Identification Champignons Importance Medicale

Identification des
champignons
dimportance
mdicale
Stage de laboratoire

Philippe Dufresne
Guy St-Germain
Mars 2013

Table des matires

PARTIE 1 INTRODUCTION LA MYCOLOGIE ET IDENTIFICATION DES CHAMPIGNONS FILAMENTEUX
1. CHAMPIGNON : DFINITION . 3
2. GNRALITS SUR LA PATHOGNICIT DES CHAMPIGNONS .... 3
3. PRINCIPAUX TYPES DE CHAMPIGNONS DIMPORTANCE MDICALE ...... 3
4. PRINCIPAUX TYPES DE MYCOSES.... 4
5. CLASSIFICATION DES CHAMPIGNONS . 5
6. MILIEUX DE CULTURE...... 6
7. TEMPRATURES DINCUBATION .. 6
8. PURIFICATION DE SOUCHES CONTAMINES 6
9. EXAMEN MICROSCOPIQUE .... 6
10. CARACTRISTIQUES DES CHAMPIGNONS FILAMENTEUX ....... 7
11. TYPES DE CONIDIES ET SPORES ASEXUES ............. 8
12. SCHMA DIDENTIFICATION DE CHAMPIGNONS FILAMENTEUX 9
13. IDENTIFICATION LESPCE ..... 14
14. SCURIT EN LABORATOIRE .... 14
PARTIE 2 LES LEVURES
1. DFINITION.... 15
2. SCHMA DIDENTIFICATION DES LEVURES ... 15
3. EXAMEN MICROSCOPIQUE .. 16
4. TESTS PHYSIOLOGIQUES.... 18
5. CARACTRISTIQUES . 19
6. CLEF DIDENTIFICATION .. 20
7. CARACTRISTIQUES DE CRYTPTOCOCCUS NEORMORMANS ET C. GATTII . 21
PARTIE 3 LES DERMATOPHYTES
1. PIDMIOLOGIE ET CLINIQUE ... 23
2. EXAMEN DIRECT ..... 25
3. ISOLEMENT ...... 27
4. MILIEUX DE CULTURE SLECTIFS..... ..28
5. CRITRES ET TECHNIQUES DIDENTIFICATION ....... .29
6. CLASSIFICATION ET DESCRIPTION DES DERMATOPHYTES ... 31
PARTIE 4 LES CHAMPIGNONS DIMORPHES
1. DFINITION ET SCURIT EN LABORATOIRE .. 37
2. ISOLEMENT .. 37
3. MILIEUX UTILISS POUR LA CONVERSION DE LA PHASE MOISISSURE LA PHASE LEVURE .... .37
4. DESCRIPTIONS ..38
5. AUTRES TECHNIQUES DIDENTIFICATION...... 44
6. MYCOSES PROFONDES : RSUM .. 45
7. SRODIAGNOSTIC . 46
ANNEXE 1 MILIEUX DE CULTURE UTILES POUR LISOLEMENT PRIMAIRE DES CHAMPIGNONS ...... ..47
ANNEXE 2 LISTE DE MILIEUX UTILES POUR LIDENTIFICATION DES CHAMPIGNONS ...... 48
ANNEXE 3 PREUVES DE SENSIBILIT AUX ANTIFONGIQUES 49
GLOSSAIRE ... 51
BIBLIOGRAPHIE ... .55

Page 3

PARTIE 1

INTRODUCTION LA MYCOLOGIE
ET
IDENTIFICATION DES CHAMPIGNONS FILAMENTEUX

1. CHAMPIGNONS : CARACTRISTIQUES

Organismes unicellulaires ou pluricellulaires dont les cellules possdent un noyau (eucaryote)
Se nourrissent par absorption et utilisent le carbone organique comme source de carbone
(ce sont des htrotrophes)
Leur paroi cellulaire contient typiquement de la chitine et du glucan
Ils peuvent se reproduire de faon sexue et/ou asexue

2. GNRALITS SUR LA PATHOGNICIT DES CHAMPIGNONS

Plus de 100 000 espces connues

Elles sont pour la plupart saprophytiques; moins de 0,5 % sont reconnus pathognes

Principaux obstacles l'invasion des tissus :
Temprature leve (37 C)
Dfenses cellulaires

Distribution gographique: parfois restreinte, parfois mondiale

Prvalence: trs leve pour certaines mycoses (dermatophytoses, candidose); faible pour
d'autres.

Contagiosit: exception faite des dermatophytoses et de cas rares de candidose, les mycoses
sont trs peu contagieuses.

Mortalit leve lorsque linfection est invasive.

3. PRINCIPAUX TYPES DE CHAMPIGNONS DIMPORTANCE MDICALE

Dermatophytes
Saprophytes pathognes (champignons dimorphes)
Saprophytes opportunistes (levures et champignons filamenteux)
Laboratoire de sant publique du Qubec
Page 4

4. PRINCIPAUX TYPES DE MYCOSES

INFECTIONS MALADIE AGENTS TIOLOGIQUES

SUPERFICIELLES

CUTANES

PITYRIASIS VERSICOLOR

DERMATOPHYTOSE

CANDIDOSE
(PEAU, ONGLES, MUQUEUSES)

Malassezia furfur

Microsporum
Trichophyton
Epidermophyton

Candida albicans, ...
SOUS-CUTANES

SPOROTRICHOSE
CHROMOBLASTOMYCOSE
MYCTOME

Sporothrix schenckii
Fonsecaea pedrosoi, ...
Pseudallescheria boydii,
Madurella
PROFONDES OU
GNRALISES
(invasives)

HISTOPLASMOSE
BLASTOMYCOSE
COCCIDIODOMYCOSE
PARACOCCIDIODOMYCOSE

PATHOGNES

Histoplasma capsulatum
Blastomyces dermatitidis
Coccidioides spp.
Paracoccidioides brasiliensis

CANDIDOSE
CRYPTOCOCCOSE
ASPERGILLOSE
MUCORMYCOSE

OPPORTUNISTES
Candida albicans, ...
Cryptococcus neoformans
Aspergillus fumigatus, ...
Rhizopus, Lichtheimia, Rhizomucor,...

HYALOHYPHOMYCOSE Ex. Fusarium, ...

PHAEOHYPHOMYCOSE Ex. Alternaria, Exophiala,

Mycologie Partie 1 Introduction/champignons filamenteux
Page 5

5. CLASSIFICATION DES CHAMPIGNONS

RGNE : FUNGI

DIVISION CLASSE GENRE
S
E
X
U

ZYGOMYCOTA
(mucoromycotina)
zygospore

ASCOMYCOTA
asque

BASIDIOMYCOTA
baside

Ordre : MUCORALES

SACCHAROMYCETES

ASCOMYCETES

TREMELLOMYCETES

Rhizopus, Mucor

Saccharomyces, Candida

Arthroderma (= dermatophytes)
Ajellomyces (= Histoplasma,
Blastomyces)

Filobasidiella neoformans
(=Cryptococcus neoformans)

FUNGI
IMPERFECTI

Attention!
Classification
ancienne obsolte

A
S
E
X
U

BLASTOMYCETES

HYPHOMYCETES:

MONILIACEAE

DEMATIACEAE

COELOMYCETES

Candida, Cryptococcus,
Rhodotorula,
Trichosporon

Aspergillus, Blastomyces,
Coccidioides, Fusarium,
Histoplasma,
Microsporum, Trichophyton

Alternaria, Cladosporium...

Phoma

Exemples de noms de champignons nomms d'aprs leurs formes asexue et sexue :
Microsporum canis = Arthroderma otae
Histoplasma capsulatum = Ajellomyces capsulata
Cryptococcus neoformans = Filobasidiella neoformans
Page 6
6. MILIEUX DE CULTURE

GLOSE SABOURAUD
GLUCOSE
Neopeptone. ....... 10 g
Glucose.. ........ 40 g
Agar15 g
Eau ........................... 1000 ml
pH final 5,6
GLOSE SABOURAUD
GLUCOSE MODIFIE (EMMONS)
Neopeptone ..10 g
Glucose..20 g
Agar .......20 g
Eau 1000 ml
pH final 7,0
GLOSE POMME DE TERRE
GLUCOSE (PDA)
Pommes de terre...200 g
Glucose .20 g
Agar.... ........ 15 g
Eau ......1000 ml
pH final 5,6

7. TEMPRATURES D'INCUBATION DES FINS DIDENTIFICATION
30
o
C
1
37
o
C
2
40
o
C et +
2

Dermatophytes X X
Dimorphes X X
Autres champignons filamenteux X X X

1
temprature de base,
2
temprature dappoint

8. PURIFICATION DE SOUCHES CONTAMINES

Purification dune souche contamine par des bactries : repiquer sur une glose slective
contenant un ou des antibactriens (ex. : chloramphnicol, gentamicine) ou repiquer sur une glose
sur laquelle on a dpos 1-3 disques contenant un ou des antibactriens appropris (ex.
aztronam, ceftazidine, tobramicine).
Purification dune souche contamine par un autre champignon : inoculer une glose
Mycosel - la souche contaminante sera inhibe si sensible au cycloheximide. Sinon procder
par dilution en milieu liquide et striation sur glose. Rpter jusqu lobtention dune souche
pure.

9. EXAMEN MICROSCOPIQUE

9.1 TYPES DE PRPARATIONS MICROSCOPIQUES
Examen d'un fragment de colonie
Technique du ruban gomm
Techniques de culture sur lame

9.2 LIQUIDES DE MONTAGE
Bleu de coton (montage semi-permanent)
eau distille . 20 ml
acide lactique . 20 ml
phnol (cristaux) ...20 g
bleu d'aniline (bleu de coton) . 0,05 g
glycrol.. 40
ml

Agent mouillant
thanol 95% 50 ml
Actone 25 ml
Acide lactique 85% .25 ml

Alcool polyvinylique (montage permanent)
eau distille ..40 ml
alcool polyvinylique 6,64 g
acide lactique 85 % 40 ml
glycrine....4 ml
fuchsine ou bleu d'aniline .. 0,05 g

Dissoudre l'alcool polyvinylique (PVA, poids
molculaire : 40,000) dans l'eau et ajouter
l'acide lactique en agitant vigoureusement.
Ajouter la glycrine et la fuchsine. Attendre 24
heures avant d'utiliser. Les prparations
microscopiques schent en 24-48 heures 40
o
C.

9.3 MICROSCOPES
clairage conventionnel
contraste de phase
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10. CARACTRISTIQUES DES CHAMPIGNONS FILAMENTEUX

10.1 DESCRIPTION DES COLONIES

a) Texture
laineuse : myclium arien abondant
duveteux : myclium arien court
poudreux : myclium arien produisant de nombreuses conidies crant
une surface d'apparence poudreuse semblable du sucre
ou de la farine
glabre : myclium arien peu abondant avec surface lisse

b) Topographie : plane, surleve, crbriforme, avec stries radiales

c) Couleur : surface, revers, pigment diffusible
brun, gris, noir = champignon dmati
blanc ou autre couleur (rouge, vert, jaune, mauve, etc.) = champignon hyalin

d) Vitesse de croissance (diamtre de la colonie 7 jours)
rapide : 3 cm
modre : entre 1 et 3 cm
lente : 1 cm

10.2 EXAMEN DES STRUCTURES MICROSCOPIQUES

a) hyphes : septs, non septs, larges (> 4 m), troits (< 4 m)
b) conidiophores : absents, simples, ramifis
c) cellules conidiognes : annellide, phialide...
d) conidies : uni- ou pluricellulaires, solitaires, en amas ou en chanes, forme (ronde, ovale, en
massue...)
e) organes de fructification : prithces, clistothces (sexu), pycnides (asexu)

Aspergillus sp.

unisri
bisri
phialides
conidies

mtule
vsicule
pied
conidiophore
Pycnides
conidies
Clistothce Prithce
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Blastoconidie

Phialoconidie

Annelloconidie
Poroconidie

simples alternes
cellule disjonctive
annulaire
frange
Arthroconidie

frange annulaire
macroconidie
microconidie
Aleurioconidie

terminale
intercalaire
Chlamydospore
Chlamydospore Chlamydospore
Chlamydospore

Sporangiospore

11. CONIDIES ET SPORES ASEXUES
Blastoconidie
(poroconidie)
Page 9

12. SCHMA D'IDENTIFICATION DE CHAMPIGNONS FILAMENTEUX
COMMUNMENT ISOLS AU QUBEC

A1. Souche sporule (conidies ou spores prsentes)

B1. Hyphes larges (>4 m), peu ou non septs (Glomeromycota/Mucorales)...(voir page 10)
B2. Hyphes gnralement troits (<4 m),septs.....C

C1. Organes de fructification prsents...(voir page 10)
C2. Organes de fructification absents.....D

D1. Conidies en chane a) prsence d'arthroconidies........(voir page 11)
b) prsence de conidies autres que des arthroconidies..(voir page 11)
D2. Conidies autrement qu'en chane...E

E1. Conidies unicellulaires.(voir page 12)
E2. Conidies pluricellulaires ou prsence la fois de conidies unicellulaires et pluricellulaires
....(voir page 13)

A2. Souche strile (conidies ou spores absentes)

1) Repiquer la souche sur 2 gloses PDA et incuber 30 2C et 36 1 C.
Repiquer aussi sur glose Mycosel (cycloheximide) et incuber 30 2C.

2) Aprs 7 jours dincubation :
Sporulation sur glose PDA . Voir A1
Aucune croissance 36 1 C et aucune croissance sur Mycosel : cet organisme nest ni
un dermatophyte, ni un champignon dimorphe. Il sagit fort probablement dun contaminant
strile.
Croissance 36 1 C et croissance sur Mycosel : selon le site disolement, il est possible
que cet organisme soit *:
un dermatophyte (ex. Microsporum audouinii, Trichophyton rubrum, T. verrucosum, T. violaceum)
un champignon dimorphe (sonde molculaire ncessaire pour confirmation)
ou un champignon opportuniste.
Croissance 36 1 C et absence de croissance sur Mycosel : il est possible que cet
organisme soit un champignon opportuniste*.
*Si le contexte le justifie (clinique, microbiologie, histopathologie, srologie, radiologie), poursuivre
lidentification en effectuant les tests appropris au type dorganisme souponn.
Au besoin, demander lavis dun laboratoire de rfrence.

Blastoconidie
Page 10

B1. Hyphes larges,
peu ou non septs
B2. Hyphes troits et septs
C1. Organes de fructification prsents

Zygomycota/Mucorales

1.2.1.1.1
1.2.1.2

O

1.2.2
10.3

produit des conidies sur les hyphes

ne produit pas de conidies sur les hyphes

Ttes aspergillaires prsentes
Sporangiophores non ramifis
colonie vert fonc,
prsence de
cellules en
noisette

colonie
jaune et
verte

Ttes aspergillaires absentes
Sporangiophores ramifis

rhizodes absents,
souvent pas ou peu de
croissance
37
o
C

rhizodes trs
primitifs
(souvent difficiles
reprer),
croissance 54 C

apophyse bien
dveloppe (rhizodes
prsents, mais souvent
difficiles reprer), les
souches pathognes se
cultivent bien
37
o
C

sporange
columelle
sporangiophore
Mucor
rhizodes
Aspergillus section
Glaucus
produit des
conidies
ovales base
tronque sur les
hyphes,
en plus des
clistothces

spores conidies
clistothce
Pseudallescheria boydii
(Scedosporium sp.)
apophyse
Prithce
entour de
soies
brunes

pycnides avec une
ouverture (ostiole)

Rhizopus
Chaetomium
Lichtheimia
(Absidia)
Phoma
ostiole

Rhizomucor
sporangiophores en
bouquets, partant
de
rhizodes bien
dvelopps,
les souches
pathognes
se cultivent bien
37
o
C

Aspergillus nidulans
Page 11
Colonie glabre blanche rose ou
jaune ple, devenant brun noir avec
lge

Arthroconidies simples,
colonie glabre, blanche

Conidiophores absents

Champignons hyalins,
conidiophores non ramifis
se terminant en vsicule

Champignons hyalins,
conidiophores ramifis en pinceau

Colonie blanche jauntre, Penicillium
croissance lente,
arthroconidies ovales

Onychocola
canadensis

Conidiophores prsents Champignons dmatis
Alternaria Cladosporium

Arthroconidies
D1. Conidies en chane

Arthroconidies
alternes

Neoscytalidium
(Scytalidium)
Aspergillus

Colonie
souvent verte

Colonie
souvent
rouille,
jamais
verte

Paecilomyces

Conidies base tronque

Arthroconidies
simples, colonie
laineuse, blanche ou
bruntre

arthroconidie
Scopulariopsis
Conidies autres que des arthroconidies

frange
annulaire
cellule
disjonctive
Geotrichum
colonie
blanche rose
ple, trs
laineuse

colonie
blanche
bruntre
poudreuse Geomyces
Chrysonilia Chrysosporium

Aureobasidium
conidies
hyalines
arthroconidies
brunes

Cicatrices
et conidies
en bouclier
Coccidioides
Malbranchea
Page 12

D2. Conidies en amas ou solitaires (fixes individuellement sur le conidiophore)
E1. Conidies unicellulaires

Conidies en amas
Champignons hyalins Champignons dmatis

Conidies solitaires (fixes individuellement sur le conidiophore)

Champignons dimorphes

Dermatophytes

Phialophora
Exophiala
Trichoderma
(Gliocladium)
Trichoderma Verticillium Acremonium

Blastomyces
dermatitidis
Histoplasma
capsulatum
Scedosporium
forme Graphium parfois
prsente
Chrysosporium
Sporothrix schenckii
Beauveria
Conidiophores
en zigzag

Conidies en rosette

Trichophyton
tonsurans
Trichophyton
mentagrophytes
Urase
positive

Urase
ngative

Autres possibilits :
- Microsporum audouinii
- Microsporum persicolor

25 C
37 C

25 C
37 C
Macroconidies
tubercules

Trichophyton
rubrum
Trichophyton
verrucosum

25 C
37 C
Page 13

E.2 Conidies pluricellulaires prsentes
(conidies unicellulaires parfois aussi prsentes)

Epidermophyton floccosum
Trichophyton
tonsurans
Ochroconis
(Scolecobasidium)
Trichophyton
mentagrophytes
Urase
ngative

Urase positive

Microsporum
canis
Microsporum
audouinii
Microsporum
gypseum
Colonie laineuse, blanche,
rose ple ou mauve,
croissance rapide

Trichothecium
Conidies bicellulaires

Colonie
blanche ou
ple

Colonie brune

Macroconidies pluricellulaires avec
microconidies unicellulaires

Conidies avec plus de 2 cellules
Dermatophytes

Curvularia

Pithomyces Epicoccum

Dermatophyte
Trichophyton
rubrum
Bipolaris
Fusarium
Ulocladium
Page 14

13. IDENTIFICATION LESPCE

Lidentification lespce est utile lorsquelle permet de :
a) slectionner un traitement
b) prvoir lvolution de la maladie
c) mieux comprendre lpidmiologie de lagent infectieux

Les organismes habituellement identifis lespce sont :
a) Candida albicans/dubliniensis et Cryptococcus neoformans/gattii
b) les levures isoles de sites normalement striles
c) les dermatophytes
d) les champignons dimorphes
e) certains saprophytes opportunistes tels que les Aspergillus

14. SCURIT EN LABORATOIRE

Au canada, selon la loi C-11, 7 champignons appartiennent au groupe de risque III :

Cladophialophora bantiana
Coccidioides immitis/posadasii
Paracoccidioides brasiliensis
Penicillium marneffei
Linhalation des conidies de ces organismes peut occasionner des infections graves.

Tous les autres champignons d'importance mdicale sont considrs comme des
organismes du groupe de risque II. Nanmoins, tant donn qu'il est souvent difficile de
distinguer les champignons du groupe de risque III uniquement par un examen
morphologique de la colonie et que les champignons filamenteux en gnral se dispersent
dans lenvironnement en librant des conidies dans lair, il est recommand de toujours les
manipuler dans une enceinte de scurit biologique afin de prvenir les infections
acquises par voies respiratoires.

ATTENTION! plus particulirement pour les colonies blanches provenant dun
site profond tel que voies respiratoires, sang, biopsies profondes ou sous-
cutanes, pus, urine, etc.

Considrer ces souches comme potentiellement dangereuses et les manipuler dans une
enceinte de scurit biologique.
viter de faire des cultures sur lame et dutiliser des milieux en botes de Ptri pour les
repiquages. Les tubes de plastique sont plus scuritaires que les tubes en verre. Des sacs de
plastique peuvent aussi tre utiliss comme emballage supplmentaire pour diminuer les
risques en cas de bris hors de lenceinte.
Sassurer que les lames prpares pour lexamen microscopique soient prpares avec un
liquide de montage contenant un dsinfectant (ex. phnol -bleu de coton) avant de les retirer
de lenceinte de scurit biologique.
Le cas chant, confier l'identification/confirmation de toute souche prsume tre un
organisme du GR 3 un laboratoire possdant exprience et installations scuritaires pour le
traitement de ce type de champignon.

Blastoconidie

Page 15

PARTIE 2

LES LEVURES

1. DFINITION
Champignons unicellulaires se reproduisant principalement par bourgeonnement.

2. SCHMA D'IDENTIFICATION DES LEVURES

Colonie blanche
blastoconidies

+

Tube germinatif

-

Encre de Chine

Candida albicans
ou
Candida dubliniensis

Assimilation de
sources de carbone
(ex. API 20c aux)

Chlamydospores
hyphes/pseudohyphes

Examen
morphologique
(Dalmau)

Arthroconidies
hyphes
(Trichosporon sp.)

Urase +
(ex. Cryptococcus sp.,
Trichosporon sp.)

Pseudohyphes
et/ou hyphes
(ex. C. parapsilosis,
C. tropicalis)

Absence de
filaments
(ex. Cryptococcus sp.
Candida glabrata)

Sites normalement striles : identifier l'espce
Systme respiratoire, urine : identifier C. albicans/dubliniensis, C. neoformans
Autres : identifier C. albicans
Page 16

3. EXAMEN MICROSCOPIQUE

3.1 FORME DES CELLULES

3.2 TUBE GERMINATIF Srum de veau ou de cheval
(germination) Inoculum lger
Incubation 3 heures 37
o
C (bain-marie)

3.3 EXAMEN MORPHOLOGIQUE Technique de Dalmau
Glose Cornmeal + Tween 80
Incubation 48-72 heures 25 C

Chlamydospores Pseudohyphes Hyphes Arthroconidies

POSITIF

NGATIF

Mycologie Partie 2 Les levures
Page 17

Hyphe Pseudohyphe
Croissance lapex de lhyphe;
allongement linaire et formation
subsquente de septums.

Croissance par bourgeonnement avec apparition
d'une constriction basale pour chaque nouvelle
blastoconidie.

Cellule terminale typiquement plus
longue que la cellule prcdente.
Cellule terminale plus courte ou gale en longueur
la cellule prcdente.

Cellule terminale habituellement
cylindrique.
Cellule terminale habituellement ronde ou ovale
(bourgeon).

Parois parallles sans constriction aux
septums.

Parois avec constriction aux septums.

Septums rfringents et droits. Septums souvent difficiles voir et habituellement
courbs.

Embranchements sans constriction
leur point d'origine et avec un premier
septum loign de l'hyphe principale.
Embranchements avec constriction au point
d'origine et avec un septum prsent au point
d'origine.

3.4 CAPSULE

Encre de chine
Levure ronde avec capsule dans LCR =>

identification prsume : C. neoformans/gattii

3.5 ASCOSPORES (rarement observes)

Glose actate ou V-8
Incubation jusqu 6 semaines
Coloration au vert de malachite

Capsule
Asques
Ascospores
Page 18

4. TESTS PHYSIOLOGIQUES

4.1 ASSIMILATION DE SOURCES DE CARBONE

Principe : utilisation d'une source de carbone
en prsence d'oxygne.
Mthode classique : bouillon de Wickerham.
Incubation 21 jours 30
o
C.
Micromthodes : API 20 C AUX, Vitek,
Auxacolor, Microscan,
Incubation 48-72 heures 30
o
C.
Critre de positivit : croissance - turbidit.

4.2 ASSIMILATION DU NITRATE DE POTASSIUM

Principe : utilisation du nitrate de potassium comme seule source d'azote.
Milieu : bouillon Yeast Carbon Base.
Incubation : 15 jours 30
o
C.
Critre de positivit : croissance - turbidit
ou
Milieu : glose nitrate.
o
C.
Critre de positivit : indicateur de pH bleu fonc.

4.3 FERMENTATION

Principe : utilisation d'une source de carbone en absence d'oxygne.
Milieu : bouillon avec tube de Durham.
o
C.
Critre de positivit : production de gaz.

4.4 HYDROLYSE DE L'URE

Principe : dgradation de l'ure et production de mtabolites alcalins.
Milieu : ure de Christensen.
Incubation 5 jours 30
o
C.
Critre de positivit : indicateur de pH rose-rouge.

4.5 PHNOLOXYDASE

Principe : dtection de la production d'une phnoloxydase pour l'identification prsomptive de
C. neoformans/gattii.
Milieu : glose Niger Seed - glose Birdseed.
Incubation 72 heures 30
o
C.
Critre de positivit : production de colonies pigmentes brun.

4.6 CANAVANINE-GLYCINE-BLEU DE BROMOTHYMOL (glose CGB)

Principe : dtection de la rsistance la canavanine et de l'hydrolyse de la glycine pour la
diffrenciation de C. neoformans et C. gattii. C. gattii est positif (bleu).
Milieu : glose CGB. Critre de positivit : indicateur de pH bleu.

Caractristiques recherches
identification exacte et reproductible
des espces contenues dans la
banque de donnes
banque de donnes tenant compte
de la variation de profils
biochimiques pour chaque espce
discrimination des espces non
incluses dans la banque de donnes

Page 19

5. CARACTRISTIQUES MORPHOLOGIQUES ET PHYSIOLOGIQUES DE LEVURES
COMMUNMENT ISOLES DE SPCIMENS CLINIQUES

Morphologie ASSIMILATION CARBONE FERMENTATION

AUTRES
ESPCES

P
s
e
u
d
o
h
y
p
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V
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3

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4
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C

C
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s
a
n
c
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s
u
r

M
y
c
o
s
e
l

Candida albicans + + + + - - - + +,- - + - - - + - + - + + f,- - +,- +,- - - - - + + +
C. dubliniensis + + + + - - - + + - + - - - -,+ - -,+ - + + - - +,f ? - - - - + + +
C. famata - - - - - - +,- + + +,- + + + - + + + +,- +,- - +,- - - -,f - - - - +,- - +,-
C. glabrata - - - - - - - - - - - - - - - + - + - - - - + - - - - + + -
C. guilliermondii +,- - - - - - - + + - + - + - + + + + + - + - -,+ -,+ - - - - + +,- +
C. kefyr + - - - - - - - + + + + +,- - +,- + -,+ - + - + +,- + - - - - - + + +
C. krusei + - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - + + -
C. lambica + - - - - - - - - - - - - - + - - - + - - - - - - - - - + ? -
C. lipolytica + + - - - - + - - - -,+ - - - - - - - - - - - - - - + - - +,- -,+ +
C. lusitaniae + - - - - - - + + - + - + - + - + - + - + - + + + - - - + + -
C. parapsilosis + - - - - - - + + - + - - - + - + - + - - - - - - - - - + +,- -
C. rugosa + - - - - - - - - - + - - - +,- - - - - - - - - - - - - - + ? -
C. tropicalis + -,+ - - - - - + +,- - + - + - + - + - + + + - + + - - - - + + +f
C. zeylanoides + - - - - - - - - - -,+ - -,+ - - - + - - - - - - - - - - - - - +
Cryptococcus
neoformans/gattii
- - - - + - + + + - + - + + + +,- + + - - - - - - - + - + + - -
C. albidus - - - - + - +,- + + +,- +,- - + + + + + +,- - - - - - - - + + - -,+ +,- -
C. laurentii - - - - + - +,- + + + + + + + + +,- + + - - - - - - - + - - - - +,-
C. uniguttulatus - - - - + - - + + - -,+ + -,+ + + +,- + - - - - - - - - + - - - - -
Geotrichum capitatum - + - - - + - - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - + + +
G. candidum - + - - - + - - - - + - - - + - - - - - - - - - - - - - -,+ - +
Pichia anomala -,+ - - - - - + + + - +,- - + - +,- +,- + - + +,- + - +,- - +,- - + - +,- ? -
Rhodotorula glutinis - - - - -,+ - - + + - +,- - + - + + + - - - - - - - - + + - +,- - +,-
R. mucilaginosa - - - - -,+ - - + + - + - +,- - + + + - - - - - - - - + -,+ - +,- - +,-
Saccharomyces
cerevisiae
+
p
- - - - - - +,- +,- - +,- - - - - +,- +,- - + +,- +,- - +,- +,- - - - - +,- +,- -
Trichosporon sp.
c
- + - - - + +,- +,- +,- + +,- +,- +,- +,- +,- +,- +,- +,- - - - - - - - + - - +,- +,- +,-
Prototheca wickerhamii - - - - - - - - - - + +,- - - - - - + - - - - - - - - - - +,- ? -
a
toutes ces espces assimilent le glucose,
b
algue pouvant tre confondue avec une levure, f : faible, p : primitif, ? : inconnu
Page 20

6. Clef didentification de levures et dorganismes levuriformes communment isols
au Qubec.
(toute identification doit tre complte ou confirme par un examen morphologique et, sil y a lieu, des tests
biochimiques)

1. Colonie blanche, jaune ple ou rose ple .................................................................................................... 2
1a. Colonie de couleur pche rose saumon ................................................................................................... 14
1b. Colonie brune noire ou prsentant tout au moins une teinte de brun, souvent non homogne ............... 15

2. Bonne croissance sur glose Sabouraud glucose ou pomme de terre (PDA) .............................................. 3
2a. Aucune croissance ou croissance trs faible sur les milieux mentionns ci-dessus sans avoir badigeonn
auparavant la surface avec de lhuile dolive ...................................................... Malassezia furfur complexe

3. Urase ngative ............................................................................................................................................. 4
3a. Urase positive .............................................................................................................................................. 9

4. Prsence de sporanges sphriques contenant de nombreuses sporangiospores; cellules bourgeonnantes
absentesPrototheca sp.
4a. Sporange absent; cellules bourgeonnantes prsentes ou absentes ............................................................. 5

5. Arthroconidies prsentes; cellules bourgeonnantes absentes................................................. Geotrichum sp.
5a. Arthroconidies absentes; cellules bourgeonnantes prsentes....................................................................... 6

6. Tubes germinatifs prsents ou chlamydospores prsentes sur glose Cornmeal Tween 80
Candida albicans/dubliniensis
6a. Tubes germinatifs absents et chlamydospores absentes .............................................................................. 7

7. Hyphes ou pseudohyphes bien dvelopps sur glose Cornmeal Tween 80 ............................................... 8
7a. Hyphes ou pseudohyphes absents ou rudimentaires sur glose Cornmeal Tween
80 ......................... C. glabrata, C. famata /guilliermondii, Saccharomyces cerevisiae

8. Croissance sur glose Mycosel (rsistance au cycloheximide)...
..Candida albicans/dubliniensis, C. kefyr, C. tropicalis, C. guilliermondii, C. lipolytica
8a. Aucune croissance sur glose Mycosel (sensibilit au cycloheximide)..
............................................................................. Candida tropicalis, C. krusei, C. parapsilosis, C. lusitaniae

9. Prsence de cellules bourgeonnantes, en forme de fuseaux; hyphes absents ou prsents ........ Ustilago sp.
9a. Diffrent de la description ci-dessus ............................................................................................................ 10

10. Prsence de cellules bourgeonnantes hyalines, ellipsodales; arthroconidies brunes parfois prsentes .......
..Aureobasidium sp.

11. Cellules bourgeonnement unipolaire avec col de bourgeonnement large; hyphes absents ........................
...............................................................................................................................Malassezia pachydermatis
11a. Diffrent de la description ci-dessus .............................................................................................................. 12

12. Arthroconidies hyalines prsentes ........................................................................................ Trichosporon sp.

13. Pseudohyphes et hyphes absents; cellules rondes ovales, habituellement encapsules prsentes ...........
................................................................................................................... Cryptococcus sp.
13a. Pseudohyphes ou hyphes prsents; prsence de cellules ovales, ellipsodales ou allonges, non
encapsules. .............................................................................................. Candida krusei, Candida lipolytica

Page 21
14. Hyphes ou pseudohyphes prsents ; ballistoconidies prsentes ................................... Sporobolomyces sp.
14a. Hyphes ou pseudohyphes absents; ballistoconidies absentes ............................................... Rhodotorula sp.

15. Arthroconidies brun fonc prsentes ................................................................................. Aureobasidium sp.
15 a. Arthroconidies absentes ............................................................................................................................... 16

16. Prsence de cellules bourgeonnantes, en forme de fuseaux ....................................................... Ustilago sp.
16a. Prsence de cellules bourgeonnantes ovodes ........................................................................................... 17

17 . Hyphes absents aprs 2 semaines sur glose Sabouraud glucose ou pomme de terre glucose ...................
..................................................................................................................................... Phaeococcomyces sp.
17a. Hyphes prsents; conidies produites en amas lextrmit de conidiophores plus ou moins bien
diffrencis .............................................................. Exophiala sp. (voir clef des champignons filamenteux).

7. Caractristiques de Cryptococcus neoformans et Cryptococcus gattii.

Cryptococcus Srotypes cologie Remarques*
neoformans
var. neoformans
(srotype D)

var. grubii
(srotype A)
distribution mondiale
Infecte principalement lhte
immunocompromis
gattii srotypes B et C
rgions (sub) tropicales et
aussi certaines rgions
climat plus tempr (Ile de
Vancouver, Italie,
Espagne, Grce,
Colombie)
Infecte souvent lhte normal
Positif sur milieu CGB (bleu)
*Chen, S et al. 2000. Epidemiology and host- and variety-dependent characteristics of infection due to Cryptococcus
neoformans in Australia and New Zealand. Australasian Cryptococcal Study Group. Clin. Infect. Dis. 31 :499-508.

Page 22

Page 23

PARTIE 3

LES DERMATOPHYTES

1. PIDMIOLOGIE ET CLINIQUE

1.1 DFINITION ET COLOGIE

Champignons kratinophiles appartenant un des trois genres suivants :

Epidermophyton
Microsporum
Trichophyton

40 espces reconnues. Plusieurs sont des saprophytes du sol.
peu prs la moiti sont des pathognes des humains, des mammifres ou des
oiseaux.

On les regroupe selon leur principal rservoir dans la nature :

Gophiles (sol)
Zoophiles (animaux)
Anthropophiles (humains)

DE TOUS LES CHAMPIGNONS, SEULES QUELQUES ESPCES APPARTENANT
AU GROUPE DES DERMATOPHYTES ONT VOLU POUR DEVENIR DES
PARASITES OBLIGATOIRES DE L'HUMAIN.

Page 24

1.2 DERMATOPHYTIE

Colonisation de tissus kratiniss tels les ongles, les cheveux et la couche corne de la peau

Raction de l'hte aux mtabolites produits par le champignon

Gnralement, pas d'invasion des tissus vivants

Entits cliniques classes selon le site anatomique
tinea capitis (cuir chevelu)
tinea barbae (barbe)
tinea cruris (aine)
tinea unguium (ongle)
tinea corporis (peau glabre)
tinea pedis (pied d'athlte)

1.3 PRLVEMENTS

Ongles*
nettoyer longle avec un tampon imbib dalcool. Au besoin, laver avec du savon et de
leau avant dutiliser lalcool.
couper le long du bord libre le plus possible
gratter sous l'ongle ou limer et rcolter les dbris

Cheveux, poils*
couper prs de la racine ou arracher de faon conserver le bulbe
le cas chant, slectionner les cheveux qui fluorescent sous la lampe de Wood

Squames*
nettoyer la zone atteinte avec du savon et de leau ou un tampon dalcool. Laisser
scher.
racler la surface de la peau avec un bistouri ou une lame de microscope et rcolter 10-
15 squames au pourtour de la lsion.

Pus
Aspirer le pus (krion) et le placer dans un tube. couvillonner les pustules avec un
coton-tige. Acheminer dans un milieu e transport standard.

Biopsie
Les biopsies sont places dans un tube, avec ou sans une petite quantit deau distille
strile.

* Conserver au sec, la temprature de la pice; traiter le plus tt possible.

Mycologie Partie 3 Les dermatophytes
Page 25

2. EXAMEN DIRECT

L'examen direct permet de :
fournir rapidement un rapport prliminaire au mdecin;
dtecter une infection fongique en l'absence d'une culture positive;
faciliter l'interprtation du rsultat de la culture.

2.1 LAMPE DE WOOD

Certains dermatophytes qui infectent les cheveux produisent un mtabolite (ptridine) qui donne
une fluorescence vert jaune lorsqu'expos une lampe de Wood (366 nm). Il s'agit
principalement de M. canis et M. audouinii. On peut utiliser la lampe de Wood en laboratoire
pour slectionner des cheveux infects pour la culture.

2.2 KOH

L'hydroxyde de potassium en solution aqueuse digre les dbris protins, blanchit plusieurs
pigments et dissout le ciment qui retient les cellules kratinises ensemble. Il permet, le cas
chant, de reprer plus facilement les hyphes lors de l'examen microscopique.

a) Ractif

KOH 10 % avec glycrol

KOH ..................... 10 g
glycrol .............. 10 ml
eau dsionise... 80 ml

(le glycrol prvient la cristallisation et retarde la dshydratation)

b) Mthode

Placer les squames ou le matriel examiner dans une goutte de ractif KOH 10 % sur une
lame. Recouvrir d'une lamelle. Laisser ragir 30 minutes; chauffer lgrement si l'on veut
acclrer la digestion.

Examiner au microscope. Fermer le diaphragme du condenseur pour obtenir un meilleur
contraste. Utiliser un objectif 10 X pour faire un balayage de la lame. Confirmer avec un
objectif 40 X.

Page 26

2.3 BLANC DE CALCOFLUOR

Le blanc de calcofluor est un fluorochrome non spcifique qui dmontre, entre autres, une
affinit pour la chitine retrouve dans la paroi cellulaire des champignons. l'examen au
microscope fluorescence, les champignons produisent une fluorescence vert pomme.

a) Ractif : blanc de calcofluor 0,1 % (calcofluor white)

blanc de calcofluor
(Fluorescent brightener 28 - Sigma F-6259) ..... 0,1 g
eau dsionise 100 ml

Dissoudre le blanc de calcofluor en chauffant trs lgrement. Conserver la temprature
de la pice dans une bouteille ambre l'abri de la lumire.

b) Mthode :

Dposer les squames ou le matriel examiner dans une goutte de ractif KOH 10 %
auquel on a pralablement ajout une goutte de la solution de blanc de calcofluor. Recouvrir
d'une lamelle, laisser ragir pendant 10 minutes et examiner au microscope fluorescence.

c) Microscopie :

Microscope pifluorescence
filtre d'excitation 300-412 nm (absorption max. 347 nm)
filtre d'arrt 500-520 nm

2.4 COLORATION ACIDE PRIODIQUE-SCHIFF (PAS)

Cette technique permet de colorer certains polysaccharides retrouvs dans la paroi cellulaire
des champignons. Les frottis sont d'abord immergs dans un bain d'acide priodique, un agent
oxydant qui brise les liaisons C - C prsentes dans les polysaccharides sous forme de 1:2
glycol (HOHC - CHOH) et les transforme en groupes aldhydes (R - CHO). Aprs lavage
l'eau, on colore la fuchsine basique qui ragit, le cas chant, avec les groupes aldhydes.
Aprs un second rinage, on dcolore avec une solution de mtabisulfite. La fuchsine ayant
ragi avec les groupes aldhydes n'est pas affecte, alors que la fuchsine libre est convertie en
un compos incolore. l'examen microscopique, les hyphes et levures apparaissent colores
rose magenta. Occasionnellement, les bactries et certains tissus peuvent aussi tre colors.

Page 27

2.5 CONCLUSION (examen direct)

TECHNIQUES AVANTAGES INCONVNIENTS
KOH
Ractif peu dispendieux et
simple prparer
Technique rapide
Exige plus d'exprience pour la
lecture
Les lames ne sont pas permanentes
BLANC DE
CALCOFLUOR
Ractif peu dispendieux et
simple prparer
Technique rapide
Lecture plus facile que KOH
Ncessite l'utilisation d'un
microscope fluorescence
Les lames ne sont pas permanentes

PAS
Lecture plus facile que KOH
Lames permanentes
Ractifs plus dispendieux et plus
nombreux
Contrle de qualit plus exigeant
Technique plus longue

3. ISOLEMENT

3.1 MILIEUX DE CULTURE

Glose Sabouraud glucose avec chloramphnicol et cycloheximide ou glose Mycosel
(BBL), Mycobiotic (Difco)
Glose Sabouraud glucose avec chloramphnicol
Format : bote de Ptri 15 x 100 mm, 40 ml ou tube 20 x 125 mm, 7 ml, inclin
Nombre de tubes ou botes ensemencer : 1 de chaque milieu
1

3.2 TEMPRATURE D'INCUBATION

30 2
o
C
2

3.3 DURE D'INCUBATION

4 semaines

1
certains laboratoires prfrent utiliser 2 tubes de chaque milieu plutt quun seul, ceci afin
damliorer les probabilits disolement.
2
la croissance sera un peu plus lente si lincubation est effectue la temprature de la pice.
Si lon souponne la prsence de Trichophyton verrucosum, on peut aussi incuber 37 C.

Page 28

4. MILIEUX DE CULTURE SLECTIFS

GLOSE SABOURAUD GLUCOSE MODIFIE + CHLORAMPHNICOL
Neopeptone, Difco .................... 10 g
Glucose ..................................... 20 g
Agar .......................................... 20 g
Chloramphnicol
(dilu dans 10 ml d'actone). 0,050 g
Eau ......................................1000 ml
pH final 7,0

GLOSE MYCOSEL (BBL) MYCOBIOTIC (Difco)
Phytone, peptone ...................... 10 g
Glucose ..................................... 10 g
Agar .......................................... 15 g
Cycloheximide .......................... 0,4 g
Chloramphnicol .................... 0,05 g
Eau ......................................1000 ml
pH final 6,5

GLOSE DTM
(Dermatophyte test medium)
Peptone (vgtal) ...................... 10 g
Glucose ..................................... 10 g
Agar .......................................... 20 g
Rouge de phnol ...................... 0,2 g
Cycloheximide .......................... 0,5 g
Gentamicine ............................. 0,1 g
Chlorttracycline ...................... 0,1 g
Eau ......................................1000 ml
pH final 5,5

GLOSE IMA
(Inhibitory Mold Agar) (BBL)
Tryptone ...................................... 3 g
Extrait de buf ............................ 2 g
Extrait de levure .......................... 5 g
Glucose ....................................... 2 g
Amidon ........................................ 2 g
Dextrine ....................................... 1 g
Chloramphnicol .................. 125 mg
Gentamicine ............................. 5 mg
Solution de sels A ................... 10 ml
Solution de sels B ................... 20 ml
Agar .......................................... 17 g
Eau ....................................... 970 ml
pH final 6,7

Page 29

5. CRITRES ET TECHNIQUES D'IDENTIFICATION

5.1 DESCRIPTION DES COLONIES
(voir page 7)

5.2 EXAMEN DES STRUCTURES MICROSCOPIQUES

a) Hyphes
En spirale Chandelier favique
En raquette Tte de clou
Pectins Corps nodulaire

b) Conidies
Microconidies
Macroconidies
Chlamydospores

5.3 PREUVES PHYSIOLOGIQUES

a) Hydrolyse de l'ure
Milieu : ure de Christensen
Incubation : 7 jours 30 2
o
C
Critre de positivit : pente rouge

b) Perforation du cheveu
Milieu : eau dsionise + extrait de levure 10 % + cheveux ples
Incubation : 7-21 jours 30 2
o
C
Critre de positivit : prsence de cnes de perforation
perpendiculaires l'axe du cheveu

c) Exigences nutritives
Milieux : gloses Trichophyton (Difco)
#1 Contrle #5 Acide nicotinique
#2 Inositol #6 Contrle nitrate d'ammonium
#3 Inositol + thiamine #7 Histidine
#4 Thiamine
Incubation : 7-21 jours 30 2
o
C.
Critre d'valuation : 0 absence de croissance, 1+ trace, 4+ bonne croissance

d) Culture sur milieu au riz
Milieu : grains de riz non enrichi, cuits (autoclavs)
Incuber 7-21 jours 30 2
o
C.
Critre de positivit : croissance ou absence de croissance

Page 30

RSUM DE L'UTILIT DES PREUVES PHYSIOLOGIQUES

PREUVES DERMATOPHYTES RSULTATS

Hydrolyse de l'ure

T. rubrum

T. mentagrophytes

- (+)

+ (-)

Perforation du cheveu

T. rubrum

T. mentagrophytes

-

+

Culture sur glose
pomme de terre glucose (PDA)

T. rubrum

M. audouinii

M. canis

pigment rouge

pigment saumon

pigment jaune

tude des exigences nutritives

T. verrucosum

T. tonsurans

T. violaceum

dpendance thiamine-inositol ou
thiamine seulement

dpendance thiamine seulement

dpendance thiamine seulement

Culture sur milieu au riz

M. audouinii

M. canis

peu de croissance

bonne croissance

Croissance
diverses tempratures

T. verrucosum

T. terrestre

M. persicolor

croissance plus rapide 37
o
C
qu' 30 2
o
C

pas de croissance 37
o
C

croissance plus rapide
30 2
o
C qu' 37
o
C

Page 31

6. CLASSIFICATION ET DESCRIPTION DES DERMATOPHYTES

PRINCIPALES CARACTRISTIQUES
DES 3 GENRES AUXQUELS APPARTIENNENT LES DERMATOPHYTES

GENRE MACROCONIDIES MICROCONIDIES
EPIDERMOPHYTON
paroi mince et lisse, en forme de massue,
en groupes
absentes
MICROSPORUM
paroi paisse et chinule,
en forme de fuseau, solitaires
en forme de massue
TRICHOPHYTON
paroi mince et lisse, en forme de cigare,
solitaires
formes varies, solitaires
ou en groupes

DERMATOPHYTES ISOLS AU QUBEC

DERMATOPHYTE COLOGIE
SITES AFFECTS
FRQUENCE D'ISOLEMENT
PEAU CHEVEUX ONGLES

E. floccosum

A

+

-

rare

commun

M. audouinii

A

+

+

-

rare

M. canis

Z

+

+

-

commun

M. gypseum

G

+

rare

-

rare

T. mentagrophytes

A, Z

+

+

+

trs commun

M. persicolor

Z

+

-

-

rare

T. rubrum

A

+

rare

+

trs commun

T. soudanense

A

+

+

+

rare

T. tonsurans

A

+

+

rare

commun

T. verrucosum

Z

+

+

rare

commun

T. violaceum

A

+

+

rare

rare
A : anthropophile G : gophile Z : zoophile

Page 32

EPIDERMOPHYTON FLOCCOSUM

Colonie
Texture : poudreuse duveteuse
Couleur : jaune moutarde, brun, vert olive
Revers : brun ple
Croissance : lente

Macroconidies : en forme de massue,
en groupes de 2-3 ou solitaires
Microconidies : absentes

MICROSPORUM AUDOUINII

Colonie
Texture : duveteuse
Couleur incolore blanc gris
Revers : rose pche (sur PDA)
Croissance : modrment rapide

Macroconidies : rares
Microconidies : plus ou moins rares

Chlamydospores terminales prsentes
Faible croissance sur milieu au riz

Page 33

MICROSPORUM CANIS

Colonie
Texture : duveteuse
Couleur : blanche jaune
Revers : jaune jaune orang
Croissance : rapide

Macroconidies : en forme de fuseau avec extrmit recourbe,
paroi chinule, solitaires
Microconidies : en forme de massue, peu nombreuses

Bonne croissance sur milieu au riz

MICROSPORUM GYPSEUM

Colonie
Texture : poudreuse
Couleur : cannelle
Revers : brun ple
Croissance : rapide

Macroconidies : en forme de fuseaux symtriques,
paroi lisse ou chinule
Microconidies : en forme de massue, peu nombreuses

MICROSPORUM PERSICOLOR

Colonie
Texture : poudreuse
Couleur : blanche, beige, jaune ple, rose ple
Revers : jaune ple, ocre, rose
Croissance : rapide

Macroconidies : en forme de fuseaux ou de massue,
parfois absentes
Microconidies : rondes ou en forme de massue,
souvent avec tige

Croissance plus rapide 30 qu' 37
o
C.

Page 34

TRICHOPHYTON MENTAGROPHYTES

Colonie
Texture : duveteuse poudreuse
Couleur : blanche
Revers : jaune brun
Croissance : modrment rapide

Macroconidies : en forme de massue, souvent absentes
Microconidies : rondes, massues, en grappes ou solitaires

Urase : positive
Perforation du cheveu : positive
Culture sur PDA
ou Cornmeal : absence de pigment rouge

TRICHOPHYTON RUBRUM

Colonie
Texture : duveteuse
Couleur : blanche, rose, jaune
Revers : rouge fonc, brun, brun jaune, incolore
Croissance : lente modrment rapide

Macroconidies : en forme de cigare, souvent absentes
Microconidies : massues, solitaires

Urase : ngative (parfois positive si trs sporule)
Perforation du cheveu : ngative
Culture sur glose pomme de terre glucose : pigment rouge

TRICHOPHYTON TONSURANS

Colonie
Texture : duveteuse-poudreuse
Couleur : crme, chamois, jaune
Revers : brun brun rouge
Croissance : lente

Macroconidies : trs rares
Microconidies : formes varies (ballon, massue,..)

Besoins en vitamines : thiamine

Page 35

TRICHOPHYTON VERRUCOSUM

Colonie
Texture : glabre
Couleur : blanche
Revers : incolore
Croissance : trs lente

Macroconidies : trs rares

Chlamydospores en chane
Besoins en vitamines : thiamine + inositol (84 %)
thiamine seulement (16 %)

Croissance plus rapide 37 qu' 30 C

TRICHOPHYTON SOUDANENSE

Colonie
Texture : glabre ou feutre
avec une frange filamenteuse au pourtour
Couleur : jaune ple rouille
Croissance : lente modrment rapide

Macroconidies : normalement absentes

Hyphes en buisson ou en fil de fer barbel

TRICHOPHYTON VIOLACEUM

Colonie
Texture : glabre
Couleur : rouge violet
Revers : rouge
Croissance : trs lente

Macroconidies : normalement absentes
Microconidies : normalement absentes

Besoins en vitamines : thiamine

Page 36

Page 37

PARTIE 4

LES CHAMPIGNONS DIMORPHES

1. DFINITION ET SCURIT EN LABORATOIRE

Champignons qui possdent deux formes. En mycologie mdicale, on utilise communment le
terme dimorphe pour dcrire 6 champignons qui poussent sous forme de moisissure la
temprature de la pice et sous forme de levure ou de sphrule sur milieux riches 37 C ou dans
les tissus.
Blastomyces dermatitidis Paracoccidioides brasiliensis
Coccidioides immitis Sporothrix schenckii
Coccidioides posadasii Penicillium marneffei

Scurit en laboratoire
Blastomyces dermatitidis, Coccidioides immitis, Coccidioides posadasii, Histoplasma capsulatum,
Paracoccidioides brasiliensis et Penicillium marneffei sont des champignons pathognes du groupe de
risque 3. Les cultures sporules de ces organismes ne devraient tre manipules que dans une
enceinte de scurit biologique de catgorie I ou II, en laboratoire de confinement niveau 3. L'inhalation
de conidies de ces champignons est l'origine de la plupart des mycoses graves acquises en
laboratoire biomdical (voir aussi Partie 1 - Scurit en laboratoire)
noter : Sans tre un dimorphe, Cladophialophora bantiana est aussi un organisme pathogne du groupe de
risque 3.

2. ISOLEMENT

Milieux d'isolement*: voir Annexe 1
Incubation : 30 2
o
C, 4-8 semaines

*Il arrive parfois que certains spcimens cliniques soient fortement contamins par des bactries ou
par des levures rsistantes au cycloheximide. Le Yeast-extract phosphate agar est un milieu
utilis pour l'isolement dHistoplasma capsulatum dans ces conditions (Beneke E.S., A. L.
Rogers.1996. Medical mycology and human mycoses. Star Publishing Company, Belmont CA). Les
laboratoires uvrant dans des rgions fortement endmiques pour certains champignons
dimorphes peuvent utiliser, de routine, ce type de milieu spcialis. Ceci ne semble pas indiqu
pour le Qubec.

3. MILIEUX UTILISS POUR LA CONVERSION DE LA PHASE FILAMENTEUSE LA
PHASE LEVURE

Glose BHI ou glose BHI + sang
Incubation : 37
o
C, 1-5 semaines

Note: cette mthode est de plus en plus dlaisse et remplace par des techniques d'identification
molculaires. Ces dernires sont considres plus rapides et plus scuritaires.
Page 38

4. DESCRIPTIONS

SPOROTRICHOSE

Infection chronique de la peau et des tissus sous-cutans extension lymphatique et caractrise
par des lsions nodulaires voluant vers lulcration.

Formes extra cutanes rares : articulations, os, muscles, systme nerveux central et systme
gnito-urinaire. Atteinte pulmonaire rsultant de linhalation de conidies.

PIDMIOLOGIE

Agent tiologique : Sporothrix schenckii

Rservoir : vgtation en dcomposition, sol

Porte d'entre : implantation traumatique du champignon dans la peau,
Inhalation (rarement)

Contagiosit : aucune

Zone d'endmie : surtout Mexique, Amrique centrale, Colombie et Brsil

SPOROTHRIX SCHENCKII

PHASE SAPROPHYTIQUE (25-30 C)

Hyphes septs

Conidiophores dlicats avec
conidies denticules fixes le long
des hyphes ou regroupes en rosette

Colonies verruqueuses noires,
brunes, grises ou blanches,
glabres ou laineuses

PHASE PARASITAIRE (37 C)

Levure bourgeonnante ovale ou fusiforme, 5-8 m

10 m
Mycologie Partie 4 Les champignons dimorphes
Page 39

HISTOPLASMOSE

Infection intracellulaire du systme rticuloendothlial, suite linhalation des conidies du
champignon.

Environ 95 % des cas sont asymptomatiques ou bnins.

Environ 5 % voluent en infection pulmonaire chronique et progressive, cutane chronique,
systmique ou systmique fulminante fatale.

Les manifestations de cette maladie sont similaires celles de la tuberculose.

PIDMIOLOGIE

Agent tiologique : Histoplasma capsulatum

Rservoir : sol des rgions d'endmie (riche en azote)

Porte d'entre : voies respiratoires


Zones d'endmie : surtout en Amrique du Nord, valles de l'Ohio et du Mississippi;
aussi rencontr dans la valle du St-Laurent.

HISTOPLASMA CAPSULATUM


Hyphes septs

Microconidies

Macroconidies tubercules

Colonies blanches ou beiges, laineuses


Petites levures, 1-5 m

Bourgeons uniques

10 m
Page 40

BLASTOMYCOSE

Infection chronique granulomateuse et suppurative avec stade primaire pulmonaire (souvent nodule
pulmonaire unique dcouverte fortuite) se dissminant souvent par la suite dautres sites,
principalement la peau et les os.

PIDMIOLOGIE

Agent tiologique : Blastomyces dermatitidis

Rservoir : sol humide - contenu lev en matire organique - pH acide



Zones d'endmie : surtout dans le sud-est des tats-Unis et dans la valle de lOhio et du
Mississippi; aussi rencontr au Manitoba, en Ontario et au Qubec.

BLASTOMYCES DERMATITIDIS


Hyphes septs

Conidies piriformes ou rondes

Colonies blanches ou beiges,
laineuses ou glabres


Levure paroi rfringente
et col de bourgeonnement large, 8-20 m

10 m
Page 41

COCCIDIODOMYCOSE

Initialement une infection respiratoire rsultant de linhalation de conidies.

Rsolution rapide dans environ 40 % des cas.

Dveloppement dune immunit forte et spcifique la rinfection.

Progression de la maladie
-infection pulmonaire chronique
-infection systmique impliquant mninges, os, articulations, tissus cutans
et sous-cutans

PIDMIOLOGIE

Agent tiologique : Coccidioides immitis, Coccidioides posadasii

Rservoir : sol



Zones d'endmie : rgions arides
Coccidioides immitis - valle de St-Joaquin, Californie
Coccidioides posadasii Arizona, sud-ouest des E.-U., Amrique
centraleet Amrique du Sud

COCCIDIOIDES IMMITIS
COCCIDIOIDES POSADASII


Hyphes septs

Arthroconidies alternes avec cellules disjonctives

Colonies beiges ou blanches, laineuses

PHASE PARASITAIRE (37-40 C)

Sphrule 10-80 m avec endospores

Note : les sphrules peuvent tre obtenues in vitro
40
o
C sur milieu Converse. Toutefois, 37
o
C sur milieux
usuels, on obtiendra des arthroconidies.
10 m

10 m
m
Page 42

PARACOCCIDIODOMYCOSE

Infection chronique granulomateuse.
Infection primaire pulmonaire souvent inapparente qui se dissmine ensuite pour former des
granulomes ulcreux dans la bouche, la cavit nasale et occasionnellement la muqueuse gastro-
intestinale.

PIDMIOLOGIE

Agent tiologique : Paracoccidioides brasiliensis

Rservoir : sol (?)



Zones d'endmie : Amrique du Sud

PARACOCCIDIOIDES BRASILIENSIS

PHASE SAPROPHYTIQUE (25 C)

Hyphes septs

Conidies piriformes et arthroconidies trs rares

Colonies blanches, beiges ou roses,
glabres ou laineuses


Levures bourgeonnement multiple, 2-30 m

Page 43

INFECTION PENICILLIUM MARNEFFEI

Infection progressive systmique rsultant de linfiltration et de linflammation du systme rticulo-
endothlial par la forme levure du champignon.
Poumons, peau, os, articulations, foie, yeux, peu prs tous les organes peuvent tre atteints.

PIDMIOLOGIE

Agent tiologique : Penicillium marneffei

Rservoir : sol, rats de bambou



Zones d'endmie : Sud-est asiatique

PENICILLIUM MARNEFFEI


Hyphes septs

Conidies ellipsodes en chanes, produites
par des phialides regroupes en pinceaux

Colonies blanches en priphrie avec centre
bleu vert; pigment diffusible rouge *


Arthroconidies (levures se multipliant par fission)
3-5 m
Colonie non pigmente.

* Dautres espces de Penicillium peuvent aussi produire un pigment diffusible rouge 25-30 C.
Toutefois, celles-ci ne sont pas dimorphes et conservent habituellement leur pigment 37 C.
10 m
Page 44

5. AUTRES TECHNIQUES D'IDENTIFICATION

5.1 IMMUNO-IDENTIFICATION : Exoantignes
a) Trousses disponibles pour l'identification de :
Coccidioides sp.
b) Technique
Extraction des antignes solubles partir d'une culture mature
Concentration de l'antigne
Immunodiffusion
Bande(s) d'identit = > identification (spcificit 100 %)

5.2 SONDES MOLCULAIRES (GenProbe)
a) Trousses disponibles pour l'identification de :
Coccidioides sp.
b) Principe
Extraction de l'ARN ribosomal
Dnaturation de l'ARN
Hybridation avec sonde chimioluminescente
Lecture avec luminomtre

5.3 SQUENAGE DE GNES

a) Mthode maison
b) Principe
Extraction de l'ADN ribosomal
Dnaturation de l'ADN
Amplification dune rgion spcifique par PCR
Squenage
Comparaison des squences obtenues avec des squences de rfrence.

ITS : internal transcribed spacer
IGS : intergeneric spacer

Clinical and Laboratory Standards Institute. 2007. Interpretive criteria for microorganism identification by DNA target sequencing.
Proposed guideline. M18-P CLSI. Wayne, PA.
Page 45

7. MYCOSES PROFONDES : CARACTRISTIQUES

CHAMPIGNONS
PATHOGNES
CHAMPIGNONS
OPPORTUNISTES

MALADIE

Histoplasmose

Blastomycose

Paracoccidiodomycose

Coccidiodomycose

Candidose

Aspergillose

Cryptococcose

Mucormycose

HTE

Normal ou affaibli

Affaibli

PORTE D'ENTRE

Poumon

Variable

ORIGINE

Exogne

Endogne, exogne

PRONOSTIC

Gurison spontane
frquente chez l'hte
normal

Dpends de la maladie
sous-jacente

IMMUNIT

Oui

Non

DISTRIBUTION GOGRAPHIQUE

Restreinte

Mondiale

Page 46

8. IMMUNODIAGNOSTIC DES MYCOSES PROFONDES
(ractifs disponibles commercialement)

INFECTION
RECHERCHE
D'ANTICORPS
RECHERCHE
D'ANTIGNES

Blastomycose

+/-

+
1

Coccidiodomycose

+

+
1

Histoplasmose

+

+
1

Paracoccidiodomycose

+

-

Aspergillose

-

+
2,3

Candidose

-

-
3

Cryptococcose

-

+

1
Analyse disponible chez MiraVista Diagnostics http://www.miravistalabs.com ou Immy http://www.immy.com

2
Dtection galactomannanes dans le srum (EIA) - Platelia Aspergillus, Bio-Rad.

3
Dtection de (1-->3)--D-glucanes dans le srum
Fungitell - Glucatell :- Associates of Cape Cod (Falmouth, USA) http://www.beacondiagnostics.com/
Fungitec G : Seikagaku Kogyo Corporation (Tokyo)

Mycologie Annexes
Page 47

Annexe 1

MILIEUX DE CULTURE POUR L'ISOLEMENT PRIMAIRE DES CHAMPIGNONS

Type de spcimen Milieux suggrs Commentaires
Spcimens
dermatologiques
(utiliser 2 milieux)

A. glose Inhibitory Mold Agar
(IMA)
ou
glose Sabouraud
chloramphnicol

Milieux sans cycloheximide mais
avec antibactriens, permettant la
croissance des dermatophytes et
de champignons saprophytes
parfois responsables de
dermatomycose.
B. glose Mycosel ou
Mycobiotique

Milieu avec cycloheximide inhibant
la croissance de champignons
saprophytes habituellement non
pathognes tout en permettant la
croissance des dermatophytes.
Autres spcimens :

non striles
utiliser 3 milieux, un
de chaque catgorie
A, B et C

normalement
striles
utiliser 2 milieux, un
de chaque catgorie
A et B

A. glose BHI avec
chloramphnicol, avec ou
sans sang

Milieu riche, sans cycloheximide,
permettant la croissance de
champignons fastidieux et inhibant
la croissance bactrienne.
B. glose IMA
ou
glose Sabouraud
chloramphnicol
Milieux sans cycloheximide
permettant la croissance de la
plupart des champignons
dimportance mdicale.
C. glose Mycosel
Milieu avec cycloheximide inhibant
la croissance de certains
champignons saprophytes
habituellement non pathognes et
permettant la croissance de
nombreux pathognes.
Notes :
1) Sauf exception, toujours utiliser des milieux avec antibactriens.
2) Certains spcimens petit volume, tel que les biopsies de corne, sont ensemencs seulement sur
un milieu riche et non slectif permettant la croissance de champignons et de bactries.
3) Lorsque le volume de spcimen est trop faible pour ensemencer tous les milieux disolement,
inoculer les milieux de la liste ci-dessus par ordre successif, jusqu puisement du spcimen.
4) La temprature dincubation recommande est de 30 C pour tous les spcimens.
5) La priode dincubation est habituellement de 4 semaines pour l'isolement de dermatophytes et de
dimorphes et de 3 semaines pour les autres agents de mycoses. Il existe des exceptions, selon la
mthode utilise, le type de spcimen ou le champignon recherch.

Labarca, J. A. et al. 1998. Critical evaluation of 4 week incubation for fungal cultures: is the fourth week useful?
J. Clin. Microbiol. 36 :3683-3685.
Maxwell, G. M. et al.1997. Duration of fungal culture incubation in an area endemic for Histoplasma capsulatum.
Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 28 :41-43.
Morris A. J. et al. 1996. Duration of incubation of fungal cultures. J. Clin. Microbiol. 34 :1583-1585.
Page 48

Annexe 2

LISTE DE MILIEUX UTILES POUR L'IDENTIFICATION DES CHAMPIGNONS

MILIEUX DE BASE Utilisation

Glose Sabouraud glucose modifie Milieu de repiquage et didentification.

Glose pomme de terre glucose
Milieu de repiquage et didentification, favorise
la sporulation et la production de pigments (ex.
T. rubrum)

Glose cerveau-coeur (BHI)
Glose cerveau-coeur + 10 %
sang de mouton
Conversion des champignons dimorphes
(Histoplasma, Blastomyces, Sporothrix)

Glose ure de Christensen
Identification des levures et des
dermatophytes

Srum de veau ou de cheval
Identification de C. albicans/dubliniensis
tube germinatif

Glose farine de mas + Tween 80
Identification des levures - examen
morphologique

Assimilation de sources de carbone
(API 20C AUX) ou autre systme
d'identification
Identification des levures

AUTRES MILIEUX

Extrait de levure 10 %
Identification des dermatophytes
(perforation du cheveu)

Gloses Trichophyton #1 4 Identification des dermatophytes

Glose nitrate
Identification des levures et de certains
champignons dmatis

Glossaire
Page 49

Annexe 3

PREUVES DE SENSIBILIT AUX ANTIFONGIQUES

1. ANTIFONGIQUES

Classe Antifongique Cible
Polynes amphotricine B, nystatin

Membrane cellulaire,
ergostrol
Azoles
fluconazole, itraconazole,
voriconazole, posaconazole
Echinocandines
caspofungine, anidulafungine,
micafungine

Paroi cellulaire
(-d glucanes)
Allylamines terbinafine
Inhibiteurs de la synthse
des protines
5- fluorocytosine Protines

2. MTHODES

Mthodes de rfrence du Clinical Laboratory Standards Institute (Voir Bibliographie)
YeastOne, Trek Diagnostics Systems, Inc.
Etest, AB Biodisk.
Vitek, bioMrieux

Technique du CLSI (anciennement NCCLS)
Avantages Limites
Mthode standardise,
reproductible
Souches pour contrle de la
qualit
Grilles dinterprtation pour
fluconazole, itraconazole,
voriconazole, 5-fluorocytosine et
chinocandines pour Candida
sp. seulement
Interprtation base sur tudes
cliniques de candidose
oropharynge et invasive
Cots, entranement du personnel
Points de lecture (endpoints) parfois subjectifs
Croissance rsiduelle avec azoles et C. albicans et C.
tropicalis
Mauvaise discrimination des souches rsistantes
lamphotricine B
Pas de grille dinterprtation pour ampho B et les
nouveaux antifongiques
Pas de grille dinterprtation pour les organismes autres
que Candida sp.

Page 50

3. RECOMMANDATIONS

1. Pour les spcimens provenant de sites profonds ou normalement striles, identifier l'agent
tiologique au genre et si possible lespce. Certaines espces sont connues pour leur
rsistance intrinsque (ex. : Candida lusitaniae et amphotricine B, Candida krusei et
fluconazole, Candida guilliermondii et chinocandines).

2. Pour dterminer la pertinence des preuves de sensibilit, se rfrer aux directives sur les
mthodes diagnostiques et thrapeutiques produites par les socits de microbiologie et
infectiologie ou par des organismes tel que le Clinical and Laboratory Standards Institute.

3. Les preuves de sensibilit peuvent tre utiles dans les cas dinfection associs un chec
thrapeutique de mme que dans les cas dinfection o la rsistance est susceptible de se
dvelopper en cours de traitement prolong (surtout lors de l'utilisation d'antifongiques azols).

4. Pour les organismes rarement isols, les preuves de sensibilit sont gnralement peu utiles.
Slectionner plutt le traitement en fonction de lexprience clinique.

5. Les preuves de sensibilit sont utiles dans le cadre de programmes de surveillance pour
tablir le profil de sensibilit de souches pathognes l'intrieur d'une institution ou sur un
territoire donn.

Pfaller, M. A., D. J. Diekema. 2012. Progress in antifungal susceptibility of Candida spp. and Laboratory
Standards Institute Broth Microdilution Methods, 2010-2012. J. Clin. Microbiol. ahead of print, 27 June 2012
(voir tableau 5)

4. DONNES DU QUBEC

Programme de surveillance 2003-2005

Espces
Antifongiques
Pourcentage de souches de Candida rsistantes
albicans
(n=288)
glabrata
(n=78)
parapsilosis
(n=43)
tropicalis
(n=21)
lusitaniae
(n=13)
krusei
(n=12)
Amphotricine B
1
0,3 11,5 2,3 0 7,7 8,3
5-fluorocytosine 2,4 0 0 4,8 0 0
Itraconazole 0 83,3 0 14,3 0 25
Fluconazole 0,3 5,1 0 4,8 0 100
2
Voriconazole 0 1,3 0 4,8 0 0
1
aucun critre dinterprtation officiel disponible. Seuil de rsistance utilis : CMI >2 mg/l.
2
toutes les souches de C. krusei sont considres rsistantes demble au fluconazole

St-Germain, G., M. Laverdire, R. Pelletier, P. Ren, A. Bourgault, C. Lemieux, M. Libman. 2008.
Epidemiology and antifungal susceptibility of bloodstream Candida isolates in Quebec: Report on 453
cases between 2003 and 2005. Can. J. Infect. Dis. Med. Microbiol. 19:55-62.

G. St-Germain, M. Laverdire, R. Pelletier, A.-M. Bourgault, M. Libman, C. Lemieux, G. Nol. 2001.
Prevalence and antifungal susceptibility of 442 Candida isolates from blood and other normally sterile
sites: results of a 2-year (1996-1998) multicenter surveillance study in Quebec, Canada. J. Clin. Microbiol.
39:949-953.

Glossaire
Page 51

Glossaire

ALEURIOCONIDIE (n.f.). Conidie libre suite la lyse d'une
cellule de support; on la reconnat habituellement par sa base
tronque, dote d'une frange annulaire.

ALTERN (adj.). Se dit d'arthroconidies alternant avec des
cellules vgtatives (cellules disjonctives); ces dernires
dgnrent et se brisent pour librer les arthroconidies.

ANAMORPHE (n.m. et adj.). Forme reproductive asexue d'un
champignon.

ANNELLIDE (n.f.). Cellule conidiogne plus ou moins
diffrencie des hyphes et produisant des conidies selon un
mode basiptal. L'extrmit de l'annellide se dveloppe selon un
mode percurrent, c'est--dire qu'il s'allonge lgrement avec la
production de chaque nouvelle conidie et porte la marque
d'anneaux qui sont autant de cicatrices laisses par les conidies
libres. Ces anneaux ne sont pas toujours visibles au
microscope optique.

ANNELLOCONIDIE (n.f.). Conidie forme par un annellide.

ANTHROPOPHILE (adj.). Se dit d'un champignon
(dermatophyte) qui se dveloppe prfrentiellement ou
exclusivement chez l'humain plutt que chez l'animal ou dans le
sol.

APEX (n.m.). Extrmit.

APOPHYSE (n.f.). Renflement en forme d'entonnoir l'extrmit
d'un sporangiophore, sous le sporange.

ARTHROCONIDIE (n.f.). Conidie issue de la dsarticulation des
cellules dun hyphe et libre soit par un processus de fission
(arthroconidies simples) soit par la lyse de cellules disjonctives
(arthroconidies alternes).

ASCOCARPE (n.m.). Structure de fructification l'intrieur de
laquelle sont forms les asques chez certains champignons de
la division Ascomycota. Les clistothces et les prithces sont
des types d'ascocarpes.

ASCOSPORE (n.f.). Spore sexue forme l'intrieur d'un
asque chez les champignons de la division Ascomycota. Il y a
habituellement 4 ou 8 ascospores par asque - parfois 2 ou des
multiples de 4.

ASQUE (n.m.). Cellule en forme de sac (rond, massu,
cylindrique) l'intrieur de laquelle sont produites des
ascospores.

BISRI (adj.). Chez les Aspergillus, prsence de phialides
supportes par des mtules fixes en surface des vsicules.

BLASTIQUE (adj.). Se dit d'un mode de formation d'une conidie
bas fondamentalement sur un processus de bourgeonnement.
La cloison qui dlimite la blastoconidie de sa cellule mre
apparat uniquement la fin du processus de formation. Ainsi,
une partie seulement de la cellule mre se transforme en
conidie. (voir: blastoconidie, annelloconidie, phialoconidie,
poroconidie, thallique).

BLASTOCONIDIE (n.f.). Conidie produite par bourgeonnement;
chez les levures, un bourgeon.

BLASTOMYCOSE (n.f.). Maladie cause par Blastomyces
dermatitidis. L'infection est habituellement acquise par inhalation
des conidies du champignon et se dveloppe initialement au
niveau des poumons. Parfois elle se dissmine, principalement
au niveau de la peau, des os ou du cerveau.

BOUCLE (n.f.). Excroissance situe sur le ct d'une hyphe, au
point de rencontre de deux cellules et faisant le pont entre celles-
ci. La prsence de ce type de structure dans les hyphes
vgtatifs d'un champignon indique son appartenance la
division Basidiomycota. [Angl. Clamp connexion].

CELLULE EN BOUCLIER. Conidie en forme de V ou de bouclier,
principalement retrouve chez les champignons du genre
Cladosporium, aux points o les chanes de conidies se ramifient
pour former deux chanes. [Angl. Shield shaped cell].

CELLULE EN NOISETTE. Cellule rfringente, paroi paisse et
de forme variable observe chez certaines espces d'Aspergillus.
[Angl. hlle cell].

CHANDELIER FAVIQUE. Hyphe se terminant par des
embranchements qui ressemblent un chandelier ou des bois de
cerf. Typiquement retrouv chez Trichophyton schoenleinii.

CHLAMYDOSPORE (n.f.). Cellule de rsistance, arrondie,
renfle, paroi paisse, intercale dans une hyphe ou terminale.
Techniquement, il ne s'agit ni d'une spore, ni d'une conidie, mais
plutt d'une structure de repos ou de rsistance attache en
permanence un hyphe.

CHROMOBLASTOMYCOSE (n.f.). Infection chronique des tissus
sous-cutans cause par un petit groupe de champignons
dmatis dont Fonsecaea pedrosoi, Phialophora verrucosa et
Cladosporium carrionii. L'infection, caractrise par des lsions
cutanes verruqueuses et la formation de cellules fumagodes
dans les tissus, est souvent limite un seul membre. Elle
survient aprs inoculation du champignon dans la peau, la suite
d'un traumatisme cutan.

CLISTOTHCE (n.m.). Organe de fructification de certains
champignons de la division Ascomycota. Il s'agit d'une structure
plus ou moins ronde l'intrieur de laquelle sont produits des
asques. Contrairement au prithce, le clistothce ne possde
pas d'ouverture et doit se briser pour librer ses ascospores.

COCCIDIODOMYCOSE (n.f.). Maladie cause par Coccidioides
immitis/posadasii. L'infection est habituellement acquise par
inhalation des arthroconidies du champignon. Initialement
pulmonaire, elle se rsorbe souvent d'elle-mme, ou parfois se
dissmine dans d'autres parties du corps, dont la peau, les os, les
articulations, le foie et les systmes nerveux central et gnito-
urinaire.

COENOCYTIQUE (adj.). Non ou peu sept; souvent utilis pour
dcrire les hyphes des Mucorales, ou d'autres structures
similaires o le cytoplasme d'un organisme n'est pas confin dans
des cellules individuelles.

Page 52

COLLERETTE (n.f.). Vestige de paroi cellulaire prsent
l'extrmit d'une phialide. La collerette ressemble souvent un
entonnoir ou un tube, mais n'est pas toujours visible au
microscope optique.

COLUMELLE (n.f.). Extrmit renfle du sporangiophore, faisant
saillie l'intrieur du sporange.

CONIDIE (n.f.). lment fongique uni ou pluricellulaire qui,
maturit, se dtache du myclium pour ensuite se dissminer; il
s'agit d'une structure de reproduction asexue.

CONIDIOGNE (adj.). Se dit d'une cellule spcialise produisant
des conidies. Par exemple, les phialides et annellides sont des
cellules conidiognes.

CONIDIOPHORE (n.m.). Hyphe spcialis sur laquelle se
dveloppent les conidies; le terme peut s'appliquer une cellule
conidiogne ou une structure spcialise qui supporte une ou
des cellules conidiognes.

CORMIE (n.f.). Faisceau de conidiophores ciments les uns aux
autres et produisant des conidies l'apex. [Angl. coremium,
synnema].

CYCLOHEXIMIDE (n.m.). Antifongique large spectre produit par
Streptomyces griseus, principalement utilis en laboratoire
biomdical comme agent slectif pour l'isolement des
dermatophytes (cf. glose Mycosel). Aussi connu sous le nom
commercial, Actidione.

DMATI (adj.). Se dit d'un champignon produisant un pigment
brun noir (mlanine) dans la paroi cellulaire de ses hyphes ou
de ses conidies. Parfois les colonies sont ples en dbut de
croissance, devenant de plus en plus fonces avec l'ge. Le
terme dmati est driv du nom donn la famille-
anamorphe Dematiaceae, un taxon artificiel cr pour englober
tous les champignons de couleur sombre produisant des conidies
en surface de filaments et non pas l'intrieur de pycnides.
Ainsi, les champignons qui se reproduisent asexuellement par
des pycnides seulement (ex. Phoma), ne sont jamais qualifis de
dmatis , mme lorsqu'ils sont bruns. Il en va de mme pour
les champignons qui se reproduisent par un mode sexu
seulement (ex. Chaetomium).

DERMATOMYCOSE (n.f.). Infection de la peau, des cheveux ou
des ongles cause par un champignon.

DERMATOPHYTE (n.m.). Champignon appartenant aux genres
Epidermophyton, Microsporum ou Trichophyton et qui infecte la
peau ou les phanres (cheveux, poils, plumes, ongles, griffes)
d'organismes vivants.

DERMATOPHYTIE,
DERMATOPHYTOSE (n.f.). Infection de la peau, des cheveux ou
des ongles cause par un dermatophyte.

DIMORPHE (adj.). Qui possde deux formes. Couramment utilis
en mycologie mdicale pour dcrire des champignons qui
exhibent un dimorphisme thermique, c'est--dire qui se
manifestent sous forme filamenteuse 25 C et sous forme de
levure ou de sphrule 37 C sur milieux spcialiss ou in vivo.
En mycologie gnrale, ce terme s'applique tout champignon
capable de se transformer d'une forme filamenteuse une forme
particulaire, indpendamment de la temprature.

DISJONCTIF, IVE (adj.). Se dit d'une cellule vide qui se
fragmente ou se lyse pour librer une conidie. [Angl. disjunctor,
separating cell].

CHINUL, (adj.). Prsentant de petites asprits en surface.

FRANGE ANNULAIRE. Petite membrane attache la base ou
aux extrmits d'une conidie libre (aleurioconidie, arthroconidie
alterne); il s'agit d'un vestige de la paroi de la cellule de support
qui s'est lyse pour librer la conidie.

FUMAGODE (adj.). Se dit d'une cellule dmatie, paroi
paisse, se divisant par fission bilatrale et retrouve dans les
tissus, chez les patients atteints de la chromoblastomycose.
[Angl. Sclerotic body].

GNICUL (adj.). Se dit d'un conidiophore flchi sur lui-mme,
formant un ou plusieurs angles. Ce type de conidiophore rsulte
typiquement d'un dveloppement sympodial.

GOPHILE (adj.). Se dit d'un champignon (un dermatophyte, ou
une espce non pathogne de Trichophyton, Microsporum ou
Epidermophyton) qui se dveloppe prfrentiellement dans le sol
plutt que chez l'animal ou l'humain. Tellurique.

GLABRE (adj.). Lisse, dpourvu de poils.

HILAIRE (adj.). Se dit d'une cicatrice bien visible et protubrante,
persistant la base d'une conidie, au point o elle s'est spare
de la cellule conidiogne.

HTROTHALLIQUE (adj.). Se dit d'un champignon dont la
reproduction sexue n'est possible qu' partir de cellules
provenant de deux souches sexuellement compatibles.

HISTOPLASMOSE (n.f.). Maladie cause par Histoplasma
capsulatum. L'infection, habituellement acquise par inhalation des
conidies du champignon, demeure le plus souvent bnigne ou
asymptomatique. Chez certains patients, elle peut devenir
chronique ou aigu et se dissminer avec des atteintes du systme
rticulo-endothlial, de la rate, du foie, des glandes surrnales, du
tractus gastro- intestinal, des muqueuses ou de la moelle
osseuse.

HOMOTHALLIQUE (adj.). Se dit d'un champignon qui peut se
reproduire sexuellement partir de cellules provenant d'une
mme souche.

HYALIN (adj.). Non pigment, incolore. Souvent utilis pour
caractriser des structures qui apparaissent incolores sous le
microscope.

HYALOHYPHOMYCOSE (n.f.). Groupe d'infections htrognes
causes par des champignons sans pigment brun dans la paroi
de leurs cellules et caractrises par la prsence, dans les tissus,
d'hyphes septs hyalins, parfois ramifies ou torulodes. Dans la
pratique, ce nom est habituellement rserv des mycoses rares
et ne remplace pas les termes bien tablis tels que aspergillose.

HYPHE (n.f. ou n.m.). Filament sept ou non sept d'un
champignon.

HYPHE EN BUISSON. Hyphe dont les ramifications se dirigent
contresens les unes des autres, en "fils de fer barbels". [Angl.
Reflexive hyphae].

HYPHE EN RAQUETTE. Hyphe compos d'une succession de
cellules renfles une de leurs extrmits, donnant l'impression
de raquettes places bout bout.

Glossaire
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HYPHE EN SPIRALE. Hyphe courb en spirale, soit plat ou en
tire-bouchon. Cette structure spcialise observe chez certains
dermatophytes est plus rigide que les spirales communment
formes par plusieurs champignons et se situe en position
terminale plutt qu'intercalaire.

HYPHE EN TTE DE CLOU. Hyphe extrmit aplatie,
typiquement rencontre chez certains dermatophytes tel
Trichophyton schoenleinii.

IMPARFAIT (adj.). Se dit de la forme asexue ou anamorphe d'un
champignon.

MACROCONIDIE (n.f.). La plus grosse de deux conidies de
grosseurs diffrentes produites par un mme champignon.
Souvent pluricellulaire.

MTULE (n.f.). Segment du conidiophore partir duquel sont
produites les phialides chez les Aspergillus bisris et les
Penicillium multiverticills.

MICROCONIDIE (n.f.). La plus petite de deux conidies de
grosseurs diffrentes produites par un mme champignon.
Souvent unicellulaire.

MOISISSURE (n.f.). Champignon microscopique produisant
principalement des filaments.

MUCORALES. Ordre du phylum Glomeromycota auquel
appartiennent, entre autres, les Absidia, Cunninghamella, Mucor,
Rhizopus et Rhizomucor. Ces champignons se distinguent par
leurs colonies croissance trs rapide composes d'hyphes
larges, non ou peu septs, et de sporanges.

MUCORMYCOSE (n.f.). Maladie cause par un champignon de
l'ordre Mucorales. Les infections causes par des champignons
de l'ordre des Mucorales (Absidia, Cunninghamella, Mucor,
Rhizomucor, Rhizopus) sont typiquement diagnostiques chez le
patient dbilit souffrant d'acidose diabtique, de malnutrition, de
brlures graves ou de maladies du systme immunitaire. Elles
sont aigus, trs souvent mortelles, et se caractrisent par la
ncrose des tissus et par la production d'infarctus au niveau du
cerveau, des poumons et des intestins. D'autre part, les
infections causes par des champignons de l'ordre des
Entomophthorales (Basidiobolus, Conidiobolus), sont
habituellement chroniques et touchent principalement les
muqueuses et les tissus sous-cutans.

MURIFORME (adj.). Sept la fois transversalement et
longitudinalement.

MYCLIUM (n.m.). Ensemble des hyphes d'une colonie d'un
champignon. Le terme est aussi utilis couramment pour
dsigner une quantit indfinie d'hyphes.

MYCTOME (n.m.). Infection chronique des tissus mous ou
osseux, habituellement limite un seul membre et caractrise
par la formation de tumfactions fistulises d'o s'chappent des
grains noirs ou blancs.

ONYCHOMYCOSE (n.f.). Infection des ongles cause par un
champignon.

ORGANE NODULAIRE. Noeud form d'hyphes enchevtres et
souvent pigmentes, caractristique de certains dermatophytes.

OSTIOLE (n.f.). Ouverture dans la paroi d'un prithce ou d'une
pycnide, par laquelle s'chappent les spores ou les conidies.

PARACOCCIDIODOMYCOSE (n.f.).Infection chronique du
systme respiratoire cause par Paracoccidioides brasiliensis.
Elle se caractrise par une atteinte primaire des poumons
accompagne de lsions secondaires aux muqueuses buccales,
nasales ou gastro-intestinales.

PARASITE (n.m. et adj.). Organisme qui vit en troit contact et
entirement aux dpens d'un autre organisme vivant.

PARFAIT (adj.). Se dit de la forme sexue ou tlomorphe d'un
champignon.

PECTIN (adj.). En forme de peigne. Principalement utilis pour
dcrire certaines hyphes de certains dermatophytes.

PDONCUL (adj.). Se dit d'une conidie supporte par un court
filament.

PRITHCE (n.m.). Fruit de certains champignons de la division
Ascomycota. Il s'agit d'une structure en forme de sac plus ou
moins ronde, l'intrieur de laquelle sont forms des asques.
Contrairement au clistothce, le prithce libre ses ascospores
par une ouverture appele ostiole.

PHAEOHYPHOMYCOSE (n.f.). Groupe d'infections htrognes
caractrises par la prsence d'hyphes, de pseudohyphes ou de
levures brunes dans les tissus. Ce nom est habituellement
rserv certaines mycoses rares pour lesquelles il n'existe
aucun nom reconnu.

PHIALIDE (n.f.). Cellule conidiogne souvent en forme de
bouteille, produisant des conidies selon un mode basiptal. La
longueur de cette cellule demeure fixe tout au long du processus
de formation des conidies. Une collerette est parfois visible son
extrmit.

PHIALOCONIDIE (n.f.). Conidie produite par une phialide.

PIRIFORME (adj.). En forme de poire.

PLOMORPHISME (n.m.). Phnomne de mutation survenant
chez les dermatophytes maintenus en laboratoire et entranant la
disparition d'lments d'identification caractristiques tels que la
pigmentation des colonies et la production de conidies.

POROCONIDIE (n.f.). Conidie forme au travers d'un pore dans
la cellule conidiogne.

PSEUDOHYPHE (n.f.). Srie de blastoconidies allonges
demeurant attaches les unes aux autres, ayant l'apparence dun
hyphe en chapelet.

PYCNIDE (n.f.). Chez les Sphaeropsidales, structure ronde en
forme de sac, avec une ouverture apicale (ostiole), l'intrieur de
laquelle sont formes des conidies. La pycnide ressemble au
prithce mais ne drive aucunement d'un processus sexu.

RHIZODE (n.m.). Hyphes ayant l'apparence de racines.

SAPROPHYTE (n.m. et adj.). Organisme qui se nourrit de matire
organique morte.

SEPTUM (n.m.). Cloison dans un hyphe, un conidiophore, une
conidie ou une spore.

SIMPLE (adj.). Se dit d'un conidiophore non ramifi.

SPHRULE (n.f.). Structure sphrique paroi paisse, produite
par Coccidioides immitis/posadasii dans les tissus; dans certaines
conditions spciales, elle peut aussi tre produite in vitro.
maturit, elle contient des endospores.

SPORANGE (n.m.). Structure en forme de sac, contenant des
spores asexues formes par un processus de clivage
cytoplasmique.
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SPORANGIOLE (n.m.). Petit sporange ne contenant qu'un faible
nombre de sporangiospores et parfois mme une seule
sporangiospore.

SPORANGIOPHORE (n.m.). Hyphe spcialis donnant
naissance un sporange.

SPORANGIOSPORE (n.f.). Spore asexue produite par clivage
cytoplasmique l'intrieur d'un sporange.

SPORE (n.f.). lment fongique de propagation, issu soit d'un
processus de reproduction sexu (ascospore, basidiospore,
zygospore), soit d'un processus de reproduction asexu
impliquant un clivage cytoplasmique (sporangiospore).

SPOROTRICHOSE (n.f.). Infection sous-cutane cause par
Sporothrix schenckii et caractrise par l'apparition de nodules
forms via le systme lymphatique, partir du point d'inoculation.
Les formes dissmines ou pulmonaires sont rares.

STRILE (adj.). Se dit d'une culture de champignon qui ne
produit aucune spore ou conidie.

STOLON (n.m.). Hyphe arien horizontal, partir de laquelle se
forment les rhizodes et les sporangiophores.

SYMPODIAL (adj.). En mycologie mdicale, se dit de la
croissance d'un conidiophore qui se dveloppe par la formation
d'un nouveau point de croissance, juste en dessous de la conidie
se situant l'apex, poussant celle-ci de ct pour s'allonger. Ce
processus se rpte plusieurs reprises. Souvent le
conidiophore prend une forme gnicule ou en zigzag.

TLOMORPHE (n.m. et adj.). Forme sexue d'un champignon.

THALLE (n.m.). Colonie; ensemble de l'appareil vgtatif et de
l'appareil reproductif d'un champignon.

THALLIQUE (adj.). Se dit du mode de formation d'une conidie qui
provient de la transformation d'un segment d'hyphe dj dlimit
par une ou des cloisons. La cellule mre se transforme au
complet en conidie. (voir: aleurioconidie, arthroconidie,
chlamydospore, blastique).

TORULODE (adj.). Se dit d'une hyphe ou d'un conidiophore qui
prsente une srie successive de renflements et d'tranglements.

TRONQU (adj.). Se dit d'une cellule dont la base se termine
abruptement, comme si elle avait t coupe.

UNISRI (adj.). Chez les Aspergillus, se dit de phialides
formes directement sur la vsicule, en l'absence de mtules.

VERTICILLE (n.m.). Souvent utilis pour dcrire un ensemble de
cellules conidiognes fixes en cercle autour d'un conidiophore
(ex. Verticillium).

VSICULE (n.m.). Structure ayant la forme d'une petite vessie.
Souvent utilis pour dcrire l'extrmit gonfle d'un conidiophore
(ex. Aspergillus) ou d'un sporangiophore (ex. Syncephalastrum).

ZOOPHILE (adj.). Se dit d'un champignon (dermatophyte) qui se
dveloppe prfrentiellement chez l'animal plutt que chez
l'humain ou dans le sol.

ZYGOSPORE (n.f.). Spore sexue forme par la fusion de deux
cellules semblables appeles gamtanges; ce type de spore est
caractristique des champignons de la division Glomeromycota.
Bibliographie
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Bibliographie

Traits gnraux (clinique et laboratoire)

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Page 56

Notes
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