Ministère de l’Ecologie, du

Développement durable,

Théorie des graphes comme

base de modélisation des
réseaux écologiques
Jean-Christophe Foltête
Patrick Giraudoux
Yves Michelin
Florian Tolle
Francis Raoul
Renaud Scheifler
Mickaël Coeurdassier

UMR 6049 ThéMA

UMR 6249 Chrono-Environnement
UMR 1273 Métafort
Introduction

Réseaux écologiques
Corridors
Trames vertes et bleues
Connectivité paysagère…

Connectivité structurelle Connectivité fonctionnelle

Introduction

Quels indicateurs de la connectivité fonctionnelle ?

- Métriques paysagères
- Rapide et facile à mettre en œuvre et à reproduire
- Significativité écologique?

- Modèles de simulation individus-centrés

- Exige un paramétrage très précis
- Difficile à reproduire

- Graphes paysagers
- Données d’entrée assez simples
- Permet analyse multi-échelle
Urban DL, Keitt TH, 2001. Landscape connectivity: a graph theoretic approach. Ecology 82: 1205-1218.
1. Principe des graphes paysagers

Donnée d’entrée :
Carte paysagère en mode
matriciel

Nomenclature définie en
fonction d’une relation
espèce-paysage

En général : valeurs de
coût (friction) associées
aux catégories
paysagères
1. Principe des graphes paysagers
1.1. Construction du graphe

Identification des taches

d’habitat optimal

Les taches = nœuds du

graphe (mode objet)

Attribution d’une valeur

de capacité à chaque
tache
1. Principe des graphes paysagers
1.1. Construction du graphe

Définition des liens

Topologie
- Complète
- Graphe minimal planaire

Directionnalité

Pondération
- Distance euclidienne
- Distance de moindre coût

Seuillage
1. Principe des graphes paysagers
1.1. Construction du graphe

Illustration d’un
ensemble de liens :

- topologie planaire

- liens non directifs

- distance de moindre
coût

- pas de seuillage
1. Principe des graphes paysagers
1.1. Construction du graphe

Seuillage du graphe

Sélection des liens dont

le coût est inférieur à un
seuil
(distance maximale de
dispersion de l’espèce)
1. Principe des graphes paysagers
1.1. Construction du graphe

Principaux
types de
graphe
1. Principe des graphes paysagers
1.2. Métriques de connectivité

Plusieurs niveaux de calcul :

local
composante
global

Théorie des graphes / métriques écologiques

Etats de l’art récents : plusieurs dizaines de métriques

Rayfield B, Fortin MJ, Fall A, 2011. Connectivity for conservation: a framework to classify network measures.
Ecology 92: 847-858.
1. Principe des graphes paysagers
1.2. Métriques de connectivité

Exemple de métriques locales de correspondant à 3

propriétés fondamentales (Urban et Keitt, 2001) :

Potentiel Flux de dispersion (F) Betweenness Centrality

démographique (R) (BC)
1. Principe des graphes paysagers
1.2. Métriques de connectivité
Principe des « delta métriques » :
- Calcul d’une métrique globale
- Suppression d’un élément
- Recalcul de la métrique, taux de variation
2. Usages des graphes paysagers
2.1. Test de la
connectivité comme
facteur jouant sur la
présence d’une espèce
Combinaison :
métriques de
connectivité
+ modèles de
distribution d’espèce

Exemple de la rainette
arboricole en Franche-
Comté
2. Usages des graphes paysagers
2.2. Prioritisation : identification des éléments-clés du réseau

Exemple de la rainette
arboricole en Franche-
Comté
2. L’outil GRAPHAB 1.0
2.1. Justification du logiciel

Outils existants

- SIG (Arc-GIS) : possibilités, incomplet

- Guidos : connectivité structurelle
- PathMatrix : matrices de distances de moindre coût
- Conefor Sensinode 2.2
: calcul de graphes uniquement
- JMatrixNet : intégration mais fortes limites

 Besoin d’un outil intégrateur

2. L’outil GRAPHAB 1.0
2.2. Principales fonctions

a. Construction du
graphe

b. Calcul des métriques

de connectivité

c. Lien avec des

données externes

Foltête J.C., Clauzel C., Vuidel G., 2012. A software tool dedicated to the modelling of landscape networks.
Environmental Modelling and Software 38: 316-327.
2. L’outil GRAPHAB 1.0
2.3. Visualisation
Données gérées sous
forme de projet

Module de visualisation
et cartographie

Calculs parallélisés

Liens avec SIG (format

shape ESRI)
2. L’outil GRAPHAB 1.0
2.3. Visualisation
Représentation topologique
2. L’outil GRAPHAB 1.0
2.4. Lien avec des données externes
2. L’outil GRAPHAB 1.0