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Evaluation du package Heemod et mise en place
d’un tableau de synthèse en Shiny pour l’analyse de

coût-efficacité
CARRANZA ALARCON, Yonatan
Les sixièmes rencontres R à Anglet

29 Juin 2017
Evaluation médico-économique
Modèle multi-état
Package Heemod
Tableau de synthèse
Conclusion
Références
Plan
1 Evaluation médico-économique
Pourquoi l’analyse et l’évaluation de coût-efficacité ?
2 Modèle multi-état
3 Package Heemod
4 Tableau de synthèse
5 Conclusion
2/23 CARRANZA ALARCON, Yonatan Biostatisticien - AngletR 2017

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Plan
3 Package Heemod
5 Conclusion

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Evaluation du coût 1 et de l’efficacité 2 (i.e. médico-économique)

de deux stratégies thérapeutiques pour le traitement d’une pa-
thologie spécifique (i.e. la fièvre, le cancer, ...).
Le schéma de l’évaluation médico économique.
1. Permettre l’allocation efficace des ressources de santé limitées.

2. Améliorer la qualité de vie ainsi que l’espérance de vie.
Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
1 Comparaison objective de deux stratégies thérapeutiques afin de

maximiser en termes d’efficacité (de gain de santé) et de minimiser en
termes de coût (des ressources engagées pour atteindre une performance
donnée).
2 Vise à savoir si le prix donné à un traitement est justifié par rapport à
l’amplitude du gain en santé que cela va apporter aux patients (i.e.
efficacité).
3 Permet la négociation de fixation du prix des médicaments et de leur
remboursement avec les parties prenantes.
4 L’évaluation coût-efficacité peut être exprimée comme le ratio incrémental
coût/efficacité (ou Incremental Cost-Effectivenness Ratio (ICER)).
CostA CostB
ICER =
E↵ectA E↵ectB

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Plan
3 Package Heemod
5 Conclusion

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Modèles multi-état - Médico Economique
Les états de santé peuvent être modélisées par une chaine de

Markov 3 X (t) à état discret S = {1, 2, ..., r } et à temps
discrets t 2 Z+ .
3. Le caractère de cette chaine peut être homogène ou non ainsi que semi-homogène.
Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
La probabilité de transiter de l’état h à j est représenté par :

Phj (t, t + ) = P(X (t + ) = j|X (t) = h), d’où est la longueur
du cycle d’étude (e.g. annuel, mensuel, ...).
La probabilité de transition est extraite à partir d’autres résultats
d’études, de méta-analyses, de registres, ou d’hypothèses. Elle sont
bien fondées et justifiées dans une approche « evidence-based
medecine ».
Par exemple dans un modèle de survie à 2 états où l’événement
d’intérêt est la mort d’un patient à cause d’une maladie.

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Simulation Modèle Multi-état [2]
N X
X S
CostA = ps,ti ⇤ cs,A
i=1 s=1
N X
X S
E↵ectA = ps,ti ⇤ es,A
i=1 s=1
CostA CostB
ICER =
E↵ectA E↵ectB
d’où ps,ti est le nombre de pa-
tients dans l’état s et le temps
ti , cs,A est le coût à l’état s
et es,A l’effectivité ou gain de
santé à l’état s.

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Plan
3 Package Heemod
5 Conclusion

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Health Economic Evaluation MODelling (Heemod [4] )

Heemod 3 supporte de modèle multi-état de type markovien, l’analyse de
coût-efficacité (ICER), l’analyse probabiliste de sensibilité (i.e.
incertitude) et la comparaison de plusieurs stratégies. Nous avons
évalués :
Evaluation de la robustesse du package à des situations extrêmes

(e.g. de résultats précis numériquement)
Evaluation de la mise en pratique de divers cas particuliers réels tels
que [3] et [1] (e.g. calcul de la mise en jour de coût- efficacité par
période et non par cycle).
Evaluation de la mise en forme sur la présentation de résultats
d’analyse d’incertitude (PSA).
Nous avons contribué à certains modifications afin de certifier le package.

3. https://github.com/pierucci/heemod
Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Plan
3 Package Heemod
5 Conclusion

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Tableau de Synthèse
Pourquoi une Application Web ?

1 Une interface ergonomique pour l’utilisateur final (H.A.S.).
2 Disponible à partir d’un navigateur web les 7 jours / 24 heures.
3 Flexible et évolutive à implémenter pour le développeur.
Pourquoi une architecture à composantes ?
1 Création et test des nouvelles composantes web indépendants
de l’application web principal.
2 Couplage faible entre composantes et modules (c-à-d. faible
interaction entre eux).
3 Réutilisation de composantes et/ou de modules dans une autre
application web.

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Principaux caractéristique
1 Package développé avec l’approche de Programmation Orienté
à Objet (i.e. package R6).
2 Hiérarchie des composantes web avec un système de routage
par composante (i.e. une URL donnée à une page web précise,
Shiny Routes), inspiré de l’architecture AngularJS2.

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Nom : Web Application for Health Economics Decision Making

(WAHEco).
Github : https://github.com/salmuz/WAHEco
Classes principales :
1 AppRoot : Noyau principal de l’Application Web, il s’occupe
de gérer les modules.
2 AppModule : Class abstraite utilisé pour créer une nouvelle
module qui contiendrait les composantes web. Il existe une
implémentation de “base” nommé SimpleModule.
3 AppComponent : Class abstraite utilisé pour créer l’interface
web personnalisé (i.e. méthode view(..)) et la logique
d’interaction Client-Serveur (i.e. méthode server(..)).

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Tableau de Synthèse - Exemple 01

> l i b r a r y (WeMeco)
> appRoot < AppRoot $new ( t i t l e = "App . � T e s t i n g " )
> shinyApp (
u i = appRoot $ u i ( ) ,
s e r v e r = appRoot $ s e r v e r ( )
)

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références

l i b r a r y ( WeMeco )
appRoot < AppRoot $ new ( t i t l e = "App . � T e s t i n g " )
simpleModule < S i m p l e M o d u l e $ new ( t i t l e = " P r e m i e r e � mo du le " )
SimpleComponent < R6Class (
c l a s s n a m e = " SimpleComponent " ,
i n h e r i t = AppComponent ,
public = l i s t (
i n i t i a l i z e = f u n c t i o n ( t i t l e = " T e s t i n g " , path = "/ t e s t i n g " , n s i d = " t e s t nsi
s u p e r $ i n i t i a l i z e ( t i t l e , path , n s i d )
},
view = f u n c t i o n (){
fluidPage ( t i t l e P a n e l (" Testing " ))
},
server = function () {
f u n c t i o n ( input , output , s e s s i o n , . . . ) {
}
},
item = f u n c t i o n (){
menuSubItem ( t e x t = "DSA" , h r e f= p r i v a t e $ROUTE_PATH, n e wt a b = FALSE ,
icon = shiny : : icon ( " cubes " ))
}
)
)
s i m p l e C o m p o n e n t < S i m p l e C o m p o n e n t $ new ( t i t l e = " Composante � v i d e " )
s i m p l e M o d u l e $ addComponent ( s i m p l e C o m p o n e n t )
appRoot $ addModule ( s i m p l e M o d u l e )
s h i n y A p p ( u i = a ppR oo t $ u i ( ) , s e r v e r = app Roo t $ s e r v e r ( ) )
Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Tableau de Synthèse - Cas Stents
Source d’inspiration : L. Baschet et

al. “Cost-effectiveness of drug-eluting
stents versus bare-metal stents in pa-
tients undergoing percutaneous coronary
intervention”
Objectif : Le principe est d’évaluer le
coût-efficacité de stents nu contre le
stents actifs, chez les patients néces-
sitant d’une Intervention coronarienne
percutanée en France.
Modélisation : Il a été modélisé avec 6
états de santés.

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Plan
3 Package Heemod
5 Conclusion

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Conclusion
Heemod est un package robuste prenant en compte plusieurs

contraintes de l’évaluation médico-économique, et ses résultats
précis certifient l’utilisation pour le décideurs.
Heemod est en évolution afin de pouvoir prendre en compte plus de
cas médico-économique concrets, appliqués, possibles à l’avenir !.
Le package WAHEco peut être utilisé pour d’autres projets web du
genre : R + Shiny, grâce à leur flexibilité et leur portabilité de
composantes.
Malheureusement, la validation externe n’a pas pu être achevée avec
succès dû à l’approche flexible (i.e. plusieurs hypothèses) qui porte
les modèles médico-économiques. Cependant, nous somme en train
d’envisager une validation externe avec le logiciel TreeAge
(http://treeage.com/).

Modèle multi-état
Package Heemod
Conclusion
Références
Réferences
Joshua A. Ray et al. “An Evaluation of the Cost-Effectiveness of Rituximab in Combination

with Chemotherapy for the First-Line Treatment of Follicular Non-Hodgkin’s Lymphoma in the
UK”. In : PharmacoEconomics 13.4 (2010), p. 346–357. doi : 10.1111/j.1524-4733.2009.00676.x.
G. Baio. Bayesian Methods in Health Economics. Chapman & Hall/CRC Biostatistics Series.
Taylor & Francis, 2012. isbn : 9781439895559. url :
https://books.google.fr/books?id=m73l%5C_jXLnCsC.
L. Baschet et al. “Cost-effectiveness of drug-eluting stents versus bare-metal stents in patients

undergoing percutaneous coronary intervention”. In : Open Heart (2016). doi :
10.1136/openhrt-2016-000445. url : http://dx.doi.org/10.2165/00019053-199813040-00003.
Antoine Filipovié-Pierucci, K. Zarca et I. Durand-Zaleski. “Markov Models for Health Economic

Evaluation : The R Package heemod”. In : ArXiv e-prints (fév. 2017). R package version 0.9.0.
eprint : 1702.03252 (stat.AP). url : https://pierucci.org/heemod.

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Package Heemod
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Evaluation du coût 1 et de l’eﬃcacité 2 (i.e. médico-économique)

1. Permettre l’allocation eﬃcace des ressources de santé limitées.

Pourquoi l’analyse et l’évaluation de coût-eﬃcacité ?

1 Comparaison objective de deux stratégies thérapeutiques afin de

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6/23 CARRANZA ALARCON, Yonatan Biostatisticien - AngletR 2017

Modèles multi-état - Médico Economique

Les états de santé peuvent être modélisées par une chaine de

Modèles multi-état - Médico Economique

La probabilité de transiter de l’état h à j est représenté par :

7/23 CARRANZA ALARCON, Yonatan Biostatisticien - AngletR 2017

Modèles multi-état - Médico Economique

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Simulation Modèle Multi-état [2]

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9/23 CARRANZA ALARCON, Yonatan Biostatisticien - AngletR 2017

Health Economic Evaluation MODelling (Heemod [4] )

Evaluation de la robustesse du package à des situations extrêmes

Nous avons contribué à certains modifications afin de certifier le package.

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Pourquoi une Application Web ?

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Nom : Web Application for Health Economics Decision Making

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Tableau de Synthèse - Exemple 01

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Tableau de Synthèse - Exemple 02

Tableau de Synthèse - Exemple 03

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Tableau de Synthèse - Cas Stents

Source d’inspiration : L. Baschet et

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Tableau de Synthèse - Cas Stents

17/23 CARRANZA ALARCON, Yonatan Biostatisticien - AngletR 2017

Tableau de Synthèse - Cas Stents

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20/23 CARRANZA ALARCON, Yonatan Biostatisticien - AngletR 2017

Heemod est un package robuste prenant en compte plusieurs

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Joshua A. Ray et al. “An Evaluation of the Cost-Eﬀectiveness of Rituximab in Combination

L. Baschet et al. “Cost-eﬀectiveness of drug-eluting stents versus bare-metal stents in patients

Antoine Filipovié-Pierucci, K. Zarca et I. Durand-Zaleski. “Markov Models for Health Economic

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