippe
saisonnière existant en un vaccin pour se protéger contre la grippe pandémique. Les sociétés
utilisant cette approche doivent donc présenter toutes les données cliniques sur la sécurité
du vaccin et sa capacité à assurer une protection avant d'autoriser le changement de la
souche grippale. Cette procédure prend généralement environ 70 jours.

Étant donné que la plupart des vaccins contre la grippe saisonnière sont autorisés au niveau
national, la responsabilité d'autoriser ce type de conversion incombe principalement aux
régulateurs des différents États membres de l'UE, plutôt qu'à l'Agence européenne des
médicaments. Les vaccins contre la grippe saisonnière ne sont normalement pas efficaces en
cas de pandémie, bien qu'ils puissent être utilisés conjointement avec des vaccins
pandémiques pour assurer une protection contre le virus de la grippe qui devrait circuler
pendant la saison de la grippe.

Nous savons déjà que l'orientation politique est de rendre la vaccination antigrippale
obligatoire pour les professionnels de santé de plus de 65 ans et les enfants, sans aucune
hypothèse scientifique ou clinique valable de son utilité. Cela se voit dans l'ordonnance de la
région du Latium signée en avril 202020.

Le raisonnement de base est que la vaccination contre la grippe devrait permettre de briser
le pic épidémique qui pourrait se chevaucher d'un point de vue temporel avec l'épidémie
SARSCov-2, mettant les unités de soins intensifs en difficulté.

Cependant, les études disponibles sur les saisons grippales précédentes montrent que le
vaccin contre la grippe est complètement inefficace dans la ceinture pédiatrique, augmente
considérablement la mortalité due à la grippe chez les plus de 65 ans 21 et augmente
l'incidence de 36% des co-infections coronavirales dues à un phénomène d'interférence
vaccinale, contrairement à la grippe naturellement contractée qui tend à avoir un effet
protecteur contre les virus parainfluenza22.De plus, la mauvaise réponse immunitaire des

20
http://www.regione.lazio.it/rl/coronavirus/ordinanza-per-vaccinazione-antinfluenzale-e-anti-
pneumococcicaobbligatoria/

21
https://www.onb.it/2018/11/02/vaccini-antinfluenzali-risposte-ed-efficacia-per-fasce-di-eta/

https://www.onb.it/2018/11/11/influenza-unepidemia-di-equivoci/

22
Vaccine. 2020 Jan 10;38(2):350-354. doi: 10.1016/j.vaccine.2019.10.005..
Influenza vaccination and respiratory virus interference among Department of Defense personnel during the
2017-2018 influenza season.
Wolff GG1.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7126676/pdf/main. pdf

Clin Microbiol Rev. 2018 Jul 5;31(4). pii: e00111-17. doi: 10.1128/CMR.00111-17.
Virological and Immunological Outcomes of Coinfections.
Kumar N1, Sharma S2, Barua S3, Tripathi BN3, Rouse BT4.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Jul 23;116(30):15194-15199. doi: 10.1073/pnas.1821317116.

13
personnes âgées les prédispose davantage à l'induction d'une aggravation des maladies
pulmonaires en cas de réinfection avec issue fatale, un mécanisme qui pourrait expliquer à la
fois les décès excessifs chez les personnes vaccinées avec le vaccin contre la grippe pendant
l'épidémie de grippe saisonnière23, qui pour le COVID-19, ceci en raison de la réactivité
croisée entre le vaccin contre la grippe et le coronavirus.

Antibody-dependent enhancement of influenza disease promoted by increase in hemagglutinin stem flexibility

and virus fusion kinetics.
Winarski KL1, Tang J1, Klenow L1, Lee J1, Coyle EM1, Manischewitz J1, Turner HL2, Takeda K1, Ward AB2,
Golding H1, Khurana S3.

Sci Transl Med. 2013 Aug 28;5(200):200ra114. doi: 10.1126/scitranslmed.3006366.

Vaccine-induced anti-HA2 antibodies promote virus fusion and enhance influenza virus respiratory disease.
Khurana S1, Loving CL, Manischewitz J, King LR, Gauger PC, Henningson J, Vincent AL, Golding H.

J Gen Virol. 2016 Jul;97(7):1489-1499. doi: 10.1099/jgv.0.000468. Epub 2016 Mar 31.
Vaccine-associated enhanced respiratory disease is influenced by haemagglutininand neuraminidase in whole
inactivated influenza virus vaccines.

Rajão DS1, Chen H2, Perez DR2, Sandbulte MR3, Gauger PC4, Loving CL1, Shanks GD5, Vincent A
https://www.researchgate.net/publication/49899173_Antibody-
Dependent_Enhancement_ADE_of_infection_and_its_possible_role_in_the_pathogenesis_of_influenza mBio.
2014 May 20;5(3):e01174-14. doi: 10.1128/mBio.01174-14.
Pathogenic influenza viruses and coronaviruses utilize similar and contrasting approaches to control
interferonstimulated gene responses.

Menachery VD1, Eisfeld AJ2, Schäfer A1, Josset L3, Sims AC1, Proll S3, Fan S2, Li C2, Neumann G2, Tilton SC4,
Chang J3, Gralinski LE1, Long C1, Green R3, Williams CM3, Weiss J3, Matzke MM4, Webb-Robertson BJ4,
Schepmoes AA4, Shukla AK4, Metz TO4, Smith RD4, Waters KM4, Katze MG, Kawaoka Y, Baric RS5.

Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Jul 1;105(26):9065-9. doi: 10.1073/pnas.0800502105.

Structure of coronavirus hemagglutinin-esterase offers insight into corona and influenza virus evolution. Zeng
Q1, Langereis MA, van Vliet AL, Huizinga EG, de Groot RJ.

Vet World. 2018 Jul;11(7):977-985. doi: 10.14202/vetworld.2018.977-985. Epub 2018 Jul 24.
Enhanced pathogenicity of low-pathogenic H9N2 avian influenza virus after vaccination with infectious
bronchitis live attenuated vaccine.
Ismail ZM1, El-Deeb AH1, El-Safty MM2, Hussein HA1.

https://sifmedico.it/wp-content/uploads/2019/06/Vaccino-quadrivalente-razionaleuso-1.pdf

Clin Rheumatol. 2018 Jun;37(6):1441-1448. doi: 10.1007/s10067-018-4078-2.

Autoimmune/inflammatory syndrome induced by mineral oil: a health problem.
Vera-Lastra O1,2, Medina G3,4, Cruz-Domínguez MP3,4, Ramírez GM5, Blancas RBP5, Amaro ALP3,4, Martínez
AV5, Delgado JS6, Jara LJ3,4.

23
Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Jul 23;116(30):15194-15199. doi: 10.1073/pnas.1821317116. Antibody-
dependent enhancement of influenza disease promoted by increase in hemagglutinin stem flexibility and virus
fusion kinetics.

Winarski KL1, Tang J1, Klenow L1, Lee J1, Coyle EM1, Manischewitz J1, Turner HL2, Takeda K1, Ward AB2,
Golding H1, Khurana S3.

Sci Transl Med. 2013 Aug 28;5(200):200ra114. doi: 10.1126/scitranslmed.3006366. Vaccine-induced anti-HA2
antibodies promote virus fusion and enhance influenza virus respiratory disease. Khurana S1, Loving CL,
Manischewitz J, King LR, Gauger PC, Henningson J, Vincent AL, Golding H.

14
Enfin, il convient de garder à l'esprit que les similitudes entre les protéines exprimées par
SARs-Cov-2 et le virus de la grippe sont déjà prédictives de ce phénomène: on sait que la
protéine hémagglutininestérase est similaire dans les deux virus et que la protéine de pointe
des coronavirus partage des caractéristiques communes avec la protéine de fusion de la
membrane virale de classe 1 des virus de la grippe24. Chez l'animal, ce phénomène est connu
pour son danger : dans une étude sur des poulets sur la grippe aviaire, l'augmentation de la
gravité et de la mortalité par complications de l'infection aviaire chez des poulets vaccinés
avec un virus atténué pour bronchite a été démontrée (le virus de la bronchite infectieuse,
IBV, est un gammacoronavirus qui présente également une homologie de séquence avec le
SRAS-Cov-2), par rapport à ceux non vaccinés, pour confirmer un effet potentialisateur entre
les deux25.
Il s'ensuit qu'il serait important d'analyser en détail toutes les données des patients COVID19
pour déterminer si un vaccin contre la grippe a été administré et, dans l'affirmative, la date
et le type de vaccin, et en particulier, il serait nécessaire d'étudier la relation entre les
vaccins trivalents adjuvés les plus recommandés en Italie*, et les résultats de mortalité, pour
déterminer si une condition de disparité virale26 se produit pendant laquelle la réponse
immunitaire aggrave l'état du patient. Il convient également de rappeler que l'adjuvant MF-
59 - squalène présent dans FLUAD a pour fonction de stimuler une réponse immunitaire plus
efficace en activant une inflammation très puissante (27) qui pourrait aggraver le syndrome
de la tempête des cytokines observé chez les patients COVID. 19.

* Le vaccin contre la grippe quadrivalent qui contient 2 souches de virus de type A (H1N1 et
H3N2) et 2 souches de virus de type B, appartenant aux deux lignées B / Victoria et B /
Yamagata permet de dépasser les limites liées au manque de protection contre la lignée B
non présent dans le vaccin trivalent, mais circulant, représentant un risque efficace pour les
populations vulnérables. La non-concordance entre les souches vaccinales et les virus en

J Gen Virol. 2016 Jul;97(7):1489-1499. doi: 10.1099/jgv.0.000468. Epub 2016 Mar 31.
Vaccine-associated enhanced respiratory disease is influenced by haemagglutinin and neuraminidase in whole
inactivated influenza virus vaccines.
Rajão DS1, Chen H2, Perez DR2, Sandbulte MR3, GaugerPC4, Loving CL1, Shanks GD5, Vincent A
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Dependent_Enhancement_ADE_of_infection_and_its_possible_role_in_the_pathogenesis_of_influenza

24
mBio. 2014 May 20;5(3):e01174-14. doi: 10.1128/mBio.01174-14. Pathogenic influenza viruses and
coronaviruses utilize similar and contrasting approaches to control interferonstimulated generesponses.
Menachery VD1, Eisfeld AJ2, Schäfer A1, Josset L3, Sims AC1, Proll S3, Fan S2, Li C2, Neumann G2, Tilton SC4,
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Schepmoes AA4, Shukla AK4, Metz TO4, Smith RD4, Waters KM4, Katze MG, Kawaoka Y, Baric RS5.

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hemagglutinin-esterase offers insight into corona and influenza virus evolution. Zeng Q1, Langereis MA, van
Vliet AL, Huizinga EG, de Groot RJ.

25
Vet World. 2018 Jul;11(7):977-985. doi: 10.14202/vetworld.2018.977-985. Epub 2018 Jul 24. Enhanced
pathogenicity of low-pathogenic H9N2 avian influenza virus after vaccination with infectious bronchitis live
attenuated vaccine. Ismail ZM1, El-Deeb AH1, El-Safty MM2, Hussein HA1.

26
https://sifmedico.it/wp-content/uploads/2019/06/Vaccino-quadrivalente-razionale-uso-1.pdf

15
circulation est appelée discordance : une discordance se produit lorsque la souche virale
recommandée contenue dans le vaccin ne correspond pas à la souche qui circule
principalement au cours de cette saison grippale. Étant donné que les vaccins trivalents ne
contiennent qu'une seule souche B, il est évident que la probabilité de non-concordance B
est particulièrement élevée ; l'incapacité de prédire correctement la lignée B prédominante
pendant la saison de la grippe a un impact négatif sur la protection individuelle contre la
grippe B, limitant l'efficacité des campagnes de vaccination contre la grippe.

Face à ce qui précède, seule une profonde ignorance fondamentale peut expliquer le sens
des choix opérés : à la fois le caractère obligatoire de la vaccination antigrippale et la
possibilité d'introduire le vaccin expérimental contre le SRAS-Cov-2 dans le vaccin contre la
grippe.

EFFICACITÉ ET SÉCURITÉ DES FUTURS VACCINS CONTRE LE SRAS-Cov-2

Allons maintenant voir en détail l'efficacité et la toxicité potentielles de ces vaccins.

EFFICACITÉ
Le SRAS-Cov-2 est un virus de structure et de caractéristiques pathologiques similaires au
SARS-Cov-1, responsable de l'épidémie en Chine en 2003. De nombreux vaccins ont été
développés contre ce virus qui n'ont jamais été commercialisés en raison de leur faible
efficacité et réactions immunopathologiques graves27. On savait déjà depuis un certain
temps au moment de la notification des premiers cas de COVID-19 que les virus du SRAS
sont des agents infectieux caractérisés par une instabilité génétique qui détermine
l'apparition de quasi-espèces, c'est-à-dire une grande population de mutants très similaires
les uns aux autres, qui rivalisent pendant l'épidémie et changent, déjà dans l'organisme des
infectés. La présence de quasi-espèces virales est considérée comme responsable de
l'impossibilité de produire un vaccin efficace et, dans le cas des vaccins atténués, de la
réversion chez les nouveaux mutants virulents. Pour cette raison, même les vaccins contre le
SRAS-Cov-2, à la fois biotechnologiques et atténués ou inactivés, présenteront cet aspect
critique qui est à la base de l'inefficacité de la vaccination. Dans le cas des coronavirus SARS-
Cov-128 et SARS-Cov-229, la littérature confirme la formation de populations mutantes et la

27
Expert Rev Vaccines. 2009 Jul;8(7):887-98. doi: 10.1586/erv.09.43.
SARS vaccines: where are we?
Roper RL1, Rehm KE.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7105754/pdf/IERV_4_11218665.pdf

28
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Infidelity of SARS-CoV Nsp14-exonuclease mutant virus replication is revealed by complete genome sequencing.
Eckerle LD, Becker MM, Halpin RA, Li K, Venter E, Lu X, Scherbakova S, Graham RL, Baric RS, Stockwell TB, Spiro
DJ, Denison MR.

RNA Biol. 2011 Mar-Apr;8(2):270-9.

Coronaviruses: an RNA proofreading machine regulates replication fidelity and diversity.

16
difficulté, sinon l'impossibilité, d'obtenir un vaccin suffisamment efficace pour protéger la
population lors d'une épidémie de grande ampleur30. L'immunité vis-à-vis du troupeau
vaccinal n'est donc qu'un simple paramètre théorique sans aucune confirmation réelle, car à
mesure que la couverture vaccinale augmente, la poussée sélective des populations
mutantes vers des formes de vaccins plus résistantes augmente plus rapidement, rendant la
vaccination inutile et augmentent la sélection de mutants encore plus pathogènes. Il est
pertinent de noter qu'au cours de la pandémie actuelle, de nombreux mutants de virulence
différente ont été trouvés précisément à la suite de la transmission intra-humaine31.

Denison MR1, Graham RL, Donaldson EF, Eckerle LD, Baric RS.

N Engl J Med. 2004 Mar 25;350(13):1366-7.

SARS-associated coronavirus quasispecies in individual patients.
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The large 386-nt deletion in SARS-associated coronavirus: evidence for quasispecies?
Tang JW1, Cheung JL, Chu IM, Sung JJ, Peiris M, Chan PK.

29
Genomic epidemiology of novel coronavirus - Global subsampling
https://nextstrain.org/ncov/global?m=div&r=division

Preprints 2020, 2020040286 doi: 10.20944/preprints202004.0286.v1

Comparative Domain-Fold Analysis of the SARS-CoV-2 ORF1ab Polyprotein: Insight into Co-Evolution,
Conservation of Folding Patterns, Potential Therapeutic Strategies, and the Possibility of Reemergence.
Karmakar, S.; Kumar, S.; Katiyar, V.

PLoS Med. 2005 Feb;2(2):e43. Epub 2005 Feb 22.

SARS transmission pattern in Singapore reassessed by viral sequence variation analysis.
Liu J1, Lim SL, Ruan Y, Ling AE, Ng LF, Drosten C, Liu ET, Stanton LW, Hibberd ML.

bioRxiv 2020.03.27.009480; doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.27.009480

SARS-CoV-2 exhibits intra-host genomic plasticity and low-frequency polymorphic quasispecies
Timokratis Karamitros, Gethsimani Papadopoulou, Maria Bousali, Anastasios Mexias, Sotiris Tsiodras, Andreas
Mentis

Clin Microbiol Infect. 2020 Mar 28. pii: S1198-743X(20)30165-8. doi: 10.1016/j.cmi.2020.03.020.
Molecular characterization of SARS-CoV-2 in the first COVID-19 cluster in France reveals an amino acid deletion
in nsp2 (Asp268del).
Bal A1, Destras G2, Gaymard A2, Bouscambert-Duchamp M3, Valette M3, Escuret V2, Frobert E2, Billaud G3,
Trouillet-Assant S4, Cheynet V5, Brengel-Pesce K5, Morfin F2, Lina B2, Josset L6.

30
Evolution (N Y). 2011 Dec;4(4):635-643.
The double-edged sword: How evolution can make or break a live-attenuated virus vaccine.
Hanley KA1.

31
bioRxiv 2020.04.29.069054; doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.29.069054
Spike mutation pipeline reveals the emergence of a more transmissible form of SARS-CoV-2
Bette Korber, Will Fischer, S. Gnana Gnanakaran, Heyjin Yoon, James Theiler, Werner Abfalterer, Brian Foley,
Elena E Giorgi, Tanmoy Bhattacharya, Matthew D Parker, David G Partridge, Cariad M Evans, Thushan de Silva,
Celia C LaBranche, David C Montefiori, Sheffield COVID-19 Genomics Group

National Science Review, 03 March 2020 nwaa036, https://doi.org/10.1093/nsr/nwaa036

On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2

17
En ce qui concerne l'utilisation de vaccins techniques construits à partir des séquences
déposées dans les bases de données (en général, à partir des séquences préservées de la
protéine spike), le problème de la présence des quasi-espèces est encore plus marqué et
critique pour son efficacité, et conduira au résultat - déjà connu aujourd'hui - qu'une grande
partie de la population mondiale sera en tout cas susceptible de se réinfecter et de subir ses
conséquences négatives, voire fatales.

Xiaolu Tang1,7 , Changcheng Wu1,7 , Xiang Li2,3,4,7 , Yuhe Song2,5,7 , Xinmin Yao1 , Xinkai Wu1 , Yuange
Duan1 , Hong Zhang1 , Yirong Wang1 , Zhaohui Qian6 , Jie Cui2,3,*, and Jian Lu1,*

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.14.20060160

Patient-derived mutations impact pathogenicity of SARS-CoV-2
Hangping Yao1 †, Xiangyun Lu1 †, Qiong Chen2†, Kaijin Xu1 , Yu Chen1, Linfang Cheng1 2 , Fumin Liu1 , Zhigang
Wu1 , Haibo Wu1 , Changzhong Jin1 , Min Zheng1 *, Nanping Wu1 3 *, Chao Jiang2,3*, Lanjuan Li1 4
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.14.20060160v1.full.pdf

J Transl Med. 2020 Apr 22;18(1):179. doi: 10.1186/s12967-020-02344-6.

Emerging SARS-CoV-2 mutation hot spots include a novel RNA-dependent-RNA polymerase variant.
Pachetti M1,2, Marini B3, Benedetti F4, Giudici F5, Mauro E3, Storici P1, Masciovecchio C1, Angeletti S6,
Ciccozzi M6, Gallo RC7,8, Zella D9,10, Ippodrino R11.

18
 APPROFONDISSEMENT

Les Quasi-espèces

Les quasi-espèces virales sont définies comme des « collections » de génomes viraux
étroitement apparentés, soumises à un processus continu de variation génétique, de
compétition entre les variantes générées et de sélection des distributions les plus
appropriées dans un environnement donné32. Ces distributions mutantes (également
appelées « essaims mutants » ou « nuages mutants ») sont générées dans des cellules et des
organismes infectés, à la suite de la réplication de virus à ARN et de certains virus à ADN.

Il est important de souligner que, grâce à l'utilisation de modèles mathématiques

développés à cet effet, il a été possible de vérifier que les quasi-espèces virales ne sont pas
simplement une collection de différents mutants, mais un groupe de variantes interactives,
qui contribuent ensemble aux caractéristiques de la population33. Les spectres mutants sont
à l'origine de l'adaptabilité du virus car ils constituent des dépôts dynamiques (en constante
évolution) de variantes virales génotypiques et phénotypiques. La figure34 suivante montre
une représentation schématique qui décrit le concept de quasi-espèce de manière simple :
un génome viral « parental » (point noir rempli) donne lieu à différentes variantes (carrés
colorés, prismes et étoiles). Les cercles concentriques représentent les cycles de réplication.
La distribution résultante après des cycles de réplication répétés est souvent appelée le «
nuage ».

32
PLoS Genet. 2019 Oct 17;15(10):e1008271. doi: 10.1371/journal.pgen.1008271.
Viral quasispecies.
Domingo E1,2, Perales C1,2,3.

Eur Biophys J. 2018 May;47(4):443-457. doi: 10.1007/s00249-018-1282-6.

Quasispecies and virus.
Domingo E1,2, Perales C3,4,5

Infect Genet Evol. 2020 Mar 9;82:104278. doi: 10.1016/j.meegid.2020.104278.

A new implication of quasispecies dynamics: Broad virus diversification in absence of external perturbations.
Domingo E1, Soria ME2, Gallego I3, de Ávila AI4, García-Crespo C4, Martínez-González B2, Gómez J5, Briones
C6, Gregori J7, Quer J8, Perales C9.

33
Sci Am. 1993 Jul;269(1):42-9.
Viral quasispecies.
Eigen M1.

34
World J Hepatol. 2015 Apr 28;7(6):831-45. doi: 10.4254/wjh.v7.i6.831.
Hepatitis C virus genetic variability and evolution.
Echeverría N1, Moratorio G1, Cristina J1, Moreno P1.

19
 Extrait de https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4411526/pdf/WJH-7-831.pdf
Le concept de quasi-espèces est né d'une formulation théorique qui a émis l'hypothèse de
l'évolution des formes de vie primitives grâce à la réplication sujette aux erreurs de réplicas
d'ARN simple ou de type « ARN ».35
Le séquençage de nouvelle génération (NGS) a considérablement élargi la capacité
d'examiner la composition de quasi-espèces virales mutantes dans des substrats
complexes36.

35
Naturwissenschaften. 1971 ;58 ;465-523.
Self-organization of matter and the evolution of biologica macromolecules.
Eigen M.

Int J Mol Sci.2019 Sep 19;20(2018). Pli: E4657. Doi:10.3390/ijms20184657.

Impact of RNA Virus Evolution on Quasispecies Formation and Virulence.
Mandary NB1, Masomian M1, Poh CL2.

36
Curr Top Microbiol Immunol. 2016;392:181-200. doi: 10.1007/82_2015_462. Estimating Fitness of Viral
Quasispecies from Next-Generation Sequencing Data Seifert D1, Beerenwinkel N2.

Domingo E., Schuster P. (eds) Quasispecies: From Theory to Experimental Systems.

Current Topics in Microbiology and Immunology, vol 392.2016 Springer International Publishing,
ISBN 978-3-319-23898-2

Virus Res. 2020 Apr 9;283:197963. doi: 10.1016/j.virures.2020.197963.

20
Grâce à ces technologies, il a été possible de mettre en évidence que les virus à ARN et un
grand nombre de virus à ADN sont des entités extrêmement dynamiques en raison de
l'occurrence continue de mutations, et dans certains cas avec la recombinaison et le
réassortiment du segment génomique, lors de leur réplication.
Un tel dynamisme moléculaire a sa base dans la fidélité de copie limitée manifestée par les
ARN polymérases ARN-dépendantes (également appelées ARN réplicases), les ADN
polymérases ARN-dépendantes (ou transcriptions inverses, RT) et certaines ADN
polymérases ADN-dépendantes.
Les taux d'erreur pour les virus à ARN, les rétrovirus et certains virus à ADN sont de l'ordre
de 10¯³ à 10¯5 mutations introduites par nucléotide copié, 104 à 106 fois plus élevées que
celles qui se produisent lors de la réplication chromosomique normale de l'ADN portable.
Les taux d'erreur élevés sont à la base de la dynamique des quasi-espèces, caractérisée par
deux propriétés principales :
1. Les virus se répliquent sous la forme d'un ensemble de génomes variants (appelés
spectres mutants, distributions, nuages ou essaims) qui diffèrent les uns des autres
par une ou plusieurs mutations. Le nombre moyen de mutations par génome dans un
spectre mutant est une mesure de la complexité génétique de la population virale,
qui est un paramètre multifactoriel.
2. La principale conséquence de la réplication du virus en tant que spectre mutant est
qu'il n'y a pas de « séquence » ou de « génome » d'un virus isolé, comme cela est
encore décrit de manière trompeuse avec la séquence nucléotidique du génome viral
rapportée dans les bases de données, et toujours dans certaines publications. La
réalité quelque peu inconfortable de nos tendances réductionnistes est que les
populations virales sont des mélanges de mutants, contrairement à ce que l'on
pourrait spéculer lorsque seules les séquences consensus sont considérées.
La présence d'un nombre abondant de génomes mutants au sein d'une population donne
aux virus le potentiel d'évolution rapide, avec une série de conséquences médicales qui se
révèlent progressivement37.
La propagation du virus dans la nature peut être le résultat de des contacts directs entre des
hôtes infectés et sensibles (hôte à hôte) ou une série d'événements plus complexes tels que
le transfert de virus d'invités infectés vers des objets externes (objet à hôte) qui à leur tour
deviennent une source de virus. Dans chaque phase de transmission d'hôte à hôte ou d'objet
à hôte, les incertitudes découlant de la présence de plusieurs types de génomes limitent la
prévisibilité des résultats évolutifs.

De plus, pour tout virus, l'invasion d'un nouvel hôte sensible est un nouveau départ pour les
événements évolutifs.
Chaque fois que l'hôte reçoit un ensemble non identique de génomes infectieux, il doit faire
face à une série unique de pressions sélectives, étudiées par la philodynamie, c'est-à-dire par

Applying next-generation sequencing to unravel the mutational landscape in viral quasispecies. Lu IN1, Muller
CP2, He FQ3.
37
Domingo, E., 2020.
Virus as Populations,
Second ed. Academic Press, Elsevier, Amsterdam.

21
l'analyse des forces immunologiques, épidémiologiques et évolutives qui influencent les
arbres phylogénétiques des génomes de virus isolés d'individus infectés38.

Un résumé schématique de deux phases dans lesquelles les processus évolutifs du virus
peuvent être divisés. - La phase 1 consiste en les événements évolutifs qui se produisent
chez un individu infecté lorsque des particules virales (représentées ici comme une
collection limitée de génomes non identiques) se répliquent dans une mosaïque
d'environnements différents. La nature du spectre mutant des différents sous-groupes de
réplication des génomes viraux rend imprévisibles les types de variants qui seront sécrétés
ou excrétés pour atteindre un individu sensible afin de démarrer un nouveau processus de
phase 1. - La phase 2 se réfère à plusieurs événements de transmission à partir de sujets
infectés chez des sujets sensibles (contours vides) pour produire une évolution à long terme
des séquences génomiques virales. L'intervalle de temps peut varier de quelques jours à
plusieurs décennies. La transmission peut être directe ou indirecte avec de multiples
incertitudes résultant de nombreuses contraintes sélectives et différences
environnementales39.

Tiré de https://www.slideserve.com/liluye/virus-evolution

La présence de quasi-espèces dans les vaccins à virus vivants atténués a déjà été décrite
dans la littérature. La séquence génomique et les caractéristiques biologiques des sous-
populations de quasi-espèces peuvent différer considérablement et la sélection d'une sous-
population plus virulente chez l'hôte vacciné peut avoir des conséquences néfastes. Par
exemple, il est documenté que le virus contenu dans le vaccin contre les oreillons est une
distribution de quasi-espèces mutantes et la neuro-virulence a été associée à des
38
Science 303, 327–332.2004.
Unifying the epidemiological and evolutionary dynamics of pathogens.
Grenfell, B.T., Pybus, O.G., Gog, J.R., Wood, J.L., Daly, J.M., Mumford, J.A., Holmes, E.C.,

39
Infect Genet Evol. 2020 Mar 9;82:104278. doi: 10.1016/j.meegid.2020.104278.
A new implication of quasispecies dynamics: Broad virus diversification in absence of external perturbations.
Domingo E1, Soria ME2, Gallego I3, de Ávila AI4, García-Crespo C4, Martínez-González B2, Gómez J5, Briones
C6, Gregori J7, Quer J8, Perales C9.

22
changements dans le niveau d'hétérogénéité génétique dans des sites génomiques
spécifiques40.

La souche Urabe utilisée dans le passé dans le vaccin contre les oreillons (qui n'est plus
utilisée en raison de la forte neuro-virulence), contient des sous-populations qui diffèrent
par la séquence du gène de l'hémagglutinine-neuroaminidase et par la propension à
provoquer une méningite post-vaccinale41.
Virus de la vaccination contre la varicelle vOka, depuis 2002, il est connu qu'il ne s'agit pas
d'un virus unique mais d'un mélange viral42. Les populations de virus de la rougeole sont
également des quasi-espèces. Déjà dans un travail de 1988, l'analyse des infections des
cellules HeLa avec une souche vaccinale contre le virus de la rougeole avait estimé une
diversité intra-population de 6 à 9 positions par génome43.

« Lorsque les implications de la dynamique des quasi-espèces ont été comprises, il est devenu
clair que les vaccins synthétiques ou les agents antiviraux utilisés en monothérapie étaient
voués à l'échec. Il est paradoxal que d'importants progrès de la biotechnologie dans la
seconde moitié du 20e siècle aient poussé les interventions antivirales dans la direction
opposée à ce qui est nécessaire pour contrôler les maladies associées aux virus qui forment
des quasi-espèces. En fait, les vaccins synthétiques constitués de peptides antigéniques ou de
protéines exprimées par des vecteurs biologiques sont devenus accessibles à la production
biotechnologique avec l'avènement de la technologie de synthèse des peptides et des
méthodes d'ADN recombinant. Des simplifications conceptuelles excessives, associées à la
facilité de production d'antigènes synthétiques, ont conduit à des centaines de projets sans
perspective de pouvoir prévenir efficacement les maladies associées aux essaims d'espèces.
Lacomplexité ne peut pas être combattue avec simplicité. » (Prof. E. Domingo)44

40
Virology. 2006 Jun 20;350(1):48-57.
Changes in mumps virus neurovirulence phenotype associated with quasispecies heterogeneity.
Sauder CJ, Vandenburgh KM, Iskow RC, Malik T, Carbone KM, Rubin SA.

Acta Neuropathol. 2017 Jan;133(1):139-147. doi: 10.1007/s00401-016-1629-y.

Deep sequencing reveals persistence of cell-associated mumps vaccine virus in chronic encephalitis.
Morfopoulou S1, Mee ET2, Connaughton SM2, Brown JR3, Gilmour K4, Chong WK5, Duprex WP6, Ferguson D2,
Hubank M7, Hutchinson C8, Kaliakatsos M9, McQuaid S10,11, Paine S8,12, Plagnol V13, Ruis C14, Virasami A8,
Zhan H15, Jacques TS8,16, Schepelmann S2, Qasim W17,18, Breuer J14,3.

41
J Med Virol. 2009 Jan;81(1):130-8. doi: 10.1002/jmv.21381.
Identification of genetic mutations associated with attenuation and changes in tropism of Urabe mumps virus.
Shah D, Vidal S, Link MA, Rubin SA, Wright KE.

42
J. Virol. 76:11447–11459
Comparison of the complete DNA sequences of the Oka varicella vaccine and its parental virus. Gomi Y, et al.
2002.

43
Cell. 1988;55(2):255–65.
Biased hypermutation and other genetic changes in defective measles viruses in human brain infections.
Cattaneo R, Schmid A, Eschle D, Baczko K, ter Meulen V, Billeter MA.

44
Microbiol Mol Biol Rev. 2012 Jun;76(2):159-216. doi: 10.1128/MMBR.05023-11. Viral quasispecies evolution.
Domingo E1, Sheldon J, Perales C.
Domingo E (2020) Virus as Populations, 2nd ed. Academic Press, Elsevier, Amsterdam

23
 DÉFINITIONS

L'épitope (ou déterminant antigénique) est la petite partie de l'antigène qui se lie à
l'anticorps spécifique. La molécule d'antigène unique peut contenir plusieurs épitopes
reconnus par différents anticorps.45

45
https://medicinaonline.co/2017/03/18/antigene-cose-e-perche-e-importante-per-il-sistema-immunitario/
https://medicinaonline.co/2017/03/17/differenza-tra-antigene-aptene-allergene-ed-epitopo/
https://medicinaonline.co/2017/03/16/epitopi-sequenziali-e-conformazionali-cosa-sono-e-come-funzionano/

24
Anticorps
Tous les anticorps partagent les mêmes caractéristiques structurelles de base (ressemblent à
un Y), mais montrent une variabilité considérable dans les régions qui se lient à l'antigène, ce
qui explique la capacité des anticorps à se lier à un grand nombre d'antigènes
structurellement différents. Une molécule d'anticorps a une structure symétrique composée
de deux chaînes légères et de deux chaînes lourdes identiques, les deux types de chaînes
contiennent une série d'unités homologues répétées qui se replient pour former une
structure appelée le domaine Ig.

25
 TOXICITÉ

Concernant la toxicité potentielle, deux principaux mécanismes immunopathologiques sont

à signaler : le péché antigénique d'origine et le rehaussement dépendant des anticorps
(appelé ADE).

26
 « Le péché antigénique original46 (original antigenic sin) et la suppression
d'épitopes liés (linked-epitope suppression)47»

Ce mécanisme peut être résumé de manière très essentielle: lorsque le vacciné est infecté
par un mutant de virus sauvage différent de l'antigène vaccinal, son système immunitaire
adaptatif répond de manière non spécifique et faible, car il est programmé pour répondre
efficacement uniquement antigène vaccinal. Cela implique que le virus continue de répliquer
chez les vaccinés conduisant à une infection chronique avec le risque de développer un état
inflammatoire auto-immun à long terme et une récidive de l'infection sous forme atypique
et résistante aux traitements médicamenteux, ou elle peut déclencher une réaction
inflammatoire excessive (tempête de cytokines) avec conséquences particulièrement
dangereuses pour le vacciné.

46
Immune Netw. 2016 Oct;16(5):261-270.
Original Antigenic Sin Response to RNA Viruses and Antiviral Immunity.
Park MS1, Kim JI1, Park S1, Lee I1, Park MS1.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5086450/pdf/in-16-261.pdf

The Open Immunology Journal 2018, 08, 16-27 DOI: 10.2174/1874226201808010016

Inter-Pathogen Peptide Sharing and the Original Antigenic Sin: Solving a Paradox
Darja Kanduc1,* and Yehuda Shoenfeld
https://benthamopen.com/contents/pdf/TOIJ/TOIJ-8-16.pdf

Front Biosci (Schol Ed). 2012 Jun 1;4:1393-401.

Peptide cross-reactivity: the original sin of vaccines.
Kanduc D1.
https://www.bioscience.org/2012/v4s/af/341/fulltext.php?bframe=2.htm

J Autoimmun. 2017 Sep;83:12-21. doi: 10.1016/j.jaut.2017.04.008.

Original antigenic sin: A comprehensive review.
Vatti A1, Monsalve DM2, Pacheco Y2, Chang C1, Anaya JM2, Gershwin ME3.

Cold Spring Harb Perspect Med. 2020 Jan 21. pii: a038786. doi: 10.1101/cshperspect.a038786.
Original Antigenic Sin: How Original? How Sinful?
Yewdell JW1, Santos JJS
Cold Spring Harb Perspect Biol. 2017 Dec 1;9(12). pii: a029629. doi: 10.1101/cshperspect.a029629. What Is
Wrong with Pertussis Vaccine Immunity? Inducing and Recalling Vaccine-Specific Immunity. Eberhardt CS1,2,
Siegrist CA1,3.

47
J Pediatric Infect Dis Soc. 2019 Sep 25;8(4):334-341. doi: 10.1093/jpids/piz005. The 112-Year Odyssey of
Pertussis and Pertussis Vaccines-Mistakes Made and Implications for the Future. Cherry JD1.
Clin Vaccine Immunol. 2010 May;17(5):741-7. doi: 10.1128/CVI.00469-09. Antibody response patterns to
Bordetella pertussis antigens in vaccinated (primed) and unvaccinated (unprimed) young children with
pertussis. Cherry JD1, Heininger U, Richards DM, Storsaeter J, Gustafsson L, Ljungman M, Hallander HO.

27
 APPROFONDISSEMENT

Le péché antigénique original

Dans les années 40, Francis et ses collègues ont observé que lorsque des vaccins contre la
grippe A étaient administrés à des enfants et des adultes plus âgés, la réponse en anticorps
ne correspondait pas à l'antigène de la grippe vaccinale. Au contraire, cela semblait
dépendre de l'âge des receveurs, chaque groupe a répondu avec des anticorps qui
réagissaient le mieux avec le sous-type de virus qu'ils avaient connu en premier dans leur
vie. Dans la pratique, les personnes vaccinées contre une souche de grippe avaient produit
des anticorps de titre supérieur contre une souche de grippe différente qui avait été leur
première expérience de la grippe dans l'enfance, même si cette souche était absente du
vaccin.

Le phénomène a été appelé « péché antigénique d'origine » et est également connu sous le
nom d'effet Hoskins. De nombreuses études suggèrent que la présence de séquences
peptidiques similaires entre les deux virus (vaccins et réinfection) conduit à l'activation des
cellules mémoire mais avec une réponse ciblée aux antigènes de la réponse primaire, avec
pour conséquence un échec vaccinal48.

Le mécanisme physiopathologique du « péché antigénique d'origine » comprend les deux

composantes immunologiques innées et adaptatives du système immunitaire, qui
influencent la façon dont le corps active une réponse secondaire à la réexposition à un
antigène. Normalement, lors de la première exposition à un antigène pathogène, la réponse
initiale implique le système immunitaire inné, qui reconnaît l'antigène comme « nouveau »,
étranger et / ou dangereux et active les cellules présentatrices d'antigène (APC) pour
stimuler davantage la réponse à travers le système immunitaire adaptatif. Les APC traitent et
présentent des antigènes aux lymphocytes T naïfs par le biais du complexe majeur
d'histocompatibilité (CMH), activant ainsi des lymphocytes antigéniques spécifiques. Cela
conduit à des cellules effectrices B, des cellules effectrices T et des cellules mémoire
produites dans un processus appelé expansion clonale.

Les cellules B activées, ou plasmocytes, produisent des anticorps spécifiques pour identifier
et « capturer » les antigènes pathogènes, qui sont ensuite avalés par les phagocytes et
détruits, protégeant ainsi le corps contre les effets nocifs de l'infection. La réponse
immunitaire adaptative à la première exposition à l'antigène prend du temps et doit passer
par les phases de reconnaissance, d'amplification et de réponse. L'ensemble du processus
est connu comme la réponse principale, qui se produit après l'exposition à un tout nouvel
agent pathogène et prend environ deux semaines pour suivre son cours.

48
Front Biosci (Schol Ed). 2012 Jun 1;4:1393-401.
Peptide cross-reactivity: the original sin of vaccines.
Kanduc D1.

Open Immunol J 2018;8:11–27

Inter-pathogen peptide sharing and the original antigenic sin: Solving a paradox
Kanduc D, Shoenfeld Y,
https://benthamopen.com/FULLTEXT/TOIJ-8-16

28
Tiré de : Elsevier's Integrated Immunology and Microbiology Book by Jeffrey K. Actor
https://www.elsevier.com/books/elseviers-integrated-review-immunology-
andmicrobiology/actor/978-0-323-07447-6

Après une deuxième exposition au même pathogène, la réponse se produit de manière

similaire mais à un rythme beaucoup plus rapide car les cellules B et T sont déjà entrées en
contact avec l'antigène du pathogène et sont capables de le reconnaître beaucoup plus
rapidement.
Les étapes suivantes sont beaucoup plus rapides et les anticorps sont également produits
plus rapidement et en plus grande quantité.
La réponse secondaire permet une élimination rapide du pathogène et ce mécanisme est à
la base de l'utilisation des vaccins. La fonction des vaccins devrait être de fournir une
exposition moins nocive à un agent pathogène de sorte que si le corps est à nouveau exposé
à un virus sauvage à l'avenir, le corps puisse réagir beaucoup plus rapidement. Cependant,
c'est lors de cette réponse secondaire que le problème du « péché antigénique originel »
peut aggraver la pathogénicité de l'infection.

Le mécanisme du « péché antigénique d'origine » se produit lorsque le corps est à nouveau

exposé à un pathogène légèrement évolué ou différent.
Dans ce cas, en raison de l'exposition précédente au premier antigène, les lymphocytes de la
mémoire ne répondent pas à la variante de l'antigène lui-même, mais interprètent et
répondent au deuxième antigène comme s'il s'agissait de l'antigène d'origine.
Lorsque le deuxième antigène est suffisamment différent de l'antigène d'origine, la réponse
du système immunitaire au second antigène est moins précise et par conséquent moins
efficace pour éliminer l'agent pathogène.
Dans la situation la plus extrême, la reconnaissance du pathogène par le système
immunitaire peut être compromise au point d'entraîner une évasion complète du pathogène
de la réponse immunitaire, avec des conséquences fatales.

29
Légende : La première exposition d'un individu au virus peut modéliser la réponse
immunitaire humorale aux infections et vaccinations ultérieures, un phénomène décrit pour
la première fois en 1960 par Thomas Francis. Des études ultérieures ont montré que les
anticorps spécifiques à une souche rencontrés précédemment dans la vie sont souvent
potentialisés par des expositions ultérieures à des virus ayant une antigénicité associée. Une
réponse hiérarchique en anticorps est ensuite générée et maintenue car les souches
rencontrées précédemment sont rappelées le plus souvent. Les anticorps qui se forment à
partir d'infections antérieures peuvent être moins efficaces pour neutraliser les souches
virales circulantes lorsque l'antigénicité change en raison de la dérive de l'antigène (antigen
drift).49

Adapté de https://www.jimmunol.org/content/jimmunol/202/2/335.full.pdf

La suppression liée à l'épitope

Le mécanisme de suppression lié à l'épitope est sensiblement différent dans sa conception

de celui du péché antigénique d'origine, en ce qu'il suppose que le système immunitaire est
inhibé / supprimé dans la réponse à l'agent infectieux par les antigènes originaux présents
dans le vaccin et ne peut donc pas être utilisé comme terme équivalent.

En fait, comme on le verra dans le cas de la toxine ACT tétanique, le système immunitaire
reste pleinement fonctionnel mais est « programmé » pour répondre en permanence aux
antigènes d'origine, ceux présents dans le vaccin, il s'agit donc d'un véritable dommage au
vaccin et d'une formulation différente du vaccin qui ne permet pas de le surmonter.

49
J Immunol. 2019 Jan 15;202(2):335-340. doi: 10.4049/jimmunol.1801149.
Original Antigenic Sin: How First Exposure Shapes Lifelong Anti-Influenza Virus Immune Responses.
Zhang A1, Stacey HD1, Mullarkey CE1, Miller MS2.

30
Le cas de la coqueluche
La toux est principalement causée par le coccobacill Gram négatif Bordetella pertussis, et est
une maladie respiratoire grave qui peut être mortelle, en particulier chez les jeunes enfants.
Il a récemment connu un retour spectaculaire dans des pays à couverture vaccinale élevée,
comme les États-Unis, l'Australie et de nombreux pays européens. Bien qu'une tendance à
une incidence plus élevée de coqueluche soit déjà visible avant la transition des vaccins à
cellules entières aux vaccins acellulaires, c'est précisément avec l'introduction des vaccins
acellulaires que le nombre de cas aatteint des niveaux record50.

La toxine coquelucheuse (PT) et la toxine adénylate cyclase (ACT) sont deux facteurs de
virulence importants de Bordetella pertussis ; en particulier, la toxine ACT se forme lorsque
la bactérie se lie à l'épithélium bronchique in vivo et peut donc difficilement être obtenue à
partir de lignées cellulaires en quantités suffisantes pour produire un antigène vaccinal51.

Pendant le développement des vaccins acellulaires contre la coqueluche (aP), PT a été choisi
comme antigène principal. Sa préparation nécessitait une détoxication pour laquelle deux
options étaient disponibles dans les années 80 : la détoxication chimique conventionnelle
après sa production au formaldéhyde ou la modification génétique des souches de
Bordetella pertussis qui produisent des PT génétiquement détoxifiés. Les vaccins aP
actuellement autorisés comprennent le PT chimiquement détoxifié qui implique la
dénaturation des protéines et donc des altérations potentielles de la structure
tridimensionnelle.
Une étude qui a utilisé des anticorps monoclonaux compétitifs a montré que ce processus de
dénaturation génère des épitopes distincts de ceux présents sur le PT d'origine, par
conséquent, l'activation de la réponse immunitaire par le premier vaccin suivie d'appels
répétés avec le PT chimiquement détoxifié génère probablement des cellules effectrices et
mémoire B qui sont de plus en plus spécifiques au vaccin et de moins en moins compétents
pour se lier au PT natif structurellement distinct.
Les différences entre les antigènes naturels et les vaccins peuvent également résulter d'un
changement dans le phénotype des souches de coqueluche (c'est-à-dire de l'apparition de
nouveaux mutants résistants), cependant, le manque d'expression de la pertactine (PRN) n'a
pas affecté l'efficacité du vaccin. Il s'ensuit donc que la dénaturation chimique du PT (péché
« chimique » d'origine), qui réduit encore l'immunogénicité déjà modeste du vaccin, est
principalement responsable de la perte progressive de la réponse immunitaire aux rappels
de vaccination.

50
Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Jan 14;111(2):787-92. doi: 10.1073/pnas.1314688110.
Acellular pertussis vaccines protect against disease but fail to prevent infection and transmission in a nonhuman
primate model.
Warfel JM1, Zimmerman LI, Merkel TJ.

51
Future Microbiol. 2010 Mar;5(3):455-69. doi: 10.2217/fmb.09.133.
Pertussis toxin and adenylate cyclase toxin: key virulence factors of Bordetella pertussis and cell biology tools.
Carbonetti NH1.

31
 Extrait de https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5710108/pdf/cshperspect-IMP-a029629.pdf

Légende : Réponses des cellules de la toxine B de la coqueluche aux immunisations primaires

et rappel de la coqueluche acellulaire (aP) ou suite à une exposition à Bordetella pertussis. La
réponse immunitaire au déclenchement avec aP (A) conduit à la formation de cellules B à
partir de la mémoire de la toxine coquelucheuse (PT). Ceux-ci sont dirigés contre les épitopes
uniques du PT dénaturé (rouge) ou du PT sauvage (bleu). Avec l'augmentation du nombre de
doses (et donc avec l'âge) à l'augmentation (B) du pourcentage de cellules B de mémoire
anti-PT spécifique, il y a une diminution proportionnelle pour les PT de type sauvage. En
conséquence, de moins en moins de cellules B spécifiques de PT de type sauvage sont
disponibles pour la réactivation au moment de l'exposition à B. pertussis.
Quant à l'ACT, en cas de contraction naturelle de la maladie, l'immunité contre l'ACT
constitue la base de la réponse immunitaire initiale, cruciale pour éliminer les bactéries lors
de la réinfection.
L'immunité créée par un vaccin acellulaire est exempte d'anticorps dirigés contre ACT car il
n'est pas présent parmi les antigènes détoxifiés (les trois anatoxines coquelucheuses
normalement présentes dans les vaccins sur le marché sont : l'anatoxine coquelucheuse (PT),
l'hémagglutinine filamenteuse (FHA), la pertactine (PRN)52 et l'immunité contre l'ancien

52
Recommendations to assure the quality, safety and efficacy of acellular pertussis vaccines
https://www.who.int/biologicals/vaccines/TRS_979_Annex_4.pdf?ua=1

32
vaccin à cellules entières53 ont montré des niveaux d'anticorps ACT négligeables par rapport
à ceux produits à la suite d'une infection naturelle. Ainsi, lorsqu'une personne vaccinée
contracte la coqueluche, il n'existe aucune défense préalable contre l'ACT qui empêche les
bactéries d'infecter les cellules. Après un vaccin dans lequel l'ACT n'est pas présent, le
système immunitaire n'est plus en mesure de répondre à la toxine à l'avenir, car il reste
« planifié » par rapport au premier contact avec le contenu du vaccin et non avec des
bactéries infectieuses.
Dans un test de provocation in vivo sur des animaux, il a été constaté qu'après la réinfection,
ceux qui avaient déjà contracté la maladie et produit des anticorps protecteurs n'étaient pas
colonisés par des bactéries, ceux qui ne l'avaient jamais contracté mettaient environ 30 jours
pour les éliminer, ceux qui avait été vacciné avec un vaccin acellulaire, les avait
complètement éliminés après 35 jours. Cela signifie que ceux qui avaient été vaccinés, tout
en ne présentant pas les symptômes de la maladie infectieuse, ou en les présentant sous
forme atypique, ont pu infecter leurs contacts comme ceux qui ont développé la maladie
pour la première fois54.

Il s'ensuit que la réapparition de la coqueluche dans des populations hautement vaccinées,

en particulier avec le vaccin aP, n'est pas attribuable à une mauvaise efficacité du vaccin
mais à une programmation incorrecte du système immunitaire provoquée par le vaccin lui-
même, beaucoup moins est due à la présence parmi la population de personnes jamais
vaccinées naturellement, immunisées contre la maladie55.

Il convient de noter que le péché antigénique d'origine peut également expliquer un autre
mécanisme d'échec du vaccin : la suppression de la réponse anticorps induite par le porte-
vaccin56.

Les vaccins conjugués sont constitués de l'antigène du vaccin et d'un vecteur, généralement
l'anatoxine tétanique ou diphtérique, ce qui augmente sa stabilité et son efficacité pour
stimuler la réponse immunitaire. Si des vaccins contre le tétanos et la diphtérie ont déjà été
administrés, suite à l'inoculation du vaccin conjugué, la réponse immunitaire contre
l'antigène du tétanos ou le vaccin antidiptère est activée plutôt que contre le porteur du
vaccin conjugué, avec une perte rapide d'efficacité également contre l'antigène du vaccin. Ce

53
Annex 6 Recommendations for whole-cell pertussis vaccine
https://www.who.int/biologicals/publications/trs/areas/vaccines/whole_cell_pertussis/Annex%206%20whole%
2 0cell%20pertussis.pdf?ua=1

54
Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Jan 14;111(2):787-92. doi: 10.1073/pnas.1314688110.
Acellular pertussis vaccines protect against disease but fail to prevent infection and transmission in a nonhuman
primate model.
Warfel JM1, Zimmerman LI, Merkel TJ.

55
Malattie, vaccini e la storia dimenticata (dissolving illusions). Epidemie, contagi, infezioni. Cos'è cambiato
davvero in Occidente negli ultimi due secoli (Italiano) – 26 aprile 2018
di Suzanne Humphries (Autore), Roman Bystriany (Autore), M. Orazzini (Traduttore)
Capitolo Pertosse

56
Vaccine. 2010 Jul 26;28(33):5503-12. doi: 10.1016/j.vaccine.2010.02.103.
Carrier induced epitopic suppression of antibody responses induced by virus-like particles is a dynamic
phenomenon caused by carrier-specific antibodies.
Jegerlehner A1, Wiesel M, Dietmeier K, Zabel F, Gatto D, Saudan P, Bachmann MF.

33
phénomène, comme nous le verrons plus tard comme nous, a également un impact
important dans le développement du nouveau vaccin porteur adénoviral contre le SRAS-Cov-
2.

« Amélioration dépendante des anticorps » (ADE)57

Le deuxième mécanisme de toxicité est l’amélioration dépendante des anticorps, étudiée

pour le coronavirus SARS-Cov-258, mais étudiée plus en profondeur également pour SARS-
Cov-159, la MERS60, la Dengue61, le Zika virus62, Ebola63, le VIH64 et, comme déjà mentionné,

57
J Virol. 2020 Feb 14;94(5). pii: e02015-19. doi: 10.1128/JVI.02015-19.
Molecular Mechanism for Antibody-Dependent Enhancement of Coronavirus Entry.
Wan Y#1, Shang J#1, Sun S2, Tai W3, Chen J4, Geng Q1, He L2, Chen Y2, Wu J1, Shi Z4, Zhou Y2, Du L5, Li F6.

58
Nat Rev Immunol. 2020 Apr 21. doi: 10.1038/s41577-020-0321-6.
The potential danger of suboptimal antibody responses in COVID-19.
Iwasaki A1,2, Yang Y3.
https://www.nature.com/articles/s41577-020-0321-6

Swiss Med Wkly. 2020 Apr 16;150:w20249. doi: 10.4414/smw.2020.20249.

Is antibody-dependent enhancement playing a role in COVID-19 pathogenesis?
Negro F1.

Medical Countermeasures Analysis of 2019-nCoV and Vaccine Risks for Antibody-Dependent Enhancement
(ADE) (2/27/2020).
Ricke, Darrell and Malone, Robert W.,
http://dx.doi.org/10.2139/ssrn.3546070

59
Hong Kong Med J. 2016 Jun;22(3 Suppl 4):25-31.
Antibody-dependent enhancement of SARS coronavirus infection and its role in the pathogenesis of SARS.
Yip MS1, Leung HL1, Li PH1, Cheung CY2, Dutry I1, Li D1, Daëron M3, Bruzzone R4, Peiris JS1, Jaume M1.

Hong Kong Med J. 2012 Feb;18 Suppl 2:31-6.

SARS CoV subunit vaccine: antibody-mediated neutralisation and enhancement.
Jaume M1, Yip MS, Kam YW, Cheung CY, Kien F, Roberts A, Li PH, Dutry I, Escriou N, Daeron M, Bruzzone R,
Subbarao K, Peiris JS, Nal B, Altmeyer R.

J Virol. 2011 Oct;85(20):10582-97. doi: 10.1128/JVI.00671-11.

Anti-severe acute respiratory syndrome coronavirus spike antibodies trigger infection of human immune cells
via a pH- and cysteine protease-independent FcγR pathway.
Jaume M1, Yip MS, Cheung CY, Leung HL, Li PH, Kien F, Dutry I, Callendret B, Escriou N, Altmeyer R, Nal B,
Daëron M, Bruzzone R, Peiris JS.

Biochem Biophys Res Commun. 2014 Aug 22;451(2):208-14. doi: 10.1016/j.bbrc.2014.07.090.

Antibodydependent SARS coronavirus infection is mediated by antibodies against spike proteins.
Wang SF1, Tseng SP2, Yen CH3, Yang JY4, Tsao CH5, Shen CW6, Chen KH7, Liu FT5, Liu WT8, Chen YM9, Huang
JC10.

60
J Virol. 2020 Feb 14;94(5). pii: e02015-19. doi: 10.1128/JVI.02015-19.
Molecular Mechanism for Antibody-Dependent Enhancement of Coronavirus Entry.
Wan Y#1, Shang J#1, Sun S2, Tai W3, Chen J4, Geng Q1, He L2, Chen Y2, Wu J1, Shi Z4, Zhou Y2, Du L5, Li F6.

61
J Infect Dis. 2020 Apr 1. pii: jiz618. doi: 10.1093/infdis/jiz618.

34
la grippe saisonnière65.
Le mécanisme de potentialisation dépendant des anticorps est assez complexe, mais peut se
résumer comme suit : lorsqu'un sujet qui a un niveau d'anticorps sous-optimal (à la suite
d'une primo-infection ou d'une vaccination) entre en contact avec un virus similaire et
devient infecté, son système immunitaire favorise l'infection et les complications fatales de
la maladie.
En d'autres termes, une partie des vaccinés sont prédisposés par la vaccination à manifester
les complications graves et fatales de la maladie dont ils veulent se protéger.

La découverte du phénomène
Ce mécanisme a été découvert dans les années 1960, lorsque le dr. Scott Halstead et ses
collègues étudiaient le virus de la dengue en Thaïlande et ont noté que les personnes qui
avaient été exposées à la dengue une deuxième fois avaient un risque accru de dengue
sévère par rapport à celles qui n'avaient pas été exposées auparavant.
Normalement, après une infection par un agent pathogène, le corps « se souvient » de
l'infection pendant longtemps parce que les cellules B et T de mémoire restent dans le corps.
Parce qu'elles ressemblent à la première infection, ces cellules de mémoire peuvent réagir
rapidement pour fournir une réponse adaptative lorsqu'une infection survient une deuxième
fois. Les cellules de mémoire peuvent rester dans le corps d'une personne pendant de
nombreuses années, même toute une vie. Les chercheurs se sont demandé pourquoi ces

Antibody-Dependent Enhancement of Severe Disease Is Mediated by Serum Viral Load in Pediatric Dengue Virus
Infections.
Waggoner JJ1,2, Katzelnick LC3, Burger-Calderon R4, Gallini J5, Moore RH5, Kuan G6, Balmaseda A4,7, Pinsky
BA8,9, Harris E3.

Microbiol Spectr. 2014 Dec;2(6). doi: 10.1128/microbiolspec.AID-0022-2014.

Dengue Antibody-Dependent Enhancement: Knowns and Unknowns.
Halstead SB1.

Science. 2017 Nov 17;358(6365):929-932. doi: 10.1126/science.aan6836.

Antibody-dependent enhancement of severe dengue disease in humans.
Katzelnick LC1, Gresh L2, Halloran ME3,4, Mercado JC5, Kuan G6, Gordon A7, Balmaseda A5, Harris E1.

62
mBio. 2019 Sep 3;10(5). pii: e01849-19. doi: 10.1128/mBio.01849-19.
Complex Scenario of Homotypic and Heterotypic Zika Virus Immune Enhancement.
Marques ETA1,2, Drexler JF3,4.

63
Cell Rep. 2018 Aug 14;24(7):1802-1815.e5. doi: 10.1016/j.celrep.2018.07.035.
Antibody-Dependent Enhancement of Ebola Virus Infection by Human Antibodies Isolated from Survivors.
Kuzmina NA1, Younan P1, Gilchuk P2, Santos RI1, Flyak AI3, Ilinykh PA1, Huang K1, Lubaki NM1, Ramanathan
P1, Crowe JE Jr4, Bukreyev A5

64
Hum Vaccin Immunother. 2014;10(10):3013-6. doi: 10.4161/21645515.2014.972148.
Could vaccination with AIDSVAX immunogens have resulted in antibody-dependent enhancement of HIV
infection in human subjects?
Shmelkov E1, Nadas A, Cardozo T.

65
Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Jul 23;116(30):15194-15199. doi: 10.1073/pnas.1821317116.
Antibody-dependent enhancement of influenza disease promoted by increase in hemagglutinin stem flexibility
and virus fusion kinetics.
Winarski KL1, Tang J1, Klenow L1, Lee J1, Coyle EM1, Manischewitz J1, Turner HL2, Takeda K1, Ward AB2,
Golding H1, Khurana S3.

35
cellules de mémoire n'aident pas à combattre une deuxième infection à la dengue et
pourquoi une deuxième infection à la dengue est souvent pire que la première. Halstead a
proposé un phénomène appelé « potentialisation de l'infection dépendante des anticorps »
pour expliquer ces observations.
L’infection par le virus de la dengue (DENV) avec l'un des 4 sérotypes viraux apparentés
(DENV1 a DENV4) provoque une variété de manifestations cliniques, allant de la maladie
fébrile spontanément résolutive, connue sous le nom de fièvre dengue (DF), à des maladies
graves menaçant le pronostic vital, telles que la fièvre hémorragique Dengue (DHF) ou le
syndrome de choc de la dengue (DSS), caractérisées par une perte vasculaire, une
thrombocytopénie, des saignements et des taux élevés de cytokines, et les cellules de
mémoire ont été observées pour fournir l'immunité contre la réinfection uniquement avec le
sérotype Dengue qui a provoqué la première infection. Halstead a proposé que lorsqu'une
personne est infectée par un deuxième sérotype Dengue, les anticorps de la première
infection aident réellement à propager l'infection virale Dengue et à augmenter la virémie,
c'est-à-dire la quantité de virus dans la circulation sanguine. Ce phénomène peut également
se produire chez les enfants qui ont reçu des anticorps contre la dengue de leur mère
pendant la grossesse. Étonnamment, au lieu de détruire le virus, les anticorps existants et les
anticorps nouvellement produits par les cellules B de mémoire peuvent réellement aider le
virus à infecter les cellules hôtes plus efficacement. Ironiquement, la potentialisation
dépendante des anticorps a pour conséquence que la réponse du système immunitaire
aggrave réellement les symptômes cliniques de la dengue et augmente le risque de
complications graves66.

Il est à noter que les virus peuvent réagir de façon croisée en induisant une EIM (par
exemple virus Dengue / Zika ; SARS-Cov-2 / autres coronavirus).
Ce phénomène est bien documenté pour la Dengue / Zika : ils sont tous deux membres de la
famille des Flaviviridae, transmis par des vecteurs, et il existe une forte similitude entre les
virus au niveau des nucléotides et des acides aminés, ce qui peut conduire au
développement d'anticorps croisés et croisés -reattivi. Dans la même zone géographique, les
infections à ZIKV et DENV conduisent à la génération d'anticorps croisés qui peuvent être
neutralisants (protecteurs) ou non neutralisants (non protecteurs). Il a été démontré qu'en
raison des anticorps réactifs croisés non neutralisants dirigés contre le DENV, l'intensité des
complications des infections à virus Zika dues à l'ADE pourrait être amplifiée et vice versa67.

66
Host Response to the Dengue Virus
https://www.nature.com/scitable/topicpage/host-response-to-the-dengue-virus-22402106/

67
Front Immunol. 2018 Apr 23;9:597. doi: 10.3389/fimmu.2018.00597.
Modulation of Dengue/Zika Virus Pathogenicity by Antibody-Dependent Enhancement and Strategies to Protect
Against Enhancement in Zika Virus Infection.
Khandia R1, Munjal A1, Dhama K2, Karthik K3, Tiwari R4, Malik YS5, Singh RK6, Chaicumpa W7.

PLoS Pathog. 2019 Apr 18;15(4):e1007640. doi: 10.1371/journal.ppat.1007640.

The possible role of cross-reactive dengue virus antibodies in Zika virus pathogenesis.
Langerak T1, Mumtaz N1, Tolk VI1, van Gorp ECM1, Martina BE1, Rockx B1, Koopmans MPG.

Microbes Infect. 2020 Mar;22(2):72-73. doi: 10.1016/j.micinf.2020.02.006

Is COVID-19 receiving ADE from other coronaviruses?
Tetro JA1.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7102551/pdf/main.pdf

36
Extrait de :
https://journals.plos.org/plospathogens/article/file?id=10.1371/journal.ppat.1007640&type=printable

Mécanisme proposé de l'ADE de l'infection à ZIKV médiée par des anticorps anti-DENV à
réactivité croisée. (A) Infection primaire par le ZIKV chez des individus naïfs. L'entrée se fait
par d'autres récepteurs et conduit à la production de virus et de cytokines. (B) Infection
secondaire au ZIKV chez un individu déjà immunisé contre le ZIKV. Une neutralisation efficace
se produit. (C) ZIKV ADE (anticorps noirs : anticorps préexistants contre l'infection primaire au
DENV). Les anticorps dans les sérums immuns peuvent réagir de manière croisée avec le ZIKV,
permettant l'entrée de complexes virus-anticorps dans les MPC via le récepteur Fc,
conduisant à une charge virale plus élevée avec des niveaux plus élevés de cytokines pro et /
ou anti-inflammatoires par rapport aux cellules infectées en l'absence d'anticorps. Ab,
anticorps ; ADE, potentialisation dépendante des anticorps ; DENV, virus de la dengue ; Fc,
fragment cristallisable; MPC, cellule phagocytaire mononucléaire; ZIKV, virus Zika.

37
 IMMUNOPATHOLOGIE DU SARS-COV-2 ET DE SES VACCINS
Les virus MERS-CoV, SARS-CoV-1 et SARS-CoV-2 sont liés sur le plan évolutif et partagent de
nombreuses similitudes dans les caractéristiques et la progression de la maladie humaine. Le
premier stade de la maladie de progression virale légère présente généralement de légers
symptômes pseudo-grippaux. La plupart des patients ne progressent pas au-delà de ce stade
et récupèrent généralement rapidement et sans conséquences. Dans le modèle animal de
souris, les cellules phagocytaires contribuent à l'élimination médiée par les anticorps du
SRAS-CoV-1 et les réponses innées sont probablement suffisantes pour supprimer le MERS-
CoV et le SRAS-CoV-2 chez la majorité des patients.
Pour certains individus (18,5%), l'infection passe dans une seconde phase sévère qui coïncide
souvent avec le moment typique du début de la réponse anticorps adaptative de l'immunité
humorale (environ 714 jours après l'infection).
Pour les patients présentant des symptômes critiques et sévères, la physiopathologie est
cohérente avec le degré d'infection des cellules immunitaires phagocytaires (MDM
immature et MoDC); [voir la figure ci-dessous pour un schéma du mécanisme en cascade].
Les chimiokines libérées par les cellules infectées peuvent attirer des cellules dendritiques
supplémentaires et des macrophages immatures susceptibles d'être infectés, entraînant une
éventuelle amplification de la cascade d'infection et une dérégulation des cellules
immunitaires.
Pour certains patients présentant des symptômes sévères, une activation excessive des
macrophages peut contribuer à une réaction inflammatoire très puissante (tempête de
cytokines). L'infection des macrophages et de certaines cellules T ainsi que la dérégulation
virale des voies cellulaires entraînent un compromis de l'immunité innée et humorale chez
les patients au cours de cette deuxième phase d'infection plus grave.

Légende : Modèle de progression de la maladie avec des réponses immunitaires normales au

début de la phase bénigne des symptômes (voir 1-3). Les cellules présentant l'antigène
migrent vers les ganglions lymphatiques pour activer les cellules (2a). La passerelle vers la
progression vers une maladie grave et critique est l'infection des phagocytes (3a) qui entraîne
une dérégulation immunitaire (4b). Dans les poumons [Ed. et dans d'autres parties du corps],
les chimiokines attirent des cellules dendritiques supplémentaires et des macrophages
immatures qui sont ensuite infectés, créant un circuit positif d'infection en cascade (4b). Les
virus et les cellules immunitaires phagocytaires infectées se propagent dans tout le corps et
infectent d'autres organes (5 et 6).

38
 Tiré de https://www.preprints.org/manuscript/202003.0138/v1

Immunopathologie de l'ADE
La potentialisation dépendante des anticorps (ADE) est un phénomène impliquant les
complexes immuns infectieux des anticorps IgG, qui interviennent dans l'aggravation des
maladies impliquant un large spectre de microbes et de vertébrés.
L'ADE est un nouveau type d'immunopathologie Gell-Coombs :
 Type I, hypersensibilité immédiate médiée par les IgE
 Type II, maladie aiguë du complexe immun médiée par des anticorps
 Type III, maladie du complexe immun de l'antigène étranger dépendant du
complément médié par les IgG

39
  Type IV, maladies immunitaires et auto-immunes à médiation cellulaire68
 Et de type V, potentialisation du complexe immun des IgG d'une infection
microbienne dans les cellules porteuses des récepteurs Fc (FcR).
Dans les immunopathologies de type II, les anticorps IgG sont souvent dirigés contre les
autoantigènes, car les antigènes microbiens imitent les séquences de protéines humaines
dans divers tissus humains, générant une réponse immunitaire qui diminue la tolérance
immunitaire et inclut le rhumatisme articulaire aigu.
Dans les immunopathologies de type III, les complexes antigène-anticorps étrangers sont
souvent piégés dans les membranes basales des doublures endothéliales. Les exemples
pathologiques comprennent la maladie sérique aiguë, la néphrite glomérulaire, les maladies
post-immunitaires de la rougeole69 et les infections respiratoires syncytiales chez les
receveurs de vaccin qui provoquent la formation de complexes immuns IgG destructeurs
principalment dans les poumons.
L'immunopathologie de type V diffère des immunopathologies de type II et III dans
lesquelles les complexes immuns ne sont pas directement cytotoxiques mais servent à
augmenter la gravité de la maladie en régulant la productivité de l'infection microbienne
intracellulaire70.

68
Hypersensitivity Reactions (Types I, II, III, IV)
http://njms.rutgers.edu/sgs/olc/mci/prot/2009/Hypersensitivities09.pdf
https://www.amboss.com/us/knowledge/Hypersensitivity_reactions

Immunol Allergy Clin North Am. 2004 Aug;24(3):373-97, v-vi. Immune mechanism of drug hypersensitivity.
Pichler WJ1.

69
Proc R Soc Med. 1974 Nov;67(11):1120-2.
Immunopathology of measles.
Lachmann PJ.
https://journals.sagepub.com/doi/pdf/10.1177/003591577406701115

70
Microbiol Spectr. 2014 Dec;2(6). doi: 10.1128/microbiolspec.AID-0022-2014.
Dengue Antibody-Dependent Enhancement: Knowns and Unknowns.
Halstead SB1.

40
Tiré de https://commons.wikimedia.org/wiki/ Fichier : 2228_Immune_Hypersensitivity_new.jpg

L'amélioration dépendante des anticorps se produit à la suite d'une infection virale dans les
cellules du système immunitaire, aggravant la tempête de cytokines, selon le mécanisme
montré dans la figure suivante.
A. Dans la neutralisation virale médiée par les anticorps, les anticorps neutralisants se
lient au domaine de liaison au récepteur (RBD) de la protéine virale Spike, ainsi qu'à
d'autres domaines, empêchant le virus de se fixer à son récepteur, l'ACE2.
B. Dans le renforcement de l'infection dépendante des anticorps, des anticorps non
neutralisants de spécificité et de petites quantités, se lient aux particules virales à
travers les domaines Fab. Les récepteurs Fc (FcR) exprimés sur les monocytes ou les
macrophages se lient aux domaines Fc des anticorps et facilitent l'entrée et
l'infection virale.
C. Dans le renforcement immunitaire à médiation par des anticorps, des anticorps non
neutralisants de spécificité et en petites quantités, se lient aux particules virales et
aux récepteurs membranaires à travers les domaines Fc. Les FcR sont donc activés via
le lien avec l'ITAM (Motif d'activation à base de tyrosine d'immunorécepteur) qui à
son tour initie la cascade de signaux pour réguler positivement les cytokines pro-
inflammatoires et réguler à la baisse les cytokines anti-inflammatoires.

41
Les immunocomplexes et l'ARN viral dans les endosomes peuvent signaler à travers les
récepteurs Toll-like 3 (TLR3), TLR7 et / ou TLR8 pour activer les cellules hôtes, entraînant une
immunopathologie.

Tiré de https://www.nature.com/articles/s41577-020-0321-6

Le tableau suivant montre les réactions de renforcement dépendantes des anticorps par
différents virus

Extrait de https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2018.02991/full fmicb-09-02991-t001

42
43
44
Comme cela s'est produit avec d'autres virus, l'amélioration des maladies induites par le
vaccin est également une préoccupation pour le développement d'un vaccin contre le SRAS-
CoV-2 et avec les données actuelles disponibles pour soutenir la corrélation potentielle entre
l'ADE et les anticorps SARS-CoV2 préexistants, il est essentiel de poursuivre d'autres études
critiques pour aborder et comprendre précisément ce problème chez l'homme.
Il existe plusieurs facteurs qui déterminent si un anticorps neutralise un virus et protège
l'hôte ou provoque une EMA et une inflammation aiguë.
Ceux-ci incluent la spécificité, la concentration, l'affinité et l'isotype de l'anticorps. Les
vaccins à vecteur viral codant pour la protéine SARS-CoV Spike (S) et la protéine
nucléocapside (N) provoquent respectivement des IgG anti-S et anti-N chez les souris
immunisées dans une mesure similaire. Cependant, après un nouveau défi, les souris
immunisées avec la protéine N présentent une régulation positive significative de la
sécrétion de cytokines pro-inflammatoires, une infiltration pulmonaire accrue des
neutrophiles et des éosinophiles et une pathologie pulmonaire plus grave. De même, les
anticorps affectant différents épitopes sur la protéine S peuvent varier dans leur potentiel
d'induire la neutralisation ou l'ADE.
Les données in vitro suggèrent que pour les cellules exprimant FcR, l'ADE se produit lorsque
l'anticorps est présent à faible concentration mais s'atténue dans la plage de concentration
élevée.

Il s'ensuit donc qu'il est d'une importance fondamentale de vérifier si dans la vaccination ou
après la vaccination il y a des anticorps non neutralisants à faible concentration car ils
peuvent prédisposer à l'apparition de l'EIM et à ses conséquences fatales71.
Enfin, un chiffre est ajouté qui montre les trois principaux mécanismes
immunopathologiques qui peuvent être déclenchés par la vaccination contre le SRAS-Cov-272

71
Arch Virol. 2014 Jan;159(1):103-16. doi: 10.1007/s00705-013-1787-3.
Determination of antibody concentration as the main parameter in a dengue virus antibody-dependent
enhancement assay using FcγR-expressing BHK cells.
Moi ML1, Takasaki T, Saijo M, Kurane I.

PLoS Negl Trop Dis. 2012;6(2):e1536. doi: 10.1371/journal.pntd.0001536.

Dengue virus infection-enhancing activity in serum samples with neutralizing activity as determined by using
FcγR-expressing cells.
Moi ML1, Lim CK, Chua KB, Takasaki T, Kurane I.

J Clin Virol. 2011 Nov;52(3):225-30. doi: 10.1016/j.jcv.2011.07.009.

Dengue virus isolation relying on antibody-dependent enhancement mechanism using FcγR-expressing BHK cells
and a monoclonal antibody with infection-enhancing capacity.
Moi ML1, Lim CK, Tajima S, Kotaki A, Saijo M, Takasaki T, Kurane I.

72
PLoS Pathog. 2013;9(12):e1003783. doi: 10.1371/journal.ppat.1003783.
Influence of mast cells on dengue protective immunity and immune pathology.
St John AL1

45
 Extrait de https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3868513/pdf/ppat.1003783.pdf

Légende du schéma
Péché antigénique d'origine
Il peut potentiellement se produire lors d'une infection secondaire d'un sérotype hétérologue
(c'est-à-dire un mutant différent de celui de l'infection primaire). Par exemple, cela
commence lorsque (1) une infection primaire par le SRAS-Cov-2 de sérotype 1 se produit, ce
qui conduit à des réponses immunitaires adaptatives où (2) des cellules T spécifiques de
sérotype 1 sont sélectionnées, activées et (3) expansion clonale pour combattre l'infection.
Pendant la résolution de l'infection primaire, des cellules T spécifiques de mémoire de
sérotype 1 sont formées et sont maintenues plus fréquemment dans le répertoire des cellules
T que d'autres cellules T naïves. (4) Une attaque secondaire avec le sérotype 1 provoquerait
une réponse de rappel de mémoire et (5) un confinement efficace de l'infection par les
cellules T. (6) Une attaque secondaire avec une souche hétérologue, de sérotype 2, a le
potentiel de réactivation des lymphocytes T mémoire qui sont cependant plus spécifiques au
sérotype 1 qu'au sérotype 2. (7) Ces cellules T mémoire spécifiques du sérotype 1 surpassent
les cellules T naïves qui seraient plus spécifiques pour le sérotype 2, conduisant à la
génération d'un pool élargi de cellules T mémoire à faible spécificité pour le sérotype 2 et (8)
une faible capacité à éliminer le virus in vivo.

46
Amélioration dépendante des anticorps
Pendant l'infection primaire (9), la sélection des lymphocytes B se produit, avec la production
d'anticorps spécifiques pour le sérotype 1. (10).
Ces anticorps préexistants (11) seront alors présents lors de l'attaque secondaire. (12) Si
l'attaque secondaire est à nouveau avec le sérotype 1, (13) la neutralisation médiée par
l'anticorps du SRAS-Cov-2 se produit, (14) et le confinement de l'infection. (15)
Si, d'autre part, l'attaque secondaire est hétérologue, c'est-à-dire avec le sérotype 2, la
spécificité de l'anticorps peut être faible (16) et les anticorps faiblement neutralisants
peuvent favoriser l'absorption médiée par les récepteurs Fc des complexes virus-anticorps.
(17) Une plus grande absorption du virus dans la cellule sans neutralisation efficace à
médiation par des anticorps conduit à des titres viraux plus élevés et augmente l'activation
des voies de signalisation intracellulaires pro-inflammatoires. (18)

La tempête des cytokines

La tempête de cytokines peut se produire lors d'une infection primaire ou secondaire lorsque
les cellules infectées produisent des niveaux élevés de cytokines ou (19) peuvent résulter de
cellules immunitaires non infectées, telles que les cellules T activées. (20)
Les cytokines agissent directement sur la vascularisation de l'hôte et favorisent la perte
vasculaire lorsqu'elles atteignent des niveaux pathologiques. (21) Les MC (mastocytes)
peuvent libérer des cytokines et d'autres médiateurs vasoactifs synthétisés de novo et pré-
stockés lorsqu'ils sont activés par le SRAS-Cov-2. (22) Avant une infection secondaire, les MC
peuvent également être sensibilisées en se liant à des anticorps spécifiques du SRAS-Cov-2
(23). Dans ce cas également, les médiateurs dérivés de la MC agissent directement sur le
système vasculaire de l'hôte pour favoriser les dommages vasculaires.

47
 AUTRES MÉCANISMES D'INDUCTION DE DOMMAGES

Syndrome auto-immun / inflammatoire

Aux mécanismes d'action connus décrits ci-dessus s'ajoute un autre type de dommage, dû à
l'homologie de séquence élevée entre le SRAS-Cov-2 et les protéines humaines : les
anticorps produits après la vaccination, par mimétisme moléculaire, attaquent à la fois
protéines virales et protéines humaines, déclenchant des réactions auto-immunes
inflammatoires contre les structures de l'organisme.
L'auto-immunité est donc une réaction indésirable qui peut survenir à la fois en raison de
l'inflammation excessive causée par une tempête de cytokines qui conduit à la destruction
des tissus, et en conséquence du mimétisme moléculaire entre l'antigène du vaccin et les
protéines humaines.

Les protéines des microbes (virus et bactéries) et des protéines humaines ont une similitude
remarquable dans la séquence, supérieure à ce qui peut être prévu du point de vue
mathématique, ce qui permet au système immunitaire d'attaquer le virus sans trop
endommager les cellules du corps. Or, c'est précisément cette similitude qui a permis la
coexistence entre virus et cellules humaines en faveur de l'évolution des cellules eucaryotes
elle-même, pourrait être un facteur qui contribue à déterminer l'évasion immunitaire
microbienne, c'est-à-dire l'incapacité du système immunitaire à éliminer potentiellement les
virus dangereux73. Ce phénomène peut expliquer pourquoi les vaccins à base d'antigènes
protéiques produisent une réponse immunitaire faible (ou absente) : la présence de
séquences protéiques dans les antigènes qui conduisent à une tolérance du système
immunitaire vis-à-vis de l'agent infectieux provoque la réponse immunitaire en cas de
l'infection est très faible et cela a conduit au développement de formulations contenant des
adjuvants.
Les adjuvants comprennent les composés inorganiques (sels d'aluminium, phosphate de
calcium), les émulsions d'huile et les produits de bactéries (par exemple les
lipopolysaccharides et les lectines), etc. avec la propriété commune de stimuler les réponses
immunitaires.

Si, d'une part, la stimulation du système immunitaire induite par l'adjuvant conduit à une
plus grande production d'anticorps contre l'antigène vaccinal, d'autre part, une stimulation
excessive peut surmonter les mécanismes de tolérance immunologique qui gardent le
système immunitaire sous contrôle et l'empêchent d'attaquer les propres protéines de
l'organisme.
Par conséquent, suite à la vaccination avec adjuvant, des réactions non spécifiques contre
les molécules / structures hôtes peuvent se produire en raison de la correspondance
peptidique massive entre les protéines microbiennes et humaines (mimétisme moléculaire)
et l'activation des processus auto-immuns.

Le type de phénomène auto-immun et la maladie qui surviendra dépendant des molécules

et des organes attachés. Par exemple, les attaques contre la myéline et les structures /
73
Biol Chem. 2019 Apr 24;400(5):629-638. doi: 10.1515/hsz-2018-0271.
The comparative biochemistry of viruses and humans: an evolutionary path towards autoimmunity.
Kanduc D1.

48
enzymes liées à la myéline peuvent provoquer des maladies démyélinisantes, tandis que les
réactions immunitaires contre les protéines et les antigènes impliqués dans le
comportement et / ou la cognition (neurobeachine, adénosine désaminase, neuroligine,
reelin, etc.) Le type de phénomène auto-immun et la maladie qui surviendra dépendront des
molécules et des organes attachés. Par exemple, les attaques contre la myéline et les
structures / enzymes liées à la myéline peuvent provoquer des maladies démyélinisantes,
tandis que les réactions immunitaires contre les protéines et les antigènes impliqués dans le
comportement et / ou la cognition (neurobeachine, adénosine désaminase, neuroligine,
reelin, etc.) ils peuvent provoquer l'autisme et des troubles du comportement.
En d'autres termes, le type de peptides partagés par les antigènes présents dans les vaccins
et par l'hôte humain joue un rôle fondamental dans la détermination de la maladie auto-
immune qui survient suite à la réaction du système immunitaire induite par l'adjuvant 74.

74
Front Biosci (Schol Ed). 2012 Jun 1;4:1393-401.
Peptide cross-reactivity: the original sin of vaccines.
Kanduc D1.

49
 LE VACCIN ITALIEN ChadOx1 nCov-19 EN PHASE D'EXPERIMENTATION

Vous trouverez ci-dessous quelques schémas de la procédure d'autorisation ordinaire pour

l'enregistrement des médicaments, appliqués au niveau national et international.

Procédure d'enregistrement 75
DIAGRAMMES

Tiré de https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4494348/pdf/vaccines-03-00320.pdf 76

75
https://www.aifa.gov.it/autorizzazione-dei-farmaci
https://ec.europa.eu/health/documents/eudralex_en
https://www.fda.gov/drugs/guidance-compliance-regulatory-information/drug-registration-and-listingsystem-
drls-and-edrls

76
Vaccines (Basel). 2015 Apr 16;3(2):320-43. doi: 10.3390/vaccines3020320.
Vaccine Adjuvants : from 1920 to 2015 and Beyond.
Di Pasquale A1, Preiss S2, Tavares Da Silva F3, Garçon N4.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4494348/pdf/vaccines-02-00320.pdf

50
Tiré de
https://pediatrics.aappublications.org/content/pediatrics/127/Supplement_1/S16/F1.large.jpg

Autorisation de mise sur le marché (AIC) 77

C'est la loi qui permet à une entreprise pharmaceutique de commercialiser un médicament,

de spécialité ou générique, produit de manière industrielle. Il existe actuellement trois types
d'autorisation de mise sur le marché dans l'UE : nationale, européenne selon la procédure
centralisée, Européenne pour la reconnaissance mutuelle (ou décentralisée). La procédure
centralisée prévoit un AIC unique valable dans toute l'Union européenne.
Cette autorisation est délivrée par décision de la Commission européenne, sur la base d'une
évaluation scientifique par les comités (CHMP : comité des médicaments à usage humain)
créés au sein de l'Agence européenne des médicaments (EMA), selon les critères de la
directive 2001/83/CE.

L'autorisation de mise sur le marché délivrée dans l'UE a une durée initiale de 5 ans. (Articles
14, paragraphe 1, du règlement (CE) no 726/2004 et 24, paragraphe 1, de la directive

77
Pediatrics. 2011 May;127 Suppl 1:S16-22. doi: 10.1542/peds.2010-1722D. Epub 2011 Apr 18.
Ensuring the optimal safety of licensed vaccines: a perspective of the vaccine research, development, and
manufacturing companies.
Kanesa-thasan N1, Shaw A, Stoddard JJ, Vernon TM.
https://pediatrics.aappublications.org/content/pediatrics/127/Supplement_1/S16.full.pdf

Methods Mol Biol. 2019;2013:165-176. doi: 10.1007/978-1-4939-9550-9_12.

Vaccine Development: From Preclinical Studies to Phase 1/2 Clinical Trials.
Artaud C1, Kara L2,3,4, Launay O5,6,7.

51
2001/83/CE).78 Après cinq ans, l'autorisation doit être renouvelée sur la base d'une
réévaluation du rapport bénéfice / risque. Une fois renouvelée, l'autorisation de mise sur le
marché est valable pour une durée illimitée, sauf si la Commission ou les autorités nationales
compétentes décident, sur la base de motifs justifiés de pharmacovigilance, de procéder à un
renouvellement supplémentaire de 5 ans. Il s'ensuit que pendant les 5 ans suivant son introduction
sur le marché, le vaccin est en fait un médicament encore en cours d'essais cliniques et est indiqué
dans la fiche technique comme médicament sous surveillance supplémentaire.

Tests précliniques pour le vaccin SRAS-Cov-2 79

Il est à noter que les tests précliniques in vitro et in vivo sur les animaux ne seront pas
supprimés, mais seront effectués en parallèle des études cliniques afin d'obtenir
l'autorisation de mise sur le marché.
Aucun type d'animal ne servira les tests nécessaires à toutes fins, et les scientifiques ont
plusieurs critères pour déterminer ce qui rend un animal utile pour tester l'efficacité des
thérapies et des vaccins. Premièrement, il doit être sensible aux infections et tous les
animaux ne le sont pas, et même lorsque les animaux de laboratoire sont sensibles aux
infections, cela ne signifie pas qu'ils tombent malades. Si un animal ne tombe pas malade de

78 https://ec.europa.eu/health//sites/health/files/files/eudralex/vol-1/reg_2004_726/reg_2004_726_en.pdf

79 http://www.animalresearch.info/en/medical-advances/diseases-research/sars-cov-2/

https://www.nytimes.com/2020/03/14/science/animals-coronavirus-vaccine.html

https://www.jax.org/news-and-insights/2020/march/expediting-covid-19-research

https://indaily.com.au/news/2020/04/02/csiro-tests-potential-covid-19-vaccines-on-ferrets/

https://thestarphoenix.com/news/local-news/covid-19-u-of-s-lab-develops-animal-model-for-covid-
vaccinetesting/

bioRxiv 2020.02.07.939389; doi: https://doi.org/10.1101/2020.02.07.939389

The Pathogenicity of 2019 Novel Coronavirus in hACE2 Transgenic Mice
Linlin Bao, Wei Deng, Baoying Huang, Hong Gao, Lili Ren, Qiang Wei, Pin Yu, Yanfeng Xu, Jiangning Liu, Feifei
Qi, Yajin Qu, Wenling Wang, Fengdi Li, Qi Lv, Jing Xue, Shuran Gong, Mingya Liu, Guanpeng Wang, Shunyi
Wang, Lin na Zhao, Peipei Liu, Li Zhao, Fei Ye, Huijuan Wang, Weimin Zhou, Na Zhu, Wei Zhen, Xiaojuan Zhang,
Zhiqi Song, Li Guo, Lan Chen, Conghui Wang, Ying Wang, Xinming Wang, Yan Xiao, Qiangming Sun, Hongqi Liu,
Fanli Zhu Chunxia Ma, Lingmei Yan, Mengli Yang, Jun Han, Wenbo Xu, Wenjie Tan, Xiaozhong Peng, Qi Jin,
Guizhen Wu, Ch uan Qin

https://media.nature.com/original/magazine-assets/d41586-020-00698-x/d41586-020-00698-x.pdf
MONKEYS AND MICE ENLISTED TO FIGHT CORONAVIRUS

https://www.livescience.com/experimental-covid19-vaccine-protects-monkeys.html
New COVID-19 vaccine shows promise in monkeys. Next step: humans.

Science. 2020 May 1;368(6490):456-457. doi: 10.1126/science.368.6490.456.

COVID-19 shot protects monkeys.
Cohen J.

52
l'infection, son utilisation est limitée, car pour tester l'efficacité du traitement, il faut
observer si le traitement arrête les symptômes. Le meilleur animal de laboratoire peut non
seulement devenir infecté et malade, mais il tomberait malade de la même manière que les
humains, montrant une évolution similaire de la maladie. Ainsi, le test donnerait le plus
d'informations.
Les espèces les plus utilisées pour les études précliniques du vaccin contre le SRAS-Cov-2
sont les suivantes :

Souris - les souches de race standard des souris ne sont pas sensibles à l'infection par COVID-
19. Dans le monde entier, plusieurs laboratoires accélèrent le temps pour augmenter les
stocks de souris génétiquement modifiées pour la recherche et pour tester la sensibilité
d'autres animaux aux infections par le virus qui cause Covid-19.
En 2003, l'Université de l'Iowa a développé une souris sensible aux infections par le virus du
SRAS. Cela s'appelle la souris hACE2. Une nouvelle étude chinoise, non encore évaluée par
des pairs, suggère que ces souris sont infectées par le SRAS-CoV-2 et développent une légère
pneumonie. L'avantage de cette souche est qu'elle possède le récepteur ACE2 humain sur
ses cellules, d'où son nom. Cela lui permet d'être infecté par le SRAS et le nouveau
coronavirus, qu'on cible via ce récepteur alors qu'il tente d'envahir les cellules. Cette souche
de souris sera utilisée dans certaines des premières expériences de laboratoire. Mais vous
devez d'abord les reproduire et cela prend au moins trois mois pour le faire.

Furets - ils peuvent être choisis comme animaux d'essai car ils ont les bonnes cellules
réceptrices dans les poumons pour permettre l'infection et, par le passé, se sont révélés être
un modèle animal approprié pour la recherche sur le SRAS, la grippe et même l'ébola. Les
chercheurs ont déterminé, grâce à l'analyse du génome, que les furets sont les meilleures
espèces pour créer un modèle animal, dans lequel les animaux vaccinés sont protégés et les
animaux non vaccinés présentent la maladie.

Primates non humains - Ce sont les espèces les plus proches de l'homme et donc les
meilleures pour ces études, car elles contractent la maladie avec des caractéristiques très
similaires à l'homme. Plusieurs laboratoires testent actuellement le vaccin sur des macaques
rhésus.

Études précliniques pour l'évaluation de la toxicité animale

Les tests sur les animaux couramment requis par les organismes de réglementation (FDA et
EMA)80 pour que les sociétés pharmaceutiques puissent procéder à des essais cliniques pour
n'importe quel médicament sont les suivants :81
 Toxicité aiguë (court terme) : de 7 à 20 rats + chiens ou primates

80
https://www.ema.europa.eu/en/human-regulatory/research-development/ethical-use-animals-medicine-
testing

https://www.accessdata.fda.gov/scripts/cdrh/cfdocs/cfcfr/CFRSearch.cfm?CFRPart=58

81
https://www.peta.org/issues/animals-used-for-experimentation/us-government-animal-
testingprograms/food-drug- administration/

53
  Toxicité subchronique (de 14 à 180 jours) : rats + chiens ou primates
 Toxicité chronique (à vie) : 120 rats + 32 chiens ou primates
 Effets cancérogènes : 400 rats + 400 souris
 Toxicité pour les systèmes reproducteurs
 Segment I (toxicité pour la reproduction en 2 générations) : 2500 rats
 Segment II (malformations congénitales) : 900 lapins + 1300 rats
 Segment III (effets péri et postnatals) : rats
 Absorption, distribution, métabolisme, excrétion et interactions pharmacologiques
des principes actifs
 (Pharmacocinétique et pharmacodynamique)
 Études spécialisées
 Toxicité génétique : 80 hamsters / souris x 2 dans 5 études distinctes
 Toxicité pour le système immunitaire : 32 rats
 Irritation de la peau / des yeux / des muqueuses : 3 lapins par test

Dans le cas des vaccins en particulier, les tests utilisent environ 2,5 millions d'animaux
chaque année et chaque lot de produit fini est testé sur des animaux avant d'être
commercialisé.
De nombreuses études requises pour un médicament à usage thérapeutique ne sont pas
prévues pour les vaccins car il est considéré que c'est un médicament qui est administré une
fois et ne peut donc pas donner les effets d'une toxicité chronique, ils ne sont pas testés
pour la toxicité systémique reproductrice, ni pour la pharmacocinétique et la
pharmacodynamique, ni pour la toxicité génétique et le système immunitaire.
Le test de toxicité anormale est normalement effectué (c'est-à-dire avec l'utilisation de
doses létales du médicament82, étant réévalué par les organismes de réglementation parce
qu'il est désormais considéré comme non fiable d'être extrapolé à l'homme), le test de
puissance suivi du test défi (c'est-à-dire que les animaux sont vaccinés avec le vaccin et la
production d'anticorps est comparée à un antigène standard fourni par l'OMS, puis les
animaux sont réinfectés pour évaluer la protection contre la maladie) et le test de virulence
pour évaluer si le vaccin atténuée peut revenir à la forme infectieuse.
Malgré le grand nombre d'animaux sacrifiés, en particulier dans la phase de recherche et de
développement de médicaments, on sait que 95% des animaux testés en phase préclinique
ne parviennent pas à être enregistrés car les tests sont inefficaces et / ou trop toxiques83.

82
Biologicals. 2020 Jan;63:101-105. doi: 10.1016/j.biologicals.2019.10.007.
Global harmonization of vaccine testing requirements: Making elimination of the ATT and TABST a concrete
global achievement.
Viviani L1, Halder M2, Gruber M3, Bruckner L4, Cussler K5, Sanyal G6, Srinivas G7, Goel S8, Kaashoek M9,
Litthauer D10, Lopes da Silva AL11, Sakanyan E12, Aprea P13, Jin H14, Vandeputte J15, Seidle T16, Yakunin D17.
J Pharm Sci. 2014 Nov;103(11):3349-3355. doi: 10.1002/jps.24125.

Historical data analyses and scientific knowledge suggest complete removal of the abnormal toxicity test as a
quality control test.
Garbe JHO1, Ausborn S2, Beggs C3, Bopst M4, Joos A5, Kitashova AA6, Kovbasenco O7, Schiller CD2, Schwinger
M8, Semenova N9, Smirnova L10, Stodart F11, Visalli T12, Vromans L5.

83
https://ncats.nih.gov/ntu/about

54
Dans le rapport de 2019 sur les statistiques relatives à l'utilisation d'animaux à des fins
scientifiques dans les états membres de l'Union Européenne, en 2015-2017, il apparaît que
le nombre d'animaux utilisés pour la recherche et le développement et la production de tous
les médicaments était de 9’388'162.84 Selon la Pharmaceutical Research and Manufacturers
of America (PhRMA), les grandes entreprises pharmaceutiques et biotechnologiques ont
dépensé 10,5 milliards de dollars ou 22% du total des coûts annuels de recherche et
développement en recherche non clinique en 2011, avec des coûts de développement
moyens allant de la phase d’étude de toxicité à la première dose testée dans l’humain, pour
un seul composé, de 6,5 millions de dollars (de 100 000 dollars à 27 millions de dollars)85.
Le nombre d'animaux utilisés en recherche devrait cependant augmenter avec l'avancement
de la recherche et du développement dans la technologie médicale, en particulier pour
l'expansion rapide des produits pharmaceutiques dans le domaine de la biotechnologie.
La douleur, l'angoisse et la mort subie par les animaux lors d'expériences scientifiques font
depuis longtemps l'objet de débats.
En plus de la grande préoccupation de l'éthique de l'expérimentation, les autres
inconvénients de l'expérimentation animale sont : l'exigence de main-d'œuvre qualifiée,
l'utilisation de protocoles qui nécessitent des temps longs et des coûts très élevés comme vu
ci-dessus. Diverses alternatives à l'expérimentation animale ont été proposées pour
surmonter les inconvénients associés à l'expérimentation animale et éviter les procédures
contraires à l'éthique ; pour ces raisons, la mise en œuvre de la stratégie 3 R (réduction,
amélioration et remplacement) est devenue de plus en plus urgente, grâce à laquelle il a
déjà été possible d'introduire diverses méthodes et organismes alternatifs pour les tests
pharmacologiques et chimiques.86

JACC Basic Transl Sci. 2019 Nov 25;4(7):845-854. doi: 10.1016/j.jacbts.2019.10.008. eCollection 2019 Nov.
Limitations of Animal Studies for Predicting Toxicity in Clinical Trials: Is it Time to Rethink Our Current
Approach?
Van Norman GA1.

84
REPORT FROM THE COMMISSION TO THE EUROPEAN PARLIAMENT AND THE COUNCIL – Brussels, 5.2.2020

https://ec.europa.eu/transparency/regdoc/rep/1/2020/EN/COM-2020-16-F1-EN-MAIN-PART-1.PDF

85
https://www.contractpharma.com/issues/2013-06/view_features/characterizing-the-cost-of-non-
clinicaldevelopment- activity/

86
Saudi Pharm J. 2015 Jul;23(3):223-9. doi: 10.1016/j.jsps.2013.11.002.
Alternatives to animal testing: A review.
Doke SK1, Dhawale SC1.
NON-ANIMAL APPROACHES THE WAY FORWARD Report on a European Commission Scientific Conference held
on 6-7 December 2016 at The Egg, Brussels, Belgium

https://ec.europa.eu/environment/chemicals/lab_animals/3r/pdf/scientific_conference/non_animal_approach
es _conference_report.pdf

55
 Tiré de https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6978558/pdf/main.pdf

Échecs de la recherche translationnelle : études précliniques et cliniques

Les pourcentages de médicaments qui échouent dans les études précliniques (en raison de la
toxicité du médicament ou du manque de son efficacité chez l’animale) et dans les études
cliniques (en raison de la toxicité du médicament ou de son échec par manque d'efficacité
chez l'homme) sont indiqués dans les colonnes 1 et 2.
La troisième colonne montre ce qui se passerait dans l’hypothèse que les échecs de toxicité
soient évités lors des essais cliniques (la moitié de tous les échecs médicamenteux dans les
essais cliniques sont dus à des problèmes de toxicité). Le taux de réussite des essais cliniques
passerait alors de 11,7% dans l'ensemble à environ 56%.

Les études cliniques, comme le montre le protocole de test du vaccin SARS-Cov2, sont
structurées pour évaluer l'immunogénicité (c'est-à-dire la formation d'anticorps contre
l'antigène du vaccin) mais sont très insuffisantes pour mettre en évidence l'apparition de
réactions indésirables à moyen-long terme, ceci à cause de la période d'observation trop
courte (normalement 7 à 15 jours), pour des échantillons de population sélectionnés trop
petits (souvent les vaccins pendant le processus d'enregistrement ne dépassent pas la phase
II sur des adultes en bonne santé) et par manque de groupes de contrôles négatifs (contrôles

56
négatifs vaccinés avec un placebo contenant de l'eau physiologique et contrôlesqui n’ont
jamais été vacciné. Habituellement, le contrôle consiste en un autre vaccin déjà
commercialisé ou le vaccin privé de l'antigène mais contenant l'adjuvant).
La dernière directive de l'OMS de 2013 contribue également à sous-estimer davantage
l'incidence des effets indésirables87, selon laquelle les fabricants ne sont plus tenus de
signaler les nouveaux effets indésirables (MAPI) aux organismes de réglementation, qui sont
détectés lors de la post-pharmacovigilance-marketing s'ils n'ont pas déjà été trouvés lors de
la phase d'enregistrement clinique (par exemple le vaccin SIDS), ou pour lesquels la
littérature scientifique a établi l'absence de lien de causalité (par exemple lien autisme-
vaccins)88.

Voici, ci-après, le schéma comparatif supplémentaire sur l'enregistrement des vaccins.

87
https://www.who.int/vaccine_safety/publications/gvs_aefi/en/ Causality assessment of an adverse event
following immunization (AEFI)
User manual for the revised WHO AEFI causality assessment classification (Second edition)

88
Version 2. F1000Res. 2018 Feb 28 [revised 2018 May 29];7:243. doi: 10.12688/f1000research.13694.2.
Revised World Health Organization (WHO)'s causality assessment of adverse events following immunization-a
critique.
Puliyel J1, Naik P2.

57
Tiré de https://gordondougan.blog/2020/04/09/how-to-make-a-new-covid-19-vaccinestarting-from-
scratch/

PLATEFORMES VACCINALES POTENTIELLES SARS-COV-289

Les vaccins actuellement testés sont essentiellement de deux types :

• biotechnologiques: ARN, ADN, vecteur adénoviral, recombinant, c'est-à-dire obtenus par

des techniques d'ADN recombinant basées sur une séquence unique du virus

• et classiques: atténués et inactivés, c'est-à-dire, obtenu à partir de la culture du virus sur

des lignées cellulaires et contient donc les quasi-espèces du virus

89
Immunity. 2020 Apr 14;52(4):583-589. doi: 10.1016/j.immuni.2020.03.007
SARS-CoV-2 Vaccines: Status Report.
Amanat F1, Krammer F2.

58
Extrait de https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7136867/
La structure d'une particule de coronavirus est représentée à gauche, avec les différentes protéines
virales indiquées. La protéine S est la principale cible pour le développement de vaccins

59
60
61
https://media.nature.com/original/magazine-assets/d41586-020-01221-y/d41586-020-01221-y.pdf

De ces plateformes, nous allons maintenant approfondir celle relative au vaccin qui, avec
une forte probabilité, sera disponible sur le marché italien à l'automne, c'est-à-dire le vaccin
à vecteur vivant TchadOx1 atténué nCov-19.90

Comme nous le verrons, ce sont des vaccins de dernière génération obtenus par la
technologie de l'ADN recombinant, avec l'utilisation d'un vecteur d'adénovirus
génétiquement modifié qui permet de transporter l'antigène de la protéine S du SRAS-Cov-2
à l'intérieur des cellules du système immunitaire. Ces types de vaccins n'ont pas été
autorisés pour être utilisés comme vaccins pour la prévention des maladies infectieuses,
alors qu'ils sont utilisés, principalement encore à un niveau expérimental, comme vaccins
thérapeutiques anticancéreux et pour la thérapie génique (avec des vecteurs capables de
s'intégrer dans le ADN).
Pour une utilisation comme vaccins prophylactiques, le vecteur est défectueux, c'est-à-dire
qu'il ne doit pas pouvoir s'intégrer dans l'ADN ou infecter les cellules. La création du vecteur
est donc une étape particulièrement critique pour laquelle le fabricant doit garantir la
sécurité.
Il serait donc important de pouvoir obtenir plus d'informations à cet égard auprès des
organismes de réglementation, car la capacité de s'intégrer dans l'ADN et de transformer les
cellules est un risque qui ne peut être totalement exclu.
Le fragment du virus SARS-Cov-2 qui appartient à la protéine Spike, c'est-à-dire la protéine
qui se lie au récepteur cellulaire ACE2 et qui est attaqué par des anticorps en cas d'infection,
est ajouté au support porteur.
L'objectif est donc de s'assurer que la cellule immunitaire dans laquelle le vecteur modifié
est introduitproduit de grandes quantités de protéines de pointe qui sont ensuite exposées

90
Guideline on quality, non-clinical and clinical aspects of live recombinant viral vectored vaccines
https://www.ema.europa.eu/en/documents/scientific-guideline/guideline-quality-non-clinical-clinical-
aspectslive-recombinant-viral-vectored-vaccines_en.pdf

Mol Ther. 2014 Mar;22(3):668-674. doi: 10.1038/mt.2013.284.

Clinical assessment of a novel recombinant simian adenovirus ChAdOx1 as a vectored vaccine expressing
conserved Influenza A antigens.
Antrobus RD1, Coughlan L1, Berthoud TK1, Dicks MD1, Hill AV1, Lambe T2, Gilbert SC3.

PLoS One. 2012;7(7):e40385. doi: 10.1371/journal.pone.0040385.

A novel chimpanzee adenovirus vector with low human seroprevalence: improved systems for vector derivation
and comparative immunogenicity.
Dicks MD1, Spencer AJ, Edwards NJ, Wadell G, Bojang K, Gilbert SC, Hill AV, Cottingham MG.

Pathogens. 2019 Nov 12;8(4). pii: E231. doi: 10.3390/pathogens8040231.

A Single and Un-Adjuvanted Dose of a Chimpanzee Adenovirus-Vectored Vaccine against Chikungunya Virus
Fully Protects Mice from Lethal Disease.
Campos RK1, Preciado-Llanes L2, Azar SR1, Lopez-Camacho C2, Reyes-Sandoval A2, Rossi SL3.

Front Microbiol. 2019 Aug 2;10:1781. doi: 10.3389/fmicb.2019.01781.

Recent Advances in the Vaccine Development Against Middle East Respiratory Syndrome-Coronavirus.
Yong CY1,2, Ong HK3, Yeap SK4, Ho KL3, Tan WS1,2.

62
sur la membrane cellulaire pour la reconnaissance par le système immunitaire et la
production d'anticorps spécifiques.
La séquence de protéine de pointe qui est insérée provient d'une seule séquence virale et,
par conséquent, en raison du phénomène des populations mutantes discuté ci-dessus, elle
conduira à la formation d'anticorps spécifiques de l'antigène vaccinal et peu spécifiques à
l'ensemble de la population virale en continu d’évolution.
La faible spécificité des anticorps vaccinaux telle que détaillée ci-dessus prédispose les
vaccinés aux deux immunopathologies particulièrement dangereuses : le péché antigénique
d'origine et le rehaussement dépendant des anticorps.
Comme déjà vu, par ailleurs, la présence de séquences superposables à celles des protéines
humaines91 comme démontré par l'analyse bioinformatique dans deux articles récemment
publiés, peut être responsable d'une réponse immunitaire auto-immune / inflammatoire
contre les structures du corps.
Quant à la qualité, la formulation exacte du vaccin n'est pas actuellement connue et pour la
production, il est connu que le vecteur modifié se propage sur des lignées cellulaires
humaines immortalisées, donc cancérigènes, provenant de tissus fœtaux / embryonnaires. Il
est donc possible que des résidus de matériel génétique de la lignée cellulaire (ADN
cancérigène et virus adventices cancérigènes) soient présents, ainsi que la présence
potentielle de matériel génétique issu du processus d'ingénierie, qui pourrait être intégré
dans l'ADN humain.
Ces critiques très importantes affectant les trois aspects du vaccin (qualité, efficacité et
innocuité) nécessitent une optimisation minutieuse du processus de purification du produit
et des tests précliniques avant de passer aux différentes phases cliniques.
Le besoin de précaution est encore accru par le fait qu'à ce jour, il n'a pas été possible pour
les entreprises d'obtenir l'enregistrement de vaccins efficaces et sûrs contre le SRAS-Cov-1 et
le MERS, c'est pourquoi il est légitime d'exiger plus de scrupules dans l'étude les différentes
étapes du processus d'autorisation.92

91
Clin Immunol. 2020 Apr 18;215:108426. doi: 10.1016/j.clim.2020.108426.
On the molecular determinants of the SARS-CoV-2 attack.
Kanduc D1, Shoenfeld Y2.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7165084/pdf/main.pdf

J Transl Autoimmun. 2020 Apr 9:100051. doi: 10.1016/j.jtauto.2020.100051.

Pathogenic Priming Likely Contributes to Serious and Critical Illness and Mortality in COVID-19 via
Autoimmunity. Lyons-Weiler J1.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7142689/

92 Nature. 2020 Mar;579(7800):481. doi: 10.1038/d41586-020-00798-8.

Coronavirus vaccines: five key questions as trials begin.
Callaway E.
https://www.nature.com/articles/d41586-020-00798-8

Nature. 2020 Mar;579(7799):321. doi: 10.1038/d41586-020-00751-9.

Don't rush to deploy COVID-19 vaccines and drugs without sufficient safety guarantees.
Jiang S.
https://www.nature.com/articles/d41586-020-00751-9

Nat Rev Immunol. 2020 Apr 21. doi: 10.1038/s41577-020-0321-6.

The potential danger of suboptimal antibody responses in COVID-19.
Iwasaki A1,2, Yang Y3.

63
Compte tenu de la littérature abondante étayant tout ce qui a été rapporté jusqu'à présent,
le choix d'accélérer la recherche clinique et la phase de production à grande échelle reste
très discutable, faute de justification scientifique qui le justifie, et surtout risqué pour les
futures personnes vaccinées.

MÉTHODE DE PRÉPARATION D'ANTIGÈNE VIRAL POUR LE VACCIN ChadOx1

nCov-1993

Construction du vecteur transporteur

https://www.nature.com/articles/s41577-020-0321-6.pdf

93
Mol Ther Methods Clin Dev. 2016 Apr 27;3:16030. doi: 10.1038/mtm.2016.30.
Methods and clinical development of adenovirus-vectored vaccines against mucosal pathogens.
Afkhami S1, Yao Y1, Xing Z1.

Hum Gene Ther. 2014 Apr;25(4):318-27. doi: 10.1089/hum.2014.007.

Challenges in manufacturing adenoviral vectors for global vaccine product deployment.
Vellinga J1, Smith JP, Lipiec A, Majhen D, Lemckert A, van Ooij M, Ives P, Yallop C, Custers J, Havenga M.
https://www.bataviabiosciences.com/wp-content/uploads/2016/12/vellinga-2014.pdf

Biotechnol J. 2015 May;10(5):741-7. doi: 10.1002/biot.201400390.

Large-scale adenovirus and poxvirus-vectored vaccine manufacturing to enable clinical trials.
Kallel H1, Kamen AA.

Vaccine. 2006 Feb 13;24(7):849-62.

Development of nonhuman adenoviruses as vaccine vectors.
Bangari DS1, Mittal SK.

Hum Gene Ther. 2014 Apr;25(4):301-17. doi: 10.1089/hum.2013.235.

Adenovirus-based vaccines for fighting infectious diseases and cancer: progress in the field.
Majhen D1, Calderon H, Chandra N, Fajardo CA, Rajan A, Alemany R, Custers J.

Curr Opin Virol. 2016 Dec;21:1-8. doi: 10.1016/j.coviro.2016.06.001.

Viral vectors as vaccine carriers.
Ertl HC1

Curr Opin Immunol. 2016 Aug;41:47-54. doi: 10.1016/j.coi.2016.05.014.

Viral vectors as vaccine platforms: from immunogenicity to impact.
Ewer KJ1, Lambe T1, Rollier CS2, Spencer AJ1, Hill AV3, Dorrell L4.

Chapter 4 Adenoviral Vector-Based Vaccines and Gene Therapies : Current Status and Future Prospects Shakti
Singh, Rakesh Kumar, Babita Agrawal Published 2019
https://www.semanticscholar.org/paper/Chapter-4-Adenoviral-Vector-Based-Vaccines-and-Gene-Singh-
Kumar/f452e476b448ac6add9429a886cf2e9aab93f4db

Adenoviruses and Adenovirus Vectors: A Primer on their Biology

http://www.hvtn.org/content/dam/hvtn/HVTNews/HVTNews%20March%202008.pdf

64
Les adénovirus (ADV) sont des virus à ADN non capsulés icosaédriques d'une taille comprise
entre 70 et 90 namomètres qui appartiennent à la famille des adénovirides.
Nommés pour le tissu adénoïde (amygdale) à partir duquel ils ont été identifiés pour la
première fois, les AdV sont désormais connus pour infecter un large éventail de tissus,
provoquant principalement des infections bénignes telles que la congestion nasale et
l'écoulement nasal, la toux et la conjonctivite.
Les vecteurs du vaccin AdV se présentent sous différentes formes en fonction de la stratégie
thérapeutique prévue. Les vecteurs défectueux sont conçus avec l'élimination du locus E1
responsable de la réplication et manquent généralement des gènes E3 pour créer un espace
supplémentaire pour l'insertion transgénique. Les vecteurs compétents conservent les gènes
E3 pour l'insertion du transgène, mais ont une capacité plus limitée pour les inserts du
transgène. Le choix entre un vecteur de réplication compétent ou défectueux dépend des
caractéristiques du virus utilisé, de son immunogénicité, de sa sécurité et de l'insert d'ADN
nécessaire.

Extrait de : https://nrc.canada.ca/en/research-development/intellectual-property-
licensing/adenoviralvectors-vaccines-cancer-therapy-l-10890

65
(Figure 1A) - Vaccins contre les infections virales et bactériennes : vecteur non répliquant et
non disséminant
Les spécialistes insèrent le code génétique de l'antigène (dans notre cas la séquence de la
protéine Spike) dans le vecteur, dont la protéase virale et la région E1 ont été éliminées.
Ensuite, ils produisent des plaques virales recombinantes, amplifient le vecteur à l'aide d'une
lignée cellulaire appropriée et le purifient. Une fois injecté, le support pénètre dans le tissu
cellulaire cible et produit des niveaux élevés d'antigène. En raison de l'absence d'E1 et de
protéases, le vecteur ne peut pas se répliquer ni se propager à d'autres cellules. La production
transitoire de haut niveau d'antigène par les cellules infectées génère une réponse
immunitaire protectrice (humorale et cellulaire) contre l'agent infectieux dont dérive
l'antigène.

(Figure 1B) : Vaccins très puissants et thérapie anticancéreuse : vecteur de réplication, pas
de diffusion
Pour les agents infectieux, les spécialistes insèrent la séquence génétique de l'antigène dans
le vecteur. La région E1 est présente, permettant au vecteur de se répliquer et d'augmenter
significativement le nombre de copies de l'antigène. Les plaques du vecteur recombinant sont
produites et amplifiées en utilisant une lignée cellulaire appropriée. Dans les vaccins contre
les agents infectieux, le vecteur se réplique dans les cellules du tissu injecté et produit de
grandes quantités d'antigène, mais ne se propage pas.

66
Extrait de semanticscholar.org/paper/Chapter-4-Adenoviral-Vector-Based-Vaccines-and-
GeneSingh-Kumar/f452e476b448ac6add9429a886cf2e9aab93f4db/figure/2
Pour la légende, voir le lien.

La création du vecteur viral peut se faire de différentes manières :

Typiquement, la production de vecteur adénoviral recombinant est basée sur l'utilisation de
lignées cellulaires telles que HEK293 (à partir de rein embryonnaire humain) et PER.C6 (à
partir de cellules rétiniennes d'embryon humain) qui complètent les fonctions du vecteur
adénoviral qui ont été éliminées ou ré-éliminées.
La lignée cellulaire principale utilisée pour les vecteurs d'adénovirus sans E1 est la lignée
cellulaire 293 dérivée de cellules rénales embryonnaires humaines qui contient la région E1
de l'adénovirus. Une autre lignée cellulaire populaire est la lignée cellulaire rétinienne
embryonnaire humaine, PER.C6® (promoteur PGK, contenant E1 et la rétine, clone numéro
6). La lignée cellulaire PER.C6® est dérivée d'une seule cellule humaine rétinérisée, qui a été
délibérément immortalisée à l'aide de la technologie de l'ADN recombinant. En
conséquence, les cellules PER.C6® peuvent se répliquer indéfiniment, ce qui leur permet
d'être cultivées en suspension monocellulaire dans des conditions sans sérum en quantités
appropriées pour les productions à grande échelle.

67
Extrait de : http://www.hvtn.org/content/dam/hvtn/HVTNews/HVTNews%20March%202008.pdf

L'un des principaux groupes travaillant dans ce domaine est l'Institut Oxford Jenner, qui
développe des vaccins contre le SRAS, le MERS, le Zika, le VIH, la tuberculose et le virus
Ebola. Leur programme d'ingénierie vectorielle dédié concentre ses efforts sur les vecteurs
adénoviraux du chimpanzé, qui ne sont pas entravés par l'immunité contre le vecteur
existant dans les populations humaines. L'un des programmes actuels pour le SRAS-Cov-2 est
dirigé par l'équipe du professeur Sarah Gilbert, qui a développé un vecteur adénoviral de
chimpanzé (ChAdOx1) contre le coronavirus MERS94.

94
Simian adenovirus and hybrid adenoviral vectors
https://patents.google.com/patent/US20150044766

https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT03399578

68
 RÉPONSE CELLULAIRE AU VACCIN95

Quant au mécanisme d'induction des réponses cellulaires et anticorps spécifiques au

transgène par les vaccins à vecteur viral à réplication défectueuse, l'administration par
injection intramusculaire provoque l'infection des cellules musculaires (non productive dans
le cas de vecteurs viraux de réplication défectueux) suivie de l'expression transgénique dans
les 24 heures, ainsi que l'activation des réponses immunitaires innées par des interactions
avec les récepteurs viraux pour la reconnaissance des acides nucléiques et des agents
pathogènes.
Les protéines exprimées subissent une dégradation protéasomique et une présentation aux
cellules T CD8 + en association avec des molécules du CMH de classe I ou elles peuvent être
sécrétées et absorbées par les cellules présentant l'antigène professionnel (APC).
L'APC peut également acquérir des antigènes vaccinaux tels que des corps apoptotiques ou
nécrotiques ou peut être activé directement en interagissant avec le vecteur viral. Les CPA
chargés par l'antigène migrent vers les ganglions lymphatiques drainants où ils sont capables
de déclencher les cellules T CD8 +, CD4 + et les cellules B.

95
Curr Opin Immunol. 2016 Aug;41:47-54. doi: 10.1016/j.coi.2016.05.014. Epub 2016 Jun 7.
Viral vectors as vaccine platforms: from immunogenicity to impact.
Ewer KJ1, Lambe T1, Rollier CS2, Spencer AJ1, Hill AV3, Dorrell L4.

Swiss Med Wkly. 2017 Aug 8;147:w14465. doi: 10.4414/smw.2017.14465. eCollection 2017.
Virally vectored vaccine delivery: medical needs, mechanisms, advantages and challenges.
Pinschewer DD1.
https://smw.ch/article/doi/smw.2017.14465

https://thenativeantigencompany.com/repurposing-adenoviruses-as-vectors-for-vaccines/

69
Extrait de https://thenativeantigencompany.com/repurposing-adenoviruses-as-vectors-for-vaccines/

CRITICALITE POUR LA QUALITé DU PRODUIT FINI

La création du vaccin implique donc deux étapes distinctes : la production du vecteur

adénoviral et la production du fragment viral de la protéine Spike du SRAS-Cov-2 en utilisant
la technologie de l'ADN recombinant ; par la suite, le vecteur modifié est cultivé sur des
lignées cellulaires immortalisées pour produire de grandes quantités d'antigène vaccinal.

La composition du vaccin contre le SRAS-Cov-2 utilisé pour l'étude clinique 1, ni son

processus de production spécifique plus en détail, sont actuellement connus.
Cependant, étant produit à partir de lignées cellulaires et de tissus pour l'extraction et la
culture et en utilisant la technologie de l'ADN recombinant, vous pouvez d'ores et déjà
considérer que les étapes de purification de l'ADN résiduel, des virus adventices des lignées
cellulaires et des fragments de matériel génétique issus de l'ingénierie du vecteur sont
certainement particulièrement critiques.

70
Extrait de : https://covid19vaccinetrial.co.uk/about
https://thenativeantigencompany.com/repurposing-adenoviruses-as-vectors-for-vaccines/

D'un point de vue clinique, l'utilisation de ces vecteurs génère une critique importante: la
première génération de vecteurs pour les vaccins à base d'adénovirus archétypaux humains
AdHu5 a montré peu d'efficacité dans les études cliniques.
Il a été découvert plus tard qu'un pourcentage élevé d'adultes humains hébergeaient des
titres importants d'anticorps neutralisants contre les sérotypes humains courants tels que
AdHu2 et AdHu5, à la suite d'une infection naturelle.
Les anticorps neutralisants pourraient réduire la puissance des vaccins viraux vectoriels en
bloquant l'entrée virale dans les cellules hôtes et donc la libération du transgène dans la
cible.
La survenue d'une immunité antivectorielle préexistante est traitée par le développement de
nouveaux vecteurs adénoviraux basés sur des sérotypes auxquels la population humaine est
moins susceptible d'êtreété exposés, y compris ceux d'origine chimpanzé.
Cependant, certains de ces vecteurs adénoviraux chimpanzés ont également une efficacité
limitée basée sur l'immunité, inexpliquée dans les populations humaines, de différents
niveaux de réactivité croisée avec les adénovirus humains et une croissance sous-optimale
dans les lignées cellulaires transformées, de sorte que les industries ont une gamme de
différents vecteurs adénoviraux disponibles pour une utilisation dans l'immunisation contre
différentes maladies, car l'induction d'anticorps neutralisants contre un vecteur peut
empêcher leur ré-administration pour une autre indication.

71
Extrait de https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1462960/figure/fig1/

Légende : Conséquences de l'immunité du vecteur adénoviral (Ad).

L'immunité HAd préexistante inhibe la transduction initiale avec des vecteurs HAd et
empêche ainsi la première utilisation de nombreux vecteurs HAd. Chez les sujets sans
immunité HAd préexistante, la première utilisation du vecteur HAd induirait de fortes
réponses immunitaires innées, cellulaires et humorales. L'immunité cellulaire élimine la
plupart des cellules transduites tandis que l'immunité humorale bloque l'infection ultérieure
avec le même vecteur HAd.

72
 PROTOCOLE DE L'ÉTUDE CLINIQUE POUR LE VACCIN ChadOx1 nCov-19

Examinons maintenant le protocole de l'essai clinique de phase 1 du vaccin qui sera

probablement déjà disponible à l'automne et évaluons quels sont les problèmes de sécurité.
Seules les pièces les plus importantes sont répertoriées :
(extrait de: http://www.isrctn.com/ISRCTN15281137
https://www.covid19vaccinetrial.co.uk/files/cov001pisv3202apr2020pdf)

ChAdOx1 nCoV-19 consiste en un virus (ChAdOx1), qui est une version affaiblie d'un virus du
rhume des chimpanzés commun (adénovirus), génétiquement modifié de sorte qu'il lui est
impossible de se développer chez l'homme. À ce virus, nous avons ajouté des gènes qui
produisent des protéines à partir du virus COVID-19 (SARS-CoV-2) appelé glycoprotéine Spike
(S), qui jouent un rôle essentiel dans la voie d'infection du virus SARS-CoV-2

Les vaccins produits par le virus ChAdOx1 ont été administrés à ce jour à plus de 320
personnes et se sont révélés sûrs et bien tolérés, bien qu'ils puissent provoquer des effets
secondaires temporaires qui sont expliqués ci-dessous (voir la section La participation au
processus comporte des risques. ?)

Jusqu'à présent, ce vaccin n'a été testé que sur des souris de laboratoire et d'autres espèces
animales et c'est la première fois que le vaccin sera administré à l'homme.
En raison du besoin urgent d'un vaccin COVID-19, avec l'accord de la MHRA, certains des
tests normalement requis pour un vaccin nouvellement fabriqué ont été modifiés, afin de
rendre le vaccin disponible plus rapidement pour une évaluation en cette étude clinique. Cela
ne devrait pas avoir d'impact sur la sécurité des vaccins.

Dans cette étude, nous utiliserons un vaccin autorisé contre le méningocoque des groupes A,
C, W et Y (MenACWY) comme vaccin de « contrôle actif », pour nous aider à comprendre la
réponse des participants au ChAdOx1 nCoV-19. MenACWY est administré aux adolescents au
Royaume-Uni depuis 2015 et protège contre l'une des causes les plus courantes de méningite
et de septicémie. Ce vaccin est également administré comme vaccin de voyage pour les pays
à haut risque. Nous utiliserons l'une des deux versions autorisées de MenACWY, Nimenrix ou
Menveo.

Visite de dépistage - 2 heures (examiner la fiche d'information des participants avec un

enquêteur, formulaire de consentement, vérification d'identité, discuter des antécédents
médicaux, examen physique, signes vitaux mesurés, analyseéchantillon de sang et d'urine).

Visites de vaccination – 2 ½ heures (signes vitaux, test sanguin, test de grossesse dans l'urine,
recevoir le vaccin, 1 heure d'observation à la clinique après le vaccin).

« Journal électronique » à compléter à la maison :

Nous vous fournirons un thermomètre, un ruban à mesurer et un compte internet pour
enregistrer tous les symptômes et la température tous les jours pendant 7 jours après la
vaccination. Après ces 7 jours, nous vous demanderons de vous inscrire si vous ne vous sentez
pas bien ou si vous prenez des médicaments dans les 3 prochaines semaines. Le personnel de

73
recherche vérifiera le journal électronique et pourra appeler pour demander plus
d'informations.

Visites de suivi - 30 minutes (signes vitaux, analyses de sang et recherche d'effets secondaires
ou de nouveaux problèmes de santé).
Après la vaccination, nous vous demanderons de participer à une série de visites de suivi,
selon le groupe auquel vous êtes affecté (d'une durée d'environ 30 minutes), comme détaillé
dans les tableaux à la fin de ce document. Pour les groupes 1 et 3, il faudra effectuer de
courtes visites 3 et 7 jours après chaque vaccin pour s'assurer que tout se passe bien, vérifier
les symptômes, le site d'injection et faire des analyses de sang. Nous vérifierons vos
observations, prendrons un échantillon de sang et examinerons votre agenda électronique
complet. Il vous sera également demandé de participer à une visite supplémentaire 1 an
après la vaccination pour nous fournir des informations supplémentaires utiles sur le vaccin,
mais cette visite sera facultative pour participer.

Effets secondaires de la vaccination

Certains symptômes au site de vaccination, ainsi que des symptômes généraux de la
vaccination, sont susceptibles de se produire. Il est important de se rappeler qu'il s'agit de
vaccins à un stade précoce de développement et que la quantité de données de sécurité
disponibles est limitée. Pour cette raison, il est possible qu'un effet secondaire plus grave se
produise que celui décrit ci-dessous ou qu'il n'ait jamais été vu auparavant.
a) Réactions locales au site de vaccination.
Un inconfort au site d'injection peut survenir pendant la vaccination
b) Réactions générales
Au cours des 24 à 48 premières heures après la vaccination, des symptômes pseudo-grippaux
peuvent survenir
c) Réactions graves
Comme pour toute vaccination, il existe un risque d'effets indésirables rares et graves, tels
qu'une réaction allergique. Ceux-ci peuvent être liés au système immunitaire ou au système
nerveux. Les réactions allergiques graves aux vaccins (anaphylaxie) sont rares, mais peuvent
être fatales. Les réactions dans le système nerveux sont également extrêmement rares, mais
elles peuvent provoquer une maladie appelée syndrome de Guillain-Barré. Il s'agit d'une
condition dans laquelle les gens peuvent développer une faiblesse grave et qui peut être
mortels.

Préoccupations théoriques - ce vaccin pourrait-il aggraver la maladie du COVID-19 ?

Par le passé, plusieurs vaccins expérimentaux ont été développés par plusieurs équipes de
recherche contre le virus du SRAS, qui appartient à la même famille que le virus COVID-19 et
infecte également les poumons. Dans certains cas, les animaux qui ont reçu certains types de
vaccins expérimentaux contre le SRAS semblent développer une inflammation pulmonaire
plus grave lorsqu'ils ont ensuite été infectés par le SRAS que les animaux non vaccinés.
Des études animales sont actuellement en cours sur le vaccin ChAdOx1 nCoV-19, mais nous
ne savons pas encore si cela pourrait également être un effet secondaire de l'exposition au
virus pandémique COVID-19 dans cette étude sur le vaccin COVID-19, si cet effet pouvait se
produire chez l'homme ou s,i dans certains cas, cela pourrait conduire à une maladie plus
grave COVID19.

74
De la révision de la fiche d'étude clinique proposée, les problèmes critiques suivants peuvent
être observés qui ne permettent pas d'évaluer correctement la sécurité du futur vaccin :

 Les vaccins dans lesquels le même vecteur adénoviral utilisé pour préparer le vaccin
contre le SRAS-Cov-2 a été utilisé ont été testés en phase 1 (320 personnes)96 et donc
les données sont extrêmement limitées. L'affirmation précédente selon laquelle ce
type de vaccin est sûr et bien toléré est trompeuse car une étude aussi limitée ne
peut donner aucune garantie de sécurité.

 Un groupe de vaccinés avec le vaccin antiméningococcique est utilisé comme témoin,

défini comme sûr car il est déjà autorisé et administré depuis un certain temps.
Par conséquent, le groupe témoin négatif avec placebo (eau physiologique) et le groupe des
non vaccinés manquent, ce qui permettrait de quantifier l'incidence réelle des effets
indésirables aigus et surtout à long terme.
De cette façon, un biais de données est déjà présent avec une sous-estimation significative
des effets indésirables.

Pour connaître les effets indésirables signalés dans la fiche technique du vaccin
antiméningococcique :

Les informations suivantes sont extraites du résumé des caractéristiques du produit de

Nimenrix déclaré par le fabricant :97
Syncope : Une syncope (évanouissement) peut survenir après ou même avant toute
vaccination, en particulier chez les adolescents en tant que réponse psychogène à l'injection
d'aiguille. Il peut être accompagné de divers signes neurologiques tels que des troubles
visuels transitoires, des paresthésies et des mouvements tonico-cloniques des membres
pendant la phase de récupération.

Thrombocytopénie et troubles de la coagulation : Nimenrix doit être administré avec

prudence chez les sujets atteints de thrombocytopénie ou de tout trouble de la coagulation,
car des saignements peuvent survenir après l'administration intramusculaire chez ces sujets .

Immunodéficience : une réponse immunitaire adéquate peut ne pas être induite chez les
patients recevant un traitement immunosuppresseur ou chez les patients présentant une
immunodéficience.Les sujets présentant une déficience héréditaire du complément (par

96
https://www.precisionvaccinations.com/vaccines/chadox1-mers-mers-cov-vaccine
Numero partecipanti = 24

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.13.036293v1
studio preclinico su animali

https://www.vaccitech.co.uk/pipeline/ vaccini che utizzano lo stesso vettore (Vaccitech)

97
RIFLESSIONI SUL VIRUS SARS-CoV-2 E LA CORSA AL VACCINO
https://www.nexusedizioni.it/it/CT/riflessioni-sul-virus-sars-cov-2-e-la-corsa-al-vaccino-6015

riassunto delle caratteristiche del prodotto: NIMENRIX

https://ec.europa.eu/health/documents/community-register/2012/20120420120470/anx_120470_it.pdf

75
exemple une carence en C5 ou C3) et les personnes recevant des traitements qui inhibent
l'activation terminale du complément (par exemple l'éculizumab) ont un risque accru de
maladie invasive causée par Neisseria meningitidis sérogroupe A, C , W-135 et Y, bien qu'ils
développent des anticorps après vaccination avec Nimenrix.

Pharmacovigilance active : 7 jours ; suit la pharmacovigilance passive pendant 3 semaines

puis à la discrétion de la personne visitée après un an.
Dans ce mode, seules les réactions aiguës non graves courantes sont détectées.
L'anaphylaxie aiguë et le syndrome de Guillain Barrè (dont le délai d'apparition peut aller
jusqu'à 6 semaines et qui est un événement indésirable potentiel du vaccin
antiméningococcique qui agit comme témoin)98 sont également considérés comme des
effets indésirables graves aigus, même si on affirme déjà qu'il s'agit de réactions
respectivement rares et extrêmement rares, tandis que la possibilité de réactions à plus long
terme peut se présenter.

Aggravation de la maladie en cas d'infection (EIM) : interroge sur la possibilité théorique de

cette maladie très grave: à partir de la comparaison entre animaux vaccinés et non vaccinés,
le groupe de patients vaccinés a montré de graves complications suite à une infection
secondaire à la vaccination.Cette preuve, bien que théorique chez l'homme car le vaccin n'a
jamais été testé auparavant, mais extrêmement grave pour la sécurité des vaccinés, aurait
dû pour cette raison nécessiter des études précliniques avec des groupes non vaccinés sur
les animaux et le groupe témoin avec placebo et le groupe jamais vacciné dans l'étude
clinique.

On peut donc en conclure que ce type d'expérimentation, qui sera la seule à être réalisée
avant la commercialisation du vaccin, n'est absolument pas en mesure de fournir des
données sur la sécurité du vaccin, car pour évaluer le risque d'EIM, il faut attendre que les
volontaires vaccinés contractent la maladie dans les deux groupes, ce qui ne peut pas se
produire pendant l'essai clinique, mais seulement après la commercialisation. Le syndrome
auto-immun / inflammatoire,qui est l'effet indésirable potentiellement le plus grave de ce
vaccin, pourrait avoir un temps de latence supérieur à 7 jours au cours duquel une
pharmacovigilance active a lieu, et peut donc ne pas être associé de manière causale au
vaccin.

Il s'ensuit qu'étant donné les risques déjà connus de ce vaccin expérimental, il aurait fallu
procéder à l'étude préclinique et aux études de phase II et III avant de procéder à
l'autorisation de mise sur le marché, notamment sur la base également de la considération
que dans cette étude clinique seules les personnesen parfaite santé sont admises, alors que
lorsqu'il sera administré à l'ensemble de la population, le risque de réactions indésirables
graves est certainement plus importantet significatif pour les catégories déjà affectées par
des maladies plus invalidantes pour lesquelles le vaccin sera plus recommandé.

98
Therapie. 2019 Sep;74(4):495-498. doi: 10.1016/j.therap.2018.12.008.
[Guillain-Barré syndrome to meningococcal conjugate vaccine: Menveo®].[Article in French]
Moukafih B1, Lachhab Z2, Moutaouakkil Y3, Fettah H2, Ahizoune A4, Tadlaoui Y2, Bennana A2, Lamsaouri J2,
Bousliman Y3

76
 CONCLUSIONS

De ce qui précède, et à la lumière de la récente grande catastrophe du vaccin Sanofi contre

la dengue, un vaccin qui avait même été testé sur 35’000 sujets, il s’avère que : aujourd'hui,
pour le SRAS-CoV-2, il était obligatoire de procéder avec une attention multipliée aux études
précliniques, aux études de phase II et III avant de procéder à des protocoles de validation
hâtive, d'autant plus que dans les protocoles actuels, seules les personnes en bonne santé
sont autorisées, alors que lorsqu'il sera administré à l'ensemble de la population, le risque
de réactions indésirables graves sera certainement plus important et plus significatif pour les
catégories déjà touchées par des pathologies plus invalidantes pour lesquelles le vaccin sera
recommandé ou, pire, rendu obligatoire.

Dre Loretta Bolgan ÉBAUCHE PERSONNELLE

Rev_18.05.2020

77