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Metabo Proteines. Univ - Lile
Metabo Proteines. Univ - Lile
D Séguy
Service de nutrition
dseguy@univ-lille2.fr
Schéma général du métabolisme protéique chez un adulte sain de 70 kg
(tiré de « Enseignement de la Nutrition », B. Beaufrère, Collège des enseignants de Nutrition)
1/ Généralités
2/ Structure des protéines
3/ Digestion et absorption des protéines
4/ Synthèse protéique
5/ Dégradation irréversible des AA
6/ Protéolyse
7/ Synthèse des AA non essentiels
8/ Méthodes d’exploration in vivo
9/ Physiologie du Métabolisme protéique
10/ Conclusion
1/ Généralités
● Structure Primaire
- Séquence spécifique
- Dipeptide (200 kD) → oligopeptide (4 AA) → Complexes enzy (106 kD)
- Protéine moyenne (20 AA, 8% leucine, 1g de N pour 6,25 g de prot)
- Composition de AA variable selon prot (Gly ! collagène, Lys " céréales)
● Structure secondaire
- Repliement dans l ’espace de la structure primaire
- Rotation des AA autour des liaisons peptidique
- Entre AA proches non contigus ( liaisons H)
→ hélice α (kératine) & feuillets β
2/ Structure des protéines
● Structure tertiaire
- Repliement dans l ’espace de la structure secondaire
- Entre AA éloignés (liaisons hydrophobes, liaisons H ponts disulfures)
- Organisation en domaines (la conformation confère une fonction)
● Structure Quaternaire
- Liaison non covalente entre plusieurs protéines (hémoglobine,
protéasome)
- Indispensable au fonctionnement des prot complexes
3/ Digestion et absorption des protéines
● Digestion prépylorique
● Digestion post pylorique luminale: peptidases pancréatiques
● Digestion de contact : peptidases membranaires
● Absorption des di et tripeptides
● Absorption des acides aminés
● Digestion intraentérocytaire des di et tripeptides
● Absorption des protéines
4/ Synthèse protéique
● Transcription
● Traduction
➔ Conditions nécessaires
➔ Pénétration intracellulaire des AA
➔ Activation des acides aminés
➔ Initiation
● Elongation
➔ Principe
➔ Terminaison
➔ Modifications
post-traductionnelles & adressage
➔ Remarques sur la synthèse protéique
4/ Synthèse protéique
● Transcription (ADN → ARNm)
- Localisée dans le noyau de la cellule
- Code génétique = séquence ADN (ou ARNm) ↔ séquence AA
- 3 bases = 1codon, 64 types et 20 AA : synonymes (code « dégénéré »)
- 3 codons stop
- ADN → ARNm grâce à l’ADN-polymérase (« transcrit primaire »)
- Seuls les exons sont exprimés dans l ’ARNm mature (« épissage »)
- L ’essentiel du contrôle cellulaire de la Σ prot est transcriptionnel
- Régulation fine par les facteurs de transcription (complexes protéiques)
* Doigts à zinc
* Fermeture éclaire à leucine
- L ’essentiel du contrôle cellulaire de la Σ prot est transcriptionnel
- Donc ARNm témoins de la Σ prot (Northern blot, RT-PCR)
4/ Synthèse protéique
● Traduction (ARNm → prot)
➔ Conditions nécessaires
- Eléments nécessaires (cytosol)
* AA
* ARNm à traduire
* ARN de transfert (ARNt)
* Enzymes et facteurs de transduction
* Ribosomes (complexes constitués de prot et d ’ARNr, 40S et 60S)
* Energie +++
- Dans le cytosol
* Sur ribosomes libres
* Sur ribosomes liés (REG)
4/ Synthèse protéique
● Traduction (ARNm → prot)
● Désamination
● Elimination de l ’azote
➔ Cycle de l’urée
➔ Amoniogénèse
● Elimination de l ’azote
➔ Cycle de l’urée
- Le glutamate est converti en glutamine (glutamine synthétase)
- Idem pour l ’Ala
- Dans le foie : Gln → Glu + NH3 (glutaminase) = cycle de l’urée
(besoin E)
- Permet l ’élimination de l’excès d’ammoniac
(urée a 2 atomes N par molécule)
- Pas de fonction métabolique de l ’urée
- La voie préférentielle d’élimination de l’azote en excès
Métabolisme hépatique de la glutamine d ’après D. Haüssinger
(tiré du « Traité de Nutrition pédiatrique, Maloine)
5/ Dégradation irréversible des AA
● Elimination de l ’azote
➔ Amoniogénèse
Protéines
Leucine Leucine
KIC KIC
CO 2 + Isovaleryl-Coa
● Généralités
● Systèmes protéolytiques (sys multiples & spécifiques)
➔ Voie lysosomale
➔ Voie calcium dépendante
➔ Voie ubiquitine-protéazome dépendante
- 2. Macroautophagie
* Enveloppement d’une portion entière de cytoplasme par double Mb
* Provient d ’une projection du RE → vésicule fermée (autophagosome)
* Fusionnement autophagosome avec lysosome (dégradation Mb et
contenu)
6/ Protéolyse
● Systèmes protéolytiques
➔ Voie lysosomale (abondants dans foie et rein)
- 3. Microautophagie
* Invagination de corps multivésiculaire (origine endosomique)
* Permet internalisation de prot ou d ’agrégats de prot intracellulaires
* Fusion avec lysosome quand nombre de vésicules suffisant
- 4. Hétérophagie
* Internalisation de protéines extracellulaires → vésicules
* Migration des hétérophagosomes vers la périphérie du noyau
* Fusion avec lysosomes (hétérophagolysosomes)
- Action des protéases lysosomales
(cathepsines, carboxypeptidases...)
Dégradation lysosomiale d ’après S. Carillo et al.
(Médecine/Sciences 1995, 11 : 723-734)
6/ Protéolyse
● Systèmes protéolytiques
● Conclusion
- La protéolyse consomme beaucoup d ’énergie
- Sa régulation est tout autant fine que celle de la protéosynthèse
7/ Synthèse des AA non essentiels
● AA essentiel
- Ne peut être synthétisé par l’organisme et doit être apporté
par l’alimentation
● Généralités
● Méthodes conventionnelles
➙ Index créatininurie/taille
➙3 méthyl-histidine urinaire (3MH)
➙ Bilan azoté
➙ Dosage des concentrations circulantes d ’AA
➙ Cathétérisme artério-veineux
➔ Index créatininurie/taille
- La créatinine provient du muscle
- Vitesse de production constante
- Son excrétion urinaire permet d’évaluer la masse musculaire
- Le rapport créatininurie / taille standardise la méthode
- De nombreux facteurs altérent la spécificité
(exercice muscu, stress, trauma, brûlure insuff rénale, régime
alimentaire en prot…)
8/ Méthodes d’exploration in vivo
● Méthodes conventionnelles
➙ Cathétérisme artério-veineux
- Dimension dynamique
- En pratique irréalisable
8/ Méthodes d’exploration in vivo
● Principe de l’utilisation des isotopes stables
- AA marqueurs du renouvellement protéique
- AA marqués aux isotopes stables
* Formes lourdes mais stables donc non radioactives
* Abondance naturelle exprimée en atome pour cent en excès (APE)
* Stabilité et innocuité identique à celle du produit tracé
- Etude des flux d’AA
(cinétique du renouvellement protéique et échanges interorganes)
-Dilution d’un AA marqué (traceur)
(suit les voies métaboliques et la cinétique de l’AA tracé)
- Exemple
* Turnover de la Leucine est 100 ± 15 µmol/kg/h
* Turnover de la GLN est 350 ± 35 µmol/kg/h
Ingesta
13
C-leucine Apports (I)
Injection (i*)
Synthèse (S)
LEUCINE PROTEINES
plasmatique
Dégradation (B)
Catabolisme
(Ox)
A l'état stationnaire : Q = Rd = Ra
13
CO2 CO 2 Rd = S + Ox
Ra = B + I
A l'état post-absorptif : I = 0
Q = S + Ox = B
● Régulation hormonale
➔ Insuline
➔ Hormone de croissance et IGF
➔ Stéroïdes sexuels
➔ Catécholamines
➔ Hormones thyroïdiennes
➔ Glucagon
➔ Glucocorticoïdes
➔ Cytokines
9/ Physiologie du Métabolisme protéique
● Régulation par les nutriments
➔ Etat post-absorptif (à jeun)
- 25% du glucose provient de la néoglucogénèse (" si >18 h jeûne)
- Les Flux d’AA se dirigent de la périphérie vers les viscères (intestin, foie)
- Le muscle squelettique exporte des Q " d’AA (" protéolyse , ! Σ prot)
- Ala et Gln = 2/3 des AA totaux libérés par muscle / 15% dans prot en tout
- → il y a une synthèse de novo de ces AA dans le muscle
- Ala gagne le foie (néoglucogénèse)
- Gln gagne l ’intestin où il sert de carburant
- En situation de pénurie l’organisme a 2 priorités
* Fournir de l ’Ala au foie (néoglucogénèse )
* Fournir de la Gln aux tissus à renouvellement rapide
Echange interorganes d ’AA chez l ’homme sain à jeun
(tiré de « La Nutrition Humaine », D. Darmaun INSERM, Nathan)
9/ Physiologie du Métabolisme protéique
● Régulation par les nutriments
➔ Etat post-prandial (nourri)
- L’image s’inverse
- Approvisionnement par glucides ingérés (glycogène et TG)
- Lipolyse périphérique freinée
- L’intestin devient une source d ’AA
- AA captés par le foie
- Exception pour les ramifiés (Leu, Ile, Val) qui gagnent le muscle
- Repas
* Freine la dégradation protéique (insuline)
* " Σ prot (lié à " des AA circulants)
* " apport énergétique (adaptée aux besoins) " la balance azoté
Echanges interorganes d ’AA chez l ’homme sain nourri
(tiré de « La Nutrition Humaine », D. Darmaun, INSERM, Nathan)
Effet de l’" de l ’apport énergétique sur la balance azoté
lors d ’un apport azoté constant d ’après
(tiré du « Traité de Nutrition Artificielle de l ’Adulte », B. Beaufrère, SFNEP)
9/ Physiologie du Métabolisme protéique
● Régulation hormonale
➔ Insuline (anabolisante)
- " la captation intracellulaire des AA
- " Σ prot (difficile à démontrer in vivo)
- ! protéolyse (effet le plus important
➔ Stéroïdes sexuels
- Anabolisantes (testostérone)
9/ Physiologie du Métabolisme protéique
● Régulation hormonale
➔ Catécholamines
- Adrénaline et noradré anabolisantes (lipo et glycogénolytiques)
- " Σ prot
- ! protéolyse
➔ Hormones thyroïdiennes
- Euthyroïdie indispensable à la croissance
- L ’hyperthyroïdie provoque une fonte musculaire " protéolyse)
➔ Glucagon
- " protéolyse
- Effet modeste (inhibition de cet effet par insuline)
9/ Physiologie du Métabolisme protéique
● Régulation hormonale
➔ Glucocorticoïdes
→ hyperinsulinisme)
- Hormones catabolisantes les plus puissantes (→
- " protéolyse
- ! Σ prot
➔ Cytokines
- Globalement catabolisantes
- " Σ prot de l ’inflammation dans le foie
10/ Conclusion