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FACULTÉ DE TECHNOLOGIE
THÈSE
DOCTORAT
Par
BOUOUDEN Walid
THÈME
DEDICACES
JE DEDIE CE TRAVAIL :
Je ne trouverai jamais assez de mots pour vous exprimer tout l’amour que
je vous porte, ma reconnaissance et ma profonde gratitude pour vos énormes
sacrifices que vous avez consenti pour moi tout le long de ma vie ;
Je prie Allah, Dieu le tout puissant, qu’il vous accorde longue et heureuse
vie et qu’il me pardonne la peine que je vous ai infligée durant ces années
d’études ;
A tous mes proches qui m’ont accordé leur soutien, y compris mes sœurs
et mon frère ;
A tous ceux qui m’ont aidé à réaliser de près ou de loin ce modeste travail.
Walid BOUOUDEN
Remerciements
REMERCIEMENTS
Je tiens à remercier particulièrement mon Directeur de thèse Pr. YACINE BENGUERBA pour m’avoir encadré
pendant ces années avec beaucoup d’enthousiasme. Je lui adresse mes plus sincères remerciements pour la confiance
qu’il m’a accordée, et pour avoir toujours fait preuve d’une grande disponibilité à mon égard.
Bien évidemment, l’étape finale de ces années de travail ne pourra être complétée que par l’évaluation et
l’appréciation des membres de jury : à savoir, le président Pr. BENTOUHAMI Embarek et les examinateurs, Pr. SOBHI
Widad, Pr. KHEMILI-TALBI Souad et Dr. CHAFAI Nadjib, à qui j’exprime à travers ces mots, ma profonde reconnaissance
pour avoir honorer par leur présence ce jury, accepter de juger ce travail et me faire profiter de leurs expertises.
Enfin et avec un réel plaisir, je réserve ces lignes en signe de gratitude et de profonde reconnaissance à tous ceux qui,
Walid BOUOUDEN
Sommaire
i
Sommaire
ii
Sommaire
Conclusion Générale………………………………………………………………………………… 99
iii
Liste des figures
iv
Liste des Acronymes et Symboles
v
Liste des Acronymes et Symboles
vi
Liste des Acronymes et Symboles
vii
Introduction générale
Introduction générale
Introduction générale
Parmi les éléments de la famille de ces nanoparticules, il y a d’une part, les nanotubes
de carbone (NTC) qui ont suscité une grande attention dans la société scientifique en raison de
leurs excellentes propriétés mécaniques, optiques, électroniques et physico-chimiques ainsi que
de leur structure extraordinaire, qui les rendent largement applicables dans un grand domaine
scientifique. Les utilisations des NTC dans le domaine biomédical se sont considérablement
accrues au cours de la dernière décennie. Leur capacité à pénétrer dans les cellules, leur faible
toxicité, leur surface spécifique élevée, l'amélioration du transport ciblé des médicaments, en
font des nanomatériaux prometteurs pour le système de consommation de médicaments avec
ciblage de leur administration aux cellules cancéreuses [2].
D’autre part, il existe aussi les (BNNT) qui représentent une classe passionnante de
matériaux tubulaires inorganiques. Ils sont naturellement non cytotoxiques et ont la capacité de
réagir avec des groupes chimiques pour se lier aux protéines et aux cellules, ce qui en fait des
matériaux appropriés pour une utilisation en tant que biocapteurs en nano-médecine [3].
Ces deux familles de NP interviennent de plus en plus dans le traitement des maladies
pulmonaires notamment l’asthme, où les sujets sont exposés à plusieurs maladies respiratoires
chroniques posant un grave problème de santé publique en raison de leur fréquence, de leur
gravité, de leurs incidences économiques, dont l’asthme, la maladie pulmonaire obstructive
chronique (MPOC), le cancer du poumon, la tuberculose et la fibrose kystique [4]
Parmi ces cancers du poumon il existe trois principaux types de traitements : la
chirurgie, la radiothérapie et les traitements systémiques (ou généraux) comme la
chimiothérapie, les thérapies ciblées ou l’immunothérapie. Ces options thérapeutiques peuvent
être utilisées seules ou associées. La prise en charge des cancers pulmonaires avancés a été
transformée ces dernières années par la personnalisation des traitements qui peuvent présenter
plusieurs effets indésirables [5]. A ce stade, une question primordiale se pose : comment le
1
Introduction générale
principe actif (avec des concentrations suffisantes pour être efficaces) pourrait-il cibler les
zones malades sans toucher les cellules saines et sans induire des dégâts ainsi qu’une
accumulation toxique dans d’autres tissus ? D’où, la nécessité primordiale de développer des
vecteurs de principe actif pour une délivrance spécifique du médicament vers leur site actif [6],
Dans ce sens, notre thèse débute par une introduction générale sur l’objectif de notre
travail, suivie de quatre chapitres essentiels que sont :
-Le chapitre-I, est consacré à des généralités sur les poumons et les maladies respiratoires
chroniques qui peuvent les affecter,
-Le chapitre-II, porte sur l’utilisation de la nanotechnologie dans le domaine médical (les
nanoparticules) où parmi les applications les plus avancées dans ce domaine, se situe la
délivrance de médicaments, et notamment le développement de thérapies ciblées anti-
cancéreuse où les nanotubes ont été choisis par rapport à d’autres composés vu leur meilleure
délivrance d’agents thérapeutiques dans la zone d’intérêt tout en limitant leur arrivée dans
d’autres tissus.
-Le chapitre-III, porte sur la définition et les principes des méthodes de modélisation
moléculaire pour comprendre la structure et les différentes propriétés physico-chimiques des
complexes nanotubes-médicament. Ces méthodes peuvent être réparties en trois catégories :
Les méthodes quantiques, la mécanique moléculaire et la dynamique moléculaire.
-Le chapitre-IV, présente une étude comparative de l’affinité entre les nanotubes de carbone
(NTC) et les nanotubes de bore de nitrure (BNNT) en tant que nanovecteurs vis-à-vis de la
molécule médicamenteuse Crizotinib, en utilisant les calculs DFT dans les phases aqueuse et
gazeuse.
2
Chapitre I
Maladies pulmonaires spécifiques
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
I.1. Introduction
Plusieurs millions de personnes sont touchées par une maladie respiratoire importante. Près de
60 000 hospitalisations causées par une maladie respiratoire sont répertoriées annuellement et
le taux d’hospitalisation est 30% plus élevé chez les hommes comparativement aux femmes.
De plus, 5 000 décès par année sont causés par une maladie respiratoire, ce qui représente
environ 10% de l’ensemble des décès annuels [7].
Ces maladies respiratoires ont également des répercussions économiques très importantes sur
le système de soins de santé. Ces coûts incluent les frais directs de soins de santé tels que les
hospitalisations, les consultations médicales, la recherche et les médicaments et représentaient
environ 5,7 milliards de dollars en 2007 [9]. À cette même date, les coûts indirects liés à
l’invalidité et à la mortalité des patients représentaient un montant supplémentaire de 6,72
milliards de dollars [8].
I.2. L’asthme est une maladie très prévalente et affecte tous les groupes d’âge. Environ 235
millions de personnes, provenant des différents continents, souffrent d’asthme et la plupart des
décès liés à cette maladie surviennent dans des pays à faible et moyen revenu. En effet, l’asthme
est une maladie pulmonaire chronique associée à une inflammation des voies aériennes à
prédominance éosinophilique et caractérisée par une obstruction bronchique réversible. Les
lignes directrices Canadiennes pour l’asthme, mis à jour en 2012, définissent l’asthme comme
étant une « atteinte inflammatoire des voies aériennes caractérisée par des symptômes
paroxystiques ou persistants, comme la dyspnée, l’oppression thoracique, les sibilances, la
production de mucus et la toux, associés à une obstruction variable du passage de l’air et à des
degrés divers d’hyperréactivité des voies aériennes à des stimuli endogènes ou exogènes » [10].
Ils sont associés à l’asthme sont, entre autres, la prédisposition génétique et l’exposition
environnementale à des substances inhalées et/ou des particules pouvant provoquer une réaction
allergique ou une irritation des voies respiratoires, par exemple, la poussière (allergène
4
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
Ils se manifestent par de la toux, une respiration sifflante, des expectorations, une oppression
thoracique ainsi qu’une dyspnée. Il existe des traitements qui peuvent soulager les différents
symptômes associés à l’asthme, mais bien qu’ils assurent une meilleure maitrise de la maladie,
ils ne permettent pas la guérison complète. Les corticostéroïdes inhalés (CSI) sont à la base du
traitement de l’asthme. Ils peuvent être donnés seuls ou combinés à un bronchodilatateur β2-
agonistes à longue durée d’action (BALA) [9, 10]. Pour assurer une efficacité maximale de la
médication, il faut d’abord minimiser l’exposition aux facteurs aggravants l’inflammation ou
l’irritation des voies respiratoires, en contrôlant l’environnement de la personne atteinte
d’asthme [12].
I.2.3. Diagnostic
Habituellement, les crises d’asthme sont plus intenses au lever et au coucher et peuvent être
déclenchés par l’exercice, des allergènes, l’air froid et même par un rire prolongé [13]. Une
nouvelle avenue pour le diagnostic de l’asthme résiderait dans la mesure de l’oxyde nitrique
exhalé (FENO), cet outil pourrait être jumelé au décompte d’éosinophiles présents dans les
expectorations et à la spirométrie pour faciliter le diagnostic de l’asthme. Toutefois, la relation
exacte entre la fraction FENO et la physiopathologie de l’asthme reste encore à définir [14].
Idéalement, le diagnostic d’asthme chez un patient devrait être confirmé avant le début du
traitement, car il est plus difficile de le poser lorsque le patient est sous traitement. Selon une
étude parue en 2012, la réussite d’un traitement en asthme passe par l’éducation et la
participation des patients, ainsi que par l’adhésion de ces derniers à leur médication [15].
I.2.4. Traitement
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Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
Lors de l’évaluation de la maitrise de l’asthme d’un patient, il est primordial de tenir compte
des deux composantes que sont le contrôle des symptômes et le risque futur d’exacerbations.
La mesure de la fonction pulmonaire est une partie importante de l’évaluation du risque futur
d’exacerbation. Elle devrait être mesurée lorsqu’on commence un nouveau traitement, reprise
3 à 6 mois suivant le début du traitement ainsi que périodiquement par la suite. Une discordance
entre les symptômes et la mesure de fonction pulmonaire devrait inciter une investigation plus
approfondie [17]. Il existe trois catégories d’outils pour l’évaluation de la maitrise de l’asthme.
-Premièrement, les outils simples de mesure pouvant être utilisés pour identifier rapidement les
patients pour qui une évaluation plus approfondie est nécessaire, incluant le Royal College of
Physicians (RCP) Three Questions’tool et le 30-second Asthma Test. -Deuxièmement, le
consensus-based GINA symptom control tool, fait partie des outils catégoriques, permettant la
classification des symptômes d’asthme de manière numérique, et qui, jumelé à l’évaluation des
facteurs de risque d’exacerbation de l’asthme chez l’adulte (Tableau I-1), peut servir de guide
dans le choix de traitement [18]. -Troisièmement, il existe aussi des outils de classification
numérique du contrôle de l’asthme, tels que l’Asthma Control Questionnaire (ACQ) et
l’Asthma Control Test (ACT), permettant de faire la distinction entre différents niveaux de
contrôle des symptômes de l’asthme. Les outils numériques sont généralement plus sensibles
aux changements dans le contrôle des symptômes de l’asthme, comparativement aux outils
catégoriques [19].
6
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
Avoir au moins un de ces facteurs de risque augmente le risque d’exacerbation même si les symptômes de
l’asthme sont sous contrôle.
Mauvais contrôle des symptômes d’asthme
Symptômes diurnes d’asthme plus de 2 fois/semaine
Réveil nocturne causé par l’asthme
Utilisation de la médication de secours plus de 2 fois/semaine
Limitation des activités causée par l’asthme
Utilisation élevée de BACA (augmentation de la mortalité si >1 inhalateurs x 200-doses/mois)
Utilisation inadéquate de CSI (non prescrit, mauvaise adhésion ou mauvaise technique d’inhalation)
VEMS < 60% de la valeur prédite
Problèmes psychosociaux ou socioéconomiques majeurs
Comorbidités tels que l’obésité, rhinosinusite, allergies à la nourriture confirmées
Éosinophilie sanguine ou dans les expectorations
Grossesse
Intubation ou soins intensifs pour asthme
≥ 1 exacerbation sévère dans les 12 derniers mois
Aux États-Unis, les coûts annuels liés à l’asthme sont d’environ 15 milliards de dollars
Américain et 80% de ces coûts directs sont engendrés par 10-20% des asthmatiques [17]. En
2011 au Canada, l’asthme a engendré des coûts de 1,8 milliard de dollars [21].
Elle englobe deux entités cliniques, la bronchite chronique et l’emphysème. C’est une maladie
respiratoire chronique caractérisée par une obstruction des voies respiratoires persistante et
progressive, associée à une réponse inflammatoire chronique au niveau des voies respiratoires
lors du contact avec des particules et gaz nocifs. À l’échelle mondiale, en 2005, environ 65
millions de personnes vivaient avec un diagnostic de MPOC. De ces personnes, plus de trois
millions sont décédées au cours de cette même année. Ces données proviennent de pays où les
habitants ont majoritairement un revenu élevé. Au Canada, entre 5 et 15% de la population âgée
de 35 à 79 ans rencontreraient les critères indiquant la présence d’une MPOC, alors que
seulement 4% de la population canadienne et le même pourcentage de la population québécoise
rapportent avoir eu un diagnostic de MPOC posé par un médecin. La MPOC est la cause
d’hospitalisation canadienne la plus fréquente parmi les principales maladies chroniques que
7
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
I.4. Le cancer broncho-pulmonaire est responsable de la plus grande mortalité par cancer
dans le monde. Il constitue un véritable problème de santé publique [23].
Dans la grande majorité des cas, les cancers du poumon sont causés par le tabagisme.
Cependant, d’autres facteurs environnementaux peuvent contribuer à la carcinogénèse agissant
souvent comme facteurs synergique avec le tabac [24].
Découvert fortuitement sur imagerie ou suspecté devant des symptômes respiratoires, le cancer
broncho-pulmonaire primitif est souvent diagnostiqué tardivement. Seul l’examen
anatomopathologique permet de poser le diagnostic avec certitude.
les Carcinomes Bronchiques à Petites Cellules (CBPC), environ 15% des cas et,
les Carcinomes Bronchiques Non à Petites Cellules (CBNPC), environ 85% des cas.
8
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
Anatomie descriptive
9
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
Figure I-2. Nœuds lymphatiques concernés par le cancer bronchique selon la classification
internationale de Mountain et Dres
Les cellules cancéreuses - celles du cancer broncho-pulmonaire entre autres- présentent des
altérations génétiques (acquises ou parfois héritées), elles résultent d'une instabilité génomique
qui s'installe progressivement par instabilité chromosomique et/ou instabilité microsatellitaire
(MSI), ces deux mécanismes n'étant pas exclusifs l'un de l'autre. Une succession d'évènements,
épigénétiques et génétiques, impliquant un grand nombre de gènes, transforme l'épithélium
normal en cancer. Le développement de mutations sur les gènes de réparation et de maintenance
de I’ADN, (oncogènes et gènes suppresseurs de tumeur), ainsi que des modifications
10
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
- Un échappement à l'apoptose ;
- Un potentiel métastatique.
En ce qui concerne l'apparition du cancer bronchique, trois théories ont été avancées [28] :
Une cancérogénèse par étapes successives où les nouvelles cellules cancéreuses ont un avantage
sur les autres et se développent ainsi ;
Il semblerait que l'on retrouve au niveau de la région 3p des gènes suppresseurs de tumeur tels
que RASSF1 (Ras association domain family), LMD1, SEMA38, SEMA3F et FHIT (fragile
histidine triade). Le rôle de FHIT est controversé mais une délétion homozygote est identifiée
dans un grand nombre de lésions prénéoplasiques et dans les cas de cancers. RASSF1 est un
gène suppresseur de tumeur qui régule négativement la voie RAS-MAPK ainsi que la
progression cellulaire en empêchant la dégradation de la protéine p53. Dans 40% des CBNPC,
11
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
son promoteur est inactivé par méthylation. SEMA3F et SEMA3B font partie de la famille des
sémaphorines et seraient des gènes suppresseurs de tumeurs impliqués dans l'apoptose et la
croissance cellulaire. Des pertes d'hétérozygotie sont également observées en 9p21 (gène p16),
en 8p21- 23, 13q14 (gène Rb) et 17p13 (p53). Dans 85% des cas de dysplasies, on observe une
aneuploïdie intéressant notamment les gènes EGFR et MYC [30].
I.4.4. Récepteurs
Cette famille de RTK comprend quatre types de récepteurs : HER1 (classiquement EGFR),
HER2, HER3 et HER4.
Les récepteurs à EGF (ou ERB) sont des protéines transmembranaires qui appartiennent à la
famille des récepteurs à tyrosine kinase (RTK). Ils sont composés de trois domaines :
La protéine EGFR est un récepteur membranaire, ubiquitaire, elle est codée par un gène situé
en 7p12-13.
Les mutations les plus fréquentes sont situées sur le domaine tyrosine kinase codant pour les
exons 18 à 21. Les mutations prédictives de réponse aux inhibiteurs de tyrosine kinase dits TKI
(tyrosine kinase inhibitors) sont les mutations sur l'exon 21 et les délétions sur l'exon 19 qui
représentent plus de 85% des mutations. Les autres mutations plus rares sont les substitutions
dans l'exon 18 et les insertions de 1 à 3 codons dans l'exon 20. Les insertions dans l'exon 20
semblent être associées à un défaut de sensibilité aux TKI. Ces mutations sont souvent associées
à une amplification génique, elle-même corrélée à la surexpression protéique mais qui n'est pas
prédictive de la réponse à la thérapie ciblée [31].
Les inhibiteurs des tyrosines kinases de l'EGFR ont l'avantage d'avoir peu d'effets secondaires
et leur administration est non invasive (per os). Cependant, la majorité des patients initialement
répondeurs progressent après 6 à 18 mois de traitement, une partie de ces résistances acquises
12
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
étant liée à la présence d'une autre mutation, située sur l'exon 20 empêchant la fixation des TKI.
Cette mutation de résistance qui est parfois détectée au stade initial de la maladie ne doit pas
faire récuser la thérapie par TKI. L'hyper expression gène c-erb-2 est retrouvée dans les cancers
non à petites cellules, et traduit un mauvais pronostic dans les adénocarcinomes [32].
I.4.5. Voies
La voie RAS/RAF/MAP :
La famille RAS comporte 3 membres nommées HRAS, KRAS et NRAS. Ce sont des protéines
G assurant la transduction du signal grâce à l'échange GDP à GTP. La protéine KRAS a la
capacité d'activer la cascade RAS/RAF/MEK/ERK. C'est également celle qui est le plus
fréquemment mutée [40].
Cette voie, qui a été la première à être identifiée dans les années 1990, est en aval d'EGFR. Elle
est activée précocement dans la carcinogénèse pulmonaire, elle joue un rôle dans la prolifération
cellulaire, l'angiogenèse et la synthèse des protéines.
Ils codent pour des protéines MYC intervenant dans le passage des 42 phases G1 à S du cycle
cellulaire. Ils sont amplifiés dans 10 à 20% des tumeurs bronchiques. Un membre de la famille
génique MYC est amplifié ou surexprimé dans 60% des lignées de carcinomes bronchiques à
petites cellules (CBPC). Tandis que le C-myc qui joue un rôle dans la prolifération et la
différenciation cellulaire est amplifié dans 10% des CNPC et surexprimé dans 45% [35].
La voie HGF/MET :
La protéine MET (mesenchymal epithelial transition factor) est un récepteur dont le ligand est
HGF (hepatocyte growth factor). Elle peut notamment activer des voies telles que
RAS/RAF/MAP ou Pl3K /AKT/mTOR, elle est impliquée dans la prolifération cellulaire,
l'invasion, la migration et l'angiogenèse des tumeurs. La voie HGF/MET peut être dérégulée
par une surexpression de HGF ou MET, une amplification, ou des mutations du gène MET.
13
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
L'amplification de MET est présente dans 1 à 5% des cancers pulmonaires non à petites cellules
et est associée à un faible pronostic. Engelman et ses collaborateurs ont rapporté que 22% des
cancers présentant une résistance aux inhibiteurs de tyrosine kinase (TKI) de EGFR ont une
amplification de MET et que cette résistance pouvait parfois être inhibée par la prise de TKI de
MET. Cette équipe a également montrée que l'amplification de MET pouvait engendrer des
résistances aux TKI de EGFR [36].
La voie ALK
En 2007, pour la première fois, une protéine de fusion impliquant le gène ALK (Anaplastic
Lymphoma Kinase) et le gène EML4 (Echinoderm Microtubule Associated Protein Like 4) a
été décrite. Cette protéine de fusion est présente dans 3 à 7% des CBNPC. Elle résulte d'une
inversion au sein du bras court du chromosome 2, liant un intron de EML443 à l'intron 19 du
gène ALK en 2p23. S’il est admis que le point de cassure de ALK ne varie pas, en revanche
EML4 peut être scindé à proximité des exons 2, 6, 13, 14, 15, 18 ou 20. En fonction des points
de cassure, la taille des protéines de fusion EML4-ALK varie, la littérature rapporte à ce jour
que treize variantes ont été identifiées. Cependant, on ne sait pas si leur implication
oncogénique est différente [37].
Les protéines de fusion du gène ALK ont un potentiel oncogénique déclenché par le
fonctionnement aberrant du site tyrosine kinase de ALK. Tout comme les protéines sauvages
ALK, elles activent de nombreuses cascades qui interagissent les unes avec les autres.
Dernièrement, différentes voies ont été étudiées dont trois sont considérées comme les plus
pertinentes. Il s'agit des voies RAS-ERK (Ras-Extracellular Signal Regulated Kinase), JAK
STAT (Janus Kinase Signal Transducers and Activators of Transcription) et enfin Pl3K
(PhosphatidyLinositol 3-Kinase) [38].
La protéine STK11 est une sérine /thréonine kinase, identifiée en 1997 en raison de son
implication dans le syndrome de Peutz-Jeghers. Cette protéine est mutée chez 30% des patients
caucasiens présentant un adénocarcinome pulmonaire.
14
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
Des chercheurs ont démontré que les délétions de STK11, chez des modèles murins mutés pour
KRAS et porteurs d'un CBP, favorisent la 44 prolifération, l'invasion et les métastases tumorales
mais qu'une mutation unique de STK11 n'engendre pas l'apparition d'un CBP [40].
Le gène P53
Il a pour la première fois été décrit en 1979. Le gène P53 est situé sur le bras court du
chromosome 17 (17p13). Il est constitué de 11 exons et code pour un facteur transcription de
53 kD a impliqué dans un grand nombre de processus biologiques comme la réparation de
I’ADN, l'arrêt du cycle cellulaire ou encore l'apoptose [41].
Les mutations du gène p53 aboutissent à la formation d'une protéine anormale et sont présentes
dans environ 70% des tumeurs bronchiques. Elles sont présentes dans les états prénéoplasiques,
la fréquence augmentant avec le degré de dysplasie [42].
Une perte d'hétérozygotie est détectée dans environ 50% des CBNPC. Plusieurs études
montrent que les mutations de P53 seraient plus fréquentes dans les carcinomes épidermoïdes
que dans les adénocarcinomes, les mécanismes mutationnels diffèrent pour ces deux types
histologiques. Il semblerait également que les mutations de P53 soient conservées dans la
progression tumorale et dans l'extension métastatique [43].
Le tabac serait l'un des protagonistes à l'origine des mutations de P53, en effet selon certaines
études, elles seraient présentes chez 26 à 71% des patients fumeurs contre 8 à 47% des patients
non-fumeurs. Par contre les études sont pour l'instant contradictoires en ce qui concerne le lien
entre exposition à l'amiante et mutations de p53 [45].
La voie Rb IP16
15
Chapitre I Maladies pulmonaires spécifiques
Conclusion
Les maladies respiratoires chroniques sont des maladies chroniques qui affectent les voies
aériennes et d'autres parties du poumon. Parmi les plus courantes, on retrouve l'asthme, la
maladie pulmonaire obstructive chronique (MPOC) et le cancer du poumon
L’asthme est une maladie chronique qui se caractérise par des crises récurrentes où l’on
observe des difficultés respiratoires et une respiration sifflante et dont la gravité et la fréquence
varient d’une personne à l’autre. Les symptômes peuvent se manifester plusieurs fois par jour
ou par semaine et s’aggravent chez certains sujets lors d’un effort physique ou pendant la nuit.
Environ 235 millions de personnes en souffrent actuellement dans le monde. C’est la maladie
chronique la plus courante chez l’enfant.
Les cancers dits « à petites cellules » qui représentent 15 à 20 % des cancers bronchiques
16
Chapitre II
Nanovecteurs administrateurs de
médicaments
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
II.1. Introduction
Ces dernières années, les nanoparticules (NPs) constituent des plateformes très
prometteuses de la recherche dans plusieurs domaines tels que la biologie, la physique et la
chimie. Ainsi, les NPs permettent de délivrer un agent de contraste ou thérapeutique
sélectivement vers une zone ciblée, telle qu’une cellule par exemple. Dans ce chapitre, nous
présenterons les principaux types de nanoparticules servant à la vectorisation (nanovecteurs)
utilisées en nanomédecine ainsi que leurs propriétés et leurs applications. Ce chapitre
s’intéressera ensuite aux propriétés des NTC et BNNT et au choix de ce type de vecteur [47].
II.2. Nanoparticules
Les nanoparticules sont constituées d’un assemblage atomique aboutissant à une structure de
taille nanométrique comprise entre 1 à 100 nm. Les nanoparticules sont caractérisées par leur
taille (nanométrique) qui peut offrir alors une énorme surface spécifique et une stabilité
importante. Ainsi, les nanoparticules peuvent former des dispersions homogènes qui ne
sédimentent pas, et sont capables par exemple d’arriver à leurs cibles cellulaires de manière
sélective. Par conséquent, ces nanoparticules peuvent jouer un rôle important dans la
vectorisation ciblée prometteuse des principes actifs. Parmi les applications les plus avancées
dans ce domaine, se situe le cheminement de délivrance ciblée des médicaments, et notamment
le développement de thérapies ciblées anti-cancéreuses. Cela permet, d’une part, d’augmenter
la sélectivité des molécules anti-tumorales délivrées par les complexes de nanoparticules, et
d’autre part, de réduire les effets secondaires résultants de la chimiothérapie [48].
18
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
les cellules saines et sans induire des dégâts ainsi qu’une accumulation toxique dans d’autres
tissus ? A noter que malgré l’efficacité du traitement, les conséquences inacceptables et
inappropriées peuvent aboutir à l’abandonner.
Par ailleurs, les principes actifs (95% possèdent des propriétés pharmacocinétiques faibles) ne
peuvent pas traverser les différentes barrières qui séparent le site d’administration du
médicament de son site d’action. Ceci est dû à leurs caractéristiques physico-chimiques
(hydrophilie, poids moléculaire, etc…) peu efficaces pour une meilleure absorption, et qui
peuvent aboutir à une dégradation, une métabolisation ou une élimination de ces principes
actifs. Par conséquent, les traitements actuels, ne pourraient pas atteindre leur cible. D’où, la
nécessité primordiale de développer des nanovecteurs de principes actifs pour une délivrance
spécifique des médicaments vers leur site actif [50].
II.2.2 Applications
Les champs d’applications des nanoparticules sont très vastes. Comme nous l’avons dit
précédemment, les nanoparticules sont connues surtout pour délivrer des principes actifs
thérapeutiques et diagnostics vers une cible donnée. Au niveau thérapeutique, nous pouvons
citer quelques exemples de nanoparticules.
19
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
d’intérêt vers une cible tout en protégeant les principes actifs thérapeutiques ou diagnostics.
Elles apparaissent donc comme des éléments de vectorisation exceptionnels [51].
20
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
hydrophobe dirigée vers l'intérieur. Elles se forment quand la concentration en surfactant dans
le milieu dépasse un seuil (ou concentration micellaire critique). Le type de micelles dépend du
surfactant mis en jeu, comme par exemple les micelles à base de phospholipides ou de
surfactants PEGylés.
Les nanoparticules polymériques à base de polymères (polysaccharides par exemple)
sont biocompatibles, beaucoup plus stables que les liposomes, et biodégradables. Cependant,
leur production est difficile, leur rendement de fabrication est faible et leur durée de
conservation est limitée. Les principaux inconvénients des nanoparticules polymériques
proviennent des importants déchets de solvants suite à leur synthèse, ce qui pourrait induire une
possible toxicité cellulaire.
Les dendrimères sont très ramifiés, ont une taille comprise entre 1 et 10 nm et se
forment par addition contrôlée de couches successives de monomères à partir d’un monomère
existant au cœur de la particule. Leur synthèse est limitée car délicate. Les nanogels sont
constitués de polymères hydrophiles mais utilisés d’une façon moins courante. Ils sont plus
flexibles que les autres nanoparticules polymériques. Ils possèdent une particule finale gonflée
d’eau et donc une grande surface spécifique et une importante capacité d’encapsulation.
Les nanoparticules lipidiques sont non toxiques, biodégradables et à base de
triglycérides. Ainsi, nous pouvons citer les nanoparticules lipidiques solides (NLS) les plus
importantes dans cette catégorie de nanoparticules. Les NLS sont constituées d’une matrice de
lipides solides, et sont plus stables. En revanche, elles ont quelques inconvénients tels que
l’accroissement de la taille avec le temps, leur possibilité de former des gels d’une façon
inattendue et leur faible rendement d’encapsulation des principes actifs. Les nanocapsules
lipidiques (NCL) sont formées d’une partie lipidique centrale liquide enfermée dans une
enveloppe solide.
Les nanoparticules inorganiques sont représentées par les nanoparticules magnétiques
et les nanocristaux semi-conducteurs.
21
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
Afin d’améliorer la fonction biologique des nanoparticules, celles-ci ont été classées selon trois
générations [48].
En principe, les agents thérapeutiques de faible poids moléculaire sont encapsulés par des
nanoparticules de 10 nm par exemple. Mais, le paramètre de faible taille ne leur permet pas
d’avoir une grande diffusion dans le sang. Ainsi, les nanoparticules sont reconnues par le
système immunitaire et phagocytées par les macrophages. Donc, pour surmonter la phagocytose
et pour que les nanoparticules puissent arriver aux zones ciblées, la notion furtivité a été utilisée.
Les nanoparticules furtives de seconde génération ont été mises en place suite à une
addition d’un agent de furtivité à la surface des nanoparticules de la première génération (Figure
II-2 B) pour limiter l’opsonisation.
Les agents de furtivité sont biocompatibles, solubles en milieu aqueux, non toxiques et ont par
ailleurs une faible immunogénicité. Parmi ces agents utilisés pour protéger les nanoparticules,
nous pouvons citer les polymères comme le polyéthylène glycol (PEG) par exemple. Ainsi, la
taille et la structure des chaînes polymériques ont un grand impact dans l’amélioration du taux
de PEGylation à la surface des particules : plus la chaîne de PEG est ramifiée, plus elle est
efficace [53].
L’activité thérapeutique ou diagnostic des principes actifs est trop limitée par les mécanismes
métaboliques. En effet, l’excrétion de ces principes actifs va diminuer leur quantité qui arrive
dans la zone cible, et ils vont s’accumuler dans les organes de séquestration tels que le rein, le
foie et la rate. La toxicité induite au niveau de ces tissus s’en retrouve donc augmentée. Ainsi,
22
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
des possibilités de modification de la surface des nanoparticules ont été mises en place afin
d’augmenter la durée de vie des nanoparticules portants les agents thérapeutiques et de relarguer
lentement les principes actifs dans le sang.
Elles sont mises en place pour limiter la longue persistance des nanoparticules de deuxième
génération dans le sang et leur extravasation dans les zones extrêmement vascularisées comme
le foie. Ainsi, pour favoriser l’accumulation des nanoparticules dans une zone d’intérêt, il est
important de fonctionnaliser leur surface par des ligands biologiques reconnus par les cellules
cibles. Les ligands ont des natures et des structures différentes telles que des saccharides, des
oligonucléotides, des anticorps, des peptides, ou d’autres types de molécules comme le folate.
Etant donné que l’addition de ces ligands à la surface des nanoparticules favorise leur
phagocytose par les macrophages, il est indispensable d’associer les agents de ciblage aux
agents de furtivité pour contrebalancer cet effet. Cependant, et pour éviter la formation d’une
barrière stérique masquant les ligands, les agents de ciblage sont éloignés du cœur de la
nanoparticule par un bras espaceur dans le but d’avoir une plus grande liberté de mouvement à
la surface de la couche de furtivité et favoriser ainsi sa liaison avec la cible. En outre, le bras
espaceur flexible joue un rôle important dans la liberté de mouvement de l’agent de ciblage afin
d’augmenter la possibilité d’interaction entre le ligand et la cible dans les meilleures conditions.
23
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
D’après tout ce qui précède, nous pouvons dire que les nanoparticules forment une unité
d’assemblage sur laquelle différents agents peuvent se fixer tels que les agents de furtivité, de
ciblage, de contraste, les agents thérapeutiques et les agents d’activation qui induisent le
relargage d’un autre type de principe actif par un stimulus extérieur. Ainsi, les agents
d’activation permettent un meilleur ciblage des principes actifs d’une façon contrôlée au sein
de leur zone d’intérêt. A noter qu’il est possible, à partir d’un même noyau d’assemblage de
base, d’aboutir à des nanoparticules possédant des propriétés différentes grâce aux agents
choisis [54]. Par ailleurs, le principe des nanoparticules multifonctionnelles, qui regroupe toutes
les considérations évoquées précédemment est illustré dans la figure II-3.
24
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
Récemment en nanosciences, plusieurs formes de carbone ont été découvertes. Les plus
connues sont les fullerènes C60 construits à partir de 60 atomes de carbone et ayant une forme
sphérique. Les formes plus allongées et cylindriques, découvertes en 1991 [55], sont appelées
nanotubes. Les nanotubes, dont la production et les applications actuellement en plein essor,
représentent les nanoparticules manufacturées pour lesquelles les risques d’exposition sont les
plus grands. En effet, la production mondiale de NTC atteint aujourd’hui plusieurs centaines de
tonnes par an, et ces nano-objets pourraient bientôt être utilisés, en masse, dans des secteurs
divers tels que l’aéronautique et l’automobile.
Les nanotubes de carbone sont très stables d’un point de vue chimique et thermique. Ils ont des
résistances mécaniques remarquables malgré leur formidable légèreté. Ces caractéristiques ont
permis leur utilisation dans un large éventail d’applications et dans des domaines variés allant
de l’électronique (transistors) à la chimie (nouveaux catalyseurs) en passant par le domaine
médical [56].
Dans le domaine médical, les NTCs sont utilisés pour la synthèse des bio-détecteurs ou pour la
délivrance des médicaments et des vaccins par exemple. Cependant, avant que des médicaments
ou des vaccins puissent être véhiculés par les NTCs, la biocompatibilité et la toxicité cellulaire
des NTCs doivent être établies. Malgré cela, ces nanostructures de carbone bénéficient
aujourd’hui d’une grande considération pour les différentes applications thérapeutiques,
notamment comme vecteurs pour le traitement anticancéreux ciblé [57].
Il existe deux formes allotropiques naturelles du carbone : le graphite et le diamant. Dans les
années 80-90, d’autres nouvelles formes allotropiques non naturelles du carbone ont été
synthétisées comme le fullerène et les nanotubes de carbone.
25
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
Les nanotubes de carbone (NTCs) sont divisés en deux catégories : les nanotubes mono-parois
(ou SWCNTs) [59] présentent un diamètre de 0,8 à 2nm et une longueur de l’ordre du
micromètre ; les nanotubes multi-parois (ou MWCNTs) ont un diamètre de 10 à 80 nm et une
longueur qui peut atteindre plusieurs dizaines de micromètres [60]. Les SWCNTs peuvent être
considérés comme des longs plans de graphène enroulés sur eux-mêmes (Figure II˗5 A) et
fermés aux extrémités par deux fullerènes (Figure II˗5 C).
Les NTCs et les fullerènes sont des membres de la même famille et peuvent être considérés
comme des fullerènes allongés. Ainsi, les NTCs sont formés d’hexagones de carbone hybridés
en sp2 comme le graphite et chaque unité hexagonale peut être assimilée à un noyau benzénique.
Les nanotubes de carbone sont donc des espèces aromatiques.
26
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
En outre, les propriétés électroniques des nanotubes de carbone changent selon l’enroulement
du feuillet de graphène, (feuillet externe dans le cas des nanotubes de carbone multi parois)
dans une orientation spécifique et peuvent être classés en trois catégories :
27
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
Les nanotubes de carbone peuvent être synthétisés par trois techniques principales :
par arc électrique, par ablation laser et par décomposition catalytique. La synthèse des différents
types de nanotubes (mono, ou multi parois) dépend de la présence ou non du catalyseur.
La technique par décharge d’un arc électrique est la méthode la plus ancienne et la
plus utilisée pour la synthèse de nanotubes de carbone. Elle a permis de fabriquer les premiers
nanotubes multi-parois [55]. Elle consiste à sublimer du graphite à l’anode et à le condenser à
la cathode (Figure II˗6) dans une enceinte sous atmosphère inerte à pression réduite ou
atmosphérique. L’utilisation de graphite pur a abouti à la fabrication des MWCNTs, et
l’utilisation de graphite contenant des catalyseurs métalliques tels que le fer, le cobalt ou le
nickel, a abouti à la synthèse de SWCNTS [61].
C’est une technique économique et facilement réalisable qui permet d’obtenir des NTCs avec
très peu de défauts structuraux. Cependant, le rendement de cette méthode de synthèse est faible
du fait de la présence d’impuretés comme les fullerènes, le carbone amorphe ou les catalyseurs
métalliques pendant la synthèse des SWCNTs.
Figure II-6. Principe du montage de synthèse des NTCs par arc électrique.
La technique par ablation laser consiste à viser une cible de graphite placée dans une
enceinte chauffée à 1200°C par un rayonnement laser de forte énergie dans le but de sublimer
ou d’expulser du carbone, qui vient se condenser sous forme de nanotubes de carbone sur une
tige de cuivre refroidie par de l’eau glacée (Figure II˗7).
28
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
Figure II-7. Principe du montage de synthèse des nanotubes de carbone par ablation laser
Cette méthode de synthèse consiste à vaporiser la cible graphitique en présence d’un catalyseur
métallique dans une atmosphère inerte. Cependant, cette technique nécessite un laser puissant
pour vaporiser le graphite. Les SWCNTs sont uniquement obtenus par cette méthode avec un
diamètre contrôlé et une pureté importante.
La croissance de nanotubes par dépôt chimique en phase vapeur (ou DVC) a permis d’obtenir
des nanotubes de carbone dont le diamètre est contrôlé par celui des particules de catalyseurs
(Fe, Ni ou Co). Cette méthode consiste à décomposer un gaz comme source de carbone
(méthane ou monoxyde de carbone) dans un four à haute température en présence d’un
catalyseur [63]. Cependant, cette méthode ne donne pas un rendement très élevé et seulement
quelques milligrammes à quelques grammes de SWCNTs sont obtenus.
Pour synthétiser des nanotubes de carbone à plus grande échelle, une méthode de croissance de
nanotubes par dépôt chimique en phase vapeur à haute pression (ou HiPCO) a été mise au point
par le groupe de Smalley [64]. Ce procédé consiste à décomposer sous haute pression du
monoxyde de carbone en présence de metallocène (Figure II˗8) et permet de synthétiser des
SWCNTs.
29
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
Les nanotubes synthétisés par cette méthode présentent un diamètre de 0,7 à 1,4 nm avec un
fort rayon de courbure (Figure II˗9).
Figure II-9. Image TEM de nanotubes de carbone mono paroi (SWCNTs) synthétisés par la
méthode HiPCO
Suite à leur synthèse, les NTCs contiennent une grande quantité d’impuretés. Ces dernières sont
problématiques pour les applications envisagées. Parmi ces impuretés, nous pouvons citer le
graphite, le carbone amorphe, les catalyseurs métalliques ou les fullerènes. Par conséquent, une
purification de ces NTCs est nécessaire avant leur utilisation. Il existe différentes méthodes de
purification telles que l’oxydation, les traitements acides, le traitement aux ultrasons, la
microfiltration, la fonctionnalisation et la chromatographie [65].
30
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
Actuellement, les NTCs, suscitent un énorme intérêt dans le monde de la recherche grâce à
leurs propriétés exceptionnelles. D'un point de vue mécanique, ils présentent à la fois une
excellente rigidité, comparable à celle de l'acier, tout en étant extrêmement léger. Un tel
filament présente une résistance 100 fois supérieure à l'acier, pour un poids divisé par six, et
cela avec une résistance peu commune aux hautes températures. Du point de vue du
comportement électrique et optique, les nanotubes mono paroi (SWCNTs) ont la particularité
exceptionnelle de pouvoir être soit métalliques soit semi-conducteurs en fonction de leur
géométrie (diamètre du tube et angle d'enroulement de la feuille de graphène). Nous résumons
ici quelques excellentes propriétés de ces nano-objets :
Résilience : la résistance des NTCs devrait être, d'après des simulations numériques,
presque 100 fois supérieure à l'acier pour un poids 6 fois moindre. Cette propriété dépend aussi
de la nature du nanotube : les MWCNTs sont beaucoup plus résistants que les SWCNTs.
Dureté : certains nanotubes sont plus durs que le diamant [66].
Conductivité thermique : les NTCs ont une conductivité thermique très élevée, de 6 à
20 W.cm-1.K-1. Cette conductivité peut dans certains cas se rapprocher de celle du diamant (20
W.cm-1.K-1).
Les propriétés électriques des NTCs sont dépendantes de leur nature. Les nanotubes SWCNTs
affichent de ce point de vue des qualités meilleures que les MWCNTs, par les interactions
électriques, de type Van der Waals, qui apparaissent entre les différentes couches de graphène.
Ils ont une conductivité supérieure à celle du cuivre et 70 fois supérieure à celle du silicium
dopé ; une grande mobilité jamais mesurée de 100000 cm2⋅V-1s-1 à 300 K. Ainsi, ils deviennent
supraconducteurs à basse température [67]; permettant de réaliser des transistors à un niveau
de miniaturisation jamais atteint jusqu'à maintenant et pourraient également permettre de
réaliser des émetteurs d'électrons à l'échelle du nanomètre.
Les plus importantes propriétés optiques des NTCs se résument à leurs propriétés d'absorption
de la lumière, leurs propriétés d'électroluminescence et leurs propriétés de photoluminescence.
31
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
Les nanotubes de carbone sont des structures creuses, qui peuvent être remplies avec d'autres
composés chimiques, ce qui en fait des récipients clos à l'échelle nanométrique. Ils sont
relativement peu réactifs et une modification chimique de leur surface fait souvent appel à des
espèces fortement réactives (oxydants forts, réducteurs forts, espèces radicalaires par exemple).
C'est pourquoi une chimie de greffage de nanotubes basée sur des interactions covalentes [68]
et non covalentes s'est fortement développée ces dernières années (adsorption de tensioactifs,
enroulement de polymères, d'ADN, adsorption de pyrènes…) [69].
Les nanotubes de carbone sont insolubles dans les solvants. Le développement de différents
types de fonctionnalisation covalente [68] ou non covalente des NTCs a permis de les rendre
solubles dans différents solvants, selon la nature des groupements greffés à leur surface. La
fonctionnalisation par des espèces hydrophiles a donc permis de rendre ces nanotubes
hydrophiles et solubles dans l’eau. Ainsi, les NTCs hydrosolubles ont été utilisés dans de
nombreuses applications biologiques et en particulier, pour la vectorisation de médicaments. Ils
sont prometteurs grâce à leur grande surface spécifique, qui permet de transporter
simultanément un ou plusieurs principes actifs comme des agents de ciblages ou d’imagerie,
par exemple. Ces caractéristiques importantes font des NTCs des éléments de nanovectorisation
de troisième génération.
Les nanotubes de carbone sont déjà utilisés dans l’industrie [70]. En effet, ils sont employés
dans des équipements sportifs (vélos, raquettes de tennis), aéronautiques (ailes d’avion) et
automobile (pneumatiques). Très prochainement, ils pourront entrer dans la composition de
textiles techniques (vêtements plus résistants), permettant d’élaborer de nouveaux composants
électroniques (diodes, écrans plats) ou être utilisés dans la filtration (membrane filtrante) et le
stockage d’énergie.
32
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
Grâce à leur petite taille, les NTCs pourraient être utilisés dans le domaine médical et
pharmaceutique. La fonctionnalisation des NTCs par modification de leur surface rend les NTC
biocompatibles pour devenir fluorescents et utilisés en imagerie, ou encore pour véhiculer un
principe actif spécifiquement vers des cibles biologiques. Nous citons ci-dessous quelques-unes
de leurs applications.
33
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
La thérapie anticancéreuse par des NTCs est une nouvelle approche du traitement du
cancer. Des NTCs fonctionnalisés avec une molécule tumorale et par un principe actif à activité
anti-tumorale permettent une délivrance ciblée d’agent anti-cancéreux (comme par exemple le
paclitaxel ou la doxorubicine [77]), dans les cellules infectées [78].
Une autre stratégie basée sur le principe de la thérapie génique, serait d’inactiver les cellules
tumorales en utilisant des ARN interférents. Les NTCs facilitent en effet le passage des ARN
interférents à travers les membranes cellulaires. Dans un modèle de xénogreffe de carcinome
pulmonaire murin, des complexes formés de NTCs fonctionnalisés avec un ARN interférent
ont exercé une activité anti-tumorale [79].
De même, l’utilisation des NTCs comme vecteur de radionucléides a été élaborée dans un
modèle de xénogreffe de lymphome murin [80]. Les NTCs ont été fonctionnalisés avec un
anticorps monoclonal anti-CD20 (Rituximab) et un radionucléide. Ces NTCs ont bien ciblé les
cellules tumorales.
Trois voies d’exposition aux NTCs ont été décrites. Ce sont la voie respiratoire (la voie
principale d’exposition), la voie cutanée et la voie orale. Les études d’exposition aux NTCs
sont encore peu nombreuses et décrites dans le milieu professionnel [81]. Plusieurs études ont
ainsi cherché à évaluer l’exposition aux NTCs par voie respiratoire de personnels travaillant à
la production ou à l’utilisation des NTCs, dans des industries ou dans des laboratoires de
recherche. Le tableau ci-dessous résume les différents travaux à ce niveau. A noter que la valeur
d’exposition référence dans la plupart des études de toxicité est de 53 µg.m3
34
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
Table II-1. Données d’exposition aux NTCs par voie respiratoire en milieu professionnel
Concentration en
Secteur professionnel Activité Références
NTC dans l’air
Industrie/Production Synthèse 0.7 à 53 µg.m-3 [Maynard et al.; 2004]
Pesée 64 µg.m-3
Industrie/Utilisation Mélange 93 µg.m-3 [Mazzuckelli et al.; 2007 ]
-3
Découpage 1094 µg.m
Pas de protection 430 µg.m-3
Laboratoire de recherche [Han et al.; 2008]
Protection 40 µg.m-3
Laboratoire de recherche Mélange/Sonication —— [Johnson et al.; 2010 ]
Cependant, il existe deux types d’exposition de la population générale aux NTCs. Le premier
concerne l’exposition directe résultant de la présence des NTCs dans des produits de
consommation (comme les textiles ou les équipements sportifs et électroniques) où aucune
donnée quantitative n’est disponible ce qui peut être considéré comme faible et le second résulte
d’une exposition indirecte environnementale par destruction ou incinération des déchets
contenant des NTCs [82].
Les propriétés physiques des NTCs ayant un impact majeur sur la toxicité de ces nanomatériaux
sont détaillées dans ce qui suit :
35
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
d’espèces réactives de l’oxygène (ROS) oxydatives [54]. Donc, il faut que les études de la
toxicité des NTCs tiennent compte du degré de pureté des NTCs et du type du catalyseur
métallique utilisé. Actuellement, il est presque impossible de supprimer les traces de catalyseurs
des NTCs. Une étude approfondie du rôle de ces catalyseurs dans la toxicité des NTCs est donc
essentielle.
La longueur des nanotubes de carbone pourrait avoir un impact sur leur toxicité. Une
étude menée sur l’installation intratrachéale (IT) de 0,5 mg de MWCNTs par rat, montre que
les NTCs d’une grande longueur (0,713 vs 6 μm) ne sont pas éliminés assez rapidement par
rapport aux NTCs de petite taille, et induisent ainsi une inflammation in vitro [85].
Actuellement, les recherches sur la toxicité in vivo des nanotubes de carbone progressent
rapidement et concernent essentiellement la toxicité par inhalation. Saito et al. [86], ont tiré la
conclusion suivante de tous les travaux précédents sur les NTCs : pas de toxicité significative
telle que la carcinogénèse par exemple, induite par les NTCs in vivo. Les organes, sites
d'accumulation des NTCs après le transport à travers la circulation sanguine, la réponse des
tissus et de cellules à l'accumulation, la période d’accumulation des NTCs et leur
biodégradabilité sont des questions importantes à élucider rapidement. Les résultats des études
de la toxicité in vitro sont difficiles à interpréter. En réalité, il est extrêmement difficile de
déterminer quel facteur est évalué dans une étude toxicologique in vitro des NTCs. Ces
nombreux facteurs, parmi lesquels nous pouvons citer l'épaisseur, la longueur, la forme, la
réactivité de surface, l'agrégation ainsi que l'influence des métaux résiduels, les dispersants sont
tous liés entre eux et leur influence individuelle est difficile à déterminer.
Contrairement aux médicaments, peu d’informations existent pour les NTCs ainsi que les
corrélations des données in vivo et in vitro. Cette question ne sera pas résolue avant les essais
cliniques. Une autre raison est qu'il n’existe pas de moyens standards pour traiter les facteurs
qui influencent les résultats des études de corrélation, tels que l'espèce animale, le mode
d'administration utilisé dans les études in vivo, et le choix des cellules utilisées dans les études
in vitro. Dans l'avenir, il sera nécessaire de s’assurer que ces facteurs sont compatibles pour
toutes les études afin d’analyser les données provenant de sources internationales et déterminer
la corrélation entre in vivo et les évaluations de toxicité in vitro du NTC, au moins dans des
modèles murins [87].
36
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
Les réponses biologiques suite à une stimulation cellulaire par des nanoparticules sont
fortement influencées par l’internalisation cellulaire de ces NPs. Les mécanismes possibles
d’internalisation des NPs sont résumés dans la figure II-10).
Figure II-10. Les mécanismes d’internalisation cellulaire des nanoparticules (NP) par :
phagocytose (A), macropinocytose (B), endocytose clatherine-dépendante (C), endocytose
clatherine-indépendante ou cavéoline-indépendante (D) endocytose cavéoline-dépendante (E)
ou par un transport passif des NP à travers la membrane plasmique (F)
macropinocytose. Cependant, la voie des clatherines est la plus étudiée pour l’internalisation
cellulaire. Elle est assez complexe et implique la signalisation intercellulaire, le recyclage de la
membrane et l’absorption des éléments nutritifs. Ainsi, l’internalisation des nanoparticules
dépend de plusieurs facteurs : les caractéristiques physico-chimiques (taille des NPs), la forme
et la charge de surface mais également le type de la lignée cellulaire. En effet, il est possible
que l’endocytose clatherine-dépendante soit la voie d’internalisation des NPs ayant une de taille
de presque 100 nm [62].
Ainsi l’étape principale pour un passage en phase clinique reste la compréhension des processus
d’internalisation des nanoparticules chargées des principes actifs.
Dans les cellules, le choix du type d’internalisation dépend de la taille des NPs, leurs formes et
leurs charges de surface. Le mode d’internalisation peut déterminer le devenir et la localisation
intracellulaire des NPs. Nous pouvons donc améliorer l’effet thérapeutique en élaborant des
stratégies fiables afin de contrôler, ou au moins, influencer l’absorption cellulaire [62].
Le mécanisme exact d’internalisation cellulaire des NTCs n'est pas encore bien établi. Certaines
publications ont montré que l'endocytose et/ou le passage passif des NTCs pourraient être
impliqués [89]. Nous résumons tous les modes d’internalisation des NTCs dans la figure II-11.
Entre les voies d'internalisation possibles des NTCs, il faut signaler l’importance de la nature
des groupements fonctionnels à leur surface, qu’elle soit covalente ou non. Par ailleurs, les
macromolécules biologiques telles que celles des protéines, de l'ADN ou des anticorps sur la
surface du nanotube sont internalisés par une endocytose énergie-dépendante. Il est probable
que les macromolécules sur la surface des NTCs entravent les interactions directes NTC-
membrane, rendant les tubes incapables de traverser directement la membrane plasmique. Dans
ce contexte, l'interaction des molécules liées à la surface des NTCs avec les récepteurs
extracellulaires qui les reconnaissent comme ligands pourraient déclencher le processus actif
d'internalisation de tout le complexe NTC-molécule. Cette explication est cohérente avec une
translocation membranaire directe des NTCs fonctionnalisés avec des molécules de faible poids
moléculaire à travers la membrane cellulaire. Ce mécanisme passif permet la localisation
directe des NTCs fonctionnalisés dans le cytoplasme et rend potentiellement les agents
thérapeutiques transportés, disponibles pour leurs cibles intracellulaires [81].
38
Chapitre II Nano-vecteurs administrateurs de médicaments
A noter que les dimensions des NTCs ont un grand impact sur les mécanismes
d’internalisation parce que les NTCs interagissent avec les cellules. Leur impact a également
été confirmé dans une étude où il a été démontré que les NTCs fonctionnalisés avec des groupes
carboxyles ou amides rentrent dans les cellules non phagocytaires par pénétration directe quand
ils sont bien individualisés ou par endocytose énergie-dépendante lorsqu’ils sont présents en
petits faisceaux [91].
Par ailleurs, la longueur des NTCs, leur degré d'agrégation et le revêtement de surface
pourraient être des paramètres principaux dans le changement d’un mécanisme d’internalisation
des NTCs à un autre [92]. A noter que le type cellulaire étudié joue également un rôle important
pendant le processus d'internalisation. En effet, les cellules phagocytaires et non phagocytaires
peuvent avoir des mécanismes d’internalisation différents des NTCs en raison de leur différence
de fonction biologique.
Conclusion
Comme nous l’avons vu dans cette partie, les nanotubes de carbone (NTCs) sont très
prometteurs pour révolutionner la thérapie, l’imagerie et le diagnostic de diverses maladies,
grâce aux propriétés exceptionnelles qui les caractérisent, notamment leur biocompatibilité. En
revanche, il est absolument nécessaire d’étudier d’autres aspects tels que la toxicité des NTCs
et leur devenir dans l’organisme.
Ainsi, les possibilités illimitées des stratégies de traitement demeurent une des perspectives les
plus excitantes des NTCs. Pour tout cela, nous avons choisi les nanotubes de carbone comme
nanovecteur de la molécule médicamenteuse Crizotinib.
39
Chapitre III
Etudes théoriques
Chapitre III Etudes théoriques
III.1. Introduction
La modélisation moléculaire est le terme générique regroupant les méthodes qui permettent de
simuler le comportement d’un système de particules. La taille du système étudié peut aller d’une
simple molécule diatomique jusqu’à des macromolécules biologiques de plusieurs dizaines de
milliers d’atomes.
Pour réaliser ce type d’étude, il est nécessaire de déterminer une expression de l’énergie
d’interaction des atomes du système moléculaire en fonction de leurs positions relatives. Pour
ce faire, les méthodes de modélisation moléculaire reposent entre autres sur deux approches
différentes [93] appelées : Mécanique Quantique et Mécanique Moléculaire.
41
Chapitre III Etudes théoriques
La mécanique quantique est le prolongement de la théorie des quanta, issue des travaux de
Planck, de leur interprétation par Einstein et de leur application à la théorie atomique par Bohr
et Sommerfeld. Elle explique la quantification de certaines grandeurs (énergie, moment
cinétique) et fait émerger le principe d'exclusion de Pauli. La nouvelle conception des particules
qui découle de la dualité onde-corpuscule, explicitée dans les travaux de Broglie (1923) conduit
à la mécanique ondulatoire.
Les méthodes de la mécanique quantique, qui font appel à la distribution des électrons
répartis en orbitales autour de la molécule, impliquent des temps de calcul souvent élevés qui
limitent leur usage à des petites molécules ou nécessitent le recours à de nombreuses
approximations. Elles sont particulièrement adaptées au calcul des charges et des potentiels
électrostatiques, à l’approche des mécanismes réactionnels ou à la polarisabilité. L’objectif de
la mécanique quantique est principalement de déterminer l’énergie et la distribution
électronique.
ΨH = ΨE (III.1)
42
Chapitre III Etudes théoriques
Les deux premiers termes de l’équation sont les opérateurs d’énergie cinétique des
électrons T et des noyaux T ; les autres termes sont des termes d’interaction de Coulomb pour
chaque paire de particules chargées : terme de répulsion noyau-noyau V , terme d’attraction
électron-noyau V et terme de répulsion électron-électron V .
H=T +T +V +V +V (III.3)
Le noyau est constitué des protons et de neutrons (la masse de proton est proche à celle de
neutron), la masse du proton est 1836 supérieure à celle de l'électron. Par conséquent, on peut
négliger en 1ère approximation, l'énergie cinétique des noyaux devant celle des électrons, c'est
une approximation dite adiabatique de Born Oppenheimer, on peut écrire la fonction d'onde
dans ce cas comme [96].
La fonction Φ ⃗ ({r⃗}) est une fonction propre de l'hamiltonien avec la valeur propre
E (R ⃗) pour les positions ( R ) des noyaux figés. Born et Oppenheimer ont montré que le
mouvement des noyaux est régi par l'équation suivante :
ℏ ∇
− ∑ +E R⃗ X R⃗ =E X( R ⃗ ) (III.6)
c. L'approximation LCAO
43
Chapitre III Etudes théoriques
orbitales moléculaires peuvent en bonne approximation être simulées par des Combinaisons
Linéaires des Orbitales Atomiques des atomes, constituant la molécule. Elle porte la
dénomination CLOA en français (LCAO en anglais). C'est évidemment une approximation,
mais les calculs montrent qu'elle est raisonnable et fournit des résultats qualitativement corrects
[97]. On écrit une orbitale moléculaire (OM) ϕ comme une somme d'orbitales atomiques (OA)
pondérées par des coefficients numériques :
ϕ=∑ C X (III.7) où :
ℏ
∑ − ∇ + ∑ +∑, = (III.8)
Cette dernière équation peut être résolue pour une seule particule. Les interactions
n'existent pas entre les électrons ( = 0), on peut décomposer dans ces conditions, l'équation
(III.8) en un système de plusieurs équations. Cependant, il faut trouver un moyen mathématique
qui permet de tenir compte des interactions électroniques tout en conservant le système
d'électrons indépendants. Dans ce but, Hartree a introduit un champ extérieur dont lequel
chaque électron peut se mouvoir indépendamment des autres.
Ainsi, l'hamiltonien peut être mis sous la forme suivante :
H=∑ H (III.9)
Où l'hamiltonien correspondant à l'électron (i) vaut :
ℏ
H=− ∆ + V(r ) + Ω (r ) (III.10)
44
Chapitre III Etudes théoriques
d'onde totale est le produit des fonctions d'onde de chacun des électrons. Par conséquent,
l'énergie est la somme des énergies de tous les électrons :
(r , r , r … , r ) =∏ Ψ r (III.11)
E=∑ E (III.12)
Une méthode semi empirique est une méthode dans laquelle une partie des calculs nécessaires
aux calculs Hartree-Fock est remplacé par des paramètres ajustés sur des valeurs expérimentales
(l'hamiltonien est toujours paramétré par comparaison avec des composés références). En
général, toutes ces méthodes sont très précises pour des familles de produits donnés voisines de
celles utilisées pour la paramétrisation.
Les méthodes semi empiriques ne considèrent que les électrons de la couche de valence
; les électrons des couches internes sont inclus dans le cœur nucléaire.
Méthode AM1 (Austin Model 1): proposée par Dewar en 1985. Elle corrige le terme de
répulsion cœur–cœur ;
Méthode PM3 (Parametric Method 3) : proposée par Stewart en 1989. Elle utilise une
procédure de paramétrisation automatique au cour des calculs.
L'idée fondamentale est que les propriétés exactes de l'état fondamental d'un système
formé de noyaux et d'électrons, sont des fonctionnelles (fonction d'une fonction) de la seule
densité électronique. La DFT [99] est basée sur les deux théorèmes suivants :
45
Chapitre III Etudes théoriques
La densité électronique qui minimise l'énergie du système est la densité exacte de l'état
fondamental (Démontré par le principe variationnel). Il reste donc à déterminer ( ( )) avec :
[ ( )]= [ ( )]+ [ ( )] (III.14)
Comme on ne connaît pas l'expression de T et pour un système d'électrons en
interaction, Kohn et Scham ont proposé alors les séparations suivantes :
[ ( )]=T [ ( )]+( [ ( )]− T [ ( )]) (III.15)
Energie cinétique d'un gaz d'électrons sans interactions et de même densité
électronique que le système réel, qu'on sait calculer en introduisant une description orbitalaire.
46
Chapitre III Etudes théoriques
[ρ( )]
V = est le potentiel inconnu d'échange-corrélation.
ρ( )
La MM est basée sur l’approximation de Born- Oppenheimer selon laquelle les électrons
sont beaucoup plus rapides que les noyaux.
La mécanique moléculaire est une méthode non quantique, mais elle a un intérêt pour
les grands systèmes ; comme dans le cas des systèmes biologiques qu’on ne peut aborder avec
les méthodes quantiques. Dans ces méthodes, on associe une fonction énergie potentielle à
chaque degré de liberté de la molécule : élongation des liaisons, variation des angles de valence,
des dièdres (rotation autour d’une liaison). Ces fonctions sont empiriques. L’optimisation de
tous les paramètres par minimisation de l’énergie fournit la géométrie d’équilibre des divers
conformères et leurs énergies relatives. Pour les molécules possédant un grand nombre de
conforméres, il existe des procédures automatiques de recherche des minimums locaux
d’énergie [101].
47
Chapitre III Etudes théoriques
= ƒ( r ⃗ , r ⃗ , r ⃗ ) (III.22)
La fonction d’énergie potentielle définit une énergie empirique, l’énergie totale étant
décomposée en une somme de termes additifs représentant chacun des interactions inter
atomiques. Elle est exprimée comme une somme de contributions de plusieurs types
d’interactions. Elle peut se décomposer en terme d’interaction intramoléculaire et un terme
d’interaction intermoléculaire.
=∑ Vé + ∑ V +∑ é V +∑V é (III.23)
48
Chapitre III Etudes théoriques
On a donc :
= ∑V +∑ Vé (III.24)
L'expression ‘’champ de force’’ recouvre l'ensemble des fonctions ainsi que les
paramètres associés aux différents types d'atomes qu'elles contiennent. Les paramètres ne sont
pas des constantes de force et sont caractéristiques d'un champ de force et non d'une molécule,
ils vérifient donc le principe dit de "transférabilité" sur lequel repose l’intérêt de cette méthode.
Le but est de construire un modèle mathématique qui décrive un ensemble de molécules. Ce
modèle mathématique est établi pour représenter aussi précisément que possible les variations
de l’énergie potentielle avec la géométrie moléculaire.
a. Energie d’élongation
Les liaisons entre les atomes dans un édifice moléculaire ont souvent tendance à s'allonger ou
à se contracter (Figure III-1).
49
Chapitre III Etudes théoriques
b. Energie de flexion
La fluctuation des atomes autour de leur position d'équilibre engendre une déformation des
angles de valence (Figure III.2).
Ce phénomène est régi par une énergie de flexion qui peut s’exprimer sous les mêmes formes
que précédemment à savoir, pour la plus simple :
c. Energie de torsion
Elle concerne l'angle dièdre formé par les atomes 1-2-3-4. Elle rend notamment compte de la
structure 3D de la molécule (Figure III.3).
50
Chapitre III Etudes théoriques
L’ensemble des termes énergétiques répertoriés jusqu’ici représente des mouvements simples
des atomes dans la molécule. Pour tenir compte des effets de couplage entre deux mouvements
non indépendants, il est d’usage de rajouter un ou plusieurs termes supplémentaires
d’interaction [105]. Les plus couramment formulés sont :
E(L, θ ) = K (L - L )( θ - θ ) (III.28)
∗
: paramètre d'énergie qui caractérise la profondeur du puits de potentiel a la distance ;
r ∗ : somme des rayons de VdW des atomes interagissant ;
r : distance interatomique ;
C , C , C : constantes du champ de force.
51
Chapitre III Etudes théoriques
Les interactions électrostatiques peuvent, dans certains cas, prendre une importance
considérable, en particulier dans le cas des molécules comportant deux ou plusieurs atomes.
Meyer et al. [106] ont proposé d'introduire un terme électrostatique même pour les
hydrocarbures. IL peut s'exprimer à partir des charges atomiques sous des moments dipolaires
de chaque liaison.
Dans le premier cas :
E(e)= ∑ / D. (III.31) où :
D constante diélectrique locale du milieu ;
charges partielles atomiques des atomes 1,2 ;
distance interatomique.
Dans le deuxième cas
52
Chapitre III Etudes théoriques
III.2.2.b. La paramétrisation
Il est important de noter que les champs de forces constituent une approche purement
empirique. Ils sont paramétrés de manière à ce que l’ensemble des différentes contributions
permet de reproduire une série de résultats expérimentaux. Un champ doit donc toujours être
considéré comme une entité indivisible et il est exclu de combiner les termes et/ou les
paramètres de deux champs dans l’espoir d’obtenir un meilleur ensemble.
Il est donc temps important dans un premier de vérifier si le champ choisi est adapté au
système à étudier
Différents champs de force sont proposés dans la littérature, ils se distinguent les uns des autres
par les termes dans le développement de l’expression de l’énergie de la molécule.
Chacun a un domaine d’application spécifique de sorte que le choix d’un champ de force
dépend des propriétés et de l’application du système que l’on veut étudier.
Type de composé : carbohydrate, complexe métallique ;
Environnement : gaz, solution ;
Type d’interaction à étudier : liaison hydrogène, …
De tels champs de force sont apparus en début des années 70 et continuent à évoluer
aujourd’hui. Ils sont regroupés en 4 classes.
MM2 est le premier champ de force développé [108]. Il a été conçu au début pour les molécules
simples (alcanes, alcènes, alcynes non conjugués, amines…), mais ses versions améliorées
MM3 (1989) et MM4 (1996) lui permet de traiter des molécules organiques de plus en plus
complexes.
b. OPLS
Le programme OPLS (Optimized Potentials for Liquid Simulations), comme l’indique son
nom, est conçu pour optimiser le potentiel qui permet la description des propriétés de
solvatation. Il est écrit par W. L Jorgensen et J. Tirado Rives [109].
53
Chapitre III Etudes théoriques
c. UFF
Universal Force Field. A. K. Rappé, C. J. Casewit et collaborateurs ont essayé de concevoir un
champ de force universel [110] capable de simuler des molécules contenant n’importe quelle
combinaison d'atomes dans le tableau périodique.
d. AMBER
Assisted Model Building with Energy Refinement, a été écrit par Kollman [111]. Le champ est
paramétré pour les protéines et les acides nucléiques (UCSF, 1994). Il a été utilisé pour les
polymères et pour d’autres petites molécules. Dans le cadre de ces travaux, nous utiliserons ce
champ de force, puisque on va traiter les protéines.
III.3. Minimisation d’énergie
La recherche de la structure de plus basse énergie est l’un des intérêts majeurs dans la
mécanique moléculaire afin de déterminer la conformation la plus stable.
Le problème posé par la minimisation énergétique des molécules est lié à la recherche
de minimums pour des fonctions d'un grand nombre de variables (3N, où N est le nombre
d'atomes).
Les méthodes de minimisation sont basées sur le calcul des dérivées de la fonction
d’énergie et utilisent des processus itératifs à partir de l’énergie potentielle et du gradient, calcul
pour un jeu de coordonnées, ces algorithmes génèrent un nouveau jeu de coordonnées
correspondant à une énergie potentielle plus basse (Soldera, 2003 ; Lomas, 1986).
54
Chapitre III Etudes théoriques
Cette méthode consiste à rechercher la direction de plus grande pente selon laquelle la
fonction E(X) représentant l'énergie décroît la plus fortement. La direction de recherche ⃗k est
donnée par l’opposé du signe du gradient de l’énergie :
⃗ = −∇ E⃗ (r ) (III.33)
⃗ =⃗ + ⃗ (III.34)
Le principe de cet algorithme est identique à celui de la méthode de la plus grande pente.
Le gradient de l'énergie potentielle constitue le critère de convergence (Mc Cammon et Harvey,
1987 ; Jacoby et al, 1972). La différence essentielle entre ces deux méthodes réside dans le fait
que la méthode du gradient conjugué tient compte à chaque pas non seulement du gradient
calculé mais aussi des gradients précédents, alors que celle de la plus grande pente non. Cette
prise en compte conjuguée permet d'accélérer la convergence vers le minimum le plus proche.
L'efficacité de cette méthode est particulièrement développée dans la proximité d'un minimum
local. C'est pourquoi elle est généralement employée pour affiner la minimisation, ceci après
quelques pas de la méthode de la plus grande pente.
55
Chapitre III Etudes théoriques
Pour cela, elle considère de manière classique l'atome comme une masse animée et donc
possédant une vitesse résultant des forces appliquées sur cet atome.
⃗( )
Ou, ⃗ = ⃗ = (III.35)
⃗ = − ⃗E = − ⃗ (III.36)
Dans les algorithmes d’intégration, les nouvelles positions et vitesses sont recalculées à
partir des précédentes à chaque incrément de temps Δt. Ce dernier doit être extrêmement faible
(1 fs = 10‐15 s) de manière à prendre en compte les vibrations atomiques les plus rapides (ex :
liaison C‐H) et obtenir des calculs stables.
56
Chapitre III Etudes théoriques
Cet algorithme prend en compte les positions et accélérations aux temps t – Δt et t pour
calculer les positions au temps t + Δt.
( + ) = ( )+ ( ) + ( ) ( . )
2
( − )= ( )− ( ) + ( ) ( . )
2
( + )=2 ( )− ( − )+ ( ) ( . )
Le calcul des nouvelles positions dans l’algorithme de Verlet n’utilise pas les vitesses.
Cette méthode de résolution numérique est extrêmement stable, qui ne nécessite pas
d’importantes ressources de mémoire et procure un temps de calcul rapide.
Le pas d'intégration dans cette méthode est divisé par deux afin d’être plus précis dans
le calcul des nouvelles coordonnées. Les vitesses sont calculées au temps t+1/2Δt et utilisées
pour calculer les positions au temps t + Δt.
( )= + − = + − + ( . )
( + )= + + = + + + ( . )
( + )= ( )+ + ( . )
Les valeurs des vitesses au temps − et des accélérations au temps t sont utilisées pour
57
Chapitre III Etudes théoriques
+ = − + ( ) ( . )
Les systèmes les plus simples sont menés dans l’ensemble microcanonique NVE. Les
ensembles NVT et NPT sont les plus utilisés pour modéliser des systèmes biologiques : les
protéines globulaires, l’ADN, des complexes biologiques et les membranes biologiques
(Adcock et al. 2006, [112]).
L’ensemble canonique (NVT) décrit un système fermé dont l'énergie du système n'est
pas connue avec précision, mais le nombre total de particules (N), le volume total (V) et la
température (T) du système sont fixes. Cet ensemble peut être utilisé pour décrire un système
isolé en faible contact thermique avec un réservoir externe de chaleur appelé thermostat. Un
échange de chaleur peut se produire entre le système et le réservoir, entraînant différentes
valeurs d'énergie totale à différents états du système. Le système, cependant, ne peut pas
échanger d'énergie avec d'autres objets que le thermostat. Les propriétés de phase peuvent être
évaluées à l'aide de cet ensemble (Ungerer and Tavitian, [113] 2006 ; Ungerer et al., 2007 [114]
Ebrahimi, 2014; Gibbs, [115] 1902).
58
Chapitre III Etudes théoriques
Ce sont plutôt les ensembles NVT et NPT qui présentent un intérêt pratique du fait de
leur analogie avec les systèmes expérimentaux.
L’une des difficultés des simulations par dynamique moléculaire est de maintenir la
température T et/ou la pression P constantes en moyenne.
Pour maintenir la température constante d’un système dans une simulation par
dynamique moléculaire, le système étudié doit être couplé à un thermostat. Le principe de ce
dernier consiste à modifier les vitesses du système au cours de la simulation pour que son
énergie cinétique moyenne soit égale à l’énergie cinétique correspondant à la température
cinétique cible T0. Pour cela, on définira la température cinétique à un instant t comme suit :
.( )
( ) = ( . ) Où,
Kb : la constante de Boltzmann.
59
Chapitre III Etudes théoriques
la pression, parmi lesquelles le barostat Berendsen où le système est couplé à un barostat. Cette
méthode permet de jouer sur la taille de la boîte de simulation pour augmenter ou diminuer la
pression à l’intérieur. Pour faire tendre la pression P vers une pression fixée P*, les longueurs
du système simulé sont multipliées par un facteur donné par l’équation suivante :
∆
µ = 1− ( ∗− ) ( . ) où :
P : la pression souhaitée ;
P* : la pression du système ;
µ : le facteur du couplage.
⁄
∆
µ = 1+ ( − ) ( . ) où :
P : la pression du système ;
µ : le facteur de correction.
ADF
60
Chapitre III Etudes théoriques
61
Chapitre III Etudes théoriques
62
Chapitre III Etudes théoriques
Conclusion
Les méthodes de la mécanique quantique sont basées sur le calcul des orbitales
moléculaires (OM), leur usage est limité aux petites molécules. Dans ces méthodes on trouve,
les méthodes ab initio, la DFT et les méthodes semi-empiriques ;
La mécanique moléculaire a un intérêt pour les molécules de grande taille, telles que les
macromolécules biologiques (protéines, acides nucléiques), ou sur des systèmes comportant un
grand nombre de molécules. Cette technique calcule l'énergie des atomes en se basant sur la
mécanique newtonienne.
63
Chapitre IV
Propriétés d'adsorption du
médicament Crizotinib sur les
nanotubes de carbone (NTC) et de
nitrure de bore (BNNT)
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
IV.1. Introduction
Les maladies pulmonaires et notamment le cancer qui est devenu l'une des principales
causes de décès dans le monde [127-131]. En ce sens, de nombreux médicaments ont été
développés pour traiter, ralentir et le guérir. Parmi ces médicaments, le médicament (R)-3-[1-
(2,6-dichloro-3-fluorophényl) éthoxy] -5-(1-pipéridin-4-yl 1Hpyrazol-4-yl) pyridin-2-ylamine
appelé le Crizotinib (CZT), considéré comme l'un des médicaments anticancéreux les plus
efficaces au cours de la dernière décennie en raison de son taux de réponse élevé à la
suppression de plusieurs cibles cancéreuses associées [132], [133]. Le CZT est un médicament
anti-tumoral qui a été récemment approuvé par l’Américaine administration des Denrées
alimentaires et des Médicaments (ADM) pour traiter le cancer pulmonaire non à petites cellules
(NSCLC). Il représente une molécule bioactive remarquable pour de larges applications dans
le traitement du cancer du sein [134]. Le CZT peut inhiber la kinase du lymphome anaplasique
(KLA) et le récepteur de la croissance des hépatocytes (c-MET) tyrosine kinases et provoque
l'apoptose via l'activation de la caspase-3. Il a montré une efficacité significative dans
l'inhibition du CBNPC ALK-positif depuis le stade précoce de la maladie. Cependant, avec la
progression de la maladie, la cellule tumorale peut résister au CZT, souvent dans les 12 mois
suivant le début du traitement [135]. De plus, en tant que médicament hydrophobe, le CZT libre
a une faible solubilité aqueuse et un temps de circulation limité dans l'environnement sanguin
[136].
65
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
chimiques (proposées comme substrats) dans ces applications sont, les nanoparticules [143],
les nanotubes (NTs) [144], les nanofils [145], les feuilles bidimensionnelles (2D) [146] et les
nanotiges [147].
Les nanotubes de nitrure de bore (BNNT) ont été découverts en 1995. Les BNNT ont
une composition similaire à celle des NTCs, mais ils sont plutôt composés d'atomes de bore et
d'azote. La nature ionique des liaisons entre les atomes B et N les rend chimiquement stables et
résistants à l'oxydation. [156]. Les BNNT sont devenus une classe passionnante de matériaux
tubulaires inorganiques [157]. Ils sont naturellement non cytotoxiques et ont la capacité de
réagir avec des groupes chimiques pour se lier aux protéines et aux cellules, ce qui en fait des
matériaux appropriés pour une utilisation en tant que biocapteurs et en nanomédecine [158].
66
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
Malgré le potentiel élevé des CNT et des BNNT à agir en tant que vecteurs
d'administration de médicaments, il existe peu d'informations dans la littérature concernant les
mécanismes d'interaction vecteur-médicament et l'énergie, qui représentent des
informations essentielles pour optimiser leur fonction. Par conséquent, les études à l'échelle
moléculaire utilisant les méthodes DFT et COSMO-RS peuvent jouer un rôle important dans
l'actualisation de ces nanomatériaux en tant que vecteurs de médicaments. L'application de
telles méthodes est considérée comme intéressante pour prédire l'efficacité d'un support
spécifique vis-à-vis d'un médicament ciblé, évitant ainsi des travaux expérimentaux longs, qui
se traduiront par des avantages économiques pour la recherche dans le traitement du cancer et
favoriseront la commercialisation des voies thérapeutiques efficaces.
Dans ce contexte, cette étude vise à comparer la capacité des CNT et des BNNT en tant
que transporteurs de CZT par des calculs DFT et COSMO-RS. Les mécanismes d'interaction,
les interactions intermoléculaires et les propriétés électroniques du CZT avec les deux
nanotubes ont été étudiés en analysant la structure optimisée et les énergies d'interaction. Les
performances d'adsorption des médicaments ont également été démontrées en étudiant leurs
traces de densité d'états (DOS) et les orbitales HOMO-LUMO (c'est-à-dire les orbitales
moléculaires les plus occupées et les orbitales moléculaires inférieures inoccupées). L'étude
COSMO-RS a été réalisée pour comprendre le mécanisme de solubilisation en phase aqueuse
des complexes, ce qui est fondamental pour évaluer leur attitude à être transportés dans le
système circulatoire sanguin.
Le module DMol3 [159], intégré dans Material Studio Software 7.0, a été utilisé pour
effectuer des calculs théoriques. L'étude a été réalisée sur des NTC et des BNNT de chiralité
(7,7) choisis sur la base d'une étude d'optimisation préalable, avec 112 atomes, une longueur
d'environ 7,48 A°, et un diamètre de 9,63 A°. Les deux extrémités des tubes de longueur finie
étaient saturées d'atomes d'hydrogène pour empêcher les liaisons pendantes.
respectivement à 10-6 Ha, [164] ; 0,004 Ha/Å [165] et 0,005Å [166]. Le potentiel chimique (μ)
[167], la dureté globale (η) [168] et l'indice d'électrophilie (ω) [169], qui donnent des
indications utiles sur la réactivité de la molécule complexe peuvent être utilisés pour visualiser
et tester ses propriétés et sa stabilité, ont été calculés à la fois en phase pure et en phase solvant
(aqueuse) en utilisant les équations suivantes [170] :
= − (IV.1)
−
= (IV.2)
2
+
= (IV.3)
2
= (IV.4)
2
L'équation suivante a été utilisée pour mesurer l'énergie d'adsorption des systèmes
étudiés :
= −( + ) (IV.5)
Où, E(CZT-Tube) est l'énergie de la structure optimisée du CZT-Tube ; ETube et ECZT sont
les énergies de la structure optimisée du tube isolé et de la molécule CZT, respectivement.
Étant donné que le CNT et le BNNT, sont hydrophiles et peuvent être entourés de
molécules d'eau lorsqu'ils sont insérés dans le corps hôte, l'influence du solvant doit être
explicitement prise en compte pour évaluer de manière fiable leurs capacités de distribution de
médicaments. En conséquence, le modèle de criblage de type conducteur pour les solvants réels
(COSMO-RS) a été utilisé pour explorer le mécanisme de solubilisation de la phase aqueuse
des complexes [171].
68
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
= .( + ′) (IV.6)
= . (0, + ) (IV.7)
′
( , ′) = . ( + ) (IV.8)
2
L'AIM est une technique utile qui permet de calculer les interactions intermoléculaires.
Le motif fondamental de l'AIM est d'exploiter la densité électronique ou densité de charge
( ; ) des molécules comme moyen d'étudier la nature et la force de l'interaction de liaison
dans les systèmes moléculaires. Au point critique (BCP), où ρ est minimum, le type des liaisons
chimiques peut être identifié à partir du signe de la seconde dérivée ∇ ρ(r) (Laplacien) [177].
Ainsi, si les valeurs ρ sont élevées et les valeurs ∇ ρ(r) sont négatives, cela indique une liaison
covalente (polaire). D'autre part, des valeurs positives de ∇ ρ(r) et de faibles valeurs de ρ
indiquent que l'énergie cinétique ( ) est supérieure à l'énergie potentielle ( ), ce qui suggère
des interactions de liaison hydrogène [178]. Le rapport | |/ illustre la compétition qui se
produit au sein du système entre sa capacité à regrouper les électrons V(r) et sa capacité à les
diluer par mobilité électronique G(r). Ainsi, un rapport (|V| / G) > 1, indique que l'interaction
s'établit avec un excès de charges électroniques alors que l'inverse est vrai pour (|V| / G) < 1.
La densité d'énergie totale H(r) = V(r) + G(r) a une valeur négative dans le premier cas et une
valeur positive dans le second. Ainsi, la classification des interactions dépend des valeurs de
cet indicateur, où, (i) interactions en couche fermée pure :|V| / G < 1, (ii) interactions en couche
fermée : 1 < |V| / G < 2, et (iii) interactions de couches partagées : |V| / G > 2. Les interactions
de liaison hydrogène appartiennent aux deux premiers types, tandis que l'interaction covalente
appartient au troisième type. De plus, les valeurs positives de ∇ ρ(r) et H indiquent la présence
d'interactions électrostatiques, tandis que les valeurs négatives ∇ ρ(r) et H caractérisent une
69
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
liaison covalente, et ∇ ρ(r) > 0 et H < 0 fait référence à une liaison covalente partielle [179]. Le
programme Amsterdam Density Functional (ADF) a été utilisé pour effectuer les calculs AIM
[180]. La méthode DFT a été utilisée pour optimiser les structures moléculaires. Le B3LYP
fonctionnel (Becke 3-Parameter, Lee, Yang et Parr) avec l'ensemble de base def-TZVP a été
utilisé pour décrire les effets d'échange et de corrélation pour l'étude AIM [181].
Pour comprendre les interactions possibles du CZT au sein des nanotubes, le module
localisateur d'adsorption du logiciel Materials Studio a été utilisé pour déterminer les structures
les plus favorables. Le tableau IV.1 regroupe d’une part les structures chimiques 2D
respectivement 3D géométriquement optimisées du CZT et d’autre part, celles du nanotube de
carbone (CNT) et du BNNT en armchair, tandis que le tableau IV.2. illustre les structures 3D
géométriquement optimisées des complexes (Configuration C1 – Configuration C4) et
(Configuration B1 – Configuration B4). Dans nos calculs DFT, ces quatre positions ont été
déterminées comme les plus favorables aussi bien pour le CNT que pour le BNNT.
CZT
Nanotube de
carbone (7,7)
Nanotubes de
nitrure de
bore (7,7)
70
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
Configuration C2
Configuration C3
Configuration C4
71
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
BNNT/CZT
Configuration B1
Configuration B2
Configuration B3
Configuration B4
Les orbitales moléculaires frontières (OMF) ont été calculées pour le CZT, les
nanotubes et les complexes médicaments-nanotubes afin de quantifier l'influence des
interactions du CZT avec les nanotubes sur les caractéristiques de la charge électronique des
nanotubes.
Les deux niveaux d’orbitales spécifiques HOMO et LUMO [182], sont les principaux
facteurs de description des propriétés électroniques de chaque système analysé. En particulier,
72
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
les électrons de l'orbitale HOMO sont plus susceptibles de participer à la formation des
complexes. De même, la théorie de l'orbitale frontière prédit qu'un site de surface avec l'orbitale
inoccupée la plus basse est un site électrophile favorable.
La figure IV.1, illustre les orbitales frontières HOMO et LUMO du CZT, des CNT et
des BNNT avec deux couleurs (taches jaune et bleue), qui ne signifient pas la charge mais plutôt
la phase de la fonction d'onde pour la molécule titre [183]. D'après la figure IV.1, on peut
observer que pour le BNNT, les HOMO sont localisés à l’extrémité du tube, et la plupart d'entre
eux aux atomes N qui sont terminés par des atomes H. Cela signifie que le nanotube peut très
vraisemblablement subir une attaque électrophile au niveau de son site N [158]. Au contraire,
les LUMO sont situés au niveau de la paire N-B, le long de l'axe principal. Dans le cas des
CNT, les HOMO et LUMO sont situés à l'extrémité du tube et la plupart des contributions sont
positionnées au niveau des atomes C liés aux atomes H.
Sites Nucleophile Sites Electrophile
HOMO LUMO
1) CZT
Key:
Atoms: carbon hydrogen boron nitrogen
oxygen chloride fluoride
Clouds: blue clouds represent the highly accumlated areas
yellow clouds represent lesser accumlated areas.
Figure IV-1. Les orbitales frontières HOMO et LUMO du CZT, du CNT et du BNNT.
73
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
HOMO
distribution
LUMO
distribution
Figure IV-2. Les orbitales frontières HOMO et LUMO du système en interaction CZT-CNT
Ces résultats révèlent que l'adsorption de la molécule médicamenteuse sur le CNT n'a
pas d'effets significatifs sur la localisation de l’HOMO et du LUMO. En d'autres termes, les
propriétés électroniques des nanotubes sont maintenues lors de l'adsorption du médicament.
Cependant, dans le cas du modèle CZT/BNNT (Figure IV.3), l’HOMO est localisé sur
la molécule de médicament tandis que le LUMO est apparu sur le BNNT, ce qui indique qu'il
y a un transfert de charge de l’HOMO vers le LUMO.
HOMO
distribution
LUMO
distribution
Figure IV-3. Les orbitales frontières HOMO et LUMO du système en interaction CZT-BNNT
74
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
À l'aide des énergies orbitales HOMO et LUMO, le potentiel chimique, la dureté globale
et l'indice d'électrophile ω ont été calculés pour CZT, CNT, BNNT et leurs complexes
correspondants CZT/CNT et CZT/BNNT, en supposant être dans le vide, utilisé pour donner
des informations sur les interactions pures du médicament avec les nanotubes sans effet externe
(comme une phase gazeuse), ou en présence d'un système solvant (ie,présence d'eau) [170].
Cette approche permet de mieux comprendre les interactions moléculaires spécifiques entre le
médicament et le nanotube. De plus, il isole la contribution du solvant (salvation) dans les
interactions énergétiques du nanotube et du médicament dans les systèmes biologiques.
Le tableau IV.3 présente les résultats des calculs en supposant une molécule
médicamenteuse absolue (sous vide). Lorsque la molécule de médicament s'approche de la
surface externe des nanotubes, la taille et la direction du vecteur (moment dipolaire électrique)
peuvent varier, également en fonction des différentes configurations d'adsorption considérées.
Dans nos données, les valeurs du moment dipolaire des CNT et des BNNT passent
respectivement de 0,0002 à 0,0012 Debye et pour les complexes médicament-nanotube de 1,7
à 3,3 Debye. La différence entre les valeurs du moment dipolaire du complexe médicament-
nanotube par rapport au nanotube est supérieure d'un ordre de magnitude pour les CNT par
rapport au BNNT. Comme il est connu, une molécule à faible gap énergétique, définie comme
|EHOMO - ELUMO |, se caractérise par une grande réactivité chimique, une faible stabilité cinétique
et peut être considérée comme une molécule molle ; au contraire, une molécule avec un grand
gap énergétique est considérée comme dure [154].
Tableau IV-3. Descripteurs moléculaires quantiques calculés pour les structures les plus stables des complexes
médicament-nanotube.
Systéme D (debye) (eV) (eV) Egap (eV) µ (eV) η (eV) ω (eV)
B1 1.767 -3.985 -1.484 2.501 -2.734 1.250 2.989
B2 3.285 -4.008 -1.561 2.447 -2.784 1.223 3.168
B3 3.159 -4.143 -1.399 2.744 -2.771 1.372 2.798
B4 1.925 -4.068 -1.368 2.700 -2.718 1.350 2.736
BNNT 0.0012 -5.353 -0.709 4.664 -3.031 2.322 1.978
C1 2.096 -3.515 -2.801 0.714 -3.158 0.357 13.967
C2 3.068 -3.542 -2.829 0.713 -3.185 0.356 14.247
C3 2.601 -3.569 -2.857 0.712 -3.218 0.356 14.544
C4 1.703 -3.494 -2.790 0.704 -3.142 0.352 14.022
CNT 0.0002 -3.685 -2.836 0.849 -3.260 0.424 12.532
CZT 2.441 -4.046 -1.483 2.563 -2.764 1.281 2.981
Lorsque le CZT est adsorbé sur BNNT, le gap HOMO-LUMO et la dureté globale
diminuent respectivement d'environ 2 et 1eV par rapport aux valeurs de référence déterminées
pour le nanotube. D'autre part, le processus d'adsorption produit une amélioration d'environ 0,3
et 1eV pour le potentiel chimique et l'indice d'électrophile respectivement.
75
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
Les complexes CNT montrent des valeurs très similaires de Egap, µ et par rapport aux
CNT, avec une élévation maximale de 2eV pour ω après adsorption de CZT. Ces résultats
mettent en évidence que, pour le CNT, sa stabilité chimique est préservée lorsque le
médicament est adsorbé en surface, tandis que les BNNT sont convertis en espèces dures lors
de l'adsorption du CZT. Il convient de mentionner que les valeurs de l'indice d'électrophile du
complexe médicament-CNT sont, en moyenne, cinq fois supérieure à celles du complexe
médicament-BNNT, ce qui suggère la plus grande stabilité du nanotube CNT.
Les mêmes calculs d'énergie ont également été effectués dans la phase aqueuse pour
prédire le comportement des nanotubes dans les systèmes biologiques (c'est-à-dire le système
circulatoire sanguin), et les résultats sont résumés dans le tableau IV.4. Tout d'abord, une légère
augmentation des valeurs d'énergie de gap peut être observée dans la solution aqueuse par
rapport aux résultats pour la phase gazeuse. De plus, les résultats obtenus dans la simulation
topologique indiquent que la nature des interactions intermoléculaires est affectée de manière
négligeable par la solvatation. Ce résultat pour le complexe-BNNT n'est pas surprenant car on
sait que les nanotubes de bore sont hydrophiles, tandis que les CNT sont hydrophobes.
Cependant, dans notre cas, l'interaction du complexe médicament-CNT était plus forte que celle
du complexe médicament-BNNT dans le milieu solvant en raison du changement du moment
dipolaire, ce qui montre une légère augmentation pour les CNT. Ainsi, l'interaction plus forte
de CZT/CNT est responsable de l'effet minimal de la solvatation sur les interactions
intermoléculaires.
Tableau IV-4. Propriétés physico-chimiques calculées pour les structures les plus stables des complexes
médicament-nanotube dans l'eau.
System D (Debye) ( ) (eV) Egap (eV) µ (eV) η(eV) ω (eV)
B1 3.457 -4.512 -1.773 2.739 -3.142 1.369 3.601
B2 3.885 -4.612 -1.794 2.818 -3.203 1.409 3.640
B3 4.428 -4.589 -1.756 2.833 -3.172 1.416 3.552
B4 2.827 -4.544 -1.687 2.857 -3.115 1.428 3.397
BNNT 0.0012 -5.627 -0.971 4.656 -3.299 2.328 2.337
C1 4.246 -3.899 -3.176 0.723 -3.537 0.361 17.327
C2 4.067 -4.008 -3.285 0.723 -3.646 0.361 18.411
C3 3.140 -3.959 -3.236 0.723 -3.597 0.361 17.920
C4 3.519 -3.955 -3.246 0.709 -3.600 0.354 18.305
CNT 0.0003 -4.147 -3.294 0.853 -3.720 0.426 16.242
CZT 3.723 -4.690 -1.818 2.872 -3.254 1.436 3.686
La position d'empilement la plus stable du CZT sur les nanotubes récupérés dans la
phase aqueuse est indiquée dans le tableau IV.5. Il a été constaté que les énergies d'adsorption
(Eads) du complexe médicament-CNT dans le gaz comme dans l'eau ont des valeurs négatives,
expliquant ainsi le caractère exothermique des interactions.
76
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
Tableau IV-5. Énergies d'adsorption (Eads) et de solvatation (Esol) des complexes médicament-nanotube.
System Eads in gas (eV) Eads in water (eV) Esol (kcal/mol)
En revanche, une seule valeur négative a été observée pour le complexe CZT- BNNT
en phase gazeuse, et des valeurs positives ont été enregistrées pour tous les autres cas. Des
valeurs positives de Eads indiquent que la molécule de médicament interagirait de manière
défavorable (énergie endothermique) avec le BNNT via ces positions d'empilement ; en d'autres
termes, ces configurations sont instables [184]. Cela pourrait être lié à des distorsions des
liaisons dans le complexe de nanotubes médicament-BNNT. L'énergie finale du système est
supérieure à la somme des énergies du médicament isolé et du nanotube (rendant ainsi l'énergie
d'adsorption positive, (voir Eq. IV.5).
Des calculs de densité d'état (DOS) ont été effectués pour le médicament brut, les
nanotubes et les complexes CZT-NT, afin d'étudier l'influence de l'adsorption du médicament
sur les propriétés des nanotubes. Les résultats sont illustrés sur les figure IV.4 et IV.5
respectivement pour CNT et BNNT.
77
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
Figure IV-4. DOS des différentes structures optimisées dans le cas des CNT
Figure IV-5. DOS des différentes structures optimisées dans le cas des BNNT
Le BNNT devrait être constitué de semi-conducteurs à large espace d'une valeur de 5,5
eV. L'écart HOMO-LUMO du BNNT est d'environ 5eV [185], [186], ce qui est cohérent avec
les résultats de liaison étroite et les calculs ab initio [187]. De plus, on observe l'absence d'écart
entre les orbitales HOMO et LUMO dans les courbes DOS du NTC. Par conséquent, on peut
en déduire que les NTC sont métalliques. Ce résultat est également en accord avec la structure
78
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
de bande à liaison étroite [188]. Les valeurs d'écart des CNT dans B1, B2, B3 et B4 sont
respectivement de 2,50 ; 2,44 ; 2,74 et 2,70 eV. En comparant ces résultats avec ceux du BNNT
environ de l’ordre 0,71; l'écart est significativement modifié en interagissant avec la molécule
médicamenteuse CZT. Par conséquent, les courbes montrent que l'adsorption de la molécule de
médicament peut modifier considérablement la conductivité électrique des nanotubes, mais leur
caractère semi-conducteur est toujours dans les BNNT à fonction non covalente.
Au contraire, le profil DOS des CNT ne montre aucun changement par l'interaction non
covalente avec la molécule CZT. Les pics HOMO et LUMO ne sont pas séparés, comme le
montre la figure IV.4, ce qui indique que les NTC conservent leur caractère métallique lors de
l'adsorption de la molécule de médicament. Les CNT peuvent être considérés comme un
meilleur support pour le médicament CZT en raison de sa conductance plus élevée dans
l’intervalle de 0 à 2eV (Figure IV.4) que celle des BNNT lors de l'adsorption des molécules
médicamenteuses (Figure IV.5).
79
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
a) CZT
b) CNT (7,7)
c) BNNT (7,7)
Key:
Colors: highly positive slightly positive neutral
slightly negative highly negative
Atoms: carbon hydrogen nitrogen boron
oxygen chloride fluorine
Figure IV.6. Surfaces latérales et de face avant COSMO pour (a) médicament CZT, (b) CNT et (c) BNNT
80
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
Configuration C2 Configuration B2
Configuration C3 Configuration B3
Configuration C4 Configuration B4
Key:
Colors: highly positive slightly positive neutral slightly negative highly negative
Atoms: carbon hydrogen nitrogen boron oxygen chloride fluorine
Figure IV-7. Surfaces latérales et de face avant COSMO pour les complexes de (a) CNT, (b) BNNT
Comme le montre la figure IV.8, un large pic a été observé pour le BNNT dans la région des
donneurs de liaisons hydrogène (HBD) [192] qui a également apparu dans le complexe
CZT/BNNT de -0,0075 à -0,015 eÅ-2, alors qu'aucun des pics ont été observés dans cette zone
à la fois pour le CNT et le complexe CZT/CNT. Cependant, un pic faible est apparu pour la
molécule CZT, ce qui indique la forte polarité du BNNT et l'inverse pour le CNT.
81
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
(a)
(b) (c)
Figure IV-8. Profils Sigma : a) médicaments CNT, BNNT et CZT, b) complexes B et c) complexes C.
(Les abréviations sont disponibles dans la section Nomenclature)
A titre comparatif, cette note est conforme à la figure IV.6 de la surface sigma illustrée par la
présence de la couleur bleue. Pour la molécule médicamenteuse, la couleur bleue correspond à
la fonction de NH2 et à l'atome N dans le cycle du pyrazole. Une couleur bleue plus foncée est
représentée dans les atomes N-H situés à l'avant du BNNT. Ainsi, les propriétés physico-
chimiques du BNNT pourraient être modifiées. L’intervalle entre -0,0075 et 0,0075 eÅ-2 décrit
la région non polaire ; dans cette zone, les pics de CNT étaient étroits tandis que ceux du
BNNT étaient larges. Dans la région des accepteurs de liaison hydrogène (HBA) [193], située
après la valeur de 0,0075 eÅ-2, de très petits pics larges ont été enregistrés pour le BNNT et ses
complexes, situés généralement à la surface du nanotube et illustrée par la couleur jaune sur la
figure IV.6.
82
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
Les tendances des molécules obtenues à partir des profils- ont également été vérifiées
en utilisant leurs affinités de potentiel- , montrées sur la figure IV.9. Le potentiel- d'une
molécule peut être défini comme l'affinité d'une surface ayant une polarité σ pour être attiré par
un type particulier de solvant (c'est-à-dire HBA, HBD, non polaire) [194], [195]. En utilisant
les potentiels- , les conclusions suivantes peuvent être tirées :
83
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
(a)
(b) (c)
Figure IV-9. Potentiels sigma : a) médicaments CNT, BNNT et CZT ; b) complexe CZT/CNT et c) complexe
CZT/BNNT (Les abréviations sont disponibles dans la section Nomenclature).
84
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
(a)
(b)
Figure IV-10. Energies des inadéquations, des liaisons hydrogène, de Van der Waals et énergies totales en
kcal/mol des complexes : (a) CNT/CZT et (b) BNNT/CZT
Les graphiques moléculaires des complexes CZT/CNT optimisés sont présentés dans la
figure IV.11. À partir des résultats du tableau IV.6, les valeurs calculées de ( ) dans les BCP
sont petits alors que 2ρ(r) sont positifs, ce qui indique que les interactions de liaisons
hydrogène sont dominantes dans toutes les configurations obtenues. Cependant, dans la
configuration C3, les résultats de 2ρ(r) étaient à la fois des valeurs négatives et positives, alors
que les valeurs de ( ) restaient élevées, ce qui illustre que la charge électronique a été partagée
et focalisée dans la région internucléaire entre les deux noyaux expliquant la liaison covalente
(polaire). D’autre part, les valeurs de 2ρ(r) et HC étaient positives dans toutes les
85
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
86
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
C1
C2
C3
C4
Figure IV-11. Graphique moléculaire des complexes CNT/CZT obtenus à partir de l'analyse AIM. Les petites
sphères rouges et les lignes vertes correspondent respectivement aux points de connexion critiques (BCP) et aux
chemins de connexion.
87
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
Tableau IV-6. Paramètres topologiques au BCP des contacts d'interaction dans les complexes CNT/CZT.
BCP ( )×103 ( )×103 ( ) ×103 ( ) ×103 (eV) ×103 ( + )×103 /| |
C1 186 5.17 17.3 3.33 -2.33 -1.17 0.998 1.43
195 8.32 27.3 5.54 -4.24 -2.12 1.3 1.31
225 4.12 12.2 2.34 -1.63 -0.813 0.715 1.44
230 5.33 16.4 3.2 -2.3 -1.15 0.9 1.39
244 6.9 23.6 4.65 -3.4 -1.7 1.25 1.37
251 3.59 12 2.24 -1.48 -0.74 0.757 1.51
253 6.85 23.4 4.61 -3.37 -1.68 1.24 1.37
256 4.57 16.8 3.16 -2.12 -1.06 1.04 1.49
293 4.1 13.6 2.57 -1.74 -0.869 0.832 1.48
294 6.81 24 4.7 -3.41 -1.7 1.3 1.38
297 3.82 11.9 2.25 -1.53 -0.763 0.723 1.47
342 7.84 27.3 5.44 -4.05 -2.03 1.39 1.34
343 3.93 13.7 2.57 -1.7 -0.852 0.862 1.51
353 5.23 17.1 3.3 -2.33 -1.16 0.972 1.42
372 6.83 22.4 4.44 -3.28 -1.64 1.16 1.35
88
Chapitre IV Propriétés d'adsorption du médicament Crizotinib sur les nanotubes NTC et BNNT
Conclusion
Dans le présent travail, une étude comparative entre le CNT et le BNNT en tant que
supports de la molécule anti-tumorale CZT a été réalisée à l'aide de calculs DFT dans les phases
aqueuse et gazeuse. Les calculs de chimie quantique ont été effectués pour comprendre la nature
des interactions entre le médicament CZT et les nanotubes. Les résultats n'ont révélé aucun effet
significatif sur la localisation des iso-surfaces HOMO et LUMO des NTC lors de l'adsorption
du médicament, révélant ainsi que les caractéristiques électroniques des NTC sont préservées.
Dans le cas du BNNT, les résultats ont indiqué que, avec une probabilité considérable, le
nanotube pourrait subir une attaque électrophile. L'analyse des valeurs du moment dipolaire a
mis en évidence que les complexes BNNT ont été convertis en une espèce dure tandis que ceux
du NTC ont montré plus de stabilité lors de la solvatation. Les calculs énergétiques ont montré
qu'une faible interaction endothermique se produit entre le BNNT et la molécule de
médicament, tandis que l'adsorption du CZT sur le CNT est exothermique. Les résultats des
paramètres d'énergie de solvatation ont démontré que le complexe CZT/CNT est plus soluble
que le complexe CZT/BNNT en milieu aqueux. Par conséquent, dans l'ensemble, les CNT
peuvent être considérés dans les systèmes biologiques comme un meilleur support pour les
molécules CZT comparées à celles du BNNT.
De plus, les calculs de densité d'états effectués, ont montré que le NTC est métallique
et corrobore les résultats obtenus pour les valeurs d'écart HOMO et LUMO. Les résultats des
profils Sigma obtenus à partir de la méthode COSMO-RS ont montré que la conductivité
électrique du BNNT pouvait considérablement changer lors de l'adsorption du médicament.
L'analyse théorique globale suggère que les NTC sont un véhicule plus prometteur pour
l'administration du médicament anticancéreux CZT dans les systèmes biologiques et leur
potentiel peut être encore amélioré en adoptant un traitement de fonctionnalisation spécifique
visant à insérer des groupes fonctionnels capables de modifier favorablement l'énergie
d'interaction médicament-support et d'augmenter la solubilité du complexe dans le milieu
aqueux. Enfin, les informations obtenues à partir des calculs de l'AIM ont confirmé la présence
de l'interaction de covalence partielle entre le médicament CZT et le NTC.
89
Conclusion générale
et perspectives
Conclusion générale
La prise en charge avancée des maladies pulmonaires a été transformée ces dernières
années par la personnalisation des traitements.
Dans ce sens, notre travail a consisté à améliorer les propriétés physico-chimiques d’une
molécule bioactive le Crizotinib (CZT) adsorbée à la surface d’un nano-support de carbone
(NTC) et/ou de nitrile de bore (BNNT) utilisés comme transporteurs vectoriels du médicament
pour optimiser son administration ciblée sur le tissu cellulaire infecté et établir ainsi et le
diagnostic et l’effet thérapeutique de leurs complexes (CZT/NTC) et (CZT/BNNT), dans le
cadre large des traitements à mettre en place contre les maladies respiratoires chroniques plus
courantes, comme l'asthme, la maladie pulmonaire obstructive chronique (MPOC) et
particulièrement le cancer du poumon.
Pour cela, il a fallu prévoir la structure et la réactivité des molécules ou de leurs systèmes,
en optant pour la modélisation moléculaire qui implique l'utilisation des méthodes de calcul
théoriques (mécanique moléculaire, mécanique quantique ab-initio ou semi-empirique,)
permettant de déterminer la représentation graphique de la géométrie et/ou de la configuration
des atomes d'une molécule et d'évaluer ses propriétés physico-chimiques.
Dans le présent travail, la molécule anti-tumorale Crizotinib a été choisie. En effet, une
étude comparative entre le NTC et le BNNT, en tant que supports de cette molécule a été
réalisée à l'aide des calculs DFT dans les phases aqueuse et gazeuse. Les calculs de chimie
91
quantique ont été effectués afin de comprendre la nature des interactions entre les complexes
nanotube-médicament CZT. Les résultats ont révélé que les caractéristiques électroniques des
NTC sont préservées. Dans le cas du BNNT, les résultats ont indiqué qu’avec une probabilité
considérable, le nanotube pourrait subir une attaque électrophile. L'analyse des valeurs du
moment dipolaire a mis en évidence que les complexes BNNT ont été convertis en une espèce
dure tandis que ceux du NTC ont montré plus de stabilité lors de la solvatation. Les calculs
des paramètres d'énergie de solvatation ont ainsi démontré que le complexe CZT/NTC est plus
soluble que le complexe CZT/BNNT en milieu aqueux. Par conséquent, dans l'ensemble, les
NTC peuvent être considérés comme meilleur support pour les molécules CZT (par rapport au
BNNT) au sein des systèmes biologiques. Ces résultats sont adéquats avec ceux des profils
Sigma obtenus à partir de la méthode COSMO-RS qui ont montré que la conductivité
électrique du BNNT pouvait considérablement changer lors de l'adsorption du médicament.
Enfin, les informations obtenues à partir des calculs de l'AIM ont confirmé la présence de
l'interaction de covalence partielle entre le médicament CZT et le NTC.
Perspectives
Une fonctionnalisation des nanotubes de carbone donnerait des dérivés plus efficaces sur le
plan diagnostic et thérapeutique avec un minimum d’effets indésirables lors de l’administration
des médicaments dans les milieux biologiques et ouvrirait un avenir radieux non seulement
pour le traitement du cancer mais pour du moins un bon nombre de pathologies inquiétantes.
92
Références bibliographiques
93
Références bibliographiques
[1] J.K. Patra, G. Das, L.F. Fraceto, E.V.R. Campos, M. del P. Rodriguez-Torres, L.S. Acosta-Torres,
L.A. Diaz-Torres, R. Grillo, M.K. Swamy, S. Sharma, S. Habtemariam, H.-S. Shin, Nano based
drug delivery systems: recent developments and future prospects, J Nanobiotechnology. 16 (2018)
71. https://doi.org/10.1186/s12951-018-0392-8.
[2] J. Simon, E. Flahaut, M. Golzio, Overview of Carbon Nanotubes for Biomedical Applications,
Materials (Basel). 12 (2019) 624. https://doi.org/10.3390/ma12040624.
[3] X. Chen, P. Wu, M. Rousseas, D. Okawa, Z. Gartner, A. Zettl, C.R. Bertozzi, Boron Nitride
Nanotubes Are Noncytotoxic and Can Be Functionalized for Interaction with Proteins and Cells, J
Am Chem Soc. 131 (2009) 890–891. https://doi.org/10.1021/ja807334b.
[5] A.J. Alberg, M.V. Brock, J.G. Ford, J.M. Samet, S.D. Spivack, Epidemiology of Lung Cancer,
Chest. 143 (2013) e1S-e29S. https://doi.org/10.1378/chest.12-2345.
[6] H. Lemjabbar-Alaoui, O. Hassan, Y.-W. Yang, P. Buchanan, Lung cancer: biology and treatment
options, Biochim Biophys Acta. 1856 (2015) 189–210.
https://doi.org/10.1016/j.bbcan.2015.08.002.
[7] H.K. Reddel, E.D. Bateman, A. Becker, L.-P. Boulet, A.A. Cruz, J.M. Drazen, T. Haahtela, S.S.
Hurd, H. Inoue, J.C. de Jongste, R.F. Lemanske, M.L. Levy, P.M. O’Byrne, P. Paggiaro, S.E.
Pedersen, E. Pizzichini, M. Soto-Quiroz, S.J. Szefler, G.W.K. Wong, J.M. FitzGerald, A summary
of the new GINA strategy: a roadmap to asthma control, European Respiratory Journal. 46 (2015)
622–639. https://doi.org/10.1183/13993003.00853-2015.
[8] S.D. Shukla, K. Swaroop Vanka, A. Chavelier, M.D. Shastri, M.M. Tambuwala, H.A. Bakshi, K.
Pabreja, M.Q. Mahmood, R.F. O’Toole, Chronic respiratory diseases: An introduction and need for
novel drug delivery approaches, Targeting Chronic Inflammatory Lung Diseases Using Advanced
Drug Delivery Systems. (2020) 1–31. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-820658-4.00001-7.
[9] H. Sung, J. Ferlay, R.L. Siegel, M. Laversanne, I. Soerjomataram, A. Jemal, F. Bray, Global Cancer
Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in
185 Countries, CA: A Cancer Journal for Clinicians. 71 (2021) 209–249.
https://doi.org/10.3322/caac.21660.
[10] D. Stambolian, G. Ibay, L. Reider, D. Dana, C. Moy, M. Schlifka, T. Holmes, E. Ciner, J.E. Bailey-
Wilson, Genomewide linkage scan for myopia susceptibility loci among Ashkenazi Jewish families
shows evidence of linkage on chromosome 22q12, Am J Hum Genet. 75 (2004) 448–459.
https://doi.org/10.1086/423789.
[11] J. Ferlay, M. Colombet, I. Soerjomataram, C. Mathers, D.M. Parkin, M. Piñeros, A. Znaor, F. Bray,
Estimating the global cancer incidence and mortality in 2018: GLOBOCAN sources and methods,
Int J Cancer. 144 (2019) 1941–1953. https://doi.org/10.1002/ijc.31937.
[13] A. Levi, Y. Kohn, K. Kanyas, D. Amann, C.-U. Pae, A. Hamdan, R.H. Segman, N. Avidan, O.
Karni, M. Korner, T.-Y. Jun, J.S. Beckmann, F. Macciardi, B. Lerer, Fine mapping of a
94
Références bibliographiques
schizophrenia susceptibility locus at chromosome 6q23: increased evidence for linkage and reduced
linkage interval, Eur J Hum Genet. 13 (2005) 763–771. https://doi.org/10.1038/sj.ejhg.5201406.
[14] R.W. Pettit, J. Byun, Y. Han, Q.T. Ostrom, J. Edelson, K.M. Walsh, M.L. Bondy, R.J. Hung, J.D.
McKay, C.I. Amos, The shared genetic architecture between epidemiological and behavioral traits
with lung cancer, Sci Rep. 11 (2021) 17559. https://doi.org/10.1038/s41598-021-96685-x.
[15] M.N. Eakin, C.S. Rand, Improving Patient Adherence with Asthma Self-Management Practices:
What Works?, Ann Allergy Asthma Immunol. 109 (2012) 90–92.
https://doi.org/10.1016/j.anai.2012.06.009.
[16] N.C. for B. Information, U.S.N.L. of M. 8600 R. Pike, B. MD, 20894 Usa, Medication for people
with asthma, Institute for Quality and Efficiency in Health Care (IQWiG), 2017.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279519/ (accessed November 27, 2021).
[17] B.C.P. van Dijk, H. Svedsater, A. Heddini, L. Nelsen, J.S. Balradj, C. Alleman, Relationship
between the Asthma Control Test (ACT) and other outcomes: a targeted literature review, BMC
Pulmonary Medicine. 20 (2020) 79. https://doi.org/10.1186/s12890-020-1090-5.
[18] O. Enilari, S. Sinha, The Global Impact of Asthma in Adult Populations, Ann Glob Health. 85 (n.d.)
2. https://doi.org/10.5334/aogh.2412.
[19] A.M. Musolf, C.L. Simpson, B.A. Moiz, C.W. Pikielny, C.D. Middlebrooks, D. Mandal, M. de
Andrade, M.D. Cole, C. Gaba, P. Yang, M. You, Y. Li, E.Y. Kupert, M.W. Anderson, A.G.
Schwartz, S.M. Pinney, C.I. Amos, J.E. Bailey-Wilson, Genetic Variation and Recurrent
Haplotypes on Chromosome 6q23-25 Risk Locus in Familial Lung Cancer, Cancer Res. 81 (2021)
3162–3173. https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-20-3196.
[20] B.C.P. van Dijk, H. Svedsater, A. Heddini, L. Nelsen, J.S. Balradj, C. Alleman, Relationship
between the Asthma Control Test (ACT) and other outcomes: a targeted literature review, BMC
Pulmonary Medicine. 20 (2020) 79. https://doi.org/10.1186/s12890-020-1090-5.
[21] H.K. Reddel, E.D. Bateman, A. Becker, L.-P. Boulet, A.A. Cruz, J.M. Drazen, T. Haahtela, S.S.
Hurd, H. Inoue, J.C. de Jongste, R.F. Lemanske, M.L. Levy, P.M. O’Byrne, P. Paggiaro, S.E.
Pedersen, E. Pizzichini, M. Soto-Quiroz, S.J. Szefler, G.W.K. Wong, J.M. FitzGerald, A summary
of the new GINA strategy: a roadmap to asthma control, Eur Respir J. 46 (2015) 622–639.
https://doi.org/10.1183/13993003.00853-2015.
[23] S. Wang, L. Xiong, X. Deng, W. Ren, C. Zhu, C. Li, Q. Zhou, [Effects of simvastatin on airway
inflammation and airway mucus hypersecretion in rats with chronic obstructive pulmonary disease],
Zhonghua Yi Xue Za Zhi. 95 (2015) 1726–1730.
[24] S. Murin, K.E. Pinkerton, N.E. Hubbard, K. Erickson, The effect of cigarette smoke exposure on
pulmonary metastatic disease in a murine model of metastatic breast cancer, Chest. 125 (2004)
1467–1471. https://doi.org/10.1378/chest.125.4.1467.
[25] A.R. de Souza, M. Zago, D.H. Eidelman, Q. Hamid, C.J. Baglole, Aryl hydrocarbon receptor (AhR)
attenuation of subchronic cigarette smoke-induced pulmonary neutrophilia is associated with
retention of nuclear RelB and suppression of intercellular adhesion molecule-1 (ICAM-1), Toxicol
Sci. 140 (2014) 204–223. https://doi.org/10.1093/toxsci/kfu068.
95
Références bibliographiques
[26] D.P. Tashkin, C. Strange, Inhaled corticosteroids for chronic obstructive pulmonary disease: what
is their role in therapy?, Int J Chron Obstruct Pulmon Dis. 13 (2018) 2587–2601.
https://doi.org/10.2147/COPD.S172240.
[27] S. Mamlouk, T. Simon, L. Tomás, D.C. Wedge, A. Arnold, A. Menne, D. Horst, D. Capper, M.
Morkel, D. Posada, C. Sers, H. Bläker, Malignant transformation and genetic alterations are
uncoupled in early colorectal cancer progression, BMC Biology. 18 (2020) 116.
https://doi.org/10.1186/s12915-020-00844-x.
[28] N. Shahidi, J.M. FitzGerald, Current recommendations for the treatment of mild asthma, J Asthma
Allergy. 3 (2010) 169–176. https://doi.org/10.2147/JAA.S14420.
[28] B.L. Parsons, Multiclonal tumor origin: Evidence and implications, Mutation Research/Reviews
in Mutation Research. 777 (2018) 1–18. https://doi.org/10.1016/j.mrrev.2018.05.001.
[29] L. Walcher, A.-K. Kistenmacher, H. Suo, R. Kitte, S. Dluczek, A. Strauß, A.-R. Blaudszun, T.
Yevsa, S. Fricke, U. Kossatz-Boehlert, Cancer Stem Cells—Origins and Biomarkers: Perspectives
for Targeted Personalized Therapies, Frontiers in Immunology. 11 (2020) 1280.
https://doi.org/10.3389/fimmu.2020.01280.
[30] L. van der Weyden, D.J. Adams, The Ras-association domain family (RASSF) members and their
role in human tumourigenesis, Biochim Biophys Acta. 1776 (2007) 58–85.
https://doi.org/10.1016/j.bbcan.2007.06.003.
[31] M.A. Lemmon, J. Schlessinger, Cell signaling by receptor-tyrosine kinases, Cell. 141 (2010) 1117–
1134. https://doi.org/10.1016/j.cell.2010.06.011.
[32] X. Nan, C. Xie, X. Yu, J. Liu, EGFR TKI as first-line treatment for patients with advanced EGFR
mutation-positive non-small-cell lung cancer, Oncotarget. 8 (2017) 75712–75726.
https://doi.org/10.18632/oncotarget.20095.
[33] J. Colicelli, Human RAS Superfamily Proteins and Related GTPases, Sci STKE. 2004 (2004) RE13.
https://doi.org/10.1126/stke.2502004re13.
[34] J. Karar, A. Maity, PI3K/AKT/mTOR Pathway in Angiogenesis, Front Mol Neurosci. 4 (2011) 51.
https://doi.org/10.3389/fnmol.2011.00051.
[35] M.M. Nau, B.J. Brooks, J. Battey, E. Sausville, A.F. Gazdar, I.R. Kirsch, O.W. McBride, V.
Bertness, G.F. Hollis, J.D. Minna, L-myc, a new myc-related gene amplified and expressed in
human small cell lung cancer, Nature. 318 (1985) 69–73. https://doi.org/10.1038/318069a0.
[36] Y. Zhang, M. Xia, K. Jin, S. Wang, H. Wei, C. Fan, Y. Wu, X. Li, X. Li, G. Li, Z. Zeng, W. Xiong,
Function of the c-Met receptor tyrosine kinase in carcinogenesis and associated therapeutic
opportunities, Mol Cancer. 17 (2018) 45. https://doi.org/10.1186/s12943-018-0796-y.
[37] S.R. Sabir, S. Yeoh, G. Jackson, R. Bayliss, EML4-ALK Variants: Biological and Molecular
Properties, and the Implications for Patients, Cancers (Basel). 9 (2017) 118.
https://doi.org/10.3390/cancers9090118.
[48] S.P. Ducray, K. Natarajan, G.D. Garland, S.D. Turner, G. Egger, The Transcriptional Roles of
ALK Fusion Proteins in Tumorigenesis, Cancers (Basel). 11 (2019) 1074.
https://doi.org/10.3390/cancers11081074.
96
Références bibliographiques
[39] S.B. Baylin, P.A. Jones, Epigenetic Determinants of Cancer, Cold Spring Harb Perspect Biol. 8
(2016) a019505. https://doi.org/10.1101/cshperspect.a019505.
[40] B. Laderian, P. Mundi, T. Fojo, S. E Bates, Emerging Therapeutic Implications of STK11 Mutation:
Case Series, Oncologist. 25 (2020) 733–737. https://doi.org/10.1634/theoncologist.2019-0846.
[41] N. Rivlin, R. Brosh, M. Oren, V. Rotter, Mutations in the p53 Tumor Suppressor Gene, Genes
Cancer. 2 (2011) 466–474. https://doi.org/10.1177/1947601911408889.
[42] A. Mogi, H. Kuwano, TP53 Mutations in Nonsmall Cell Lung Cancer, Journal of Biomedicine and
Biotechnology. 2011 (2011) e583929. https://doi.org/10.1155/2011/583929.
[52] S. Zienolddiny, D. Ryberg, M.O. Arab, V. Skaug, A. Haugen, Loss of heterozygosity is related to
p53 mutations and smoking in lung cancer, Br J Cancer. 84 (2001) 226–231.
https://doi.org/10.1054/bjoc.2000.1528.
[46] R. Shandilya, N. Pathak, N.K. Lohiya, R.S. Sharma, P.K. Mishra, Nanotechnology in reproductive
medicine: Opportunities for clinical translation, Clin Exp Reprod Med. 47 (2020) 245–262.
https://doi.org/10.5653/cerm.2020.03650.
[47] J.K. Patra, G. Das, L.F. Fraceto, E.V.R. Campos, M. del P. Rodriguez-Torres, L.S. Acosta-Torres,
L.A. Diaz-Torres, R. Grillo, M.K. Swamy, S. Sharma, S. Habtemariam, H.-S. Shin, Nano based
drug delivery systems: recent developments and future prospects, J Nanobiotechnology. 16 (2018)
71. https://doi.org/10.1186/s12951-018-0392-8.
[48] I. Khan, K. Saeed, I. Khan, Nanoparticles: Properties, applications and toxicities, Arabian Journal
of Chemistry. 12 (2019) 908–931. https://doi.org/10.1016/j.arabjc.2017.05.011.
[49] J.K. Patra, G. Das, L.F. Fraceto, E.V.R. Campos, M. del P. Rodriguez-Torres, L.S. Acosta-Torres,
L.A. Diaz-Torres, R. Grillo, M.K. Swamy, S. Sharma, S. Habtemariam, H.-S. Shin, Nano based
drug delivery systems: recent developments and future prospects, J Nanobiotechnology. 16 (2018)
71. https://doi.org/10.1186/s12951-018-0392-8.
[50] A. Zaid Alkilani, M.T.C. McCrudden, R.F. Donnelly, Transdermal Drug Delivery: Innovative
Pharmaceutical Developments Based on Disruption of the Barrier Properties of the stratum
corneum, Pharmaceutics. 7 (2015) 438–470. https://doi.org/10.3390/pharmaceutics7040438.
[51] D. Chenthamara, S. Subramaniam, S.G. Ramakrishnan, S. Krishnaswamy, M.M. Essa, F.-H. Lin,
M.W. Qoronfleh, Therapeutic efficacy of nanoparticles and routes of administration, Biomater Res.
23 (2019) 20. https://doi.org/10.1186/s40824-019-0166-x.
[53] J.S. Suk, Q. Xu, N. Kim, J. Hanes, L.M. Ensign, PEGylation as a strategy for improving
nanoparticle-based drug and gene delivery, Adv Drug Deliv Rev. 99 (2016) 28–51.
https://doi.org/10.1016/j.addr.2015.09.012.
97
Références bibliographiques
[55] G. Bao, S. Mitragotri, S. Tong, Multifunctional Nanoparticles for Drug Delivery and Molecular
Imaging, Annu Rev Biomed Eng. 15 (2013) 253–282. https://doi.org/10.1146/annurev-bioeng-
071812-152409.
[56] S. Iijima, Helical microtubules of graphitic carbon, Nature. 354 (1991) 56–58.
https://doi.org/10.1038/354056a0.
[56] L. Li, C.A. Wartchow, S.N. Danthi, Z. Shen, N. Dechene, J. Pease, H.S. Choi, T. Doede, P. Chu, S.
Ning, D.Y. Lee, M.D. Bednarski, S.J. Knox, A novel antiangiogenesis therapy using an integrin
antagonist or anti-Flk-1 antibody coated 90Y-labeled nanoparticles, Int J Radiat Oncol Biol Phys.
58 (2004) 1215–1227. https://doi.org/10.1016/j.ijrobp.2003.10.057.
[57] A.B. Zakaria, F. Picaud, T. Rattier, M. Pudlo, F. Dufour, L. Saviot, R. Chassagnon, J. Lherminier,
T. Gharbi, O. Micheau, G. Herlem, Nanovectorization of TRAIL with single wall carbon nanotubes
enhances tumor cell killing, Nano Lett. 15 (2015) 891–895. https://doi.org/10.1021/nl503565t.
[58] P.M. Ajayan, Nanotubes from Carbon, Chem. Rev. 99 (1999) 1787–1800.
https://doi.org/10.1021/cr970102g.
[59] D.S. Bethune, C.H. Kiang, M.S. de Vries, G. Gorman, R. Savoy, J. Vazquez, R. Beyers, Cobalt-
catalysed growth of carbon nanotubes with single-atomic-layer walls, Nature. 363 (1993) 605–607.
https://doi.org/10.1038/363605a0.
[60] A. Aqel, K.M.M.A. El-Nour, R.A.A. Ammar, A. Al-Warthan, Carbon nanotubes, science and
technology part (I) structure, synthesis and characterisation, Arabian Journal of Chemistry. 5 (2012)
1–23. https://doi.org/10.1016/j.arabjc.2010.08.022.
[61] Y. Huh, J.Y. Lee, J. Cheon, Y.K. Hong, J.Y. Koo, T.J. Lee, C.J. Lee, Controlled growth of carbon
nanotubes over cobalt nanoparticles by thermal chemical vapor deposition, J. Mater. Chem. 13
(2003) 2297–2300. https://doi.org/10.1039/B304582J.
[62] Yacaman et al.; 1993]Yacaman, M. J.; Yoshida, M. M.; Rendon, L.; Santiesteban, J. G.,
Catalytic growth of carbon microtubules with fullerene structure. Applied Physics Letters
1993, 62 (2), 202-204.)
[63] null Ren, null Huang, null Xu, null Wang, null Bush, null Siegal, null Provencio, Synthesis of
large arrays of well-aligned carbon nanotubes on glass, Science. 282 (1998) 1105–1107.
https://doi.org/10.1126/science.282.5391.1105.
[64] P. Nikolaev, M.J. Bronikowski, R.K. Bradley, F. Rohmund, D.T. Colbert, K.A. Smith, R.E.
Smalley, Gas-phase catalytic growth of single-walled carbon nanotubes from carbon monoxide,
Chemical Physics Letters. 313 (1999) 91–97. https://doi.org/10.1016/S0009-2614(99)01029-5.
[66] H.L. Wong, R. Bendayan, A.M. Rauth, Y. Li, X.Y. Wu, Chemotherapy with anticancer drugs
encapsulated in solid lipid nanoparticles, Adv Drug Deliv Rev. 59 (2007) 491–504.
https://doi.org/10.1016/j.addr.2007.04.008.
98
Références bibliographiques
[68] D. Tasis, N. Tagmatarchis, A. Bianco, M. Prato, Chemistry of Carbon Nanotubes, Chem. Rev. 106
(2006) 1105–1136. https://doi.org/10.1021/cr050569o.
[70] H. Haniu, N. Saito, Y. Matsuda, T. Tsukahara, Y. Usui, N. Narita, K. Hara, K. Aoki, M. Shimizu,
N. Ogihara, S. Takanashi, M. Okamoto, S. Kobayashi, N. Ishigaki, K. Nakamura, H. Kato, Basic
Potential of Carbon Nanotubes in Tissue Engineering Applications, Journal of Nanomaterials. 2012
(2012) e343747. https://doi.org/10.1155/2012/343747.
[72] D. Lee, Y. Chander, S.M. Goyal, T. Cui, Carbon nanotube electric immunoassay for the detection
of swine influenza virus H1N1, Biosens Bioelectron. 26 (2011) 3482–3487.
https://doi.org/10.1016/j.bios.2011.01.029.
[73] A. De La Zerda, C. Zavaleta, S. Keren, S. Vaithilingam, S. Bodapati, Z. Liu, J. Levi, B.R. Smith,
T.-J. Ma, O. Oralkan, Z. Cheng, X. Chen, H. Dai, B.T. Khuri-Yakub, S.S. Gambhir, Carbon
nanotubes as photoacoustic molecular imaging agents in living mice, Nature Nanotech. 3 (2008)
557–562. https://doi.org/10.1038/nnano.2008.231.
[74] A. Bianco, K. Kostarelos, M. Prato, Applications of carbon nanotubes in drug delivery, Curr Opin
Chem Biol. 9 (2005) 674–679. https://doi.org/10.1016/j.cbpa.2005.10.005.
[75] H.A.F.M. Hassan, L. Smyth, N. Rubio, K. Ratnasothy, J.T.-W. Wang, S.S. Bansal, H.D. Summers,
S.S. Diebold, G. Lombardi, K.T. Al-Jamal, Carbon nanotubes’ surface chemistry determines their
potency as vaccine nanocarriers in vitro and in vivo, Journal of Controlled Release. 225 (2016) 205–
216. https://doi.org/10.1016/j.jconrel.2016.01.030.
[76] B. Kateb, M. Van Handel, L. Zhang, M.J. Bronikowski, H. Manohara, B. Badie, Internalization of
MWCNTs by microglia: possible application in immunotherapy of brain tumors, Neuroimage. 37
Suppl 1 (2007) S9-17. https://doi.org/10.1016/j.neuroimage.2007.03.078.
[77] X. Zhang, L. Meng, Q. Lu, Z. Fei, P.J. Dyson, Targeted delivery and controlled release of
doxorubicin to cancer cells using modified single wall carbon nanotubes, Biomaterials. 30 (2009)
6041–6047. https://doi.org/10.1016/j.biomaterials.2009.07.025.
[78] Y. Lin, S. Taylor, H. Li, K.A.S. Fernando, L. Qu, W. Wang, L. Gu, B. Zhou, Y.-P. Sun, Advances
toward bioapplications of carbon nanotubes, J. Mater. Chem. 14 (2004) 527–541.
https://doi.org/10.1039/B314481J.
[89] J.E. Podesta, K.T. Al-Jamal, M.A. Herrero, B. Tian, H. Ali-Boucetta, V. Hegde, A. Bianco, M.
Prato, K. Kostarelos, Antitumor activity and prolonged survival by carbon-nanotube-mediated
therapeutic siRNA silencing in a human lung xenograft model, Small. 5 (2009) 1176–1185.
https://doi.org/10.1002/smll.200801572.
[80] M.R. McDevitt, D. Chattopadhyay, B.J. Kappel, J.S. Jaggi, S.R. Schiffman, C. Antczak, J.T.
Njardarson, R. Brentjens, D.A. Scheinberg, Tumor targeting with antibody-functionalized,
radiolabeled carbon nanotubes, J Nucl Med. 48 (2007) 1180–1189.
https://doi.org/10.2967/jnumed.106.039131.
99
Références bibliographiques
[81] A. Ashkenazi, R.C. Pai, S. Fong, S. Leung, D.A. Lawrence, S.A. Marsters, C. Blackie, L. Chang,
A.E. McMurtrey, A. Hebert, L. DeForge, I.L. Koumenis, D. Lewis, L. Harris, J. Bussiere, H.
Koeppen, Z. Shahrokh, R.H. Schwall, Safety and antitumor activity of recombinant soluble Apo2
ligand, J Clin Invest. 104 (1999) 155–162. https://doi.org/10.1172/JCI6926.
[82] N.C. Mueller, B. Nowack, Exposure modeling of engineered nanoparticles in the environment,
Environ Sci Technol. 42 (2008) 4447–4453. https://doi.org/10.1021/es7029637.
[83] D.B. Warheit, B.R. Laurence, K.L. Reed, D.H. Roach, G.A.M. Reynolds, T.R. Webb, Comparative
Pulmonary Toxicity Assessment of Single-wall Carbon Nanotubes in Rats, Toxicological Sciences.
77 (2004) 117–125. https://doi.org/10.1093/toxsci/kfg228.
[84] P. Wick, P. Manser, L.K. Limbach, U. Dettlaff-Weglikowska, F. Krumeich, S. Roth, W.J. Stark, A.
Bruinink, The degree and kind of agglomeration affect carbon nanotube cytotoxicity, Toxicol Lett.
168 (2007) 121–131. https://doi.org/10.1016/j.toxlet.2006.08.019.
[85] R. Kopelman, Y.-E. Lee Koo, M. Philbert, B.A. Moffat, G. Ramachandra Reddy, P. McConville,
D.E. Hall, T.L. Chenevert, M.S. Bhojani, S.M. Buck, A. Rehemtulla, B.D. Ross, Multifunctional
nanoparticle platforms for in vivo MRI enhancement and photodynamic therapy of a rat brain
cancer, Journal of Magnetism and Magnetic Materials. 293 (2005) 404–410.
https://doi.org/10.1016/j.jmmm.2005.02.061.
[86] G. Jia, H. Wang, L. Yan, X. Wang, R. Pei, T. Yan, Y. Zhao, X. Guo, Cytotoxicity of carbon
nanomaterials: single-wall nanotube, multi-wall nanotube, and fullerene, Environ Sci Technol. 39
(2005) 1378–1383. https://doi.org/10.1021/es048729l.
[87] M. van der Zande, R. Junker, X.F. Walboomers, J.A. Jansen, Carbon nanotubes in animal models:
a systematic review on toxic potential, Tissue Eng Part B Rev. 17 (2011) 57–69.
https://doi.org/10.1089/ten.TEB.2010.0472.
[88] R.M. Steinman, I.S. Mellman, W.A. Muller, Z.A. Cohn, Endocytosis and the recycling of plasma
membrane, J Cell Biol. 96 (1983) 1–27. https://doi.org/10.1083/jcb.96.1.1.
[89] L. Lacerda, J. Russier, G. Pastorin, M.A. Herrero, E. Venturelli, H. Dumortier, K.T. Al-Jamal, M.
Prato, K. Kostarelos, A. Bianco, Translocation mechanisms of chemically functionalised carbon
nanotubes across plasma membranes, Biomaterials. 33 (2012) 3334–3343.
https://doi.org/10.1016/j.biomaterials.2012.01.024.
[90] K.T. Al-Jamal, H. Nerl, K.H. Müller, H. Ali-Boucetta, S. Li, P.D. Haynes, J.R. Jinschek, M. Prato,
A. Bianco, K. Kostarelos, A.E. Porter, Cellular uptake mechanisms of functionalised multi-walled
carbon nanotubes by 3D electron tomography imaging, Nanoscale. 3 (2011) 2627–2635.
https://doi.org/10.1039/C1NR10080G.
[91] Q.-S. Mi, D. Ly, S.-E. Lamhamedi-Cherradi, K.V. Salojin, L. Zhou, M. Grattan, C. Meagher, P.
Zucker, Y.H. Chen, J. Nagle, D. Taub, T.L. Delovitch, Blockade of tumor necrosis factor-related
apoptosis-inducing ligand exacerbates type 1 diabetes in NOD mice, Diabetes. 52 (2003) 1967–
1975. https://doi.org/10.2337/diabetes.52.8.1967.
[92] B. Kang, S. Chang, Y. Dai, D. Yu, D. Chen, Cell response to carbon nanotubes: size-dependent
intracellular uptake mechanism and subcellular fate, Small. 6 (2010) 2362–2366.
https://doi.org/10.1002/smll.201001260.
100
Références bibliographiques
[95] An Introduction to Molecular Orbitals, Oxford University Press, Oxford, New York, 1993.
[97] T. Clark, M.G. Hicks, Models of necessity, Beilstein J Org Chem. 16 (2020) 1649–1661.
https://doi.org/10.3762/bjoc.16.137.
[98] J. Kohanoff, Electronic structure calculations for solids and molecules: theory and computational
methods, Cambridge university press, 2006.
[99] D. Bagayoko, Understanding density functional theory (DFT) and completing it in practice, AIP
Advances. 4 (2014) 127104.
[101] N.L. Allinger, X. Zhou, J. Bergsma, Molecular mechanics parameters, Journal of Molecular
Structure: THEOCHEM. 312 (1994) 69–83.
[102] N.L. Allinger, Y.H. Yuh, J.H. Lii, Molecular mechanics. The MM3 force field for hydrocarbons.
1, Journal of the American Chemical Society. 111 (1989) 8551–8566.
[103] S.C. Hoops, K.W. Anderson, K.M. Merz Jr, Force field design for metalloproteins, Journal of
the American Chemical Society. 113 (1991) 8262–8270.
[104] J. Wang, R.M. Wolf, J.W. Caldwell, P.A. Kollman, D.A. Case, Development and testing of a
general amber force field, Journal of Computational Chemistry. 25 (2004) 1157–1174.
[107] A.J. Hopfinger, R.A. Pearlstein, Molecular mechanics force-field parameterization procedures,
Journal of Computational Chemistry. 5 (1984) 486–499. https://doi.org/10.1002/jcc.540050510.
[108] G. Velraj, K. Janaki, A.M. Musthafa, R. Palanivel, Spectroscopic and porosimetry studies to
estimate the firing temperature of some archaeological pottery shreds from India, Applied Clay
Science. 43 (2009) 303–307. https://doi.org/10.1016/j.clay.2008.09.005.
[109] W.L. Jorgensen, P. Schyman, Treatment of Halogen Bonding in the OPLS-AA Force Field:
Application to Potent Anti-HIV Agents, J. Chem. Theory Comput. 8 (2012) 3895–3901.
https://doi.org/10.1021/ct300180w.
[110] A.K. Rappe, C.J. Casewit, K.S. Colwell, W.A. Goddard, W.M. Skiff, UFF, a full periodic table
force field for molecular mechanics and molecular dynamics simulations, J. Am. Chem. Soc. 114
(1992) 10024–10035. https://doi.org/10.1021/ja00051a040.
101
Références bibliographiques
[111] A. Pérez, I. Marchán, D. Svozil, J. Sponer, T.E. Cheatham, C.A. Laughton, M. Orozco,
Refinement of the AMBER Force Field for Nucleic Acids: Improving the Description of α/γ
Conformers, Biophysical Journal. 92 (2007) 3817–3829.
https://doi.org/10.1529/biophysj.106.097782.
[112] Adcock, S.A., McCammon, J.A. Molecular dynamics: survey of methods for simulating
the activity of proteins. Chemical Reviews, 106, 1589‐1615. 2006.
[113] Ungerer, P., et al. Molecular simulation of the thermophysical properties of fluids: from
understanding toward quantitative predictions. Journal of Molecular Liquids, 134 (1-3), 71- 89.
2007.
[114] Ungerer, P., Lachet, V., Tavitian, B. Applications of molecular simulation in oil and gas
production and processing. Oil & Gas Science and Technology, 63 (3), 387–403. 2006. Verlet L.
Phys. Rew., 159,98 (1967).
[116] P.T. Cummings, J.B. Gilmer, Open-source molecular modeling software in chemical
engineering, Current Opinion in Chemical Engineering. 23 (2019) 99–105.
https://doi.org/10.1016/j.coche.2019.03.008.
[117] R.M. Hathout, A.A. Metwally, Towards better modelling of drug-loading in solid lipid
nanoparticles: Molecular dynamics, docking experiments and Gaussian Processes machine
learning, European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics. 108 (2016) 262–268.
https://doi.org/10.1016/j.ejpb.2016.07.019.
[118] S. Pirhadi, J. Sunseri, D.R. Koes, Open source molecular modeling, Journal of Molecular
Graphics and Modelling. 69 (2016) 127–143. https://doi.org/10.1016/j.jmgm.2016.07.008.
[120] E.C. Brace, A.S. Engelberth, Enhancing silymarin fractionation using the conductor-like
screening model for real solvents, Journal of Chromatography A. 1487 (2017) 187–193.
https://doi.org/10.1016/j.chroma.2017.01.058.
[121] A. Klamt, F. Eckert, Prediction of vapor liquid equilibria using COSMOtherm, Fluid Phase
Equilibria. 217 (2004) 53–57. https://doi.org/10.1016/j.fluid.2003.08.018.
[122] M. Turchi, G. Lian, Q. Cai, I. Wood, J. Rabone, M. Noro, Multi-scale modelling of solute
partition equilibria of micelle-water and microemulsion-water systems using molecular dynamics
and COSMOtherm, in: A. Espuña, M. Graells, L. Puigjaner (Eds.), Computer Aided Chemical
Engineering, Elsevier, 2017: pp. 2773–2778. https://doi.org/10.1016/B978-0-444-63965-3.50464-
5.
[123] Z.-W. Wang, B. Li, Q.-B. Lin, C.-Y. Hu, Two-phase molecular dynamics model to simulate the
migration of additives from polypropylene material to food, International Journal of Heat and Mass
Transfer. 122 (2018) 694–706. https://doi.org/10.1016/j.ijheatmasstransfer.2018.02.004.
102
Références bibliographiques
[125] S. Benabid, A.F.M. Streit, Y. Benguerba, G.L. Dotto, A. Erto, B. Ernst, Molecular modeling of
anionic and cationic dyes adsorption on sludge derived activated carbon, Journal of Molecular
Liquids. 289 (2019) 111119. https://doi.org/10.1016/j.molliq.2019.111119.
[126] Z. Lei, D. Yang, Y. Zhang, P. Cui, Constructions of coal and char molecular models based on
the molecular simulation technology, Journal of Fuel Chemistry and Technology. 45 (2017) 769–
779. https://doi.org/10.1016/S1872-5813(17)30038-5.
[127] Cadelis, G., Kaddah, S., Bhakkan, B., Quellery, M., Deloumeaux, J., 2013. Épidémiologie et
incidence du cancer bronchique primitif dans une région à faible consommation tabagique : la
Guadeloupe. Données 2008–2009 du registre des cancers. Revue des Maladies Respiratoires 30,
537–548. https://doi.org/10.1016/j.rmr.2013.01.010
[128] Legodec, J., Bérard, H., 2013. L’analyse de la qualfité de vie en oncologie thoracique. Revue des
Maladies Respiratoires Actualités, Cours du Groupe d’Oncologie thoracique de Langue Française
GOLF 2013 5, e1–e4. https://doi.org/10.1016/S1877-1203(13)70494-4
[129] Marchand, A., 2018. Reconnaissance et occultation des cancers professionnels : le droit à
réparation à l’épreuve de la pratique (Seine-Saint-Denis) (phdthesis). Université Evry-Val
d’Essonne/Université Paris Saclay.
[130] Zriyra, N., 2013. Profil épidémiologique des bactéries responsables des infections respiratoires
basses à l’exception des mycobactéries diagnostiquées au CHU de Rabat. (Thesis).
[131] D. Waterhouse, J. Lam, K.A. Betts, L. Yin, S. Gao, Y. Yuan, J. Hartman, S. Rao, S. Lubinga,
D. Stenehjem, Real-world outcomes of immunotherapy–based regimens in first-line advanced non-
small cell lung cancer, Lung Cancer. 156 (2021) 41–49.
https://doi.org/10.1016/j.lungcan.2021.04.007.
[132] D.F. Heigener, M. Reck, Crizotinib, in: U.M. Martens (Ed.), Small Molecules in Oncology,
Springer, Berlin, Heidelberg, 2014: pp. 197–205. https://doi.org/10.1007/978-3-642-54490-3_11.
[133] H. Sun, P. Chen, D. Li, Y. Li, T. Hou, Directly Binding Rather than Induced-Fit Dominated
Binding Affinity Difference in (S)- and (R)-Crizotinib Bound MTH1, J. Chem. Theory Comput. 12
(2016) 851–860. https://doi.org/10.1021/acs.jctc.5b00973.
[134] J.G. Marques, V.M. Gaspar, D. Markl, E.C. Costa, E. Gallardo, I.J. Correia, Co-delivery of
Sildenafil (Viagra®) and Crizotinib for Synergistic and Improved Anti-tumoral Therapy, Pharm
Res. 31 (2014) 2516–2528. https://doi.org/10.1007/s11095-014-1347-x.
[135] C. Zhou, S.-W. Kim, T. Reungwetwattana, J. Zhou, Y. Zhang, J. He, J.-J. Yang, Y. Cheng, S.-
H. Lee, L. Bu, T. Xu, L. Yang, C. Wang, T. Liu, P.N. Morcos, Y. Lu, L. Zhang, Alectinib versus
crizotinib in untreated Asian patients with anaplastic lymphoma kinase-positive non-small-cell lung
cancer (ALESIA): a randomised phase 3 study, The Lancet Respiratory Medicine. 7 (2019) 437–
446. https://doi.org/10.1016/S2213-2600(19)30053-0.
[136] Z.-M. Jiang, S.-P. Dai, Y.-Q. Xu, T. Li, J. Xie, C. Li, Z.-H. Zhang, Crizotinib-loaded polymeric
nanoparticles in lung cancer chemotherapy, Med Oncol. 32 (2015) 193.
https://doi.org/10.1007/s12032-015-0636-5.
[137] S. Hossen, M.K. Hossain, M.K. Basher, M.N.H. Mia, M.T. Rahman, M.J. Uddin, Smart
nanocarrier-based drug delivery systems for cancer therapy and toxicity studies: A review, Journal
of Advanced Research. 15 (2019) 1–18. https://doi.org/10.1016/j.jare.2018.06.005.
103
Références bibliographiques
[138] M. Kaur, P. Singh, K. Singh, U.S. Gaharwar, R. Meena, M. Kumar, F. Nakagawa, S. Wu, M.
Suzuki, H. Nakamura, A. Kumar, Boron nitride (10BN) a prospective material for treatment of
cancer by boron neutron capture therapy (BNCT), Materials Letters. 259 (2020) 126832.
https://doi.org/10.1016/j.matlet.2019.126832.
[139] A. Mortazavifar, H. Raissi, A. Akbari, DFT and MD investigations on the functionalized boron
nitride nanotube as an effective drug delivery carrier for Carmustine anticancer drug, Journal of
Molecular Liquids. 276 (2019) 577–587. https://doi.org/10.1016/j.molliq.2018.12.028.
[141] R.J. Chen, S. Bangsaruntip, K.A. Drouvalakis, N.W.S. Kam, M. Shim, Y. Li, W. Kim, P.J. Utz,
H. Dai, Noncovalent functionalization of carbon nanotubes for highly specific electronic biosensors,
PNAS. 100 (2003) 4984–4989. https://doi.org/10.1073/pnas.0837064100.
[142] J. Li, J.-J. Zhu, Quantum dots for fluorescent biosensing and bio-imaging applications, Analyst.
138 (2013) 2506–2515. https://doi.org/10.1039/C3AN36705C.
[143] R. Hong, N.O. Fischer, A. Verma, C.M. Goodman, T. Emrick, V.M. Rotello, Control of Protein
Structure and Function through Surface Recognition by Tailored Nanoparticle Scaffolds, J. Am.
Chem. Soc. 126 (2004) 739–743. https://doi.org/10.1021/ja037470o.
[144] R.J. Chen, Y. Zhang, D. Wang, H. Dai, Noncovalent Sidewall Functionalization of Single-
Walled Carbon Nanotubes for Protein Immobilization, J. Am. Chem. Soc. 123 (2001) 3838–3839.
https://doi.org/10.1021/ja010172b.
[145] Y. Cui, Q. Wei, H. Park, C.M. Lieber, Nanowire Nanosensors for Highly Sensitive and Selective
Detection of Biological and Chemical Species, Science. 293 (2001) 1289–1292.
https://doi.org/10.1126/science.1062711.
[146] A. Singh, G. Sinsinbar, M. Choudhary, V. Kumar, R. Pasricha, H.N. Verma, S.P. Singh, K.
Arora, Graphene oxide-chitosan nanocomposite based electrochemical DNA biosensor for
detection of typhoid, Sensors and Actuators B: Chemical. 185 (2013) 675–684.
https://doi.org/10.1016/j.snb.2013.05.014.
[147] J. Cao, T. Sun, K.T.V. Grattan, Gold nanorod-based localized surface plasmon resonance
biosensors: A review, Sensors and Actuators B: Chemical. 195 (2014) 332–351.
https://doi.org/10.1016/j.snb.2014.01.056.
[148] J.K. Patra, G. Das, L.F. Fraceto, E.V.R. Campos, M. del P. Rodriguez-Torres, L.S. Acosta-
Torres, L.A. Diaz-Torres, R. Grillo, M.K. Swamy, S. Sharma, S. Habtemariam, H.-S. Shin, Nano
based drug delivery systems: recent developments and future prospects, J Nanobiotechnology. 16
(2018) 71. https://doi.org/10.1186/s12951-018-0392-8.
[149] V.K. Kayastha, S. Wu, J. Moscatello, Y.K. Yap, Synthesis of Vertically Aligned Single- and
Double-Walled Carbon Nanotubes without Etching Agents, J. Phys. Chem. C. 111 (2007) 10158–
10161. https://doi.org/10.1021/jp073551l.
[150] Jiang, Z.-M.; Dai, S.-P.; Xu, Y.-Q.; Li, T.; Xie, J.; Li, C.; Zhang, Z.-H. Crizotinib-
Loaded Polymeric Nanoparticles in Lung Cancer Chemotherapy. Med Oncol 2015, 32 (7),
193. https://doi.org/10.1007/s12032-015-0636-5.)
104
Références bibliographiques
[151] Z. Tu, Z. Ou-Yang, Single-walled and multiwalled carbon nanotubes viewed as elastic tubes
with the effective Young’s moduli dependent on layer number, Phys. Rev. B. 65 (2002) 233407.
https://doi.org/10.1103/PhysRevB.65.233407.
[152] S.K. Prajapati, A. Malaiya, P. Kesharwani, D. Soni, A. Jain, Biomedical applications and
toxicities of carbon nanotubes, Drug and Chemical Toxicology. 0 (2020) 1–16.
https://doi.org/10.1080/01480545.2019.1709492.
[153] S.M. Sharker, <p>Hexagonal Boron Nitrides (White Graphene): A Promising Method for
Cancer Drug Delivery</p>, IJN. 14 (2019) 9983–9993. https://doi.org/10.2147/IJN.S205095.
[154] M. Sheikhi, S. Shahab, R. Alnajjar, M. Ahmadianarog, Adsorption Properties of the New Anti-
Cancer Drug Alectinib on CNT(6,6-6) Nanotube: Geometry Optimization, Molecular Structure,
Spectroscopic (NMR, UV/Vis, Excited State), FMO, MEP and HOMO–LUMO Investigations, J
Clust Sci. 30 (2019) 83–96. https://doi.org/10.1007/s10876-018-1460-9.
[155] K.N.H. Nudelman, B.C. McDonald, D.K. Lahiri, A.J. Saykin, Biological Hallmarks of Cancer
in Alzheimer’s Disease, Mol Neurobiol. 56 (2019) 7173–7187. https://doi.org/10.1007/s12035-019-
1591-5.
[156] H. Xu, Q. Wang, G. Fan, X. Chu, Theoretical study of boron nitride nanotubes as drug delivery
vehicles of some anticancer drugs, Theor Chem Acc. 137 (2018) 104.
https://doi.org/10.1007/s00214-018-2284-2.
[157] S.U.D. Shamim, M.H. Miah, M.R. Hossain, M.M. Hasan, M.K. Hossain, M.A. Hossain, F.
Ahmed, Theoretical investigation of emodin conjugated doped B12N12 nanocage by means of
DFT, QTAIM and PCM analysis, Physica E: Low-Dimensional Systems and Nanostructures. 136
(2022) 115027. https://doi.org/10.1016/j.physe.2021.115027.
[158] H. Xu, L. Li, G. Fan, X. Chu, DFT study of nanotubes as the drug delivery vehicles of Efavirenz,
Computational and Theoretical Chemistry. 1131 (2018) 57–68.
https://doi.org/10.1016/j.comptc.2018.03.032.
[159] V.A. Basiuk, L.V. Henao-Holguín, Effects of Orbital Cutoff in DMol3 DFT Calculations: A
Case Study of meso-Tetraphenylporphine–C60 Complex, Journal of Computational and Theoretical
Nanoscience. 10 (2013) 1266–1272. https://doi.org/10.1166/jctn.2013.2840.
[161] J.M. Smith, S.P. Jones, L.D. White, Rapid Communication, Gastroenterology. 68 (1975) 1339–
1343. https://doi.org/10.1016/S0016-5085(75)80263-0.
[162] A.-R. Allouche, Gabedit—A graphical user interface for computational chemistry softwares,
Journal of Computational Chemistry. 32 (2011) 174–182. https://doi.org/10.1002/jcc.21600.
[163] Y. Luo, S. Yin, W. Lai, Y. Wang, Effects of global orbital cutoff value and numerical basis set
size on accuracies of theoretical atomization energies, Theor Chem Acc. 133 (2014) 1580.
https://doi.org/10.1007/s00214-014-1580-8.
[164] S.E.E. Warrag, A.S. Darwish, F.O.S. Abuhatab, I.A. Adeyemi, M.C. Kroon, I.M. AlNashef,
Combined Extractive Dearomatization, Desulfurization, and Denitrogenation of Oil Fuels Using
Deep Eutectic Solvents: A Parametric Study, Ind. Eng. Chem. Res. 59 (2020) 11723–11733.
https://doi.org/10.1021/acs.iecr.0c01360.
105
Références bibliographiques
[165] F.A. Hatab, A.S. Darwish, T. Lemaoui, S.E.E. Warrag, Y. Benguerba, M.C. Kroon, I.M.
AlNashef, Extraction of Thiophene, Pyridine, and Toluene from n-Decane as a Diesel Model Using
Betaine-Based Natural Deep Eutectic Solvents, J. Chem. Eng. Data. 65 (2020) 5443–5457.
https://doi.org/10.1021/acs.jced.0c00579.
[166] T. Lemaoui, Y. Benguerba, A.S. Darwish, F.A. Hatab, S.E.E. Warrag, M.C. Kroon, I.M.
Alnashef, Simultaneous dearomatization, desulfurization, and denitrogenation of diesel fuels using
acidic deep eutectic solvents as extractive agents: A parametric study, Separation and Purification
Technology. 256 (2021) 117861. https://doi.org/10.1016/j.seppur.2020.117861.
[167] R.G. Pearson, The electronic chemical potential and chemical hardness, Journal of Molecular
Structure: THEOCHEM. 255 (1992) 261–270. https://doi.org/10.1016/0166-1280(92)85014-C.
[168] Z. Demircioğlu, Ç.A. Kaştaş, O. Büyükgüngör, Theoretical analysis (NBO, NPA, Mulliken
Population Method) and molecular orbital studies (hardness, chemical potential, electrophilicity and
Fukui function analysis) of (E)-2-((4-hydroxy-2-methylphenylimino)methyl)-3-methoxyphenol,
Journal of Molecular Structure. 1091 (2015) 183–195.
https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2015.02.076.
[169] N.R. Sheela, S. Muthu, S. Sampathkrishnan, Molecular orbital studies (hardness, chemical
potential and electrophilicity), vibrational investigation and theoretical NBO analysis of 4-4′-(1H-
1,2,4-triazol-1-yl methylene) dibenzonitrile based on abinitio and DFT methods, Spectrochimica
Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy. 120 (2014) 237–251.
https://doi.org/10.1016/j.saa.2013.10.007.
[170] S. Alareeqi, D. Bahamon, R.P. Nogueira, L.F. Vega, Understanding the relationship between
the structural properties of three corrosion inhibitors and their surface protectiveness ability in
different environments, Applied Surface Science. 542 (2021) 148600.
https://doi.org/10.1016/j.apsusc.2020.148600.
[171] A. Klamt, G. Schüürmann, COSMO: a new approach to dielectric screening in solvents with
explicit expressions for the screening energy and its gradient, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2. (1993)
799–805. https://doi.org/10.1039/P29930000799.
[172] T. Lemaoui, F. Abu Hatab, A.S. Darwish, A. Attoui, N.E.H. Hammoudi, G. Almustafa, M.
Benaicha, Y. Benguerba, I.M. Alnashef, Molecular-Based Guide to Predict the pH of Eutectic
Solvents: Promoting an Efficient Design Approach for New Green Solvents, ACS Sustainable
Chem. Eng. 9 (2021) 5783–5808. https://doi.org/10.1021/acssuschemeng.0c07367.
[173] T. Lemaoui, A.S. Darwish, N.E.H. Hammoudi, F. Abu Hatab, A. Attoui, I.M. Alnashef, Y.
Benguerba, Prediction of Electrical Conductivity of Deep Eutectic Solvents Using COSMO-RS
Sigma Profiles as Molecular Descriptors: A Quantitative Structure–Property Relationship Study,
Ind. Eng. Chem. Res. 59 (2020) 13343–13354. https://doi.org/10.1021/acs.iecr.0c02542.
[174] T. Lemaoui, A.S. Darwish, A. Attoui, F.A. Hatab, N.E.H. Hammoudi, Y. Benguerba, L.F. Vega,
I.M. Alnashef, Predicting the density and viscosity of hydrophobic eutectic solvents: towards the
development of sustainable solvents, Green Chem. 22 (2020) 8511–8530.
https://doi.org/10.1039/D0GC03077E.
[175] T. Lemaoui, N.E.H. Hammoudi, I.M. Alnashef, M. Balsamo, A. Erto, B. Ernst, Y. Benguerba,
Quantitative structure properties relationship for deep eutectic solvents using Sσ-profile as
molecular descriptors, Journal of Molecular Liquids. 309 (2020) 113165.
https://doi.org/10.1016/j.molliq.2020.113165.
106
Références bibliographiques
[176] K.A. Kurnia, F. Lima, A.F.M. Cláudio, J.A.P. Coutinho, M.G. Freire, Hydrogen-bond acidity
of ionic liquids: an extended scale, Phys. Chem. Chem. Phys. 17 (2015) 18980–18990.
https://doi.org/10.1039/C5CP03094C.
[177] S.J. Grabowski, J.M. Ugalde, Bond Paths Show Preferable Interactions: Ab Initio and QTAIM
Studies on the X−H···π Hydrogen Bond, J. Phys. Chem. A. 114 (2010) 7223–7229.
https://doi.org/10.1021/jp103047p.
[178] I. Rozas, I. Alkorta, J. Elguero, Behavior of Ylides Containing N, O, and C Atoms as Hydrogen
Bond Acceptors, J. Am. Chem. Soc. 122 (2000) 11154–11161. https://doi.org/10.1021/ja0017864.
[180] G. te Velde, F.M. Bickelhaupt, E.J. Baerends, C. Fonseca Guerra, S.J.A. van Gisbergen, J.G.
Snijders, T. Ziegler, Chemistry with ADF, Journal of Computational Chemistry. 22 (2001) 931–
967. https://doi.org/10.1002/jcc.1056.
[182] M. Khodam Hazrati, N. L. Hadipour, A DFT study on the functionalization of C60 fullerene
with 1,2-benzoquinone, Computational and Theoretical Chemistry. 1098 (2016) 63–69.
https://doi.org/10.1016/j.comptc.2016.11.007.
[183] A. Streitwieser, Molecular Orbital Theory for Organic Chemists, in: Pioneers of Quantum
Chemistry, American Chemical Society, 2013: pp. 275–300. https://doi.org/10.1021/bk-2013-
1122.ch009.
[185] J. F. Khoury, J. C. Vitale, T. L. Larson, G. Ao, Boron nitride nanotubes enhance mechanical
properties of fibers from nanotube/polyvinyl alcohol dispersions, Nanoscale Advances. (2021).
https://doi.org/10.1039/D1NA00677K.
[186] A. Rubio, J.L. Corkill, M.L. Cohen, Theory of graphitic boron nitride nanotubes, Phys. Rev. B.
49 (1994) 5081–5084. https://doi.org/10.1103/PhysRevB.49.5081.
[188] C.-W. Chen, M.-H. Lee, S.J. Clark, Band gap modification of single-walled carbon nanotube
and boron nitride nanotube under a transverse electric field, Nanotechnology. 15 (2004) 1837–1843.
https://doi.org/10.1088/0957-4484/15/12/025.
[189] O.E. Babiker, M. Shuhaimi, M.I.A. Mutalib, Molecular Simulation for Piperazinium Based ILs:
Effects of Alkyl Chain, Concentration and Anions on Henry’s Constants, Applied Mechanics and
Materials. 625 (2014) 448–453. https://doi.org/10.4028/www.scientific.net/AMM.625.448.
107
Références bibliographiques
[192] P. Jayasudha, R. Manivannan, S. Ciattini, L. Chelazzi, K.P. Elango, Selective sensing of cyanide
in aqueous solution by quinone-indole ensembles – quantitative effect of substituents on the HBD
property of the receptor moiety, Sensors and Actuators B: Chemical. 242 (2017) 736–745.
https://doi.org/10.1016/j.snb.2016.11.117.
[194] S.E.E. Warrag, A.S. Darwish, I.A. Adeyemi, M.K. Hadj-Kali, M.C. Kroon, I.M. AlNashef,
Extraction of pyridine from n-alkane mixtures using methyltriphenylphosphonium bromide-based
deep eutectic solvents as extractive denitrogenation agents, Fluid Phase Equilibria. 517 (2020)
112622. https://doi.org/10.1016/j.fluid.2020.112622.
108
Annexes
Annexes
A-1
Tableau A.1. Les écarts, la liaison hydrogène, van der Waals et les énergies moyennes totales en kcal/mol des
configurations les plus stables dans les complexes BNNT et CNT.
Energie
d’interaction Misfit H-Bond VdW Total mean
(kcal/mol)
Complex B
B1 4.96511 -1.04885 -46.20957 -42.29331
B2 6.43456 -2.64330 -56.22420 -52.43294
B3 6.24787 -1.74375 -53.06803 -48.56391
B4 6.76943 -3.38213 -54.85999 -51.47269
Complex C
C1 8.22412 -0.52635 -40.83276 -33.13499
C2 10.18489 -1.81566 -48.00008 -39.63085
C3 10.09580 -0.59334 -48.81073 -39.30827
C4 11.01578 -1.07416 -51.06660 -41.12498
110
Annexes
A-2
Tableau A.2. Numérotation des atomes qui composent les complexes de nanotube de carbone avec le Crizotinib
obtenus par analyse AIM.
N° Atome N° Atome
1 C 83 C
2 C 84 C
3 C 85 H
4 C 86 H
5 C 87 H
6 C 88 H
7 C 89 H
8 C 90 H
9 C 91 H
10 C 92 H
11 C 93 H
12 C 94 H
13 C 95 H
14 C 96 H
15 C 97 H
16 C 98 H
17 C 99 H
18 C 100 H
19 C 101 H
20 C 102 H
21 C 103 H
22 C 104 H
23 C 105 H
24 C 106 H
25 C 107 H
26 C 108 H
27 C 109 H
28 C 110 H
29 C 111 H
30 C 112 H
31 C 113 Cl
32 C 114 Cl
33 C 115 F
34 C 116 O
35 C 117 N
36 C 118 N
37 C 119 N
38 C 120 N
39 C 121 N
40 C 122 C
41 C 123 C
42 C 124 C
43 C 125 C
44 C 126 C
45 C 127 C
46 C 128 C
47 C 129 C
48 C 130 C
49 C 131 C
50 C 132 C
51 C 133 C
52 C 134 C
53 C 135 C
54 C 136 C
55 C 137 C
56 C 138 C
57 C 139 C
58 C 140 C
59 C 141 C
60 C 142 C
61 C 143 H
62 C 144 H
63 C 145 H
64 C 146 H
65 C 147 H
66 C 148 H
111
Annexes
67 C 149 H
68 C 150 H
69 C 151 H
70 C 152 H
71 C 153 H
72 C 154 H
73 C 155 H
74 C 156 H
75 C 157 H
76 C 158 H
77 C 159 H
78 C 160 H
79 C 161 H
80 C 162 H
81 C 163 H
82 C 164 H
112
Annexes
A-3
Tableau A.1. Le point critique de liaison (BCP) pour les complexes CNTs/CZT
Atome1 Atome2
BCP
CNTs CZT
C1
186 45 153
195 70 156
225 19 151
230 8 148
244 9 145
251 18 151
253 23 146
256 56 119
293 5 148
294 22 146
297 81 155
342 57 154
343 85 159
353 110 114
372 108 114
C2
178 99 144
190 98 130
209 99 129
242 101 120
254 104 121
279 107 121
284 93 114
286 21 160
279 107 121
334 90 114
339 109 113
346 24 160
350 88 141
379 112 140
425 91 161
C3
209 10 148
232 11 148
238 39 152
254 9 118
283 106 119
301 27 146
314 109 129
318 3 143
322 25 146
333 112 153
354 111 127
C4
233 36 113
286 33 131
292 5 159
306 34 133
326 7 129
334 58 130
348 35 128
365 31 145
113
Annexes
A-4
====================================
BADER ATOMIC PROPERTIES
====================================
Atom Density Net charge Laplacian
--------------------------------------------------------
1 6 6.0110 -0.0110 -7.8199E-04
2 6 6.0144 -0.0144 3.0639E-03
3 6 6.0165 -0.0165 -2.6283E-03
4 6 5.9947 0.0053 2.0170E-03
5 6 6.0096 -0.0096 -3.6664E-03
6 6 6.0013 -0.0013 -1.7234E-03
7 6 5.9970 0.0030 -5.7843E-03
8 6 6.0181 -0.0181 -2.1172E-03
9 6 5.9967 0.0033 -2.2991E-03
10 6 6.0040 -0.0040 1.3703E-03
11 6 6.0061 -0.0061 2.4871E-03
12 6 5.9992 0.0008 -9.5214E-03
13 6 6.0067 -0.0067 -3.9029E-03
14 6 5.9951 0.0049 -4.9753E-03
15 6 5.9976 0.0024 1.4713E-04
16 6 6.0103 -0.0103 -2.5946E-04
17 6 6.0019 -0.0019 -3.2419E-03
18 6 6.0202 -0.0202 -2.1414E-03
19 6 6.0115 -0.0115 -9.4904E-04
20 6 5.9998 0.0002 -1.2039E-03
21 6 6.0105 -0.0105 3.3866E-04
22 6 6.0065 -0.0065 -1.6167E-03
23 6 5.9909 0.0091 5.2041E-03
24 6 6.0127 -0.0127 -9.2268E-04
25 6 5.9952 0.0048 5.9661E-05
26 6 6.0139 -0.0139 -5.5144E-04
27 6 5.9931 0.0069 -1.5188E-05
28 6 6.0021 -0.0021 -9.6263E-03
29 6 5.9819 0.0181 9.2235E-03
30 6 5.9950 0.0050 6.3009E-03
31 6 5.9882 0.0118 -2.1790E-03
32 6 5.9917 0.0083 9.1109E-04
33 6 5.9908 0.0092 5.4177E-03
34 6 6.0049 -0.0049 -6.6629E-03
35 6 5.9935 0.0065 -3.6289E-03
36 6 5.9923 0.0077 5.3418E-03
37 6 5.9931 0.0069 -1.2712E-03
38 6 5.9963 0.0037 -1.2120E-03
39 6 6.0069 -0.0069 3.9440E-03
40 6 5.9840 0.0160 -1.3671E-03
41 6 6.0089 -0.0089 2.9638E-03
42 6 6.0011 -0.0011 9.2774E-03
43 6 6.0108 -0.0108 3.3976E-03
44 6 6.0002 -0.0002 2.7284E-03
45 6 6.0058 -0.0058 -2.1212E-03
46 6 6.0133 -0.0133 -7.1215E-03
47 6 6.0024 -0.0024 -3.8242E-03
48 6 5.9944 0.0056 5.2682E-03
49 6 6.0002 -0.0002 -3.0126E-03
50 6 5.9826 0.0174 5.2065E-03
51 6 5.9930 0.0070 4.7434E-03
52 6 5.9929 0.0071 5.9726E-03
53 6 5.9972 0.0028 2.7530E-03
54 6 5.9862 0.0138 -5.0634E-03
55 6 5.9873 0.0127 -1.5961E-03
56 6 5.9853 0.0147 2.3025E-03
57 6 6.0033 -0.0033 -3.1623E-03
58 6 5.9933 0.0067 -1.1060E-03
59 6 5.9998 0.0002 -2.7036E-03
60 6 6.0205 -0.0205 -2.9903E-03
61 6 5.9802 0.0198 4.6360E-03
62 6 6.0140 -0.0140 -2.3467E-03
63 6 6.0015 -0.0015 8.8176E-04
64 6 6.0009 -0.0009 -8.2529E-04
65 6 6.0018 -0.0018 6.5423E-04
66 6 6.0020 -0.0020 -7.4918E-05
67 6 5.9970 0.0030 -3.3503E-03
68 6 6.0051 -0.0051 -1.1012E-03
114
Annexes
115
Annexes
116
Annexes
A-5
=============================================
BADER ATOMIC PROPERTIES
=============================================
117
Annexes
118
Annexes
119
Annexes
A-6
===================================
BADER ATOMIC PROPERTIES
===================================
Atom Density Net charge Laplacian
--------------------------------------------------------
1 6 6.0148 -0.0148 -4.4542E-04
2 6 6.0112 -0.0112 4.0615E-03
3 6 6.0202 -0.0202 -1.5956E-03
4 6 5.9944 0.0056 3.9286E-03
5 6 6.0028 -0.0028 -3.7438E-03
6 6 5.9920 0.0080 -1.5022E-03
7 6 5.9949 0.0051 -8.0112E-03
8 6 6.0063 -0.0063 1.0785E-03
9 6 5.9879 0.0121 -3.3994E-03
10 6 6.0152 -0.0152 1.5699E-03
11 6 6.0144 -0.0144 5.1285E-04
12 6 5.9998 0.0002 -7.5864E-03
13 6 6.0081 -0.0081 -3.2465E-03
14 6 5.9959 0.0041 -6.0800E-03
15 6 6.0019 -0.0019 9.3936E-04
16 6 6.0165 -0.0165 -2.2744E-03
17 6 6.0031 -0.0031 -3.0256E-03
18 6 6.0120 -0.0120 -1.1179E-03
19 6 6.0021 -0.0021 1.3312E-03
20 6 5.9974 0.0026 -1.7027E-03
21 6 5.9961 0.0039 3.7615E-04
22 6 6.0087 -0.0087 -5.4066E-03
23 6 5.9907 0.0093 3.7555E-03
24 6 5.9969 0.0031 -2.7097E-03
25 6 5.9992 0.0008 1.2302E-03
26 6 6.0145 -0.0145 6.7753E-05
27 6 5.9909 0.0091 -1.8855E-03
28 6 6.0154 -0.0154 -7.6282E-03
29 6 5.9928 0.0072 8.6293E-03
30 6 5.9927 0.0073 6.5947E-03
31 6 5.9947 0.0053 -2.0788E-03
32 6 5.9965 0.0035 2.1514E-03
33 6 5.9881 0.0119 4.6952E-03
34 6 6.0028 -0.0028 -5.8759E-03
35 6 5.9967 0.0033 -3.4260E-03
36 6 5.9822 0.0178 1.3146E-03
37 6 5.9979 0.0021 -1.4220E-03
38 6 5.9967 0.0033 -1.2068E-03
39 6 6.0177 -0.0177 6.8065E-03
40 6 5.9973 0.0027 2.7633E-03
41 6 6.0031 -0.0031 4.2669E-03
42 6 5.9916 0.0084 8.7538E-03
43 6 5.9998 0.0002 -5.9654E-04
44 6 5.9970 0.0030 1.7251E-03
45 6 5.9969 0.0031 -3.2155E-03
46 6 6.0093 -0.0093 -6.8450E-03
47 6 5.9985 0.0015 -3.5233E-03
48 6 5.9961 0.0039 5.0688E-03
49 6 5.9995 0.0005 7.2543E-05
50 6 5.9905 0.0095 4.7753E-03
51 6 5.9910 0.0090 5.6425E-03
52 6 5.9892 0.0108 -2.7159E-03
53 6 6.0035 -0.0035 2.9913E-03
54 6 6.0144 -0.0144 2.1847E-03
55 6 5.9922 0.0078 -8.1293E-04
56 6 5.9998 0.0002 4.5749E-03
57 6 5.9969 0.0031 -8.2489E-03
58 6 5.9973 0.0027 -1.0040E-03
59 6 5.9978 0.0022 -2.8559E-03
60 6 6.0154 -0.0154 -1.8045E-03
61 6 5.9861 0.0139 4.5554E-03
62 6 6.0170 -0.0170 -2.0421E-03
63 6 6.0069 -0.0069 -7.5726E-04
64 6 6.0043 -0.0043 -9.2047E-04
65 6 6.0056 -0.0056 2.5272E-04
66 6 5.9942 0.0058 -3.9986E-04
67 6 5.9959 0.0041 -3.0005E-03
68 6 6.0115 -0.0115 -1.4736E-03
120
Annexes
121
Annexes
122
Annexes
A-7
===================================
BADER ATOMIC PROPERTIES
===================================
Atom Density Net charge Laplacian
Atom Density Net charge Laplacian
--------------------------------------------------------
1 6 6.0125 -0.0125 -5.9621E-04
2 6 6.0209 -0.0209 4.0053E-03
3 6 6.0136 -0.0136 -2.5635E-03
4 6 5.9833 0.0167 2.5138E-03
5 6 6.0210 -0.0210 -9.3056E-04
6 6 5.9967 0.0033 -4.5287E-03
7 6 5.9970 0.0030 -5.3814E-03
8 6 6.0134 -0.0134 -6.8330E-05
9 6 5.9957 0.0043 -3.0461E-03
10 6 6.0147 -0.0147 4.7859E-04
11 6 6.0105 -0.0105 1.1522E-03
12 6 5.9942 0.0058 -8.7114E-03
13 6 6.0184 -0.0184 -4.8932E-03
14 6 5.9928 0.0072 -3.2678E-03
15 6 5.9924 0.0076 1.0122E-03
16 6 6.0146 -0.0146 -1.0899E-03
17 6 5.9979 0.0021 -2.8189E-03
18 6 6.0170 -0.0170 -2.0163E-03
19 6 6.0067 -0.0067 2.0262E-04
20 6 5.9977 0.0023 -2.1024E-03
21 6 6.0089 -0.0089 2.7006E-04
22 6 6.0004 -0.0004 -7.6922E-04
23 6 5.9835 0.0165 4.6862E-03
24 6 6.0110 -0.0110 -7.4261E-04
25 6 5.9960 0.0040 -3.1907E-03
26 6 6.0121 -0.0121 -2.2629E-04
27 6 5.9941 0.0059 -2.5102E-04
28 6 6.0045 -0.0045 -9.0313E-03
29 6 5.9928 0.0072 8.8898E-03
30 6 5.9854 0.0146 2.0481E-03
31 6 5.9947 0.0053 -2.1071E-03
32 6 5.9874 0.0126 1.6198E-03
33 6 5.9864 0.0136 5.8939E-03
34 6 5.9929 0.0071 -5.2508E-03
35 6 5.9832 0.0168 -3.0092E-03
36 6 5.9913 0.0087 2.9917E-03
37 6 5.9898 0.0102 -3.0400E-03
38 6 5.9912 0.0088 -6.2785E-04
39 6 6.0071 -0.0071 5.7516E-03
40 6 5.9866 0.0134 -1.7141E-04
41 6 5.9948 0.0052 3.0454E-03
42 6 5.9904 0.0096 8.6300E-03
43 6 6.0028 -0.0028 2.6879E-03
44 6 5.9949 0.0051 1.7355E-03
45 6 5.9954 0.0046 -3.1919E-03
46 6 6.0058 -0.0058 -6.1944E-03
47 6 5.9959 0.0041 -3.3266E-03
48 6 5.9956 0.0044 4.4860E-03
49 6 5.9943 0.0057 -1.9102E-03
50 6 5.9899 0.0101 4.7612E-03
51 6 5.9902 0.0098 5.5514E-03
52 6 5.9922 0.0078 3.3312E-03
53 6 6.0038 -0.0038 2.2991E-03
54 6 5.9978 0.0022 -1.3340E-03
55 6 5.9926 0.0074 -1.0165E-03
56 6 6.0007 -0.0007 2.0302E-03
57 6 6.0019 -0.0019 -5.0568E-03
58 6 5.9803 0.0197 -1.2090E-03
59 6 6.0058 -0.0058 -2.4903E-03
60 6 6.0240 -0.0240 -1.9814E-03
61 6 5.9689 0.0311 5.2475E-03
62 6 6.0046 -0.0046 -2.5347E-03
63 6 6.0039 -0.0039 1.5197E-03
64 6 6.0036 -0.0036 -6.2176E-04
65 6 6.0040 -0.0040 6.0594E-04
66 6 5.9869 0.0131 -4.7363E-03
67 6 5.9952 0.0048 -3.3484E-03
123
Annexes
124
Annexes
125
Résumé:
Dans ce travail, des généralités sur les maladies pulmonaires chroniques, telles que l’asthme, les
maladies MPOC ou encore le cancer bronchique ont été développés. L’utilisation de nanoparticules,
notamment les nanotubes de carbone NTCs et BNNTs ont été étudiés et exploités comme
administrateurs vectoriels ciblés d’agents anticancéreux. Les méthodes de calculation DFT ont été
traités. Une étude sur les mécanismes d'adsorption et les interactions entre la molécule médicament
anticancéreuse Crizotinib (CZT) à la surface des nanotubes de carbone (NTCs) et de nitrure de bore
(BNNTs) a été réalisée dans le but de déterminer le nano-vecteur le plus adéquat pour l'administration
de ce médicament. Les investigations ont été menées à l'aide de la théorie de la densité fonctionnelle
(DFT) et du modèle de criblage de type conducteur pour les solvants réels (COSMO-RS). Les
descripteurs moléculaires quantiques (QMD) ont également été calculés pour expliquer le mécanisme
d'interaction médicament-support et l'énergie d'adsorption. En utilisant la méthode COSMO-RS, une
interaction plus forte est observée pour le CZT-NTCs par rapport au CZT-BNNTs. Une étude de
solvatation dans l'eau a également révélé que le complexe CZT-NTCs est plus soluble que le CZT-
BNNTs. Enfin, une analyse de la théorie quantique des atomes dans les molécules (QTAIM) a été
utilisée pour étudier la nature des interactions intermoléculaires. Sur la base des résultats obtenus, il a
été conclu que lors de l'administration du médicament CZT dans des milieux biologiques, les NTC sont
plus stables et meilleurs re-largueurs que les BNNTs.