Paul Sabatier

Mars 2007

M a g a z i n e s c i e n t i f i q u e - n u m é r o 9

Dossiers

Biologie
végétale
Génie
des
procédés

Avec la participation de
la Délégation Midi-Pyrénées du CNRS
www.ups-tlse.fr
 édito

Un seul mot d’ordre : coopérer…

Vous allez découvrir une nouveauté dans la page de couverture de ce numéro : la mention
de la participation de la délégation Midi-Pyrénées du CNRS
à la réalisation du magazine scientifique Paul Sabatier.

Il faut rappeler que la raison d’être de ce magazine est de

faire connaître à l’extérieur et à l’intérieur de notre
université les plus importants résultats des équipes de
recherche. Et, c’est un fait qu’une partie significative de nos
laboratoires sont des unités mixtes avec le CNRS, où
travaillent en parfaite harmonie des enseignants-
chercheurs et des chercheurs.

Cette participation de la délégation du CNRS ne peut être

que bénéfique pour le magazine et pour la diffusion, vers
MAGAZINE UPS un public de plus en plus important, des principaux
N° 9 — MARS 2007 résultats scientifiques et des enjeux de la recherche.

© Emmanuel Grimault 2003

Illustration Nous avons l’espoir que dans les prochaines semaines
de couverture : l’administration régionale de l’INSERM, fortement
Visualisation de
l'expression d’un gène impliquée dans nos laboratoires de recherche dans le
dans les organes floraux
de la plante modèle
domaine de la santé, participe aussi à la réalisation du
Arabidopsis thaliana magazine.
après transformation
génétique. Nous avons eu l’occasion de mentionner dans des numéros
Directeur précédents l’apparition récente de nouvelles structures à caractère régional, les RTRA
de la publication :
(réseaux thématiques de recherche avancée) et les RTRS (réseaux thématiques de recherche
Jean-François Sautereau
Rédacteur en chef : et de soins), qui ont pour objet de rendre plus visibles, mieux coordonnées, les compétences
Daniel Guedalia
Comité de rédaction : existant sur le site toulousain ou régional. Mais il ne faut pas oublier que depuis plusieurs
Isabelle Berry années, la politique de site était déjà devenue une réalité entre les différents établissements.
Patrick Calvas
Jean-Pierre Daudey En particulier, dans le cas de certaines thématiques scientifiques, le potentiel de recherche
Daniel Guedalia est réparti entre plusieurs établissements, ce qui rend nécessaire une coopération entre leurs
Alexandra Guyard
Guy Lavigne équipes et leurs laboratoires.
Et
Carine Desaulty, Nous avons souhaité illustrer cette situation, où une discipline est partagée entre plusieurs
délégation Midi-Pyrénées
du CNRS établissements, par le choix des deux dossiers scientifiques présentés dans ce numéro :
Conseillère de rédaction : Celui sur la Biologie végétale, domaine où l’UPS a deux importants laboratoires, qui
Anne Debroise
Ont participé collaborent dans le cadre de l’Institut Fédératif « Agrobiosciences, Interactions et Biodiversité »
à ce numéro :
avec des équipes appartenant à l’INRA, au CNRS, à l’INP.
Coordination dossiers
scientifiques : Celui sur le Génie des procédés, domaine où les équipes de l’UPS sont en interaction
Biologie végétale :
Marie-Ange Albouy
avec le fort potentiel existant à l’INP.
Génie des procédés : Dans ces deux exemples, c’est le potentiel du site qui est de plus en plus visible au niveau
Martine Poux
Conception graphique national et international et chaque établissement ou organisme accompagne avec ses
et impression : moyens cet effort collectif. Dans d’autres domaines scientifiques, par contre, c’est l’un
Ogham-Delort
05 62 71 35 35 n°8096 des établissements qui porte la presque totalité du potentiel.
Nous avons réservé une double page pour vous faire connaître les deux lauréats (1er et 3ème)
dépôt légal :
Mars 2007 des prix à l’innovation en Midi-Pyrénées.
ISSN : 1779-5478
Tirage : 2000 ex. Ces deux exemples de débouchées sur l’innovation, ainsi que les deux dossiers, montrent
bien la continuité existant entre ce que l’on appelle une recherche de base et une recherche
Université Paul Sabatier
appliquée.
118, route de Narbonne
31062 Toulouse cedex 9 Je vous souhaite une agréable lecture.

Jean-François SAUTEREAU
Président de l’Université
sommaire
Dossier :
4
Biologie végétale

12
Prix de l’innovation
- Du talc dans l’espace
- Des micro-organismes dans…

14
Vie des laboratoires
- Dans les secrets de la mousson africaine
- Prévoir l’évolution d’un cancer
- Ils ont réinventé la crémaillère
- NARVAL scrute la vie magnétique des étoiles

Dossier :
18
Génie des procédés

26
A propos de…
- Les écoles doctorales

Vos encouragements, vos critiques, vos suggestions, une seule adresse :

revue-paulsabatier@adm.ups-tlse.fr
Vous pouvez consulter et télécharger ce magazine et les numéros antérieurs
sur le site www.ups-tlse.fr (rubrique «Recherche»)
dOSSIER BIOLOGIE VÉGÉTALE

Les plantes recèlent-elles

encore des secrets ?
Elles ont beau être nos alliées depuis la nuit des temps, les plantes ne
cessent de nous étonner et leur potentiel reste encore loin d’être
complètement exploité…

La contribution des végétaux à notre qualité de trois génomes : nucléaire, mitochondrial et

>>> Raoul RANJEVA, directeur de recherche
CNRS au Laboratoire « Surface cellulaire et
signalisation chez les végétaux »
(SCSV, unité Mixte UPS/CNRS).
Visiting Miler Professor UC Berkeley
>>> Zinnia Elegans : plante horticole fleurissant
nos jardins utilisée en laboratoire pour étudier
la vascularisation chez les végétaux.
vie est tellement naturelle qu’il arrive qu’on en
oublie l’importance. Les plantes fournissent à
l’homme, en effet, la base de sa nourriture mais
également de nombreux matériaux pour la
construction ou pour l’habillement. Capables de
synthétiser de très nombreuses substances qui
leur sont spécifiques, les plantes sont connues
pour être des sources de médicaments et pour
égayer les paysages par la variété de leurs formes.
A ces propriétés exceptionnelles, il faut rajouter
le caractère renouvelable (en principe) des
ressources végétales et l’effet protecteur de la
végétation contre l’érosion des sols. Les végétaux
ont aussi permis de découvrir des lois de portée
générale en biologie : la transmission
mendélienne des caractères génétiques,
les transposons (gènes sauteurs) ou, encore
récemment, le rôle de l’ARN interférant dans
la régulation de l’expression des gènes. Plus
spécifiquement, la compartimentation génétique
est particulièrement marquée chez les plantes
puisque, dans la cellule végétale, s’expriment
plastidial.
Ces propriétés, ainsi que la simplicité
morphogénétique qui permet de contrôler leur
processus de dédifférenciation/différenciation,
font des plantes un modèle singulier d’étude
du processus de développement.
L’exploitation extensive et intensive des
ressources a fragilisé le caractère renouvelable
des espèces végétales jusqu’à remettre en cause
notre mode de vie. Dans les pays développés, le
souci est maintenant de passer de la production
quantitative à la production qualitative avec
l’impératif de la préservation de l’environnement.
Dans ce contexte, les potentialités des végétaux
sont à explorer et à approfondir par les chercheurs.
Dialogues chimiques
Comprendre les dialogues chimiques et
physiques entre les plantes et leur
environnement devient un enjeu vital et
constitue en soi un thème de recherche
important sous le terme « signalisation ».
>>>

L’Institut Fédératif de Recherche 40

La communauté scientifique toulousaine impliquée dans l’étude des plantes comprend, en plus des acteurs universitaires
présents dans les laboratoires SCSV et EDB, une communauté beaucoup plus large regroupée dans un Institut Fédératif
de Recherche, l’IFR40, intitulé « Agrobiosciences, interactions et biodiversité ». Cet institut créé en 1996 réunit aujourd'hui
environ 350 personnes réparties dans 6 unités de recherche* représentant 5 établissements publics : UPS, CNRS, INRA,
INP-ENSAT et L’ENFA, auxquels est associée la société Biogemma Mondonville.
Depuis sa création, l'IFR40 a pour objectif de promouvoir et de fédérer sur Toulouse l'ensemble des recherches dans le
domaine de la biologie et de la microbiologie végétales, en particulier les mécanismes de développement et de signalisation
cellulaire, et les interactions entre les plantes et les microorganismes pathogènes ou symbiotiques. L'entrée en 2007
de l'UMR «EDB» a permis d'intégrer les dimensions adaptative et évolutive.
La recherche réalisée à l’IFR 40 est pluridisciplinaire, elle s’appuie sur des plates-formes mutualisées de haute technologie
et labellisées au plan national.
Les travaux menés dans le cadre de cet Institut contribuent au développement d'une agriculture plus soucieuse
de l'environnement, génératrice de produits de meilleure qualité ou adaptés à de nouvelles filières de transformation.
Ils concernent également la préservation et la gestion de la biodiversité.
* laboratoire « Surfaces Cellulaires et Signalisation chez les Végétaux » (CNRS/UPS), laboratoire « Evolution et Diversité Biologique » (CNRS/UPS/ENFA), « Laboratoire des
Interactions Plantes Microorganismes » (CNRS/INRA), laboratoire « Symbiose et Pathologies des Plantes » (INP/ENSAT), laboratoire « Génomique et Biotechnologie des Fruits »,
(INRA/INP-ENSAT), « Centre National de Ressources Génomiques Végétales » (INRA).

page 4 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9


dOSSIER
>>> Les connaissances de base acquises devraient
ensuite, ou en parallèle, permettre d’agir de
manière raisonnée. Ainsi, favoriser les
interactions entre plantes et microorganismes
(bactéries, champignons) vivant en symbiose
avec elles et leur apportant les éléments
minéraux nécessaires est essentiel pour limiter
l’apport d’engrais chimiques. De même, stimuler
les mécanismes de défenses naturelles contre les
agresseurs biologiques, rendre les plantes plus
aptes à utiliser les ressources en eau, à s’adapter
à des terrains salés et à la sécheresse, et
orienter la qualité du bois formé naturellement
sont également des bases du développement
durable.
Atteindre de tels objectifs vitaux nécessite
l’intégration des concepts et méthodologies
de la biologie moderne (du gène à la biologie
des systèmes) en essayant de comprendre
les nouvelles propriétés qui émergent
à chaque niveau d’organisation.
L’offre de formation en biologie
et technologie du végétal
L’université Paul Sabatier offre, souvent en
collaboration avec d’autres établissements, une
large palette de formations en biologie et
technologies du végétal. Ces formations sont
inscrites dans le dossier du pôle de compétitivité
AgriMip Innovation, et sont regroupées à l’UPS
avec les formations de microbiologie sous le thème
Microbiologie-Agrobiosciences.
Plusieurs niveaux de diplôme sont proposés :
> Une licence professionnelle (co-habilitée avec
l’Ecole Nationale de Formation Agronomique)
sur les aspects des biotechnologies végétales et
leur application à la sélection variétale.
> Un master professionnel de Bioingénierie
option Biotechnologie végétale.
page 5
Biologie Végétale
>>> Culture de cellules isolées de feuilles de Zinnia
elegans observées en microscopie à fluorescence
mettant en évidence les cellules impliquées dans
la vascularisation. (Plateforme Microscopie Imagerie
cellulaire) de l'IFR40. (Copyright Labo SCSV).
Le dispositif toulousain en sciences végétales
est organisé pour répondre à ces défis
scientifiques et sociétaux. Dans ce cadre,
l’université Paul Sabatier occupe une place
centrale en assurant sa double mission de
formation et de recherche en collaboration avec
le CNRS et l’INRA.
Les sciences végétales sont un champ de
recherche vaste et essentiel pour l’homme,
aujourd’hui et pour sa qualité de vie demain.
Contact : ranjeva@scsv.ups-tlse.fr
> Un master recherche « Biosciences Végétales
», (co-habilité avec l’ENSA de Toulouse)
La poursuite en doctorat dans un des laboratoires
de l’IFR 40 s’effectue dans le cadre de deux filières
(« Développement des plantes » et « Interaction
plantes-microorganismes ») de l’Ecole Doctorale
Sciences Ecologiques Vétérinaires Agronomiques et
Bioingénieries (SEVAB).
Contact : Christophe Roux, Professeur UPS
(roux@scsv.ups-tlse.fr)
Site : www.scsv.ups-tlse.fr rubrique
« sites pédagogiques »
 Biologie Végétale

dOSSIER Dans les gènes

de l’eucalyptus
Gérer une forêt exige des outils de plus en plus sophistiqués. Des outils
moléculaires permettent ainsi d’améliorer la production du bois. Exemple de
l’eucalyptus.

L’accroissement de la population humaine s’accompagne

>>> Jacqueline Grima-Pettenati, DR CNRS, et
son équipe du Laboratoire « Surfaces
cellulaires et signalisation chez les végétaux »
(unité mixte UPS/CNRS)
d’une demande toujours plus forte en bois, aussi bien
comme source d’énergie que de bois matériau et
de fibres, alors que la surface totale des forêts tend
à diminuer. Conséquence directe, une aggravation
de l’état des forêts naturelles dont le cycle de
renouvellement n’arrive plus à compenser les
prélèvements. Par ailleurs, l’utilisation de plantations
forestières à forte croissance et à courte rotation fait
partie des solutions envisagées pour créer des puits
à CO2 atmosphérique afin de lutter contre le
réchauffement climatique. Préserver les forêts naturelles
et répondre à ces demandes rend stratégique
le développement de programmes d’amélioration
génétique des arbres cultivés en vue d’augmenter
la contribution des plantations industrielles,
aussi bien en terme de quantité que de qualité. >>> Eucalyptus dalrympleana,
Longages (Haute Garonne)

>>> Chantal Teulières, Professeur UPS, et
son équipe du Laboratoire « Surfaces
cellulaires et signalisation chez les végétaux »
(unité mixte UPS/CNRS)
Eucalyptus
Excellent puit à carbone, l’eucalyptus est la première
espèce de plantation industrielle dans le monde.
Présentant une capacité exceptionnelle de croissance,
même sur des sols pauvres, cet arbre est surtout
recherché pour la qualité de ses fibres adaptées à
la fabrication de la pâte à papier. En France,
l’implantation d’une espèce rustique a débuté en Midi
Pyrénées sous l’impulsion de l’industrie papetière locale
et avec le soutien du Conseil Régional.
Mais la sensibilité au gel de l’eucalyptus limite son aire
d’implantation, en particulier en France, et restreint
également sa production de biomasse. La tolérance au
froid et la qualité du bois sont donc aujourd’hui les
deux caractères ciblés pour l’amélioration génétique
de l’eucalyptus. Les programmes traditionnels
d’amélioration n’ont permis de sélectionner que
des variétés tolérant -18°C, ce qui reste insuffisant
pour éliminer le risque des planteurs.
Les propriétés intrinsèques du bois chez les ligneux
dépendent directement des parois secondaires
des cellules du bois. Ces parois sont en très grande
partie formées de cellulose et de lignines dont les
proportions relatives affectent directement la qualité
du bois. Créer de nouvelles variétés dont les teneurs
en polymères au niveau des parois seraient différentes
permettrait donc de produire du bois mieux adapté
aux besoins.
Sélection génétique
La sélection génétique classique chez les arbres forestiers se
heurte à des contraintes spécifiques : évaluation tardive
des caractères cibles, complexité des caractères, longueur
des générations. Ainsi, l’identification directe des gènes
impliqués dans le contrôle des caractères d’intérêt
constitue une étape incontournable pour l’application
de la sélection assistée par marqueurs.
Les chercheurs des deux équipes ont isolé une large
collection de gènes d’eucalyptus dont 26 000 ont été
séquencés. Grâce à l’analyse de puces à ADN contenant
plusieurs milliers de ces gènes, nos équipes ont identifié
ceux dont l’expression semble corrélée à la tolérance au
froid ou à la formation du bois. Le rôle biologique de ces
gènes majeurs est actuellement vérifié par l’étude des
conséquences de leur sur- ou sous-expression dans la
plante. Les résultats obtenus permettront tout d’abord
la progression des connaissances fondamentales sur
le développement et les mécanismes adaptatifs
des végétaux. Ensuite, les différences au niveau de la
séquence de ces gènes dans les populations naturelles
d’eucalyptus sont recherchées et analysées en regard avec
la variabilité des tolérances au froid et des qualités de bois.
Les polymorphismes ainsi révélés sur les gènes d’intérêt
pourront alors potentiellement servir de marqueurs pour
une sélection précoce des meilleures variétés.
Contact : grima@scsv.ups-tlse.fr et
teulieres@scsv.ups-tlse.fr

page 6 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9


>>> Elisabeth JAMET, DR CNRS, et son équipe
Protéines pariétales et développement du
laboratoire Surfaces Cellulaires et Signalisation
chez les Végétaux (SCSV, unité mixte UPS/CNRS).
>>> Déborah GOFFNER, CR CNRS, et son équipe
Différenciation du xylème et dynamique pariétale
du laboratoire Surfaces Cellulaires et Signalisation
chez les Végétaux (SCSV,unité mixte UPS/CNRS).
>>> Deux éléments de vaisseau conducteur de sève montrant une ornementation de la paroi
secondaire de type réticulé et ponctué. La lignine a été colorée en rouge par le phloroglucinol.
Parois végétales :
une polyvalence utile à l’homme
Cellulose, pectines et lignines jouent des rôles clefs au cours du développement
des plantes et de leurs interactions avec des facteurs environnementaux. Ces
bio-polymères constituent l’essentiel d’une biomasse valorisable.
Les parois végétales, structures semi-rigides entourant
les cellules et autorisant le port dressé des plantes,
constituent environ 80% de la biomasse. Elles sont
valorisables sous forme de bois, pâte à papier, fibres
textiles, gélifiants pour l’industrie agroalimentaire,
fourrage pour les animaux ou biocarburants. Les
possibilités de modulation de la composition et de la
structure des parois au cours du développement et des
interactions avec l’environnement sont au cœur de
nos recherches.
Protéines polyvalentes et flexibles
Tous les constituants pariétaux sont remodelables
afin de faire face aux exigences du développement ou
des contraintes environnementales. Cette polyvalence
et cette flexibilité sont rendues possibles par l’activité
des protéines pariétales. Les parois primaires sont
constituées de réseaux de polysaccharides : la cellulose
forme des microfibrilles parallèles ; les hémicelluloses
entourent et relient entre elles ces microfibrilles ; les
pectines forment un gel qui détermine le degré de
porosité des parois et participe à l’adhésion cellulaire.
Dans les tissus spécialisés tels les vaisseaux, des
parois secondaires riches en lignines sont mises en
place. A ces polymères, il faut ajouter des réseaux de
protéines structurales et de nombreuses protéines
mobiles ou en interaction avec eux. Nous avons
entrepris des analyses protéomiques des parois de la
plante modèle Arabidopsis ce qui a permis d’obtenir
la première description des répertoires de protéines
pariétales de différents types cellulaires.
Actuellement, environ un quart des protéines prédites
pour être adressées aux parois d’Arabidopsis ont été
page 7
Biologie Végétale
identifiées et distribuées en huit classes
fonctionnelles. Une telle variété est à l’image de la
diversité des rôles joués par les parois et de leur
dynamique. Par exemple, les expansines tirent leur
nom de leur capacité à permettre le glissement des
fibres de cellulose. Les peroxydases et les laccases
modulent le degré de polymérisation des protéines
structurales et des lignines. Outre ces familles
de protéines, nous avons mis en évidence des
protéines majeures dont la fonction n’est pas connue.
Nous recherchons maintenant leurs rôles, avec
la perspective de trouver de nouvelles fonctions
pour les parois.
Au coeur des stratégies de recherches
agronomiques et bio industrielles
Nous cherchons également à comprendre les
mécanismes moléculaires conduisant à la mise en
place d’une paroi secondaire par la cellule végétale.
Pour mener à bien ce projet, des approches
multidisciplinaires (génomiques, génétiques,
physiologiques) sont développées en partant d’une
plante modèle (Arabidopsis thaliana) et en allant vers
une plante d’intérêt agronomique (Zea mays). Nous
disposons aujourd’hui d’un large panel de plantes
(mutants ou transformants) altérées dans
l’élaboration et l’assemblage des parois cellulaires.
Ces mutants ou transformants sont des outils de
choix pour découvrir le rôle et la fonction des gènes et
leur étude a d’ores et déjà permis des avancées
significatives dans le domaine. Au delà d’un aspect
fondamental, la découverte de tels gènes a des
retombées significatives dans les secteurs
agronomiques (alimentation animale) et bio
industriels (production de bioéthanol). En effet,
avec l’épuisement des énergies fossiles à l’échelle
planétaire, les recherches visant à valoriser la
biomasse lignocellulosique (parois) s’intensifient.
Nous nous attachons maintenant, en partenariat
avec des chimistes, à définir l’idéotype des plantes
à vocation énergétique du futur.
Contacts : goffner@scsv.ups-tlse.fr et
jamet@scsv.ups-tlse.fr
Site laboratoire : http://www.scsv.ups-tlse.fr
 Biologie Végétale

Comprendre
la communication des plantes
Elles réagissent à la lumière et à la température, adaptent leur reproduction à leur
environnement, combattent leurs agresseurs… Au cœur de ces réponses, le calcium…

Comme tous les êtres vivants, les plantes sont

constamment en interaction avec les paramètres de
l’environnement et leurs variations (lumière,
température, qualité des sols, agresseurs) vis-à-vis
desquels elles adaptent leur programme de
développement et de reproduction. Cette aptitude à
percevoir des informations physiques ou chimiques
et à les convertir en un code interprétable par la
machinerie cellulaire repose sur des réseaux de
signalisation dont la compréhension constitue l’un
des enjeux de la biologie intégrative. Le calcium est
l’un des principaux messagers qui véhiculent dans la
dOSSIER

>>> Plantes d’Arabidopsis cultivées en situation de déficit hydrique.

>>> Benoît RANTY, CR CNRS,
Jean-Philippe GALAUD, MCF UPS,
Christian MAZARS, CR CNRS
au laboratoire Surfaces Cellulaires et
Signalisation chez les Végétaux
(SCSV, Unité mixte UPS/CNRS)
cellule l’information nécessaire à l’établissement des
réponses biologiques aux stimuli de l’environnement.
Dans ce cadre, les activités du laboratoire SCSV
consistent à élucider le sens des messages calcium
produits dans les cellules végétales en réponse à des
signaux externes, et à déchiffrer les systèmes
d’interprétation des informations transmises par ce
messager.
Message calcium
Pour détecter en temps réel les variations du taux de
calcium dans les cellules végétales, nous utilisons
l’aequorine, une protéine d’origine animale qui émet
de la lumière lors d’une stimulation calcique. Les
cellules végétales, dotées de cette protéine après
transformation génétique, ont montré que
l’amplitude, la durée, la fréquence et la localisation
du message calcium fournissent un potentiel
combinatoire, apte à générer une partition, ou
signature calcique, propre à chaque stimulus initial.
La perturbation artificielle de cette signature nous
permet en outre d’appréhender l’importance du
message calcium dans l’établissement des réponses
biologiques observées.
Les outils moléculaires de décodage des signaux
calcium englobent à la fois des protéines liant le
calcium (qui assurent les fonctions de récepteurs
primaires) et leurs cibles respectives. Bien que le
calcium serve de messager intracellulaire chez tous
les organismes, les plantes se distinguent par une
La plante de gauche a été génétiquement modifiée et est déficiente
pour un gène de signalisation calcium.
gamme de récepteurs primaires et de cibles propres
au règne végétal, sur lesquels nous focalisons nos
études. Les ressources génétiques récemment
développées à partir de plantes-modèles telles
qu’Arabidopsis thaliana, nous aident à apprécier le
caractère essentiel des récepteurs primaires pour
activer les réponses des plantes aux facteurs de
l’environnement. Les méthodes biochimiques et
génétiques d’analyse des interactions moléculaires
sont exploitées en vue d’identifier les événements
de signalisation allant des cibles immédiates des
récepteurs jusqu’aux stades ultimes des cascades
de signalisation.
Stress salin et hydrique
Toutes les données acquises montrent que le calcium
est un commutateur central dans les réponses des
plantes à l’environnement. La modulation des voies
de signalisation associées à cet ion a déjà permis
d’augmenter la tolérance des plantes au stress salin
et au stress hydrique.
Contacts : ranty@scsv.ups-tlse.fr
galaud@scsv.ups-tlse.fr
mazars@scsv.ups-tlse.fr

page 8 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9


>>> Monique GARDES, Professeur à l’UPS, au
Laboratoire « Evolution et Diversité Biologique »
(EDB, unité mixte UPS/CNRS) et son équipe.
>>> Guillaume BÉCARD, Professeur à l’UPS,
directeur du SCSV (unité mixte UPS/CNRS)
et son équipe.
>>> Jean-Jacques BONO, Chargé de recherche
INRA et Annick BARRE, Maître de conférences
à l’UPS, et leur équipe du SCSV.
A eucaryotes le font depuis plus longtemps encore.
B
>>> Symbiose endomycorhizienne associant
les racines des plantes (ici les racines
de la plante modèle Medicago truncatula) et
certains champignons du sol (ici Gigaspora rosea).
A : Champignon à l’extérieur
de la racine observé à la loupe binoculaire.
B : Champignon à l’intérieur de la racine
observé au microscope.
PLANTES ET MICROBES :
un vieux couple plein d’avenir
La compréhension des symbioses qui perdurent depuis des centaines de millions
d’années entre les champignons microscopiques et des plantes est en pleine
progression.
Il y a 450 millions d’années, lorsque les continents
n’étaient pas encore séparés et que les premières
formes animales présentes dans les océans étaient
encore très primitives, des végétaux commençaient à
s’adapter à la vie sur la terre solide. Un examen au
microscope des organes primitifs (fossilisés) qui leur
servaient de racines, permet d’observer dans les
tissus internes la présence de champignons
microscopiques. On les connaît aujourd’hui sous le
nom de champignons endomycorhiziens. Ils vivent
en symbiose avec près de 80% des espèces végétales,
depuis les mousses jusqu’aux plantes à fleurs, et
sont présents dans tous les écosystèmes. Tout en
colonisant les cellules racinaires des plantes, ils
forment en prolongement un mycélium externe très
dense qui s’étend dans le sol au-delà du système
racinaire. Ce mycélium extrait les ressources
hydriques et minérales du sol et les draine jusqu’aux
racines en échange de sucres fournis par la plante.
Mieux nourrie et hydratée, la plante-hôte est en
meilleure santé et croît plus rapidement.
Réduire les engrais et l’irrigation
Plusieurs raisons ont justifié l’intérêt que porte la
communauté internationale à cette symbiose
depuis plusieurs décennies : le fait qu’elle soit très
ancienne, son succès écologique remarquable et les
perspectives de plus en plus concrètes qui s’ouvrent
à son exploitation agronomique pour réduire les
besoins en engrais et en irrigation.
A Toulouse, les recherches visent à mettre en
évidence les mécanismes cellulaires et moléculaires
qui font que deux partenaires symbiotiques
peuvent interagir de façon aussi intime et durable,
un peu comme les mitochondries et les cellules
Deux équipes du laboratoire SCSV, en
collaboration étroite avec des équipes INRA,
cherchent à caractériser la nature chimique des
molécules les plus importantes échangées entre les
partenaires. Ce sont généralement des molécules
de faible taille moléculaire. On évalue l’importance
de leur rôle par des approches génétiques. Ces
molécules-signal, sorte de clés d’entrée, ont leur
« serrure » correspondante, qu’on appelle des
récepteurs et qu’on cherche aussi à isoler et à
décrire grâce aux approches de la biochimie
structurale. Les recherches dans ce domaine se
sont considérablement accélérées ces dernières
page 9
Biologie Végétale
années. Elles ont été stimulées par les données
acquises en génomique végétale et par une
découverte qui a surpris les chercheurs : la
symbiose fixatrice d’azote qui associe les
légumineuses et les bactéries rhizobia, et la
symbiose endomycorhizienne, pourtant très
différente et beaucoup plus ancienne, que
partagent certaines voies de signalisation et de
reconnaissance. Ceci suggère que des langages
moléculaires très conservés permettent aux plantes
de reconnaître les microbes bénéfiques avec
lesquels s’associer et ceux contre lesquels elles
doivent déclencher leurs systèmes de défense.
Associations préférentielles
Il reste de nombreuses boîtes noires et
d’importantes recherches à faire pour comprendre
plus finement comment les plantes interagissent
avec les microorganismes. A une échelle moins
réductionniste, une équipe d’écologie du
laboratoire EDB essaie de comprendre quels sont
les mécanismes à l’origine de la diversité fongique
dans notre f lore actuelle et des associations
préférentielles qu’on observe dans la nature entre
génotypes végétaux et fongiques. Ces recherches
font appel à des méthodes de phylogénie
moléculaire et d’identification génétique et à des
puces à ADN, pour reconnaître le champignon
dans la racine. La caractérisation des champignons
associés à différentes plantes hôte dans des
environnements variés permet de faire émerger les
profils de distribution des espèces et des individus,
et donc les processus d’assemblages de la diversité
dans le temps et dans l’espace. Ainsi, des données
récentes ont révélé des communautés fongiques
très riches et diversifiées dans des habitats non
perturbés par l’homme depuis plusieurs centaines
d’années. Au contraire, les habitats soumis à
de fortes perturbations anthropiques semblent
favoriser des communautés essentiellement
constituées d’espèces pionnières à large spectre de
distribution ainsi que des populations d’individus
éphémères incapables de coloniser durablement
leur environnement.
Contacts : becard@scsv.ups-tlse.fr
gardes@cict.fr
Bono@scsv.ups-tlse.fr
 Biologie Végétale
>>> André PORNON, Maître de conférences UPS et
Christophe THÉBAUD, Professeur UPS et
leurs équipes du laboratoire Evolution et
Diversité Biologique (EDB, Unité mixte UPS/CNRS).
>>> Antirrhinum : un système modèle en écologie
évolutive pour l'étude de l'évolution des plantes
à fleurs; ici, Antirrhinum majus visité par
un bourdon pollinisateur dans les Pyrénées.
page 10 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9
Comment expliquer la grande
diversité des plantes à fleurs ?
Si la variété des plantes à fleurs émerveille le promeneur, elle constitue un
véritable casse-tête pour les biologistes. Une variété qui ne serait pas
uniquement le fruit du hasard…
Les plantes à fleurs (ou Angiospermes) forment une
composante majeure de la biodiversité terrestre,
englobant de 250 000 à 400 000 espèces réparties
en 460 familles. Cette lignée évolutive, apparue
il y a environ 130 millions d’années, surpasse en
nombre et abondance tout autre groupe de plantes
et domine la végétation terrestre depuis environ
100 millions d’années. La formation très rapide,
à l’échelle des temps géologiques, d’une biodiversité
d’une richesse inouïe du point de vue des formes et
des modes de vie a longtemps constitué pour les
biologistes un « abominable mystère », selon la
formule utilisée par Charles Darwin pour décrire
son incapacité à comprendre les causes du
phénomène. Car l’explication traditionnelle qui
consiste à présenter les nouvelles possibilités
reproductives offertes par la fleur, en particulier
la pollinisation par les insectes, comme le facteur
déclenchant de l’explosion du nombre d’espèces
paraît trop simple. Récemment, l’analyse
moléculaire de la diversification des familles de
plantes à fleurs au cours de l’évolution a montré
que la biodiversité actuelle est le résultat d’au
moins 10 épisodes de multiplication intense
du nombre d’espèces. Ces épisodes semblent
correspondre à des périodes où les conditions
environnementales ont été grandement modifiées
par les variations du climat. Ainsi, l’évolution
de la biodiversité des plantes à fleurs
dépendrait fortement du contexte
géographique et historique, ainsi que des
mécanismes moléculaires et écologiques
qui peuvent influencer le rythme de la
formation de nouvelles espèces en
réponse aux variations de
l’environnement.
Arbres d’Amazonie
Le laboratoire EDB s’intéresse à ces
problèmes en privilégiant deux axes de
recherches. Le premier concerne la mise
en place de la biodiversité, en utilisant
les arbres des forêts humides d’Amérique
du Sud comme système biologique de
référence. Ces forêts abritent plus de
70 000 espèces de plantes à fleurs,
avec par endroits jusqu’à 300 espèces
d'arbres par hectare (40 au maximum en Europe).
Mais cette biodiversité n’est pas uniformément
répartie. En Amazonie, des parcelles forestières
éloignées de 100 km possèdent seulement un tiers
de leurs espèces d’arbres en commun. Les théories
classiques de l’écologie ont longtemps considéré
qu’une telle hétérogénéité spatiale de la biodiversité
ne dépendait que des changements de substrat ou
des conditions climatiques actuelles. Des modèles
mathématiques inspirés de la théorie neutraliste
de l’évolution (selon laquelle le hasard est le
premier moteur de l’évolution avant la sélection
naturelle) montrent que les différences observées
sont fonction du contexte géographique de la
formation des espèces. Ainsi, à l’échelle de
l’Amazonie, de nombreuses espèces sont absentes
de certaines régions simplement parce qu’elles
n'ont pas encore eu le temps de s'y disperser.
Gueules-de-loup
Le deuxième axe porte sur les mécanismes de
la formation des espèces, et tente d’expliquer
la mise en place des différences morphologiques et
fonctionnelles chez les gueules-de-loup
(Antirrhinum). Le genre Antirrhinum comprend un
grand nombre d’espèces, très différentes les unes
des autres du point de vue de la morphologie et
de l’écologie, malgré une différenciation récente.
Des analyses génétiques et moléculaires montrent
que les différences très marquées de la couleur des
fleurs entre les espèces s’expliquent par l’évolution
d’un petit nombre de gènes dont l’action influence
l’intensité de deux grands types de pigments
(anthocyanes, aurones) dans la fleur. Par ailleurs,
l’étude de la variabilité naturelle chez certaines
espèces des Pyrénées indique que la sélection
naturelle est impliquée dans l’évolution des
différences de couleur de fleurs et a joué un rôle
important dans la formation des espèces. Ces
recherches doivent permettre de mieux comprendre
la nature des changements moléculaires impliqués
dans les premiers stades de la formation des espèces
et de déterminer si l’adaptation à des
environnements différents est le véritable moteur
de la biodiversité chez les plantes à fleurs.
Contact : thebaud@cict.fr

>>> Arnaud BOTTIN, Maître de conférences UPS,
membre de l’équipe IPM du Laboratoire « surfaces cellulaires
et signalisation chez les végétaux » (unité mixte UPS/CNRS)
>>> Protection des plantes par des éliciteurs : des plantes de Medicago truncatula
ont été inoculées par l’agent de l’anthracnose Colletotrichum trifolii soit directement (A)
soit après un traitement par des éliciteurs induisant l’immunité végétale (B).
On observe que les plantes traitées par les éliciteurs ont résisté, tandis que celles
qui n’ont pas reçu le traitement ont été tuées par le parasite.
Vers un vaccin
pour les plantes
Les produits phytosanitaires classiques posent de graves problèmes pour
l’environnement et la santé humaine. La compréhension des mécanismes de
l’immunité végétale pourrait nous sortir de cette ornière.
Depuis l’invention de l’agriculture, l’homme doit faire
face au fléau que représentent les maladies affectant
les cultures. Les champignons filamenteux sont les plus
dévastateurs des microorganismes parasites des
plantes. Au cours du XXème siècle, des produits
phytosanitaires issus de la chimie ont été largement
utilisés afin de lutter contre ces agents pathogènes.
Plusieurs dizaines de milliers de tonnes de fongicides
sont encore répandus sur les cultures chaque année en
France, posant de graves problèmes pour
l'environnement et la santé humaine. Pour développer
de nouvelles stratégies de lutte, il est nécessaire de
comprendre comment les champignons attaquent les
plantes, et comment celles-ci s’en défendent. En effet,
les plantes ont un système de défense naturel, qui
présente des points communs avec l'immunité innée
des animaux.
La reconnaissance de molécules « antigènes »
(appelées éliciteurs) produites par les parasites entraîne
des réactions de rejet de l'agresseur. Un conflit
moléculaire s'engage alors entre les deux partenaires,
dont l’issue détermine le devenir de l'interaction
(maladie ou résistance). Les travaux effectués au sein
du laboratoire SCSV s'attachent à identifier les
acteurs clés de ce conflit en utilisant comme modèle
biologique la légumineuse Medicago truncatula en
interaction avec les champignons Colletotrichum et
Aphanomyces, responsables respectivement de maladies
foliaires et racinaires. La pertinence de ce modèle tient
en particulier au fait que les légumineuses sont
devenues la source majeure de protéines pour les
animaux d’élevage depuis l’interdiction des farines
animales dans leur alimentation, et représentent
également une
source de
protéines de plus
en plus
importante dans
l’alimentation
humaine.
Immunité
végétale
Deux éliciteurs
ont d’ores et déjà
été caractérisés
parmi les
page 11
Biologie Végétale
protéines extracellulaires des champignons parasites :
une pectinase, enzyme d’attaque des parois végétales,
et une lectine liant la cellulose végétale. D’autres
éliciteurs sont en cours d’identification par analyse des
séquences obtenues dans le cadre d‘un projet de
séquençage du génome d’Aphanomyces mené en
collaboration avec le Génoscope d’Evry. L’analyse des
relations structure-fonction de ces protéines permet de
définir les domaines moléculaires responsables de leur
perception par les cellules végétales. Un objectif à
moyen terme est d’identifier les récepteurs impliqués
dans cette perception, ainsi que les voies de
signalisation qui sont à la base de l’immunité végétale.
Par ailleurs, un couple de lignées sensibles et
résistantes de M. truncatula a été sélectionné pour
chaque parasite étudié, et l’analyse génétique de leur
descendance a permis d’identifier des déterminants
impliqués de façon majeure dans la résistance. Leur
clonage moléculaire est en cours. Enfin, l’étude
simultanée de l’expression d’un grand nombre
de gènes par utilisation de « puces à ADN »
(étude transcriptomique) a permis l'identification
d’ensembles de gènes induits au cours de la mise en
place de la défense. Des études complémentaires sont
en train de préciser le rôle de ces gènes dans
la résistance.
De nouveaux produits phytosanitaires
Une application de l'activité des éliciteurs est
de les utiliser comme des « vaccins » naturels dont
l’application au champ permet d’immuniser les
cultures. Malgré des essais prometteurs, le
développement commercial de ce type de produits se
heurte à des problèmes d'efficacité par rapport aux
traitements fongicides classiques. En collaboration
avec plusieurs industriels, nous cherchons à optimiser
ces produits en couplant des approches de génomique
fonctionnelle (étude du transcriptome des plantes
traitées) avec des essais au champ (protection des
cultures). L'enjeu de ces recherches est de proposer
des solutions aux contraintes actuelles de
l'agriculture, à savoir satisfaire la demande
alimentaire tout en préservant
l'environnement.
Contact: bottin@scsv.ups-tlse.fr
 Innovations
>>> François MARTIN, professeur à l’UPS,
chercheur au Laboratoire de mécanismes
de transfert en géologie (LMTG, unité mixte
UPS/CNRS/IRD).
>>> Talcs colorés nanométriques avant et
après séchage : blanc avec Magnesium,
vert avec Niquel, rose avec Cobalt.
page 12 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9
Deux équipes récompensées au
Innovation
Du talc dans l’espace…
Les Nano-talcs synthétiques constituent un lubrifiant idéal pour des pièces
soumises à de hautes températures, comme celles utilisées dans l’aéronautique
et l’espace (1). Entretien avec François Martin, lauréat du 1er prix.
➜ Pourquoi avoir pensé au talc pour développer
des nouveaux matériaux ?
Depuis 7 ans, je me suis intéressé avec mon collègue
J. P Bonino de l’Institut Carnot-CIRIMAT (unité
mixte UPS/CNRS/INP) aux revêtements de surface
de pièces métalliques utilisées dans l’industrie des
transports. Un des soucis majeurs que l’on
rencontre, c’est que les lubrifiants (téflon, MoS2,
graphite, …) introduits dans ces revêtements de
surface tiennent mal en température. Si bien qu’au-
delà de 300-350°C, leur introduction devient
inutile. Or le talc naturel est un lubrifiant, les
fesses des bébés le savent bien. Mais un lubrifiant
qui conserve ses propriétés jusqu’à haute
température (900-950°C).
➜ Quel est l’objectif poursuivi dans vos travaux ?
Notre travail sur l’introduction du talc naturel dans
les revêtements de surface nous a permis en 2004
de déposer un brevet sur ce travail et d’obtenir en
2004 déjà le 1er prix de l’innovation Midi-
Pyrénées. Mais nous avions vu que l’introduction de
particules de talc naturel qui ont des tailles
micrométriques dans nos revêtements induisaient
des rugosités de surface, des effets de décohésion du
revêtement car les particules de talc étaient « trop
grosses » en comparaison de la matrice « amorphe
nanométrique » de nos revêtements. L’idée m’est
donc venue, non pas de tenter de broyer du talc par
d’autres techniques (plus de 30 ans de travaux sur
ce sujet à Rio Tinto Minerals Luzenac Group), mais
de fabriquer du talc de taille nanométrique.
➜ Quelle est l’innovation la plus importante ?
C’est de pouvoir être capable de synthétiser des talcs
de tailles nanométriques mono-disperses à chimie
contrôlée et en grande quantité. Nous sommes
passés en 2 ans avec le soutien du CNRS, de la
région Midi-Pyrénées, et de l’AVAMIP de production
de type laboratoire (quelques milligrammes) à une
production semi-industrielle (dizaines de
Kilogrammes). Un réacteur de 250 Litres est en
cours d’acquisition et permettra une production
journalière de 50 kg afin de tester ces nouveaux
produits en application industrielle gros volume.
Le remplacement chimique du Magnesium par
d’autres cations nous permet aussi d’innover en
matière de couleur car les talcs synthétiques restent
colorés même après broyage contrairement aux talcs
naturels toujours blancs ou gris après broyage.
➜ Quelle est la contribution des différents
laboratoires ?
Le laboratoire pilote est le LMTG où tous les
réacteurs et le savoir-faire sont implantés. J’ai
déposé avec Rio Tinto Minerals 3 brevets industriels
en août 2006 sur les protocoles de synthèse. Mais
l’implication du Institut Carnot-CIRIMAT est forte
aussi avec les tests physiques sur les matériaux
composites incorporant les nano-talcs.
➜ Quelles sont les principales applications
du produit ?
Ce sont en fait des marchés nouveaux que ne
couvrent pas le talc naturel, car ces nano-particules
présentent des propriétés physiques, magnétiques, et
électriques exceptionnelles et surtout absentes dans
les talcs naturels. Juste un exemple car nous
sommes en phase de protection industrielle, mais le
comportement magnétique à basse température
laisse présager des applications en peintures
aéronautiques pour bloquer les rayonnements
magnétiques de haute altitude tout en gardant en
plus les propriétés du talc naturel comme barrière
anti-UV par exemple.
➜ Peut-on dire que vous avez fait mieux que
la nature ?
Ce que la nature faisait en 14 Millions d’années
avec des défauts (talcs naturels), nous le faisons
en 4 heures sans défaut !!!
Contact : martin@lmtg.obs-mip.fr
(1) Travail réalisé en collaboration entre le LMTG, le
CIRIMAT-Institut Carnot (unité mixte UPS/CNRS/INP),
et la société Rio Tinto Minerals Luzenac.

26e concours
Midi-Pyrénées
innovations
>>> Claire DUMAS, doctorante, Luc ETCHEVERRY,
Assistant-ingénieur CNRS, Régine BASSÉGUY,
CR CNRS, Marie-Line DÉLIA, MCF INP et
Alain BERGEL, DR CNRS, travaillant au LGC
(unité mixte UPS/INP/CNRS).
>>> Schéma du prototype de pile à combustible
microbienne implantée dans le port de Gênes.
Les découvertes récentes suggèrent que
des bactéries adhérées (biofilms) oxydent les
matières organiques en transférant directement
les électrons à l’anode. Le LGC a mis en évidence
un processus similaire à la cathode.
Des micro-organismes
dans les piles à combustible
Des piles à combustible propre, fonctionnant à partir de déchets et de micro-organismes :
ce rêve d’écologiste est en train de prendre forme dans le laboratoire de Génie chimique,
récemment récompensé par le 3ème prix de l’innovation en Midi-Pyrénées. Entretien avec
Alain Bergel, qui pilote ce projet.
➜ Vous travaillez plus particulièrement sur les
piles à hydrogène. Quel est le problème posé ?
Une pile à combustible à hydrogène est constituée de
deux électrodes : une anode sur laquelle l’hydrogène perd
ses électrons (réaction d’oxydation) en les injectant dans
le circuit électrique, et une cathode sur laquelle l’oxygène
extrait les électrons du circuit (réaction de réduction).
Les performances des piles à combustible sont
directement corrélées à la vitesse de ces deux réactions.
En l’état actuel, la réaction de réduction de l’oxygène
utilise des catalyseurs extrêmement chers, à base de
platine. Notre invention a pour but de remplacer ces
catalyseurs par des électrodes en acier inoxydable
recouvertes de certains micro-organismes qui se
développent en particulier dans l’eau de mer.
Pourquoi avoir pensé aux micro-organismes ?
Vers la fin des années 90 nous avons étudié la corrosion
induite par l’adhésion de micro-organismes sur les
matériaux, en collaboration avec le CEA de Saclay et
l’institut des sciences de la mer de Gênes. Il est apparu
que la présence de micro-organismes accélère de façon
considérable la vitesse de réduction de l’oxygène sur
certains matériaux comme les aciers inoxydables. Plutôt
que d’essayer de l’éviter, objectif visé dans le domaine
de la corrosion, nous avons donc cherché à trouver
les conditions qui favorisent cette réaction afin de
l’appliquer aux piles. Ce type de glissement d’une
thématique vers l’autre a été facilité par le fait de
travailler dans un laboratoire d’ingénierie généraliste
comme le nôtre.
Quel est le principe de l’innovation qui vous a
permis d’obtenir ce prix ?
Nous avons réalisé une cathode « microbienne » en eau
de mer couplée à une anode qui utilise le même principe
et permet ainsi de remplacer le combustible hydrogène
par du lait ou des sédiments marins. Dans ce cas,
l’anode est aussi constituée d’un matériau relativement
bon marché, du graphite, et ce sont des micro-
organismes adhérant à sa surface qui accélèrent le
transfert des électrons du combustible vers l’électrode.
page 13
Innovations
A ce jour, seuls les micro-organismes parviennent
à arracher des électrons aux matières organiques
contenues dans les sédiments marins, le lait ou d’autres
milieux, et à les injecter dans un circuit électrique. Cette
découverte qui ne date que du début du 21ème siècle crée
une effervescence incroyable au sein de plusieurs
universités américaines : les projets sont soutenus
à hauteur de millions de dollars, les articles dans les
journaux scientifiques et de vulgarisation s’enchaînent
à une vitesse incroyable.
Avec quel type de combustible peuvent fonction-
ner ces piles microbiennes ?
Les piles microbiennes ouvrent la voie à l’utilisation de
toute sortes de matières organiques de très bas coût.
On peut espérer convertir directement en électricité le
potentiel énergétique contenu dans des effluents urbains
ou des déchets agricoles. Il est envisageable de construire
des piles domestiques alimentées par les déchets
organiques ménagers qui participeront à l’alimentation
électrique de la maison. L’éventail des applications
n’a pour limite que l’imagination des chercheurs…
Quelle puissance de production peut-on espérer ?
C’est le point sur lequel il faut progresser. Le prototype
qui nous a permis d’obtenir le prix de l’innovation
produit 0,28 Watt/m2 de surface d’électrode. C’est à ce
jour la densité de puissance la plus élevée pour un
prototype fonctionnant dans un environnement naturel.
En laboratoire, dans des conditions bien contrôlées, les
piles microbiennes ont d’ores et déjà fourni des densités
de puissance de plusieurs Watt par mètre carré.
Avez-vous déposé un brevet ?
Le CNRS a déposé un brevet en 2002 en collaboration
avec le CEA de Saclay qui est associé à l’ensemble de
ces recherches. A cette date nous ne maîtrisions pas les
mécanismes mis en œuvre, mais nous percevions la
portée que pouvaient avoir les résultats.
Contact : Alain.Bergel@ensiacet.fr
 Vie des laboratoires
laboratoires
Vie des
>>> Celine MARI, CR CNRS et Frank ROUX,
Professeur UPS, chercheurs au Laboratoire
d’Aérologie (unité mixte UPS/CNRS)
>>> Photo d'une ligne de grain sur le site
d'Hombori au Mali (©F. Guichard).
page 14 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9
Dans les secrets
de la mousson africaine…
Une grande opération scientifique internationale d’étude de la mousson africaine
est en cours. Elle implique notamment des chercheurs toulousains, parmi
lesquels Céline Mari et Frank Roux, du laboratoire d’aérologie.
➜ Pourquoi cet effort international pour étudier
la mousson africaine ?
Le projet AMMA (Analyses Multidisciplinaires de
la Mousson Africaine) est un projet international
visant à améliorer notre connaissance de la mousson
de l'Afrique de l'Ouest. L'enjeu est de comprendre
la variabilité de l'échelle journalière à l'échelle
interannuelle de la mousson, porteuse de pluie, si
importante pour les sociétés africaines. L'ambition est
à terme d'améliorer la prévision de la mousson et des
processus dynamiques et chimiques associés tels que
la pluviométrie, le cycle hydrologique, les transports
de poussières ou l'impact de l'ozone.
➜ L’étude de la mousson n’a-t-elle que des
motivations scientifiques ?
Outre le défi scientifique, le projet est motivé par
les questions de sécurité alimentaire et de santé des
populations africaines, questions directement liées
à l'arrivée, à la durée et à l'intensité de la mousson.
L'étude de la mousson africaine et ses impacts couvre
de nombreuses disciplines : de la dynamique et de la
chimie de l'atmosphère à l'agriculture en passant par
l'hydrologie et l'étude des insectes et des parasites.
Nous formons également des scientifiques africains,
ce qui est très important pour assurer d'une part
la continuation des travaux après le départ des
scientifiques européens, d'autre part le passage vers
l'opérationnel des résultats qui seront obtenus. C'est
la première fois qu'une expérience d'une telle ampleur,
par sa durée, par les budgets engagés et par le nombre
de participants, est réalisée en Afrique. Un tel
programme ne pouvait donc se concevoir
qu'à l'échelle internationale.
➜ Quelles sont les équipes qui ont participé ?
Le projet AMMA est une initiative française qui a
regroupé de nombreux laboratoires sous diverses
tutelles : le CNRS, le CNES, Météo-France, l'IRD et
les universités. Pour la seule université Paul Sabatier,
le LA et le CESBIO ont activement participé au
programme, chacun dans leur propre domaine
d'expertise. Le CESBIO a pour vocation l'étude du
fonctionnement des surfaces continentales ainsi que
les interactions entre la surface et l'atmosphère dans
les régions sahéliennes. Ce laboratoire a instrumenté
le site d'Hombori au Mali qui a servi de base entre
autres à des ballons captifs. Le Laboratoire d'aérologie
a eu un rôle de coordination important sur les
composantes de chimie et de dynamique
atmosphérique du projet. Les thématiques couvertes
par les équipes du LA sont : les émissions d'aérosols et
de précurseurs de l'ozone, l'étude des systèmes
convectifs et des perturbations associées sur la
dynamique de la couche limite et sur la chimie
atmosphérique, l'évolution de ces systèmes en cyclones
sur l'Atlantique tropical. Le LA a notamment réalisé
les mesures au sol d'aérosols et de chimie sur le site
de Djougou (Bénin), les mesures par radiosondages
ozone à Cotonou (Bénin), le guidage des deux avions
de recherche français pendant l'été 2006 à Niamey
(Niger) et l'opération des radars UHF et VHF
sur plusieurs sites.
➜ Avez-vous rencontré des problèmes
d’infrastructure ?
Un effort sans précédent a été réalisé dans le cadre
du programme pour assurer des conditions de travail
opérationnelles satisfaisantes sur les différents sites au
Niger, au Bénin et au Mali, où l'infrastructure initiale
était souvent défaillante faute de moyens. Il faut
souligner les efforts accomplis par les techniciens et
les scientifiques qui ont participé à la phase de terrain,
notamment pour l'exploitation de gros moyens
instrumentaux comme les radars ou les avions, et
pour de longs suivis sur les sites spécifiques.
➜ Etes-vous satisfaits des données obtenues ?
Il est encore tôt pour se prononcer sur la qualité de
l'ensemble des données. Les dernières opérations des
avions de recherche en Afrique se sont terminées à la fin
du mois de septembre. Malgré quelques soucis, ces avions,
dont c'était là le premier déploiement scientifique, ont
donné toute satisfaction. Il en va de même pour les
instruments au sol, et les premières données sont très
prometteuses. La fin du projet est prévue vers 2010 mais
nul doute que les découvertes, les progrès et les nouvelles
questions engendrés par le programme AMMA
continueront de susciter de nouveaux travaux sur
l'Afrique bien au delà de cette date.
Contacts : marc@aero.obs-mip.fr
rouf@aero.obs-mip.fr
 Vie des laboratoires

Prévoir l’évolution d’un cancer

Un réseau associant des scientifiques et des entreprises propose une voie
prometteuse pour prédire l’évolution d’une cellule cancéreuse. Explications de
Christophe Cazaux, professeur de génétique et biologie cellulaire à l’UPS, et
responsable de ce réseau labellisé par le « Plan Cancer ».

>>> Cristophe CAZAUX, Professeur à l’UPS,
chercheur à l’Institut de Pharmacologie et
de Biologie Structurale (IPBS,
unité mixte UPS/CNRS).
➜ Quel est l’intérêt de prédire l’évolution
d’un cancer ?
Grâce aux campagnes de sensibilisation, d’examens
biocliniques et radiographiques à visée préventive, et
au progrès des techniques d’imagerie, le cancer est
diagnostiqué de plus en plus précocement. Le médecin
est toutefois très souvent dans l’incapacité de prédire
après traitement (le plus souvent l’exérèse de la tumeur)
l’évolution de la maladie pour chaque patient en terme
de vitesse et de sévérité. Hors des données statistiques
sur une population de patients, il est de plus en plus
demandé par chacun de répondre à la question de
l’évolution de sa propre maladie en terme de survie,
de qualité de vie.
➜ Comment peut-on connaître à l’avance
l’évolution de la maladie ?
L’arsenal thérapeutique anti-tumoral du siècle qui
commence mettra à la disposition du médecin des
« cartes d’identité génétique » de la tumeur
diagnostiquée afin que celui-ci puisse prédire en fonction
de ce patrimoine génétique l’évolution de la maladie.
Ces cartes d’identité recèleront des familles de gènes plus
ou moins exprimés par rapport au tissu sain, révélateurs
d’un tissu « dangereux » ou pas. Nous appelons
« marqueurs pronostiques » ces gènes dérégulés.
➜ Quel est le point essentiel des résultats que
vous venez de publier ?
Les tissus cancéreux sont sujets de façon précoce à de
multiples dommages sur leur ADN, et l’absence de
réparation de ces dommages facilite la progression de la
tumeur. Parmi les équipes du réseau, celle dirigée par
Bernard Salles (Professeur à l’UPS) ainsi que celle que
je codirige avec Jean-Sébastien Hoffmann (Inserm) ont
mis en évidence de nouveaux gènes impliqués dans la
réparation des cassures de l’ADN. Nous avons montré,
en collaboration avec Rosine Guimbaud, Janick Selves
et Georges Delsol de l’hôpital Purpan, que ces gènes
sont sous exprimés dans les stades précoces de la
maladie, favorisant l’émergence de cassures de l’ADN,
d’une instabilité génétique propice à la progression
tumorale. Ils représentent donc des facteurs
pronostiques potentiels.
➜ Quels sont les participants à ce réseau ?
sommes structurés avec des équipes de Montpellier,
Bordeaux et Limoges. Sur Toulouse, les équipes pilotées
par DidierTrouche (LBME), Martine Defais, Bernard
Salles, Jean-Sébastien Hoffmann et moi-même, Ahmed
Khamlichi (IPBS), Christian Bailly (CNRS/Pierre Fabre)
participent activement à la démarche.
➜ Cette approche peut-elle changer l’exercice
de la médecine anticancéreuse ?
Il est clair que nous nous dirigeons vers une approche
individualisée du traitement du cancer. Chaque
individu est unique génétiquement, mais chaque
tumeur, pour un organe donné, est aussi différente !
Comprendre ces différences au-travers du spectre
génétique de la tumeur considérée doit permettre
d’orienter à dessein la thérapie. Par exemple une
tumeur incapable de réparer son ADN sera certes
« agressive » mais aussi très sensible à la radiothérapie
et/ou chimiothérapie dont l’objet est de briser la double
hélice nucléique ou d’arrêter la multiplication
du clone tumoral.
➜ Y a-t-il une relation avec le futur cancéropôle
sur le site de Langlade ?
Totalement. Nous souhaitons développer cet axe dans
le cadre du cancéropôle toulousain, en privilégiant par
exemple l’étude des tumeurs cutanées, malheureusement
en progression constante, qui sont directement dues aux
dommages à l’ADN causés par les rayons UV solaires.
christophe.cazaux@ipbs.fr
>>> Plate-forme de « peignage moléculaire » de l’IPBS (responsable
MJ Pillaire, CR Inserm) qui permet de « peigner » sur plaque de verre

Le « Plan Cancer » organisant la recherche dans ce sylanisée des fibres chromosomiques extraits de cellules cancéreuses
en culture et de mesurer la vitesse de synthèse de l’ADN.
domaine par cancéropôles supra-régionaux, nous nous

page 15
 Vie des laboratoires
Vie des laboratoires
>>> Christian JOACHIM, directeur de recherche
CNRS et son équipe du Centre d'Elaboration
des Matériaux et d'Etudes Structurales
(CEMES, unité CNRS, associée à l’UPS).
page 16 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9
Ils ont réinventé la crémaillère !
Des roues, un essieu, un pignon… La liste des pièces nanométriques qui voient le
jour sur la paillasse de l’équipe de nanosciences du CEMES ne cesse de s’allonger.
Mais où veulent-ils donc en venir ? Entretien avec Christian Joachim.
➜ Deux résultats récents1 concernent une
crémaillère, puis une roue moléculaires.
De quoi s’agit-il ?
Il s’agit d’expériences de mécanique avec une seule
molécule ! Nous travaillons à la réalisation de
molécules-machines munies de roues pour y
embarquer toutes la machinerie d’une nano-voiture.
Etape par étape, nous avons défriché ce domaine au
CEMES avec nos collègues d’IBM Zurich puis de la
Frei Universitat de Berlin. Après l’observation de la
rotation aléatoire d’une roue moléculaire à plat en
1998, la conception et la synthèse d’une brouette
unimoléculaire en 2003 puis la synthèse d’un
moteur moléculaire en 2005, nous sommes donc >>> La molécule essieu-roues développée au CEMES.
parvenus en 2006 à faire fonctionner la première
crémaillère moléculaire d’un pignon chimiquement deux roues d’un diamètre de l’ordre
de 1.2 nanomètres de diamètre. de 0.7 nm. Ces deux roues n’ont pas de « pneus »
pour une meilleure adhérence sur la surface de
➜ En quoi cela consiste-t-il ? roulement, une surface de cuivre ultra propre. Sa
Nous avons tout d’abord mis au point une rugosité naturelle présente des rangées d’atomes de
crémaillère moléculaire et avons montré comment cuivre séparées d’une distance de 0.3 nm environ et
suivre et contrôler le sens de rotation d’une d’une hauteur mono-atomique, une excellente
molécule-pignon, molécule en forme d’étoile, le long surface de roulement.
de cette crémaillère avec une précision meilleure que
0.1 nanomètre. Pour réaliser cette expérience, nous ➜ Comment procédez-vous ensuite ?
avons d’abord conçu avec A. Gourdon la molécule- L’expérience réalisée par L. Grill consiste ensuite à
pignon. A. Gourdon a synthétisé cette molécule. En déposer délicatement des molécules essieu-roues sur
plus de son rôle mécanique, cette molécule est la surface de cuivre puis à repérer par imagerie STM
capable de s'auto-assembler sur une surface pour et à très basse température les molécules se trouvant
former de petits cristaux bidimensionnels faits d'une dans la bonne orientation par rapport aux rangées
mono-couche parfaitement organisée. Les bords de d’atomes de la surface. Ensuite la pointe du STM
ces cristaux conservent la dentelure des molécules est positionnée sur une roue afin de la faire tourner
qui les composent. Une de ces bordures sert alors en avançant la pointe.
de crémaillère pour l’expérience de mécanique
moléculaire qui a été réalisée par L. Gross sur ➜ L’étape suivante est donc la voiture
un microscope à effet tunnel (STM) à basse moléculaire ?
température. Une voiture moléculaire… d’abord guidée par la
pointe du STM et peut-être un jour téléguidée, afin
➜ La roue moléculaire est donc l’étape d’envoyer les informations pour la faire avancer sur
suivante ? une surface sans fil à la molécule !
Oui, G. Rapenne a monté deux roues moléculaires
sur un essieu le plus court possible afin de pouvoir 1- Références : Nature Materials, 6, 30 (2007) et Nature
contrôler la rotation d’une des roues et suivre cette Nanotechnology, 2, 95 (2007), publiés en ligne
rotation en temps réel. Pour préparer cette le 10 Décembre 2006 et le 21 janvier 2007, respectivement.
expérience, nous avons conçu et synthétisé une
machinerie moléculaire simple faite d’une molécule-
Contact: joachim@cemes.fr
essieu de 0.6 nm de long où viennent se lier

>>> Jean-François DONATI, DR CNRS
au laboratoire d’astrophysique de Toulouse-
Tarbes (LATT, unité mixte UPS/CNRS)
>>> Un réseau complexe de lignes de champ
magnétique surgit de la surface de la bébé-étoile
SU Aurigae. Cette image a été obtenue grâce à
l'effort conjoint de NARVAL et ESPaDOnS.
NARVAL scrute
la vie magnétique des étoiles
Un nouvel instrument, NARVAL, vient d’être installé sur le Télescope
Bernard Lyot (TBL) du Pic du Midi, le propulsant ainsi à la place de premier
observatoire mondial du magnétisme des astres. Jean-François Donati,
concepteur de l’instrument NARVAL, nous en explique les enjeux.
➜ Quelle est la fonction de NARVAL ?
NARVAL a pour but de décrypter la lumière des étoiles,
d’une part en analysant - par le biais d’un spectrographe
- la manière dont l’intensité lumineuse émise par les
étoiles se distribue en couleurs élémentaires, d’autre part
en examinant - à l’aide d’un polarimètre - la façon dont
cette onde lumineuse vibre dans l’espace. D’où son nom
de spectropolarimètre. Les équipes de recherche
toulousaines ont acquis une compétence et une notoriété
mondialement reconnues dans le domaine de la
spectropolarimétrie astronomique.
➜ Comment est né NARVAL ?
NARVAL est le frère jumeau d’ESPaDOnS, conçu et mis
au point par notre équipe entre 1999 et 2004, puis
installé sur le télescope Canada-France-Hawaii (TCFH)
au sommet du volcan Mauna Kea à Hawaii.
➜ Quelles seront les principales applications
scientifiques ?
NARVAL et ESPaDOnS sont des instruments conçus et
optimisés pour étudier les champs magnétiques des astres
et leurs effets sur la vie des étoiles et des planètes.
En effet, la polarisation contenue dans la lumière des
étoiles permet d’étudier les champs magnétiques qu’elles
abritent, et d’évaluer non seulement leur intensité,
mais aussi la manière dont ils sont distribués,
orientés et structurés.
Mais aujourd'hui, relativement peu de choses sont
connues au sujet de ces champs magnétiques - même
celui du Soleil reste encore un mystère pour nous. Afin
de résoudre ces énigmes, les astrophysiciens en sont venus
à observer le champ magnétique d’étoiles très diverses,
en procédant à la manière d’un docteur qui ausculte
plusieurs patients pour percer les secrets d’une maladie.
➜ Existe-t-il d’autres instruments équivalents au
monde ?
NARVAL et ESPaDOnS sont, de très loin, les
instruments les plus efficaces au monde pour mener des
études sur le magnétisme des astres. Mais si ESPaDOnS
équipe un télescope de plus grande taille, il partage les
nuits au TCFH avec d’autres instruments également très
sollicités et n’est utilisé que 50 nuits par an ; NARVAL
page 17
Vie des laboratoires
est en revanche disponible à plein temps pour les
astronomes, ce qui en fait le principal observatoire
mondial du magnétisme des astres. NARVAL va donc
permettre aux astronomes français et étrangers de mettre
les bouchées doubles et de mener des projets beaucoup
plus ambitieux qu’auparavant. Les scientifiques de
plusieurs pays ne s’y sont pas trompés, en prenant
d’assaut le télescope dès l’ouverture de NARVAL à la
communauté!
➜ ESPaDOnS et NARVAL sont donc concurrents ?
Bien au contraire! ESPaDOnS se concentre plutôt sur des
études ponctuelles d’étoiles peu lumineuses, alors que
NARVAL mène des études de fond nécessitant un suivi
prolongé et répété d’étoiles plus brillantes et plus
nombreuses. Mais la complémentarité de NARVAL et
ESPaDOnS est encore plus évidente lorsqu’ils travaillent
de concert: comme le Soleil se couche sur les Pyrénées
quand il se lève sur Hawaii, NARVAL et ESPaDOnS ne
perdent alors plus une miette des secrets de la vie
magnétique des étoiles!
➜ Combien de temps pour réaliser ce projet ?
NARVAL, d’un coût d’un million d’euros, a directement
bénéficié du développement d’ESPaDOnS, si bien que sa
construction n’a duré que 2 ans à peine, entre 2004 et
2006.
➜ Quel est le temps de vie prévisible
de NARVAL ?
Vu son caractère innovant, NARVAL devrait rester
compétitif sur le plan international pour une durée d’au
moins 10 ans, assurant du même coup la pérennité de
l’astronomie au Pic du Midi pour la prochaine décennie.
Contact: donati@ast.obs-mip.fr
Pour en savoir plus :
http://www.ast.obs-mip.fr/projets/narval/v1/
 GÉNIE DES PROCÉDÉS

Le Génie des procédés :

de l’industrialisation
au développement durable
Le génie des procédés est une science méconnue. Pourtant, en 60 ans,
elle s’est retrouvée au cœur des enjeux de notre société de production.

Si tout le monde connaît Paul Sabatier, prix Nobel,
son élève Joseph Cathala mérite lui aussi sa place
dans le panthéon des scientifiques toulousains. Il
fut le pionnier en France du génie chimique,
science née aux Etats-unis et en Angleterre et
dOSSIER
qui vise à concevoir, calculer, fabriquer,
dimensionner les appareils et les techniques
utilisés dans l’industrie en vue d’une production
à grande échelle. Très rapidement, ses concepts
de base appliqués en premier lieu à la chimie ont

>>> Martine POUX, Ingénieur de Recherche
INP au Laboratoire de Génie Chimique
(LGC, unité mixte UPS/CNRS/INP) et
Joël BERTRAND, DR CNRS et
Directeur du LGC.
qu’il a implantée à Toulouse après un séjour
Outre-Manche.
En 1949, il n’y a même pas 60 ans, Joseph Cathala
crée l’Institut de Génie Chimique à Toulouse. A la
même période, Maurice Letort, adoptait une
démarche similaire à Nancy en fondant l’Ecole
Supérieure des Industries Chimiques. Aujourd’hui
encore, ces deux pôles sont leaders en France en
recherche et en formation dans le domaine du
génie des procédés.
Mais, comment définit-on le génie des procédés ?
Le point de départ est le génie chimique, science
pu être transposés à toutes les industries de
transformation de la matière : la chimie, les
matériaux, l’agro-alimentaire, la métallurgie, le
traitement des eaux, la pharmacie…La discipline
prenant alors la dénomination de génie
des procédés.
De la goutte au réacteur
Le génie des procédés se décline à plusieurs
échelles. Il intègre l’étude des phénomènes
locaux, par exemple au niveau d’une particule, >>>

Les filières de formation en Génie des Procédés

L’Université Paul Sabatier (UPS), l’Institut National Polytechnique (INP), et l’Institut National des Sciences
Appliquées (INSA) proposent à Toulouse un panel de formations diplômantes en génie des procédés, allant
du niveau Technicien via le département « Génie Chimique - Génie des Procédés » de l’IUT Paul Sabatier, au
niveau Ingénieur et au Doctorat.

Ainsi, l’UPS propose un master, dans la mention Mécanique, Energie et Procédés, avec une spécialité
Recherche (Génie des Procédés et Environnement) et deux spécialités professionnelles (« Procédés physico-
chimiques » et « Procédés de production, contrôle et qualité des produits de santé »).
Il faut aussi citer la formation en ingénieurs spécialisés en génie des procédés proposée par l’INSA, l’Ecole
Nationale Supérieure d’Ingénieurs en Arts Chimiques et Technologiques, ENSIACET, et l’Ecole des Mines
d’Albi-Carmaux.

La poursuite en Doctorat s’effectue dans le cadre de l’école doctorale Typep, (Transfert, dynamique des
fluides, énergétique et procédés) co-habilitée UPS/INP/INSA/EMAC. Environ une quarantaine de thèses par an
sont soutenues dans la thématique Génie des procédés.

page 18 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9

 Génie des procédés

dOSSIER
>>>
d’une goutte soumise à des contraintes
d’écoulement, jusqu’à une approche plus globale
de l’appareil de transformation (réacteur,
extracteur..). La phase ultime englobe le procédé
au complet, c’est-à-dire toutes les étapes de
production incluant la gestion des fluides, le
contrôle, la commande... Ces études font appel à
des techniques expérimentales pointues, à des
compétences en modélisation et simulation >>> Réacteur d'oxydation en CO2 supercritique sous
numérique. pression (150 bar).

Le génie des procédés n’est donc pas une

discipline « isolée » : il se rapproche, pour une
étude locale des phénomènes de la physique, de
la chimie, de la biologie, mais aussi de la
thermique, de la mécanique des fluides, de
l’automatique, de l’informatique pour la
conception du procédé. C‘est sûrement dans cet
aspect plurisdisplinaire que le Génie des Procédés
puise toute sa richesse.
Enfin, c’est une science inventive, innovante et
sociétale. C’est elle qui apporte la réponse aux
grandes problématiques actuelles par la création
de nouveaux procédés répondant à des normes
environnementales strictes, de développement
durable, de sécurité, d’énergie.
Les pages qui suivent illustrent, de manière
non-exhaustive, cette diversité.
Contacts : Martine.Poux@ensiacet.fr et
Joel.Bertrand@ensiacet.fr

Le potentiel de recherche
sur le site toulousain
La recherche toulousaine en génie des procédés est essentiellement concentrée au
Laboratoire de Génie Chimique, unité mixte CNRS/UPS/l’INP. Ce laboratoire
rassemble près de 240 personnes, ce qui en fait le centre de recherche généraliste le
plus important en France et même en Europe. Les points forts de recherche se
déclinent autour des thématiques : Bioprocédés et systèmes microbiens ; Génie des
Interfaces et des milieux divisés ; Procédés Electrochimiques, Procédés et systèmes
industriels et Réaction, mélange et séparation.

D’autres laboratoires toulousains ou midi-pyrénéens sont spécialisés dans des

domaines d’activité plus ciblés. On peut citer le Laboratoire de chimie agro-
industrielle (LCA, unité INRA/INP), le Laboratoire d’Ingénierie des systèmes
>>> Simulation numérique biologiques et des procédés (LISBP, unité mixte CNRS/INSA/INRA) et le Laboratoire de
de la forme du vortex développé
génie des procédés et des solides divisés à Albi, (LGPDS, unité mixte CNRS/EMAC).
dans une cuve agitée.

page 19
 Génie des procédés

dOSSIER Des solvants propres

>>> Séverine CAMY, maître de conférences
à l’INP., et Jean-Stéphane CONDORET,
professeur à l’INP., tous deux chercheurs
au Laboratoire de Génie Chimique (unité
mixte UPS/CNRS/INP) devant le prototype
d'oxydation haute pression.
pour une chimie verte
Les fluides supercritiques offrent une alternative saine et non polluante
aux solvants traditionnels.
Ils sont souvent toxiques, parfois dangereux. Ils
s’enflamment, émettent des composés organiques
volatils nocifs pour la santé, etc. Pourtant, dans le
domaine de la chimie, les solvants organiques sont
très souvent indispensables pour la réalisation des
réactions : ils mettent en contact les molécules
réactives, ajustent la viscosité du système réactionnel,
parfois aussi assurent un rôle de "tampon
thermique". Si ces solvants auront du mal à
disparaître tout à fait, la nécessité de passer à une
chimie verte remet en question leur utilisation
systématique. Parmi les pistes alternatives,
l'utilisation des fluides supercritiques, et le dioxyde
de carbone en particulier, apparaît très séduisante.
Dans cet état intermédiaire entre gaz et liquide, ces
fluides présentent un pouvoir solvant ajustable (en
variant pression ou température), et des propriétés de
transport (diffusivité, viscosité..) très favorables
(meilleures que celles des solvants usuels). De plus, le
dioxyde de carbone est un composé "naturel" dont le
contact avec les produits est considéré comme
totalement inoffensif. Nul besoin avec lui de passer
par les étapes classiques de purification des produits
qui ont souvent pour but de traquer les dernières
traces de solvant organique, surtout dans le domaine
de l'agro-alimentaire ou de la santé. Par ailleurs,
quand il et utilisé comme solvant, le dioxyde de
carbone joue un rôle négligeable dans l'augmentation
de l'effet de serre atmosphérique. Non seulement
cette utilisation émet de très faibles quantités vers
l’atmosphère par rapport aux émissions issues des
combustibles fossiles, mais en plus il est alors quasi
intégralement recyclé.
Implants chirurgicaux
Notre laboratoire possède depuis une dizaine
d'années une expertise dans le domaine des
fluides supercritiques. Ainsi, en collaboration
avec des spécialistes de la cellulose du Centre
de Recherche sur les Macromolécules
Végétales de Grenoble (CERMAV), l'équipe
“fluides supercritiques” a montré que l’on
devient hémostatique (c’est à dire capable de stopper
les hémorragies), antimicrobienne et dégradable par
les organismes supérieurs, lui ouvrant ainsi la voie
pour la fabrication d'implants chirurgicaux à
biorésorbabilité contrôlée. Des produits de cette
nature existent déjà depuis plusieurs années, comme
les spécialités Surgicel® ou Interceed®,
commercialisées par le géant américain
Johnson&Johnson. Sur le plan industriel, l’absence
d’alternatives permet actuellement à cette société de
bénéficier d’une situation de quasi monopole. La
technologie* proposée par le LGC et le CERMAV
concurrence avantageusement leur procédé, qui utilise
des solvants perfluorés, onéreux et néfastes pour
l’environnement.
La conception de l'appareillage expérimental, et
son utilisation, requièrent un savoir faire et une
technicité spécifique, puisqu'il s'agit d'un
appareillage fonctionnant sous haute pression
(jusqu'à 200 bars).
Prix de l’innovation
Ce procédé de fabrication, lauréat du Prix de
l'Innovation Midi-Pyrénées en 2005, est représentatif
de la façon dont science et technologie peuvent
s'allier pour élaborer des matériaux performants,
à très haute valeur ajoutée, qui permettent
d’apporter de véritables services dans la vie des gens,
notamment dans le domaine de la santé. Ces
matériaux sont pensés, dès le départ, avec une
optique de biocompatibilité et de développement
durable.
Cette action est enfin un bon exemple de
collaborations permettant le croisement optimal
des compétences, procédés et produits et une vraie
préoccupation de la gestion du transfert
de technologie vers le secteur industriel.
(*) MONTANARI S., VIGNON M., SAMAIN S., CONDORET J.S.
(2004) Brevet français N° FR FR 2 873 700
Procédé d’oxydation contrôlée des polysaccharides

>>> Au voisinage du point supercritique, la phase gaz
dense et la phase liquide expansée sont de plus en plus
semblables, jusqu’à ne plus pouvoir être distinguées
pour passer à l‘état supercritique, où les molécules
s’associent en agrégats fugaces et très mobiles.
pouvait oxyder sélectivement de la cellulose,
en milieu dioxyde de carbone supercritique,
utilisant le dioxyde d’azote (NO2) comme
Contacts : Jeanstephane.Condoret@ensiacet.fr
oxydant. Cette oxydation sélective donne à la
et Severine.Camy@ensiacet.fr
cellulose des propriétés remarquables. Celle-ci

page 20 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9

dOSSIER
>>> Eric CLIMENT, Maître de conférences
à l’INPT et Olivier MASBERNAT, CR CNRS,
au Laboratoire de Génie Chimique
(unité mixte CNRS-INPT-UPS)
>>> Simulation de la dispersion de bulles
dans un écoulement turbulent.
Lorsque l’écoulement
modifie les transferts…
Que deviennent des bulles, des grains de sable, ou des gouttes d’huile dispersées
dans de l’eau en mouvement dans un circuit de tuyauterie ? La réponse à cette
question conditionne l’efficacité d’un procédé industriel.
Le taux de production d’une espèce chimique ne dépend
pas uniquement de la cinétique de la réaction. La
présence d’un écoulement conditionne la mise en
contact des réactifs et contrôle ainsi les performances
du réacteur. Un procédé industriel de transformation
de la matière ou de l’énergie fait ainsi intervenir à la
fois des phénomènes d’interaction physiques et
chimiques qui sont intimement couplés.
Dans le cas où le milieu fluide est composé de plusieurs
phases, dont l’une au moins est fractionnée sous forme
d’inclusions dispersées (gouttes, bulles ou particules
solides), les phénomènes de transport et de transfert
de matière deviennent extrêmement compliqués à
prédire. Quel est le rôle de l’écoulement sur la
dispersion de la phase dispersée, la déformation voire
la rupture des interfaces fluides et en retour comment
est modifiée la structure de l’écoulement par les
transferts aux interfaces de quantité de mouvement,
d’énergie et de masse ? Cette question est au cœur de
notre activité de recherche. Progresser dans la
compréhension et la prédiction du comportement
des écoulements diphasiques en milieux denses nécessite
le développement d’outils de simulation et de moyens
de mesure qui permettent une analyse locale
des phénomènes.
Mesurer l’écoulement au laser
Les moyens de mesure les plus performants sont fondés
sur des techniques optiques, non-intrusives. Grâce au
soutien de la fédération de recherche FERMaT(1), nous
avons mis en place des moyens de vélocimétrie laser et
de visualisation par caméra rapide en milieu optique
homogène. Les indices optiques des deux phases sont
ajustés par ajout d’un soluté dans le fluide porteur,
ce qui permet d’éliminer les interfaces et de mettre en
œuvre les techniques optiques évoquées. Le suivi de la
trajectoire d’une inclusion marquée (goutte ou
particule solide) ou la vélocimétrie par images de
particules (PIV) dans la phase continue donne accès
au mouvement instantané des deux phases ou encore
à la déformation des interfaces.
Ces travaux trouvent des applications dans l’industrie
pétrolière par exemple. On sait que, à l’issue de l’étape
d’extraction du pétrole, le mélange diphasique eau-
page 21
Génie des procédés
huile subit de profondes modifications au cours de son
transfert quand il passe par des irrégularités (coudes,
changement de section de conduite, diaphragme). Nous
avons pu mettre en évidence la relation qu’il y a entre
la turbulence dans l’écoulement du fluide et l’évolution
de la distribution des tailles de gouttes. C’est une
donnée indispensable pour le dimensionnement des
installations industrielles de séparation et de transport.
Prédire le colmatage d’un filtre
La simulation numérique est aussi d’une aide précieuse
pour analyser le rôle respectif de chacun des termes
d’interaction sur le comportement global de la
suspension. Dans ce contexte, on développe des codes
numériques pour simuler le comportement de la phase
continue qui prennent en compte la présence des
interfaces des inclusions. On a alors le choix de l’échelle
spatiale de la simulation qui va de l’écoulement autour
d’une particule isolée jusqu’au calcul de plusieurs
milliers de particules dont les trajectoires sont liées aux
propriétés locales et instantanées de l’écoulement. Le
développement de ces codes est effectué en partenariat
avec l’Institut de Mécanique des Fluides de Toulouse
(unité mixte UPS/CNRS/INPT) mais aussi avec le
support des centres de calcul scientifique à haute-
performance régionaux (CalMip) et nationaux
(IDRIS/CINES). Le post-traitement de cette somme
colossale d’informations permet de valider ou
d’infirmer des modèles macroscopiques d’interaction.
Nous avons ainsi pu simuler l’adhésion et la remise
en suspension de particules colloïdales sur une paroi
filtrante soumise à un écoulement turbulent. La
simulation numérique conduit alors à une meilleure
prédiction du colmatage de la surface poreuse.
(*) MONTANARI S., VIGNON M., SAMAIN S., CONDORET J.S.
(2004) Brevet français N° FR FR 2 873 700
Procédé d’oxydation contrôlée des polysaccharides
Contacts : Eric.Climent@ensiacet.fr et
Olivier.Masbernat@ensiacet.fr
 Génie des procédés
dOSSIER
>>> Catherine XUEREB, Directrice de Recherche
CNRS au Laboratoire de Génie Chimique
(unité mixte UPS/CNRS/INP)
>>> Empilement de plaques de silicium
microstructurées catalytiques, internes
d'un microréacteur.
page 22 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9
Small is beautiful :
voici les microréacteurs
Plus rapides, plus rentables, moins polluantes, moins dangereuses : les
réactions chimiques réalisées dans des réacteurs miniaturisés présentent
de nombreux avantages.
« Tout ce qui est petit est mignon »... Ce dicton
populaire, semble avoir fait des émules dans le monde
scientifique ces dernières années, avec notamment
les nanotechnologies... et les microréacteurs.
Non, les microréacteurs ont beau être de vrais bijoux
technologiques, ils ne sont pas étudiés pour leur
esthétique, mais bien pour leurs capacités spécifiques,
qui ouvrent de nouveaux champs aux transformations
chimiques ou physiques.
Un microréacteur est un appareil au sein duquel vont
se dérouler des opérations de mélange, de contact entre
phases, de réaction, de transfert de masse ou de
transfert thermique. Mais pourquoi les conduire à
toute petite échelle ? Tout simplement parce que l’on va
exploiter les propriétés liées aux très petits volumes
manipulés, et surtout créées par le très fort rapport
entre les surfaces de l’appareil et le volume des fluides
qu’il contient, ainsi que les échelles temporelles très
courtes qui sont naturellement associées aux petites
échelles spatiales. La largeur spécifique d’un canal ainsi
miniaturisé se situe dans la gamme 200Ìm à 5mm.
Eviter les emballages dangereux
Réussir une miniaturisation signifie optimiser la taille
du micro-procédé en fonction des contraintes liées à
l’opération qui va s’y dérouler. Ici, c’est l’appareil que
l’on adapte au produit, et non plus l’inverse. Citons un
exemple : de nombreuses réactions chimiques doivent se
dérouler en milieu dilué pour rester dans un domaine
opératoire où l’on sera capable d’évacuer l’énergie
fournie par une réaction qui dégage de la chaleur. On
évite ainsi des emballements qui pourraient s’avérer
dangereux. Travailler dans un microréacteur peut
permettre d’utiliser des réactifs purs et à des
températures plus élevées, ce qui augmente les
rendements, diminue la formation de sous-produits et
autorise la réduction des étapes de séparation
ultérieures. Dans cet exemple, il faut assurer un certain
débit de production, de l’ordre de quelques litres/heure
pour un appareil. Le dimensionnement s’effectuera sous
la contrainte du transfert thermique (diamètre et
forme des canaux) et du temps de séjour (longueur des
canaux). Une production plus importante sera obtenue
par la parallélisation de plusieurs unités.
De nombreuses applications des micro et mini-
réacteurs sont étudiées dans notre laboratoire. On peut
évoquer les réaction électrochimiques, les réactions
catalytiques (dont la dépollution de composés
organiques volatiles), la fabrication d’émulsions à taille
contrôlée, l’identification des paramètres de cinétiques
rapides, le mélange d’espèces miscibles, les transferts et
la réaction en milieu diphasique gaz-liquide ou liquide-
liquide, tout en intégrant bien sûr les aspects liés au
transfert thermique.
Bancs d’essais
Nous disposons d’appareils commercialisés ou en phase
de mise au point par les équipementiers du secteur,
ainsi que de microréacteurs conçus en collaboration
avec le LAAS (unité CNRS, associée à l’UPS), qui
maîtrise les technologies pour la fabrication d’appareils
en silicium/verre ou en matériau polymère transparent
(PDMS). Ces dernières structures permettent l’analyse
des phénomènes internes, soit par des caméras rapides
couplées à des microscopes, soit par micro-vélocimétrie
par images de particules (Ì-PIV). Le montage et
l’instrumentation de ces bancs d’essai ont demandé un
élargissement des compétences des équipes techniques,
les problématiques technologiques étant complètement
nouvelles, ce qui s’est opéré au mieux étant donné les
connaissances de base de ces personnels. Les études
sont souvent complétées par de la modélisation qui
couvre les aspects hydrodynamique, transferts et
réaction. Cette approche permet entre autres choses de
prédire l’influence de la géométrie du microréacteur sur
l’opération, ou l’influence des paramètres opératoires
sur l’avancement de la réaction et le profil de
température...
Les microprocédés ouvrent des possibilités nouvelles
pour la recherche et pour les entreprises. Ils s’inscrivent
totalement dans une démarche de qualité, de sécurité,
d’innovation et d’intensification des procédés.
Une brique pour l’usine du futur...
Contact : Catherine.Xuereb@ensiacet.fr
dOSSIER
>>> Claire ALBASI, chargée de recherche
CNRS, au laboratoire de Génie Chimique
(unité mixte UPS/CNRS/INP)
Eliminer les médicaments
présents dans les eaux usées
Un nouveau procédé, qui associe une membrane et des microorganismes
qui consomment des molécules toxiques, permet de nettoyer des effluents
particulièrement dangereux.
Le bioréacteur à membrane est un procédé qui couple
un traitement biologique et une séparation par
membrane pour produire un effluent exempt de
bactéries et de matières en suspension. Comme dans
un traitement conventionnel, la biomasse épuratrice,
composée de microorganismes indigènes de l’eau,
consomme la pollution organique (carbone et azote
assimilables). En l’absence de membrane, la séparation
physique entre l’eau et les microorganisme se fait par
simple décantation. Mais cette décantation ne s’opère
plus correctement quand les microorganismes se sont
trop développés. La membrane va justement
permettre de séparer l’eau des microorganismes à des
concentrations plus élevées, c’est à dire pour des temps
de séjours des boues dans le bioréacteur plus longs.
Les bioréacteurs à membranes présentent de nombreux
avantages. Ainsi, la qualité de l’eau ne dépend plus
de la décantation (supprimée). Par ailleurs, le choix
judicieux du diamètre de pores de la membrane
assure une désinfection de niveau quasi constant.
La compacité et la flexibilité des installations réduisent
leur volume d’un facteur 4. L’efficacité de la
biodégradation des composés organiques est accrue
par une augmentation du temps de séjour, égal à celui
de la biomasse. Enfin, la quantité de boues produites
est plus faible, ce qui réduit d’autant leur coût
de traitement.
Les premiers travaux de recherche sur les bioréacteurs
à membranes réalisés dans notre laboratoire ont porté
sur le fonctionnement de bioréacteurs à membranes
immergées (fibres creuses Polymem, Toulouse).
Anti-cancéreux au sortir des hôpitaux
Ayant évalué les limites, mais surtout le potentiel
de ses procédés, il était tentant d’étendre les
perspectives de traitement à des effluents
qualifiés de difficiles.
Les effluents hospitaliers, ceux de l’industrie
pharmaceutique, mais aussi ceux des stations
d’épuration sont toxiques à plusieurs titres, et
notamment parce que, malgré leur faible
concentration, ils se dégradent mal que ce soit par
des procédés biologiques ou chimiques. Or, leur
présence dans l’environnement se décline par des
page 23
Génie des procédés
>>> Pilote bioréacteur à membrane.
cancers, des allergies, des maladies thyroïdiennes, une
baisse de la fertilité, des malforamtions chez l’embryon.
Ces molécules dans l’environnement aquatique sous
forme initiale ou métabolisée posent le double problème
de la quantification de leur toxicité et des voies
possibles de leur élimination. Cette préoccupation
n’est actuellement sous le coup d’aucune législation,
ni en France ni ailleurs dans le monde.
Nous avons alors proposé d’évaluer la potentialité
d’un bioréacteur à membrane pour éliminer des
médicaments et plus particulièrement des médicaments
anticancéreux contenus dans des eaux usées au sortir
des hôpitaux. En effet, ce procédé doit permettre
d’allonger le temps de contact entre les molécules
toxiques et les microorganismes épurateurs. Pour cela,
l’accent sera mis sur le paramètre temps de séjour
des boues dans le bioréacteur, qui se présente comme
le verrou d’une épuration avancée. Conjointement
à l’évaluation du fonctionnement du procédé, la
disparition de la toxicité sera suivie par des méthodes
de génotoxicité. Ce projet est financé par l’Agence
Nationale de la Recherche et rassemble des compétences
multiples de notre laboratoire ainsi que des partenaires
extérieurs, comme la Pharmacie Hospitalière de
Montpellier et les entreprises CDS et Pall Exekia.
Cette étude est la première du genre pour ce qui
concerne les médicaments anticancéreux ; son
originalité réside dans l’association de compétences
interdisciplinaires mises au service de sa réalisation.
Contact : Claire.Albasi@ensiacet.fr
 Génie des procédés
dOSSIER
>>> Brigitte CAUSSAT, Maître de Conférences
à l’ INPT, chercheur au laboratoire de
Génie Chimique (unité mixte CNRS/UPS/INPT).
>>> Philippe SERP, Professeur à l’INPT chercheur
au laboratoire de chimie de coordination
(LCC, unité du CNRS associée à l’UPS et à l’INPT).
>>> Réacteurs de CCVD en lit fluidisé pour
la synthèse en masse de nanotubes
de carbone multi-parois.
page 24 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9
Nanotubes de carbone :
vers une production
en masse et à faible coût
Comment transposer une voie de synthèse de laboratoire à un procédé industriel
pour produire des nanomatériaux aux propriétés révolutionnaires ? C’est ce qu’a
réussi une équipe pluridisciplinaire.
La découverte des nanotubes de carbone en 1991,
par le japonais Sumio Iijima, lors de l'étude de la
synthèse des fullerènes (C60) a permis de mettre à
jour une nouvelle forme cristalline du carbone. Les
nanotubes de carbone sont des structures tubulaires
constituées d'un ou de plusieurs feuillets de carbone
ou graphène enroulés sur eux-mêmes. Ces molécules
unidimensionnelles ont une longueur micrométrique
et un diamètre variant de un à plusieurs nanomètres
selon le nombre de tubes co-enroulés. On parle ainsi
de nanotube mono- ou multi-parois
Les propriétés mécaniques, électriques et thermiques,
exceptionnelles des nanotubes de carbone suscitent
depuis plusieurs années un engouement hors du
commun de la part de la communauté scientifique.
En effet, ce matériau est cent fois plus résistant et six
fois plus léger que l'acier, c’est le meilleur émetteur
à effet de champ connu, et sa conductivité thermique
est comparable à celle, exceptionnelle, du diamant.
Des nanotubes de carbone commencent aujourd’hui
à être employés pour fabriquer des matériaux
composites légers et extrêmement résistants, des
plastiques conducteurs, des capteurs chimiques et
biologiques, des batteries et piles à combustible à
faible consommation, … Outre les aspects
toxicologiques qui font l’objet de nombreuses études
de part le monde, l’obstacle majeur au développement
de toutes ces applications est le coût élevé de
production ainsi que le manque de compréhension
des mécanismes en jeu lors de la synthèse
de ces nano-objets.
Synthèse performante
En 1999, des spécialistes de catalyse et de
matériaux du LCCFP (Laboratoire catalyse chimie
fine et polymères, équipe d’accueil de l’INPT), ont
mis au point une voie de synthèse particulièrement
performante de nanotubes de carbone multi-parois,
par CCVD (Catalytic Chemical Vapor Deposition) en
lit fluidisé, utilisant des catalyseurs pulvérulents fer
sur alumine et de l’éthylène comme source de
carbone. Dans le but d’accroître la productivité
du procédé et d’optimiser ses conditions de
fonctionnement, le LCCFP a fait appel aux
compétences du LGC début 2001..
Le procédé de CCVD en lit fluidisé consiste
à assurer un brassage vigoureux de la poudre
catalytique par le gaz réactif dans un réacteur
cylindrique vertical. Dans des conditions
appropriées de température, débit et pression
partielle en réactif, les nanotubes de carbone
croissent sous la forme d’enchevêtrements
tridimensionnels autour des grains de catalyseur.
L’influence des paramètres opératoires clés sur le
rendement du procédé, sa sélectivité, l’efficacité
catalytique et les caractéristiques des nanotubes
formés, a été étudiée. Il a été montré qu’au delà de
650°C, le procédé perd en sélectivité mais produit
des nanotubes de plus forte surface spécifique (la
surface dépliée), car probablement avec moins de
défauts intra-tubes. Dès 5 minutes de dépôt, des
nanotubes de longueur micronique et de diamètre
proche du diamètre final existent, ce qui tendrait à
montrer que la nucléation et la croissance sont très
rapides et que cette dernière démarre par la paroi
externe. La croissance des nanotubes engendre une
élévation spectaculaire de la hauteur de lit fluidisé
et une baisse concomitante de la vitesse au
minimum de fluidisation avec le temps de dépôt.
Ces divers éléments nécessitent un contrôle affiné
des paramètres de fluidisation et du procédé
en général.
Productivité multipliée par 100
Grâce à un soutien de l’ANVAR, deux changements
d’échelle successifs du procédé ont alors été réalisés
au LGC et sa productivité est ainsi passée en moins
de deux ans de 3 g/h à plus de 300 g/h, plaçant
ainsi ces laboratoires en position dominante au
plan international en terme de productivité. Depuis
2002, la société ARKEMA soutient et participe
activement au développement de cette technologie
en apportant ses propres modifications.
Une convention d’exploitation a été signée en juin
2006 entre ARKEMA et l’INPT et le CNRS.
Le 30 janvier 2006 a eu lieu l’inauguration
de la première unité d’Europe sur le site d’ARKEMA
à Lacq (Pyrénées-Atlantiques), produisant près
de 10 tonnes par an de nanotubes. ARKEMA
envisage un véritable développement industriel
de cette technologie.
Contacts : Brigitte.Caussat@ensiacet.fr et
Philippe.Serp@ensiacet.fr
dOSSIER
>>> Pierre GROS, Maître de Conférences à l’UPS et
Maurice COMTAT, Professeur à l’UPS,
chercheurs au Laboratoire de Génie Chimique
(LGC, unité mixte UPS/INP/CNRS).
>>> Contrôle électrochimique
de marqueurs redox dans le vin.
Un génie électroanalytique
Génie des procédés
multi-tâches
Quel point commun entre l’étude du vieillissement cutané, la confection
de cosmétiques, la microoxygénation du vin, l’analyse des sels nutritifs
dans la colonne d’eau océanique ? Dans tous ces domaines on utilise des
capteurs et des méthodes électrochimiques.
L’électrochimie peut être définie comme la discipline
étudiant les interfaces entre des conducteurs
électroniques et des conducteurs ioniques et les
réactions de transfert d’électrons qui s’y déroulent.
Des méthodes simples, rapides, précises et à haute
résolution spatio-temporelle sont proposées pour
l’analyse de composés capables d’échanger des
électrons avec un conducteur électronique, soit
par réaction électrochimique directe, soit après
des réactions chimiques conduisant à des espèces
électro-actives.
Cosmétiques anti-vieillissement
>>> Analyse électrochimique
Depuis les années 2000 notre équipe développe
non invasive à la surface de la peau.
notamment des capteurs et des méthodes
électrochimiques d’analyse pour l’étude et le
contrôle des processus d’oxydation en milieu Grands fonds marins
biologique complexe. Pour l’analyse de la peau,
un réseau de microcapteurs non invasifs simplement Les silicates sont des sels nutritifs essentiels
appliqués sur la peau détecte et dose l’acide dans les environnements aquatiques et l’analyse
ascorbique, l’acide urique et le glutathion à la précise de leur concentration est importante.
surface de la couche cornée. Ce dispositif permet de Traditionnellement dosés par spectrophotométrie
montrer en temps réel l’effet d’un stress photo- après leur réaction avec des sels de molybdène,
induit sur le pouvoir antioxydant global de la peau. une méthode électrochimique a été développée,
Parallèlement, l’utilisation d’un microréacteur conduisant à un dispositif autonome (les sels
électrochimique en couche mince a débouché sur de molybdène et les protons sont apportés dans
une méthodologie de contrôle des propriétés anti- l’échantillon par une électrolyse à potentiel
vieillissement de produits dermo-cosmétiques dans constant et l’analyse du complexe faite par
une configuration semblable à la couche de crème chronoampérométrie). De même quelques méthodes
appliquée sur la peau. électrochimiques sont adaptées pour mesurer des
concentrations de sulfure au voisinage des sources
Oxygénation du vin hydrothermales océaniques.
Une autre application, l’élevage du vin. L’essentiel
(90%) du vin du monde n’est plus élevé en barrique
Contacts :
(qui laisse passer l’oxygène) mais dans des cuves
Contacts : gros@chimie.ups-tlse.fr et
étanches en ciment ou en acier inoxydable. La
comtat@chimie.ups-tlse.fr
technique de la microoxygénation consiste à injecter
dans le vin en cours d’élevage l’oxygène à des doses
et à des vitesses similaires à celles rencontrées au
cours de l’élevage en barrique. Une première
méthode électrochimique permet de définir un
indice global d’aptitude d’un vin à recevoir
l’oxygène et une deuxième est mise en œuvre pour
détecter deux des marqueurs importants dans
l’élevage du vin.
page 25
A propos de… A propos de…
Les Ecoles Doctorales
Les Ecoles Doctorales, tout le monde croît les connaître. Pourtant, leur rôle
exact est loin d’être bien connu. Nous avons fait le point avec Robert
Martino, professeur de chimie et directeur du collège des études doctorales
(CED) de l’UPS.
➜ Pouvez-vous rappeler les principales ➜ Depuis peu le site toulousain s’est doté
missions des Ecoles Doctorales (ED) ? d’un Collège Doctoral (CD) de site.
Les trois principales missions des ED sont : d’assurer la Quel est l’objectif visé ?
gestion de la thèse et de son bon déroulement ; de Le CD de site s’inscrit dans le PRES Université de
>>> Robert MARTINO, professeur à l’UPS
proposer aux doctorants des formations scientifiques Toulouse ; il concerne environ 4000 doctorants
et directeur du collège des études
complémentaires ainsi que des formations à caractère inscrits et 650 docteurs formés annuellement. Il
doctorales de l’UPS.
professionnalisant et de définir un dispositif d’appui à coordonne, dès à présent, la mise en commun des
l’insertion professionnelle des docteurs, ainsi que son moyens de formation professionnalisante mis à la
suivi.. disposition des doctorants du site Midi-Pyrénées.
L’objectif immédiat du CD est l’harmonisation de la
C’est un champ beaucoup plus vaste que la charte des thèses et la rédaction des principes
simple attribution des allocations de recherche… d’application de l’arrêté du 7 août 2006 relatif à la
L’attribution des allocations de recherche du Ministère formation doctorale (deux chantiers déjà bien avancés)
reste un point essentiel dans la vie de l’ED. Toutefois, ainsi que la mise en place de processus de concertation
il est important de noter que les autres sources de visant à améliorer le fonctionnement du site :
financement des thèses représentent selon les ED, entre harmonisation des procédures d’inscription, des
2 et 4 fois, le nombre d’allocations du Ministère.. En critères de validation d’acquis pour l’inscription
clair, les laboratoires, devant la faible dotation en en thèse…
allocations ministérielles, se sont efforcés de rechercher
d’autres sources de financement pour leurs doctorants. L’objectif visé à plus long terme est de contribuer à
faire reconnaitre, dans le monde économique français,
➜ Quel est le rôle des ED dans l’insertion un statut du docteur distinct de celui de l’ingénieur,
professionnelle et le suivi du devenir ce qui nécessitera une réflexion sur les missions du
des docteurs ? docteur, sa formation, ses qualités intrinsèques et …
Les ED mettent à la disposition des doctorants diverses la sélection des doctorants.
formations à caractère professionnel. Les ED doivent
faire partager aux acteurs de la recherche leur souci Contact : rmartino@chimie.ups-tlse.fr
d’une insertion professionnelle réussie des docteurs,
sachant qu’environ les trois-quarts d’entre eux ne
peuvent pas espérer une carrière académique. Le suivi
du devenir des docteurs qui doit être assuré par les ED
fonctionne globalement bien, mais doit être amélioré
dans certains secteurs disciplinaires.

➜ Pourquoi avoir créé le Collège des Etudes

Doctorales (CED) de l’UPS ?
Le CED de l’UPS a été créé dans le but d’amener les
directeurs d’ED à communiquer sur le mode de
fonctionnent de leurs ED respectives. L’existence du
CED a permis, outre la mutualisation de certains
modules scientifiques ou technologiques, le
développement ou la création d’une offre de formation
professionnalisante commune à toutes les ED :
Doctoriales , modules « Vers mon Métier » et, plus
récemment, perfectionnement dans la maîtrise de la
langue anglaise.

page 26 Paul Sabatier — Le magazine scientifique — numéro 9

La Recherche à l’UPS
Le Potentiel de Recherche de l’Université Paul Sabatier se répartit
sur 99 laboratoires, dont 80 reconnus au niveau national,
la plupart unités mixtes avec le CNRS, l’INSERM, l’IRD, l’INRA, le CNES…
Plus de 2000 chercheurs et enseignants-chercheurs et
1000 personnels technique et administratif travaillent
dans ces laboratoires.
1450 doctorants sont inscrits à l’UPS, répartis dans 9 Ecoles Doctorales.

Les grands domaines de recherche sont :

> Biologie et Santé : 6 laboratoires mixtes, 6 unités INSERM, 14 EA ; 3 IFR.
> Chimie : 5 laboratoires mixtes ; 1 unité CNRS, 1 EA ; 1 JE, 1 Fédération.
> Mathématiques : 3 laboratoires mixtes et 1 Fédération.
> Sciences Ecologiques : 3 laboratoires mixtes ; 1 Fédération.
> Sciences Humaines et de Société : 6 EA, 1 ERT.
> Sciences pour l’Ingénieur : 4 laboratoires mixtes ; 3 EA. 1 ERT,
2 Fédérations.
> Sciences Physiques : 4 laboratoires mixtes ; 1 unité CNRS. 1 Fédération.
> Sciences et Technologies de l’information et de la communication :
1 laboratoire mixte, 1 unité CNRS, 2 EA, 1 ERT, 1 Fédération.
> Sciences de la planète et de l’Univers : 7 laboratoires mixtes. 1 Observatoire.
> Sciences de la Vie : 8 laboratoires mixtes, 1 EA, 2 IFR.

Pour plus de détails consultez : www.ups-tlse.fr rubrique "recherche"

© P. DUMAS
© OMP
Les MASTERS à L’UPS
Domaines > sciences de la modélisation, de l’information et
des systèmes (4 mentions)

de > sciences et techniques de la matière et

de l’énergie (6 mentions)
formation > sciences de la planète et de l’univers (4 mentions)
> sciences de la vie et de la santé (9 mentions)
> sciences humaines et sociales (1 mention)
> gestion (2 mentions)

Le cursus master comporte en 2ème année une centaine de spécialités

“ recherche ” et “ professionnelle ”. Un certain nombre de ces spécialités sont
cohabilitées avec d’autres universités et établissements de la région
toulousaine.