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Donner trois mesures de comparaison de formes permettant dvaluer de faon

quantitative des mthodes de segmentation dimages, donner les formules correspondantes


et les expliquer?
Les mesures de similarit, cest--dire la fonction qui permet de quantifier le succs relatif dun
recalage avec une transformation donne,
la somme des diffrences en valeur absolue (SDA)
La somme des diffrences au carr (SDC)
TYPES DE DISTANCES
La distance la plus connue est la distance Euclidienne, qui dfinit lespace cartsien.
d ( x, y )

x y
i 1

(pour des vecteurs de dimension n). La distance Euclidienne est souvent

utilise au carr.

Distance de Mahalanobis :
d x, y

x y Cov D x y

o Cov(D) est la matrice de covariance. Si les lments de x et de y sont indpendants, la matrice


de Covariance sera lidentit et la distance de Mahalanobis serait gale la distance Euclidienne.
La boule associe une distance de Mahalanobis est de forme elliptique, alors que la boule dune
distance Euclidienne est un cercle (en deux dimensions).
Erp 1
Inter
Union
Modul
Expliquer la diffrence entre recalage iconique et recalage gomtrique.
En traitement d'image, le recalage est une technique qui consiste en la mise en correspondance
d'images 1, ceci afin de pouvoir comparer ou combiner leurs informations respectives.
Recalage : Consiste trouver une transformation spatiale permettant daligner une image (source
ou flottante) sur une autre (cible ou rfrence).
Pourquoi faire du recalage? Le recalage vise compenser les variations de mesure
Aide au diagnostic
Planification et suivi des traitements
Grandes mthodes de recalage
(Mthode du chanfrein, mthode de Woods) ou de logiciel (AIR)
Exemple de recalage :
1) Intra-patient, mono-modalit _ Exemple : volution de lsions (images IRM dun patient
atteint de SEP quelques mois dintervalle)

2) Intra-patient, multi-modalit _ Exemple : fusion dinformations provenant de 2 modalits


diffrentes
3) Inter-patient, intra-modalit _ Exemple : Segmentation partir dun atlas anatomique
4) Extension en 3D
Mthodes de recalage
2 grandes familles :
Approches gomtriques : recalage de points, courbes, surfaces
Approches iconiques : recalage voxel voxel

Approches gomtriques
Mise en correspondance de points, courbes, etc positionns manuellement ou automatiquement
Trs souvent recalage rigide ncessitant les contours initiaux
Un exemple : recalage par chanfrein (Calcul dune carte de distance au contour sur limage de
rfrence)

Approches iconiques
Nutilisent pas de primitives gomtriques
Evite une tape de segmentation
Prfres quand il est difficile dextraire des structures communes des jeux de donnes
Utilisent lintensit et la position des voxels
Recalage rigide ou non-rigide
Un exemple : mthode de Woods (1992) Logiciel AIR : Automated Image Registration

Approche icnique
Cette classe de mthodes se fonde essentiellement sur l'utilisation des intensits des deux images
via l'utilisation d'une mesure de similarit, sans prendre en compte l'information gomtrique.
Cette approche peut galement s'appuyer sur une information drive des caractristiques
diffrentielles de l'image ou sur une transforme de Fourier. Cependant, dans le cas du recalage
multimodal ou monomodal inter-patients, la relation entre l'intensit des images n'est pas
toujours triviale calculer. De plus, on n'extrait pas un sous-ensemble d'attributs, et par
consquent le nombre de donnes traiter est lev (l'entiret de l'image).
Approche gomtrique
Ces mthodes furent parmi les premires tre proposes de par leur similitude avec la mthode
utilise par un tre humain pour mettre en correspondance deux images. Elles se fondent en effet
sur l'extraction partir de chacune des images de primitives gomtriques (points saillants, coins,
contours, ...). Par la suite, ces primitives sont apparies afin de dterminer la transformation entre
les deux images. Cette approche est intressante car ces primitives sont faciles manipuler et
elles permettent d'tre indpendante des modalits. Cependant, extraire ces attributs n'est pas
toujours ais.

En traitement d'imagerie mdicale, il y a beaucoup d'applications cliniques et de


recherches au recalage d'images. Les quatre grands domaines de recherches sont:

Le recalage inter-patients : pour mettre en correspondance les informations entre


plusieurs patients. Cela permet de crer des modles anatomiques ou fonctionnels de
rfrence, ou mme des atlas (sur base de la segmentation) ;
Le recalage intra-patient monomodal : pour suivre l'volution d'une lsion et
compenser les changements de sa position chez un patient par un seul mode
exploratoire ;
Le recalage intra-patient multimodal : pour mettre en correspondance les
informations anatomiques et fonctionnelles (plutt par recalage rigide ou affine)
chez un patient par plusieurs modes exploratoires ;
Le recalage atlas-donnes : pour mettre en correspondance des donnes cliniques
avec un atlas de rfrence.

Donner 3 exemples de mesures de similarit utilisables pour le recalage iconique.


Le catalogue des mesures existantes, tel que dresse par A. Roche [164], se divise en quatre
Parties.
1. Les mesures de diffrence dimages en gnral, qui supposent que les mmes objets
auront les mmes intensits dans les deux images recaler.
2. Le coefficient de corrlation, qui suppose un lien affin entre les intensits dun mme
objet reprsente dans les deux images recaler.
3. Le critre de Woods et ses variantes, ainsi que le rapport de corrlation, rendent compte
dune dpendance fonctionnelle entre les intensits des images recaler.
4. Enfin, une dpendance de nature statistique entre deux images peut tre quantifie par
lentropie conjointe, linformation mutuelle ou linformation mutuelle normalise
Expliquer le principe de leffet BOLD en IRM fonctionnelle ?
Le signal BOLD est le signal qui reflte les variations locales et transitoires de la quantit
d'oxygne transport par l'hmoglobine en fonction de l'activit neuronale du cerveau.

Citer trois mthodes pour calculer des aprioris sur les images IRM ?
Atlas Segmentation partir dun atlas anatomique / Atlas de rfrence
Atlas numrique voxlis/
Model deformable
Model a base ASP
C'est quoi la diffrente TEP et TEMP expliquer les deux mthodes ?
La tomographie par mission de positons (TEP) est une mthode d'imagerie
mdicalepratique par les spcialistes en mdecine nuclaire qui permet de mesurer en trois
dimensions une activit mtabolique ou molculaire d'un organe grce aux missions produites
par les positons (positrons en anglais) issus d'un produit radioactif inject au pralable.
La tomographie par mission de positons (TEP) est une modalit dimagerie mdicale qui
mesure la distribution tridimensionnelle dune molcule marque par un metteur de positons.
Lacquisition est ralise par un ensemble de dtecteurs rpartis autour du patient. Les dtecteurs
sont constitus dun scintillateur qui est choisi en fonction de nombreuses proprits, pour
amliorer lefficacit et le rapport signal sur bruit. Le circuit de concidence mesure les deux

photons gamma de 511 keV mis dans des directions opposes qui rsultent de lannihilation du
positon.
La tomographie d'mission monophotonique, (TEMP) dite aussi SPECT (de l'anglais : Single
photon emission computed tomography), tomoscintigraphie par mission monophotonique est
une technique d'imagerie mdicale nuclairetomographique base sur la scintigraphie et qui
permet de raliser des images et des reconstructions en trois dimensions des organes et de
leur mtabolisme au moyen d'un ensemble de gamma camras qui tournent autour du patient.

Dcrire le principe de dtection en imagerie nuclaire. ?


Utilisation de produits radioactifs pour produire des images de la structure et de la fonction de
lintrieur du corps.
Donner le principe de fonctionnement de EEG et EMG ?
L'lectroencphalographie (EEG) est une mthode d'exploration crbrale qui mesure l'activit
lectrique du cerveau par des lectrodesplaces sur le cuir chevelu souvent reprsente sous la
forme d'un tracappel lectroencphalogramme. Comparable l'lectrocardiogrammequi
permet d'tudier le fonctionnement du cur, l'EEG est un examenindolore et non-invasif qui
renseigne sur l'activit neurophysiologique du cerveau au cours du temps et en particulier
du cortex crbral soit dans un but diagnostique en neurologie.

L'lectromyographie (EMG) est une technique mdicale qui permet d'enregistrer, avec un
lectromyographe, les courants lectriques qui accompagnent l'activit musculaire. Elle permet
d'tudier le systme nerveux priphrique, les muscles et la jonction neuromusculaire, d'obtenir
un lectromyogramme et d'tablir un lectrodiagnostic.
Principes de b ase de lImagerie par Rsonance Magntique ?
LIRM est une technique base sur lobservation de la rsonance magntique nuclaire (RMN)
des protons de leau. En effet, leau constitue environ 70% du corps humain et le proton 1H est
naturellement abondant et trs sensible en RMN[2].
Lintensit du signal observ va donc dpendre de la concentration en eau, mais aussi du
temps de relaxation des spins nuclaires. Ainsi on pourra obtenir une image de la rpartition en
eau dans le corps du patient.
Le rle des agents de contraste va tre de diminuer ce temps de relaxation afin daugmenter
lintensit des signaux.
L'IRM fonctionnelle (IRMf), aussi appele imagerie BOLD, est une technique base sur
l'imagerie par rsonance magntique qui permet de dtecter les zones du cerveau actives dans une
tche, un processus ou une motion.

Les effets sur images IRM aprs produit agent de contraste ?


En imagerie mdicale, un produit (ou agent) de contraste est une substance qui augmente
artificiellement le contraste permettant de visualiser une structure anatomique (par exemple, un
organe)

Quel est leffet dun agent de contraste ?


Les agents de contraste IRM sont des molcules destines amliorer la qualit des diagnostics
par imagerie mdicale par rsonance magntique.
Les paramtres des tissus que l'on peut observer en IRM ?
Cerveau (Diagnostic de la sclrose en plaques, de la maladie dAlzheimer, de lpilepsie)
Moelle pinire
Diagnostic des lsions)
Muscles, tendons.
Vaisseaux: angiographie
Diagnostic des accidents
vasculaires crbraux)
Coeur
viscres
La tomographie d'mission monophotonique, (TEMP) dite aussi SPECT (de l'anglais : Single
photon emission computed tomography), tomoscintigraphie par mission monophotonique est
une technique d'imagerie mdicale nuclairetomographique base sur la scintigraphie et qui
permet de raliser des images et des reconstructions en trois dimensions des organes et de
leur mtabolisme au moyen d'un ensemble de gamma camras qui tournent autour du patient.

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