REPUBLIQUE ALGERIENNE DEMOCRATIQUE ET POPULAIRE

MINISTERE DE L'ENSEIGNEMENT SUPERIEUR ET DE LA RECHERCHE

SCIENTIFIQUE

UNIVERSITE ABOU BEKR BELKAID TLEMCEN

FACULTE DES SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE DE LA TERRE

ET DE L’UNIVERS

DEPARTEMENT DE BIOLOGIE

Laboratoire de Microbiologie Appliquée à l’Agroalimentaire, au Biomédical et à

l’Environnement
« LAMAABE »

MEMOIRE
Présenté par :

SEGHIR SOUHAIB

En vue de l’obtention du diplôme

de MASTER

En Microbiologie Fondamentale

Caractérisation des gènes de résistance aux antibiotiques chez Acinetobacter

baumannii

Soutenu le 12/07/2023, devant le jury composé de :

Présidente Mme Bendimerad Nahida Maître de conférences B Université de Tlemcen

Encadrante Mme Mesli Merad boudia Maître de conférences B Université de Tlemcen

Esma
Examinatrice Mme Ayad Amel Maître de conférences B Université de Tlemcen

Année Universitaire : 2022-2023

 1

Plan de travail

1-Introduction

2-Généralités

3-Objectif de travail

4-Matériel et méthodes

5-Résultats et Discussion

6-Conclusion

7-Perspectives
4-Matériel et méthodes

Isolement et identification

1. Réalisation des prélèvements

2. Mise en culture des prélèvements

2. Isolement et purification
3. L’identification par le système VITEK® 2 Compact

1. Préparation de l’inoculum

2. Préparation de la cassette

3. Manipulation sur l’instrument VITEK®2 Compact

4. Conservation

5. Antibiogramme
1. L’antibiogramme par diffusion des disques d’antibiotiques sur la gélose

2. Réalisation de l’antibiogramme par le système VITEK® 2 Compact

6-Conclusion

Cette étude révèle une augmentation de la fréquence et de la résistance des souches

d'A.baumannii, ce qui représente un défi pour la prise en charge thérapeutique. Pour résoudre
ce problème, il est nécessaire de contrôler l'environnement hospitalier, ajuster l'antibiothérapie
pour chaque patient en se basant sur les résultats de l'antibiogramme et d'optimiser l'utilisation
des antibiotiques à l'hôpital.

7-Perspectives

Elargissement de la période d’étude

Réalisation d’une étude multicentrique

Développer des stratégies visant a prévenir les infections causées par A. baumannii en
Algerie.

Créer une base de données exhaustive regroupant toutes les informations relatives aux
souches d'Acinetobacter baumannii Algeriennes,

évaluer les autres possibilités thérapeutiques de traitements des infections à A.baumannii

1-Introduction

Acinetobacter baumannii, une bactérie ubiquitaire et opportuniste, se présente comme un

coccobacille à Gram négatif. Elle est souvent impliquée dans les infections nosocomiales, en
particulier dans les unités de soins intensifs. Le traitement de ces infections est souvent difficile, à
cause de leur résistance naturelle et acquise aux nombreux antibiotiques, ainsi que de leurs multiples
facteurs de virulence.

en seulement 40 ans, cette espèce est passée d'une "bactérie insignifiante" peu pathogène et
sensible à la plupart des antibiotiques disponibles à l'époque, à une bactérie pathogène capable
d'acquérir facilement une multi-résistance aux antibiotiques

2-Généralités

Les bactéries appartenant au genre Acinetobacter sont considérées comme des

microorganismes coccobacillaires à gram négatif et ubiquitaires

A.baumannii est l'espèce la plus commune et celle qui est le plus souvent associée aux
infection nosocomiales et communautaires

A.baumannii est l'espèce la plus commune et celle qui est le plus souvent associée aux
infection nosocomiales et communautaires

Les mécanismes de résistance chez Acinetobacter baumanni

1. Résistance naturelle
2. Résistance acquise
3-Objectif de travail
L'objectif de cette étude consiste à évaluer la fréquence d'isolement et à décrire le profil de
résistance d'Acinetobacter baumannii vis-à-vis des divers antibiotiques, isolés à partir de trois
hôpitaux : CHU de Tlemcen (service de réanimation et de chirurgie), l’hôpital de Beni Saf (service de
chirurgie, d’infectiologie, des urgences et de maternité) et l’hôpital d’Ain Témouchent (service de
réanimation).

5-Résultats et Discussion

1. Mise en culture des prélèvements

cultures positives cultures négative

8%

92%

Le taux de cultures positives et cultures négatives

 2. Les résultats d’identification

Identifier Non édentifier

12,19%

87,80%

Le taux d’identification des BGN

3. Répartition des souches identifiées

BGNnF Entérobactéries Autres bactéries

12,19%

35,36%

52,43%

Répartition des BGN à partir des prélèvements

 Acinetobacter baumannii Pseudomonas aeruginosa

31,03%

68,96%

Répartition des BGNnF

 6
Réanimation
5
Chirurgie
4
Chirurgie

3 Maternité

2 Infectiologie

1 Blocs opératoires Urgences et

Chirurgie

0 Réanimation

Le nombre d’isolats d’A.baumannii selon les services d’hospitalisation des trois hôpitaux

4.La répartition des isolats d’A.baumannii selon la nature des prélèvements

Sonde urinaire Plaie

Aspiration endo-trachéale Mains
20% 30%

20%

30%

La Répartition des souches d’A.baumannii selon les prélèvements des patients dans les trois hôpitaux
 Lit
Table
Appareil de ventilation mécanique (AVM)
Poignée de porte
Chariot de soins
Poignée de poubelle
Couloir
10%
10% 20%

10%

20%
10% 20%

La Répartition des souches d’A.baumannii selon les prélèvements environnementaux dans les trois
hôpitaux

5. Profil de résistance d'Acinetobacter baumannii aux antibiotiques

R S I
5%

35%

60%

La Résistance des souches d’A.baumannii contre l’antibiotique gentamycine

 Taux des souches résistantes % Taux des souches intermédiaires %
Taux des souches sensibles %

37,5%
50%
50% 50% 50% 50%
0% 12,5% 50%
0% 0%
0% 87,5%
12,5% 0%
50% 50% 50% 50%
37,5% 50%
50%
TZP 0%
CTX
CAZ
IMI 12,5%
GEN
CIP
CS
TMP/SMX

Profil de résistance des isolats d’Acinetobacter baumannii testées par le système VITEK®2 Compact