Ethologie et chronobiologie CM1/CM2/3 (7-14-21/09/20)

GRAFF Christian

I) Approches qualitatives de la temporalité

A) « Temps » et dimension temporelle (temporalité) :

Temps remplacé par instant.

Tout s’inscrit dans le temps.

Les instants sont des points sur un axe uni dimensionnel temporelle allant du passé
vers le futur.
Les dates sont des dates arithmétiques d’instant.
Instants sont séquentiellement ordonnés en dates croissantes tout le long de
l’axe.
La durée est la différence arithmétique mesurée entre deux dates.

Les évènements sont façonnés par des chgmt (de masse, d’nrj, d’espace).
Des états s’étendent entre deux dates.
Un moment s’étend entre des états aussi : le début et la fin.

Les répétitions sont des chgmts, des évènements ou des états qui sont identifiés
comme similaires.

Les cycles sont des répétitions de chgments, évènements ou états qui sont
identifiés dans ordre particuliers.

Un rythme est un cycle dont les phases ont des durées similaires. Un rythme
périodique a un cycle de durée similaire.
B) Cycles et rythmes :

1) Répétition :

Pour les identifier soit se sont des évènements, laps de temps qui passent.
Les actions qui se répètent sont des phases et forme un cycle.

On parle de rythme quand on connaît la durée.

Si évènements se succèdent dans 1 ordre caractéristique = un cycle.

 2) Durée :

Rythme caractérisé par la durée.

Quand la séquence des évènements est caractéristiques on parle de cycle binaire

( allumer/éteindre).

Quand ordre et durée sont caractéristique => rythme.

Si la durée est variante (ex : hormones), y a pas de rythme.
Chez la femme le cycle ovulation/règles etc est un rythme car c’est un cycle
caractéristique. Surtout ces pillules, en effet 21 j pilules, 7 jours de règles. Le cycle
forme un rythme de 28 jours => cycle périodique.

Période = durée caractérisituqe de certains rythmes.

C) Universalité des rythmes et des cycles :

1) Acceptation large de la notion de rythme :

Rythme : ruthmos => écoulement (rhumo = nez qui coule). Ca évoque le temps qui
passe.

Rythme biologique => Rythmes périodiques uniquement.

Le rythme de reproduction du pinçon est biologique mais le rythme de son
chant ne l’est pas.

2) Intérêt transdisciplinaire :

a) Arts et Lettres

On a bcp de qualifications des rythmes, c’est une approche qualitative (différente de

celles en bio qui est approche quantitative).

Le langage = rythme =< prosodie ( ex : prosodie du français = syllabique, peu

d’intonation caractérisée).

b) Science → Quantitatif
  Modèle pauvre : inconvénient → pauvre (rythme lanscinant), l’avantage → peu
de notion.

 Modèle de la chronologie est basé sur la période

Période lié à la fréquence.

Un cycle e peut être anticiper.

 Intérêt de l’étude des rythmes :
→ Possibilité d’anticiper/ prévoir
→ l’harmonisation : accorder différents phénomènes grâce au rythme
→ Potentialiser : utiliser force sociale par ex : + de puissance si tt le monde
tire quelqu’un en meme temps.

D) Liens entre rythmes à différents niveaux hiérarchiques

d’étude :

1) Monde physique :

Quand on observe des phénomènes, on peut les étudier à différents niveaux :

biologique, moléculaire etc.
La bio des population c’est étudié un groupe d’organisme.

Dans le monde physique il y a des successions d’évènements à des périodes

spécifiques (ex : la rotation de la Terre → période de 24h).

 Les sons : vibrations c’est un rythme soit lent donc grave ou rapide donc aiguë.

 Lumière bleue et rouge agissent sur des récepteurs différents de nos yeux.

Rythme astronomique de la rotation de la terre cela joue sur le rythme biologique des
plantes.

2) Monde biologique :

3 grandes fonctions de la vie :

- Réciproque
- Cardiaque
Cycles sont rythmés, ordonnés.
Niveau élémentaires : onde cérébrales qui sont caractérisés par l’activité mentale.

Les rythmes biologiques dépendent des conditions physiques.

Monde physique joue sur le biologique parce que les deux sont un peu mélanger et ont
donc des répercussions l’un sur l’autre.

Des objets plus gros seront plus lent.

Psychologie → science du vivant

Physiologie →

Parmi les rythmes bio il y a les rythmes philo

3) Monde social :

 Rythmes culturels (sociologie) : élémentaires : rythme des pas, danse,

musique.

Rythmes bio jouent sur la prosodie, le rythme cardiaque

 Rythmes collectifs : les repas, associer aux rythmes bio aussi.

Rythmes bio basé sur les bio qui eux même basés sur des rythmes astronomique

 Rythme de la semaine est une invention culturelle.

 Facteur de cohésion : si on casse un rythme de société on en recrée 1 alors on

a une cohésion.

Religions sont rythmés aussi par ex le jeûne est un rythme.

4) Modélisation :

Le modèle de rythme le plus simple va rythmer les molécules etc..

L’analyse des signaux est applicable aux niveaux bio et psycho

Le rythme ponctuel

Le plus connu est le rythme sinusoïdale qui est une analyse d’un signal qui est basé
dessus.
II) Modèles quantitatifs, exemples naturels

A) Physique ondulatoire et analyse du signal (basées sur la

trigonométrie) :

Modèles quantitatifs basé sur la physique ondulatoire. Une onde, vibration c’est un
rythme périodique et caractérisé en physique. En physique appliqué y a une branche :
l’analyse du signal ( son enregistré décomposé par outils math qui est la trigo (étude
des angles)).
Un signal meme complexe est une vibration => théorème de Fournier.

1) Période :

Période : durée écoulée entre deux phases (évènements ou états, des phénomènes)
similaires est la période du cycle donc du rythme qu’on appelle R.périodique.

Période s’écrit avec unité de durée : s, ms, min, année etc..

Le nbr de min, s etc que dure un cycle = période.

La période est cste. Elle est sujette à des variations et donc elle peut s’allonger
(rythme ralenti) ou se raccourcir (rythme accélère).
Période est Long, rythme Lent
Période Courte, rythme Rapide

2) Fréquence :

Fréquence : le nbr de fois que ce déroule un cycle dans une unité de temps données.

f=1/T.
f en Hz (inverse de la seconde)
T en s

Fréquence Haute = rythme Rapide

Fréquence Basse = rythme Lent

Phénomène lent : longue période et fréquence haute

Phénomène rapide : courte période et fréquence basse.
 3) Représentation (dire l’intérêt en psycho) :

La première représentation d’un cycle c’est un cercle. Souvent représenté sous forme
de cercle par ex cycle de l’eau vu au collège.
Pour se comprendre y a des conventions, en effet ce cercle se lit dans le sens
inverse des aiguilles d’une montre (de gauche à droite).

La durée d’un tour est tjrs la meme si rythme est périodique. La durée d’un tour = la
période.

Les phénomènes sont représentés sur un axe du temps qui s’écoule.

Le phénomène quantitatif le plus simple c’est la sinusoïde.

4) Amplitude :

5) Phase :

Moment caract du cycle et donc du rythme, dans le modèle sinusoïdale on a la phase

montante, l’accrophase (le max), descendante, etc..

6) Déphasage :

La différence entre l’un où se trouve dans une position et l’autre dans une autre
position.

L’opposition de phase c’est une demi période de 180°.

7) Liens avec la taille, la masse et l’énergie

B) Entraînement

1) Définiion
Qd 2 syst périodique de fréquence proche agissent l’un sur l’autre, ils ont
tendance à adopter une fréquence commune qui est intermédiaire entre ces 2
périodes initiales.

2) Asymétrie :

QD y a 2 phénomènes, y en a un + puissant que l’autre. Les 2 syst se

synchronisent sur la même période. Celui qui a le plus modifié sa fréquence de
départ=entraîneur.

3) Robustesse et désolidarisation :

La fréquence et la période doivent être similaires au départ.

2 personnes qui se tiennent par le doigt et par le bras, ça a moins de chance de
fonctionner.
Pdt un temps ils auront la même période, puis cela reviendra à la normal =>
désolidarisation

4) Harmoniques possibles :

5) Fréquence intrinsèque :

La fréquence intrinsèque est indépendante de la fréquence de l’entraîneur.

Il faut frapper la corde de guitare pour avoir la fréquence intrinsèque.

6) Notion de résonance :

Augmentation d’amplitude d’une oscillation sous l’influence d'impulsion périodique

d’autres fréquences très voisines.
Chaque objet à une fréquence de résonance qui lui est propre.
et si on lui donne une impulsion équivalent à cette fréquence il va vibrer plus qu'avec
d'autres fréquences genre un verre en cristal de x dimensions aura une fréquence
résonante de 2000hz et si on chante à cette fréquence précise assez fort il va vibrer
plus que si on chantait à 500 hz et se casse

C) Entraîneur naturels

1) Situation

2 types de facteurs :
Endogène (interne) on l’appel un pacemaker ou horloge interne.
Exogène (externe) appeler Zeitgeber ou horloge exogène

2) Isolation et Libre cours

Si facteur interne ou externe au système. On isole le syst et on regarde si phénomène

se poursuit on appelle ca les experience de libre cours.
Les expériences de libre-cours mettent en évidence si le facteur est endogène ou
exogène à ce système.
Certaines plantes ont fleurs ou feuillage qui s’ouvrent ou se replient elle a un
pacemaker.

3) Exemples d’entraîneurs exogènes importants

Le rythme jour/nuit : nycthémère t= 24h

La marée.:diurne ou semi-diurne t=12,4h. Marée au max : vives eaux et marée au

min : mortes-eaux.
Morte-eaux en lien avec la lune. les marées hautes ont des hauteurs différentes,
la marée haute la plus haute étant à la pleine lune et à la nouvelle lune
Marées jouent sur tous les organismes qui vivent dans la mer ou vers la mer..
La lune agit sur plantes et animaux (sur zooplanctons).
Periode de la lune : t=29.53 jours.

L’influence de la lune se fait par la lumière.

Variation saisonnières : période saisonnière:1 an. Pdt un temps les enfants naissaient
plus en automne pour éviter que les femmes soient enceinte en hiver. Au 21è s en Fr
les femmes accouchent le plus au mois de mai grace aux congés payer. Le jour où on
né le moins le dimanche et le samedi.
La saison agit en fonction de la durée du jour par rapport à la nuit : la
photopériode, les saisons sèche et humide, les moussons,

température dans zone tempéré a très peu d’influence c’est un facteur déclencheur.

4) Exemples d’entraîneurs endogènes importants

Nerveux
Hormonaux : cycle menstruel
Biochimiques :
Mécanismes : feedback= rétrocontrôle

5) Biorythmes
Le jour où on né on a compté à 0 et au bout de 1 ans 365. 3650 donc 10 ans contient
le nombre de 3 et divisible par 3 et selon la configuration du nombre, on est dans état
particulier.
Biorythmes c’est comme astro ca nous dis dans un jour pair impair donc prédisposer à
subir tel ou telle influence
Un rtyhme bio est un rythme périodique du vivant.
Les biorythmes c’est une science occulte comme l’astro.

Quand on identifie un rythme on peut anticiper.

Horloge quel qu’elle soit n’est jamais fiable

D) Complémentarité des entraîneurs et sens biologique

1) L'anticipation d'un paramètre externe possède une valeur adaptative certaine

Par ex : l’horloge interne prévois que hiver = froid.

2) Mais un entraîneur exogène naturel n’est pas totalement fiable :

Ex : Lumière baisse donc souris va rentrer chez elle pour son cycle alors qu’il peut
juste y avoir des nuages.

Système hormonal des oiseaux peut être déréglé.

3) Donc nécessité d’horloge interne.

Ne déduis pas automatiquement selon lumière

L’être vivant a en lui une « petite voix » qui lui dit si il est midi ou minuit.

Horloge interne → décodage.

Il faut se fier aux horloges ext et interne. Il faut avoir les deux pour plus
d’exactitude.

4) Nécessité des deux facteurs en interaction :

Cela évite la dérive.

III. Rythmes circadiens

A) Le Nycthémère et quelques rythmes nycthéméraux

Rythme nycthéméral suit un rythme jour/nuit. Son influence passe par la lumière =>
élément déclencheur.

1) Le Zeitgeber

Le Zeitgeber est un cycle jour/nuit.

Lumière : photolyases.
Les première cell ont pu survivre car mécanismes qui ont put protéger
leurs ADN et les réparer. Histones (associé à L’ADN, ce sont les « bobines » de
l’ADN). Photolyases empêchent ou fav le déroulement au bon moment (pas le jour où
y a UV)de l’ADN et sont sensible à la lumière. Les différentes molécules
(photolyases, cryptochromes, B-Mall, Clk..) agissent les unes sur les autres, y a
mécanismes bio avec feedback en retard.
Photopériode : durée relative du jour et de la nuit.
La température c’est aussi un entraîneur et joue sur les animaux qui ont pas une
température régulière.

 2) Rythmicité interne

Rythmes ultradiens : sont rythmes d’environs 24h et c’est un rythme plus rapide
(fréquence élevé), période courtes
Rythmes infradiens :sont rythmes d’environs 24h, rythme moins rapide (fréquence
moins élevé.
La plupart des cell ont une expressions des gênes et le rythmes des mitoses est
marqué sur un rythme de 24h.Cette expressions des gênes va faire que certianes
substance sont ± présentent dans le corps.

B) Le rythme veille/sommeil

1) Espèce diurnes nocturnes ou crépusculaires

Diurnes : dort la nuit et fait le reste le jour. H est diurne.

Bcp d’esp sont crépusculaires cad deux phases d’activités et deux phases de repos.
Les expériences sur la rythmicité sur veille sommeil ont considéré l’H diurne mais on
considère comme l’H est diurne à tendance crépusculaire cad en particulier dans pays du sud,
les humains se réveillent tôt le matin, sont actif toute la mâtiné et à midi ils font la sieste et
vers 16h ils sont actifs jusqu’à même après le coucher du soleil.

2) Le sommeil électroencéphalograpique (EEG) et oculomyographique (OMG),

animaux sans cortex.

Électro : électrique, encéphalo : qui vient de encéphale (à l’intérieur de la terre), graphique :

tracer/écriture.
EEG : tracer de l’activité électrique du cerveau
Quand on est très actif, les variations sont très fréquentes : on parle d’onde d’état.
Quand on est au repos, ces ondes d’état font places aux ondes alpha (plus lente et de plus
grandes amplitudes). Ces ondes ont été observer sur EEG humain et sur le chat.
Il existe sommeil paradoxale : un moment où bien que le corps est détendu, on peut
faire Electromyogramme (EMG, cad tracer électrique des muscles) : on voit que les yeux
bougent.

Le sommeil se def chez l’H sur des critères électromyographique.

Mais y a nbrx animaux qui ont pas de cortex : comme reptil oiseaux (pas meme cortex que
nous) ou invertébré (pas du tout).
Le sommeil est différent mais chez tout les animaux on a phase d’activité et de repos
donc au lieu de dire veille/sommeil on dit cycle activité/repos

3) Expériences de libre cours (free running)

→ Isolement temporel :

Quand organisme isolé, ils conservent rythme d’à peu près 24h de rythme activité/repos

→ Régime d’éclairement :

Eclairement cst : lumière tjrs allumé (on l’a fait subir à des animaux, et plantes, chez
l’humain on appel ça une torture).
Obscurité cst : noir totalement
Pénombre cst : niveau de luminosité n’empêche pas diurne de dormir mais permet de voir ces
activités.

Chez humain on utilise auto-éclairement : la personne peut allumer ou éteindre selon son
envie.

→ Persistance :
On a différents régime d’éclairement et on obtient de façon général un persistance d’une
période d’environs 24h. Circa (période d’environs 1 jours) Dien (Jour) : Circadien. Si ça dure
+ 24h infradien, -24h ultradiens.

→ Loi d’Aschoff :

Chez les diurnes éclairement cst la periode est plus courte et en pénombre cst la
période est plus longue.

→ Parfois allongement progressif ou désynchronisation et désorientation

temporelle Siffre (1972)

Siffre : fr aventurier, spéléologue et il a proposé de voyager hors du temps. Il s’est fait

enfermer dans une grotte et il y est resté des mois entiers sans horloge, dans le noir,
température cst. En même temps des allemands on fait la même mais avec bunker. Siffre est
allé dans une grotte où y avait glacier.
On observe que la personne à un pacemaker (horloge endogène) qui est circadienne.
Notre syst a une période d’environ 24h et se fait entraîner par l’entraîneur extérieur. Quand
on est en libre cours, le syst permet

4) Entraîneurs de substituions artificiels

On peut entraîner les org avec substitue du nycthémère

→ lumière : entraîneur le plus puissant

→ Sociaux : l’oiseau chanteur en libre court : alterne ces phases d’activité et repos d’environs
24h. On administre à cet animal un enregistrement de son propre chant ou d’un animal de la
meme esp toutes les 26h. Il l’entend toutes les 26h et cet évènement entraîne tout le syst
activité/repos de l’animal.
Chez l’H ca marche aussi.
Cet entraîneur est plus faible que la lumière.

→ Travail/repos : Entrianement par le travail en général

4. Entraineurs de substitution expérimentaux

On peut influer directement sur le cycle jour nuit via une lumière artificielle : on substitue le naturel par l’artificielle pour
recréer des conditions nouvelles de cycles.
Hors la lumière, l’homme se case aussi sur les entraîneurs sociaux : le rythme veille- sommeil est relié à l’heure socialement
fixée (dormir vers X heure).
Et pendant longtemps les scientifiques croyaient que les entraîneurs sociaux étaient les plus puissants, en réalité il s’agit de
l’horloge interne.
• Photopériodes squelettiques : il s’agit de flash de lumière qui provoquent l’activité ou le sommeil. L’animal va en fait se
caler sur les flash et les considérer comme des indicateurs temporels.
-> Inversions
-> Sociaux; horloge déréglée
-> Travail/repos
-> Photopériodes squelettiques

C. Le rythme des températures

1. Nature
2. Variations

3. Lié au rythme veille-sommeil

4. Désolidarisation

IV. Fonctionnement de l’horloge endogène

A. Identification (rat): Noyau suprachiasmique

1. Anatomie

-> Noyau de substances grises: environ 10000 neurones x2 chez l’homme

2. Physiologie

-> Lésion
-> Stimulation
-> Enregistrement
-> Isolation chirurgicale dans le cerveau (in vivo)
-> Isolation en milieu de survie (in vitro)
-> Greffe de NSC: Nouveau né

B. Bases génétiques

1. Hamsters sélectionnés génétiquement

2. Souris en libre cours sur plus de 10 générations restent rythmées
3. Gène « clock » homologue chez souris et drosophile
4. Note sur répercussions métaboliques
5. Mécanismes biochimique et génétique basés sur les photolyases