UNIVERSITE DE LA MANOUBA

INSTITUT SUPERIEUR DE BIOTECHNOLOGIE SIDI THABET

LICENCE APPLIQUEE EN B IOLOGIE ANALYTIQUE EXPERIMENTALE

PARCOURS : BIOLOGIE ET CONTROLE QUALITE

Rapport d’activité pratique

INTERET DE L’EXAMEN ANATOMOPATHOLOGIQUE

Préparé par :

Farah ABIDI

Dr . Slim HAOUET Encadreur entreprise

Dr. Abir GMIDENE Encadreur ISBST

Année universitaire : 2021-2022

 Dédicaces

Avec l’expression de ma reconnaissance, je dédie ce modeste travail à ceux qui, quels que soient
les termes embrassés, je n’arriverais jamais à leur exprimer mon amour sincère.

Mes chers parents qui m’ont toujours poussé et motivé dans mes études .sans eux n’aurais
certainement pas fait d’études longues.

A l’homme, mon précieux offre de dieu, qui doit ma vie , ma réussite et tout mon respect : mon
cher père Chokri.

A la femme qui souffert sans laisser souffrir, qui n’a jamais dit mon âmes exigences et qui n’a
épargné aucun effort pour me rendre heureuse : mon adorable mère Fathia.

A mon frère, mon âme sœur et mon tout dans la vie qui n’a pas cessée de me conseiller,
encourager et soutenir tout au long de mes études. Que dieu lui protège et l’offre la chance et le
bonheur mon héro Cheher.

Merci pour leurs amours et leurs encouragements.

 REMERCIEMENT

Je voudrais remercier Dr. Selim HAOUET de m’avoir facilité le travail

Dans la réalisation de ce projet, pour son encadrement, sa vaillance

pour mon intégration dans le département, sa gentillesse, son apport

scientifiques et surtout pour m’avoir confié ce sujet.

Je voudrais remercier Dr Abir GMIDEN pour m’avoir accordé quelques

heures de son temps précieux, pour m’ orienter et me donner des conseils

qui m’ont illuminé dans mes choix méthodologiques.

Je remercie enfin toute l’équipe de service anapath pour leur

Soutien moral.

Mes remerciements vont également à tous les enseignants,

Et n’oublie jamais de remercier ma famille pour tous leur support et leur

soutien pour terminer mon chemin éducative malgré les moments de
faiblesse, de perturbation et surtout de stresse.

Enfin je remercie ceux qui me donner un coup de pousse pour avancer.

 SOMMAIRE

INTRODUCTION………………………………………………………………………..........................…..1

DONNEES BIBLIOGRAPHIQUES……………………………………………….……………………..…2
1. Historique…………………………………………………...……....2

2. Définition et objectifs…………………………………………….….2

3. Examen anatomopathologique de la biopsie………........................2

4. Examen anatomopathologique de la pièce opératoire ……….........2

5. Domaine d’investigation……………………………………………..2

OBJECTIFS………………………………………………………………………..……………………….……..3

MATERIEL ET METHODES………………………………………………………………….…………. 4
1. Population étudiée………………………………………………….4

2. Méthodes………………………………………...………………....4

2.1. Prise en charge des prélèvements ………………………..…...4

Résultat et discussion……………………………………………….……………………………………...8
2.. Exemples étudiés………………………………….……………8,9

CONCLUSION………………………………………………………………………………..……...………...10

REFFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES………………………………………..………………….…11
 Liste des figures :
FIGURE 1:FIXATION DES PIECES OPERATPOIRES AU FORMOL À 10%..............................................4
FIGURE 2:AUTOMATE DE DÉSHYDRATATION...................................................................................5
FIGURE 3: INCLUSION EN PARAFFINE...............................................................................................5
FIGURE 4: BLOCS DE PARAFFINE......................................................................................................6
FIGURE 5:RABOUTAGE ET COUPES AU MICROTOME.........................................................................6
FIGURE 6: COLORATION DES LAMES................................................................................................7
FIGURE 7: OBSERVATION MICROSCOPIQUE: D’UNE COUPE D'APPENDICE MONTRANT UN OXYURE
ADULTE EN COUPE TRANSVERSALE, AU GROSSISSEMENT X50. (6)..........................................9
FIGURE 8: OBSERVATION MICROSCOPIQUE: INFECTION PARASITAIRE SUIVIE UN AVORTEMENT
SPONTANÉE,..............................................................................................................................9
 Liste des tableaux :

TABLEAU 1:DEUX EXEMPLES ÉTUDIÉS APRÉS LE PRÉLÈVEMENT.....................................................8

 PRESENTATION DU LABORATOIRE Où LE STAGE A ETE

EFFECTUE

SERVICE D’ANATOMIE ET CYTOLOGIE PATHOLOGIEQUES

HOPITAL RABTA

CHEF SERVICE : Dr HAWET SELIM

Le service d’Anatomie et Cytologie Pathologiques assure à l’hôpital Rabta une activité

diagnostique et de recherche. L’activité diagnostique repose sur l’analyse des tissus et des
cellules prélevés lors d’actes chirurgicaux, endoscopiques ou autres. Le but de ce service est
également de fournir des éléments pronostiques pour les patients, d’évaluer les résultats des
traitements et de mieux comprendre les causes et mécanismes des maladies.

(a) NOMBRE D’EXAMENS RÉALISÉS/AN : 2020

(b) NOMBRE TOTAL : 11200

(c) TYPES D’EXAMENS

Examens extemporanés, examens cytologiques, examens immun histochimiques Plateau
technique
Salle de macroscopie, salle de technique, salle d’immune histochimie

(d) ACTIVITÉS PRINCIPALES

Histologie, cytologie, examen extemporané

(e) ACTIVITÉS SPÉCIALISÉES

Coloration spéciale, immun histochimie.

(f) STAFFS INTERSERVICES

Staffs quotidiens du service Staff hebdomadaire de chirurgie générale Staff mensuel de

neurochirurgie Staff mensuel de dermatologie.
 Introduction

Représenta l’activité six que ce travail dans le cadre des activités pratiques programmées durant
notre cursus universitaire à savoir :

Activité 1 : comment faire un CV (curriculum vitae) professionnel.

Activité 2 : Soft Skills.

Activité 3 : Fiche métier

Activité 4 : Rapport sur les secteurs où on peut travailler.

Activité 5 : Rapport sur l’industrie de produit cosmétique SAYDERMA

Concernant cette activité six , j’ai effectué un stage pratique d’une durée de deux semaines au
niveau du l’hôpital Rabta Tunis au sein de service Anatomopathologie et ce pour consolider mes
connaissances théoriques dans ce domaine par un stage pratique.

L’histologie est une spécialité qui consiste à étudier au microscope la structure des tissus
organiques, qu’ils soient humains, animaux ou végétaux. En médecine, elle contribue au
dépistage et au diagnostic de certaines pathologies, mais aussi à de nombreux travaux de
recherche.

En effet, c’est une branche de l’anatomie qui s’intéresse à la structure microscopique des tissus
et cellules composant un organisme, afin de mieux comprendre et analyser leur fonctionnement.
On pourrait d’ailleurs parler d’anatomie microscopique [1].

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 DONNEE BIBLIOGRAPHIQUE

1. Historique
Le premier traité d'anatomopathologie publié est, en 1679, celui de Théophile Bonet, un
médecin genevois, Sepulchretum: sive anatomia practica ex cadaveribus morbo denalis.
L'anatomopathologie moderne commence au XVIIIe siècle avec l'Italien Giovanni Batista
Morgagni. Au XIXe siècle, le médecin allemand Rudolf Virchow fera une contribution notable.
En France, la première chaire universitaire indépendante de cette discipline est créée par Jean
Lobstein en 1819, à la Faculté de Médecine de l'Université de Strasbourg [2]

2. DÉFINITION ET OBJECTIF
L'anatomopathologie étudie les anomalies ou les altérations de structure des cellules, des tissus et
des organes d’un sujet vivant ou décédé pour permettre d’établir le diagnostic des maladies et
d’en comprendre les mécanismes. On parle aussi d’examen histopathologique. Cet examen
anatomopathologique est souvent abrégé par les professionnels de santé en « examen anapath ».
C’est l’examen anatomopathologique qui permet d’établir de façon définitive le diagnostic de
cancer. On parle de preuve histologique.
De manière générale, un examen anatomopathologique est réalisé à deux moments clés de la
prise en charge d’un cancer :
Au moment du diagnostic, lorsque l’on réalise un examen anatomopathologique de la biopsie ;
Après la chirurgie, lorsqu’un examen anatomopathologique de la pièce opératoire est demandé

3. L’EXAMEN ANATOMOPATHOLOGIQUE DE LA BIOPSIE :

Lorsqu’une anomalie est décelée, un prélèvement au niveau de cette anomalie doit être réalisé
afin de l’analyser au microscope et d’établir un diagnostic.

4. L’EXAMEN ANATOMOPATHOLOGIQUE DE LA PIÈCE OPÉRATOIRE :

La pièce opératoire désigne tout ce qui est retiré lors d’une chirurgie (tumeur + tissu sain autour
d’elle, ganglions, etc.). A l’issue de la chirurgie, toute pièce opératoire est envoyée au service de
pathologie afin d’être analysée et d’établir un diagnostic.

5. Nombreux sont les domaines d’investigation de l’examen anatomopathologie dont

surtout :

 Pathologie chirurgicale :
o Dermato pathologie ,Neuropathologie ,Néphropathologie...
 Cytologie pathologique

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4
OJECTIFS

Les objectifs de ce travail consistent à :

-consolider notre formation fondamentale dans le domaine des analyses et technologies

cellulaires par un stage pratique .

-suivre toutes les étapes de examens anatomopathologiques depuis le traitement des

prélèvements , la préparation des lames jusqu’à l’observation microscopique .

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 MATERIEL ET METHODES

1 .Population étudiée :

Nous avons mené une étude perspective portant sur plus que 20 cas au service d’anatomie de
cytologie pathologiques de l’hôpital Rabta durant la période de 28 février-14mars.

Les différents prélèvements provenaient du service de chirurgie générale du même hôpital.

2. Méthodes :

2.1 Prise en charge des prélèvements :

Les différents prélèvements reçus au service anatomopathologie , passent par une série de
préparation par un ensemble des techniciens qui travaillent en chaine.

2.1.1. Fixation

La fixation a pour but de s’opposer à la déshydratation prématurée des cellules et surtout à la

putréfaction des tissus. On utilise le formol dilué à 10% (figure 1), car il permet une bonne étude
immunohistochimique.

Figure 1:Fixation des piéces opératoires au formol à 10%

2.1.2. Déshydratation

Les tissus contenus dans les cassettes sont déshydratés dans un automate de déshydratation
(figure 2) par passages successifs dans des solutions alcooliques de plus en plus concentrées.
L’alcool est ensuite remplacé par un solvant organique dans lequel peuvent se dissoudre à la fois
l’alcool et la paraffine. La durée de la fixation dépend de la taille du prélèvement.

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 Figure 2:Automate de déshydratation

2.1.3. Inclusion en paraffine chauffée

L’échantillon est alors immergé dans la paraffine chauffée à une température dépassant juste son
point de fusion, puisque celle-ci est solide à température ambiante.

L’étape finale de l’inclusion est manuelle et consiste à réorienter convenablement le fragment

tissulaire dans le sens de la coupe dans un moule de paraffine (figure 3)

Figure 3: Inclusion en paraffine

2.1.4.Le réfroidissement

Une fois l’échantillon bien imprégné, on le laisse refroidir dans un moule rempli de paraffine qui
se solidifie, on obtient des blocs de paraffine (figure 4).

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 Figure 4: Blocs de paraffine
2.1.5. Raboutage et coupes au microtome

En se refroidissant, le fragment, imbibé de paraffine, se trouve inclus dans un bloc solide à partir
duquel, grâce à un microtome comportant un rasoir, des coupes de 5 microns d’épaisseur sont
obtenues (figures 5). Il faut éviter à chaque fois des coupes striées ou déchirées pour avoir une
bonne coupe et facile à lire après .

Figure 5: Raboutage et coupes au microtome

2.1.6 Réhydratation

Une fois les plans de coupe réalisés, ils sont déposés sur une lame de verre et la paraffine est
dissoute par un solvant organique avant un temps de réhydratation par des solutions alcooliques
de plus en plus diluées.

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2.1.7. Coloration

Après dissolution de la paraffine, puis réhydratation, le tissu est coloré. La coloration usuelle
associe un colorant basique nucléaire (hématéine ou hématoxyline) et un colorant acide
cytoplasmique (éosine, érythrosine) (figure 6).

Figure 6: Coloration des lames

2.1.8. Montage des lames

Le montage des lames consiste à appliquer une lamelle sur une lame à l’aide d’un milieu de
montage. Ce processus offre une protection contre la décoloration .il favorise l’examen
microscopique en assurant une meilleur visualisation des détails structuraux.

2.1.9 Étude au microscope optique

Toutes les lames histologiques étaient réexaminées par un pathologiste senior.

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11
1. Exemples étudié

Parmi les 20 prélèvements recueilles de laboratoire durant la période de stage

J’ai que suivre l’interprétation de deux cas seulement .

(Tableau 1) :deux exemples étudiés aprés le prélèvement

Patient Sexe Age Type de prélèvement

Appendicectomie[4]

Homme 43 ans

produit d’expulsion (Grossesse

arrête)[5]

Femme 26 ans

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2. Interprétation :

Après préparation du prélèvement , inclusion en paraffine ,coupe et montage entre lame et

lamelle la coupe a été observée au microscope optique ou grossissement ×50 (figure 7).

Exemple n°1 : Appendicectomie

Figure 7: observation microscopique: d’une coupe d'appendice montrant un oxyure adulte

en coupe transversale, au grossissement x50 [6].

Exemple n°2 : produit d’expulsion (Grossesse arrêter) [7].

L’observation microscopique de celle coupe a montré une infection (figure 8)

Figure 8: observation microscopique infection parasitaire suivie un avortement spontanée.

Toxoplasmose
*Infection par les ovocytes: chat,
Sable, terre, végétaux, eau
Contaminée
*Passe la barrière placentaire

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14
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 Discussion :

Durant ce travail j’i suivi le déroulement d’un examen anatomopathologique , j’ai constaté une
équipe très organisé , toutes les étapes se font sous forme d’un travail à la chaine entre les
différents techniciens du laboratoire.

J’ai remarqué aussi que le diagnostic doit être très précis et parfois on peut demander un
deuxième avis.

En effet , l’Anatomopathologie peut demander un avis a un confrère quand il ya un difficulté ou

poser un diagnostic( Diagnostic incertain, les diagnostics sont différents selon les observations).

Un second airs est donc primordial pour la fiabilité du diagnostic puisqu’il aura une influence
directe sur le totalement proposé au patient .

L’examen anatomopathologie est donc très précis et donne des résultats fiables qui orientent à
choix thérapeutiques , c’est une discipline qui ne cesse d’évaluer grâce à l’innovation
technologique.

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 CONCLUSION

Ce stage à l’hôpital Rabta m’a permis d’approfondir mes connaissances, notamment dans
le milieu de service anatomopathologie et sur les technologies biomédicales qui sont mises au
service du patient.

Il m’a permis également de mieux assimiler la théorie qui m’a été enseignée pendant les 3 ans au
sein de l’institue supérieur de biotechnologie sidi thabet.

Tous ces acquis vont me permettre d’aborder avec plus de sérénité les tâches qui me Seront
attribuées prochainement, dans mes nouvelles fonctions.

Ce rapport met en exergue la place importante de l’Anatomopathologie pour le soin, en

particulier dans la lutte contre le cancer

Il met également en exergue l'importance du rôle des praticiens en Anatomopathologie dans le

domaine de la santé publique, notamment pour les activités de surveillance et d'observation de la
santé de la population.

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 LES REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES :

(1) Diawara D (2019). Aspects épidémiologiques, cliniques et anatomopathologiques des

cancers de l’estomac dans le service de chirurgie A du CHU du Point G, Thèse de Médecine,
Bamako,19M88: 81p.

(2) Dictionnaire de médecine Flammarion, 8e édition (2022). ‘’Anatomopathologie-

Histoire’’, https://fr.wikipedia.org

(3)- Dictionnaire de médecine Flammarion (2019). ‘’Anatomo-pathologie - Définition et

Explications’’, https://www.techno-science.net.

(4)- Nassaf O (2021). Appendicite aigue : Appendicectomie Coelioscopique vs

conventionnelle, Thèse de Médecine, Université Cadi Ayyad, Marrakech, p 24-26.

(5)- Guillaume D, Jacques C (2012). Nématodoses intestinales: aspects épidémio-cliniques et

diagnostic. Revue Francophone des Laboratoires 2012(440):39–55. DOI:10.1016/S1773-
035X(12)71364-3

(6)- Beucher G, Carcopino X, Capmas P, Costedoat-Chalumeau N, Deffieux X, Delabaere A,

Gallot V, Huchon C, Iraola E, Lavoue V, Legendre G, Lejeune Lemery D, Leveque J, Saada V,
Nedellec S, Nizard J, Subtil D, Quibel T et Vialard F (2014). Pertes de
grossesse .recommandations pour la pratique clinique — Texte court. Gynécologie Obstétrique
et Biologie de la Reproduction, 43: 918—928

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