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Virus Ebola

Pr Iyane SOW
OBJECTIFS

1. Décrire les caractères du virus


2. Citer deux produits pathologiques pour la
confirmation virologique

3. Décrire les conditions de transport des


échantillons
4. Citer les techniques utilisées pour la
confirmation virologique
Introduction

• Virus à ARN de polarité négative, appartenant à la


Famille des Filoviridae et au Genre Ebolavirus

• Responsable de fièvre hémorragique virale

• Hautement pathogène : à manipuler dans des


laboratoires de haute sécurité (niveau 4)
Introduction

• 1976 : deux épidémies de fièvre hémorragique ont


débuté à Nzara (Soudan) et Yambuku (Zaire) avec
taux de létalité élevés (53% et 88%),

• Deux virus proches isolés et nommés Ebola (rivière


coulant près de Yambuku): Ebola-Zaire et Ebola-
Soudan

•1989 : Virginie (USA) plusieurs singes importés des


philippines morts de fièvre hémorragique : virus
dénommé Ebola-Reston
Introduction

• 1994 : au parc national de Taï en Côte d’Ivoire une


personne infectée en effectuant la nécropsie d’un
singe trouvé mort (elle a survécu): Ebola-Côte
d’ivoire rebaptisé Ebola-Forêt de Taï

• 2008 : Ebola-Bundibugyo, identifiée en Ouganda

• E. Zaïre et E. Soudan responsables quasi-totalité cas


humains; Ebola Reston transmissible à l'homme sans
donner de signes cliniques
2. Virologie

2.1. Taxonomie :
• Ordre : Mononegavirale
• Famille : Filoviridae
• Genre : Ebolavirus ou Virus Ebola
• Espèces : E. zaire, E. soudan, E. reston, E. forêt
de Taï, E. bundibugyo
2.2. Structure :
 Virus ayant une forme filamenteuse
parfois bifurquée prenant la forme
d’un U ou d’un «6»
 Taille des filaments très variable,
jusqu’à 1 400 nm, diamètre = 80 nm
EBOLA
 Forme infectieuse mesure 790 nm
 Virus enveloppé avec une
nucléocapside tubulaire à symétrie
hélicoïdale
Structure des Filoviridae
• Le génome:
 ARN monocaténaire linéaire, non segmenté,
à polarité négative, d’environ 19 kb
 ARN polymérase
 Code sept protéines virales 
• Caractères physico-chimiques :
o Virus enveloppé fragile ne survit pas dans milieu
extérieur
o Détruit par la chaleur: 30 minutes à 60 °C, par les UV,
les rayons gamma, les solvants des lipides (éther), la
bêta-propiolactone
o Inactivé par: eau de javel, savon, détergents, formol…
3. Epidémiologie & Pouvoir
pathogène

3.1. Transmission
. Nécessite un contact étroit et prolongé ;
. Parfois par l’intermédiaire de materiel souillé
. Risque contamination par projection de sang,
urine, vomissures
3.2. Tableau clinique
. Incubation : 4 à 10 jours
. Début brutal avec fièvre, céphalées, myalgies
. Puis apparition de troubles digestifs (nausée,
vomissements, hématémèse, melena), de signes
d’hémorragies (pétéchies, ecchymoses)
. Evolution défavorable vers la mort dans un
état de choc
NB : ce tableau est accompagné de
perturbations biologiques (lymphopénie,
neutropénie, agrégation anormale des plaquettes)
4. Dignostic au Laboratoire

4.1. Prélèvement
o Prélever du sang dans deux tubes: un tube
sec de 10 ml et un tube EDTA de 10 ml
o Prélever des tissus
o Autres : urines, LCR
- Manipuler avec extrême précaution
- Envoi à un laboratoire de haute sécurité (P4)
4.2. Transport : Triple emballage
- Tube : 1er emballage doit être mis dans un
sachet avec un tissu absorbant,
- puis ce sachet sera mis dans un pot bien fermé
(2ème emballage)
- enfin ce pot sera mis dans un carton ou une
glacière (3ème emballage).

NB : respecter la chaine de froid (+4°C)


Fiche clinique dûment renseignée par un personnel de santé
et qui doit être accessible sans ouvrir l’emballage
Transport: Triple emballage

Sac en plastique scelle


Parafilm
Tube a bouchon a vis
Echantillon
Papier absorbant

Pot bien fermé


A NE PAS FAIRE
• Ne pas congeler le sang total

• Ne pas laisser les tubes de sang ouverts


sur la paillasse

• Ne pas secouer le tube de sang total

• Ne pas mettre les formulaires d’enquête


au contact des échantillons
4.3. Techniques au Laboratoire
Nécessité d’un laboratoire de type P4 (ou P3 amélioré)
Etabli selon Classe de risque des agents pathogènes
Risque de Prophylaxie ou
Groupe de Risque propagation traitement
risque Infectieux dans la efficace
collectivité
Pas de
1 pathologie Sans objet Sans objet
Peuvent
2 provoquer une Peu probable Oui
maladie
Peuvent Probable Généralement
3 provoquer une possible
grave maladie
Provoquent une Élevé Non connu à ce
4 maladie grave jour
Techniques au Laboratoire

 PCR :
Détecte les ARN viraux dans le sang ou les tissus
à la phase aiguë.
Séquençage permet de typer les souches virales.

 ELISA :
Détecte les antigènes circulant dans le sang ou
présent dans les pièces nécropsiques.
Techniques au Laboratoire

 Microscopie électronique :
Détecte le virus dans les tissus, les prélèvements
biologiques et les isolements en culture cellulaire.

 Culture cellulaire :
Sur cellules Vero E6 .
ECP (7 à 10 jours) pas toujours évident,
Confirmation par IFD.
Techniques au Laboratoire

 Sérologie :

o Tests ELISA détection d’Ac IgM et IgG


spécifiques

o Tests utilisant antigènes viraux inactivés

o Bonne spécificité et sensibilité mais positive


tardivement
4. Conclusion

• Virus fragile mais hautement pathogène


• Triple emballage obligatoire pour le transport
• Confirmation par un laboratoire spécialisé (IPD)
MERCI

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