TP XX - L’inéducable évolution des génomes au sein des populations.

On peut mettre en équation la séparation des allèles lors de la méiose et leur réassociation au hasard lors de la
fécondation, ce qui permet de calculer les effectifs des génotypes des descendants et la fréquence des allèles. Des
modèles numériques ont été mis au point pour comprendre l’évolution des fréquences des allèles.
Dans les populations eucaryotes à reproduction sexuée, le modèle théorique de Hardy-Weinberg prévoit la stabilité
des fréquences relatives des allèles dans une population.

Comment évoluent ces fréquences au sein d’une population ?

Activité 1 : L’équilibre de Hardy Weinberg

Consigne : A l’aide des différentes ressources montrer comment l’utilisation d’un modèle numérique permet de
vérifier la loi de Hardy-Weinberg. Votre réponse comportera un texte illustré par des captures des graphiques.

Ressource 1 : La loi de Hardy-Weinberg.

Le modèle de Hardy Weinberg est une théorie des probabilités qui décrit le phénomène aléatoire de transmission
des allèles dans une population répondant à des critères bien précis (que nous définirons plus tard).

On considère un gène possédant deux allèles, A et a. La fréquence FA de l'allèle A est égale à p et La fréquence Fa de
l'allèle a est égale à q. Comme il n'y a que deux allèles, on a p + q = 1.

Si les différents individus de la population se croisent au hasard, on obtiendra différents génotypes.

1 Déterminez les différents génotypes et les fréquences associées en complétant le tableau de croisement
suivant.

Gamète mâle Allèle A Allèle a

Gamète femelle (fréquence p) (fréquence q)
Allèle A génotype fréquence du génotype fréquence du
(fréquence p) génotype génotype
(A//A) p x p = p2 (A//a) pq
Allèle a génotype fréquence du génotype fréquence du
(fréquence q) génotype génotype
(A//a) pq (a//a) q2

2 Déterminez, dans les zygotes, les fréquences F A et Fa des allèles A et a.

FA = F (A//A) + 1/2 F (A//a) = p2 + 1/2 (2 pq) = p2 + pq

Fa = F (a//a) + 1/2 F (A//a) = q2 + 1/2 (2 pq) = q2 + pq

3 Comme le postule la loi de Hardy Weinberg, montrez que la fréquence allélique n'évolue pas au fil des
générations (c'est à dire que FA chez les zygotes = p et Fa chez les zygotes = q)

Aide : si p + q = 1 alors q = 1 - p et p = 1 - q

FA = p2 +pq = p2 + p(1-p) = p2 + p - p2 = p

Fa = q2 +pq = q2 + q(1-q) = q2 + q - q2 = q

La fréquence des allèles n'a pas changé d'une génération à l'autre.

Ressource 2 : Vérification de la loi de Hardy-Weinberg

Cf. Document 4 p.77 (Belin)

Montrer que la répartition des génotypes des groupes sanguins dans la population étudiée est en accord avec la
loi de Hardy-Weinberg.

Correction :
fM = (406+(744/2)) / (406 + 744 + 332)
fM = 778 / 1482 = 0,5249662618083671
fN = (332 + (744/2)) / (406 + 744 + 332)
fN = 704 / 1482 = 0,4750337381916329

Nombre de (M//M) = 408

Nombre de (N//N) = 334
Nombre de (M//N) = 739

La loi de Hardy-Weinberg est vérifiée dans cette population.

Ressource 3 : Modélisation de la loi de Hardy-Weinberg

Etape 1

Préparation de la construction du modèle numérique de suivi de deux allèles d’un gène

▪ On considère, dans une population, un gène représenté par deux allèles notés M et N

▪ On désigne les individus de la population par leur génotype (nommé entité dans le modèle)
Correction : Entités (M//M) (M//N) (N//N)
▪ Pour calculer l’évolution au cours du temps des effectifs des génotypes des différents individus, le modèle
doit comporter des équations matérialisant toutes les possibilités de reproduction entre les individus. Il doit
aussi tenir compte des proportions des descendants obtenus.
 le tableau ci-dessous (à ne pas confondre avec un échiquier de croisement) permet de préparer la
modélisation :

génotype
du parent
mâle (M//M) (M//N) (N//N)
génotype du
parent femelle
(M//M) (M//M) (M//N)
(M//M) (M//M) (M//N)
(M//M)
(M//M) (M//N) (M//N)
(M//M) (M//N) (M//N)

(M//M) (M//M) (M//N)

(M//M) (M//N) (M//N)
(M//N)
(N//M) (N//M) (N//N)
(N//M) (N//N) (N//N)

(N//M) (N//M) (N//N)

(N//M) (N//N) (N//N)
(N//N)
(N//M) (N//M) (N//N)
(N//M) (N//N) (N//N)

Tableau des possibilités et résultats de reproductions dans une population d’individus

(dans le cas d’un gène présent sous la forme de 2 allèles)

1 Indiquer en ligne et en colonne tous les génotypes possibles pour les géniteurs
2 Rayer les cases redondantes
3 Noter à l’intersection ligne/colonne les génotypes des 4 descendants possiblement obtenus.

Ouvrir Edu’Modèles : https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/edumodeles/algo/index.htm

(Ou version serveur)

Etape 2 : Construction du modèle :

Agents (ou entités)

Déclarer les entités dans Edu’Modèles.

Aide : Le nom comportera les allèles des entités entre parenthèses et séparés par // - Apparence Disque (choisir
une couleur) - Cocher l'agent est mobile - Probabilité de déplacement : 100 - Demi vie : 100 - Nombre d'agents :
Utiliser les données du document fourni pour les groupes sanguins : M//M 406 / M//N 744 / N//N 332.

Correction
(M//M) (M//N) (N//N)

Règles (ou comportements)

A partir du tableau précédent et en vous aidant du modèle suivant, renseigner les règles permettant de prévoir les
résultats des fécondations entre entités.

Aide
 Nom de la règle :
Indiquer les génotypes
des parents

Indiquer le génotype de Indiquer le génotype de

chaque parent chaque descendant
possible

Etape 3 : Affichage des résultats du modèle.

Rubrique Animation : Valeurs à entrer

Tour de chauffe : 50 / Durée : 300 / Vitesse de l’animation : Maximum

Lancer la modélisation.
Exporter Les données du graphique sous la forme d’un fichier CSV. Voir Fiche technique : FT-Edumodèles-Algo.pdf.
Ouvrir le fichier avec Excel. Copier les quatre premières colonnes et les coller dans le fichier Fréquences-
alleles.xlxs
A partir des données du graphique montrer que la population obéit la loi de Hardy-Weinberg

Correction

Variations des génotypes

La fréquence des allèles est conservée au cours des différentes générations. La loi de Hardy Weinberg est vérifiée
par le modèle.
Problème :

Question : Quelle remarque pouvez-vous faire sur les fréquences des allèles du groupe sanguins dans les
différentes populations ? La loi de Hardy-Weinberg est-elle alors confirmée ?

Activité 2 : Les écarts à l’équilibre :

Consigne

A partir des différentes ressources et des modélisations montrer que les populations étudiées n'obéissent pas à la
loi de Hardy Weinberg et expliquer l'origine du déséquilibre.

Votre réponse comportera un texte illustré par des captures des graphiques.

Exemple 1 : Les drosophiles.

En 1956, le chercheur Peter Buri mène des élevages

de drosophiles et génère 107 populations de
drosophiles selon le protocole suivant.

Protocole
Chaque population est initialement fondée avec 16
individus hétérozygotes pour la mutation "brown
eye" : 8 mâles et 8 femelles de génotype
(bw75//bw);
A chaque éclosion de génération, seuls 16 individus
sont conservés (8 mâles et 8 femelles) pour former la
génération suivante.
D'après Nathan

1 - A partir du modèle Drosophile.mod simuler les résultats de l'évolution de 4 populations différentes en

respectant les conditions de l'expérience de Peter Buri (Respecter le nombre de drosophiles de l’expérience et
répéter 4 fois la simulation sur 300 tours).
2 - A partir des données des graphiques obtenus avec les mêmes méthodes que l'activité 1 vérifier si la
population obéit la loi de Hardy-Weinberg. (Utiliser le fichier Frequences-Allèles-Drosophile.xlsx)
3 - Quelle constatation peut-on faire ?
4 - Quel mécanisme permet de l'expliquer ?
Correction

Les populations n'obéissent pas à la loi de Hardy Weinberg. Les fréquences des allèles ne sont pas conservées.
L'évolution des génotypes et de la fréquence des allèles varient au hasard => cas de dérive génétique liée au faible
effectif de la population de départ.

Exemple 2 : Les éléphants du parc de Gorongosa.

Il y a des dizaines d'années, environ 4 000 pachydermes

vivaient au Mozambique dans le parc de Gorongosa. Selon
Joyce Poole, spécialiste du comportement des éléphants et
exploratrice National Geographic qui étudie ces animaux dans
le parc. Mais après la guerre civile, en partie financée par la
vente de l'ivoire, ils ne se comptaient plus qu'en centaines.
Dans sa nouvelle étude qui n'a pas encore été publiée, la
scientifique révèle que sur les 200 femelles adultes connues
du parc, 51 % de celles qui ont survécu à la guerre, âgées de
25 ans minimum, sont dépourvues de défenses, tout comme
32 % des femelles nées après la guerre.
Normalement, cette caractéristique ne touche que 2 à 4 % des éléphants femelles d'Afrique.
D'après https://trustmyscience.com/

L'absence de défense est due à l'existence d'un allèle récessif : I désigne l'allèle permettant la croissance des
défenses. I- désigne un allèle muté inhibant la croissance des défenses porté par le chromosome sexuel X. On peut
donc avoir :
Eléphant femelle avec défenses de génotype (Xi//Xi)
Eléphant femelle avec défenses de génotype (Xi//Xi-)
Éléphant femelle sans défenses de Génotype (Xi-//Xi-)
Eléphant mâle avec défenses de génotype (Y//Xi)
Eléphant mâle sans défenses de génotype (Y//Xi-)

1 - Dans le modèle Elephant-Braconnier.mod créer les actions de braconnage.

Aide :

Ajouter une action : Nom de la règle "Braconnage (Génotype de l'éléphant)" - Type : Réaction (rencontre entre
plusieurs agents) - Age minimal des réactifs : 0 - Probabilité de réaction à chaque tour : 100 - Réactifs : Braconnier +
Génotype de l'éléphant - Choisir les produits permettant de conserver le braconnier et de faire disparaitre l'éléphant
chassé.
Créer autant d'action de braconnage qu'il y a de génotypes correspondant à des éléphants à défenses.
Important :
- Bien identifier les génotypes correspondant au phénotype recherché par le braconnier pour créer les règles.
- Lorsqu’un éléphant est tué il ne doit plus apparaitre dans les produits de la règle.
2 - A partir du modèle Elephant-Braconnier.mod simuler l'évolution de 4 populations d'éléphants différentes
obtenues sans braconnier, puis avec 1, 5 et 10 braconniers.
3 - A partir des données des graphiques obtenus avec les mêmes méthodes que l'activité 1 vérifier si la population
obéit la loi de Hardy-Weinberg. (Utiliser le fichier Frequences-Allèles-Elephant.xlsx)
4 - Quelle constatation peut-on faire ?
5 - Quel mécanisme permet de l'expliquer ?

Correction

Sans braconnier 1 braconnier 5 braconniers 10 braconniers

Variation des génotypes Variation des génotypes Variation des génotypes Variation des génotypes

Variation des fréquences des allèles.
La fréquence des allèles
est conservée.
Variation des fréquences des Variation des fréquences des
Variation des fréquences des allèles.
allèles. allèles.
Diminution de la fréquence Diminution de la Disparition de l'allèle Xi.
de Xi. fréquence de Xi.

La pression de chasse des braconniers ne s'exerce que sur les éléphants ayant des défenses. L'allèle responsable
de la disparition des défenses permet la survie des éléphants porteurs de cet allèle. C'est la sélection naturelle qui
explique les modifications de fréquences des allèles.