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Gilles Frison.
Introduction aux mthodes de chimie quantique
frison@dcmr.polytechnique.fr
01 69 33 48 34
http://www.dcmr.polytechnique.fr/~frison
Etat
Gazeux
Liquide et
Macromolcules
Solide
priodique
Degrs de libert
Limits par
le nombre de
particules
Trs grands
Rduits par
symtrie
Mcanique classique
Thermodynamique
statistique
Trivial
Possible
Facile
Mcanique quantique
Possible
Impossible
directement
Possible
Conformations
Isomries
Mcanismes
ractionnels
Elments
inhabituels
Mcanique classique
Thermodynamique
statistique
Oui
Non
Non
Non
Mcanique quantique
Oui
Oui
Oui
Oui
Confrontation thorie/exprience
Les expriences donnent souvent une information
indirecte, leur dconvolution est parfois difficile
Les conditions exprimentales ont parfois une
influence essentielle sur la proprit mesure
Les calculs de niveaux de sophistication croissants
donnent accs des valeurs converges
Theoretical chemistry : full partner with experiment
W. A. Goddard, Science 1985, 227, 917
Relation thorie/exprience
La thorie vient aprs lexprience, pour confirmer linterprtation
des rsultats, interprter des rsultats mystrieux, proposer de
nouveaux modles prdictifs.
Thorie et exprience avancent simultanment, en v-et-vient :
les calculs servent optimiser les conditions exprimentales, les
rsultats exprimentaux rduisent le champ dinvestigation des
calculs, jusqu la convergence.
Les calculs prcdent lexprience lorsquelle est particulirement
difficile, voire la remplacent :
- en milieu extrme (astrophysique ; toxiques ; explosifs)
- de cot excessif (screening et nouveaux mdicaments)
La chimie quantique
Le dveloppement de thories, dalgorithmes et de programmes
(domaine rserv des chimistes thoriciens).
Le dveloppement de modles, porte plus limite que celle des
thories mais plus applicables, bass sur les connaissances spcifiques
dun domaine (en particulier exprimentales) : pas particulirement
lapanage des thoriciens.
Modles simples
La chimie calculatoire : lutilisation de chanes de programmes standardises, user-friendly, comme une technique, une spectroscopie
parmi dautres dans larsenal de tout chimiste.
Calculs rigoureux
Classique
Gaussian
NWChem
MOPAC
Jaguar
Turbomole
HyperChem
Chem3D
SYBYL
GROMOS
CHARMm
Moyens de calcul
A lchelle du laboratoire
PC simples ou amliors
Contexte
Pourcentage darticles thoriques dans Inorganic Chemistry
pourcentage
14.00
12.00
10.00
8.00
6.00
4.00
2.00
0.00
1994 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005
DFT
annes
Source : ISI Web of science
Objectifs
Connaissance des mthodes classiques en
chimie quantique
Permettre un regard critique sur les rsultats
thoriques
Plan du cours
1-Mthodes ab initio
Thorie de HF
Mthodes post-HF
2-Mthodes DFT
3-Mthodes semiempiriques
4-Mthodes Mixtes
Aspects thoriques
Exemples de ce que lon peut modliser, et avec quelle prcision
Hartree-Fock
Principe variationnel
Dterminant de Slater
Mthode SCF
LCAO et base dOA
Thorme de Koopmans
ROHF et UHF
Limites de HF
La fonction donde
Systme avec n lectrons et M noyaux
Proprits de
(1)
(v , v ,,v ) (v , v ,,v ) dv dv dv
=1
=<|>
Proprits de
(2)
(v , v ,,v ) A (v , v ,,v ) dv dv dv
1 2
n
1 2
n = <|A|>
1 2 n
Observable A
Position x, y, z, r
Multiplication par x, y, z, r
Impulsion p
nergie cintique
nergie potentielle
nergie totale
Moment cintique
Equation de Schrdinger
H
H
= E
(1)
E=<|H|>
Expression du hamiltonien
h2
h2
e2ZN
e 2 Z NZ M
e2
H =
N
+
+
i
2me i
N 2MN
N,i 4 0r iN
N<M 4 0r NM
i< j 4 0r ij
Te : Energie cintique
des lectrons i de
masse me
TN : Energie cintique des
noyaux N de masse MN
VNe : Attractions
coulombiennes
lectron - noyau
VNN : Rpulsions
noyau - noyau
Vee : Rpulsions
lectron lectron
En units atomiques :
1
1
ZN
Z NZ M
1
H =
N i
+
+
2 i
N 2mN
N,i r iN
N<M r NM
i< j r ij
Approximations (1)
Approximation stationnaire
Lhamiltonien du systme ne contient pas de termes
dpendant explicitement du temps
Approximations (2)
Approximation de Born-Oppenheimer : on dcouple les
mouvements des lectrons de ceux des noyaux.
Les masses des noyaux tant grandes devant celles des lectrons,
leurs mouvements sont lents. On peut rsoudre une quation de
Schrdinger pour le mouvement des lectrons dans le potentiel
cr par les interactions noyau-noyau et lectron-noyau.
Formellement : on admet que loprateur nergie cintique
des noyaux ne couple pas des fonctions lectroniques diffrentes.
Lquation de Schrdinger est rsolue pour le mouvement
des lectrons.
Les positions des noyaux sont des paramtres.
Surface de potentiel
Minimum 2
Minimum 1
1 1
1 1
, et = , , appeles spin et spin
2 2
2 2
Pour N lectrons :
S = s
N
Le principe variationnel
H =
N
1
1
Z
Z Z
1
N i N + N M +
2mN
2 i
N,i r iN
N<M r NM
i< j r ij
Echelle nergtique
Fonction donde
associe
Energie
E0
essai
Principe de rsolution de
lquation de Schrdinger
H tant connu, chercher parmi toutes les fonctions donde
possibles celle qui donne lnergie la plus basse.
On cherche minimiser la fonctionnelle E[
] = < | H | >
Echelle nergtique
Fonction donde
associe
Energie
Limite du sous-ensemble
E0
essai
Approximation orbitale
On approche la fonction donde o par un produit de fonctions i
dpendant chacune des coordonnes (despace et de spin) dun seul
lectron.
i : spinorbitales
Consquence physique
Lapproximation orbitale revient considrer que les lectrons se
meuvent indpendamment les uns des autres.
La probabilit de trouver un lectron dans lorbital i aux coordonnes ri ne
dpend pas de la position des autres lectrons
condition respecter :
Principe de Pauli
2 lectrons ne peuvent tre dcrit par une mme spinorbitale
fonction de
spin ( ou )
(4)
fonction despace
(orbitale molculaire)
DS (x1,x2,,xi,,xn) =
Notation simplifie:
n!
1(x1) 2(x1)...
i(x1) ... n(x1)
1(x2) 2(x2)...
i(x2) ... n(x2)
...
1(xi) 2(xi) ...
i(xi) ... n(xi)
...
1(xn) 2(xn)...
i(xn) ... n(xn)
DS =
n!
1 2... i
... n
(5)
Hartree-Fock
La solution Hartree-Fock (
HF) de lquation
de Schrdinger correspond au meilleur
dterminant de Slater DS
Les variables : les spinorbitales i
Lnergie est une fonctionnelle des spinorbitales E[{
i}]
Echelle nergtique
Fonction donde
associe
Energie
essai
EHF
Limite Hartree-Fock
HF
E0
i = 1, 2, , n
(6)
i : nergie de lorbitale i
F : oprateur de Fock. Cest un hamiltonien monolectronique
Oprateur de Fock
HHF
= F(i) = H =
i=1
1
[-_
i
i=1
_ZA +
1
_
]
i=1 j>i
rij
ZA
_
A=1 riA
h(i)
+ VHF(i)
Potentiel Hartree-Fock
(champs moyen exerc par les autres
lectrons sur llectron i)
E=
*
(1,2 ) (1,2 )dv1dv 2
H(1,2)=h(1)+h(2)+ 1
r12
(1,2)=1(1)2(2)
1
2 (2 )h(1)2 (1)1 (2 )dv1dv 2 = 0
= 1
*
*
1 (1)2 (2 )
1
1 (1)2 (2 )dv1dv 2 = J12
r12
Intgrale coulombienne
*
*
(
)
1
2 (2 )
1
2 (1)1 (2 )dv1dv 2 = K12
r12
Intgrale dchange
(nulle pour des spins diffrents)
i, j
VHF(1)
1
J n (1) i (1) = dv2 n* (2 ) n (2 ) i (1)
r12
1
K n (1) i (1) = dv2 n* (2 ) i (2 ) n (1)
r12
Mthode SCF
Rsoudre le systme dquation F i = i i (cest dire
dterminer les i) ncessite de connatre F qui dpend luimme des i via les intgrales J et K
Impossible directement
Utilisation dune technique itrative appele mthode du
champ auto-cohrent, ou en anglais self-consistent field
(SCF)
Mthode SCF
Dbut : jeu initial de
spinorbitales i (l)
l=0
Calcul des
intgrales J (l)
et K (l)
Le champs moyen
est connu
Rsolution de
F(l) i = i i
l = l+1
Nouveau jeu
i (l+1)
i (l+1) devient
le jeu initial
Solution
converge
oui
non
Calcul de
lnergie E(l+1)
Echelle nergtique
Fonction donde
associe
Energie
EDS
DS
EHF
Limite Hartree-Fock
HF
nergie de corrlation EC
EC = E0 - EHF
E0
i = 1,, n
Ha
Hb
Ha
Hb
Energie (eV)
N N+
14.5
N+ N2+
29.6
N2+ N3+
47.4
N6+ N7+
666.8
TOTAL
1485
Ha
Ha
Hb
Superposition des OA HF
Ha
Hb
OM HF
Hb
Orbitale Molculaire
Coefficient
Orbitales Atomiques
i = i = cij j
j=1
F i = i i
variables : i
i = cij j
j=1
Intgrales monolectroniques
n
i=1
L2 intgrales
Intgrales bilectroniques
J et K
(1)
1
_
(1)
b
L4 intgrales
Il faut :
* Trouver un compromis entre la
taille de la base et la prcision
* Trouver des pour lesquelles
les intgrales sont simples
numriquement rsoudre
Choix des i
les orbitales de latome hydrognode (atome un lectron)
nlm = Rn,l(r)Ylm(,)
Rn,l(r) fonction radiale
Ylm(,) harmonique sphrique
n nombre quantique principal
n entier positif
g=N
xa
yb
zc
2
-r
e
gaussienne "primitive"
gc = i di gi
gaussienne "contracte"
SV (Split-Valence)
chaque orbitale atomique de cur est reprsente par une gaussienne contracte (le cur
est reprsent par une base minimale) et chaque orbitale atomique de valence est
reprsente par plusieurs gaussiennes contractes (la valence est DZ, TZ,).
Exemple : 6-31G
Exemple 1
Atome dHydrogne. Base 6-31G
Valence : orbitale 1s : deux gaussiennes contractes avec 3 et 1 primitives
3 gaussiennes primitives
type s (valence)
1 gaussienne
type s (valence)
H0
S 3 1.00
0.1873113696D+02
0.2825394365D+01
0.6401216923D+00
S 1 1.00
0.1612777588D+00
Exposants
0.3349460434D-01
0.2347269535D+00
0.8137573261D+00
0.1000000000D+01
Coefficients di
Fonctions de polarisation
Lors de la formation de liaisons, la densit se dforme
par rapport leur symtrie initiale dans les atomes
(polarisation)
On ajoute des orbitales de nombre quantique azimutal (l)
plus lev que celui correspondant aux orbitales de
valence de latome ("orbitales atomiques" p pour
lhydrogne, d pour le carbone,)
Cela sindique par la lettre P, une (ou deux) toile(s) (*)
ou la nature des orbitales ajoutes (p, d, )
Exemples :
SVP
6-31G* = 6-31G(d)
6-31G** = 6-31G(d,p)
Fonctions diffuses
Ces gaussiennes ont de trs petits exposants et leur
dcroissance en fonction de la distance au noyau est
donc lente.
Elles sont ncessaires pour dcrire correctement la partie
externe de la densit (anions, liaisons faibles de type van
der Waals,)
Habituellement, ce sont des orbitales de type s ou p
Cela sindique par un (ou deux) signe(s) +
Exemple :
6-311+G(2df,2p)
Exemple 2
Oxygne en 6-311+G(2df,2p)
6 gaussiennes primitives
type s (cur)
3 gaussiennes primitives
types s et p (valence)
2 x 1 gaussiennes
types s et p (valence)
1 gaussienne
types s et p (diffuse)
2 x 1 + 1 gaussiennes
types d et f (polarisation)
O0
S 6 1.00
0.000000000000
0.8588500000D+04 0.1895150083D-02
0.1297230000D+04 0.1438590063D-01
0.2992960000D+03 0.7073200310D-01
0.8737710000D+02 0.2400010105D+00
0.2567890000D+02 0.5947970261D+00
0.3740040000D+01 0.2808020123D+00
SP 3 1.00
0.000000000000
0.4211750000D+02 0.1138890124D+00 0.3651139738D-01
0.9628370000D+01 0.9208111006D+00 0.2371529830D+00
0.2853320000D+01 -0.3274470358D-02 0.8197019412D+00
SP 1 1.00
0.000000000000
0.9056610000D+00 0.1000000000D+01 0.1000000000D+01
SP 1 1.00
0.000000000000
0.2556110000D+00 0.1000000000D+01 0.1000000000D+01
SP 1 1.00
0.000000000000
0.8450000000D-01 0.1000000000D+01 0.1000000000D+01
D 1 1.00
0.000000000000
0.2584000000D+01 0.1000000000D+01
D 1 1.00
0.000000000000
0.6460000000D+00 0.1000000000D+01
F 1 1.00
0.000000000000
0.1400000000D+01 0.1000000000D+01
OA
Primitives
Energie
STO-3G
3-21G
6-31G
6-31G(d)
6-31G(d,p)
6-311G(d,p)
6-311++G(d,p)
6-311++G(3df,2p)
Aug-cc-PVTZ
Aug-cc-PVQZ
Aug-cc-PV5Z
7
13
13
18
24
30
36
59
92
172
287
21
21
30
36
42
48
54
82
127
241
425
-74,959350
-75,584483
-75,984302
-76,009250
-76,023120
-76,046996
-76,053424
-76,058378
-76,061203
-76,066672
-76,068003
Limite HF
-76,075
Temps (s)
1
1
1
1
1
1
1
3
51
759 (12min39s)
8928 (2h30)
oui
Etapes ultrieures
ventuelles
non
Optimisation de gomtrie
La structure dune molcule quelconque, comportant N atomes,
est spcifie par 3N-6 coordonnes.
Lnergie est donc une hypersurface 3N-5 dimensions.
Calcul du gradient
de lnergie (et )
Converg ?
non
oui
Gomtrie optimise
Variation de
la gomtrie
Structure de H2O
Valeurs exprimentales : O-H = 0.9578 , HOH = 104.48
Fonctions
Distance
O-H
Angle
HOH
Base
de base
HF
MP2
HF
MP2
STO-3G
0.989
1.014
100.00
97.27
3-21G
13
0.967
0.989
107.69
105.19
6-31G
13
0.950
0.974
111.50
109.37
6-31G*
18
0.948
0.969
105.58
104.14
cc-pVDZ
24
0.9463
0.9649
104.61
101.90
cc-pVTZ
58
0.9406
0.9591
106.00
103.59
cc-pVQZ
115
0.9396
0.9577
106.22
104.02
cc-pV5Z
211
0.9396
0.9579
106.33
104.29
cc-pV6Z
322
0.9396
0.9581
106.33
104.36
Base
HF
MP2
STO-3G
1.709
1.600
3-21G
2.387
2.308
6-31G
2.501
2.463
6-31G*
2.191
2.195
cc-pVDZ
2.057
1.964
cc-pVTZ
2.026
1.922
cc-pVQZ
2.008
1.904
cc-pV5Z
2.003
1.895
Moment dipolaire de CO
Valeur exprimentale : 0.122 D
C- O+
Base
HF
MP2
CCSD(T)
cc-pVDZ
-0.255
0.296
0.141
cc-pVTZ
-0.263
0.280
0.127
cc-pVQZ
-0.265
0.275
0.118
cc-pV5Z
-0.265
0.273
0.115
Thorme de Koopmans
quations de HF : F i = i i
.
.
.
j
i
.
.
.
-HOMO
Calculs HF/6-31G*
eV
kJ/mol
eV
kJ/mol
H2C
CH2
10,51
1014
10,19
983
HC
CH
11,40
1100
11,00
1062
9,07
875
8,75
844
9,24
892
9,02
870
8,83
852
8,65
835
12,62
1218
13,53
1305
10,84
1046
12,03
1161
10,48
1011
11,85
1143
CH2
H2C
CH3
H2O
H3C
OH
OH
H3C
arrachement de
llectron i en
gelant les i
M-i+
M =
HF
1
n!
|12i-1ii+1n |
Mg-i+ =
DS
1
(n-1)!
|12i-1i+1n |
HF
DS g
HF
DS
attention :
EHF
=<
HF |
H|
HF
> i
i=1
DS
E
DS g
EM-i+
HF
EM-i+
M-i+
EM-i+
-i
HF
IE(i)
IE(i)
EHF
M
corrlation
M
E0M
Compensation derreur entre corrlation et relaxation
Pas de compensation derreur pour laffinit lectronique
ROHF et UHF
spinorbitale- : i = i
note
spinorbitale- : i = i
note
Restricted-Open Shell HF
(ROHF)
Unrestricted HF
(UHF)
s(s+1) = <|S2|>
0,176
0,146
E(UHF) = -38,9213052 Eh
E = 13,2 kJ/mol
-0,097
-0,408
-0,453
-0,581
-0,590
-0,614
-0,777
-0,828
-0,949
-11,229
Calcul ROHF
-11,208
-11,257
Calcul UHF