donnes Raster
QGIS Perfectionnement
version 2.1 A
6 fvrier 2015
Table des
matires
Matrise d'ouvrage : MEDDE - METL - MAAF / Matrise d'uvre : ENTE Aix - ENSG /
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Objectifs
Matrise d'ouvrage : MEDDE - METL - MAAF / Matrise d'uvre : ENTE Aix - ENSG /
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Introduction
Les donnes raster dans les SIG correspondent des matrices de cellules rectangulaires de
mme dimension qui reprsentent des objets. Les donnes raster typiques sont :
Les modles numriques de terrain o la cellule de base correspond la maille
lmentaire portant l'altitude.
Les cartes scannes et les orthophotos ariennes ou satellitaires pour lesquelles
chaque pixel de l'image correspond une cellule de base de la matrice ;
Les donnes raster ne sont pas associes des donnes attributaires. QGIS utilise la
bibliothque GDAL pour lire et crire les donnes raster, ce qui reprsente une centaine de
formats diffrents.
Si l'approche par type de donnes a t prfre pour tre plus proche des cas
d'utilisation, il ne faut pas oublier que, sauf cas particuliers, beaucoup de
commandes prsentes dans ce module s'appliquent de la mme manire aux
modles numriques de terrain et aux images raster.
Les commandes expliques dans ce module peuvent tre soit des commandes par dfaut de
QGIS soit des extensions . Le caractre facultatif de ces dernires peut conduire ce que
certaines commandes dcrites ci-aprs n'apparaissent pas dans les menus, auquel cas il faut
les activer, voire les installer, via le menu "Extension". A titre d'information et de vrification,
l'organisation du menu Raster complet devrait tre le suivant, en cas d'installation avec le
package "Expert" :
Sous-menu
Commande
Origine
Calculatrice Raster
Gorfrencer
Gorfrencer
Extension Gorfrenceur
intgre par dfaut dans QGIS
( activer ventuellement)
Interpolation
Interpolation
Projections
Conversion
Extraction
Cration de contours,
Dcouper ...
Analyse
Divers
VRT, Fusionner
Information, ...
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Sous-menu
Commande
Origine
Paramtres de GdalTools
Analyse de
terrain
Pente, Aspect,
Ombrage, ...
Raster Calc
Raster Calc
Les modles
numriques de
terrain (MNT)
I -
Remarque
Le choix d'tirer par dfaut l'histogramme l'ouverture d'une couche raster se fait
dans les prfrences : Options - Rendu - Rasters
Nous reviendrons un peu plus loin sur ces manipulations de l'histogramme
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distribuer les MNT de la BD Alti. Ce format de fichier (lisible par n'importe quel
diteur de texte) contient dans son en-tte les informations permettant QGIS de
positionner les cellules de la matrice :
ncols 401 (nombre de colonnes de la matrice)
nrows 401 (nombre de lignes de la matrice)
xllcorner 464987.50 (abscisse du point situ en bas gauche de la zone
modlise)
yllcorner 6734987.50 (ordonne du point situ en bas gauche de la zone
modlise)
cellsize 25.00 (taille de la cellule de base : ici, le pas du MNT est de 25 mtres)
NODATA_value -9999 (valeur qui indique l'absence de donnes pour la cellule
considre, notamment lorsque la cellule est en-dehors de l'emprise modlise)
Puis les donnes d'altitude (ici en mtres)
: 401 lignes contenant chacune 401
valeurs :
51 52 52 52 52 51 52 55 58 58 59 [....]
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Afin de vrifier le rsultat obtenu, cliquer sur "Appliquer" pour appliquer la palette de
couleurs sans sortir de la fentre des proprits ou sur "OK" pour appliquer la palette
et revenir la carte.
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Complment
: Sauvegarder le classement
Il est possible de sauvegarder cette liste des entres sous forme d'un fichier TXT avec
le bouton
la suite.
Comme souvent dans QGIS, certaines fonctions quasiment similaires sont disponibles
par des mthodes diffrentes. Pour l'analyse du MNT, on peut utiliser :
soit les commandes par dfaut de QGIS
qui font partie du noyau du
logiciel ;
soit une extension, ici dnomme "Analyse de terrain".
Les diffrences portent souvent sur les possibilits de paramtrage des commandes.
De plus, l'extension "Analyse de terrain" propose des commandes moins nombreuses
limites quelques traitements spcifiques sur les MNT. Nous tudierons cette
solution en premier.
Il est noter que
ces deux solutions crent des nouvelles couches raster
contenant le rsultat de ces analyses de terrain (la couche originale du MNT n'est pas
modifie) qui peuvent donc tre utilises indpendamment du MNT.
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Mthode
Pour mettre en uvre le calcul de l' ombrage par exemple (la mthode est peu de
choses prs identique pour le calcul de la pente, de l'aspect et de la rugosit), les
lments saisir sont les suivants :
14
Pour modifier cet affichage, il faut utiliser nouveau les proprits de la couche. Par
dfaut, le type de rendu est
Bande grise unique ce qui est bien adapt au
rendu habituellement retenu pour symboliser les ombrages. On peut y apporter des
modifications pour obtenir le rsultat souhait :
bouton
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Rsultat ombrage
Mthode
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Mthode
: La calculatrice raster
La calculatrice raster permet de faire des calculs arithmtiques et/ou logiques sur les
valeurs de chaque cellule. Le rsultat de ce calcul est enregistr dans une nouvelle
couche avec de multiples formats disponibles :
dans la fentre de la calculatrice, il faut choisir la couche raster sur laquelle
les calculs vont porter, ainsi que le numro de la bande de couleur qui est
indique par un numro aprs un @ (exemple : MNT_25M_asc@1) ;
donner le nom de la couche qui sera cre en sortie de calcul ;
les calculs pourront porter sur une emprise particulire dfinir, ou sur
l'tendue actuelle de la couche ;
l'expression de la calculatrice doit tre compose partir des oprateurs
disponibles dans la liste ou tape directement dans la zone rserve cet
effet.
Ici, nous souhaitons obtenir les zones du MNT qui sont situes en-dessous de
l'altitude 35 m : MNT_25M_asc@1 <= 35
18
Le rsultat obtenu est une couche (ici au format Gotiff et superpose au Scan25)
qui contient des cellules pouvant prendre deux valeurs 0 ou 1, reprsentes par deux
couleurs :
les cellules de couleur blanche pour la
valeur = 1 correspondant la
vrification de l'expression "valeur du terrain <= 35 m"
les cellules colores en noir lorsque cette expression n'est pas vrifie (terrain
au-dessus de 35 m) : valeur = 0.
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Mthode
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Outil de contours
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Mthode
Les outils d'analyse du terrain par dfaut de QGIS sont disponibles dans le menu
Raster - Analyse - MNT/DEM (Modles de terrain) . On y retrouve des commandes
quivalentes celles qui ont dj t examines dans l'extension "Analyse Raster de
terrain" :
Ombrage : mme signification que dans l'extension "Analyse raster de
terrain" ;
Pente :mme signification que dans l'extension "Analyse raster de terrain" ;
Aspect : mme signification que dans l'extension "Analyse raster de terrain" ;
Couleur du relief : correspond "Relief" dans l'extension "Analyse raster de
terrain" ;
Rugosit du terrain (TRI) : mal traduit, il faudrait dire "index de rugosit
du terrain" ;
ainsi que deux autres modes complmentaires d'analyse :
Index de position topographique : cet index est dfini comme la diffrence
des valeurs entre la cellule centrale et la moyenne de ses voisines ;
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Mthode
: L'interpolation
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sous-menu
L'interpolation sert valuer les valeurs prises en tout point d'un territoire par une
grandeur dont on ne connat prcisment que quelques localisations. Par exemple,
comment valuer l'altitude en tout point partir d'un MNT au pas de 25 mtres.
Dans QGIS, l'interpolation se fait :
avec un fichier vectoriel en entre : attention, un fichier raster de MNT ne
peut pas tre choisi, il faut un fichier vectoriel de points, avec un attribut
correspondant l'altitude (Champ Z).
en sortie un fichier raster de MNT dont on prcisera la taille des cellules de
base.
en paramtrant la mthode d'interpolation : distance inverse une puissance
ou plus proche voisin , etc.
Le choix des paramtres d'interpolation est extrmement important et peut
conduire des rsultats plus ou moins surprenants. Il faut bien retenir que
quelle que soit la mthode retenue, cette fonctionnalit ne crera pas de
nouvelles donnes, elle ne fera que modeler un affichage visuellement plus
satisfaisant, mais ne traduisant pas obligatoirement la ralit.
L'interpolation peut tre utilise sur des donnes de tout type, pas seulement
l'altitude bien entendu. Voici un exemple de cartographie ralise sur une grandeur
pour le moins tonnante : un article sur le blog d'ADRIENH1
A noter qu'il existe galement une extension "Interpolation" accessible dans le menu
Raster, sous-menu Interpolation.
Comme souvent avec les extensions, son utilisation peut sembler plus simple que la
commande par dfaut :
en entre, un (ou plusieurs) fichiers vectoriels : un attribut doit correspondre
l'altitude (Champ Z). Mais on peut galement choisir d'autres formats que
des fichiers de points, l'altitude pouvant tre extraite des objets
gographiques si ceux-ci disposent de cette information.
en sortie un fichier raster de MNT au format ASC, dont on prcisera la taille
des cellules de base.
en paramtrant la mthode d'interpolation : pondration par distance inverse
(IDW) ou interpolation par triangulation (TIN)
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II -
II
Le suivi de l'environnement par tldtection est un domaine technique trs dynamique dans
lequel la manipulation des images ariennes ou satellitaires joue un rle primordial.
Cependant, cette squence sur le traitement des images raster n'est pas un cours sur la
tldtection et ne peut aborder toutes les questions qui relvent de cette technique.
Elle a simplement pour objectif de dcrire les commandes de QGIS utilises pour la
manipulation des images, qu'il est ncessaire de connatre.
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Fentre Mtadonnes
Complment
Certaines images sont associes une palette qui dfinit la couleur de chaque pixel :
chaque pixel est associ une valeur qui correspond sa couleur dans la palette.
Ces images sont dites " bande grise unique" puisqu'une seule valeur par pixel est
stocke dans l'image. Il est possible galement d'afficher ces images en "dgrad de
gris".
Par contre, d'autres images, notamment les photographies, sont codes pour chaque
pixel par un tripl de valeurs pour les couleurs visibles, le rouge, le vert et le bleu
(modle RVB). Chaque canal est cod selon son intensit. On parle d'
images 3
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Codage des
couleurs
Affichage
taille du
pixel
Scan 25
couleur
bande unique
Palette
2,5 m
Scan 25 EDR
bande unique
2,5 m
Scan 100
couleur
bande unique
Palette
10 m
Scan Rgional
bande unique
Palette
25 m
BD Ortho
couleur
3 bandes
0,5 m
BD Ortho HR
3 bandes
0,2 m
BR Ortho IRC
3 bandes
0,5 m
RapideEye
Multispectral
5 bandes
5m
Spot5
5 bandes
10 m
Landsat 8
11 bandes
30, 15 et 100
m
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Construire un VRT
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Mthode
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Histogramme
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histogramme
Remarque
contraste
Certaines images peuvent tre fournies sans talement des dynamiques et sont
visuellement difficiles exploiter car elles n'ont aucun contraste : elles apparaissent
trs sombres. C'est le cas notamment des images satellitaires RapidEye fournies par
GoSud.
Pour amliorer l'affichage, on peut utiliser les solutions suivantes :
utiliser le bouton "tendre l'histogramme ..." de la barre d'outils Raster ;
utiliser la commande "Etirer jusqu'au MinMax" de l'onglet Style des proprits
de la couche en fixant soi-mme les valeurs min et max que l'on aura pu
valuer grce l'histogramme ;
utiliser cette mme commande mais avec l'cart-type.
34
E. Le gorfrencement
Le gorfrencement consiste projeter dans le systme de coordonnes souhait
une image raster dpourvue d'informations gographiques. Il peut, par exemple,
s'agir d'une image scanne d'une ancienne carte papier, d'une planche cadastrale.
Le module "Gorfrenceur" de QGIS se trouve dans le menu Raster. Pour
gorfrencer une image, il faut tre capable de dterminer sa surface des points
dits "de contrle" dont les coordonnes sont connues :
soit il faut tablir la correspondance entre certains points de l'image et leurs
quivalents sur un rfrentiel gographique (btiments, ouvrages d'art,
carrefours, etc).
C'est le gorfrencement en mode relatif.
soit il peut s'agir du carroyage imprim si l'image est une carte scanne (les
graticules, dont les coordonnes sont reprables).
C'est le gorfrencement en mode absolu.
Mthode
relatif
Lancer le gorfrenceur :
menu Raster - Gorfrencer
ou bouton
Conseil : Il est possible de paramtrer le gorfrenceur pour qu'il soit affich dans
la fentre principale de QGIS (menu
Paramtres du Gorfrenceur,
Configurer le Gorfrenceur ) afin de faciliter le passage d'une fentre
l'autre.
Dans la mme fentre, cocher les cases Montrer l'identifiant et Montrer les
coordonnes pour afficher ces informations lors de la saisie des points.
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Configurer le Gorfrenceur
La dmarche pour gorfrencer une image dans QGIS est bien conue. Dans un
premier temps, charger l'image raster gorfrencer dans le gorfrenceur avec le
bouton
36
et saisir
les coordonnes X et Y de
chaque point. Pour cela, on
peut :
soit saisir manuellement les
coordonnes X et Y de
, le nom
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Lancer le gorfrencement
. Lorsque la couche raster
en sortie est affiche, il est
toujours possible de modifier les
paramtres, de dplacer ou
supprimer les points de
contrle, en crer de nouveaux
dans le gorfrenceur qui reste
ouvert l'cran.
Mthode
Le gorfrencement d'une image raster en mode absolu
Le fichier MNT_La_Fleche.png (dossier Divers) comprend 4 points de calage (croix),
dont les coordonnes (SCR RGF93/Lambert 93) sont :
Points de calage
Pour gorfrencer ce fichier raster dans QGIS ouvrir le gorfrenceur (menu Raster
Gorfrencer)
Ouvrir le fichier image MNT_La_Fleche.png dans le gorfrenceur en prcisant le
SCR ( RGF93/Lambert 93) :
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Fentre du gorfrenceur
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):
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Paramtres de transformation
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de gorfrencement2.
logo GoInformations
Mthode
2 - http://www.geoinformations.developpement-durable.gouv.fr/spip.php?
page=article&id_article=3066&id_rubrique=724
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Mthode
principale (attention ne pas confondre les deux boutons qui sont visuellement trs
proches).
Comme cette tche est assez fastidieuse, il est recommand d'exporter cette liste
vers un fichier pour pouvoir la rutiliser par la suite. La barre d'outils de droite
possde d'autres boutons permettant la gestion de ce tableau de valeurs
: rajouter,
supprimer, valeurs par dfaut, charger une table, sauvegarder une table.
46
Mthode
Il peut tre utile de raliser la procdure inverse, c'est--dire n'afficher que les pixels
correspondant une classe de valeurs permettant d'isoler, au sein de l'image, des
zones particulires.
La bande spectrale du proche infrarouge permet ainsi d'identifier certaines classe
d'occupation du sol, comme les surfaces d'eau, car l'eau absorbe la quasi-totalit du
rayonnement dans ces longueurs d'onde.
Pour slectionner dans l'image les pixels d'une certaine classe de valeurs, on peut de
nouveau utiliser l'onglet "style" des proprits de la couche. Si l'on prend l'exemple
de la BD Ortho IRC, nous allons slectionner les pixels dont la valeur correspond la
surface de l'eau :
pour cela, la premire action consiste afficher la bande 1 en dgrad de gris
(cette bande 1 correspond l'infrarouge, voir la documentation de l'IGN).
visuellement, on peut constater que les surfaces d'eau sont effectivement
reconnaissables leur couleur sombre, indiquant une absorption du
rayonnement infrarouge.
en utilisant le bouton
, on peut obtenir la valeur des pixels sur diffrentes
surfaces d'eau (regarder la valeur de la bande 1). On peut faire une premire
approximation en retenant les valeurs entre 50 et 62 ;
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dans l'onglet Style, la palette de couleur tant rgle sur Dgrad de gris,
saisir les valeurs Min et Max 50 et 62
dans la zone "Amliorer le contraste", choisir "Couper jusqu'au MinMax" et
valider.
En rglant les valeurs Min et Max 140 et 180, on obtient une rsultat totalement
diffrent, o la surface de l'eau a totalement disparu et o la vgtation est
particulirement mise en valeur.
48
Conseil
Les exemples prsents n'ont pas la prtention de dcrire des procdures mtier
prcises, mais d'attirer l'attention sur les grandes possibilits offertes par QGIS pour
le traitement des donnes raster.
Les manipulations ci-dessus ne concernent que l'affichage des couches Rasters et
permettent de dterminer les valeurs des pixels retenir en fonction de l'objectif de
traitement que l'on s'est fix. Pour continuer exploiter les donnes, il faut utiliser
d'autres outils, comme la calculatrice raster qui va extraire de la couche initiale les
pixels retenus (la surface de l'eau, la vgtation, etc.) pour crer une nouvelle
couche raster qui sera utilise pour des traitements ultrieurs
: tamisage,
polygonisation, etc.
On peut galement citer le calcul d'indices qui vont permettre de caractriser la
nature du sol, dont l'indice NDVI qui est dcrit ci-dessous.
Mthode
Les indices de vgtation sont bass sur des oprations arithmtiques entre deux
bandes spectrales, gnralement le rouge et le proche infrarouge, mais galement
les bandes du proche et du moyen infrarouge.
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Exemple
Dans cet exemple, on veut dterminer les zones de vgtation situes sous une
certaine altitude (en l'occurrence 35 mtres d'altitude). On retiendra le couvert
vgtal pour lequel l'indice NDVI est suprieur 0.4 (couvert arbor, plus dense que
dans l'exemple prcdent).
On utilise toujours les couches ORTHO IRC et MNT au pas de 25 mtres.
On peut effectuer le calcul en une seul fois avec la calculatrice Raster en appliquant
la formule suivante :
( "0468_6740_IRC@1" - "0468_6740_IRC@2" ) /
( "0468_6740_IRC@1" + "0468_6740_IRC@2" ) >= 0.4 AND
"MNT_25M_asc@1" <= 35
: NDVI >=
52
Longueur
d'onde
Rsoluti
on
Bande 1 - Arosols
0,433 - 0,453
m
30 m
Bande 2 - Bleu
0,450 - 0,515
m
30 m
Bande 3 - Vert
0,525 - 0,600
m
30 m
Bande 4 - Rouge
0,630 - 0,680
m
30 m
Bande 5 - Infrarouge
proche
0,845 - 0,885
m
30 m
Bande 6 - Infrarouge
moyen 1
1,560 - 1,660
m
30 m
Bande 7 - Infrarouge
moyen 2
2,100 - 2,300
m
30 m
Bande 8 Panchromatique
0,500 - 0,680
m
15 m
Bande 9 - Cirrus
1,360 - 1,390
30 m
m
Tableau 1 Bandes spectrales OLI de Landsat 8
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"Infrarouge thermique".
Bande spectrale
Bande 10 - Infrarouge
moyen
Longueur
d'onde
10,30 - 11,30
m
Rsoluti
on
100 m
Bande 11 - Infrarouge
11,50 - 12,50
100 m
moyen
m
Tableau 2 Bandes spectrales TIRS de Landsat 8
La bande QA (Quality Assessment)
Les donnes obtenues depuis l'instrument OLI de Landsat 8 contiennent une bande
QA pour Quality Assessment (valuation de la qualit). Chaque pixel de la bande QA
contient une valeur dcimale qui, transforme en nombre binaire 16 bits, permet
de traduire un certain nombre d'tats relatifs la surface du sol, l'atmosphre et au
capteur et pouvant affecter l'utilisabilit du pixel considr. Par exemple, les bits 10
et 11 qui traduisent la prsence de neige au sol peuvent prendre 4 valeurs (00, 01,
10 et 11) correspondant au fait que l'algorithme d'analyse n'a pas pu dterminer
l'tat de la surface (00) ou bien en a une confiance limite (01), une confiance
moyenne (10) ou une confiance lve (11).
Remarque
Les images de Landsat obtenues par tlchargement sont lourdes car elles couvrent
une zone gographique de plusieurs centaines de kilomtres carrs
: les images
tlcharges pour cette prsentation vont de 127 Mo 510 Mo (pour la bande 8, de
rsolution deux fois plus leve). Pour pouvoir les manipuler plus facilement et les
intgrer dans le jeu de donnes du stage, elles ont t dcoupes avec la commande
Raster - Extraction - Dcouper
de QGIS, en utilisant la couche "Communes"
comme masque de dcoupage.
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Pour choisir les bandes spectrales afficher et leur ordre, il faut passer par les
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Complment
Au lieu de crer une nouvelle image composite comme nous venons de le voir, il est
possible de crer un raster virtuel (VRT) qui va assembler les diffrentes images
originales et conserver chacune d'entre elles sous forme de bande spectrale spare :
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D'autres outils
pour les donnes
raster
III -
III
Projections
Conversion
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la valeur tait 0.
RVB vers PCT : pour calculer une table de pseudo-couleurs (PCT) optimale
partir d'une image RVB
PCT vers RVB : pour convertir une bande de couleurs indexes en RVB.
Extraction
Analyse
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Tamiser : efface les surfaces rasters plus petites que la taille donne en pixel
et les remplace par la valeur de la surface voisine la plus importante.
Presque noir : (ou presque blanc) pour scanner une image et convertir les
pixels qui sont dans une couleur presque noire (ou presque blanche) dans une
couleur noire totale (ou blanche). Peut tre utile sur des images compresses
pour les corriger.
Remplir la valeur nulle : remplit les rgions slectionnes (gnralement des
zones nodata) en interpolant partir de pixels valides autour des bords de la
zone (sur une distance maximum saisir).
Proximit (distance raster) : cet utilitaire gnre une "carte raster de
proximit" qui indique la distance entre le centre de chaque pixel et le centre
du pixel le plus proche qui est dsign comme un pixel cible (les cibles sont
les pixels qui correspondent une valeur de pixel prcise). Voir l'exemple cidessous.
Grille (interpolation) : Ce programme cre une grille rgulire (raster) partir
des donnes parpilles dans une source de donnes. Les donnes en entres
seront interpoles pour remplir les nuds de la grille avec des valeurs,
diverses mthodes d'interpolation peuvent tre choisies.
MNT/DEM (Modles de terrain) : sous-menu tudi en dtail dans le chapitre
consacr aux MNT
Mthode
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Divers
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Complment
Pour la plupart des fonctions ci-dessus, la fentre de saisie des paramtres prsente
une zone dans laquelle s'inscrit la commande GDAL qui sera lance. Il est possible de
la modifier pour rajouter des paramtres qui ne sont pas prvus dans l'interface
graphique, en utilisant le bouton d'dition de l'expression.
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64
Solution des
exercices
donnes".
La teinte grise obtenue est reprsentative de la valeur de la pente du terrain calcule.
La copie d'cran ci-dessous correspond l'utilisation de l'extension
Analyse du
terrain. Si l'on utilise la commande par dfaut de QGIS, ne pas oublier de choisir le
rsultat en degrs (car cette commande permet de choisir entre degrs et
pourcentage).
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calculatrice raster
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Pour reprer les valeurs des pixels des routes rouges et orange, utiliser le
bouton "i" Identifier les entits : rouge=191- orange = 134
dans la calculatrice Raster, utiliser l'expression Extrait_72_Topo@1 = 191 OR
Extrait_72_Topo@1 = 134
enregistrer le rsultat dans une couche Raster au format GoTiff (tirer
l'histogramme pour visualiser et constater la pertinence du calcul)
lancer la commande de proximit sur cette nouvelle couche
: valeur = 1 unit = GEO
enregistrer le rsultat dans une couche Raster au format GoTif (tirer
l'histogramme pour visualiser)
lancer la commande Contours sur cette couche : distance = 250
enregistrer le rsultat dans une couche vectorielle (format SHP par exemple).
afficher cette couche vectorielle sur le scan25 initial.
Matrise d'ouvrage : MEDDE - METL - MAAF / Matrise d'uvre : ENTE Aix - ENSG /
Licence ouverte ETALAB
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