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Enseignement Complémentaire
Génétique clinique, chromosomique et moléculaire
PCEM2 – DCEM1
Klaus Dieterich
kdieterich@chu-grenoble.fr
Inserm U836, GIN, Eq Muscle et Pathologie, Grenoble
Inserm U788, Plateforme Génomique, Kremlin-Bicêtre
Plan
• Généralités
– Mécanismes des anomalies du développement
– Quelques principes
– Quelques chiffres
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Plan
• Généralités
– Mécanismes des anomalies du développement
– Quelques principes
– Quelques chiffres
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Généralités
• Anomalie du développement :
– Morphogenèse/ mise en place anormale
– D’un organe ou tissu
– Aboutissant à un défaut de structure
Généralités
• Anomalie du développement :
– Morphogenèse/ mise en place anormale
– D’un organe ou tissu
– Aboutissant à un défaut de structure
• Malformation et déformation
– Agénésie rénale et faciès de Potter + pieds varus équins
• Dysplasie et déformation
– Dysplasie rénale sévère avec insuffisance rénale et faciès de
Potter et pieds varus équins
Généralités
• Associations variables des 4 mécanismes
– Primitif et secondaires
• Malformations multiples conséquences d’une première
– Séquence de Pierre – Robin :
Plan
• Généralités
– Mécanismes des anomalies du développement
– Quelques principes
– Quelques chiffres
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Généralités
• Quelques principes
Colobome 80-90%
Heart disease 75-80%
Atresia choanae 58%
Genital anomalies 75%
Ear anomalies 90%
Mental retardation 100%
Généralités
• Quelques principes
– Hétérogénéité causale
– Hétérogénéité causale
Neurologique
Musculaire Facteurs Maladies
Osseux utérins maternelles
Tissu conjonctif
Arthrogrypose
Généralités
• Quelques principes
– Hétérogénéité causale
– Hétérogénéité causale
• Séquence de Pierre – Robin : idiopathique et isolé
Généralités
• Quelques principes
– Hétérogénéité causale
• Séquence de Pierre – Robin : collagénopathie
Généralités
• Quelques principes
– > 4000 tableaux cliniques => Penser souvent à ce qui est fréquent !!!
Plan
• Généralités
– Mécanismes des anomalies du développement
– Quelques principes
– Quelques chiffres
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Généralités
• Quelques chiffres
Méningomyélocèle
Atrésie de l’oesophage
Fente labiale
Hernie diaphragmatique
Fente palatine
Utérus bicorne
Mains
Œil
Visage et bouche
Oreille
Série1
Peau
Thorax
Pieds
Autres
Mains
Œil
74%
Visage et bouche
Oreille
Série1
Peau
Thorax
Pieds
Autres
100,00%
Avec 1 ou plusieures malformations majeures
90%
90,00%
80,00%
70,00%
60,00%
50,00% Série1
40,00%
30,00%
20,00%
11%
10,00% 3%
1,40%
0,00%
0 (85%) 1 (13,4%) 2 (0,8%) 3 ou plus
(0,5%)
Nombre d'anomlies mineures par nouveau-né
Plan
• Généralités
– Mécanismes des anomalies du développement
– Quelques principes
– Quelques chiffres
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Malformations congénitales
• Causes des malformations congénitales
Environnemental
7%
Génique
7%
Chromosomique
7%
Inconnu
57%
Multifactoriel
22%
Malformations congénitales
• Causes des malformations congénitales
– Chromosomiques
4,5
4
% de grossesses concernées
3,5
3 Prénatal létal
2,5
(Fausse couche)
1,5
0,5
Nouveau-né
0
1
Incidence des anomalies chromosomiques
Malformations congénitales
• Causes des malformations congénitales
– Chromosomiques
Autres
100% 100%
Autres
80% T13
80%
Trisomies T18
T21
60% 60%
45,X
XXY
40% 40%
XYY
45,X XXX
20% 20%
Polyploïdies
0%
0%
1 1
Environnemental
7%
Génique
7%
Chromosomique
7%
Inconnu
57%
Multifactoriel
22%
Malformations congénitales
• Causes des malformations congénitales
– Génétiques
• Maladies monogéniques
– Mendéliennes
» Autosomiques récessives : Mutations MKS – Meckel Gruber
» Autosomiques dominantes : Mutations CDH7 – CHARGE
» Liées à l’X récessives : Mutations DHCR7 – SLO
– (Mitochondriales/ maternelles : surtout déficit énergétique/
métaboliques, parfois responsable de tableaux malformatifs)
– Epigénétiques
• Maladies à empreinte parentale
– P.ex.: Syndromes de Prader-Willi, Angelman, Beckwith-
Wiedemann, Silver-Russel
Malformations congénitales
• Causes des malformations congénitales
Environnemental
7%
Génique
7%
Chromosomique
7%
Inconnu
57%
Multifactoriel
22%
Malformations congénitales
• Causes des malformations congénitales
– Environnementales
• Agents infectieux
– Rubéole congénitale : Cataracte, Cardiopathie (< 10SA),
Rétinopathie, Surdité (10 – 16SA)
– CMV : Tb neurologiques, hydrocéphalie, …
– Toxoplasmose : Tb neurologiques, microcéphalie, …
Malformations congénitales
• Causes des malformations congénitales
– Environnementales
• Agents infectieux
– Rubéole congénitale : Cataracte, Cardiopathie (< 10SA),
Rétinopathie, Surdité (10 – 16SA)
– CMV : Tb neurologiques, hydrocéphalie, …
– Toxoplasmose : Tb neurologiques, microcéphalie, …
• Maladie maternelle
– Diabète insulinodépendant : Sd de régression caudale, CIV,
anomalies du tube neural
– Phénylcétonurie : Microcéphalie, retard mental,
cardiopathies
– Déficit en folates : Anomalies du tube neural
Malformations congénitales
• Causes des malformations congénitales
– Environnementales
• Agents infectieux
– Rubéole congénitale : Cataracte, Cardiopathie (< 10SA),
Rétinopathie, Surdité (10 – 16SA)
– CMV : Tb neurologiques, hydrocéphalie, …
– Toxoplasmose : Tb neurologiques, microcéphalie, …
• Maladie maternelle
– Diabète insulinodépendant : Sd de régression caudale, CIV,
anomalies du tube neural
– Phénylcétonurie : Microcéphalie, retard mental,
cardiopathies
– Déficit en folates : Anomalies du tube neural
• Médicaments
– Anticonvulsivants (valproate…) : Anomalies du tube neural, dysmorphie,
…
– Talidomide : Anomalies réductrices des membres, …
– Warfarine : Hypoplasie nasale, microcéphalie, …
Malformations congénitales
• Causes des malformations congénitales
– Environnementales
• Agents infectieux
– Rubéole congénitale : Cataracte, Cardiopathie (< 10SA),
Rétinopathie, Surdité (10 – 16SA)
– CMV : Tb neurologiques, hydrocéphalie, …
– Toxoplasmose : Tb neurologiques, microcéphalie, …
• Maladie maternelle
– Diabète insulinodépendant : Sd de régression caudale, CIV,
anomalies du tube neural
– Phénylcétonurie : Microcéphalie, retard mental,
cardiopathies
– Déficit en folates : Anomalies du tube neural
• Médicaments
– Anticonvulsivants (valproate…) : Anomalies du tube neural, dysmorphie,
…
– Talidomide : Anomalies réductrices des membres, …
– Warfarine : Hypoplasie nasale, microcéphalie, …
• Physiques
– Irradiation X : Microcéphalie
Malformations congénitales
• Causes des malformations congénitales
Environnemental
7%
Génique
7%
Chromosomique
7%
Inconnu
57%
Multifactoriel
22%
Malformations congénitales
• Causes des malformations congénitales
– Multifactorielles
• Gènes de susceptibilité
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Malformations congénitales
• Types des malformations congénitales
– Morphogenèse incomplète
• Défaut de développement : Agénésie rénale
• Hypoplasie : Micrognathie dans le Syndrome de Treacher Collins
• Séparation incomplète : Syndactylie
• Fusion incomplète : Fentes labiales
Malformations congénitales
• Types des malformations congénitales
– Morphogenèse incomplète
• Défaut de développement : Agénésie rénale
• Hypoplasie : Micrognathie dans le Syndrome de Treacher Collins
• Séparation incomplète : Syndactylie
• Fusion incomplète : Fentes labiales
– Forme aberrante
• Sacrum en faucille
Malformations congénitales
• Types des malformations congénitales
– Morphogenèse incomplète
• Défaut de développement : Agénésie rénale
• Hypoplasie : Micrognathie dans le Syndrome de Treacher Collins
• Séparation incomplète : Syndactylie
• Fusion incomplète : Fentes labiales
– Forme aberrante
• Sacrum en faucille
– Tissu accessoire
• Chondromes prétragiens
• Polydactylie
Malformations congénitales
• Types des malformations congénitales
– Morphogenèse incomplète
• Défaut de développement : Agénésie rénale
• Hypoplasie : Micrognathie dans le Syndrome de Treacher Collins
• Séparation incomplète : Syndactylies
• Fusion incomplète : Fentes labiales, anomalies tube neural
– Forme aberrante
• Sacrum en faucille
– Tissu accessoire
• Chondromes prétragiens
• Polydactylie
– Défaut fonctionnel
• Arthrogrypose congénitale
Plan
• Généralités
– Mécanismes des anomalies du développement
– Quelques principes
– Quelques chiffres
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Plan
• Généralités
– Mécanismes des anomalies du développement
– Quelques principes
– Quelques chiffres
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Malformations congénitales
• Alcool
– Diagnostic :
• Signes cliniques neurologiques et dysmorphiques
• Présomption de la consommation d’alcool
– Questionnaires aux femmes enceintes… (DETA)
– FDR :
» > 30 ans
» bas niveau socio-économique
» binge drinking
Malformations congénitales
• Alcool
– Diagnostic :
• Signes cliniques neurologiques et dysmorphiques
• Présomption de la consommation d’alcool
– Questionnaires aux femmes enceintes… (DETA)
– FDR :
» > 30 ans
» bas niveau socio-économique
» binge drinking
– Diagnostic :
• Signes cliniques neurologiques et dysmorphiques
• Présomption de la consommation d’alcool
– Questionnaires aux femmes enceintes… (DETA)
– FDR :
» > 30 ans
» bas niveau socio-économique
» binge drinking
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Malformations congénitales
• Cigarette
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Malformations congénitales
• Fentes labiales et labio-palatines
2.2% 4%
10% 10%
Malformations congénitales
• Fentes labiales et labio-palatines
0.3%
4.3% 0.6%
0.3%
Malformations congénitales
• Fentes labiales et palatines
– Prévention :
• Acide folique
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Malformations congénitales
• Anomalies du tube neural
• J+28 à J+30
• Défaut de fermeture
Malformations congénitales
• Anomalies du tube neural
• Population générale
– 1 /1000
• Population générale
– 1 /1000
• FDR identifiés
– Antagonistes de l’acide folique (MTX, valproate, …)
– Carence nutritionnelle en folates
– Polymorphisme dans la Méthylène Tétrahydrofolate Réductase
MTHFR
– Origine géographique et ethnique (Bretagne, …)
Malformations congénitales
• Anomalies du tube neural
• Réduction du risque
– 50% environ
Plan
• Généralités
– Mécanismes des anomalies du développement
– Quelques principes
– Quelques chiffres
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Malformations congénitales
• Chromosomiques : Syndrome de Smith-Magenis
– 1/ 25.000
Malformations congénitales
• Chromosomiques : Syndrome de Smith-Magenis
– 1/ 25.000
– QI 20 – 80
– Dysmorphie faciale
• Traits grossiers, visage plat, lèvre supérieure recourbée et philtrum
court
– Malformations organiques
• Rénales, cardiaques, ophtalmologiques, …
– Comportement
• Automutilations, onychotillomanie, polyembolokoilomanie,
insensitivité à la douleur
– Sommeil
• Inversion rythme veille – sommeil (anomalie de la synthèse de
mélatonine)
Malformations congénitales
• Chromosomiques : Syndrome de Smith-Magenis
Malformations congénitales
• Chromosomiques : Syndrome de Smith-Magenis
– del17p11.2 ; 3,7 Mb
FISH
CGHarray
Caryotype
Malformations congénitales
• Chromosomiques : Syndrome de Smith-Magenis
– Prise en charge
• Non spécifique (orthophonie, psychomotricité, …)
• Béta-bloquant + mélatonine pour les troubles du rythme
nycthéméral
Avant traitement
Avant traitement
Après traitement
béta-bloquant
Après traitement
béta-bloquant +
mélatonine
Malformations congénitales
• Chromosomiques : Syndrome de Smith-Magenis
• Dup17p11.2
Quiz !
Malformations congénitales
• Quiz : Mécanisme ?
Malformations congénitales
• Quiz : Mécanisme ?
Malformations congénitales
• Quiz : Mécanisme ?
Malformations congénitales
• Quiz : Mécanisme ?
Malformations congénitales
• Quiz : Mécanisme ?
Malformations congénitales
• Quiz : SAF ?
Plan
• Généralités
– Mécanismes des anomalies du développement
– Quelques principes
– Quelques chiffres
• Malformations congénitales
– Causes des malformations congénitales
– Types de malformations congénitales
– Quelques exemples
• Environnementales :
– Alcool
– Cigarette
• Multifactorielles :
– Fentes labiales et labio-palatines
– Anomalies du tube neural
• Chromosomiques
– Syndromes de Smith-Magenis et Potocki-Lupski
• Approche dysmorphologique
Approche dysmorphologique
• Dysmorphologie
– Buts :
• Diagnostic
– Clinique
– Moléculaire
• Pronostic
• Traitement spécifique (très rare)
• Risque de récurrence
• Diagnostic prédictif
Approche dysmorphologique
• Les grandes étapes :
– Interrogatoire
– Examen clinique
– Examens paracliniques
– Grossesse
– Accouchement
– Etapes du développement
psychomoteur (assise, marche,
parole)
– Croissance staturo-pondérale,
périmètre crânien
– Malformations organiques
Approche dysmorphologique
• Interrogatoire :
– Grossesse
– Accouchement
– Etapes du développement
psychomoteur (assise, marche,
parole)
– Croissance staturo-pondérale,
périmètre crânien
– Malformations organiques
– Comportement
– Alimentation
– Sommeil
– Prise en charge
Approche dysmorphologique
• Interrogatoire :
– ATCD familiaux
– Médicaments, notamment
pendant la grossesse
– Autres substances
Approche dysmorphologique
• Interrogatoire :
– ATCD familiaux
– Médicaments, notamment
pendant la grossesse
– Autres substances
– Arbre généalogique
Approche dysmorphologique
• Examen clinique
1/2
1/3
1/3
1/2
1/3
Enfant Adulte Adulte
Approche dysmorphologique
• Examen clinique
1 1 1
Hypotélorisme
1 <1 1
Approche dysmorphologique
• Examen clinique
1 1 1
Hypertélorisme
1 >1 1
Approche dysmorphologique
• Examen clinique
1 1 1
Epicanthus
1 1 1
Approche dysmorphologique
• Examen clinique
1 1 1
Blépharophimosis
<1 1 <1
Approche dysmorphologique
• Examen clinique
FP haut dehors
Approche dysmorphologique
• Examen clinique
FP bas dehors
Approche dysmorphologique
• Examen clinique
Sourcils
Ensellure nasale
Ailes du nez
Narines
Columelle
Philtrum
Bouche
Cavité orale
Menton
Approche dysmorphologique
• Examen clinique
• Bilan métabolique
• Bilan métabolique
– A visée étiologique
• Caryotype leucocytaire
• (Cyto)génétique ciblée (gène, anomalie chromosomique)
• Génétique non ciblée (CGHarray, MLPA)
– En lignes
• OMIM – online mendelian inheritance in Man
• Orphanet
• GeneReview
• Pubmed
• …
Approche dysmorphologique
• Bases de données et aides au diagnostic
– En lignes
• OMIM – online mendelian inheritance in Man
• Orphanet
• GeneReview
• Pubmed
• …
– En lignes
• OMIM – online mendelian inheritance in Man
• Orphanet
• GeneReview
• Pubmed
• …
– Souvent longue
• Special Report : A Review of Environmental Risk Factors for Congenital Anomalies, EUROCAT,
Edition 1, 2004